Məlumat

Aspergillus clavatus birhüceyrəli orqanizmdirmi?

Aspergillus clavatus birhüceyrəli orqanizmdirmi?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Burton İnsan Parazitologiyası kitabını Google tərəfindən yox, tapa bilmədim. Maya iki filuma bölünür: onlardan biri Ascomycotadır. Aspergillus clavatus verilmiş filuma aiddir. Maya birhüceyrəlidir. Beləliklə, Aspergillus clavatusun birhüceyrəli olması mümkündür.

Aşağıdakı şəkildən Aspergillus clavatusun birhüceyrəli orqarizm olub-olmadığını deyə bilərsinizmi?

Beyni zədələyən birhüceyrəli parazitləri tapmalıyam. Göbələk patulin beynin qanamasına səbəb olur, lakin meyarlara cavab vermək üçün hələ də birhüceyrəli olmalıdır.


Maya təkhüceyrəli olduğunu deyirsiniz.

Bununla belə, qəliblər çoxhüceyrəli olan filamentli göbələklər kimi təsvir edilir. Kalıbın sapları koloniyalar verir "aseksual reproduktiv strukturların əmələ gəlməsi nəticəsində yaranan yunlu, tüklü və ya məxməri görünüş, bəzən dənəvər və ya tozlu bir görünüş"(1).

Aspergillus belə bir növdür. Filamentlər adlanır hiflər. Aspergillusda hiflərin onu çoxlu hüceyrələrə ayıran bölmələri və ya divarları var. Buna septa hif deyilir.

  1. McPherson, et al. Henrinin Laboratoriya Metodları ilə Klinik Diaqnoz və İdarəetmə. 22-ci nəşr. 2011. Saunders.

Otofagiya zülalı 5

<p>Annotasiya hesabı UniProtKB girişinin və ya proteomunun annotasiya məzmununun evristik ölçüsünü təmin edir. Bu xal <strong>annotasiyanın düzgünlüyünün ölçüsü kimi istifadə edilə bilməz</strong>, çünki biz hər hansı bir zülal üçün "düzgün annotasiya" təyin edə bilmirik.<p><a href='/help/annotation_score' target='_top'> Daha çox. </a></p> - i homologiyasından çıxarılan zülal <p>Bu, zülalın varlığını dəstəkləyən sübut növünü göstərir. Nəzərə alın ki, 'zülal varlığı' sübutu göstərilən ardıcıllığın(lar) dəqiqliyi və ya düzgünlüyü haqqında məlumat vermir.<p><a href='/help/protein_existence' target='_top'>Daha çox. </a></p>

Məzmunu görmək üçün solda bölmə seçin.


<p>Bu bölmə zülal haqqında hər hansı faydalı məlumatı, əsasən bioloji bilikləri təqdim edir.<p><a href='/help/function_section' target='_top'>Daha çox. </a></p> Funksiya i

Diqqət

<p>UniProtKB avtomatik annotasiya sistemi tərəfindən əl ilə təsdiqlənmədən yaradılmış məlumat.</p> <p><a href="/manual/evidences#ECO:0000256">Daha çox. </a></p> Qaydalara uyğun olaraq avtomatik təsdiqləmə i

<p><a href="http://www.uniprot.org/help/function%5Fsection">Funksiya</a> bölməsinin bu alt bölməsi fermentin katalitik fəaliyyətini, yəni fermentin kataliz etdiyi kimyəvi reaksiyanı təsvir edir.<p ><a href='/help/catalytic_activity' target='_top'>Daha çox. </a></p> Katalitik aktivlik i

Qaydalara uyğun olaraq avtomatik təsdiqləmə i

<p><a href="http://www.geneontology.org/">Gene Ontology (GO)</a> layihəsi 3 kateqoriyaya bölünmüş iyerarxik idarə olunan lüğət toplusunu təqdim edir:<p><a href='/help/ gene_ontology' target='_top'>Daha çox. </a></p> GO - Molekulyar funksiya i

GO - Bioloji proses i

<p>UniProtKB Açar sözlər iyerarxik quruluşa malik <a href="http://www.uniprot.org/keywords">idarə olunan lüğət</a> təşkil edir. Açar sözlər UniProtKB girişinin məzmununu ümumiləşdirir və maraq doğuran zülalların axtarışını asanlaşdırır.<p><a href='/help/keywords' target='_top'>Daha çox. </a></p> Açar sözlər i

Qaydalara uyğun olaraq avtomatik təsdiqləmə i

Qaydalara uyğun olaraq avtomatik təsdiqləmə i

Qaydalara uyğun olaraq avtomatik təsdiqləmə i

Qaydalara uyğun olaraq avtomatik təsdiqləmə i

Qaydalara uyğun olaraq avtomatik təsdiqləmə i


Açar sözlər

Nikoletta Hegedüs 2005-ci ilin iyun ayında Macarıstanın Debrecen Universitetinin Elmlər Fakültəsində Ətraf Mühit üzrə Tədqiqatçı (Magistr) kimi məzun olmuşdur. O, 2011-ci ilin sentyabr ayında Macarıstanın Debrecen Universitetinin Mikrob biotexnologiyası və hüceyrə biologiyası kafedrasında biologiya üzrə fəlsəfə doktoru dərəcəsini bitirmişdir. 2011-ci ilin oktyabr ayından o, Avstriyanın İnsbruk Tibb Universitetinin Biomərkəzinin Molekulyar Biologiya Bölməsində Florentin Marksın tədqiqat qrupunda postdoktorluq vəzifəsində çalışır. Tədqiqatın əsas sahəsi: göbələklər tərəfindən istehsal olunan kiçik sisteinlə zəngin antifungal zülalların hissetmə/siqnal funksiyasına xüsusi diqqət yetirməklə onların molekulyar təsir mexanizmi.

Florentin Marks Avstriyanın İnsbruk Tibb Universitetində Mikrobiologiya ixtisası üzrə təhsil alıb. 2006-cı ildən Avstriyanın İnsbruk Tibb Universitetinin Biomərkəzinin Molekulyar Biologiya şöbəsinin dosenti və Tətbiqi Mikologiya qrupunun rəhbəridir. Onun əsas tədqiqat sahəsi antimikrob peptidləri və onların molekulyar səviyyədə mexaniki funksiyasının səciyyələndirilməsini əhatə edir. Onun xüsusi marağı kiçik, kationik və sisteinlə zəngin antifungal zülalların hüceyrə siqnalında, oksidləşdirici stressin və apoptozun induksiyasında və göbələklərin diferensiasiyasının tənzimlənməsində funksiyasını öyrənməkdən ibarətdir.


Cavab masası

Heyvanlar və bitkilər hər ikisi Eukariotlar kimi təsnif edilir və buna görə də böyük, mürəkkəb, çoxhüceyrəli orqanizmlər yarada bilirlər. 2 Krallığı (Animalia və Plantae) fərqləndirən hüceyrə səviyyəsində bir neçə əsas fərq var. Texniki əhəmiyyət kəsb etmədən, sualınızla bağlı ən mühüm fərq, bitkilərin xlorofil ehtiva etməsidir və buna görə də günəş işığından istifadə edərək öz qidalarını yarada bilər.

Bitkilərin (tərifinə görə, tərkibində xlorofil olan eukariotlar) günəş işığını "enerjiyə" çevirməkdə çox təsirli olmaq üçün təkamülləşdiklərini, heyvanların isə bu seçim olmadan təkamül etdiyini və ehtiyac duyduqları qidaları yemək məcburiyyətində qaldığını nəzərə aldıqda bu çox vacibdir. Beləliklə, onların əvəzinə yeməkləri üçün yem axtarmağa və ya hətta ovlamağa imkan verən mexanizmlər inkişaf etdirdilər.

Müəyyən bir nöqtədə, təkhüceyrəli orqanizm təkamül zamanı çoxhüceyrəli bitkilərə səbəb olan xlorofili birləşdirdi. Heyvanların əcdadı bitki və heyvanların sonuncu ortaq əcdadından asılı olmayaraq təkamül keçirmişdir. Buna görə də, bitkilər və heyvanlar kifayət qədər fərqlidir, məsələn. cütləşmə 'rituallarında' (bitkilərdə buna çiçəklər və toxumlar daxildir - heyvanlarda isə cütləşmə və hamiləlik dövrləri var) və immun sistemi və qan dövranı sistemi kimi sistem dəyişiklikləri (bunlar ümumiyyətlə heyvanlarda bitkilərdən daha mürəkkəbdir) . Bütün bunlar qida mənbəyi seçimi ilə tətbiq olunan təkamül təzyiqlərindəki fərqdən irəli gəlir.

Qeyd etdiyiniz kimi, bütün qaydalara istisnalar var, ona görə də bütün bitkilərdə xlorofil yoxdur, lakin bir qayda olaraq belədir! (Vikipediya: "Bəzi bitkilər parazitdir və normal miqdarda xlorofil istehsal etməyə və ya fotosintez etməyə bilər.").


Aspergillus clavatus birhüceyrəli orqanizmdirmi? - Biologiya

NCBI bir çox genomik biologiya alətləri və resursları, o cümlədən bir çox veb saytlara və bu növlərə aid verilənlər bazalarına keçidləri ehtiva edən orqanizmə xüsusi səhifələr təqdim edir. Sizi bu səhifədə verilmiş bağlantıları araşdırmağa dəvət edirik.

Montaj və Annotasiya Məlumatı


Elanlar

Xəritə Viewer - genom annotasiya yeniləmələri:
Növlərqurmaq
Xəritə Viewer Buraxılışı
Musculus (siçan)37.2 2 mart 2011-ci il
Rattus norvegicus (siçovul) RGSC v3.4 28 dekabr 2010-cu il
Sus scrofa (donuz)Sscrofa9.2 28 dekabr 2010-cu il
Bos buğa (inək)5.2 28 dekabr 2010-cu il
Homo sapiens (insan) 37.2 9 noyabr 2010-cu il
Callithrix jacchus (ağ tüklü qulaqlı marmoset)1.1 19 oktyabr 2010-cu il
Macaca mulatta (makaka rezusu)1.2 19 oktyabr 2010-cu il
Pongo abelii (Sumatra oranqutanı)1.2 19 oktyabr 2010-cu il
Ailuropoda melanoleuca (nəhəng panda)AilMel_1.0 19 oktyabr 2010-cu il
Oryctolagus cuniculus (Avropa dovşanı)1.1 20 sentyabr 2010-cu il
Aedes aegypti (sarı qızdırma ağcaqanad)1.1 20 sentyabr 2010-cu il
Drosophila melanogaster5.22 20 sentyabr 2010-cu il
Xenopus (Silurana) tropicalis (qərb pəncəli qurbağa)1.1 9 sentyabr 2010-cu il
Saccoglossus kowalevskii (palamut qurdu)1.1 19 iyul 2010-cu il
Danio rerio (zebra balığı)Zv8 23 iyun 2010-cu il
Drosophila psevdoobscura2.3 24 noyabr 2009-cu il
Arabidopsis thaliana (siçan-qulaq tərəzi)9.1 14 oktyabr 2009-cu il
Vitis vinifera (şərab üzüm) IGGP 1 7 aprel 2009-cu il
Taeniopygia guttata (zebra ispinoz) 1.1 5 mart 2009-cu il
Hidra magnipapillata1.1 28 yanvar 2009-cu il
Physcomitrella patens (mamır) 1.1 8 yanvar 2009-cu il
Caenorhabditis elegans (nematod) WS190 10 oktyabr 2008-ci il
Anopheles gambiae (ağcaqanad)AğamP3.3 10 oktyabr 2008-ci il
Ciona intestinalis1.1 16 sentyabr 2008-ci il
Acyrthosiphon pisum (noxud aphidi) 1.1 6 avqust 2008-ci il
Equus caballus (at)EquCab2.0 21 iyul 2008-ci il
Tribolium kastaneum (qırmızı un böcəyi) 2.1 9 iyun 2008-ci il
Babesia bovis1.1 26 mart 2008-ci il
Cryptosporidium hominis1.1 26 mart 2008-ci il
Giardia intestinalis1.1 26 mart 2008-ci il
Leishmania mayor1.1 26 mart 2008-ci il
Paramecium tetraulelia1.1 26 mart 2008-ci il
Plasmodium berghei1.1 26 mart 2008-ci il
Plasmodium chabaudi1.1 26 mart 2008-ci il
Plasmodium yoelii1.1 26 mart 2008-ci il
Tetrahymena thermophila1.1 26 mart 2008-ci il
Trichomonas vaginalis1.1 26 mart 2008-ci il
Chlamydomonas reinhardtii1.1 25 mart 2008-ci il
Guillardia teta1.0 25 mart 2008-ci il
Hemiselmis andersenii1.1 25 mart 2008-ci il
Ostreococcus 'lucimarinus'2.0 25 mart 2008-ci il
Aspergillus clavatus1.1 14 fevral 2008-ci il
Caenorhabditis briggsae1.1 13 fevral 2008-ci il
Populus trichocarpa1.1 8 yanvar 2008-ci il
Aspergillus fumigatus2.1 2 yanvar 2008-ci il
Aspergillus niger1.1 2 yanvar 2008-ci il
Cryptococcus neoformans2.1 2 yanvar 2008-ci il
Eremothecium gossypii3.1 2 yanvar 2008-ci il
Magnaporthe Grisea (düyü partlayan göbələk)3.1 2 yanvar 2008-ci il
Nasonia vitripennis (zərgər arı) 1.1 12 sentyabr 2007-ci il
Ostreococcus 'lucimarinus'2.0 9 avqust 2007-ci il
Ornithorhynchus anatinus (orqanot) 1.1 11 iyul 2007-ci il
Monodelphis domesticus (opossum)MonDom5 8 mart 2007-ci il
Populus trichocarpa (qara pambıq ağacı)1.1 12 yanvar 2007-ci il
Gallus gallus (toyuq)2.1 30 noyabr 2006-cı il
Dictyostelium discoideum2.1 2 noyabr 2006-cı il
Strongylocentrotus purpuratus (dənizkirpisi)2.1 18 oktyabr 2006-cı il
Pan troglodytes (şimpanze)2.1 5 oktyabr 2006-cı il
Apis mellifera (arı)Amel_4.0 11 avqust 2006-cı il
Dictyostelium discoideum1.1 22 noyabr 2005-ci il
Canis familiaris (it)2.1 8 sentyabr 2005-ci il

İnsan Genomu

İnsan Genomu
İnsan Genomu Layihəsi insan genetikası haqqında görünməmiş miqdarda bilik yaratdı. İnsan genom resurslarını araşdırın, Map Viewer-dən istifadə edərək insan genomu ardıcıllığına göz atın, Entrez Gene-də gen məlumatını tapın və OMIM-də genetik pozğunluqlar haqqında məlumat əldə edin.


Etika bəyannamələri

Rəqabət edən maraqlar

Genom ardıcıllığı NC_007194–NC_007201 qoşulma nömrələri ilə GenBank-a təqdim edilmişdir. Bütün mikroarray ifadə məlumatları A-MEXP-205 (massiv dizaynı) və E-MEXP-332 və E-MEXP-333 (eksperimental məlumatlar) qoşulma nömrələri ilə ArrayExpress (http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress) vasitəsilə əldə edilə bilər. ). Yenidən çaplar və icazələr haqqında məlumat npg.nature.com/reprintsandpermissions saytında mövcuddur. Müəlliflər heç bir rəqabət aparan maliyyə maraqlarını bəyan etmirlər.


Növlərin təsviri

Aspergillus bölmə Flavi tarixən sarı-yaşıldan qəhvəyi və tünd sklerotiyaya qədər çalarlarda konidial başlı növlər daxildir. Hedayati və b. (2007) nəzərdən keçirmişdir A. flavus kompleks və iki cinsi növ daxil olmaqla 23 növ və ya sort, Petromyces alliaceusP. albertensis. Bir neçə növ bölmə Flavi aflatoksinlər istehsal edir, bunların arasında aflatoksin B1 göbələklər tərəfindən istehsal olunan bir çox təbii ikincil metabolitlərdən ən zəhərlidir. Aflatoksinlər əsasən tərəfindən istehsal olunur A. flavusA. paraziticusbirlikdə mövcud olan və demək olar ki, hər hansı bir məhsul və ya qida üzərində böyüyən (Varga və b. 2011). Kompleksin daxilində, A. flavus həm insanlar, həm də heyvanlar üçün əsas tibbi əhəmiyyətli patogendir. Bununla birlikdə bəzi digər növlər A. flavus mürəkkəb, xüsusilə A. oryzae, A. avenaceus, A. tamari, A. alliaceusA. nomius, nadir hallarda, əsasən səthi infeksiyalara səbəb ola bilər (Hedayati və b. 2007, de Huq və b. 2015).

Qeyd:
Daxildə növlərin dəqiq identifikasiyası A. flavus morfoloji və biokimyəvi xüsusiyyətlərin üst-üstə düşməsi səbəbindən kompleks çətin olaraq qalır. Morfoloji identifikasiyalar üçün kimi hesabat vermək tövsiyə olunur Aspergillus flavus kompleks.

Molekulyar İdentifikasiya:
ITS ardıcıllığının təhlili yalnız növ kompleks səviyyəsini müəyyən etmək üçün kifayətdir. Qəti identifikasiya üçün &beta-tubulin, kalmodulin və aktin genlərinin təhlili tələb olunur (Samson və b. 2007, Balajee və b. 2005a).

Aspergillus flavus

Aspergillus flavus bütün dünyada yayılmışdır və normal olaraq torpaqda və bir çox çürüyən üzvi maddələrin üzərində saprofit kimi baş verir, lakin o, həm də insanlar və heyvanlar üçün tanınmış patogendir. İmmun çatışmazlığı olan xəstələrdə otit, keratit, kəskin və xroniki invaziv sinüzit, ağciyər və sistem infeksiyalarının törədicisi olur. A. flavus sonra ikinci yerdədir A. fumigatus insan invaziv aspergillozunun səbəbi kimi (Hedayati və b. 2007).

RG-2 orqanizmi.

Morfoloji təsvir:
Czapek Dox agarda koloniyalar dənəvər, düz, tez-tez radial yivli, əvvəlcə sarı, lakin yaşla tez parlaqdan tünd sarı-yaşıl rəngə çevrilir. Konidial başlar adətən şüalanır, sonradan boş sütunlar əmələ gətirmək üçün parçalanır (əsasən 300-400 & mikrom diametrdə), biseriyalıdır, lakin bəzi başları birbaşa vezikülün üzərində yerləşən fialidlərə malikdir (uniseriate). Conidiofor stipes hialin və qaba kobuddur, tez-tez vezikül yaxınlığında daha çox nəzərə çarpır. Konidiyalar kürəşəkillidən yarımkürəşəkilli (diametri 3-6 mikrom), solğun yaşıl və nəzərəçarpacaq dərəcədə exinulyasiyaya malikdir. Bəzi suşlar qəhvəyi rəngli sklerotiya əmələ gətirir.

Əsas Xüsusiyyətlər:
Yayılan sarı-yaşıl koloniyalar, kobud divarlı çəpərlər, bütün səthində fialidlər daşıyan yetkin veziküllər və nəzərəçarpacaq dərəcədə exinulated konidiyalar.

Antifungal həssaslıq: Aspergillus flavus kompleks (Avstraliya Milli məlumatları) MİK & mikroq/ml.
Yox < 0,016 0.03 0.06 0.125 0.25 0.5 1 2 4 > 8
AmB 68 1 5 7 30 22 3
VORI 68 1 1 6 25 24 11
POSA 57 2 1 5 16 26 7
ITRA 68 1 3 11 43 10

Aspergillus bölmə Fumigati mavi-yaşıl və kolbaşəkilli veziküllərin çalarlarında sütunvari konidial başları olan uniseriate aspergilla ilə xarakterizə edilən növlər daxildir (Raper və Fennell, 1965). &ldquo-ya aid teleomorfik növlərAspergillus fischeri seriyası&rdquo A. fumigatus qrupu (Raper və Fennell, 1965) cinsinə yerləşdirildi Neosartoriya (Trichocomaceae ailəsi) Malloch və Cain (1972). Bölmə Fumigati 23-dən çoxu daxildir Neosartoriya növ və 10 anamorfik növ (Samson və b. 2007).

Baxmayaraq ki A. fumigatus kompleks daxilində əsas insan patogeni kimi tanınır, son filogenetik tədqiqatlar bəzi insan və heyvan infeksiyalarının səbəb ola biləcəyini göstərdi. A. lentulus, A. fumigatiaffinis, A. fumisynnematus, A. felis, Neosartorya fischeri, N. pseudofischeri, N. udagawae, N. hiratsukaeN. spinsosa (Coriglione və b. 1990 Summerbell və b. 1992 Padhye və b. 1994a Lonial və b. 1997 Jarv və b. 2004 Balajee et al. 2005, 2006 Barrs və b. 2013).

Aspergillus fumigatus

RG-2 orqanizmi.

Morfoloji təsvir:
Czapek Dox agarda koloniyalar adətən mavi-yaşıl olur, səthi zamşabənzər sıx keçə konidioforlardan ibarətdir. Konidial başlıqlar adətən sütunvari (400 x 50 & mikrora qədər, lakin çox vaxt daha qısa və daha kiçik) və tək seriyalıdır. Conidiophore stipes qısa, hamar divarlıdır və vezikülün yuxarı üçdə ikisində bir sıra fialidləri dəstəkləyən konusvari son veziküllərə malikdir. Konidiyalar uzun zəncirlər əmələ gətirən bazipetal ardıcıllıqla əmələ gəlir və kürədən alt kürələrə (diametri 2,5-3,0 mikrom), yaşıl və incə kobud olur. Qeyd: Bu növ 55C maksimum böyümə temperaturu ilə termotolerantdır.

Əsas Xüsusiyyətlər:
Bir sıralı və sütunvari konidial başlıqlar vəzikülün yuxarı üçdə ikisi ilə məhdudlaşır və bir-birinə təxminən paralel olaraq əyilir.

Molekulyar İdentifikasiya:
İTS-nin ardıcıl analizi yalnız növ kompleksi səviyyəsini müəyyən etmək üçün kifayətdir. Qəti identifikasiya təhlili üçün &beta-tubulin, kalmodulin və aktin genləri tələb olunur (Samson və b. 2007 Balajee və b. 2005).

Antifungal həssaslıq: Aspergullus fumigatus kompleks (Avstraliya Milli məlumatları) MİK & mikroq/ml
Yox < 0,008 0.016 0.03 0.06 0.12 0.25 0.5 1 2 4 8 > 16
AmB 523 2 40 122 167 130 58 3 1
VORI 486 1 1 27 112 259 54 11 13 5 3
POSA 415 7 27 50 69 162 79 13 7 0 0 1
ITRA 523 1 6 17 41 74 244 115 15 5 1 4
ANID 249 5 170 52 18 1 1 2
MICA 249 91 95 48 12 2 1
CAS 264 2 22 91 106 24 12 1 5 5

Aspergillus felis -nin üzvüdür A. fumigatus mürəkkəbdir və insanlarda, itlərdə və pişiklərdə invaziv aspergilloz və rinosinüzitin törədicisi kimi bildirilmişdir. Bütün ev sahibi növlərdə xəstəlik tez-tez aqressiv antifungal terapevtik rejimlərə davamlıdır.

RG-1 orqanizmi.

Morfoloji təsvir:
koloniyaları A. felis zamşaya bənzəyən flokoza, ağ rəngli konidiyaların səpələnmiş boz yaşıl yamaqları ilə (konidiasiya yavaşdan zəifdir). A. felisin konidial başları qısa, sütunlu və bir sıralıdır. Konidiofor zolaqları hamar divarlıdır və veziküllər adətən subglobose formada olur. Konidiya globose (diametri 2-3 & mikrom), hamardan incə kobudlaşmışa qədər.

Molekulyar İdentifikasiya:
A. felis
bölmənin digər üzvlərindən fərqləndirilə bilər Fumigati &beta-tubulin, kalmodulin və aktin genlərinin ardıcıl analizi ilə (Barrs) və b. 2013). İTS ardıcıllığı tövsiyə edilmir.

Şərh:
A. felis
fenotipik olaraq oxşardır Aspergillus viridinutans, lakin 45°C-də böyümək qabiliyyəti ilə fərqlənir. Bu növ filogenetik olaraq əlaqəlidir Neosartorya aureolaN. udagawae və fərqlənir N. aureola heterotallik çoxalma rejiminə sahib olmaqda.

Antifungal həssaslıq: Aspergillus felis (Avstraliya Milli məlumatları) MİK & mikroq/ml
Yox < 0,016 0.03 0.06 0.125 0.25 0.5 1 2 4 > 8
AmB 13 1 11 1
VORI 13 1 3 1 5 3
POSA 13 4 3 2 1 2 1
ITRA 13 1 2 2 4 1 3

Aspergillus lentulus torpaqda geniş yayıldığı görünür və indi immunosupressiv xəstələrdə invaziv aspergillozun törədicisi kimi yaxşı sənədləşdirilmişdir. A. lentulus hissəsidir A. fumigatus kompleks.

RG-2 orqanizmi.

Morfoloji təsvir:
koloniyaları A. lentulus zamşaya bənzəyir, flokozaya qədər, ağ rəngli konidiyaların səpələnmiş boz-yaşıl yamaqları var (əksər suşlarda kondisiya yavaşdan zəifdir). Konidial başlar qısa, sütunlu və bir sıralıdır. Konidiofor ucları hamar divarlıdır, bəzən qıvrımlıdır və tez-tez boyunda sıxılır. Veziküllər adətən subglobose formada olur. Konidiya kürəşəkillidən geniş ellipsoidə qədər (diametri 2-3,2 & mikrom), hamardan incə kobudlaşmışa qədər.

Molekulyar İdentifikasiya:
A. lentulus
bölmənin digər üzvlərindən fərqləndirilə bilər Fumigati &beta-tubulin, kalmodulin və aktin genlərinin ardıcıl analizi ilə (Samson) və b. 2007, Balajee və b. 2005b). İTS ardıcıllığı tövsiyə edilmir.

Antifungal həssaslıq: Aspergillus lentulus (Avstraliya Milli məlumatları) MİK & mikroq/ml
Yox <0.03 0.06 0.125 0.25 0.5 1 2 4 8 > 16
AmB 5 1 1 3
VORI 5 3 2
POSA 5 1 1 3
ITRA 5 2 1 1 1

Sinonimiya: Neosartorya fischeri

Aspergillus fischeri -nin üzvüdür A. fumigatus mürəkkəbdir və əsasən konservləşdirilmiş qida məhsullarında rast gəlinir və hazırda immunosupressiv xəstələrdə invaziv aspergillozun törədicisi kimi sənədləşdirilmişdir.

RG-1 orqanizmi.

Morfoloji təsvir:
koloniyaları A. fischeri zamşabənzər flokoza, ağdan solğun sarıya qədər yavaşdan zəif konidiasiyaya malikdir. Konidial başlar qısa, sütunlu və bir sıralıdır. Konidiofor ucları hamar divarlıdır və veziküllər adətən alt kürədən kolbaya qədərdir. Konidiya kürə şəklində və yarımkürəşəkilli (diametri 2-2,5 mikrom), hamardan incə kobudlaşmışa qədər. 37C-də yaxşı böyümə.

Molekulyar İdentifikasiya:
A. fischeri bölmənin digər üzvlərindən fərqləndirilə bilər Fumigati &beta-tubulin, kalmodulin və aktin genlərinin ardıcıl analizi ilə (Samson) və b. 2007 Balajee və b. 2005b). İTS ardıcıllığı tövsiyə edilmir.

Antifungal həssaslıq: Aspergillus fischeri (Avstraliya Milli məlumatları) MİK & mikroq/ml
Yox <0.03 0.06 0.125 0.25 0.5 1 2 4 8 > 16
AmB 8 1 5 2
VORI 8 1 3 3 1
POSA 8 4 1 1 2
ITRA 8 1 2 2 3

Aspergillus altcins Nidulantlar Gams və b. (1985) biseriat konidial başları, qəhvəyi piqmentli tez-tez qısa stipiləri və yaşıl konidiyaları olan növlər daxildir. Kleistothecia yumşaq divarlıdır, Hülle hüceyrələri ilə əhatə olunmuşdur və askosporlar qırmızıdan bənövşəyi rəngə qədərdir. Bölmə Nidulantlar cinsin ən böyük yarımcinslərindən biridir Aspergillus, və 80-ə yaxın növü əhatə edir. Əsasən tibbi patogenlər kimi bir neçə növ bildirilmişdir Aspergillus nidulans, həm də A. sydowii, A. unguis, A. rugulovalvusA. tetrazonus.

Molekulyar İdentifikasiya:
İTS ardıcıllığı yalnız növ kompleksini müəyyən etmək üçün kifayətdir. A. nidulans bölmənin digər üzvlərindən fərqləndirmək olar Nidulantlar &beta-tubulin, kalmodulin və aktin genlərinin ardıcıl analizi ilə.

Aspergillus nidulans

Aspergillus nidulans dünya miqyasında yayılmış tipik torpaq göbələyidir, onun insan və heyvanlarda da xəstəliyə səbəb olduğu bildirilmişdir.

RG-1 orqanizmi.

Morfoloji təsvir:
Czapek Dox agarda koloniyalar adətən düz yaşıl rəngdədir, konidial təbəqənin daxilində və üzərində tünd qırmızı-qəhvəyi kleistotesiya əmələ gəlir. Əks zeytundan tünd-boz və ya bənövşəyi-qəhvəyi ola bilər. Konidial başlar qısa, sütunvari (diametri 70 x 30 & mikrom-a qədər) və biseriatdır. Konidiofor ucları adətən qısa, qəhvəyi və hamar divarlıdır. Konidiyalar kürəşəkilli (diametri 3-3,5 mikrom) və kobud divarlıdır.

Əsas Xüsusiyyətlər:
Konidial başlar qısa, sütunvari və biseriyalıdır. Xəndəklər adətən qısa, qəhvəyi və hamar divarlıdır. Konidiyalar kürəşəkilli və kobud divarlıdır.

Antifungal həssaslıq: Aspergillus nidulans kompleks (Avstraliya Milli məlumatları) MİK & mikroq/ml
Yox < 0,016 0.03 0.06 0.125 0.25 0.5 1 2 4 > 8
AmB 24 5 10 1 6 2
VORI 24 3 7 13
POSA 24 1 6 6 5 2
ITRA 24 1 3 6 10 4

Qara aspergilli, Aspergillus bölmə Nigri (Gams və b. 1985) bir və ya biseriya konidial başları, sferikdən piriformalı veziküllərə, hamar divarlı çəpərlərə və qara və ya qara rəngli konidiyalara yaxın növlər daxildir. Bu qrupa təxminən 26 növ daxildir Aspergillus niger təcrid olunmuş ən çox yayılmış növdür. A. niger bütün qitələrdən təcrid oluna bilər və ətraf mühit şəraitinə görə çox seçici deyil. Bu qrupda insan və heyvan infeksiyası ilə əlaqəli olan digər növlər daxildir A. acidus, A. aculeatus, A. brasiliensisA. tubingensis.

Molekulyar İdentifikasiya:
In Aspergillus bölmə Nigri, bütün növlər calmodulin ardıcıllığı məlumatlarından istifadə etməklə bir-birindən fərqləndirilə bilər və biri istisna olmaqla, hamısı &beta-tubulin ardıcıllığı məlumatlarından istifadə etməklə fərqləndirilə bilər. İTS ardıcıllığı yalnız bir və biseriat növlərin kobud təsnifatı üçün istifadə edilə bilər (Samson və b. 2007).

Aspergillus niger

Aspergillus niger cinsin ən çox yayılmış və asanlıqla müəyyən edilə bilən növlərindən biridir Aspergillus, sonradan qara konidiya daşıyan ağdan sarıya qədər miselyum mədəniyyətinin səthi ilə. Bu növ aspergillomalarda çox rast gəlinir və otomikozun ən çox rast gəlinən agentidir. O, həm də ümumi laboratoriya çirkləndiricisidir.

RG-1 orqanizmi.

Morfoloji identifikasiya:
Czapek Dox agarda koloniyalar tünd-qəhvəyidən qara konidial başların sıx təbəqəsi ilə örtülmüş yığcam ağ və ya sarı bazal hissədən ibarətdir. Konidial başlar böyükdür (diametri 3 mm-ə qədər 15-20 &mikrom), kürəşəkilli, tünd qəhvəyi rəngdədir, radiasiyaya çevrilir və yaşla bir neçə boş sütuna bölünməyə meyllidir. Conidiophore stipes hamar divarlı, hialin və ya vezikülə doğru tündləşir. Konidial başlar biseriatdır, fialidlər qəhvəyi, çox vaxt septat metulalar üzərində əmələ gəlir. Konidiyalar kürəşəkillidən yarımkürəşəkilli (diametri 3,5-5 mikrom), tünd qəhvəyi-qara və kobud divarlıdır.

Əsas Xüsusiyyətlər:
Konidial başlar tünd-qəhvəyidən qaraya qədərdir, radiasiyalı və fialidlərdən iki dəfə uzun olan metulalarla biseriatdır. Konidiya qəhvəyi və kobud divarlıdır.

Antifungal həssaslıq: Aspergillus niger kompleks (Avstraliya Milli məlumatları) MİK & mikroq/ml
Yox < 0,016 0.03 0.06 0.125 0.25 0.5 1 2 4 8 > 16
AmB 75 16 27 16 13 3
VORI 71 3 5 8 16 28 10 1
POSA 60 1 7 7 15 18 12
ITRA 75 1 3 8 13 34 14 1 1

Aspergillus bölmə Terrei (Gams və b. 1985) Aspergillus terreus kompleksə tünd qəhvəyi çalarlarda biseriat, sütunvari konidial başları olan növlər daxildir (Raper və Fennell 1965). Bu bölmənin ən əhəmiyyətli növləri A. terreus, ətraf mühitdə hər yerdə olan (Samson və b. 2011). Digər iki növün tibbi patogenlər olduğu bildirilmişdir. A. alabamensisA. niveus.

Molekulyar İdentifikasiya: A. terreus bölmənin digər üzvlərindən fərqləndirmək olar Terrei &beta-tubulin, calmodulin və aktin genlərinin ardıcıl analizi ilə. İTS ardıcıllığı yalnız növlərin kompleks səviyyəsini müəyyən etmək üçün kifayətdir.

Aspergillus terreus

Aspergillus terreus adətən torpaqda olur və bəzən insan və heyvanların patogeni kimi bildirilir.

RG-2 orqanizmi.

Morfoloji identifikasiya:
Czapek Dox agarda koloniyalar adətən zamşa bənzəyir və darçın buffından qum-qəhvəyi rəngə qədər sarıdan dərin çirkli qəhvəyi tərs rəngə malikdir. Konidial başlar yığcam, sütunvari (diametri 500 x 30-50 & mikrom-a qədər) və biseriyalıdır. Metulalar fialidlər qədər uzundur. Conidiofor stipes hialin və hamar divarlıdır. Konidiyalar kürədən ellipsoidə qədər (diametri 1,5-2,5 mikrom), hialindən bir qədər sarıya qədər və hamar divarlıdır.

Əsas Xüsusiyyətlər:
Darçın-qəhvəyi mədəniyyətlər, konidial başlar fialidlər qədər uzun müddətdir metula ilə biseriatdır.

İstinadlar:
Raper və Fennell (1965), Domsch və b. (1980), McGinnis (1980), Soğan və b. (1981), Samson və Pitt (1990), Samson və b. (1995), de Huq və b. (2000) və Klich (2002).


2. Göbələklərdə Tənzimlənən Hüceyrə Ölümü

Yeni nəsil göbələk əleyhinə terapevtiklər üçün konseptual, eləcə də mexaniki cəhətdən yeni hədəfləri aşkar etmək üçün böyük potensiala malik yeni kəşf sahəsi, əvvəllər proqramlaşdırılmış hüceyrə ölümü (PCD) olaraq adlandırılan tənzimlənən hüceyrə ölümüdür (RCD). Son iki onillikdə birhüceyrəli eukariotlarda RCD-nin baş verməsi intensiv tədqiqat mövzusu olmuşdur və göbələklərin tənzimlənən hüceyrə ölümünün bir neçə fərqli alt proqramlarına tabe olduğu göstərilmişdir. Bu tədqiqatların əksəriyyəti yaxşı qurulmuş model sistemində aparılmışdır Saccharomyces cerevisiae. 2018-ci il Hüceyrə Ölümü üzrə Nomenklatura Komitəsi tərəfindən təklif olunan hüceyrə ölümü üsullarının təsnifatına və mayada hüceyrə ölümü nomenklaturasına dair son təlimatlara əsasən [35, 36], S. cerevisiae və ehtimal ki, digər göbələklər ən azı üç fərqli RCD növünə məruz qala bilər: daxili apoptoz (əvvəllər tip I PCD), otofagik hüceyrə ölümü (əvvəllər II tip PCD) və tənzimlənən nekroz (əvvəllər III tip PCD). Tarixən əhəmiyyətli səylər bu RCD yollarının daha böyük mexaniki və bioloji anlayışının əldə edilməsinə yönəldilmişdir. S. cerevisiae, son tədqiqatlar da daxil olmaqla, insan patogen göbələklərində RCD ilə bağlı yeni anlayışlar təmin etmişdir CandidaAspergillus növlər. Burada, bu mövzuda əsas anlayışları və əhəmiyyətli irəliləyişləri ümumiləşdiririk.

2.1. Göbələklərdə Tənzimlənən Hüceyrə Ölümünün Bioloji Rolları

Eukaryotik hüceyrələrin funksional olaraq qocaldığı, zəiflədiyi və nəticədə ölümlə qarşılaşdığı siqnallar, mexanizmlər və yollar onların mənşəyi, inkişafı və yetkinləşməsi üçün eyni dərəcədə vacibdir. Beləliklə, RCD hüceyrə populyasiyaları üçün daha böyük mikrob icmasına aktiv şəkildə töhfə verməyən və ya ondan zərər çəkən fərdi hüceyrələri ən səmərəli və ən az pozucu senzura etmək üçün bir vasitə kimi inkişaf etmişdir. RCD-nin bu baxımdan xüsusilə mənalı olduğu nümunə parametrlərinə çoxalma, koloniyaların qurulması, mövcud koloniyalardan və ya abseslərdən kvorum aşkarlanması və metastatik yayılma, biofilmin olgunlaşması və antifungal agentlər qarşısında sağ qalma və yaşamaq və patogenez üçün zəruri olan bir çox digər proseslər daxildir. Beləliklə, göbələk RCD-ni gələcək nəsil antifungal terapevtiklərin innovativ və mexaniki cəhətdən yeni hədəfi kimi dəstəkləyən əsaslı əsaslar var.

Birhüceyrəli orqanizmlərdə apoptotik proqramın hissi metazoanlarda olduğu qədər aydın olmasa da, ortaya çıxan məlumatlar zədələnmiş və ya köhnə hüceyrələrin ölümünün klonal populyasiyanın sağ qalmasına kömək etdiyi ssenariləri təsvir edir [37]. RCD-nin uğursuz cütləşmə [38], maya koloniyasının diferensasiyası [39] və ya replikativ və xronoloji yaşlanma [40�] kimi fizioloji ssenarilər zamanı baş verdiyi göstərilmişdir. Replikativ qocalma fərdi ana hüceyrənin keçə biləcəyi hüceyrə bölünmələrinin sayına aid olsa da, xronoloji yaşlanma bölünməyən hüceyrələrin stasionar fazada canlı qalma müddətini əks etdirir. Hər iki qocalma ssenarisində apoptoz köhnə, geri dönməz şəkildə zədələnmiş və ya daha böyük göbələk hüceyrəsi populyasiyasına zərər verən funksiyaları pozulmuş hüceyrələrin aradan qaldırılmasına xidmət edir. Bundan əlavə, apoptotik proqram rəqabət edən göbələk populyasiyaları tərəfindən də qaçırıla bilər, məsələn, həssas ştammlarda hüceyrə ölümünə səbəb olan öldürücü toksinlərin ifrazı ilə [43].

Ümumilikdə, RCD alt proqramları, yaşamaq və çoxalmaq üçün zəruri olan siqnal molekullarından tutmuş, antifungal agentlər də daxil olmaqla, mövcud ətraf mühit və ev sahibi təhlükələrinə qədər müxtəlif stimullar və ssenarilərin bolluğu ilə induksiya edilə bilər. Xüsusi RCD yollarının aktivləşdirilməsi üçün fərqli molekulyar oyunçulardan və hadisələrdən nisbi asılılıq, orqanizmin xüsusi bir stress siqnalı ilə qarşılaşdığı şərti kontekstlərə tabe olduğu görünür [44]. Molekulyar və biokimyəvi xüsusiyyətlərinə əsasən, hüceyrə ölümünün apoptotik rejimi xarici və daxili apoptoza bölünür [35]. Xarici apoptoz, sonradan hüceyrə ölümünə səbəb olan spesifik transmembran reseptorlarının aktivləşdirilməsi ilə başlasa da, daxili apoptoz, hamısı mitoxondriya vasitəçiliyi ilə hüceyrə ölümü proseslərində birləşən müxtəlif hüceyrə stressləri ilə induksiya edilə bilər. Maya, çox güman ki, tipik xarici apoptoza tab gətirməsə də, daxili apoptoz mövcuddur və bu günə qədər mayada ən yaxşı öyrənilmiş RCD ssenarisini təmsil edir. Morfoloji cəhətdən hüceyrə ölümünün bu üsulu sistematik DNT fraqmentasiyası, nüvə kondensasiyası, plazma membranının xarici vərəqində fosfatidilserinin məruz qalması və reaktiv oksigen növlərinin yığılması daxil olmaqla əlamətdar xüsusiyyətlərlə xarakterizə olunur.

Apoptotik hüceyrə ölümünü idarə edən əsas molekulyar mexanizm təkamül yolu ilə qorunmuş görünür və son iyirmi ildə mayada apoptozun məməlilərin əsas effektorlarının çoxsaylı həmkarları müəyyən edilmişdir [45�]. Məsələn, bunlara apoptoza səbəb olan amilin (Aif1) və Endonukleaz G (Nuc1) ortoloqları daxildir. Apoptotik insult və nüvəyə köçürüldükdən sonra mitoxondriyadan sərbəst buraxıldıqda, DNT-nin parçalanmasına və sonradan hüceyrə ölümünə səbəb olurlar [48, 49]. Endonukleaz G üçün bu proses mitoxondrial adenin translokatorunu əhatə edir, bu da maya apoptozunda mitoxondrial keçiricilik keçid məsaməsinin əmələ gəlməsini və aktivləşdirilməsini nəzərdə tutur [48].

Hiperpolyarizasiya, oksidləşdirici partlayış və reaktiv oksigen növlərinin (ROS) yaranması, mitoxondrial transmembran potensialının dağılması, sitokromun sərbəst buraxılması kimi mitoxondrial xüsusiyyətlər C, sitokromun itirilməsi C oksidaz fəaliyyəti və ya mitoxondrial parçalanmanın müvafiq tetikleyicilərdən və ssenarilərdən asılı olaraq müxtəlif dərəcədə apoptotik ölümə töhfə verdiyi göstərilmişdir [50]. Buna baxmayaraq, aşağıda müzakirə olunduğu kimi, fürsətçi maya və patogen göbələklər də daxil olmaqla, müxtəlif göbələk orqanizmləri arasında bu mövzularda dəyişikliklər müşahidə edilmişdir.

2.2. Tənzimlənən Hüceyrə Ölümü Alt Proqramları Saccharomyces cerevisiae

Baxmayaraq ki S. cerevisiae tipik insan patogen deyil, fürsətçi çıxması S. cerevisiae xroniki xəstəliyi, xərçəngi və immunosupressiyası olan xəstələrdə infeksiyalar bildirilmişdir [51]. Üstəlik, bu orqanizmdən bir model kimi istifadə edilən tədqiqatlar vasitəsilə RCD haqqında əhəmiyyətli fikirlər əldə edilmişdir. Aşağıdakı müzakirədə RCD-nin genetik və mexaniki aspektləri nəzərdən keçirilir S. cerevisiae Bu baxımdan, xüsusən də bir çox RCD determinantları və yolları nəzərə alınmaqla yüksək prioritet insan patogenlərində homoloji sistemlərə malikdir, o cümlədən Candida növlər və patogen qəliblər.

2.2.1. Daxili apoptoz (Tip I PCD)

Daxili apoptoz, bəlkə də hüceyrə komponentlərinin kaspazadan asılı və ya müstəqil mexanizmlər tərəfindən sistematik şəkildə parçalandığı RCD yollarının ən məşhurudur. Məməlilərin daxili apoptozu ilə müqayisə oluna bilən mayada apoptoz sitoxromun sərbəst buraxılması ilə müşayiət olunur. C mitoxondriyadan, beləliklə oksidləşdirici fosforlaşmanı pozur. Bununla birlikdə, sitozolik sitokromun iştirakı C apoptosomların əmələ gəlməsində, məməli hüceyrələrində müşahidə olunduğu kimi, hələ mayada nümayiş etdirilməmişdir.

Bu günə qədər məməli kaspazlarının bir ortoloqu müəyyən edilmişdir S. cerevisiae: metakaspaz Yca1 (ləqəb Mca1) [52]. Kaspazaların (aspartat-X diyadlarını hədəf alan) və metakaspazların (lizin-X və ya arginin-X diadlarını hədəf alan) fərqli parçalanma xüsusiyyətlərinə baxmayaraq, bu proteazlar ümumi təkamül mənşəyini bölüşür və hüceyrə ölümünün ayrılmaz hissəsidir. Xüsusilə, TSN zülalı (Tudor stafilokok nükleazı) kaspazaların və metakaspazaların ilk ümumi substratı kimi müəyyən edilmişdir, filogenetik məsafəyə baxmayaraq ciddi funksional qorunma tələb olunur [53]. Tədqiq olunan apoptotik ssenarilərin təxminən 40%-i S. cerevisiae Bu günə qədər hüceyrə məhvinin icraçısı kimi Yca1-in mövcudluğundan ən azı qismən asılıdır [54]. Kaspaza bənzər fəaliyyətlərin hətta Yca1 olmayan hüceyrələrdə də aşkarlanması faktı göstərir ki, kaspaza bənzər aktivliyə malik əlavə proteazlar mayada RCD-yə kömək edir [55]. Belə proteazlardan biri koheziya kompleksinin alt bölməsi olan Scc1-in (ləqəb Mcd1) parçalanması yolu ilə metafazadan anafazaya keçid zamanı bacı xromatidlərin ayrılmasını asanlaşdıran yüksək dərəcədə qorunan proteaz olan separin Esp1 ola bilər [56]. Esp1 sistein proteazlarının CD qəbiləsinə (superailəsinə), kaspazaları, transamidazaları və bakterial gingipainləri də əhatə edən proteazlar qrupuna aiddir [56]. Hidrogen peroksidin səbəb olduğu apoptoz zamanı Scc1-in Esp1 tərəfindən parçalanması C-terminal Scc1 fraqmentini verir ki, bu da nüvədən mitoxondriyaya yerləşərək, mitoxondrial transmembran potensialının, sitoxromun dağılmasına səbəb olur. C sərbəst buraxılması və hüceyrə ölümü [57]. Bir neçə əlavə proteaz maya apoptozu ilə əlaqələndirilmişdir. Bunların arasında HtrA2/Omi-ortoloji serin proteaz Nma111 oksidləşdirici stress nəticəsində yaranan hüceyrə ölümündə iştirak edir [58] və maya inhibitoru-apoptoz proteini Bir1-in proapoptotik parçalanmasından məsuldur [59]. Eyni şəkildə, serin karboksipeptidaz Kex1 hipoklorit və sirkə turşusu ilə müalicə zamanı hüceyrə ölümünün həyata keçirilməsində, həmçinin N-qlikozilləşmə qüsurlarında iştirak edir [60, 61].

Çoxsaylı endogen və ekzogen tetikleyicilərin mayada metakaspazadan asılı, eləcə də metakaspazadan müstəqil yollar vasitəsilə daxili apoptotik hüceyrə ölüm yollarını başlatdığı bildirilmişdir [45�]. Endogen tetikleyicilər arasında, məsələn, DNT zədələnməsi və replikasiya stressi [62], N-qlikozilləşmədə qüsurlar [61], xronoloji və ya replikativ yaşlanma [41, 42], sitoskeleton dinamikasında pozulmalar [63] və mRNT sabitliyinin pozulması [64] . Eyni şəkildə, maya apoptozu üçün müxtəlif ekzogen stimullar müəyyən edilmişdir, o cümlədən sirkə turşusu və hidrogen peroksidin aşağı dozaları, hiperosmotik stress, istilik, yüksək duz konsentrasiyası, UV şüalanması, dəmir, mis və manqan kimi ağır metallar, seramid, amiodaron, aspirin, müxtəlif antitümör agentləri və daha çox [45, 46, 65]. Patogenezlə əlaqəli olaraq, spesifik host müdafiə amillərinin müxtəlif göbələklərdə, o cümlədən apoptozun daxili yolunun induksiyası vasitəsilə hərəkət etdiyi göstərilmişdir. S. cerevisiae. Məsələn, suda-quruda yaşayanlar tərəfindən istehsal edilən dermaseptin ailəsindən olan peptidlər Aif1-dən asılı apoptozu tetikler [66] və bitki mənşəli müdafiə peptid osmotin, Rasdan asılı apoptozu aktivləşdirərək öldürür [67]. Maraqlıdır ki, hüceyrə ölümünün bu rejimi osmotinin plazma membran reseptoru Pho36 ilə bağlanmasını tələb edir və beləliklə, xarici apoptozun bir variantını təşkil edə bilər (həmçinin aşağıda Bölmə (4)-ə baxın).

Daxili apoptozun mitoxondrial yoluna daxil olan məməli zülallarının homoloqlarının mayada funksional olduğu və konservləşdirilmiş hüceyrə ölümü mexanizmləri vasitəsilə hərəkət etdiyi göstərilmişdir. For instance, heterologous expression of the human proapoptotic protein Bax in yeast causes outer mitochondrial membrane permeabilization, cytochrome C release, and cell death [45]. Simultaneous heterologous expression of the human antiapoptotic regulators Bcl-2 or Bcl-XL prevents Bax-induced death and enhances yeast resistance to the apoptotic stimuli H2O2 and acetic acid [50]. Thus, the intrinsic pathway of apoptosis in yeast can be complemented by human or other mammalian homologues, again highlighting the functional conservation of the apoptotic program.

2.2.2. Autophagic Cell Death (II tip PCD)

Autophagy represents the degradation pathway in eukaryotic cells through which the bulk of intracellular molecular turnover occurs, including breakdown of a wide range of cytoplasmic material such as aggregated proteins, organelles, and in some cases, pathogen determinants. During macroautophagy, cargo destined for degradation is sequestered into double-membraned vesicles termed autophagosomes and targeted to the vacuole for subsequent degradation and recycling. Discovered more than half a century ago, autophagy is now recognized as a catabolic process required for the coordinated regulation of cell development, infection control, aging, and other physiological and pathophysiological fates, including cell death. Similar to other RCD subroutines, the fundamental autophagic mechanisms and molecules are conserved across the evolutionary spectrum from microbes to man. Indeed, most of the autophagy-related (ATG) genes and pathways have been identified and characterized in yeast cells under nutrient limiting and other stress conditions [68, 69]. While autophagy mostly represents a prosurvival and longevity-ensuring program, excessive autophagy can also contribute to cell death, in particular during development [70]. Autophagic cell death is characterized by increased numbers of autophagosomes along with aberrant protein and organelle turnover. Evidence suggests that autophagic cell death occurs in yeast cells, but the precise contribution of distinct autophagic processes to cell death execution is relatively unexplored [46]. Even so, data supporting this concept are emerging. Heterologous expression of mammalian p53 in yeast causes cell death accompanied by an upregulation of autophagy, and deletion of ATG1ATG5 partly restores survival [71]. In addition, selective leucine starvation causes a mode of death that requires the presence of essential autophagy regulators such as Atg8 [72]. Indications for an involvement of excessive autophagy targeting mitochondria (mitophagy) derive from studies showing that cells lacking the mitophagy regulator Uth1 are no longer susceptible to cell death induced by expression of mammalian Bax [73]. However, as Bax also causes mitochondria-mediated apoptosis in yeast, the precise contributions of mitophagy to Bax-mediated yeast cell death requires further investigation.

2.2.3. Regulated Necrosis (III növ PCD)

Historically, necrosis has been predominantly considered to represent a purely coincidental mode of cell death upon extreme, biochemical, immunological, or mechanical insult that results in membrane rupture, swelling of organelles, and indiscriminant spilling of cell content into its surroundings. In recent years, a more specific view of necrosis has emerged, representing a more fine-tuned and regulated mechanism with implications in inflammatory responses in a variety of physiological conditions [74, 75]. In mammalian cells, the cascade of molecular events and signaling pathways that ultimately leads to necrotic RCD often involves proteases such as calpains and cathepsins, as well as the kinases RIP1 and RIP3 [74]. While most of our knowledge of regulated necrosis comes from mammalian systems, studies demonstrating this form of RCD existing in yeast have been published [76]. During chronological aging, a portion of dying cells exhibit typical hallmarks of necrosis, including loss of membrane integrity and nucleocytosolic redistribution of Nhp6A, the yeast counterpart of mammalian high mobility group box-1 protein HMGB1 [77]. This necrotic, age-associated cell death is inhibited by spermidine, a natural polyamine whose levels decline during the aging process. Spermidine inhibits cell death via an epigenetic process that involves histone H3 deacetylation and induction of autophagy. Thus, the ability of distinct pharmacological and genetic interventions to modulate this process argues that necrotic cell death is highly regulated. In this respect, deletion of distinct histone acetyltransferases blocks regulated necrosis as well [77]. Furthermore, peroxisomal function, perturbation of vacuolar function, and pH homeostasis as well as excess palmitoleic acid and elevated levels of free fatty acids have been associated with regulated necrotic cell death [78�]. In counterbalance, high levels of the vacuolar protease Pep4, the yeast orthologue of mammalian cathepsin D, prevent both apoptotic and necrotic death during yeast chronological aging. Notably, the inhibition of apoptosis requires the proteolytic activity of native Pep4, while the suppression of necrosis is facilitated by the short propeptide version of Pep4 [83].

2.3. Regulated Cell Death in Candida Növlər

Candida albicans represents the main model system to study fungal pathogenicity and virulence, and RCD of C. albicans has been observed upon exposure to various antifungals and other stressors ( Figure 1 ). Candida species have been shown to undergo RCD with typical characteristics of intrinsic apoptosis, whereas other forms of RCD such as autophagic cell death and regulated necrosis remain largely unexplored in this organism [84]. Among the triggers for such apoptotic pathways are for instance acetic acid and hydrogen peroxide [85], antifungal peptides from plants [86, 87], and other sources [88, 89], as well as a variety of botanicals such as perillaldehyde, honokiol, baicalin, and cinnamaldehyde [90�]. In addition, clinical antifungal agents, including caspofungin and micafungin, two echinocandins that disturb cell wall biogenesis, can promote RCD in C. albicans [94, 95]. In most of these scenarios, apoptotic death of Candida is accompanied by an accumulation of reactive oxygen species and mitochondrial dysfunction [91, 92, 96].

Model of host defense peptide mechanisms versus C. albicans. (1) Host cells activated by C. albicans deploy prestored and upregulate nuclear- (N-) encoded host defense peptides that directly interact with C. albicans to (2) target electronegative cell wall components (e.g., glycosylceramide or all specific cell proteins) (3) permeabilization of the cytoplasmic membrane during or following entry into the cytoplasm (4) target the electronegative phospholipid composition and transnegative potential (Δψ) of mitochondria (Mito) (5) perturb mitochondrial functions essential to cell cycle and trafficking, as well as de-energization and respiratory decoupling activation of caspase and/or metacaspase pathway responses (6) combined effects of cell envelope damage and mitochondrial dysfunction invokes the regulated cell death response which corresponds to hallmark features of apoptosis, including phosphatidylserine (PS) expression. This integrated model is supported by recent publications [115, 125, 131]. It should be understood that different antifungal peptides may exert different mechanisms or a different mechanistic sequence. For example, in the case of plant defensins, the sequence of membrane perturbation and ceramide accumulation has not yet been resolved. It could well be that ceramide accumulation is a first consequence of interaction with glucosylceramides (e.g., step 2 as with RsAFP2). Alternatively, membrane perturbation could potentially be a consequence of the induction of RCD and hence, only appears at step 6.

kimi S. cerevisiae, one metacaspase (Mca1) has been identified in C. albicans to date, and Mca1-dependent as well as -independent apoptotic cell death scenarios have been detected [84]. C. albicans cells lacking Mca1 are more resistant to oxidative stress-induced cell death than parental organisms [97]. Of note, increased caspase activity has been observed in relation to induction of apoptosis in C. albicans exposed to other stimuli, for instance the quorum sensing molecule farnesol [98, 99], the plant-derived macrocyclic bisbibenzyl plagiochin E [96] or silibinin [100]. In contrast, cell death resulting from caspofungin is executed through a Mca1-independent manner but instead requires Aif1 [94, 101].

Amphotericin B, an antifungal agent in clinical use for more than 30 years, triggers apoptotic death of C. albicans [85, 102] and inhibits biofilm formation of C. albicans, C. krusei, və C. parapsiloz [103]. Its fungicidal effects are accompanied by increased caspase activities, and concomitant exposure to caspase inhibitors provides cytoprotection. Interestingly, simultaneous pharmacological inhibition of histone deacetylation enhances amphotericin B-induced apoptosis of established Candida biofilms [103]. Furthermore, earlier studies connected apoptotic death in C. albicans to increased Ras signaling [104] and defects in glutathione synthesis [105]. More recently, human lactoferrin has been reported to induce apoptosis in C. albicans via binding and inhibition of the plasma membrane H + -ATPase Pma1, which eventually results in disturbed ion homeostasis, mitochondrial dysfunction, and death [106]. Moreover, host cells seem to be able to utilize the apoptotic program of fungal pathogens as a defense system. For example, interaction with macrophages induces metacaspase activation and apoptosis in C. albicans [107]. In this process, distinct metacaspase substrates involved in glycolysis and protein quality control were decreased [107].

It should be understood that a given fungal organism may employ distinct apoptotic pathways, depending on multiple factors in context. For example, cell density may affect nutritional availability or activate quorum sensing pathways leading to apoptosis [108]. Thus, the effects of farnesol or other signals with respect to quorum sensing, biofilm formation, and cell death may vary depending on the microenvironmental conditions in context of infection and the strategies of fungal growth characteristics therein (e.g., yeast versus hyphae).

2.4. Regulated Cell Death in Pathogenic Molds

Müqayisədə Sakkaromislər və ya Candida species, less is known regarding RCD in Aspergillus species (Ascomycetes) or their Mucoromycotina cousins, Rizopus və ya Mucor. However, recent data point to parallels in RCD among pathogenic fungi. Farnesol-induced quorum-sensing mechanisms may exist in Aspergillus, ultimately yielding RCD [109]. Məsələn, in A. nidulans, farnesol induces the expression of an apoptosis-inducing factor (AIF-) like mitochondrial oxidoreductase, mitochondrial ATPase inhibitor, and cytochrome C peroxidase. As a result, ROS accumulation and mitochondrial fragmentation is observed, consistent with a process of caspase-independent apoptosis in this organism. Early studies also suggest that Mucor species have explicit RCD responses to stress. For instance, the HMG-CoA reductase inhibitor lovastatin can inhibit posttranslational modification of proteins, including prenylation. Following exposure to lovastatin, M. racemosus arrested sporangiospore germination, yielding profound cytoplasmic condensation and DNA fragmentation [110]. More recent studies reported that specific sesterterpene-type metabolites, including ophiobolins A and B, can induce apoptosis in Mucor species [111]. The calcineurin pathway governs key virulence and antifungal resistance pathways in Rizopus as well as in other pathogenic molds such as Mucor. Interestingly, when exposed to the calcineurin inhibitor tacrolimus, the fungistatic triazole agents posaconazole and itraconazole became fungicidal for R. oryzae [112]. This effect was accompanied by DNA fragmentation, phosphatidylserine externalization, ROS accumulation, and activation of caspase-like functions. From these examples, there is considerable evidence supporting the view that caspase-dependent and -independent pathways of RCD exist in pathogenic molds and yeasts.


AspGD at the 25th Fungal Genetics Conference

We have submitted the following abstract to the 25th Fungal Genetics Conference, which will take place in March, 2009:

The Aspergillus Genome Database (AspGD), a curated database of Aspergillus gene, protein, and genomic sequence information for the fungal research community. Martha Arnaud 1 , Gail Binkley 1 , Marcus Chibucos 2 , Maria Costanzo 1 , Jonathan Crabtree 2 , Stuart Miyasato 1 , Prachi Shah 1 , Marek Skrzypek 1 , Jennifer Russo Wortman 2 , and Gavin Sherlock 1

1 Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305-5120 2 Institute for Genome Sciences, University of Maryland School of Medicine, Baltimore, MD

We have recently obtained funding to create a resource for the Aspergillus research community, AspGD, which will be a multispecies genomics database modeled on the CandidaSaccharyomyces Genome Databases. Our goal is to facilitate research on Aspergilli and on other medically and economically important fungal pathogens by providing a first-stop reference for Aspergillus genomics and molecular biology, with up-to-date, high-quality, curated scientific information and web-based research tools. We will implement an optimized annotation pipeline across all Aspergillus genomes, to maintain a set of current and consistent gene boundary annotations, and will incorporate links between genomes based on orthology and synteny data. Gene function, localization, and mutant phenotype annotations will be manually curated from the Aspergillus ədəbiyyat. We will provide web-based tools for sequence visualization and retrieval, and for analysis of sequence information and gene product annotations. All of the data in AspGD will be freely available to the public from http://www.aspgd.org/. In addition, we will maintain a colleague registry by which Aspergillus research community members may share contact information and research interests, to facilitate collaboration. We strive to be responsive to the needs of the research community, and we welcome your feedback and suggestions.

AspGD curators may be contacted from our Suggestions and Questions page. AspGD is supported by grant RO1 AI077599 from the NIAID at the NIH.


Videoya baxın: Aspergillosis (Iyul 2022).


Şərhlər:

  1. Mezishura

    Fikrinizi tamamilə bölüşürəm. Mənə elə gəlir ki, bu, əla ideyadır. Sizinlə tam razıyam.

  2. Quincy

    Bu gözəl ifadə doğru yerdə gələcək.

  3. Hildebrand

    Congratulations, I think this is a wonderful thought.

  4. Renzo

    Authoritative post :), tempting ...

  5. Abiel

    Mən buna şübhə edirəm.

  6. Nikor

    Məncə, onlar yanılırlar. Gəlin bunu müzakirə etməyə çalışaq.

  7. Marx

    Yes it's all science fiction

  8. Macauliffe

    Yalnız sizə lazım olan şey. Yaxşı mövzu, mən iştirak edəcəyəm. Birlikdə düzgün cavaba gələ bilərik.



Mesaj yazmaq