Məlumat

10.3: RNT-nin strukturu və funksiyası - Biologiya

10.3: RNT-nin strukturu və funksiyası - Biologiya


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Öyrənmə Məqsədləri

  • Ribonükleotidlərin biokimyəvi quruluşunu təsvir edin
  • RNT və DNT arasındakı oxşarlıqları və fərqləri təsvir edin
  • Zülal sintezində istifadə olunan üç əsas RNT növünün funksiyalarını təsvir edin
  • RNT-nin irsi məlumat kimi necə xidmət edə biləcəyini izah edin

Struktur olaraq ribonuklein turşusu (RNT) DNT-yə çox bənzəyir. Bununla belə, DNT molekulları adətən uzun və cüt zəncirli olsa da, RNT molekulları daha qısadır və adətən tək zəncirlidir. RNT molekulları hüceyrədə müxtəlif rolları yerinə yetirirlər, lakin əsasən zülal sintezi (tərcümə) və onun tənzimlənməsi prosesində iştirak edirlər.

RNT strukturu

RNT adətən tək zəncirlidir və fosfodiester bağları ilə bağlanmış ribonukleotidlərdən ibarətdir. RNT zəncirindəki ribonukleotid dörd azotlu əsasdan (A, U, G və C) biri olan riboza (pentoza şəkəri) və bir fosfat qrupu ehtiva edir. Şəkərlər arasındakı incə struktur fərqi DNT-yə əlavə sabitlik verir, DNT-ni genetik məlumatın saxlanması üçün daha əlverişli edir, halbuki RNT-nin nisbi qeyri-sabitliyi onu daha qısamüddətli funksiyaları üçün daha uyğun edir.

RNT-yə xas olan pirimidin urasil adeninlə tamamlayıcı əsas cütü əmələ gətirir və DNT-də istifadə olunan timin əvəzinə istifadə olunur. RNT tək zəncirli olsa da, əksər növ RNT molekulları RNT zəncirindəki tamamlayıcı ardıcıllıqlar arasında geniş molekuldaxili əsas cütləşməsi göstərir və onların funksiyası üçün vacib olan proqnozlaşdırıla bilən üçölçülü struktur yaradır (Şəkil (PageIndex{1}) və Şəkil (PageIndex{2})).

Məşq (PageIndex{1})

RNT-nin quruluşu DNT-nin quruluşundan nə ilə fərqlənir?

Protein sintezində RNT-nin funksiyaları

Hüceyrələr, tərcümə prosesi vasitəsilə zülalların sintezini istiqamətləndirmək üçün RNT yaradaraq DNT-də saxlanan məlumatlara daxil olurlar. Hüceyrə daxilindəki zülallar hüceyrə strukturlarının qurulması və hüceyrələrə spesifik xüsusiyyətlərini verən hüceyrə kimyəvi reaksiyaları üçün ferment katalizatoru kimi xidmət edən bir çox funksiyaya malikdir. Zülal sintezində birbaşa iştirak edən üç əsas RNT növü xəbərçi RNT (mRNT), ribosomal RNT (rRNA) və transfer RNT (tRNA)dır.

1961-ci ildə fransız alimləri Fransua Yakob və Jak Monod DNT ilə onun zülal məhsulları arasında bir vasitəçinin mövcudluğu fərziyyəsini irəli sürdülər və bunu xəbərçi RNT adlandırdılar.1 Tezliklə onların fərziyyələrini dəstəkləyən dəlillər toplandı ki, DNT-dən məlumat mRNA-dan istifadə edərək zülal sintezi üçün ribosoma ötürülür. Əgər DNT hüceyrə məlumatlarının tam kitabxanası kimi xidmət edirsə, mRNT müəyyən bir zamanda lazım olan xüsusi məlumatın fotokopisi kimi xidmət edir və zülal yaratmaq üçün göstərişlər verir.

mRNT hüceyrədəki bütün hüceyrə fəaliyyətlərinə nəzarət edən DNT-dən gələn mesajı daşıyır. Hüceyrə müəyyən bir zülalın sintez edilməsini tələb edərsə, bu məhsulun geni "işə salınır" və mRNT transkripsiya prosesi ilə sintez olunur (bax: RNT Transkripsiyası). Daha sonra mRNT tərcümə prosesi zamanı kodlaşdırdığı zülalın sintezini istiqamətləndirmək üçün ribosomlar və digər hüceyrə mexanizmləri (Şəkil (PageIndex{3})) ilə qarşılıqlı əlaqədə olur (bax Protein sintezi). mRNT nisbətən qeyri-sabitdir və hüceyrədə, xüsusən də prokaryotik hüceyrələrdə qısa ömürlüdür, bu da zülalların yalnız lazım olduqda əmələ gəlməsini təmin edir.

rRNT və tRNT sabit RNT növləridir. Prokaryotlarda və eukaryotlarda tRNT və rRNT DNT-də kodlanır, sonra fərdi yetkin RNT növlərini ehtiva edən daha kiçik fraqmentləri buraxmaq üçün kəsilən uzun RNT molekullarına kopyalanır. Eukariotlarda rRNT-nin sintezi, kəsilməsi və ribosomlara yığılması nüvənin nüvə bölgəsində baş verir, lakin bu fəaliyyətlər prokariotların sitoplazmasında baş verir. Bu tip RNT-lərin heç biri bir polipeptidin sintezini istiqamətləndirmək üçün göstərişlər daşımır, lakin zülal sintezində digər mühüm rolları oynayır.

Ribosomlar rRNT və zülaldan ibarətdir. Adından da göründüyü kimi, rRNT ribosomların əsas tərkib hissəsidir, ribosomun kütləsinin təxminən 60%-ni təşkil edir və mRNT-nin bağlandığı yeri təmin edir. rRNT mRNT, tRNT və ribosomların düzgün uyğunlaşdırılmasını təmin edir; ribosomun rRNT-si də fermentativ aktivliyə (peptidil transferaza) malikdir və zülal sintezi zamanı iki düzülmüş amin turşusu arasında peptid bağlarının əmələ gəlməsini katalizləyir. Uzun müddətdir ki, rRNT-nin ilk növbədə struktur rolu olduğu düşünülsə də, onun ribosomdakı katalitik rolu 2000-ci ildə sübut edilmişdir.2 Yale Universitetində Tomas Steitz (1940-) və Peter Moore (1939-) laboratoriyalarında olan elm adamları ribosom quruluşunu kristallaşdıra bildilər. Haloarcula marismortui, Ölü dənizdən təcrid olunmuş halofil arxeon. Bu işin əhəmiyyətinə görə Steitz 2009-cu ildə Kimya üzrə Nobel Mükafatını ribosom quruluşunun başa düşülməsinə mühüm töhfələr verən digər elm adamları ilə bölüşdü.

Transfer RNT RNT-nin üçüncü əsas növüdür və ən kiçiklərindən biridir, adətən cəmi 70-90 nukleotid uzunluğundadır. Ribosomdakı zülal sintezi yerinə düzgün amin turşusunu daşıyır. Bu, sintez edilən polipeptid zəncirinə düzgün amin turşusunun daxil edilməsinə imkan verən tRNT və mRNA arasında əsas cütləşmədir (Şəkil (PageIndex{4})). tRNT və ya rRNT-dəki hər hansı mutasiyalar hüceyrə üçün qlobal problemlərə səbəb ola bilər, çünki hər ikisi düzgün protein sintezi üçün lazımdır (Cədvəl (PageIndex{1})).

Cədvəl (PageIndex{1}): RNT-nin strukturu və funksiyası
mRNTrRNTtRNT
StrukturQısa, qeyri-sabit, tək zəncirli RNT DNT daxilində kodlanmış genə uyğundurRibosom kütləsinin 60%-ni təşkil edən daha uzun, sabit RNT molekullarıQısa (70-90 nukleotid), geniş molekuldaxili əsas cütləşməsi ilə sabit RNT; bir amin turşusu bağlama yeri və bir mRNT bağlama yeri ehtiva edir
FunksiyaDNT və zülal arasında vasitəçi kimi xidmət edir; ribosom tərəfindən kodladığı zülalın birbaşa sintezi üçün istifadə olunurZülal sintezi zamanı mRNT, tRNT və ribosomun düzgün uyğunlaşdırılmasını təmin edir; amin turşuları arasında peptid bağlarının meydana gəlməsini katalizləyirRibosomda zülal sintezi yerinə düzgün amin turşusunu daşıyır

Məşq (PageIndex{1})

Zülal sintezində iştirak edən üç əsas növ RNT molekulunun funksiyaları hansılardır?

İrsi Məlumat kimi RNT

RNT əksər hüceyrələrdə irsi məlumat rolunu oynamasa da, DNT-si olmayan bir çox virus üçün RNT bu funksiyanı yerinə yetirir. Beləliklə, RNT açıq şəkildə genetik məlumat kimi xidmət etmək üçün əlavə imkanlara malikdir. RNT adətən hüceyrələrdə tək zəncirli olsa da, viruslarda əhəmiyyətli müxtəliflik var. Ümumi soyuqluğa səbəb olan rinoviruslar; qrip virusları; və Ebola virusu tək zəncirli RNT viruslarıdır. Uşaqlarda və digər immun çatışmazlığı olan insanlarda ağır qastroenteritlərə səbəb olan rotaviruslar ikiqat zəncirli RNT viruslarına misaldır. İki zəncirli RNT eukaryotik hüceyrələrdə qeyri-adi olduğundan, onun mövcudluğu viral infeksiyanın göstəricisi kimi xidmət edir. DNT genomu əvəzinə RNT genomuna malik olan bir virusun təsiri Viruslarda daha ətraflı müzakirə olunur.

Əsas anlayışlar və xülasə

  • Ribonuklein turşusu (RNT) adətən tək zəncirlidir və tərkibində pentoza şəkəri kimi riboza və timin əvəzinə pirimidin urasil var. Bir RNT zəncirinin üçölçülü quruluşa sahib olması üçün əhəmiyyətli intramolekulyar baza cütləşməsinə məruz qala bilər.
  • Üç əsas RNT növü var, hamısı protein sintezində iştirak edir.
  • Messenger RNT (mRNT) tərcümə zamanı DNT ilə protein məhsullarının sintezi arasında vasitəçi rolunu oynayır.
  • Ribosomal RNT (rRNT) ribosomların əsas tərkib hissəsi olan sabit RNT növüdür. Zülal sintezi zamanı mRNT və ribosomların düzgün uyğunlaşmasını təmin edir və zülal sintezi zamanı iki düzlənmiş amin turşusu arasında peptid bağlarının əmələ gəlməsini katalizləyir.
  • Transfer RNT (tRNT) ribosomda zülal sintezinin müvafiq yerinə bir amin turşusu daşıyan kiçik bir stabil RNT növüdür. Bu, tRNT və mRNA arasındakı əsas cütləşməsi, sintez edilən polipeptid zəncirinə düzgün amin turşusunun daxil edilməsinə imkan verir.
  • Hüceyrələrdə uzunmüddətli genetik məlumat üçün RNT istifadə edilməsə də, bir çox viruslar RNT-dən genetik material kimi istifadə edirlər.

Çoxlu seçim

Aşağıdakı RNT növlərindən hansı zülalı kodlayır?

A. dsRNT
B. mRNT
C. rRNT
D. tRNT

B

Nuklein turşusu qarışıqdan təmizlənir. Molekullar nisbətən kiçikdir, tərkibində urasil var və əksəriyyəti amin turşusu ilə kovalent şəkildə bağlıdır. Aşağıdakılardan hansı təmizlənmişdir?

A. DNT
B. tRNT

D

Aşağıdakı RNT növlərindən hansı katalitik qabiliyyəti ilə tanınır?

A. tRNT

C

Ribosomlar rRNT-dən və başqa hansı komponentdən ibarətdir?

  1. protein
  2. polipeptidlər
  3. DNT
  4. mRNT

Aşağıdakılardan hansı RNT-ni genom kimi istifadə edə bilər?

  1. bir bakteriya
  2. bir arxeon
  3. bir virus
  4. eukariot

C

Uyğunluq

Düzgün molekulu onun təsviri ilə uyğunlaşdırın:

___tRNA ___rRNA ___mRNAA. ribosomun əsas komponentidir B. gendəki məlumatın surətidir C. amin turşusunu ribosoma daşıyır

KABİNƏ

Doğru yalan

Ribosomlar əsasən RNT-dən ibarətdir.

Doğru

Cüt zəncirli RNT adətən hüceyrələrin içərisində olur.

Yalan

Qısa cavab

DNT nukleotidləri ilə RNT nukleotidləri arasında hansı fərqlər var?

DNT-nin əsas ardıcıllığında saxlanılan məlumat hüceyrənin xüsusiyyətlərini təyin etmək üçün necə istifadə olunur?

Tamamlayıcı əsas cütləri bir RNT molekulunda molekuldaxili baza cütləşməsinə necə kömək edir?

Əgər antisens RNT 5'AUUCGAAUGC3' ardıcıllığına malikdirsə, onun bağlanacağı mRNT ardıcıllığı hansıdır? Çəkdiyiniz molekulun 5′ və 3′ uclarını etiketlədiyinizə əmin olun.

Niyə ikiqat zəncirli RNT (dsRNA) RNT müdaxiləsini stimullaşdırır?

Tənqidi Düşüncə

Şəkildə mRNT, rRNT və tRNT-nin yerini müəyyənləşdirin.

tRNT və rRNT molekullarının mRNT molekullarından daha sabit olması nə üçün məntiqlidir?

Haşiyələr

  1. 1 A. Zəngin. "RNT Oyanışı Dövrü: İlk İllərdə RNT-nin Struktur Biologiyası." Biofizikanın Rüblük Baxışları 42 yox. 2 (2009): 117–137.
  2. 2 P. Nissen və başqaları. "Peptid bağı sintezində ribosom fəaliyyətinin struktur əsasları." Elm 289 yox. 5481 (2000): 920–930.

Rnt1p-nin strukturu və funksiyası: hədəflənmiş RNT deqradasiyası üçün RNTi-yə alternativ

İki zəncirli RNT bağlayan zülal (dsRBP) ailəsi bütün eukariotlarda RNT-nin redaktəsini, sabitliyini və funksiyasını idarə edir. Bu ailənin mərkəzi xüsusiyyəti, RNT spiralının yaratdığı kiçik yivlər arasındakı xarakterik məsafəni tanıyan yüksək dərəcədə qorunmuş ikiqat zəncirli RNT bağlayan domendən (dsRBD) istifadə edərək ümumi RNT dupleksinin tanınmasıdır. Bu mövzuda növlər və funksional spesifikliklər verən dəyişikliklər bildirilmişdir, lakin əksər dsRBP-lər ümumi dsRNA-nı bağlamaq qabiliyyətini saxlayır. Ribonukleaza III (RNase III) ailə üzvləri müvafiq olaraq bakterial RNase III, maya Rnt1p, insan Drosha və insan Dicer ilə təmsil olunan dörd sinifə bölünür. Bütün dsRBP-lər və RNase III ailəsinin əksər üzvləri kimi, Rnt1p də dsRBD-yə malikdir, lakin onun əksər qohumlarından fərqli olaraq, ümumi RNT spirallarına zəif bağlanır. Bunun əvəzinə, RNT1p, Saccharomyces cerevisiae-də ifadə edilən və RNTi (RNT müdaxiləsi) mexanizmindən məhrum olan yeganə məlum RNase III, gövdə döngə strukturlarının xüsusi sinfini tanıyır. Spesifik substratları tanımaq üçün Rnt1p-nin dsRBD-i αβββααα topologiyası və C-terminusunda ardıcıllığa məxsus RNT bağlama motivi ilə ixtisaslaşmışdır. 1996-cı ildə Rnt1p-nin kəşfindən sonra onun genetikası, funksiyası, strukturu və təsir mexanizminin öyrənilməsində, bu fermentin spesifikliyinin artmasının səbəblərini və mexanizmlərini və onun RNT deqradasiyası mexanizminə təsirini izah edən mühüm irəliləyiş əldə edilmişdir. Bu məqalə aşağıdakı kateqoriyalara bölünür: RNT Dövriyyəsi və Nəzarət > Dövriyyə/Nəzarət Mexanizmləri Zülallar və Digər Molekullarla RNT Qarşılıqlı Əlaqələr > Protein-RNT Tanınması RNT Emalı > Kiçik RNT-lərin Emalı RNT Zülallar və Digər Molekullar-Proteinlərlə Qarşılıqlı Əlaqələr >.

Açar sözlər: RNT deqradasiyası RNT emal RNase III Rnt1p dsRNA-məcburi zülal.


2-ci Hissə: RNT Birləşdirmə Maşının İçində

00:00:07.19 Mən Yale Universitetindən Anna Marie Pyle
00:00:09.27 və bu gün mən sizə quruluş haqqında danışacağam
00:00:12.20 və bir RNT bağlama maşınının funksiyası,
00:00:15.10 katalitik şəkildə kəsə bilən bir RNT molekuludur
00:00:18.15 və RNT hissələrini birləşdirərək bir-birinə tikin.
00:00:24.28 Bu gün diqqət edəcəyim maşın Qrup II öz-özünə yapışan intron adlanır
00:00:29.03 və bu molekul çox böyük bir ribozim və ya katalitik RNT,
00:00:33.19 öz birləşməsini və öz transpozisiyasını kataliz edə bilən,
00:00:37.02 bu, əvvəlki əlavə yerlərə qayıtmaq deməkdir.
00:00:41.09 Və bunlar çox, çox böyük fermentlərdir
00:00:44.01 və onlar təbiətdəki ən böyük ribozimlərdən biridir.
00:00:47.27 Və burada gördüyünüz kimi,
00:00:49.09 bu, onların kataliz etdiyi reaksiyadır - iki mərhələdən keçir.
00:00:52.21 İlk addımda intron bir quruluşa bükülür
00:00:56.11 birləşmə reaksiyasını kataliz edə bilər,
00:00:59.18 su ilə vasitəçilik edir,
00:01:01.12 və ya intron daxilində adenozinin 2' hidroksil (2'-OH) qrupu.
00:01:05.15 Bu addımdan sonra siz aralıq lariat alırsınız və,
00:01:09.00 yapışdırmanın ikinci addımında,
00:01:10.16 5' əlavə sahəsinin 3'-OH qrupu yenidən hücum edir,
00:01:14.22 lariat intron və ligated eksonları buraxmaq.
00:01:19.07 Bu sizə tanış görünməlidir
00:01:20.13 çünki katalizləşdirilmiş eyni reaksiya növüdür
00:01:23.12 nüvə spliceosomunuz tərəfindən,
00:01:25.06 bütün RNT-lərimizi emal etmək üçün vacib olan birləşdirmə maşınıdır.
00:01:30.14 Bunu perspektivə qoymaq üçün,
00:01:32.10 anlayın ki, pre-mRNA-larınızın və ya prekursor mesajlarınızın əksəriyyəti,
00:01:37.15 10 introna qədər və bəzən daha çox olur.
00:01:40.29 Və bunlar spliceosomunuzun funksiyası vasitəsilə aradan qaldırılmalıdır.
00:01:44.16 Beləliklə, spesifikliyi başa düşməyimiz çox vacibdir
00:01:47.02 və bu reaksiyanın mexanizmi.
00:01:50.02 Model sistem olaraq,
00:01:50.25 Mən Qrup II intron öz-özünə əlavə etmə sisteminə diqqət yetirdim.
00:01:55.03 Bu sistemlər arasındakı fərq bükülmüş quruluşdur
00:01:58.07 intronun özü bu reaksiyanı katalizləyir
00:02:01.25 heç bir zülal olmadıqda,
00:02:03.25 Spliceosom isə yüzlərlə zülal tələb edir
00:02:07.23 və çox yüksək dərəcədə qorunan RNT molekulları dəsti
00:02:09.28 eyni reaksiyanı kataliz etmək.
00:02:12.08 Beləliklə, onlar birləşdirmə mexanikasını anlamaq üçün faydalı paralel sistemlərdir.
00:02:19.21 Beləliklə, II Qrup intronlarının necə göründüyünə bir az daha diqqət yetirək:
00:02:23.02 onların domen arxitekturası və ikincil strukturu altı kök və ya domendən ibarətdir
00:02:27.27 bu kimi mərkəzi təkərdən yayılan.
00:02:31.13 Domain 1 və ya ən böyük domen,
00:02:33.14 həmişə ilk olaraq transkripsiya edilir və qatlanır
00:02:36.23 və bu, bütün digər domenlərin bağlandığı iskele domeninin bir növüdür.
00:02:40.28 O, həmçinin hədəfləri tanımaq üçün ardıcıllıqları ehtiva edir
00:02:44.08 hücum edəcək və parçalanacaq,
00:02:46.02 xüsusilə öz 5 'eksonu.
00:02:49.10 Digər domenlər kataliz üçün kritik deyil,
00:02:52.03 lakin II Qrup intronun ən vacib hissəsidir
00:02:54.20 Domen 5 adlanan bu kiçik saç tıxacıdır.
00:02:58.16 Qrup II intronun yeganə hissəsidir
00:03:00.29 Müxtəlif növlər arasında demək olar ki, dəyişməz
00:03:03.25 və bu maraqlıdır, çünki II qrup intronlar nəhəng molekullardır.
00:03:07.20 Onların ölçüsü 400-1000 nukleotiddir
00:03:10.23 və ironikdir ki, burada yalnız bu 34 nukleotid azdır.
00:03:14.20 onun ən qorunan xüsusiyyətidir.
00:03:17.16 II Qrup intronun digər mühüm hissəsi Domain 6,
00:03:20.12 və bu adenozini ehtiva edən sahədir
00:03:22.28 Birləşmənin ilk addımı üçün nükleofili daşıyır.
00:03:26.15 Qrup II intronlarının çoxu ilk addım üçün sudan nukleofil kimi istifadə edir.
00:03:31.11 Beləliklə, II qrup intronun əsas təşkilati planı budur.
00:03:36.03 Onların reaksiya mexanizmi nədir?
00:03:38.03 Çox sadə SN2 reaksiyasını katalizləyirlər,
00:03:41.11 sıra içərisində nükleofilik hücumdur,
00:03:43.18 2'-OH qrupu olan bir spirt
00:03:48.23 başqa bir riboza və ya su,
00:03:50.27 bu fosfatda in-line hücumları,
00:03:53.05 sizə triqonal bipiramidal ara məhsul verir
00:03:57.07 və bu fosfat və 3'-OH qrupunun buraxılması
00:04:01.06 konfiqurasiyanın çevrilməsi ilə.
00:04:03.29 Kimyəvi biologiya üsullarından istifadə edərək,
00:04:05.27 Joe Piccirilli bunun bir reaksiya olduğunu anladı
00:04:09.28 Qrup II intronun nüvəsindəki metal ionları ilə katalizlənir.
00:04:14.26 Və beləliklə II qrup intronlar, bir çox ribozimlər kimi,
00:04:17.07 lakin hamısı deyil,
00:04:17.22 bir metalloenzimdir və metalları aşağıdakı şəkildə istifadə edir.
00:04:23.25 O, maqneziumların ayrılan qrupu koordinasiya etdiyini göstərdi
00:04:26.26 və nükleofil
00:04:27.28 mənfi yük yığılmasını sabitləşdirmək
00:04:30.23 bu keçid vəziyyətində.
00:04:33.03 Beləliklə, bu nisbətən sadə bir reaksiyadır
00:04:34.27 və həm birinci, həm də ikinci addımlarda demək olar ki, eyni reaksiyadır
00:04:37.26 birləşmə.
00:04:42.10 Beləliklə, biz bu RNT-lərin əsas bədən planını bilirdik
00:04:44.20 və biz onların hansı reaksiyanı katalizlədiyini bilirdik,
00:04:47.12 lakin biz kimyəvi katalizin dəqiq mexanizmini həqiqətən başa düşmədik.
00:04:51.19 Və biz də bu RNT-nin ehtimal olduğunu bilirdik
00:04:53.22 hər cür maraqlı üçüncü struktur motivlərə sahib olmaq.
00:04:57.24 Beləliklə, bu molekulun arxitekturasını anlamaq istəsək
00:05:00.27 və onun dəqiq mexanizmi,
00:05:03.00 bizə yüksək ayırdetmə kristal quruluşu lazım idi.
00:05:06.18 Beləliklə, əsas olaraq, edə biləcəyimiz şey ikinci dərəcəli strukturdan getmək idi,
00:05:10.25 və ya molekulun yol öldürmə xəritəsi, mən onu adlandırmaq istəyirəm,
00:05:14.06 üçüncü struktura.
00:05:16.12 Və mən sizə bu səyahət haqqında bir az danışacağam
00:05:18.15 və necə bir əlavə maşının nüvəsini görselleştirmeye başladıq.
00:05:25.01 Hamısı II Qrup intronun müəyyən edilməsi ilə başladı
00:05:28.02 asanlıqla kristallaşacaq.
00:05:29.28 Və biz bu molekulu təxminən 10 il axtardıq,
00:05:32.24 Qrup II intronlarının çox, çox müxtəlif növlərinə baxır
00:05:35.08 və son dərəcə sabit və kristallaşa bilən birini tapmağa çalışır.
00:05:39.09 Nəhayət, asanlıqla kristallaşan birini tapdıq
00:05:42.29 eubacterium Oceanobacillus iheyensis ardıcıllığında.
00:05:47.07 Və biz bu molekulu transkripsiya etdikdə,
00:05:49.01 biz onun özünü birləşdirdiyini və sabitləşdiyini gördük
00:05:51.20 çox aşağı maqnezium fizioloji ionlarında və temperaturda.
00:05:56.08 Və beləliklə, perspektivli bir namizəd idi.
00:05:59.27 Biz daha sonra bu molekulun təxminən 120 fərqli konstruksiyasını yaratmağa davam etdik.
00:06:04.20 onu qablaşdırmağa çalışmaq üçün
00:06:07.11 və gözəl kristallar düzəldin
00:06:09.01 hansı quruluşu həll edə bildik.
00:06:12.07 Və bütün bu konstruksiyaların 87 nömrəsi,
00:06:14.27 nəhayət 3.1 Angstrom qətnaməsinə kristallaşdı,
00:06:18.11 strukturun həlli üçün hədəf aralığındadır.
00:06:21.04 Və yalnız bu molekulu necə dəyişdirdiyimizi göstərmək üçün
00:06:23.23 kristallaşmanı tədricən yaxşılaşdırmaq üçün,
00:06:25.17 bilməlisiniz ki, biz bütün bu müxtəlif sapların uzunluqlarını dəyişdirmişik,
00:06:29.00 döngə tərkibi,
00:06:30.25 çox, çox fərqli şeyləri dəyişdi
00:06:32.12 molekulun qablaşdırılması və kristallaşma qabiliyyətini optimallaşdırmaq üçün.
00:06:37.10 Nəhayət, kristalın keyfiyyət səviyyəsinə çatdıqdan sonra,
00:06:43.03 X-ray kristaloqrafiyasından istifadə edərək onun strukturunu həll edə bildik.
00:06:47.07 Bu rəqəmi sizə göstərmək istəməyimin səbəbi,
00:06:49.07 Oceanobacillus intronun elektron sıxlığını göstərir,
00:06:53.28 bunu sizə göstərməkdir,
00:06:55.03 ilk dəfə elektron sıxlığına nəzər saldığınız zaman,
00:06:58.09 və ya kristalloqrafik təcrübənin nəticəsi,
00:07:00.22 görünən gözəl sarmalları görə bilərsiniz
00:07:04.06 və siz molekulun ümumi planını çox yaxşı görə bilərsiniz
00:07:07.22 RNT vəziyyətində.
00:07:09.07 Zülallarda onu görmək çox vaxt daha çətindir
00:07:11.19 RNT-də olduğundan ikinci dərəcəli struktur xüsusiyyətləri.
00:07:16.18 Beləliklə, bu, bu molekula ilk baxışımızın təsviri idi.
00:07:21.14 Nəhayət bütün nukleotidləri bu xəritədə modelləşdirə bildiyimiz zaman,
00:07:26.08 biz bu intronun tam strukturunu əsasən həll edə bildik.
00:07:32.00 Və bunun diqqətəlayiq kürəşəkilli bir forma olduğunu dərhal görə bilərsiniz.
00:07:37.01 Bu sadə ikiqat sarmal deyil
00:07:38.14 və bu, nizamsız bir sıra iplər deyil,
00:07:40.26 çox yığcam qlobular molekuldur,
00:07:43.09 qlobular zülal haqqında düşündüyünüz qədər.
00:07:46.03 Diqqətə layiq olan bir sıra memarlıq xüsusiyyətləri var
00:07:49.10 və mən bir anda bunlara diqqət yetirəcəyəm.
00:07:51.24 Ancaq burada yuxarıda bir növ iskele olduğunu görə bilərsiniz,
00:07:56.13 və o, aktiv saytın daxil olduğu bir boşluq yaradır.
00:08:00.26 Aktiv sayt bu qırmızı dupleksdir,
00:08:03.26 və bu daha əvvəl sizinlə danışdığım Domain 5-dir.
00:08:06.27 Çox, çox yüksək qorunan RNT
00:08:09.06 Bir müddətdir ki, aktiv sayt olacaq.
00:08:12.21 Və maraqlısı budur ki, burada ucları çıxaran bu sarmallar,
00:08:18.16 bunlar çox vaxt II qrup intronların kodlaya biləcəyi boşluqları ehtiva edir
00:08:21.28 intron ardıcıllığının özündə daşınan zülallar üçün açıq oxu çərçivələri.
00:08:27.00 Və maraqlıdır, çünki görə bilərsiniz ki, əgər bu RNT daha böyük olsaydı
00:08:31.19 uzanacaq və yoluna mane olmayacaqdı
00:08:34.04 ribozim aktiv sahəsi burada qatlanmış vəziyyətdədir.
00:08:42.17 Beləliklə, bu molekula diqqətlə baxarkən,
00:08:44.23 biz çox şey öyrənə bildik,
00:08:46.09 və sizə danışacağım ilk şey
00:08:49.05 bizə üçüncü dərəcəli qarşılıqlı təsirlər haqqında məlumat verməsidir
00:08:52.08 və RNT-də üçüncü dərəcəli struktur xüsusiyyətləri.
00:08:54.26 Bu molekulun aşkar etdiyi bir çox yeni anlayışlar var idi
00:08:57.11 və onların əksəriyyəti intron Domain 1 daxilində idi.
00:09:01.20 Xatırladım ki, II Qrup intronun 5'-ən domeni
00:09:05.04 əvvəlcə qatlanır və o, avtonom şəkildə qatlanır
00:09:07.16 xüsusi bir üçüncü struktura.
00:09:10.14 II Qrup intronun strukturunda,
00:09:12.22 biz bunu burada görə bilərik.
00:09:14.24 İntronun qalan hissəsi boz rəngə çevrildi
00:09:17.04 Beləliklə, bütün bu rənglərdə Domain 1-ə diqqət yetirə bilərsiniz.
00:09:22.11 Bu domen daxilində bir sıra çox maraqlı motivlər var
00:09:24.11 və mən sizə onlardan bir neçəsini göstərəcəyəm.
00:09:27.25 Məsələn, onlardan ikisi mənim diqqət etməyi xoşlayıram burada göstərilir.
00:09:32.09 Və strukturda harada olduqlarını göstərmək üçün,
00:09:35.07 və ikinci dərəcəli quruluşdakı bu bölgə beş yollu bir qovşaqdır,
00:09:38.25 təsəvvür etdiyiniz kimi,
00:09:40.01 bütün bu sarmallar üçün olduqca mürəkkəb bir arxitektura qəbul etməlidir
00:09:44.03 düzgün istiqamətə işarə etmək və üçüncü qatın meydana gəlməsi üçün.
00:09:48.02 Beləliklə, sizə üç ölçülü məkanda bu beş yollu qovşağı göstərməyə icazə verin.
00:09:52.11 Buradakı quruluş budur.
00:09:55.00 Bu, üçüncü dərəcəli qarşılıqlı təsirlərin əlamətdar dəstidir
00:09:57.16 və birləşdirilmiş motivlər.
00:10:00.18 Ən çox sevdiyim, burada T-loop motivi adlanır,
00:10:03.23 və gördüyünüz bu mavi dönüşdür
00:10:07.09 strukturlarda tez-tez gördüyümüz motivi xatırladır,
00:10:11.21 GNRA tetraloop adlanır,
00:10:15.21 amma demək olar ki, içində bir deşik var:
00:10:18.01 Bu mövqedə baza çatışmır
00:10:20.07 və o, gələn adenozinlə doldurulur
00:10:23.00 molekulun bu boz hissəsindən.
00:10:25.02 Beləliklə, bu RNT-nin çox hissəsi eyni şəkildə bir yerdə saxlanılır
00:10:28.16 köhnə moda bir masa qurulardı,
00:10:30.25 yivlərə oturan və bir yerdə tutan dirəklərlə
00:10:34.00 bütün iskele bu şəkildə,
00:10:35.27 və ilk növbədə baza yığma qarşılıqlı təsirləri ilə sabitləşdi.
00:10:40.04 Və daha çox qorunan yığma qarşılıqlı əlaqəni görə bilərsiniz
00:10:43.14 və burada bu mövqedə formalaşan şəbəkələr.
00:10:47.16 Molekulun mənim üçün başqa bir sevimli hissəsi Z-lövbər adlanır.
00:10:52.01 Və ikinci dərəcəli strukturda,
00:10:54.08 bunun mexanizm olduğunu görə bilərik
00:10:57.03 yaşıl sarmal əslində mükəmməl paralel olur
00:11:02.09 narıncı sarmal ilə, burada, bu quruluşda gördüyünüz kimi.
00:11:05.18 Beləliklə, bu iki sarmal yan-yana olmalıdır.
00:11:09.00 Bu necə işləyir?
00:11:10.24 Onların içərisindəki iki döngə aşağıdakı şəkildə bir-birinə əriyir.
00:11:14.25 Beləliklə, burada narıncı sarmal, yaşıl sarmalın bir hissəsi,
00:11:19.01 və narıncı sarmal yarandıqda baş verənlər,
00:11:22.09 Burada normal əsas cütlər olduğunuzu görürsünüz,
00:11:25.20 və sonra əsaslardan biri fırlanır
00:11:27.29 və başqa bir narıncı iplə əsas cüt yaratmaq əvəzinə,
00:11:31.06 yaşıl iplə əsas cüt təşkil edir.
00:11:34.00 Onun növbəti qonşusu gəlir və əsas cüt təşkil edir
00:11:36.24 başqa bir narıncı iplə,
00:11:38.14 və sonra növbəti baza yenidən fırlanır,
00:11:41.14 Bazalar və iki tel arasında bu əlaqə ziqzaqını yaratmaq,
00:11:46.02 bir tək ipdən daha çox.
00:11:49.03 Beləliklə, bu üç telli quruluş həqiqətən maraqlı bir yoldur
00:11:51.27 RNT-lər mərkəzi ipin tanınmasını şaxələndirə bilər.
00:11:59.09 Qoz-fındıq və boltlar üçün başqa bir konsepsiya
00:12:01.29 aşkar edilmiş RNT-ni bir araya gətirmək üçün
00:12:04.08 və II Qrup intronu ilə nümunə göstərilmişdir
00:12:09.11 riboza fermuar motividir.
00:12:11.03 Bu əslində ilk dəfə 1996-cı ildə Cate və Doudna tərəfindən təsvir edilmişdir.
00:12:14.09 ilk yüksək keyfiyyətli kristalloqrafik strukturlardan birində
00:12:17.16 mürəkkəb RNT molekulu.
00:12:20.16 Və göstərdikləri şey bu mühüm konsepsiyadır:
00:12:24.11 riboza şəkərinin 2'-OH qrupu çox yapışqandır
00:12:27.07 və ikiləşmiş hidrogen bağları yarada bilər
00:12:29.28 RNT iplərini birləşdirə bilən.
00:12:32.23 Beləliklə, burada bir RNT zənciriniz varsa,
00:12:34.25 və burada bir RNT ipi,
00:12:36.19 onlar bir araya gələ bilərlər
00:12:39.06 2'-OH qruplarının interdigitasiyası ilə.
00:12:42.23 Qrup II intronun bir çox yerində gördüyümüz də məhz budur.
00:12:47.05 Xüsusilə, burada yuxarıda,
00:12:49.16 alfa-alfa adlı uzun məsafəli öpüşmə döngəsi qarşılıqlı əlaqəsi var,
00:12:53.25 və mən sizə bu təsvirdə bu əsas cütləri burada göstərirəm,
00:12:58.15 həmin qarşılıqlı əlaqənin sonunda,
00:13:00.07 RNT zəncirləri burada gördüyünüz kimi bir-birinə çox, çox yaxınlaşır.
00:13:04.19 Və bunu etdikdə,
00:13:05.21 fermuarlar və ribozlar və 2'-OH qrupları bu şəbəkəni təşkil edir
00:13:11.20 bütün ansamblı bir-birinə yapışdırmağa xidmət edir.
00:13:18.21 Beləliklə, biz üçüncü dərəcəli qarşılıqlı əlaqələr haqqında danışdıq
00:13:20.25 bu mürəkkəb quruluş tərəfindən aşkar edilmişdir.
00:13:23.14 İndi baş verənlər haqqında sizinlə bir az daha danışmaq istəyirəm
00:13:25.24 intronun aktiv saytında
00:13:28.02 və kimyanı necə kataliz edir.
00:13:30.29 Beləliklə, məni uzun müddət çaşdıran şeylərdən biri
00:13:33.00 ikinci dərəcəli quruluşa baxanda
00:13:36.13 və II Qrup intronun konservativ xüsusiyyətləri bunlar idi,
00:13:39.11 Domen 5 çox yüksək qorunub saxlanılsa da,
00:13:42.16 qəribə və yüksək səviyyədə qorunma var idi
00:13:45.10 Domenlər 2 və 3 arasındakı bu qovşaqda.
00:13:48.24 Və mən merak etdim, niyə o qovşaqda bir neçə nukleotid var
00:13:52.16 Domen 5 kimi qorunur.
00:13:55.15 Və cavab ortaya çıxan strukturdan gəldi
00:13:57.01 onların eyni səviyyədə saxlanmasının səbəbi
00:13:59.29 odur ki, onlar eyni struktur qurumun bir hissəsidir.
00:14:03.12 Həmin qovşağın içəri girdiyini görə bilərsiniz
00:14:05.08 və qırmızı sarmalın əsas yivində bağlanır.
00:14:10.05 Yaxından bu kimi görünür:
00:14:12.09 gözəl üçlü sarmal əmələ gətirir,
00:14:14.17 Beləliklə, bu birləşmə nukleotidləri daxil olur
00:14:18.01 və əsas yiv kənarı ilə hidrogen bağları yaradır
00:14:21.17 Domen 5-in aşağı gövdəsi
00:14:24.05 və başqa biri Domain 5-in başqa sektorundan formalaşır.
00:14:30.04 Beləliklə, bu üçlü sarmal,
00:14:32.28 bu mövqedə RNT onurğasında kəskin bükülmə ilə birlikdə,
00:14:37.14 Qrup II intron nüvəsində çox güclü metal ion platforması yaradın.
00:14:43.15 Bunun baş verməsinin səbəbi, burada təsəvvür edə bilməyinizdir,
00:14:46.27 bir araya gələn çoxlu, çoxlu fosfatlar var
00:14:50.02 çox, çox kiçik bir məkanda,
00:14:51.24 molekulun bu bölgəsindəki elektrostatik potensial
00:14:55.02 həddindən artıq olur
00:14:56.28 və bu, çox, çox əlverişli olur
00:14:58.23 xüsusi nöqtələrdə metal ionlarının bağlanmasına.
00:15:02.00 Və həqiqətən də görürsən
00:15:03.14 iki divalent kation bu mövqedə bağlanır
00:15:06.17 tam 3.9 Angstrom ayrı.
00:15:10.13 Və bu, çox vaxt fermentlər üçün bir imzadır
00:15:14.01 riboza və ya deoksiriboza birləşməsinin parçalanmasını kataliz edən
00:15:18.14 iki metal ion mexanizmi vasitəsilə.
00:15:23.12 Beləliklə, etdiyimiz iş və əlavə iş vasitəsilə,
00:15:26.03 biz bildik ki, bu mövqelərdə 1 və 2 metallar
00:15:30.01 həqiqətən birləşdirmək üçün lazım olan katalitik metal ionlarıdır,
00:15:33.26 Joe Piccirilli kimyəvi biologiya təcrübələrindən proqnozlaşdırdığı kimi.
00:15:37.29 Və onlar qayçı əlaqəsi üzərində dayanırlar
00:15:40.13 bu bağı hədəf substratda parçalamaq.
00:15:45.10 Beləliklə, bu çox razı idi, çünki aydın idi
00:15:47.07 digər fermentlərə bəzi cəhətdən oxşar olan bir metalloenzimimiz var idi
00:15:51.28 və hələ biz bunun bütün hekayə olmadığını bilirdik.
00:15:55.05 Və bunun səbəbi kristalloqrafik qətnamədə
00:15:59.01 biz bu molekulu öyrənmək üçün istifadə edirdik,
00:16:01.02 biz digər metal ionları ilə uyğun gələn əlavə elektron sıxlığını gördük.
00:16:05.21 Lakin məlumatlar onların mövqeyini birmənalı şərh etmək üçün kifayət qədər yaxşı deyildi.
00:16:09.22 Biz bunun üzərində daha çox çalışdıq,
00:16:11.26 ayırdetmə qabiliyyətini artırmaq və anormal səpilmədən istifadə etmək,
00:16:14.15 metal ionlarının mövqeyini mismarlamaq üçün bir vasitədir.
00:16:19.25 Xüsusilə, kristallarımızın ayırdetmə qabiliyyətini yaxşılaşdırdıqda,
00:16:24.07 metal ionlarının olması ehtimalının çox olduğunu gördük
00:16:27.06 həm də bu mövqedə və bu mövqedə.
00:16:30.18 Və ətrafdakı RNT-nin onlarla qarşılıqlı əlaqəsinə görə,
00:16:34.03 çox güman ki, bunlar kalium ionları idi.
00:16:37.09 Beləliklə, bu bizim üçün təəccüblü idi,
00:16:38.26 sadə monovalent kation görünə bilər
00:16:41.10 aktiv saytda belə mühüm rol oynamaq.
00:16:45.02 Bu barədə həqiqətən güclü bir bəyanat vermək üçün,
00:16:46.26 biz onların mövqeyini birmənalı şəkildə müəyyən etməli olduq,
00:16:49.21 və bu, onları ağır bir ion ilə əvəz etməklə edildi
00:16:52.26 X-şüalarını olduqca yaxşı difraksiya edir
00:16:56.20 və bu, kalium üçün yaxşı bir təqliddir.
00:16:58.28 Beləliklə, biz daha 14 kristal quruluşu həll etdik
00:17:02.08 metalların bütün bu müxtəlif birləşmələrində intronun.
00:17:06.09 Xüsusilə, diqqətinizi bu vəziyyətə cəlb edəcəyəm,
00:17:09.01 burada kalium talliumla əvəz olundu
00:17:12.18 və maqnezium eyni saxlanıldı.
00:17:15.06 Və bu quruluşda,
00:17:16.16 fərq xəritəsindən görə bilərsiniz
00:17:18.16 tallium dəqiq mövqeləri tutur
00:17:22.23 hipotez etdiyimiz kalium tərəfindən işğal edilmişdir.
00:17:25.25 Və ion radiusunda və funksiyasındakı oxşarlıqlarına görə
00:17:29.23 və paralel rubidium məlumatları ilə oxşarlıq,
00:17:32.23 eyni şeyi edir,
00:17:34.16 biz kalium əldə etdiyimizə əmin olduq
00:17:37.09 aktiv saytın mühüm tərkib hissəsi kimi.
00:17:43.00 Beləliklə, bu xüsusi struktur dəstində,
00:17:46.00 biz pulsuz introna baxırdıq,
00:17:48.05 heç bir substrat bağlanmadan,
00:17:50.06 ağlabatan yaxşı qətnamə ilə.
00:17:52.09 Və bu halda aşağıdakı şəkli görə bildik:
00:17:55.08 biz iki divalent metal ionunun olduğunu görə bildik
00:18:00.16 (bir substrat olmadıqda, onlar su ilə əlaqələndirilmişdir)
00:18:01.14 və onlara çox, çox yaxın olan kaliumların olduğu aydın idi.
00:18:05.18 Biz yaxın olanları K1 və K2 adlandırdıq.
00:18:09.12 Yaxın yoxlama K1-in demək olar ki, əsas daşı kimi olduğunu ortaya qoydu
00:18:13.08 Metal 2 (M2) saytının formalaşması üçün.
00:18:16.03 Beləliklə, kimya üçün mütləq tələb olunan bu katalitik metal ionu,
00:18:19.20 liqandların təşkili ilə yerində saxlanılır
00:18:22.25 bu kalium tərəfindən yerləşdirilir.
00:18:25.16 Və sonrakı strukturlar göstərdi,
00:18:27.03 bir azdan sizə danışacağam,
00:18:28.29 mutasiya yolu ilə bu saytı qarışdırsanız
00:18:33.00 və ya yanlış ölçülü metal ionu ilə əvəz edilməsi,
00:18:35.14 Metal 2 bağlanmır və ribozimi öldürür.
00:18:41.14 Beləliklə, bu, bizə izah etmək üçün sadəcə bir nəzarət təcrübəsi idi
00:18:43.17 bütün bu qəribə, anormal səpilmə ionlarında,
00:18:46.29 biz hələ də ribozim kimyası alırdıq, ya yox.
00:18:50.26 Beləliklə, bu normal vəziyyətdir,
00:18:52.23 Burada bir xəbərçi RNT-nin intron fraqmentinə və ekzonik fraqmentlərə bölündüyünü görürsünüz.
00:18:58.24 Və burada görə bilərsiniz ki, talliumda,
00:19:01.02 demək olar ki, daha xoşbəxtdir: siz intron və ekzonik komponentlərə gedən xəbəri görürsünüz,
00:19:06.17 və hətta ara vəziyyət vasitəsilə,
00:19:08.06 kalium vəziyyətindən daha sürətli sürətlə.
00:19:10.18 Beləliklə, hətta tallium və maqneziumda belə,
00:19:12.28 bu çox xoşbəxt bir fermentdir,
00:19:14.21 talliumun kalium yerlərini əvəz etməsi məntiqlidir.
00:19:20.11 Beləliklə, indiyə qədər sizə göstərdiyim hər şey intronun məhsul vəziyyətində olmuşdur.
00:19:25.27 Bu, bioloji cəhətdən uyğun bir vəziyyətdir
00:19:28.09, çünki bu sərbəst intron tərs birləşməyə qadirdir
00:19:32.16 oxşar ardıcıllığın RNT-lərinə və hətta DNT-yə.
00:19:36.14 Buna görə də əhəmiyyəti var,
00:19:37.29 amma eyni zamanda çox maraqlı idim
00:19:39.29 birləşmədə aktiv sahənin rolu,
00:19:42.20 və mən birləşdirmənin ilk addımını vizuallaşdırmaq istədim.
00:19:45.21 Birləşməyə baxmaq üçün 5' eksonunuz olmalıdır
00:19:48.04 intronun birinci domeninə bağlıdır.
00:19:51.19 Beləliklə, bu tikinti idi
00:19:52.24 daha əvvəl sizə söylədiyim məlumat üçün istifadə edilmişdir,
00:19:56.29 yenisini yaratmalı olduq
00:19:58.13 və tamamilə yeni strukturlar ansamblını həll edin
00:20:01.25 5' ekson əlavə edildi.
00:20:03.18 Və biz bunu etdik.
00:20:06.07 Həm də bütün qeyri-adi metal ionlarının varlığında.
00:20:09.28 Və aşağıdakı maraqlı şeyi görürsünüz
00:20:11.29 5' ekson əlavə edildikdə:
00:20:14.20 kimyanın baş verəcəyi kəsici əlaqəni görə bilərsiniz,
00:20:17.20 katalitik maqnezium ionlarının üzərinə daxil edilir
00:20:21.18 və siz qayçı fosfatın hazır olduğunu görə bilərsiniz
00:20:23.13 nukleofil su ilə hücuma məruz qalacaq,
00:20:25.29 biz də müşahidə edə bildik.
00:20:28.24 Və iki kalium görə bilərsiniz
00:20:30.13 aktiv saytı dəstəkləməkdə mühüm rol oynayır.
00:20:33.24 Bu quruluşu kalsiumun varlığında əldə etdik
00:20:36.22 və bu xüsusi vəziyyətdə fosfat parçalanmır.
00:20:40.03 Ancaq maqnezium əlavə etdiyiniz zaman,
00:20:42.12 dekolte görürsünüz
00:20:43.25 və parçalanmış fosfatın köç etdiyini görürsən
00:20:46.05 bu mövqedən kalium 2-ə keçin.
00:20:49.27 Beləliklə, bu, kalium 2-nin mexanizmdə əsas rol oynadığını söyləyir:
00:20:53.26 sabitləşdirmək üçün vacibdir
00:20:55.18 ilk addım reaksiyasının məhsulu.
00:20:58.12 Beləliklə, hər bir metal ionunun bütün prosesdə mühüm rolu var.
00:21:06.05 Beləliklə, mən sizə K1 və K2 haqqında danışdım,
00:21:07.29 M1 və M2,
00:21:09.09 amma bunun sizi düşündürməsinə imkan verməyin
00:21:11.18 bunlar strukturdakı yeganə vacib metallardır.
00:21:14.13 Bunlar kimya üçün çox vacib olanlardır,
00:21:16.21 lakin metal ionlarının tutulması ilə bağlı gördüyümüz əlavə işlər
00:21:20.22 bütün bu RNT-də bizə çoxlu metal ionlarının olduğunu göstərir
00:21:24.29 Bu RNT boyu yüksək doluluq var
00:21:27.24 və müxtəlif üçüncü dərəcəli quruluş motivlərini dəstəkləyir.
00:21:31.28 Metal ionları RNT molekullarının təşkilində mühüm rol oynayır
00:21:36.28 və buna görə də biz bunları da araşdırmağa davam edirik.
00:21:43.12 Beləliklə, indiyə qədər nə öyrəndik?
00:21:46.05 İntron bizə kimyəvi səviyyədə pre-mRNT birləşmə mexanizmi haqqında öyrətdi,
00:21:50.07 lakin bu, katalizator kimi RNT haqqında bəzi yeni fikirləri də ortaya qoydu.
00:21:54.18 Bizə aşağıdakı anlayışları göstərdi:
00:21:57.03 Ribozim kimyası üçün təkcə ikivalentli ionların deyil,
00:22:01.19 monovalent ionlar da rol oynaya bilər,
00:22:04.13 və kalium həm quruluşda, həm də katalizdə xüsusilə vacibdir.
00:22:09.29 II qrup intron birləşməsi zamanı,
00:22:11.14 kalium 1 və 2-nin hər birinin rol oynadığını görürük
00:22:14.24 vacib olan mexanizmdə.
00:22:16.26 Bu o deməkdir ki, II qrup intronlar,
00:22:18.00 və bəlkə də digər ribozimlər,
00:22:19.22 sadə iki metal ion fermenti deyil.
00:22:23.00 Əslində, protein fermentləri kimi,
00:22:24.18 metal klasterlərdən istifadə edə bilərlər,
00:22:26.26 zülal dünyasında çox, çox yayılmış bir nümunədir.
00:22:30.23 Beləliklə, müxtəlif növ ionlardan ibarət heteronuklear metal qrupları,
00:22:34.13 mühüm mövzu ola bilər.
00:22:37.19 Və bu da bizi ona gətirir ki, üst-üstə düşəndə
00:22:40.01 Zülal fermentləri ilə qrup II intronun aktiv sahəsi,
00:22:43.07 mühüm paralelləri görə bilərsiniz
00:22:44.13 kimya etdikləri şəkildə.
00:22:49.13 Beləliklə, indi sizə bir az danışacağam
00:22:51.11 Bu quruluşun natrium formasından öyrəndiklərimiz,
00:22:54.23, çünki o, bizə ilk dəfə bir var olduğunu ortaya qoydu
00:22:57.26 Qrup II intron aktiv sahəsi daxilində alternativ uyğunluq.
00:23:01.14 Bunu necə şərh etdiyimizi sizə deyəcəyəm.
00:23:05.00 Beləliklə, biz çoxdan bilirik ki, təsadüfən buferlərinizi yaratsanız,
00:23:08.18 və ya iştirak edən bir reaksiyaya hər hansı bir natrium əlavə edin
00:23:11.22 işlədiyimiz II Qrup intronlarından hər hansı biri,
00:23:14.05 heç bir reaksiya kimyası görmürsən.
00:23:15.24 Siz heç bir əlavə görmürsünüz.
00:23:17.17 Beləliklə, bunun mənası var, çünki natrium kalium ilə eyni ion radiusuna malik deyil
00:23:21.16 və o, kalium sahələrinə uyğun gəlmir.
00:23:24.12 Və əminik ki, intronun natrium formasını görürük.
00:23:27.11 alternativ aktiv sayt uyğunlaşmasını qəbul edir.
00:23:32.14 Konformasiya keçidi kimi görünənləri görürük
00:23:35.01 iki əsasın fırlanmasını əhatə edən iki yapışdırma addımı arasında,
00:23:39.11 biri burada, biri burada.
00:23:42.14 Gördüyümüz odur ki, intronun əvvəlki formasında,
00:23:44.24 Burada bu əsas yiv üçlüyü var
00:23:47.29 və RNT onurğasında sıx dönüşünüz var,
00:23:50.20 və natrium şəklində, bu əsaslardan ikisi çevrildi.
00:23:54.22 Bir halda, 70 dərəcə
00:23:56.05 və bir halda katalitik guanozin molekullarından biri
00:23:59.21 bu mövqedən bura qədər hərəkət edir,
00:24:02.17 indi tamamilə fərqli bir domenlə əlaqə qurur: Domain 3.
00:24:06.26 Bu cür memarlıq yenidən təşkili baş verdikdə,
00:24:10.02 Aktiv sahədəki metal ionları əslində tərk edir
00:24:13.02 və o, aktiv saytda böyük bir açıq çuxur yaradır.
00:24:17.02 Bu, əslində lazımdır
00:24:18.08 çünki birləşdirmə addımları arasında
00:24:21.02 İlk addım üçün reaktivlər yoldan çıxmalıdırlar
00:24:23.24 və ikinci addım üçün reaktivlər daxil olmalıdır.
00:24:26.10 Və buna görə də bunun ola biləcəyini fərz etdik
00:24:29.10 addımlar arasında baş verməli olan yenidən tənzimləmə
00:24:32.03 lazım olan dəyişikliklərə məruz qalmağınız üçün
00:24:34.04 əlavənin ikinci addımını stimullaşdırmaq və prosesi tamamlamaq.
00:24:38.15 Beləliklə, II qrup intron birləşməsini təsəvvür edirsinizsə
00:24:40.29 daha əvvəl izah etdiyim kimi, bu iki addımla yer alır,
00:24:44.11 yaxından bu aşağıdakı şəkildə baş verə bilər.
00:24:47.14 Biz bilirik ki, aktiv saytın təşkili, əvvəllər,
00:24:51.00 və birləşdirmənin ilk addımından dərhal sonra,
00:24:52.29 belə görünür,
00:24:54.11 iki katalitik metal ionları və dəstəkləyici kaliumlar ilə.
00:24:58.19 Və biz bunu bir aralıqda fərz etdik
00:25:01.05 iki dövlət arasında iki bazanın fırlanması daxildir.
00:25:06.18 Bundan sonra baş verir və yapışdırmanın ikinci mərhələsi qurulur,
00:25:09.22 siz aktiv saytın islahatı alırsınız
00:25:13.05 və metal ionları və başlanğıc vəziyyətinə qayıdın.
00:25:20.16 Beləliklə, aktiv saytın təşkili haqqında düşünsək
00:25:24.22 yapışdırmanın ilk addımı üçün,
00:25:26.08 yəni kimya üçün səlahiyyətli sayt,
00:25:30.10 biz bu məlumatı götürə bildik
00:25:33.12 və splicing təkamülü haqqında çox şey öyrənin
00:25:37.18 eukariotlarda.
00:25:40.03 Bunun səbəbi Qrup II intron quruluşudur
00:25:43.02 memarlığın necə olduğunu düşünmək üçün bir növ yol xəritəsi kimi xidmət etdi.
00:25:46.16 eukaryotik spliceosom təşkil edilə bilər.
00:25:50.21 Və bunu düşündüyüm səbəb aşağıdakılardır.
00:25:53.14 Domain 5, bütün aktiv sayt elementlərini ehtiva edən bu yüksək qorunan motiv,
00:25:58.10 burada bu kimi ikinci dərəcəli strukturda göstərilir.
00:26:01.16 Və bunlar nöqtəli xətlərdə,
00:26:03.11 kristal quruluşumuz tərəfindən aşkar edilən üçüncü dərəcəli qarşılıqlı təsirləri göstərdi.
00:26:08.01 Və biz bilirik ki, həqiqətən qorunan RNT molekullarından biri
00:26:12.05 spliceosomunuzda,
00:26:13.13 U6 kiçik nüvə RNT adlanır,
00:26:16.00, II qrup intronlarda həmişə Domain 5-i xatırladan ikinci dərəcəli bir quruluşa malikdir,
00:26:22.05 və uzun illər insanlar aralarında oxşarlığın olduğunu fərz edirdilər.
00:26:25.11 Hətta oxşar yerlərdə iki metal ionunu bağladılar.
00:26:29.11 Ancaq həll etdiyimiz struktur
00:26:31.17 U6-nın bir hissəsini təklif etdi
00:26:33.19 eyni molekulyar qarşılıqlı təsirləri edə bilər
00:26:36.03 Qrup II intronda müşahidə etdiyimiz.
00:26:39.14 Və Joe Piccirilli laboratoriyalarının son işi
00:26:42.18 və John Stahley Çikaqo Universitetində,
00:26:45.08 spliceosomal RNT istifadə edərək,
00:26:48.02 həqiqətən spliceosomal aktiv sahənin olduğunu göstərdi
00:26:50.26 II qrupa çox, çox bənzəyir.
00:26:53.24 Və əslində, spliceosomun M1 və M2
00:26:57.02 eyni şəkildə yerləşdirilir,
00:26:58.28 və proqnozlaşdırılan əsaslarla,
00:27:00.12 Qrup II intronda müşahidə edildiyi kimi.
00:27:03.08 Beləliklə, bu həyəcanvericidir, çünki o deməkdir ki,
00:27:05.19 çoxdan proqnozlaşdırıldığı kimi,
00:27:07.29 Qrup II intronlar və spliceosom
00:27:09.20 ümumi təkamül əcdadı paylaşa bilər.
00:27:15.04 Beləliklə, yekunlaşdırmaq üçün,
00:27:17.28 Oceanobacillus Qrup II intronlarının tədqiqatları vasitəsilə,
00:27:20.17 biz bir RNT əlavə edən maşının strukturunu və aktiv yerini vizuallaşdırdıq,
00:27:24.21 Qrup II nüvəsindəki metal ionlarını təyin etdik,
00:27:27.21 həm monovalentlər, həm də ikivalentlər üçün mühüm rollar tapmaq
00:27:30.18 quruluş və kimya.
00:27:32.24 Bu ribozim yeni metal ion klasterindən istifadə edir,
00:27:35.25 o deməkdir ki, RNT kimyası zülal kimyasından o qədər də fərqlənmir.
00:27:40.02 Metal klaster substrat olmadan da toxunulmazdır,
00:27:42.21 demək olar ki, bu fermentin dişləri var deməkdir
00:27:45.08 Məntiqlidir, çünki II qrup intronlar DNT-yə hücum edə bilən retroelementlərdir.
00:27:51.04 Biz struktur dəyişikliyi gördüyümüzə inanırıq
00:27:53.06 birləşdirmənin iki addımı arasında
00:27:55.02 və biz onun xüsusiyyətlərini xarakterizə etməyə başlaya bilərik.
00:27:58.25 Və başqalarının işinə görə,
00:28:00.11 indi aydın oldu ki, II qrup intronlar və spliceosom
00:28:03.03 demək olar ki, eyni aktiv sayta malikdir.
00:28:06.15 Beləliklə, II Qrup strukturu həqiqətən faydalı oldu
00:28:07.27 çünki bizə kimya, quruluş və təkamül haqqında öyrədilib.
00:28:12.29 Beləliklə, bütün bu işlər üç çox istedadlı insan tərəfindən edildi:
00:28:16.19 Nav Toor,
00:28:17.29 Marco Marcia,
00:28:19.09 və Kevin Keating,
00:28:20.11 Raj Rajashankarın böyük köməyi ilə
00:28:22.12 və Olga Fedorova.
00:28:23.09 Mən bu insanlara zəhmət və fədakarlıqlarına görə çox borcluyam.
00:28:26.26 Bu təqdimatı dinlədiyiniz üçün çox sağ olun.


RNT (ribonuklein turşusu): strukturu və növləri (diaqramlarla)

RNT-nin ilkin quruluşu DNT ilə eynidir. O, həmçinin 5 ′-3′ şəkər fosfat əlaqələri olan bir polinükleotid zənciridir. Lakin şəkər ribozadır və ümumiyyətlə tək zəncirli molekul kimi mövcuddur. Bu səbəbdən, tamamlayıcı əsaslar arasında bir-bir nisbəti yoxdur. Purinlərin miqdarı pirimidinlərin miqdarına bərabər deyil.

RNT-dəki dörd əsas bazadan biri timin əvəzinə urasildir (U). RNT-nin biofiziki xassələri ikinci dərəcəli quruluşu daha az göstərir. Bununla belə, əsasların ardıcıllığını eyni zəncirdə tamamlayıcı ardıcıllıqla izlədikdə, polinükleotid saç sancısı kimi tanınan antiparalel dupleks quruluş yaratmaq üçün öz üzərinə qatlana bilər.

Onun gövdəsi, əsas qoşalaşmış qoşa spiral nahiyəsi və bir ucunda qoşalaşmamış əsasları olan ilgək var (şək. 3.55). Bu bölgələrdə G də U ilə cütləşə bilər, lakin G-C cütü qədər güclü deyil.

Hüceyrələr üç növ RNT-xəbərçi RNT (mRNA), ribosomal RNT (rRNA) və transfer RNT (tRNT) ehtiva edir. Messenger RNT protein sintezi üçün şablon kimi xidmət edir. Bu molekulların çox heterojen sinfidir və çox qeyri-sabitdir. Normal hüceyrənin ümumi RNT-nin 2 – 5%-ni təşkil edir. İlk dəfə Hershey (1956) tərəfindən aşkar edilmişdir. Messenger RNT-nin adı və konsepsiyası ilk dəfə F.Jacob və J.Monod (1961) tərəfindən verilmişdir.

Ərinmiş DNT bəzi xüsusi m-RNT ilə yavaş-yavaş soyuduqda, DNT-RNT hibrid molekulları əmələ gəlir ki, bu da m-RNT-nin DNT dupleksinin şablon zəncirindən əmələ gəldiyini göstərir.

Ölçü baxımından çox heterojendir, çünki genlər və ya gen qrupları uzunluğa görə dəyişir. Prokariotlarda mRNT molekulunun tərcüməsi çox vaxt onun transkripsiyasının tamamlanmasından əvvəl başlayır, çünki mRNT-lər həm transkripsiya edilir, həm də 5-3-ə çevrilir və hər iki proses nüvə membranı ilə ayrılmır.

(i) mRNA-ların strukturu :

Messenger RNT-lər zülalların amin turşusu ardıcıllığını kodlayır. Fərdin həyatının müəyyən bir mərhələsində müəyyən bir hüceyrədə fərqli mRNA növlərinin sayı və növləri (transkriptomik = mRNT profili) həmin mərhələdə hüceyrədə mövcud olan müxtəlif zülalların (proteomika = zülal profili) sayı ilə müqayisə edilə bilər. Messenger RNT-lər ümumi hüceyrə RNT-nin 1%-dən 2%-ə qədərini təşkil edir.

Bütün mRNA-lar müəyyən xüsusiyyətlərə malikdir:

(a) Onlar xüsusi bir polipeptidi kodlayan davamlı nukleotidlər ardıcıllığını ehtiva edirlər

(b) Onlar sitoplazmada olur və

(c) Onlar ya ribosomlara bağlıdırlar, ya da tərcümə olunmaq üçün belə bir birləşməyə qadirdirlər.

(d) Polipeptidlər üçün müşahidə olunan molekulyar kütlələrin diapazonuna uyğun olaraq, mRNA-ların uzunluğu bir neçə yüz nukleotiddən bir neçə min nukleotidə qədər dəyişir.

(e) mRNA-lar ümumiyyətlə rRNA və tRNA-dan daha labildir, baxmayaraq ki, bəzi mRNA-lar üçün dövriyyə sürəti olduqca yavaşdır.

Əksər mRNA-larda əhəmiyyətli kodlaşdırılmayan seqment, yəni amin turşularının yığılmasına rəhbərlik etməyən bir hissə var. Məsələn, hər bir globin mRNT-nin təxminən 25 faizi kodlaşdırılmayan, tərcümə olunmamış bölgələrdən (UTR) ibarətdir. Kodlaşdırılmayan hissələr mesajçı RNT-nin həm 5, həm də 3-cü ucunda yerləşir və mühüm tənzimləyici rolları olan ardıcıllıqları ehtiva edir.

Kodlaşdırılmayan nukleotidlərə əlavə olaraq, eukaryotik mRNA-ların 5 və 3 terminallarında prokaryotik mesajlarda olmayan xüsusi modifikasiyaları var. Eukaryotik mRNT-lərin 5-ci ucunda metilləşdirilmiş quanosine “cap, ”- 3′-də poli(A) quyruğu əmələ gətirən 50-250 adenozin qalığından ibarət bir sıra var.

Başlama və bitirmə kodonları arasındakı ardıcıllıq açıq oxu çərçivəsini (ORF) təşkil edir. Bu uzunluqda çox dəyişkən olan 5′ və 3′ tərcümə edilməmiş bölgələrlə əhatə olunmuşdur. Nəticə etibarilə, mRNT-nin uzunluğu həmişə onun kodladığı amin turşusu ardıcıllığının uzunluğu ilə uyğun gəlmir.

5′ və 3′ UTR-lərin dəqiq funksiyası bir çox mRNT-lər üçün hələ də zəif başa düşülür, lakin çox vaxt bu bölgələrdə ikinci dərəcəli strukturlar yarada bilən və mRNT-nin daşınmasını, tərcüməsini və sabitliyini tənzimləyən zülallarla qarşılıqlı əlaqədə olan RNT ardıcıllığı olur.

3′ poliadenilat quyruğu DNT-də kodlaşdırılmır, lakin mRNT nüvədən sitoplazmaya ixrac edilməzdən əvvəl transkripsiyadan sonra əlavə olunur. Endonükleaza və poli(A) polimerazı ehtiva edən ferment kompleksi transkriptin 3-cü ucuna yaxın bir siqnal ardıcıllığını (5′ – AAUAAA – 3′) tanıyır, siqnaldan aşağı axındakı pre-mRNT-ni ayırır. , və 3’sonuna 20-250 adenozin qalığı əlavə edir.

Plastid və mitoxondrial mRNT-lərin quruluşu sitoplazmatik mRNT-dən fərqlənir. Orqanellar mRNA-lar həm 5′ qapaq, həm də poli(A) quyruğu ilə üz-üzədir. Transkripsiyadan sonrakı RNT emalındakı fərqlər nəticəsində mitoxondrial mRNT-lər adətən 5 trifosfat qrupunu saxlayır, əksər plastid mRNA-ların 5 ucları isə monofosforilləşir.

Prokaryotik mRNA-lar kimi, əksər orqanella mRNA-ların 5- və 3-UTR-ləri tənzimləyici və sabitləşdirici funksiyaları olan kök-halqa quruluşunu yarada bilər. Bu RNT strukturları tez-tez zülallarla qarşılıqlı əlaqədə olur və mRNT-nin işlənməsi, tərcüməsi və deqradasiyasına təsir edən siqnallar kimi xidmət edir.

Eukaryotik hüceyrələr kiçik, sabit RNT-lərin əlavə siniflərini ehtiva edir. Stabil uridinlə zəngin RNT-lər kiçik nüvə ribonukleo-proteinlərinin (UsnRNP) komponentləridir və eukariotların kiçik nüvə RNT-lərinin (snRNA) əsas sinfini təşkil edir. Bu RNT-lər U1-dən başlayaraq nömrələnir. Bəzi snRNA-lar nukleoplazmada yüksək nüsxədə olur və əsas snRNA kimi tanınır.

Kiçik snRNA-ların əksəriyyəti nüvədə yerləşir və buna görə də snoRNA-lar (kiçik nüvə RNTləri) təyin olunur. SnRNP-lərdəki snRNA-ların əksəriyyəti nüvədəki prekursor mRNT-lərdən kodlaşdırılmayan bölgələrin birləşdirilməsində iştirak edir.

Digər snRNA-lar, poli (A) quyruğu olmayan histon pre-mRNT-nin 3'terminalının emalında iştirak edirlər. SnoRNA-ların əksəriyyəti rRNT prekursorlarının emalında iştirak edir.

Eukariotlarda transkripsiya və tərcümə eyni vaxtda olmur, çünki transkripsiya nüvə prosesidir və tərcümə sitoplazmatik prosesdir. Yeni transkripsiya edilmiş mRNA-lar nüvədən sitoplazmaya daşınan əsas gen transkriptləri adlanır.

Eukariotların funksional mRNA-ları bir neçə növ emal yolu ilə əsas gen transkriptlərindən aşağıdakı kimi alınır:

(a) Pre-mRNT və ya böyük mRNT prekursorunun kiçik fərdi mRNT molekullarına parçalanması.

(b) Molekulun 5-ci ucuna 7-metil quanozin qruplarının bağlanması və ya əlavə edilməsi.

(c) Poli (A) quyruğu və ya mRNT molekulunun 3-8242 ucuna 200 nukleotid uzunluğunda adenilat nukleotid ardıcıllığının əlavə edilməsi.

(d) Xüsusi zülallarla komplekslərin əmələ gəlməsi.

5′ sonundan başlanğıc kodonuna qədər olan əsas ardıcıllığa lider ardıcıllığı, aralarındakı kodlaşdırılmayan ardıcıllıqlara isə intronlar deyilir. Zülala çevrilən kodlaşdırma ardıcıllığına ekzonlar deyilir. İlkin transkriptin işlənməsi intron ardıcıllığının çıxarılmasını nəzərdə tutur.

Fərdi gen transkriptlərinin transkripsiyadan sonrakı modifikasiyaları yuxarıda qeyd olunan 4 növ emaldan bəzi və ya hamısından keçə bilər.

Eukaryotik hüceyrələrin nüvələrində sintez edilən qeyri-ribosomal RNT-lərin əksəriyyəti çox böyükdür və ölçüləri çox dəyişkəndir və heterogen nüvə RNT(hnRNA) və ya pre-mRNT adlanır.

Transkripsiyadan dərhal sonra bu nəhəng molekulların nüvə daxilində sürətli işlənməsi nüvədən sitoplazmaya daşınan mRNT molekullarının əmələ gəlməsi ilə nəticələnir. Emal zamanı ilkin transkriptlərdən intronlar ayrılır.

Aşağıdakı kimi üç fərqli bağlama mexanizmləri var:

(a) tRNT prekursorunun endonükleaza və liqaz fermenti ilə birləşdirilməsi.

(b) Tetrahymena RNT prekursorunun avtosplikasiyası unikal reaksiya mexanizmidir və RNT molekulunun özü tərəfindən kataliz edilir (öz-özünə yapışma). Bu katalizator RNT molekullarına ribozimlər deyilir. Bu cür birləşmə mexanizmində heç bir protein fermenti iştirak etmir.

Bu avtokatalitik aktivliyin bir neçə aşağı eukariotun rRNT prekursorlarında və bir çox müxtəlif növlərin mitoxondri və xloroplastlarında çoxlu sayda mRNT, tRNT və mRNT prekursorlarında baş verdiyi göstərilmişdir.

(c) mRNT-dən əvvəlki transkriptlərin intronları splisiosomlar adlanan ribonukleoprotein kompleksləri tərəfindən kataliz olunan iki mərhələli reaksiyalarda bölünür.

Bitki nüvə pre-mRNA-larının intronları dəyişir, AU ilə zəngindir və onların birləşmə qovşaqlarında qorunmuş ardıcıllığa malikdir. Dikotlarda bu intronlar 70% AU ehtiva edir, monokotlarda isə 60%. Hər bir ekson-intron qovşağını əhatə edən nukleotid ardıcıllığı yüksək dərəcədə qorunur.

Bitkilərin demək olar ki, bütün nüvə mRNT intronlarında, 5′ birləşmə yerində (donor yer) və 3’splice sahəsində (qəbuledici yer) sərhəd ardıcıllığı 5′ GU və AG 3′-dən ibarətdir. Bu xüsusiyyət GU-AG qaydası kimi tanınır. Əlavə struktur elementi, filial sahəsi, adətən, 3’splice yerindən 20-40 nukleotid yuxarıda yerləşir.

İntronun kəsilməsi zamanı intronun 5’sonu budaq yerində adenin qalığı ilə birləşərək lariat əmələ gətirir. Pre-mRNT intron birləşməsi böyük ribonukleoprotein kompleksində (splisosomda) baş verir ki, bu kompleksdə snRNA-lar U1, U2, U4/U6 kompleksi və kiçik ribonuklear zülallarla (snRNP) və qeyri-snRNP zülal faktorları ilə əlaqəli qalan 115 var. Şəkil 3.58).

Aşağıdakı cədvəldə dörd əsas intron növü verilmişdir:

Öz-özünə yapışma mexanizmi intronlar qrupundan asılı olaraq dəyişir. Qrup-l intronlarının birləşdirilməsi guanozin molekulu və ya 5'fosforilləşdirilmiş törəmə intron ardıcıllığına bağlandıqda başlanır. Bağlanmış guanosinin 3'OH qrupu 5'splice yerindəki fosfat qrupuna hücum edərək, bu yerdəki fosfodiester bağını parçalayaraq ekson-1-i buraxır.

Ekson-1-in sonundakı 3′ OH 3’splice yerində fosfatla reaksiya verir, iki eksonu bağlayır və xətti intronu buraxır (şək. 3.59). II qrup intronların öz-özünə yapışma mexanizmi nüvə pre-mRNT-lərinin birləşdirilməsinə bənzəyir, lakin spliceosomun əmələ gəlməsini nəzərdə tutmur. Bu birləşmə reaksiyaları adətən molekuldaxili olur və bir transkriptdən ekzonları birləşdirirlər və cis-splicing adlanır.

Bunun əksinə olaraq, bitkilərin müəyyən qrup II intronları iki və ya daha çox RNT molekulunu əhatə edən yeni bir trans-splicing mexanizmi ilə çıxarılır. Bitki xloroplastlarında və mitoxondrilərdə olur. Yalnız RNT polimeraza III tərəfindən transkripsiya edilən kiçik, sabit RNT-lərin müəyyən növləri geniş emaldan keçmir.

RNT növləri:

(i) Ribosomal RNT :

Hüceyrə RNT-nin əsas hissəsi ribosom RNT-dir. Ribosomların əsas komponentidir, lakin zülal sintezində onun müəyyən rolu aydın deyil. Bitkilər, yosunlar və fotosintetik protistlərin hər birində üç sinif ribosom var: sitoplazmatik, plastid və mitoxondrial. E. coli ribosomlarında üç növ rRNT tapılır. Onlar çöküntü davranışına görə 5S, 16S və 23S adlanırlar.

Hər ribosomda bu rRNT növlərinin hər birinin bir molekulu var. Eukaryotik ribosomlar isə 5S, 7S, 18S və 28S rRNT növlərinin hər birində bir molekuldan ibarətdir. Ribosomal RNT hüceyrədə 3 növ RNT arasında ən çox olanıdır.

Ribosomal RNT tək zəncirlidir, lakin o, həm də tamamlayıcı bölgələr və saç sancağı ilgəkləri arasında qoşa zəncirlərin əmələ gəlməsi səbəbindən yüksək dərəcədə ikinci dərəcəli modifikasiyalar göstərir. Hər bir döngə dupleks gövdələri ehtiva edir. Döngələr və gövdələr zülal sintezi üçün müxtəlif ribosomal zülallar və digər fermentlər üçün xüsusi vektor bağlayıcı yerləri təmin edir.

E. coli-dən təcrid olunmuş 16S rRNT-nin 3-cü ucu 30S ribosomunda mRNT-nin bağlanma yeri kimi xidmət edən Parıltı və Dalqarno ardıcıllığına malikdir. Bu ardıcıllıq mRNT-nin başlanğıc sonunu tanımağa kömək edir. 5S rRNA bütün tRNA-ların TΨC ardıcıllığını tamamlayan bir ardıcıllığa malikdir. Beləliklə, 5S RNT tRNT-nin ribosomlara bağlanması üçün vacibdir.

Pre-rRNA-ların emalına nukleolitik parçalanma və metilləşmə daxildir. Bəzi eukaryotik rRNT transkriptləri intronun özü tərəfindən birləşir (öz-özünə birləşən, ribozim).

17S, 5.8S və 25S rRNA molekullarını kodlayan nüvə rRNA gen klasterindəki transkripsiya vahidləri RNT polimeraza I tərəfindən tək bir uzun prekursor molekuluna transkripsiya edilir, daha sonra bir sıra parçalanma və metilləşmə mərhələlərindən keçərək 17S51S əldə edir. , və 25S rRNT molekulları.

5S rRNT-nin müvafiq nüvə genlərindən transkripsiyası müstəqildir və RNT polimeraza III tərəfindən katalizlənir. Heç bir emal tələb etmir.

17S, 5.8S və 25S rRNA-lar bir neçə RNaz tərəfindən katalizləşdirilmiş reaksiyaların işlənməsi ilə ümumi 45S rRNA prekursor molekulundan istehsal olunur. Emal zamanı 25S və 5.8S rRNA-ları hidrogen bağına çevrilir və emal başa çatdıqdan sonra qoşalaşmış qalır (şək. 3.60).

Dörd plastid rRNA molekulu polikistronik transkripsiya vahidi kimi kodlaşdırılıb ki, bura həm də 16S və 23S rRNT-ni ayıran spacer bölgəsində tRNA ala və tRNA lle-ni kodlayan iki tRNT genini ehtiva edir, hər birində uzun bir intron var. Mürəkkəb bir emal yolu ilə prekursor RNT 16S, 23S, 4.5S və 5S rRNA-lara və tRNT prekursorlarına parçalanır.

Parçalanmış tRNT prekursorları daha sonra funksional tRNT lle və tRNA ala molekullarına işlənir. tRNA-lar nüvə genlərinin klasterlərindən RNT polimeraza III tərəfindən transkripsiya edilir, lakin 5S rRNA-dan fərqli olaraq onların işlənməsi lazımdır (Şəkil 3.61).

(ii) Transfer RNT :

Transfer RNT ilk dəfə 4S-də çökən RNT-nin bir hissəsi kimi müəyyən edilmişdir. tRNT-lərin uzunluğu 75-85 nukleotiddir. Onlar həmçinin həll olunan RNT və ya sitoplazmik RNT kimi tanınırlar. Transfer RNT ikiqat funksiyaları yerinə yetirən bir adapter molekuldur. Həm kodonu, həm də amin turşusunu tanıyır.

tRNT-nin nukleotid ardıcıllığı yonca yarpağı formasını verir. Bu quruluşda bir-birini tamamlayan qoşalaşmış əsaslar tək telli ilmələr üçün gövdələr əmələ gətirir. Kök və döngə strukturları tRNT-nin qolları kimi tanınır.

tRNT molekulunun əsas ardıcıllığı ilk dəfə 1965-ci ildə Robert Holley tərəfindən müəyyən edilmişdir. Adi A, G, C və U istisna olmaqla, onların tərkibində psevduridin (Ψ), dihidroridin (H) kimi müxtəlif qeyri-adi nukleozidlər var.2U), ribotimidin (rT), inozin (I), adenozin və quanosinin mono- və dimetil törəmələri və onların tiollaşdırılmış törəmələri.

Bu dəyişikliklər yalnız poliribonukleotid zəncirinə daxil edildikdən sonra dörd əsasdan birində baş verir. tRNT molekulunda dörd döngə və dörd əsas qol var. Qollar strukturlarına və funksiyalarına görə adlanır.

Həmişə qoşalaşmamış -C-C- ilə bitən əsas qoşalaşmış gövdən ibarət qəbuledici qolu Sərbəst 3''OH qrupu aminoasilatlanmış və 5'' ucu ümumiyyətlə G və ya C ilə bitən ardıcıllıq.

Digər qollar qoşalaşmış gövdələrdən və qoşalaşmamış ilmələrdən ibarətdir. D-qolu dihidrourasil əsasının mövcudluğuna görə adlandırılmışdır. Antikodon qolu həmişə döngənin mərkəzində antikodon üçlüyü ehtiva edir. TΨC qolu bu üçlü ardıcıllığın mövcudluğuna görə adlandırılmışdır.

tRNT-nin dəyişkən xüsusiyyəti, TΨC və antikodon qolları arasında yerləşən əlavə qoldur və təbiətinə görə tRNT iki növə təsnif edilir: I sinif tRNA (kiçik əlavə qolu olan) və sinif. -II tRNT-lər (böyük əlavə qolu olan). Yonca yarpağı ətrafında saat əqrəbi istiqamətində həmişə qəbuledici sapda 7 əsas cüt, TΨC qolunda 5, antikod qolunda 5 və adətən D qolunda üç əsas cüt olur.

Nüvə tRNT intronlarının mövqeyi qorunur, lakin onların ardıcıllığı qorunmur. Endonükleaza pre-tRNT-ni intronun hər iki ucunda parçalayır və nəticədə 5'tRNT seqmentinin 3'üncü hissəsində siklik 2', 3'fosfat qrupu və sərbəst 5' əmələ gəlir. -3′ tRNT seqmentinin hidroksil qrupu.

Siklik fosfat qrupu 2'fosfat qrupu yaratmaq üçün parçalanır. Sərbəst 5' hidroksil qrupu daha sonra fosforlaşdırılır və hər iki yarı RNT liqazı ilə birləşdirilir. 2'fosfataz 2'fosfat qrupunu xaric edərək, yetkin birləşdirilmiş tRNT əldə edir.


RNT: Tərif, növləri, strukturu və funksiyaları

Johannes Friedrich Miescher (İsveçrəli həkim və bioloq) ilk dəfə 1869-cu ildə nüvədən gələn "nüklein" kimi Nuklein turşularını kəşf etdi. Severo Ochoa de Albornoz (İspan-Amerika həkimi və biokimyacı) RNT sintez mexanizmini kəşf etdi 1959-cu ildə Nobel mükafatı aldı. Artur Kornberq ilə birlikdə kəşflərinə görə fiziologiya və ya tibb sahəsində mükafat. 1965-ci ildə Robert W. Holley maya tRNT-nin 77 nukleotidini sıralayır.

Ribonuklein turşusu və ya RNT vacib bioloji makromolekuldur. Ümumiyyətlə, DNT tərəfindən kodlanmış irsi məlumatın zülallara çevrilməsinə kömək edir. Canlı hüceyrənin nukleotidlərində riboza şəkəri olan və genlərin kodlaşdırılmasında, dekodlanmasında, tənzimlənməsində və ifadəsində çoxlu həyati rolları yerinə yetirən nuklein turşusu Ribonuklein turşusu və ya RNT adlanır.

Prokaryotik hüceyrədə bunlar sitoplazmada, xromosomda, ribosomda, nüvədə, plastiddə və mitoxondriyada olur. Eukaryotik hüceyrələrdə 90% RNT sitoplazmada, 10% isə digər strukturlarda olur. Bəzi viruslarda RNT genetik material kimi mövcuddur.

RNT-nin fiziki strukturu

Əsasən RNT bir zəncirli zərrəcikdir, lakin onların ikincil strukturunda bir neçə U formalı döngələr var. O, geniş ikiqat spiral quruluşu göstərə bilər və həmçinin müxtəlif üçüncü strukturlar yarada bilər.

RNT-nin kimyəvi quruluşu

RNT molekulu ribonukleotidin polimeridir. Hər bir ribonukleotid aşağıdakı molekullardan ibarətdir:

Bir RNT molekulundakı hər bir nukleotid dörd azotlu əsasdan birinə malikdir: adenin, guanin, sitozin və urasil. İlk ikisi purin, sonrakı ikisi isə pirimidin əsaslarıdır.

RNT növləri

RNT iki əsas növdən ibarətdir, məsələn:

1. Genetik RNT və ya gRNA: RNT genetik material kimi fəaliyyət göstərdikdə, o, genetik RNT kimi tanınır, məsələn. Bəzi virusların RNT-si.

2. Qeyri-genetik RNT: RNT yalnız zülal sintezində iştirak etdikdə, o, qeyri-genetik RNT adlanır, məs. Eukaryotik və prokaryotik hüceyrələrin RNT.

Qeyri-genetik RNT daha sonra aşağıdakı üç növə bölünür:

  1. Ribosomal RNT və ya rRNT
  2. Messenger RNT və ya mRNA
  3. Transfer RNT və ya tRNT

Ribosomal RNT və ya rRNT: Hüceyrədəki ümumi RNT-nin təxminən 80%-ni təşkil edir. Bunlar nüvələrdə sintez olunur və hüceyrələrin zülal fabrikləri olan ribosomda baş verir. Ribosomal RNT budaqsız, çevik polinükleotid zəncirindən ibarətdir. Bu zəncir aşağı ion konsentrasiyasında sarmal olaraq qalır, lakin onun azot əsasları yüksək ion konsentrasiyasında spiral hissəni təşkil edir. Bu halda adenin urasillə, guanin isə sitozinlə bağlanır.

Eukaryotik rRNT dörd növdür: 28S rRNA, 18S rRNA, 5.8S rRNA və 5S rRNA.

Ribosomal RNT-ni (rRNT) göstərən şəkil

RRNT-nin funksiyaları

  • Ribosomal RNT mRNT-nin amin turşularına deşifrə edilməsi prosedurunu verir və tərcümə zamanı tRNA-larla qarşılıqlı əlaqədə olur.
  • Ribosomun içərisində üstünlük təşkil edən materialdan ibarətdir. Protein sintezi zamanı.
  • tRNT, mRNT və ribosomun düzgün uyğunlaşmasına zəmanət verir.
  • Amin turşuları arasında peptid bağının yaranması zamanı kataliz edir.

Messenger RNT və ya mRNA

Fransız alimləri Fransua Yakob və Jak Monod 1961-ci ildə mRNT adını yaratdılar. mRNT bir neçə min nukleotiddən ibarət tək zəncirlidir. DNT-nin tamamlayıcı zolağı kimi yaradılmışdır, buna görə də DNT-də olduğu kimi əsas ardıcıllığa malikdir. Xətti quruluşunda mRNT-nin iki kodlaşdırma ucu və orta kodlaşdırma zonası var. mRNT-nin iki ucu 5´lider və 3´ qoşqu ucu kimi tanınır. mRNT hüceyrədəki ümumi RNT-nin 3-5%-ni təşkil edir.

mRNA, hüceyrənin orijinal planı olan DNT-dən transkripsiya nəticəsində əldə edilən irsi məlumatın surətidir. Bu irsi məlumat zülalların əmələ gəlməsi üçün təlimat kimi istifadə edilmək üçün hüceyrələrin zülal fabriklərinə, ribosoma gətirilir.

MRNT-nin funksiyaları

  • mRNT nüvədəki DNT şablonundan transkripsiya edilir və kodlaşdırma məlumatını ribosomlarda zülal sintezi yerlərinə aparır.

Transfer RNT və ya tRNT

Transfer RNT də tRNA kimi tanınır. Bu, xüsusi bir amin turşusunun yeni bir polipeptid zəncirinə ötürülməsinə kömək edən kiçik və yonca yarpağı formalı RNT-dir. Tərcümə zamanı bu ötürülmə protein sintezinin ribosomal yerində baş verir.

Bu vəziyyətdə, 20 amin turşusunun hər biri zülal meydana gətirmək üçün onunla bağlanan xüsusi bir tRNT-yə malikdir. tRNT 70-95 nukleotiddən ibarətdir. O, tərcümənin vacib komponentidir və əsas funksiya kimi zülal sintezi zamanı amin turşularının ötürülməsini həyata keçirir. Beləliklə, ona transfer RNT və ya tRNT deyilir. tRNT-yə adapter molekullar da deyilir, çünki o, mRNT-nin genetik ardıcıllığının zülallara çevrilməsində adapter rolunu oynayır. Bəzən tRNT ia da həll olunan və ya aktivator RNT adlanır.

Robert Willium Holley və b. (1965) tRNT-nin yonca yarpağı model strukturunu təklif etmişdir. O, 1968-ci ildə bu modeli təsvir etdiyinə görə Har Qobind Xorana və Marşal Uorren Nirenberq ilə Fiziologiya və Tibb üzrə Nobel Mükafatına layiq görülüb. Bu modelə görə, tRNT-nin tək polinükleotid zənciri beş qol yaratmaq üçün öz üzərinə qatlanır. Qollar bunlardır:

  1. Qəbuledici qolu
  2. Dihidroridin (DHU) qolu və ya D qolu
  3. Antikodon qolu
  4. Dəyişən qol və
  5. Tiamin psedositozin və ya TΨC qolu.

tRNA da DHU döngəsi, dəyişən döngə, antikodon döngəsi, T-dövrəsi və ya TΨC döngəsi və amin turşusu qəbuledici ucuna malikdir. Onun dörd normal bazası A, G, U, C və izonin (I), dihidouridin, psedouradin və s. kimi bəzi naməlum əsaslar var. Tək tRNT zəncirinin hər iki ucu (5´-3´) kənarda mövcuddur.

tRNT-nin yonca yarpağı model strukturunu göstərən şəkil

TRNT-nin funksiyaları

  1. O, ribosomda zülal sintezi yerinə düzgün amin turşusu molekullarını təyin edir və nəql edir.
  2. O, ilk növbədə amin turşularının daşınması ilə tanışdır.
  3. Zülalların qurulması prosesində də iştirak edir.

RNAa da geniş şəkildə aşağıdakı növlərə bölünə bilər:

Kodlaşdırılmayan RNT (ncRNA) aşağıdakı iki növdən ibarətdir, məsələn:

Kodlaşdırılmayan RNT (ncRNA) daha sonra ölçülərinə görə aşağıdakı iki növə bölünür, məsələn:

1. IncRNA və ya Uzun ncRANS: IncRNA-da minimum 200 nukleotid mövcuddur.

2. Kiçik ncRNAS: ncRNAS-da 200-dən az nukleotid mövcuddur.

Kiçik ncRNA-lar aşağıdakı beş növə bölünür:

1. miRNA: Buna mikro RNT də deyilir

2. snoRNA: Kiçik nukleolar RNT kimi də tanınır

3. snRNT: Kiçik nüvə RNT kimi də tanınır

4. siRNA: Buna kiçik müdaxilə edən RNT də deyilir

5. piRNA: O, həmçinin PIWI ilə qarşılıqlı RNT adlanır

MiRNA-ların ölçüsü təxminən iyirmi iki (22) nukleotid uzunluğundadır və xüsusi əhəmiyyət kəsb edir. Əksər eukaryotik hüceyrələrdə onlar gen tənzimləmə funksiyasını yerinə yetirirlər. Bəzi miRNA-lar şişin inkişafına və şişin yaranmasına səbəb olan hədəf genləri tənzimləyə bilər. piRNA-nın ölçüsü təxminən 26-31 nukleotid uzunluğundadır. Onlar əksər heyvanlarda mövcuddur. Onlar bir xromosomda bir yerdən digərinə hərəkət edən sıçrayan genlərin və ya transpozonların ifadəsini tənzimləyə bilər. Bu genlər ilk dəfə Barbara McClintock tərəfindən müəyyən edilmişdir.

Yekun qeydlər

Mütləq olaraq, RNT molekulyar tədqiqatlar üçün DNT qədər əhəmiyyətlidir, çünki gen ifadəsinin qiymətləndirilməsi spesifik toxumada mövcud olan tam mRNT-yə əsaslanır. mRNT transkripsiya proseduru üçün əsasdır, tRNT isə tərcümə proseduru üçün vacibdir və rRNT tərcümənin baş verdiyi ribosomları təşkil edir. istifadə etməklə genin ifadə miqdarını təxmin etmək olar Əks transkripsiya polimeraza zəncirvari reaksiya texnika və ya RT-PCR texnikası RNT-nin qiymətləndirilməsi vasitəsilə.


Ribosomların strukturu və funksiyası izah olunur

Ribosomların əsas funksiyası xəbərçi RNT-də göstərildiyi kimi amin turşularının ardıcıllığına görə zülalların sintezidir.

Ribosomların əsas funksiyası xəbərçi RNT-də göstərildiyi kimi amin turşularının ardıcıllığına görə zülalların sintezidir.

Bitki və heyvan hüceyrəsini tədqiq edərkən, hüceyrə fəaliyyətini həyata keçirmək üçün birlikdə koordinasiya edən bir çox orqanoidlə qarşılaşmış ola bilərsiniz. Belə mühüm hüceyrə orqanoidlərindən biri zülal sintezindən məsul olan ribosomdur. Mitoxondriyalar enerji istehsalı üçün hüceyrənin güc mərkəzi hesab edilsə də, ribosomlar bir hüceyrədə zülal sintezi üçün yer kimi məşhurdur.

Ribosomların tərkibi və quruluşu

Bizim üçün yazmaq istərdinizmi? Yaxşı, biz sözü yaymaq istəyən yaxşı yazıçılar axtarırıq. Bizimlə əlaqə saxlayın, danışarıq.

Ribosomlar təxminən bərabər miqdarda ribonuklein turşusu (RNT kimi qısaldılmış) və zülallardan ibarətdir. Ribonuklein turşusu hüceyrədə ribosomların sintez olunduğu nüvədən alınır.

Sadə prokaryotik hüceyrə (məsələn, bakteriya) bir neçə minlərlə ribosomdan ibarətdir, yüksək inkişaf etmiş eukaryotik hüceyrədə (məsələn, insan hüceyrəsi) bir neçə milyon ribosom var. Prokaryotik ribosomlar eukaryotik ribosomlardan daha kiçikdir.

Ribosomal quruluşa gəldikdə, tipik bir ribosom hər birində RNT və zülalları ehtiva edən iki alt hissədən ibarətdir. Bu iki alt bölmə müəyyən bir mühitdə çökmə sürətinə görə təsnif edilir.

Məsələn, eukaryotik hüceyrədəki iki alt bölmə 40S (kiçik alt bölmə) və 60S (daha böyük alt vahid) təşkil edir, burada ‘S’ sıxlıq vahidi Svedberq deməkdir. Beləliklə, alt bölməyə verilən dəyər nə qədər yüksəkdirsə, alt bölmənin ölçüsü də bir o qədər böyükdür.

Hüceyrədə Ribosomların Fəaliyyəti

Bir hüceyrədə ribosomlar sitoplazmanın iki bölgəsində yerləşir. Bəzi ribosomlar sitoplazmada səpələnmiş (sərbəst ribosomlar adlanır), digərləri isə endoplazmatik retikuluma (bağlanmış ribosomlar) bağlıdır. Müvafiq olaraq, ribosomlarla bağlanan endoplazmatik retikulumun səthi kobud endoplazmatik retikulum (RER) adlanır. Həm sərbəst ribosomlar, həm də bağlı ribosomlar oxşar quruluşa malikdir və zülalların istehsalına cavabdehdirlər.

Ribosomların əsas funksiyalarından danışarkən, onlar xüsusi zülalların əmələ gəlməsi üçün amin turşularının yığılması rolunu oynayırlar ki, bu da öz növbəsində hüceyrənin fəaliyyətini həyata keçirmək üçün vacibdir. Hamımızın zülalların istehsalı ilə bağlı ədalətli fikrimiz olduğundan, dezoksiribonuklein turşusu (DNT) əvvəlcə DNT transkripsiyası prosesi ilə RNT (messencer RNT və ya mRNT) istehsal edir, bundan sonra mRNA-dan genetik mesaj DNT-nin tərcüməsi zamanı zülallara çevrilir.

Ribosomlar tərəfindən zülal sintezi haqqında daha dəqiq desək, mRNT-də zülal sintezi zamanı amin turşularının yığılma ardıcıllığı müəyyən edilmişdir. Nüvədə sintez edilən mRNT daha sonra zülal sintezinin daha da davam etdirilməsi üçün sitoplazmaya daşınır. Sitoplazmada ribosomların iki alt bölməsi mRNT polimerləri ətrafında birləşir və genetik koda uyğun olaraq transfer RNT (tRNA) köməyi ilə zülalları sintez edir. Protein sintezinin bütün bu prosesinə mərkəzi dogma da deyilir.

Adətən sərbəst ribosomlar tərəfindən sintez edilən zülallar sitoplazmanın özündə istifadə olunur, bağlı ribosomlar tərəfindən istehsal olunan zülal molekulları isə hüceyrədən kənara daşınır. Zülalların qurulmasında ribosomların əsas funksiyasını nəzərə alsaq, hüceyrənin ribosomlar olmadan fəaliyyət göstərə bilməyəcəyini başa düşmək olar.

Əlaqədar Yazılar

Nüvə hər eukaryotik hüceyrədə mövcud olan sferik formalı orqanoiddir. O, eukaryotik hüceyrələrin idarəedici mərkəzidir, genlərin koordinasiyasına və gen ifadəsinə cavabdehdir. Quruluş & hellip

Ribosomlar sıx bir xüsusiyyətə malik hüceyrənin kiçik orqanoidləridir və zülal istehsalına kömək edir. Onlar mənşəyi nüvədə olan nukleoproteinlərdir. Bizə&hellip haqqında daha çox məlumat verin

Sitoplazma hüceyrə daxilindəki boşluğu tutan və dolduran mayedir. Gel kimi sitoplazma hüceyrənin müxtəlif orqanoidlərini ehtiva edir və yerində saxlayır. Bu &hellip


Zika virusunun tam uzunluqlu NS5 zülalının quruluşu və funksiyası

Bu yaxınlarda yayılan Zika virusu (ZIKV) 30-dan çox ölkədə 1 milyondan çox insana yoluxub. ZIKV virusla kodlanmış replikasiya zülallarından istifadə edərək RNT genomunu təkrarlayır. Qeyri-struktur zülal 5 (NS5) tərkibində RNT-nin bağlanması üçün metiltransferaza və viral RNT sintezi üçün polimeraza daxildir. Burada tam uzunluqlu NS5-in kristal strukturlarını və onun polimeraza sahəsini 3.0 Å qətnamə ilə bildiririk. NS5 strukturu, əlaqəli Yapon ensefalit virusunun NS5 zülalına təəccüblü oxşarlıqlara malikdir. Metiltransferaza substratın bağlanması və aktiv sahə üçün daxili cibləri ehtiva edir. Polimerazadakı əsas qalıqlar hepatit C virusunun polimerazasının başlanğıc kompleksi ilə oxşar mövqelərdə yerləşir. Polimeraza konformasiyasına metiltransferaza təsir edir ki, bu da RNT sintezinin in vitro daha səmərəli uzadılmasını təmin edir. Ümumilikdə, nəticələrimiz ZIKV infeksiyası və ZIKV replikasiyasının inhibitorlarının inkişafına dair gələcək tədqiqatlara kömək edəcəkdir.

Maraqların toqquşması bəyanatı

Müəlliflər heç bir rəqabət aparan maliyyə maraqlarını bəyan etmirlər.

Rəqəmlər

Şəkil 1. Tam uzunluqlu ZIKV NS5-in strukturu.

Şəkil 1. Tam uzunluqlu ZIKV NS5-in strukturu.

( a ) Aranjımanı göstərən lent təsviri…

Şəkil 2. NS5 strukturunun müqayisəsi…

Şəkil 2. ZIKV-nin NS5 strukturunun JEV və DENV strukturları ilə müqayisəsi.

Şəkil 3. ZIKV NS5 metiltransferazanın strukturu…

Şəkil 3. ZIKV NS5 metiltransferaza domeninin (MT) strukturu.

( a ) Müqayisə...

Şəkil 4. ZIKV RNT-dən asılı RNT-nin strukturu…

Şəkil 4. ZIKV RNT-dən asılı RNT polimeraza domeninin (RdRp) strukturu.

( a ) Lentlə təmsil…

Şəkil 5. MT RNT sintezinə təsir edir...

Şəkil 5. MT ZIKV RdRp ilə RNT sintezinə təsir göstərir.

Şəkil 6. ZIKV-dən NS5 zülalı…

Şəkil 6. Braziliyadan təcrid olunmuş ZIKV-dən olan NS5 zülalı müqayisə edilə bilən RNT sintezinə malikdir...


10.3: RNT-nin strukturu və funksiyası - Biologiya

Kodlaşdırılmayan RNT və Ribonukleoproteinlərin strukturu və funksiyası

RNT-nin transkripsiya və tərcümənin tənzimlənməsindən tutmuş xromosomların uclarının sintezinə və enzimatik reaksiyalara qədər hər şeydə rolu getdikcə daha çox aşkar edilmişdir. Bunları etmək üçün RNT müxtəlif formalar alır və tez-tez xüsusi RNT-zülal kompleksləri əmələ gətirir.

Laboratoriyamız RNT və ribonukleoprotein komplekslərinin (RNP) quruluşunu və funksiyasını öyrənir. Tarixən bizim əsas tədqiqat alətimiz çoxölçülü nüvə maqnit rezonans (NMR) spektroskopiyası olmuşdur ki, bu da makromolekulların üçölçülü strukturlarını təyin etmək və məhlulda onların dinamikasını öyrənmək üçün bir üsul təqdim edir. Bu günləri birləşdiririk elektron mikroskopiyası, X-ray kristalloqrafiyası, kiçik bucaqlı rentgen şüalarının səpilməsi və NMR spektroskopiyası RNT və RNP domenlərinin, komplekslərinin və birləşmələrinin ətraflı strukturlarını, dinamikasını və arxitekturasını əldə etmək.

Struktur və dinamika məlumatları, bu nuklein turşularının və nuklein turşusu-zülal komplekslərinin hüceyrədə necə işləməsi və RNT-dəki mutasiyaların xəstəliyə necə səbəb ola biləcəyi barədə fikir vermək üçün müxtəlif biokimyəvi və molekulyar bioloji üsullardan istifadə etməklə funksiya ilə əlaqələndirilir.

Hal-hazırda, laboratoriyamdakı tədqiqatlar struktur, funksiya, dinamika, yığılma və qatlama üzərində cəmlənmişdir: (1) insan telomerazası, (2) tetrahymena telomeraza, (3) ribosviçlər, (4) H/ACA RNP-lər və (5) digər kodlaşdırmayan RNT-lər. Tədqiqat haqqında daha çox öyrənmək üçün.

Biz həmişə həvəsli və istedadlı insanları axtarırıq!

Namizəd məzun tələbələr Biokimya və Molekulyar Biologiya (BMB) Proqramı və ya ACCESS proqramı vasitəsilə müraciət etməlidirlər.

Doktoranturaya müraciət edənlər əhatə məktubu və CV göndərməli və 3 arayış məktubunun birbaşa Juli Feigon-a ya poçt və ya e-poçt vasitəsilə göndərilməsini təşkil etməlidirlər (e-poçta üstünlük verilir).

Tədqiqatla maraqlanan və ən azı bir il həftədə 12+ saat işləmək istəyən yüksək motivasiyalı bakalavrlar Prof. Feyqona e-poçt və CV göndərməlidirlər.


RNT-nin 3 növü və onların funksiyaları

  • kimya
    • Biokimya
    • Əsaslar
    • Kimyəvi qanunlar
    • Molekullar
    • Dövri Cədvəl
    • Layihələr və Təcrübələr
    • Elmi metod
    • Fiziki kimya
    • Tibbi Kimya
    • Gündəlik Həyatda Kimya
    • Məşhur kimyaçılar
    • Uşaqlar üçün Fəaliyyətlər
    • İxtisarlar və Akronimlər
    • Ph.D., Biotibbi Elmlər, Tennessi Universiteti, Knoxville
    • B.A., Fizika və Riyaziyyat, Hastings Kolleci

    Ümumi bir ev tapşırığı və test sualı tələbələrdən RNT-nin üç növünü adlandırmağı və onların funksiyalarını sadalamağı xahiş edir. Bir neçə növ ribonuklein turşusu və ya RNT var, lakin əksər RNT üç kateqoriyadan birinə düşür.


    DMCA şikayəti

    Vebsayt vasitəsilə mövcud olan məzmunun (Xidmət Şərtlərimizdə müəyyən edildiyi kimi) müəllif hüquqlarınızdan birini və ya bir neçəsini pozduğuna inanırsınızsa, lütfən, təyin edilmiş şəxslərə aşağıda təsvir olunan məlumatları ehtiva edən yazılı bildiriş (“Pozulma bildirişi”) təqdim etməklə bizə bildirin. agent aşağıda verilmişdir. Əgər Varsiyanın Tərbiyəçiləri Pozunma Bildirişinə cavab olaraq tədbir görsə, o, bu cür məzmunu Varsity Tərbiyəçilərinə təqdim etdiyi ən son e-poçt ünvanı vasitəsilə bu cür məzmunu əlçatan edən tərəflə əlaqə saxlamağa yaxşı niyyətlə cəhd edəcək.

    Pozuntu bildirişiniz məzmunu əlçatan edən tərəfə və ya ChillingEffects.org kimi üçüncü tərəflərə göndərilə bilər.

    Nəzərinizə çatdıraq ki, məhsul və ya fəaliyyətin müəllif hüquqlarınızı pozduğuna dair ciddi şəkildə təhrif etsəniz, ziyana görə (xərclər və vəkil haqları daxil olmaqla) məsuliyyət daşıyacaqsınız. Beləliklə, əgər Vebsaytda yerləşən və ya onunla əlaqəli olan məzmunun müəllif hüququnuzu pozduğuna əmin deyilsinizsə, əvvəlcə vəkillə əlaqə saxlamağı düşünməlisiniz.

    Bildiriş göndərmək üçün bu addımları yerinə yetirin:

    Siz aşağıdakıları daxil etməlisiniz:

    Müəllif hüququ sahibinin və ya onların adından hərəkət etmək səlahiyyəti olan şəxsin fiziki və ya elektron imzası Pozulduğu iddia edilən müəllif hüququnun identifikasiyası Müəllif hüququnuzu pozduğunu iddia etdiyiniz məzmunun xarakteri və dəqiq yerinin təsviri, kifayət qədər Varsity Repetitorlarına həmin məzmunu tapmaq və müsbət şəkildə müəyyən etmək imkanı verən təfərrüat, məsələn, biz sualın hansı xüsusi hissəsinin məzmununu və təsvirini ehtiva edən xüsusi suala (yalnız sualın adı deyil) keçid tələb edirik – şəkil, link, mətn və s. – şikayətiniz adınız, ünvanınız, telefon nömrəniz və e-poçt ünvanınıza aiddir və Sizin bəyanatınız: (a) müəllif hüququnuzu pozduğunu iddia etdiyiniz məzmundan istifadənin vicdanla inandığınıza qanunla və ya müəllif hüququ sahibi və ya belə sahibin agenti tərəfindən icazə verilməmişdir (b) Pozulma haqqında bildirişinizdə olan bütün məlumatların dəqiq olması və (c) yalan şahidlik etmə cəzası altında, ya müəllif hüququ sahibi və ya onların adından hərəkət etmək səlahiyyəti olan şəxs.

    Şikayətinizi təyin olunmuş agentimizə göndərin:

    Charles Cohn Varsity Tutors MMC
    101 S. Hanley Rd, Suite 300
    Sent-Luis, MO 63105


    Videoya baxın: İrsi məlumatlar və genetik və RNT nin Sixaliyeva 9 sinif (Iyul 2022).


Şərhlər:

  1. Dabbous

    Zəhmət olmasa ətraflı məlumat verin

  2. Heathleah

    Bloqun daim inkişaf etdiyinə şadam. Bu yazı yalnız populyarlığa əlavə edir.

  3. Armando

    can fill in the blank ...

  4. Daira

    Məncə siz haqlı deyilsiniz. müzakirə edəcəyik. PM-ə yazın, əlaqə saxlayaq.



Mesaj yazmaq