Məlumat

Etibarlı identifikasiya üçün bir Qısa Tandem Təkrar (STR) kifayətdirmi?

Etibarlı identifikasiya üçün bir Qısa Tandem Təkrar (STR) kifayətdirmi?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Laboratoriya genomda yalnız bir STR-nin analizini simulyasiya edir. Bu təhlil real həyatda etibarlı identifikasiya üçün kifayət edərmi? Yoxdursa, DNT-dən istifadə edərək kimisə daha etibarlı şəkildə tanımaq üçün nə edilə biləcəyini izah edin.


Eyni STR bir çox fərd tərəfindən paylaşıla biləcəyi üçün identifikasiya üçün bir STR əlbəttə kifayət deyil. Bununla belə, bir çox STR-nin birləşməsi identifikasiya üçün kifayət edəcəkdir. Tələb olunan say populyasiyada STR-nin neçə variantının mövcudluğundan (və ya müəyyən etdiyiniz növdən asılı olaraq) və mutasiya dərəcəsinin nə olmasından (nüvə STR-ləri bəzi digər genetik markerlərlə müqayisədə nisbətən sürətlə mutasiyaya uğrayır, lakin onlar hələ də tez-tez istifadə olunur, çünki ucuz və genotiplənməsi asandır).


CA2740414A1 - Snps-dən str allelik genotip çıxarmaq üçün sistem və üsul - Google Patents

[0001] Bu ixtira ümumiyyətlə fərdin genotipinə və daha spesifik olaraq STR müəyyən etmək üçün SNP-STR assosiativ nümunələrinin istifadəsinə aiddir.
bioloji nümunədən fərdləri müəyyən etmək üçün fərdin genotipi.

[0002] Bitki, heyvan və mikrob genomlarında nümunənin bioloji mənbəyini müəyyən etmək vasitəsi kimi genetik variantlardan istifadəni dəstəkləmək üçün kifayət qədər genetik dəyişkənlik mövcuddur.
İnsan və digər bitki və heyvan genomları DNT analizi ilə fərdləri birmənalı şəkildə müəyyən edə biləcək dərəcədə həll edilmişdir.

[0005] Bununla belə, STR lokuslarının təhlili texniki cəhətdən çətindir, onu yavaş, bahalı edir və bəzən məhkəmə-tibbi və ya əməliyyat mühitində əldə ediləndən daha yüksək nümunə keyfiyyəti tələb edir. Əksinə, SNP-ləri təhlil etmək üçün çoxlu sürətli, ucuz və asan kommersiya üsulları mövcuddur. Bunun səbəbi, SNP-lərin genetik xəstəlik və farmakogenetikadakı rollarına geniş cəlb edilməsi və onlara dərin maraq göstərməsidir.
Bu tibbi ehtiyac bazarın cazibəsini artırdı və SNP-nin bolluğunu təmin etmək üçün əlaqəli texnologiya təkan verdi
aşkarlama metodologiyaları. SNP-nin aşkarlanması üsulları davamlı olaraq təkmilləşir, əksinə STR-lər genetik tibb üçün markerlər kimi əhəmiyyətini itirir və buna görə də onların aşkar edilməsini yaxşılaşdırmaq üçün daha az texnoloji inkişaf səyləri tətbiq edilir. Bir çox ekspert hesab edir ki, yeni sistemləri təsdiqləmək üçün lazım olan ölçü, xərc və intensiv əmək tələbləri nəzərə alınmaqla, insan STR identifikasiya verilənlər bazası yaxın gələcəkdə heç vaxt dəyişməyəcək. Bu o deməkdir ki, insanın identifikasiyası DNT analizində texnoloji nailiyyətlərdən geri qalma riski altındadır.

[0014] Daha bir təcəssümdə, genom üçün SNP bürcünün yaradılması üçün kompüter sistemi və metodu təmin edilir, o cümlədən: server və şəbəkə ilə qoşulmuş müştəri, serverə və/yaxud şəbəkə ilə müştəriyə qoşulmuş proqram, üçün konfiqurasiya edilmiş proqram: genomda SNP-lərdən STR allel genotipini çıxarmaq üçün STR tipli kompüterləşdirilmiş üsulla əlaqəli olan genomda çoxlu SNP-lərin əldə edilməsi, o cümlədən: kompüter vasitəsilə genomun çoxsaylı SNP-lərinin qəbulu
kompüter tərəfindən genomun STR lokus allelinin qəbul edilməsi və kompüter tərəfindən SNP hesablanması
genomun çoxlu SNP-lərini STR ilə əlaqələndirən bürc assosiasiya dəyəri
genom üçün lokus alleli.

ŞƏKİLLƏRİN QISA TƏSVİRİ

[0022] Şəkil 8 daxili mikrovariantları ehtiva edən STR lokusunun və onun bir neçə allelinin nümunəsini göstərir.

İXHIRIN TƏCESMƏLƏRİNİN TƏSVİRİ

[0023] Bu ixtira nümunədə STR-allelik makiyajı çıxarmaq üçün onlardan istifadəyə icazə verən şəkildə müvafiq STR lokusları ilə genetik olaraq əlaqəli olan Tək Nukleotid Polimorfizmlərini (SNP) müəyyən etmək üçün üsulları təmin edir. Bu SNP STR-assosiativ genetik nümunələri genomik olaraq STR markerlərinə ekvivalent olacaq və buna görə də fərdin STR genotipini təyin etmək üçün istifadə edilə bilər. Nəticədə SNP
məlumat STR növünü çıxarmaq üçün istifadə oluna bilər və sonra müəyyən edilmiş STR-i axtarmaq üçün istifadə edilə bilər
bioloji nümunə ilə əlaqəli xüsusi fərdləri və ya qrupları müəyyən etmək üçün verilənlər bazası.

[00241 Şəkil 1, bir təcəssümə uyğun olaraq ən azı bir genomda SNP-lərdən STR allel genotipini çıxarmaq üçün sistemi təsvir edir. İxtira bioloji nümunədə STR allelləri haqqında bilik əldə etmək üsulu kimi SNP-lərin istifadəsi üçün analizi açıqlayır.
Şəkil 1-ə istinad edərək, ən azı bir müştəri kompüteri 110 şəbəkə 105 üzərindən ən azı bir server kompüterinə 115 qoşula bilər. Ən azı bir proqram 120 ən azı bir müştəri kompüterinə 110 və/yaxud ən azı bir serverə qoşula bilər. kompüter 115 şəbəkə üzərində.
Ən azı bir proqram 120 ən azı bir assosiativ dəyər təyinetmə modulundan 130 ən azı bir uyğunluq modulundan 145, ən azı bir SNP genotip verilənlər bazasından 135 və ən azı bir STR lokus allel verilənlər bazasından 140 ibarət ola bilər. Qeyd etmək lazımdır ki, verilənlər bazası 135 və 140 proqram 120-də və ya 120-dən kənar proqramda yerləşə bilər. Bundan əlavə, 120-ci proqram müştəri kompüterində 110 və/yaxud server kompüterində 115-də yerləşə bilər. Bundan başqa, bir çox əlavə verilənlər bazası və modullar 120-ci proqram tərəfindən istifadə oluna bilər və burada yerləşə bilər. proqram 120 və ya xarici proqram 120.

[00251 Ən azı bir assosiativ təyinetmə modulu 130 assosiativ dəyər kimi təyin edilmiş SNP-STR birgə irsiyyətinin statistik ehtimalını müəyyən edə bilər. A
assosiativ dəyərin ilk komponenti STR arasındakı əlaqənin tarazlığının pozulmasıdır
dəyişən təkrar bölgə və yaxın SNP. (Bu, aşağıda daha ətraflı təsvir edilmişdir.) Assosiativ dəyərin digər komponenti STR və SNP arasında diferensial mutasiya dərəcələridir.
(Bu, həmçinin aşağıda daha ətraflı təsvir edilmişdir.) Assosiativ dəyər verilənlər bazalarının skan edilməsi və ya birbaşa təcrübə vasitəsilə empirik olaraq müəyyən edilə bilər. Bundan əlavə, assosiativ dəyər empirik təhlildə əldə edilən məlumatlardan riyazi olaraq müəyyən edilə bilər.

[00261 Assosiativ dəyərin necə təyin olunduğunu izah etməyə kömək etmək üçün Şəkil 4 TPOX lokusunun filogenetik ağacını təsvir edir, ABŞ CODIS lokuslarından biri Qafqaz populyasiyasında STR allellərinin tezliyinə əsasən çəkilir. 5-dən 13-ə qədər olan rəqəmlər STR allellərinin, hərflər isə SNP-lərin təmsilidir. İxtira STR lokusları ilə əlaqəli olan SNP dəstlərindən ibarətdir ki, bunlardan SNP nümunələri dəstlərinə assosiativ STR-ləri təyin etmək üçün istifadə edilə bilər, beləliklə, SNP variantları və STR variantları arasında genetik körpü təmin edilir. Körpü həm genetik, həm də statistik olacaqdır.
Nəticə etibarilə, kompozit SNP növündən verilənlər bazası daxilində STR növü və beləliklə, STR nəticə çıxara bilər.
növü verilənlər bazası axtarışı üçün istifadə oluna bilər, beləliklə SNP texnologiyasının daha yeni texnoloji imkanlarından istifadə etməklə STR verilənlər bazası yardım proqramını qoruyub saxlaya bilərsiniz.

[0027] İxtiranın işə salınması üçün SNP-nin birə bir assosiasiyası
STR alleli ilə nümunə ciddi şəkildə lazım deyil. Məsələn: SNP STR ilə əlaqəli genetik nümunə THO1 6, 7 və 8 ilə əlaqələndirilə bilər, lakin 9, 10 və ya 10.1 ilə əlaqələndirilə bilər. Bütün 13 CODIS yeri və bəlkə də bəzi başqaları üçün eyni tipli assosiasiya etməklə CODIS-də axtarış aparılacaq.
məsələn, olan girişlər üçün verilənlər bazası:

ThO - 6, 7, 8 VWF - 5, 6, 7 D21-11, 12 Bu, bioloji nümunəyə töhfə verə biləcək bir qrup fərdlərin seçilməsi ilə nəticələnəcək. Digər məhkəmə məlumatları (cinayətin yeri və fərdin yeri) uyğunlaşa biləcək şəxslərin sayını daha da daraltmaq üçün istifadə edilə bilər.
Mümkün uyğunluqların bu hovuzundan fərdlər bioloji nümunə ilə əlaqəsini təsdiqləmək üçün STR-SNP assosiativ dəyərlərinin müəyyən edilməsində istifadə olunan SNP nümunələri üçün təhlil edilə bilər. Genetik uyğunluğun bu triajı yalnız SNP-dən istifadə edərək STR verilənlər bazalarını axtarmaq üçün effektiv vasitə ilə nəticələnir
data.

[0032] Bir təcəssümdə SNP assosiasiya dəyəri genetik fenotip məlumatı ilə birləşdirilir. Məsələn, bir subyektin genetik piqmentasiya xüsusiyyəti müəyyən edilə bilər. Məsələn, nuklein turşusu nümunəsi və ya subyektin polipeptid nümunəsi SNP ilə birlikdə tək nukleotid polimorfizmlərini (SNP) müəyyən etmək üçün istifadə olunur.
assosiasiya dəyəri, saç kölgəsi, saç rəngi, göz kölgəsi və ya göz rəngi, dəri kölgəsi/rəngi kimi genetik piqmentasiya xüsusiyyətini ehtiva edən nəticə çıxarmağa imkan verir və daha sonra irqlə bağlı nəticə çıxarmağa imkan verir. Beləliklə, ixtiranın tərkibi və üsulları, məsələn, cinayət yerində mövcud olan nuklein turşusu nümunəsindən potensial cinayət qurbanının və ya cinayət törətmiş şəxsin fiziki xüsusiyyətləri ilə bağlı məlumatların əldə edilməsi üçün məhkəmə-tibbi alətlər kimi faydalıdır. əhliləşdirilmiş heyvanların, mal-qaranın və bu kimi məhsulların yetişdirilməsinə kömək etmək üçün alətlər, istədiyiniz kimi piqmentasiya xüsusiyyətini ehtiva edir. Bundan əlavə, ixtiranın SNP assosiasiya dəyəri ilə birlikdə istifadə edilə bilən genetik fenotiplərə genetik xəstəliklər (məsələn, yaşa bağlı makulyar degenerasiya riski Huntington xəstəliyi, oraq hüceyrəli anemiya) daxildir (məsələn, ABŞ
2006/0263807 US2008/0193922). Bundan əlavə, şəxsi genetik məlumatların qorunması üçün bu məlumatların ciddi şəkildə nəzarətə alınacağı və məsələn, məhkəmə məmurlarına veriləcəyi nəzərdə tutulur.

[0033] Bu ixtiraya bənzətmə elektrik keçiriciliyinin nəzərdən keçirilməsində görünə bilər. Materiallara ümumiyyətlə keçiricilər və ya izolyatorlar deyilir. Məsələn, mis adətən keçirici, parça isə izolyator hesab olunur. Köhnə naqillərdə izolyator kimi parça tapıla bilər. Bununla belə, parça çoxsaylı plastik materiallar və ya şüşə ilə müqayisə edilərsə, bu materiallardan daha çox elektron keçirmə qabiliyyətinə malikdir. Buna görə də parça şüşəyə nisbətən keçiricidir.
Nəticə etibarı ilə keçiricilik elektronların yol boyu diferensial hərəkətidir. Bununla belə, qısaqapanma halında elektronların yolu pozulur və gərginlik itiriləcək və ya diferensial keçiricilərin funksional ekvivalent olduğu nöqtəyə qədər azalacaq. Bu ixtira ilə paralellik ondan ibarətdir ki, genetiklər adətən SNP-lərin STR-lərlə müqayisədə funksional olaraq sıfır mutasiya dərəcəsi nümayiş etdirdiyini və buna görə də iki növ genetik variant üçün mutasiyaların modem genotipinin təyinat yerinə müxtəlif sürətlə çatacağını düşünürlər. Bununla belə, genomun xüsusilə tibbi və ya fizioloji cəhətdən müvafiq sahələrində mutasiyalar orqanizmin genetik uyğunluğunun azalmasına və ya tamamilə itirilməsinə səbəb olduğundan - faktiki olaraq genomik qısaqapanma - xalis effekt genomik bir santimorqan daxilində belə aşkar genetik əlaqənin olmamasıdır. məsafə.
Buna görə də dogma göstərir ki, genetik identifikasiya üçün SNP-lərdən istifadənin praktiki faydası yoxdur.
Bu ixtira bu ümumi inancın yanlış olduğunu və STR və SNP arasında DNT kontekstində müəyyən edilə bilən və faydalı olan genetik birliyin olduğunu öyrədir.
identifikasiya.

[0034] Bir orqanizmin yüksək mutasiya nisbətləri ilə bağlı genetik mənada uyğun qalması üçün mutasiya nisbətini tarazlaşdırmaq üçün kəsilmiş seçim mexanizminin mövcud olduğu iddia edilmişdir: əslində, genetik ölüm (PNAS) vasitəsilə mutasiyaların aradan qaldırılması. 1997 94:16 səh. 8380-8386). Bu, genomun fenotipik cəhətdən uyğun olan bölgələrində vacibdir. Fenotipik uyğunluq vəziyyətində, kəsilmiş seçim mexanizminin funksiyası kimi allelik birləşmələr itirilə bilər. Bu ixtira bunun əksini açıqlayır - STR insan identifikasiyası üçün istifadə edilən genetik bölgələrdə fitneslə bağlı heç bir məhdudiyyət olmadığı üçün SNP və STR-lər neo-müasir insan genomlarının 23 xromosom cütü üzərində effektiv şəkildə sabitləşdiyi vaxtdan populyasiyadan süzülüb. Bu zaman çərçivəsi əhalinin səpələnməsi nəticəsində inkişaf etmiş birliklərə sahib olmaq üçün kifayət qədər uzundur. Bundan əlavə, bu ixtira yalnız bir neçə və ya bir neçə nəslin təkamül şəkli kimi baxıldıqda, ümumiyyətlə əlavə davam edən mutasiyalardan izolyasiya edilir.

[0035] Bu yanaşmanın məqsədəuyğunluğu fərdin nəslini təyin etmək üçün mövcud iki vasitənin yeni nəzərdən keçirilməsi ilə sübut edilə bilər. Autosomal SNP-lər fərdin insan populyasiyasının mənşəyinin müəyyən edilməsində istifadə olunur (23 və mən, DNAPrint Genomics).
Buna görə də SNP-lər təkamül yolu ilə əlaqələndirilə bilər və nəticədə bir qrup insan genetik “oxşarlığı” ilə nəticələnir. STR-lər fərdin etnik mənsubiyyətini proqnozlaşdırmaq üçün də istifadə edilmişdir (The DNT Ancestry Project, The Genographic Project). Bu onu göstərir ki, STR
allellər seçilmiş populyasiya ilə də əlaqələndirilir. Əslində SNP və STR allelləri eyni seçilmiş populyasiya ilə əlaqələndirilə bilər. Bundan belə nəticə çıxır ki, eyni populyasiya ilə əlaqəli olan SNP və STR allelləri bir-biri ilə əlaqəli olmalıdır. Bu unikal "A=B, B=C, A=C " perspektivi ixtiranın arxasında duran tezislərlə uyğun gələn nəticədir.
Bu ixtira xüsusi assosiativ dəyərlər əldə etmək və insan identifikasiyası tətbiqləri üçün istifadə etmək üçün SNP və STR allelləri arasında əlaqəni müəyyən edir.

[0036] SNP STR-assosiativ genetik nümunəsi tək bir SNP qədər az və ya təsadüfi olmayan şəkildə STR lokusu ilə əlaqələndirilə bilən qədər çox ola bilər. (Şəkil 4 nəzəri sadələşdirilmiş halı təqdim edir.) Şəkil 4-dən STR alleli 5 SNP ilə əlaqələndiriləcək.
Al bürcü.

[0037] SNP STR-assosiativ genetik nümunəsi, assosiativ dəyəri müəyyən edilə bilən istənilən genetik variant markerini ehtiva edə bilər. Bunlara aşağıdakılar daxil ola bilər, lakin bunlarla məhdudlaşmır:
Hədəf STR hiperdəyişən bölgəsini əhatə edən bölgələrdəki SNP-lər, bialel olan SNP-lər, triallelik SNP-lər, tetrallelik SNP-lər, əlavələr, silinmələr, sadə təkrar variantları, hədəf STR hiperdəyişən bölgəsinin hədəf lokus təkrar vahidləri daxilində SNP-lər, qeyri-hədəf STR-lər, nüsxə sayı variasiyaları, translokasiyalar, metilasiya modifikasiyaları, deasetilasiya modifikasiyaları, epigenetik markerlər və hər hansı digər müəyyən edilə bilən genetik variantlar. Bir aspektdə allel lokusunun genetik variantı amelogenindir. Başqa bir baxımdan, lokus bir xəstəlik və ya pozğunluqla əlaqələndirilir.

[0038] Alternativ təcəssümdə, STR ilə birlikdə SNP-lər üçün assosiasiya dəyərləri burada nümunə göstərildiyi halda, digər polimorfizmlər və ya genetik variasiya INDELS, nüsxə sayı variasiyaları (CNV), hiperdəyişən bölgələr və s. daxil olmaqla, lakin bununla məhdudlaşmayaraq STR-lərlə istifadə edilə bilər. .

[0039] Bu ixtiranın təcəssümü, STR verilənlər bazasında bioloji nümunə (məsələn, qan, sperma, vaginal yaxma, toxuma, saç, tüpürcək, sidik, sümük) ilə əlaqəli ola bilən şəxslərin müəyyən edilməsində STR təyininin istisna edilməsidir. , dəri və bədən mayelərinin və ya toxumalarının qarışıqları). Bu ixtira buna görə də SNP texnologiyasını “geriyə uyğun” edir
geniş STR verilənlər bazası ilə.

[0040] İxtira CODIS-ə daxil olmayan STR-lərlə istifadə üçün tətbiqlərə malikdir
və İnterpol, FSS və digərləri tərəfindən istifadə olunan verilənlər bazası kimi CODIS olmayan digər verilənlər bazaları ilə eyni dərəcədə uyğundur.

[0041] İxtira, həmçinin, Genom Geniş Assosiasiyasının Tədqiqatları kimi məhkəmə ekspertizası və ya insan identifikasiyası ilə əlaqəsi olmayan STR-lərlə istifadə üçün tətbiqlərə malikdir.

[0042] İxtira həmçinin nukleotidlərin sayına görə dəyişən təkrar vahidlərdən ibarət təkrar lokuslarla istifadə üçün tətbiqlərə malikdir, o cümlədən, lakin bunlarla məhdudlaşmır: di-, tri-, tetra-, penta-, heksa-, hepta- nukleotid təkrarlanır və daha çox sayda nukleotid olan təkrar vahidlər.

[0043] İxtira həmçinin müxtəlif uyğunluqlara malik təkrar vahidlərlə istifadə üçün tətbiqlərə malikdir, o cümlədən, lakin bunlarla məhdudlaşmır: başdan quyruğa, başdan-başa, quyruqdan quyruğa və əvvəlki təkrar vahid quruluşlarının bütün kombinasiyaları.

[0044] İxtira həm də insan olmayan fərdi identifikasiya ilə istifadə üçün tətbiqlərə malikdir. Qeyri-insan eyniləşdirməyə heyvanlar (ev və ya vəhşi), bitkilər, həşəratlar, onurğasızlar və mikroblar daxil ola bilər.

[0045] Yuxarıda qeyd edildiyi kimi, assosiativ dəyərin bir komponenti STR dəyişəninin təkrar bölgəsi ilə yaxınlıqdakı SNP-lər arasında əlaqə balanssızlığıdır. Assosiativ dəyərin başqa bir komponenti STR və SNP arasındakı diferensial mutasiya dərəcələridir. Bu iki anlayış aşağıda daha ətraflı təsvir edilmişdir.

[0046] Santimorqan I% -ə uyğun olan genetik 'məsafə' ölçüsüdür
rekombinasiya dərəcəsi. İnsanlarda təxminən 1 milyon bazadır. SNP tezliyi təxminən 1000 bazada 1-dir, beləliklə rekombinasiyanın hər 1%-i üçün 1000 SNP olacaqdır. Bu o deməkdir ki, həmin ardıcıllıq məkanında olan genetik variantların bütöv bir vahid kimi nəsillərə ötürülmə ehtimalı 99% təşkil edir. İxtira istənilən sayda baza ilə məhdudlaşmasa da, o, məsələn, STR-nin hər tərəfində 1000 əsasın təhlilini əhatə edə bilər.
hər bir allel üçün lokus. Məsələn, Şəkil 4-ə baxın.

[0047] STR-lər üçün mutasiya dərəcələri hər 10 reproduktiv hadisə üçün 2-dir, SNP-lər isə 103-104 hadisədə tez-tez dəyişir. SNP bu ixtira üçün bir üstünlükdür
nisbəti çox aşağıdır, çünki bu, SNP haplotipinin çox dəyişməyəcəyi deməkdir. Hələ hətta STR
mutasiya dərəcəsi STR genotipləri ilə etnik birləşməyə imkan verəcək qədər aşağıdır.
Underhill və həmkarları (2003) genetik variantların filogenetik analizini aparmaq üçün mutasiya nisbətlərindəki bu uyğunsuzluqdan istifadə edirlər. İnsanın bütün genetik təkamülünün bu hərtərəfli təhlili milyonlarla il ərzində insan əhalisinin 1000-39 nəslini araşdırır. Bu zaman miqyasında diferensial mutasiya dərəcəsi əhəmiyyətlidir. Bununla belə, insanın identifikasiya təhlili üçün yalnız 1, 2 və ya ən çoxu 3 və ya 4 nəsli, əsasən canlı fərdlər tərəfindən daşınan mövcud insan genomunu qiymətləndirmək lazımdır. Bu təkamül snapshot analizində mutasiya nisbətləri əlavə dəyişkənliyin səbəbləri kimi daha az təsirlidir.

[0048] Assosiativ dəyərlərə həm əlaqə balanssızlığı, həm də mutasiya nisbətləri təsir edəcək. Bu ixtira assosiativ dəyərləri müəyyən etmək üçün HAPMAP layihəsi kimi mövcud verilənlər bazalarından əldə edilmiş empirik məlumatlardan istifadə edə bilər. Seçilmiş populyasiyaların ardıcıllığının müəyyən edilməsi kimi eksperimentlər assosiativ dəyərlərin aydınlaşdırılması məqsədi ilə həyata keçirilə bilər. Alternativ olaraq riyazi funksiyalar və ya alqoritmlər assosiativ dəyərləri müstəqil olaraq və ya empirik şəkildə əldə edilmiş assosiativ dəyərlərlə birlikdə müəyyən etmək üçün istifadə edilə bilər.

[0049] Bir SNP nümunəsi birdən çox STR alleli ilə əlaqələndirilə bilər (məsələn, Şəkil 5 və 7-ə baxın) və ya birdən çox SNP nümunəsi bir STR ilə əlaqələndirilə bilər.
allel (bax, məsələn, Şəkil 8). Biz burada öyrədirik ki, bu assosiasiya dəyəri hər bir hal üçün empirik olaraq müəyyən edilə və hər bir SNP-STR assosiasiyasına təyin edilə bilər.SNP triajlı STR lokuslarını, məsələn, Birləşdirilmiş DNT İndeks Sistemində 13 STR lokusunu birləşdirməklə biz verilənlər bazasındakı fərdləri yalnız SNP əsasında STR genotipləri ilə uyğunlaşdıra biləcəyik.
ardıcıllıq məlumatları.

[0050] Bundan əlavə, biz STR ilə əlaqəli olmayan genotiplərlə əlaqəli olan istinad çərçivəsi SNP-lərdən də istifadə edə bilərik. Buna görə də deyə bilərik ki, SNP nümunəsi X ilə müəyyən edilmiş genotipik fonda SNP nümunəsi Y STR alleli TPOX 6 ilə əlaqələndirilir. Lakin SNP nümunəsi Z ilə müəyyən edilmiş genotipik fonda eyni SNP
Y nümunəsi STR alleli TPOX 10 ilə əlaqələndirilir. Qeyri-STR-SNP genotipik fon etnik mənsubiyyət, xəstəliklərdən qorunma və ya müvafiq zaman miqyasında sabit olan digər genetik xüsusiyyətlərə görə ola bilər. Bu istinad çərçivəsi SNP nümunələri otosomal, Y və/və ya mitoxondrial genetik mənbələrdən gələ bilər və nəsil testi üçün istifadə olunanlarla eyni ola bilər (23 və mən, DNAPrint Genomics). Alternativ olaraq, yuxarıda qeyd olunan amillərdən asılı olmayaraq STR-SNP-lərlə çeşidlənən qeyri-STR-SNP-lər tapıla bilər.

[0051] Bir təcəssümdə, STR-nin hər iki tərəfində 1000 SNP olan 1.000.000 əsas təhlil edilə bilər və nəticədə hər bir STR üçün birləşmə təmin etmək üçün 2000 SNP mövcuddur.
yer. 13 STR lokus üçün daha sonra 26,000 SNP olacaq. SNP-lərin çoxluğu təxminən 10-dan 30.000.000-a qədər, 30.000-dan 3.000.000-a qədər, 300.000-dan 3.000.000-a qədər və ya 3.000.000-dan 30.000.000-a qədər və ya bunların hər hansı bir kombinasiyası ola bilər. 2002-ci ildən bəri bir çox SNP-nin mövcud olduğunu təhlil edə bilən texnologiyalar (məsələn, Affymetrix və 454). Bu gün belə texnologiyalar adi hala çevrilir. Bir neçə məhsul (məsələn, 454, ABI, Affymetrix və Illumina) 2.000.000 bazanı tez və ucuz yazmaq qabiliyyətinə malikdir. Pacific Biosciences, Opgen və digər tək molekul sıralama texnologiyaları kimi daha yeni texnologiyalar sürətlə bazara çıxır. Əvvəlki texnologiyalar 2002-ci ildə ixtiraya imkan verə bilsə də, bu yeni texnologiyalar bu ixtira üçün tələb olunan məhsuldarlığı idarə etmək üçün daha səmərəli vasitələr vəd edir.

[00521 Bütün genom ardıcıllığı texnologiyası sürətlə inkişaf edir. Bu texnologiyalar bu ixtiraya çox uyğundur. Bundan əlavə, STR-assosiativ genetik nümunələri müəyyən etmək üçün bir genomun yalnız bir alt çoxluğunun zəruri olduğu düşünülür, bütün genom ardıcıllığı məlumatını əldə etmək daha praktik ola bilər. Praktiklik, genomun bir hissəsini əldə etmək üçün çətin olsa da, bütün genom ardıcıllığı üçün yüksək dərəcədə zərifləşdirilmiş sistemlərin və dəstlərin inkişafı ilə bağlı ola bilər. Məlumdur ki, bütün genom ardıcıllığı bu analiz üçün praktiki texnologiya ola bilər.

[0053] Qarışıqlar insan identifikasiyası tədqiqatları üçün çox çətin məsələdir.
Sübutlar nizamlanmayan hərəkətlər vasitəsilə paylandığı üçün cinayət araşdırmalarında geniş yayılmışdır. SNP analizi sürətlə irəlilədikcə, qarışıqların həllinə kömək edən riyazi üsullar inkişaf etdirilir. Qarışıqları həll edən bu cür riyazi üsullardan SNP-ləri STR-lərlə əlaqələndirmək üçün assosiativ amilləri müəyyən etmək üçün də istifadə edilə bilər.

[0054] Əlavə olaraq, tək nukleotid səviyyəsində ardıcıllığın dəyişməsi analizinə tələbat STR üçün deyil, SNP-lər üçün spesifik olan hesablama məhsullarına gətirib çıxardı.
Bunlar ani ixtira ilə birlikdə işləyəcək.

[0055] Bir təcəssümdə tək SNP nümunəsi tək STR ilə əlaqələndiriləcəkdir
allel. Başqa bir təcəssümdə, SNP və STR lokusu arasındakı əlaqə, birdən çox SNP modelinin bir STR alleli ilə əlaqəli olması ola bilər. Daha bir təcəssümdə, SNP və STR lokusu arasındakı əlaqə tək SNP modelinin birdən çox STR alleli ilə əlaqəli olması ola bilər.

[0056] Bu ixtira genetik variantlar arasında genetik əlaqəni təyin etmək üçün bir analizdir. Tercih edilən təcəssümdə bu analiz SNP nümunələrini STR allelləri ilə əlaqələndirən məlumatdan ibarətdir.

[0057] Hər bir SNP - STR üçün müəyyən edilə bilən assosiasiya faktoru
birləşməsi nəzərdə tutulur. Bu ölçülmüş dəyər CODIS və digər verilənlər bazalarını axtarmaq üçün istifadə olunacaq, SNP STR ilə əlaqəli genetik nümunənin yazılmasını STR ilə geri uyğunlaşdıracaq.
verilənlər bazaları.
Belə bir axtarışın proqnozlaşdırılan nəticəsi, mümkün bir ssenaridə, bioloji nümunənin SNP analizi üçün mümkün uyğunluq olan birdən çox fərddir.
müəyyən edilə bilər. Bu halda mümkün şübhəlilərin sayını azaltmaq üçün şəxsin hadisəyə yaxınlığı, fiziki təsviri, mədəni xüsusiyyətləri və cinayət müfəttişlərinə məlum olan digər amillər kimi digər müvafiq məlumatlardan istifadə edilə bilər. Bioloji nümunə ilə əlaqəli fərdin son identifikasiyası nümunədə tapılan STR-assosiativ genetik model üçün son şübhəli hovuzda bütün şəxslərin yazılması ilə olacaq.

[0058] İxtiranın bir aspektində SNP assosiasiya dəyəri fərdləri müəyyən etmək üçün qeyri-genetik məlumatla birlikdə istifadə edilə bilər. Məsələn, cinayət təhqiqatında məhkəmə-tibbi araşdırmalar kontekstində bir şəxsin həbsdə olub-olmaması, müəyyən bir ayaqqabı ölçüsü və ya müəyyən çəki diapazonuna malik olub-olmaması, şübhəlinin kişi və ya qadın olması və sair kimi məlumatlar istifadə edilə bilər. şəxsin şəxsiyyətinin müəyyən edilməsinə əlavə yardım etmək.
[0059] Diferensial SNP/STR mutasiya dərəcələri siqnal emal alqoritmlərindən və Əhali Tezliklərindən istifadə edərək çarpaz korrelyasiya həyata keçirir. Bu ixtirada yeni bir şəkildə birləşdirilən üç amil var. Birincisi, SNP-lərin və STR-lərin qeyri-bərabər mutasiya dərəcələri STR tipinin SNP tipi ilə əlaqəsinin təhlili üçün əsas hesab olunur.
İkincisi, siqnal emal alqoritmləri SNP-ni təhlil etmək üçün istifadə olunan üsullardır
data. Üçüncüsü, SNP-lərin populyasiya tezlikləri STR növünün tamamlanma ehtimalını təmin edən əlavə məlumatdır.

[0060] Diferensial mutasiya dərəcələrinə gəldikdə, mutasiyaya səbəb olan molekulyar mexanizmlər SNP və STR arasında fərqlənir (bax, məsələn, Mahtani, M.M. və Willard, H.F. (1993)).
Polimorfik X ilə əlaqəli tetranukleotid təkrar lokusu yeni mutasiyaların yüksək sürətini göstərə bilər ki, bu da qısa tandem təkrar lokuslarında mutasiya mexanizmlərinə təsir göstərir (bax, məsələn, Hum. Mol. Genet. 2: 431-437). Dağ et. al. (2002) diferensial mutasiya dərəcələrinin tək STR ilə əlaqəli tək SNP istifadə edərək SNP/STR sisteminin təkamül tarixini araşdırmaq qabiliyyətinə malik olduğuna diqqət çəkdi. Bundan əlavə, onlar bu ixtirada olduğu kimi SNP-dən istifadə edərək STR tipinə dair nəticə çıxarmadılar. Bu ixtira genetik olaraq STR ilə əlaqəli çoxsaylı SNP-lərə baxır ki, STR lokusu ilə əlaqəli SNP-lərin nümunəsi və tezliyi naməlum STR növündən nəticə çıxarmağa imkan verəcəkdir. Bu SNP texnologiyası kimi lazımdır
analiz, yüksək dərəcədə deqradasiya olunmuş DNT ehtiva edə bilən tipik cinayət yeri nümunəsi nəzərə alındıqda, STR-lərin təhlili texnologiyasından əhəmiyyətli dərəcədə daha həssasdır. 13 STR lokusuna təsir edən deqradasiya ehtimalı bir milyon (məsələn) SNP lokusuna olan deqradasiyanın təsirindən qat-qat böyükdür. SNP lokuslarını təhlil edərkən hətta 50% itkisi kifayət qədər bütöv və ya pozulmamış SNP lokuslarını buraxacaq. birmənalı identifikasiya üçün. Nümunədən STR lokuslarının 50%-nin itirilməsi identifikasiyaya imkan verəcək kifayət qədər məlumatın olub-olmamasına təsir göstərəcək. Beləliklə, məhkəmə nümunəsində, çox güman ki, yalnız klassik STR təhlili nəticə verməyəcək, SNP təhlili isə əslində kifayət qədər məlumat verəcəkdir. (Lakin, yalnız STR növü cinayətkar verilənlər bazasında axtarıla bilər).

[0061] Şəkil 8 çoxlu mikrovariantları ehtiva edən D21 S 11 allelindən cari genotip məlumatından istifadə etməklə bunun təsvirini təqdim edir. Sol sütun müxtəlif allellərdə mövcud olan tetramerik təkrarların sayını əks etdirən allel təyinatını göstərir. Tam olmayan rəqəm dəyərləri tam tetramerik vahiddən (məsələn, yalnız beş, üç və ya iki əsas) daha az mövcud olan allelləri göstərir. Bu qismən təkrar vahidlər ümumiyyətlə əsasların daxil edilməsi və ya silinməsidir və SNP-lərin yaradıldığı eyni mexanizmlər tərəfindən yaradıla bilər.
Hazırda yaşayan və yaxınlarda vəfat etmiş insan əhalisinin məlumat bazalarında bu mikrovariantlar qorunur. Bu ixtira STR allelləri ilə əlaqəli SNP-lərin istifadəsini öyrədir və Şəkil 8-də nümunə verilmiş bu məlumatlar təsdiq edir ki, bütöv tetramer təkrar vahidlərinin əlavə edilməsi və ya çıxarılmasından başqa mutasiyalar STR alleli ilə etibarlı şəkildə əlaqələndirilə bilər.
Buna görə də, xüsusi STR allelləri ilə əlaqəli SNP-lər də məhkəmə-tibbi insan identifikasiyası üçün uyğun olan vaxt çərçivəsində qorunacaq.

[0062] STR və SNP arasında mutasiyada diferensial nisbət o deməkdir ki, müxtəlif etnik mənsubiyyətlərdə və müxtəlif STR allel qruplarında SNP və STR-lərin müxtəlif assosiasiyaları olacaq. Məsələn, CODIS STR TPOX-un 7-ci alleli Qafqaz populyasiyasında müşahidə olunmayıb, lakin İspan populyasiyasında 0,7%, Afrika populyasiyasında isə 2% o diferensial tezliklərdə mövcuddur. Bir genomun kodlaşdırma bölgələrində mutasiyaya təkamül məhdudiyyəti var, çünki bu sahələrdə demək olar ki, bütün mutasiyalar bu halda insan olan orqanizmin uyğunluğuna zərərlidir.
Bununla belə, məhkəmə CODIS lokusları aşkar fenotipik təsirdən azad olmaq üçün seçilir və buna görə də populyasiyada saxlanılan mutasiyalara qarşı seçim təzyiqindən azaddır.
Bu o deməkdir ki. İnsanın təkamül tarixi boyunca STR və SNP mutasiyaları müxtəlif sürətlərdə toplanır və buna görə də özlərini unikal birləşmələrdə qruplaşdırmağa hazırlaşırlar.

[0063] Bu ixtira ilə bağlı praktiki tətbiq baxımından, bu o deməkdir ki, STR genetik ardıcıllığı ilə əlaqəli (həm daxilində, həm də xaricində) allel qrupları və fərdi allellər arasında korrelyasiya üçün mövcud olan bir sıra SNP-lər olacaq. . İxtiranın bu aspektinin riyazi nəticələri aşağıda verilmişdir.

[0064] Aşağıdakı nümunələr ixtiranın illüstrativ təcəssümüdür və genetik variasiyanın, cihazların, texnologiyanın, genetik markerlərin növlərinin, məlumatların təhlili, məlumatların təfsiri, statistik təhlili və ya hər hansı digər aspektin müəyyən edilməsi üsulları ilə bağlı hər hansı məhdudiyyəti göstərmək üçün nəzərdə tutulmur. STR-assosiativ genetik nümunələrin yaradılması və s.

SİQNALARIN EMAL ALQORİTİMLƏRİNDƏN İSTİFADƏ EDİLƏN KÖRRELYASYON.
[0065] DNT nümunəsinin toplanması və onun işlənməsinin ümumi prosesi rfu (nisbi flüoresan vahidlər) dəyərlərinin iki ölçülü elektroferoqramını və ya SNP-lər vəziyyətində, allel çağırışları kimi şərh edilən nöqtə intensivliyini yaradır. Bu ixtiranın məqsədləri üçün biz ənənəvi məhkəmə rfu terminologiyasından ya STR mənasında istifadə edəcəyik.
elektroferoqram pik intensivliyi və ya SNP massivi nöqtə intensivliyi. Mövcud məhkəmə DNT analitik üsulları ümumiyyətlə rfu dəyərlərinə məhəl qoymadan bu ölçülərdən yalnız birindən, allel çağırışından istifadə edir. Rfu və ya intensivlik dəyərlərinə məhəl qoymadan allel çağırışlarına diqqətin məhdudlaşdırılması çoxsaylı eyni allellərin, yəni dozanın töhfəsini inkar edir, lakin standart məhkəmə-tibbi təcrübənin təsdiq edilmiş şərh qaydalarına uyğundur. Digər ölçüdən, rfu dəyərlərindən istifadə etmək üçün giriş, gücləndirilmiş DNT və çıxış, elektroferoqram arasında əlaqəni təsvir edən bir modelə sahib olmaq lazımdır. Yenə də bu ixtiranın məqsədləri üçün elektroferoqram termini STR testindən alınan izi və ya SNP testindən intensivliklər massivini ifadə etmək üçün istifadə olunacaq. Bu model baxımından hər biri ekvivalentdir.
Bu proses bir neçə ayrı və fərqli addımdan ibarətdir. Belə bir prosesi modelləşdirməyin yollarından biri prosesin hər bir addımını təhlil etmək, həmin addımın təsvirini formalaşdırmaq və sonra prosesləri silsiləli şəkildə silməkdir. Səs-küyün mövcudluğunda ünsiyyətdən tutmuş kosmosdan fotoşəkillərin şərhinə qədər geniş spektrli fiziki və kimyəvi proseslərdə müvəffəqiyyətini sübut edən alternativ bir yanaşma stasionar xətti sistem analitik üsullarının tətbiqidir. Bu yanaşmada bütün fərdi addımlar "proses" və ya "qara qutu" yaratmaqla birlikdə yığılır. Siqnallar “qara qutu”ya yerləşdirilir və oradan nəticələr çıxır.
Bizim vəziyyətimizdə siqnal elektroferoqramdır. Sistem təhlili daxili proseslərin təfərrüatlarına məhəl qoymadan giriş və çıxış arasındakı əlaqəni müəyyən etməklə məhdudlaşır.

[0066] Bütün proses təklif olunan riyazi modelləşdirmə ilə uğurla müalicə olunur [0067] Giriş məhsuldarlığı çıxış [0068] S(x) ---------- s(x) [0069] Burada, s(x) yayılma funksiyasını, x isə STR sisteminin baza cütləri (bp) və ya SNP-nin massiv yeri ilə ölçülən molekulyar çəkidir. Bu anlayışlardan istifadə edərək stasionar xətti sistemi təyin edə bilərik. Bu müzakirə boyunca biz x-dən başqa hər yerdə sıfır dəyərinə malik olan funksiyanı göstərmək üçün delta funksiyası 6(x) terminindən istifadə edəcəyik. Onun dəyəri 1-dir. Riyazi olaraq, biz qara qutuya çox kəskin girişlə ping edirik, delta funksiyasını yerinə yetirin və nəticədə çıxan nəticəni müşahidə edin, "zəng çalır". Hər DNT üçün
nümunə girişində çıxış elektroferoqramları dəsti olacaq, nti(x) burada n 1-dən n maks. arasında dəyişir və STR elektroferoqramması üçün hansı boyanın istifadə edildiyini göstərir (çünki çoxsaylı STR allelləri eyni molekulyar çəkiyə malik ola bilər, lakin müxtəlif boya) və ya SNP-nin massiv yeri. Funksiya aşağıdakı formadadır:

[0070] nti(x) = nEiasn(x-x) n = 1-dən c (1) [0071] Burada nEi n-ci boya/SNP üçün i alt simvolu üzərindəki cəmini göstərir
elektroferoqram sn(x) sistemin n-ci boya üçün yayılma funksiyasını bildirir elektroferoqram x müvafiq elektroferoqramda (və ya SNP massivinin yeri) i-ci zirvənin yeridir və a i-ci zirvənin amplitudasıdır. x SNP sisteminin nömrəsi və ya STR sisteminin boyasıdır. Bu format tələb olunur, çünki ümumiyyətlə hər bir boya elektroferoqramında yayılma funksiyaları digərlərindən fərqli ola bilər və qarışıq DNT vəziyyətində
nümunələrdə zirvələrin amplitüdləri dəyişəcək. Bu müzakirəni sadələşdirmək üçün biz bütün boyaları/SNP-ləri daxil etmək üçün genişlənməni qoruyub saxlayaraq, yalnız bir elektroferoqramla işləyəcəyik. Hesablamaların hər bir boya üçün mutatis mutandis təkrarlanması nəzərdə tutulur.
Tək DNT nümunələri üçün a = bütün i və j üçün olduğu kimi, bir boya elektroferoqramında bütün zirvələrin amplitüdləri bərabərdir. "doublet" olan bir istisna var
baş verir, lakin tək bir DNT nümunəsi üçün dəstdə ikincili zirvənin daxil edilməsində ümumilik itkisi yoxdur. Piklər, fərdi yayılma funksiyalarının maksimumları s' (xx) = 0 tənliyi ilə müəyyən edilən x nöqtələrində yerləşir. Onların hamısı bərabər olduğundan, amplitudalar 1-ə normallaşdırıla bilər. Ni(x)-dən biz qururuq. identifikator, nO(x), [0072] nQ(x) = nEi6(xx) ilə verilmişdir. (2) [0073] DNT nümunəsində sıfır element olmadığı üçün biz müəyyən edə bilərik:

[0075] burada nN n-ci boya elektroferoqramında zirvələrin sayı və ya SNP-nin massiv yerləridir. Buna görə də hər bir SNP massivinin hər STR kimi unikal identifikatoru olacaq
elektroferoqramma. Nəticə etibarilə, bir SNP və bir-biri ilə tam olaraq əlaqəli olan bir STR identifikatoru və tək bir şəxs olacaq və buna görə də STR növü SNP üçün yaradılan identifikatorla müəyyən edilə bilər. Bu assosiativ dəyərdir. İki identifikatorun dəqiq əlaqəsi empirik olaraq müəyyən ediləcək.

[0076] Şübhəli DNT nümunəsi ilə uyğunluğu tapmaq üçün məlumat bazasında axtarış müəyyən bir siqnalın, f(x) bir və ya daxilə daxil olub-olmadığını müəyyən etmək üçün bir sıra mesajlar vasitəsilə axtarışa bənzəyir, "(x) daha çox və əgər varsa, harada yerləşir. Ən sadə belə axtarış f(x)-ni hər bir n(x) ilə korrelyasiya etməkdir. (x)-də f(x) üçün uyğunluq varsa, korrelyasiya öz mövqeyində pik nöqtəsinə çatacaq. Riyazi olaraq, bu əməliyyat tənlik ilə təmsil olunur:

[0077] C(x) = ff((T)g(6-x)d6 (3) [0078] DNT analizi zamanı siqnallar təkcə eyni formaya deyil, həm də eyni mənşəyə malik olmalıdır. , həm f((Y) və (6) diskret funksiyalardır.
Bu şəraitdə çarpaz korrelyasiya inteqralının diskret məhsullara və cəmlərə qədər azaldığını görəcəyik.

İLƏ SNP ALLELLƏRİNİN ƏHALİ TEZLİKLƏRİ
STR ALLELESƏ HAQQINDA.

[0079] Aydındır ki, SNP mutasiyaları STR mutasiyalarının bütün təkamül tarixini əhatə edəcək. Yəni qədim və buna görə də bütün STR-də rast gəlinən SNP-lər olacaq
allellər və STR allel qruplarının alt dəstəsində olan daha yeni SNP mutasiyaları.
Bu, allel qrupları ilə üst-üstə düşən SNP-lərin fərqləndirilməsində vacibdir və sadəcə Hardy-Weinberg (HW) populyasiya ehtimallarından istifadə etməklə həll edilə bilər. Məsələn, SNP-də
TPOX alleli 11-i aydın şəkildə müəyyən edən, lakin 6 və 8 TPOX allelləri ilə üst-üstə düşən nəticə, sual hansı TPOX allelidir? 6 yoxsa 8? Cavab mümkün birləşmələrin populyasiya tezliyinə əsaslanır. HW ehtimalı 1/2(pi*pj) kimi hesablanır, burada i#j. Qafqaz populyasiyasında 11,6 kombinasiyasının 1041-də 1 ehtimalı var (yayımlanmış STR allel tezliklərindən istifadə etməklə), 11,8 kombinasiyasının isə 4-də I ehtimalı var. 11,8 birləşmənin mövcud olma ehtimalı ən yüksək olduğundan, ilk nəticə 11,8 olaraq qeyd olunacaq.
Bunların ehtimallar olduğunu nəzərə alsaq, nadir birləşmənin mümkün olacağını qeyd etmək vacibdir və əgər digər SNP nəticələrinə əsasən nadir birləşmə göstərilirsə, o zaman identifikasiyanın gücü, əslində qəti olmasa da, daha güclü olacaqdır.

[00801 Şəkil 2 mümkün allel birləşmələrinin sayı və hədəf bölgənin nisbi ölçüsü baxımından STR və SNP-lərin müqayisəsini göstərir. Qısa Tandem Təkrarlar (STRs) (məsələn, məhkəmə DNT testlərində istifadə olunur) hər hansı qısa, təkrarlanan DNT-dir.
ardıcıllıq. Məsələn, ATATATATATAT DNT ardıcıllığı A və T adlı iki əsasdan ibarət təkrarlanan motivə malik STR-dir. DNT DNT arasında səpələnmiş müxtəlif STR-lərə malikdir.
hüceyrə funksiyalarını kodlayan ardıcıllıqlar. Orqanizmlər, ən azı bəzi STR lokusları üçün təkrar sayına görə bir-birindən fərqlənir. Məsələn, 1 nömrəli şəxs müəyyən bir məkanda 1-ci tip "ATATATAT", №2-də isə 2-ci tip "ATATATATAT" ola bilər.
eyni lokusda. Tək nukleotid polimorfizmləri (SNP) bir genom ardıcıllığında tək bir nukleotid (məsələn, A, T, C. və ya G) dəyişdirildikdə baş verən DNT ardıcıllığının dəyişmələridir. Məsələn, SNP AAGGCTAA DNT ardıcıllığını ATGGCTAA-ya dəyişə bilər. Dəyişikliyin SNP hesab edilməsi üçün o, əhalinin ən azı 1%-də baş verməlidir.

[00811 SNP-lər fərdin insan populyasiyasının mənşəyini müəyyən etmək üçün istifadə edilə bilər (bax: məsələn, 23 and me, DNAPrint Genomics). SNP-lər təkamül yolu ilə əlaqələndirilə bilər, nəticədə bir qrup insan genetik "bənzərliyi". STR-lər fərdin mənşəyini də proqnozlaşdıra bilər (Bax, məsələn, DNT Ancestry Project, the Genographic Project). STR allelləri seçilmiş populyasiyalarla əlaqələndirilə bilər.Əslində, SNP və STR allelləri eyni seçilmiş populyasiya ilə əlaqələndirilə bilər. Beləliklə, eyni populyasiya ilə əlaqəli olan SNP və STR allelləri bir-biri ilə əlaqələndirilməlidir (A=B, B=C, beləliklə, A=C).
Bir təcəssümdə SNP-lər və STR allelləri arasında əlaqə aşkar edilə bilər.
Bu faydalı ola bilər, çünki SNP məlumatını əldə etmək çox vaxt daha asandır, lakin əhəmiyyətli STR verilənlər bazası mövcuddur.

[00821 Bol SNP lokusları müxtəlif insan populyasiyalarında səciyyələndirilmiş və tədqiq edilmişdir. Bundan əlavə, yalnız bir nukleotidin SNP markerləri ilə ölçülməsi lazımdır, halbuki bir sıra nukleotidlərin (bəzən uzunluğu yüzlərlə nukleotidlərin) STR markerləri ilə ölçülməsi lazımdır. SNP-lərin mutasiya nisbətləri də STR-lərdən 100.000 dəfə aşağıdır.
Beləliklə, SNP-lər daha sabitdir.

[0083] STR lokuslarının təhlili SNP-nin təhlili üçün tələb olunandan daha çətin, yavaş və bahalı ola bilər. Bundan əlavə, STR lokuslarının təhlili SNP-nin təhlili üçün tələb olunandan daha yüksək keyfiyyət tələb edə bilər. Bunun səbəbi, SNP-lərin genetik xəstəlik və farmakogenetikada rollarına görə daha çox araşdırma aparması ola bilər ki, bu da çoxsaylı SNP aşkarlama metodologiyaları ilə nəticələnir.

[0084] İllərlə aparılan sınaqlar nəticəsində, bioloji nümunələri unikal şəkildə müəyyən etmək üçün STR markerlərinə əsaslanan insan identifikasiyası üçün böyük verilənlər bazası mövcuddur. Marker kimi SNP variantlarından istifadə edən belə verilənlər bazası yoxdur. Verilənlər bazasının STR-lərdən bəzi digər DNT-lərə dəyişdirilməsi
marker (məsələn, SNP) qadağandır. Bundan əlavə, bir çox məlumat nöqtələri artıq mövcud olmayan məhkəmə nümunələrindən gəldiyi üçün verilənlər bazalarını hərtərəfli yenidən işləmək və maksimum effektivliyi saxlamaq imkanı yoxdur.

[0085] Beləliklə, SNP məlumatını STR məlumatı ilə əlaqələndirmək çox faydalı ola bilər.
Məsələn, SNP allellərinin populyasiya tezliyi STR ilə müqayisə edilə bilər
allellər. SNP mutasiyaları STR mutasiyalarından daha az baş verdiyi üçün SNP
mutasiyalar STR mutasiyalarının bütün təkamül tarixini əhatə edəcək. Yəni qədim olan və buna görə də bütün STR allellərində və daha yeni SNP-lərdə olan SNP-lər olacaq.
STR allel qruplarının alt çoxluğunda olan mutasiyalar. Bu, allel qrupları ilə üst-üstə düşən SNP-lərin fərqləndirilməsində mühüm ola bilər və məsələn, Hardy-Weinberg (HW) populyasiya ehtimallarından istifadə etməklə həll edilə bilər.

[0086] Məsələn, TPOX alleli 11-i aydın şəkildə müəyyən edən, lakin TPOX allel 6 və 8 ilə üst-üstə düşən SNP nəticəsində 6 və ya 8 tətbiq edilirmi? Cavab populyasiya birləşmələrinin populyasiya tezliyinə əsaslana bilər. HW ehtimalı 1/2(p*pj) kimi hesablana bilər, burada itj. Qafqaz populyasiyasında 11,6 kombinasiyasının 1041-də 1 ehtimalı var (yayımlanmış STR allel tezliklərindən istifadə etməklə), 11,8 birləşməsinin isə 4-də 1 ehtimalı var. Çünki 11,8 kombinasiyası ən yüksək ehtimala malikdir. mövcudluğu, ilk nəticə 11,8 olaraq qeyd edilə bilər. Bunların ehtimallar olduğunu nəzərə alaraq, nadir birləşmənin mümkün olacağını qeyd etmək vacibdir və əgər digər SNP-ə əsaslanarsa.
nəticələr, nadir birləşmə göstərilir, o zaman identifikasiyanın gücü qəti deyilsə, o qədər güclü olacaqdır.

[0087] Qeyd etmək lazımdır ki, STR lokus alleli ən azı bir Birləşdirilmiş DNT İndeks Sistemi (CODIS) verilənlər bazası STR lokusundan və ya hər hansı digər növ STR lokusundan (məsələn, CODIS olmayan verilənlər bazası (məsələn, İnterpol, FSS) STR lokusundan ibarət ola bilər. ) və ya onların hər hansı birləşməsi.
Məsələn, bir təcəssümdə STR lokusları aşağıdakı qrupdan seçilə bilər: TH01, TPOX, CSFIPO, vWA, FGA, D3S1358, D5S818, D7S820, D13S317, D16S539, D8S1179, D18S1179, digər təcəssümdə D18S11, D18S11, və D12S11di. , STR lokusları aşağıdakı qrupdan seçilə bilər:
THO1, TPOX, CSFIPO, vWA, FGA, D3S1358, D5S818, D7S820, D13S317, D16S539, D8S1179, D18S51 və D21S11.

[0088] Şəkil 3, bir təcəssümə uyğun olaraq ən azı bir genomda SNP-lərdən STR allel genotipini çıxarmaq üçün metodu təsvir edir. 305-də ən azı bir genomun SNP məlumatı əldə edilə bilər. 310-da, genom üçün Qısa Tandem Təkrar (STR) lokus allel məlumatı, məsələn, orqanizmdən alınan nümunədən əldə edilə bilər. STR lokus allel məlumatı fərdin identifikasiyası üçün genetik variant markerləri kimi istifadə edilə bilər. Nəzərə alın ki, nümunə (məsələn, bioloji nümunə, nuklein turşusu olan nümunə) aşağıdakılardan ibarət ola bilər: barmaq izi, qan, sperma, vaginal yaxma, insan toxuması (məsələn, tək tip, qarışıq), saç, tüpürcək, sidik, sümük, dəri və ya bədən mayesi (məsələn, tək tip, qarışıq) və ya onların hər hansı bir kombinasiyası. Bundan əlavə, nümunə birdən çox orqanizmdən ola bilər. Məsələn, nümunə cinayət yerindən bir neçə nəfərin qanı ola bilər.

[0089] 315-də SNP məlumatı ən azı bir SNP bürcünün assosiativ dəyərini əldə etmək üçün STR lokus allel məlumatı ilə müqayisə edilə bilər (həmçinin 'SNP-STR birgə irsinin 'statistik ehtimalına' istinad edilir' və ya ' 34genetik variant lokus allel məlumatı"). Bir təcəssümdə assosiativ dəyər müxtəlif mutasiya dərəcələri, əlaqə balanssızlığı, daxiletmə, silinmə, təkrar variant, nüsxə nömrəsi variantı, translokasiya, metilasiya modifikasiyası, deasetilasiya modifikasiyası və ya epigenetik marker və ya onların hər hansı bir kombinasiyası ilə müəyyən edilə bilər. Assosiativ dəyər verilənlər bazalarını skan etməklə (məsələn, HAPMAP layihəsi) birbaşa təcrübə (məsələn, seçilmiş populyasiyaların ardıcıllığının müəyyən edilməsi) və ya riyazi düsturlar və ya onların hər hansı birləşməsi ilə müəyyən edilə bilər.

[0090] Şəkil 4-ə istinad edərək, ABŞ-dan biri olan TPOX lokusunun Filogenetik ağacı
CODIS lokusları, Qafqaz populyasiyasında STR allellərinin tezliyinə (yəni variasiyalara) əsaslanaraq təsvir edilmişdir. 5-13 rəqəmləri STR allellərini təmsil edir. A-I hərfləri SNP-ləri təmsil edir.

[0091] Aydındır ki, genetik variantlar orqanizmin uyğunluğunu azaltmamaq şərti ilə zamanla orqanizmin genomunda toplanır. STR vəziyyətində, insanın identifikasiyası üçün istifadə edilən lokuslar insan genomu daxilində neytrallıqları üçün xüsusi olaraq seçilir və buna görə də variantlar orqanizmin uyğunluğu baxımından neytraldır.
Hər bir STR alleli üçün unikal SNP nümunələri tapmaq mümkün deyilsə, spesifik allel qrupları ilə əlaqəli SNP-lərdən istifadə edilə bilər. Bundan əlavə, SNP-ləri meta-qruplara qruplaşdırmaqla, birləşən fərd qruplarını müəyyən etmək mümkün olacaq. Məsələn, mədəni bir mövzuya sahib bir küçə dəstəsi. Xüsusilə çoxlu lokuslar tədqiq edildikdə, bunun hələ də güclü statistik əhəmiyyəti olacaqdır.

[0092] Bir təcəssümdə tək SNP nümunəsi tək STR ilə əlaqələndirilə bilər
allel. Başqa bir təcəssümdə bir STR alleli birdən çox SNP ilə əlaqələndirilə bilər
naxış. Başqa bir təcəssümdə, bir SNP nümunəsi birdən çox STR alleli ilə əlaqələndirilə bilər.

[0093] Məsələn, Şəkil 5-də SNP alleli B STR ilə əlaqələndirilə bilər
allel 5, 6, 8 və 9. Başqa bir misal olaraq, SNP STR ilə əlaqəli bir genetik model THO 1 6, 7 və 8 ilə əlaqələndirilə bilər, lakin 9, 10 və ya 10.1 deyil. Bir təcəssümdə, bütün 13 CODIS yeri və bəlkə də digərləri üçün bu cür əlaqələndirmə etməklə, CODIS verilənlər bazası, məsələn, ThO - 6, 7, 8 VWF - 5, 6, 7 D21 - 11 olan qeydlər üçün axtarış edilə bilər. , 12. Bu, bioloji nümunəyə töhfə verə biləcək bir qrup fərdlərin seçilməsi ilə nəticələnə bilər.
Digər məlumatlar (məsələn, cinayətin yeri, şəxsin yeri) uyğunlaşa biləcək şəxslərin sayını daha da daraltmaq üçün istifadə edilə bilər.

[0094] Bundan əlavə, SNP-ləri meta-qruplara qruplaşdırmaqla, bir-birinə bağlı olan fərdlər qruplarını (məsələn, mədəni mövzuya malik olan dəstə, əlaqəli şəxslər) müəyyən etmək olar. İnsanın STR identifikasiyası üçün istifadə edilən genetik bölgələrdə fitneslə bağlı heç bir məhdudiyyət olmadığından, SNP və STR-lər neo-müasir insan genomlarının 23 xromosom cütü üzərində effektiv şəkildə sabitləşdiyi vaxtdan etibarən əhali arasında süzülür.
Bu zaman çərçivəsi əhalinin səpələnməsi nəticəsində inkişaf etmiş birliklərə sahib olmaq üçün kifayət qədər uzundur.
Bundan əlavə, yalnız bir neçə və ya bir neçə nəsildən ibarət təkamül şəklinə tətbiq edildikdə, ixtiranın bir təcəssümü əlavə davam edən mutasiyalardan izolyasiya edilir.
Bunun səbəbi, SNP sürətindən (hər nəsil üçün 0,01 olaraq təxmin edilən) daha böyük olan STR mutasiya dərəcəsinin hər nəsil üçün yalnız 0,2 olduğu təxmin edilir. Buna görə də 3 nəsildə STR allelinin mutasiyaya uğraması ehtimalı yoxdur. Məhkəmə tətbiqləri yaşayan və ya yaxınlarda vəfat etmiş şəxslərin araşdırılmasını nəzərdə tutduğundan, STR və SNP arasında mutasiya dərəcəsi fərqi problem yaratmayacaq. Bu yolla bir neçə nəsil orqanizmləri nisbi dəqiqliklə müqayisə etmək olar.

[00951 Şəkil 6 orqanizmin bioloji nümunəyə uyğun olması ehtimalını göstərən assosiativ dəyər (yuxarıda 315-ə baxın) əldə etmək üçün SNP məlumatının STR lokus allel məlumatı ilə necə müqayisə oluna biləcəyi ilə bağlı təfərrüatları təsvir edir. 605-də müəyyən bir STR yeri seçilir. 610-da, seçilmiş STR-də mövcud olan SNP-lər
lokuslara rast gəlinir. 615-də, seçilmiş STR lokusunda tapılan SNP allelinə hansı STR nümunəsinin uyğun olduğunu anlamaq üçün "Rosetta daşı" istifadə olunur. Şəkil 5-də SNP allelinə uyğun gələn bəzi STR allel nümunələri təsvir olunur, hansı STR allellərinin verilmiş SNP bürcləri ilə əlaqə qura biləcəyinə dair nəticə çıxarmaq üçün assosiativ dəyərin necə tətbiq oluna biləcəyi göstərilir. Şəkil 5, SNP-lərin STR-lərlə necə əlaqələndirilə biləcəyinin olduqca sadələşdirilmiş modelidir. Məsələn, Şəkil 4-dən biz SNP allelinin A STR allelləri 5,6,7,8,9,10,11,12 və 13 ilə əlaqəli olduğunu görürük. nümunədə, lakin o, yeri müəyyən etməyə kömək edir. SNP alleli B STR allelləri 5, 6, 8 və 9 ilə əlaqələndirilir. Buna görə də SNP
A, B bürcləri nümunədə STR allellərinin 5, 6, 8 və 9-un mövcudluğunu göstərəcək.
Nümunədə SNP allel D varlığının müəyyən edilməsi STR-nin mövcudluğunu müəyyən edər
allel 9, bununla da müəyyən STR allel identifikasiyasını təmin edir. Nəzərə alın ki, hər bir maraq dairəsinin Şəkil 5-ə bənzər cədvəli ola bilər, istisna olmaqla, hər bir cədvəldə hər bir maraq dairəsi üçün STR və SNP məlumatlarını əks etdirən bir neçə yüz və ya min sıra və sütunlar ola bilər.

[0096] Şəkil 3-ə qayıdaraq, 320-də assosiativ dəyər ən azı bir SNP genotip verilənlər bazası 135 yaratmaq üçün istifadə edilə bilər. Məsələn, 6(x) girişi s(x) çıxışını verə bilər.
S(x) x-dən başqa hər yerdə sıfır dəyərinə malik olan funksiyanı təmsil edə bilər, burada onun 1 dəyəri var. Bundan əlavə, s(x) funksiyanı təmsil edə bilər, burada s yayılma funksiyası və x molekulyar çəkidir, STR sisteminin baza cütləri (bp) və ya SNP-nin massiv yeri ilə ölçülür. Hər bir DNT nümunəsi girişi üçün ni(x) ilə təmsil olunan bir sıra çıxış elektroferoqramları ola bilər, burada n 1-dən n maks. arasında dəyişir və STR elektroferoqramı üçün hansı boyanın istifadə olunduğunu göstərə bilər (çünki çoxsaylı STR allelləri eyni ola bilər) molekulyar çəki, lakin boyaya görə fərqlidir) və ya SNP-nin massiv yeri.

[0097] Bundan əlavə, ni(x) = nEiasn(x-x,) düsturu istifadə oluna bilər, burada n=1 ilə k arasındadır. nEi n-ci boya/SNP üçün i alt simvolu üzərindəki cəmini göstərə bilər
elektroferoqram sn(x) n-ci boya üçün sistemin yayılma funksiyasını ifadə edə bilər Elektroferoqram xi müvafiq elektroferoqramda i-ci zirvənin yeri ola bilər (və ya SNP massivinin yeri) ai i-ci zirvənin amplitudası və k ola bilər. SNP sisteminin nömrəsi və ya STR sisteminin boyası ola bilər. Bu düstur faydalı ola bilər, çünki ümumiyyətlə, hər bir boya elektroferoqramında yayılma funksiyaları digərlərindən fərqli ola bilər və qarışıq DNT vəziyyətində
nümunələrdə, zirvələrin amplitüdləri dəyişə bilər.

[0098] Bir misalda yalnız bir elektroferoqramdan istifadə edilir və genişlənmə bütün boyaları/SNP-ləri əhatə edə bilər. Hesablamanın tək DNT nümunələri üçün ai = bütün i və j üçün olduğu kimi hər boya üçün təkrarlanması nəzərdə tutulur. Yəni tək boya elektroferoqramında bütün zirvələrin amplitüdləri bərabərdir. Dublet baş verdikdə istisna var, lakin tək DNS nümunəsi üçün ikinci dərəcəli zirvənin dəstə daxil edilməsində ümumilik itkisi yoxdur. Fərdi yayılma funksiyalarının zirvələri, maksimumları x nöqtələrində yerləşə bilər
s"(x-x,) = 0 tənliyi ilə müəyyən edilir. Hamısı bərabər olduğu üçün amplitudalar 1-ə normallaşdırıla bilər. Ni(x)-dən nQ(x) identifikatoru aşağıdakı kimi qurula bilər:

[0099] nS2(x) = nEiB(xx) [0100] DNT nümunəsində sıfır element olmadığına görə, nQ(0) = nN, burada nN n-ci boya elektroferoqrammasındakı zirvələrin sayı və ya massiv yerləridir. SNP. Beləliklə, hər bir SNP massivinin hər STR kimi unikal identifikatoru ola bilər
elektroferoqramma.
Nəticə etibarı ilə, bir SNP və bir STR identifikatoru bir-biri ilə və tək bir şəxslə tam olaraq əlaqəli ola bilər və buna görə də STR növü SNP üçün yaradılan assosiativ dəyərlə müəyyən edilə bilər. İki identifikatorun dəqiq əlaqəsi empirik olaraq müəyyən edilə bilər.

[0101] Yenidən Şəkil 3-ə qayıdaraq, 325-də SNP genotip verilənlər bazası 135 uyğunluqların olub olmadığını müəyyən etmək üçün STR lokus allel verilənlər bazası 140 ilə müqayisə edilə bilər. Qeyd etmək lazımdır ki, bir təcəssümdə STR lokus allel verilənlər bazası 140 insan STR məlumatı heyvan STR məlumatını (məsələn, ev heyvanları, vəhşi heyvanlar, həşəratlar, onurğasızlar) mikrob məlumatlarını və ya bitki STR məlumatlarını və ya onların hər hansı kombinasiyasını ehtiva edə bilər. Bir təcəssümdə, STR məlumatı məhkəmə ekspertizası ilə əlaqəli ola bilər (məsələn, Genom Geniş Assosiasiyası Araşdırmaları).

[0102] Şübhəli DNT nümunəsi ilə uyğunluğu tapmaq üçün verilənlər bazasında axtarış müəyyən bir siqnalın onlardan birinə və ya bir neçəsinə daxil olub-olmadığını və əgər varsa, onun harada yerləşdiyini müəyyən etmək üçün bir sıra mesajlar vasitəsilə axtarışa bənzəyir. Bir təcəssümdə axtarış hər bir gn(x) ilə f(x) korrelyasiyasını keçə bilər. Əgər gn(x)-də f(x) üçün uyğunluq varsa, korrelyasiya öz mövqeyində zirvəyə çatacaq. Riyazi olaraq bunu aşağıdakılarla ifadə etmək olar:

[0103] C(x) = f f(a) (a- )d6 [0104] DNT analizi zamanı siqnallar təkcə eyni formaya deyil, həm də eyni mənşəyə malik olmalıdır. Bundan əlavə, həm f(a) həm də (a) diskret funksiyalardır.
Bu şəraitdə çarpaz korrelyasiya inteqralı diskret məhsullara və cəmlərə endirilə bilər.

[0105] 330-da hər hansı uyğunluq varsa, uyğunluqlar haqqında məlumat uyğunluq modulu 145 tərəfindən təmin edilə bilər. Bu, ən azı bir orqanizmin identifikasiyasını asanlaşdıra bilər.

[0106] İxtira yuxarıda göstərilən nümunələrə istinadla təsvir olunsa da, başa düşüləcək ki, modifikasiyalar və variasiyalar ixtiranın ruhu və əhatə dairəsini əhatə edir. Müvafiq olaraq, ixtira yalnız aşağıdakı iddialarla məhdudlaşır.


Qaya kimi möhkəm - çətin kəllə sümüklərinin məhkəmə-tibbi identifikasiyası üçün DNT mənbəyi kimi petrosal sümüyün CE və MPS əsaslı analizlərinin müqayisəsi

Skelet qalıqlarından qısa tandem təkrarı (STR) yazmaq çətin iş ola bilər. Sümüklərin mənşəyinin ətraf mühit şəraitindən asılı olaraq, DNT deqradasiya edilə bilər və STR tipləşdirməsi maneə törədilə bilər. Ümumiyyətlə, sıx və yığcam sümüklərin DNT-ni daha yaxşı qoruduğu bilinir. Bir sıra tədqiqatlar artıq sübut etdi ki, bud sümüyü və dişlər yüksək DNT yazma müvəffəqiyyət dərəcələrinə malikdir. Təəssüf ki, bu elementlər skelet qalıqları ilə bağlı bütün hallarda mövcud deyil. Qismən və ya tək skelet elementlərini emal edərkən, DNT-nin mühafizəsinin nisbətən daha yüksək olduğu sümük sahələrini seçmək əlverişlidir. Xüsusən də kəllə sümükləri cinayət araşdırmaları zamanı təsadüfən aşkar edilir. Kəllə sümüyü bir neçə hissədən ibarətdir. Bu müayinədə biz skelet qalıqlarının insan identifikasiyası üçün daş sümüyünün potensialını məhkəmə-tibbi iş işində qiymətləndirdik. 2010-cu ildən 2017-ci ilə qədər Almaniyanın Ulm şəhərindəki Hüquq Tibb İnstitutunun DNT şöbəsində toplanmış səkkiz naməlum kəllə sümükünün müxtəlif bölmələrindən material və (mümkün olduqda) əlavə olaraq digər skelet elementləri optimallaşdırılmış DNT çıxarılması və STR tiplənməsi ilə işlənmişdir. strategiya. Nəticələr vurğulayır ki, daş sümüklərindən STR yazmaq bütün fərdlərdə, hətta parietal sümüyün analizinin uğursuz olduğu hallarda belə hesabatlı profillərə gətirib çıxarır. Üstəlik, kapilyar elektroforez (CE) tipləməsinin kütləvi paralel ardıcıllıq (MPS) analizi ilə müqayisəsi göstərir ki, MPS pozulmuş insan qalıqlarını təhlil etmək potensialına malikdir və hətta naməlum şəxslərin fenotipi və əcdadları haqqında əlavə məlumat vermək iqtidarındadır.

Bu, abunə məzmununun, qurumunuz vasitəsilə girişin önizləməsidir.


Fiziki və kimyəvi ayırma üsulları

İndiyə qədər tədqiqatların əksəriyyəti cinsi təcavüz cinayətləri üçün ayırma üsullarının inkişafı üzərində cəmləşmişdir. Bu hallarda spermatozoidlər adətən maraq doğuran bioloji materialdır. Bununla belə, bu hüceyrələr çox vaxt qurbanın vaginal, rektal və ya bukkal hüceyrələrinin böyük miqdarından fərqli olaraq yalnız kiçik miqdarda olur.

Diferensial lizis üsulu [18-20] uzun müddət spermatozoidləri epitel hüceyrələrindən ayırmaq üçün qızıl standart olmuşdur. Baxmayaraq ki, bu üsul nəzəri olaraq biri cinayətkarın DNT-sini, digəri isə qurbanın DNT-sini ehtiva edən iki fraksiya təmin edə bilsə də, ayrılma həmişə tamamlanmır və qarışıq genotiplərlə nəticələnir [20].

Alternativ olaraq, kişi iştirakçının DNT-si çox az miqdarda olduqda, qarışıq ləkələrdə kişi komponentini aşkar etmək üçün Y-xromosom STR analizinin istifadəsi təklif edilmişdir [21, 22]. Buna baxmayaraq, autosomal STR-lərdən fərqli olaraq, Y STR profilləri bütün ata qohumları üçün eynidir [23]. Üstəlik, Y-xromosom rekombinasiyasının olmaması səbəbindən Y STR haplotip müxtəlifliyi oxşar autosomal STR panellərindən daha aşağıdır. Buna görə də, Y STR uyğunluğunun müşahidəsi autosomal STR uyğunluğu ilə eyni ayrı-seçkilik gücünə malik deyil. Bəziləri hesab edir ki, Y STR yazısı daxilolmalar üçün deyil, yalnız istisnalar üçün istifadə edilə bilər [24].

Alternativ olaraq, müxtəlif fiziki ayırma üsulları bildirilmişdir. 1998-ci ildə Chen et al. ölçü və forma fərqlərinə əsaslanaraq spermatozoidləri epitelial hüceyrələrdən ayırmaq üçün filtrasiya metodu işləyib hazırlamışdır [25]. Nümunədə mövcud olan spermatozoidlərin əksəriyyəti (70%) filtrdən keçir, epitel hüceyrələri isə onun üstündə qalır. Buna baxmayaraq, epitel hüceyrələrinin təxminən 1% -dən 2% -ə qədəri də filtrdən, həmçinin parçalanmış epitel hüceyrələrindən nüvələrdən keçir və qarışıq genotiplər yaranır.

Floresansla aktivləşdirilmiş hüceyrə çeşidlənməsi, hüceyrə populyasiyalarının immunolabelinq əsasında çeşidləndiyi başqa bir hüceyrə ayırma üsuludur. Əsas çatışmazlıq ondan ibarətdir ki, o, yalnız təzə vaginal yuyulma zamanı tətbiq oluna bilər, vaginal yaxmalara və ya arxiv materialına deyil [26]. Üstəlik, bu texnika süspansiyonda olan hüceyrələr üçün yaxşı uyğun olsa da, toxuma preparatlarında maraq doğuran bölgələrin ayrılmasına imkan vermir [3] məsələn. abort toxumasında valideynlik testi üçün.

2001-ci ildə Virciniya Universitetinin tədqiqatçıları maqnitlə aktivləşdirilmiş hüceyrələrin çeşidlənməsinə əsaslanan hüceyrə ayırma metodunu inkişaf etdirməyə başladılar (http://www.healthsystem.virginia.edu/internet/news/Archives01/forensic.cfm). Bu antikor əsaslı yanaşmanın ən böyük çətinlikləri sperma hüceyrə səthini hədəf alan spesifik monoklonal antikorların müəyyən edilməsində və deqradasiya olunmuş məhkəmə nümunələrində sperma hüceyrə səthi antigenlərinin sabitliyindədir. Bu tədqiqatda sperma baş antigeni üçün spesifik monoklonal antikor, ekvatorial seqment zülalı və sperma flagellar antigeni üçün spesifik monoklonal antikor, kalsium bağlayan tirozin fosforlaşması ilə tənzimlənən zülal hazırlanmışdır (http://www.ncjrs.gov/pdffiles1/nij) /qrantlar/220289.pdf).

Bu yaxınlarda Horsman et al. sperma və epitel hüceyrələrinin ayrılması üçün mikrofabrikasiya edilmiş cihazı təsvir etmişdir. Bu üsul bu hüceyrələrin diferensial fiziki xassələrindən istifadə edir, nəticədə epitel hüceyrələrinin çöküntüsü və adsorbsiyasını şüşə mikroqurğudakı giriş anbarının dibinə gətirir. Tampon axını sperma hüceyrələrinin çıxış anbarına doğru miqrasiyasına səbəb olur, epitel hüceyrələri isə giriş anbarında qalır [27]. Bununla belə, spermanın bərpası yalnız təxminən 25% və ya daha az idi.

Yuxarıda təsvir edilən bütün üsulların qarışığın ayrılması, məhsuldarlığı və çox az miqdarda başlanğıc material və ya arxiv materialı ilə işləmə qabiliyyəti ilə bağlı çatışmazlıqları var. Buna görə də, əksər tədqiqatçılar bu çatışmazlıqları aradan qaldırmaq üçün LCM-nin istifadəsinə diqqət yetirirlər. LCM qarışıq nümunələrdən hədəf hüceyrələrin xüsusi toplanması imkanını təklif edir. Bundan əlavə, mikrodisseksiya birbaşa mikroskopik vizuallaşdırma altında həyata keçirilir. Ən son UV və IR LCM sistemlərindən istifadə edərək, LCM-dən sonra toplama cihazının mikroskopik müayinəsi düzgün hüceyrələrin təcrid olunduğunu yoxlamağa imkan verir.


Material və Metodlar

Xəstələrin müəyyənləşdirilməsi

Bütün xəstələrin nümunələri Universitet Xəstəxanasının Fundacion Jimenez Diaz Biobankından alınır. Biz CHM-nin ilkin klinik diaqnozu ilə, əsasən İberiya əhalisindən olan qırx bir qohum olmayan ailəni təhlil etdik. Yenidən təsnif edilən dörd əlavə ailə də öyrənildi. Bu tədqiqatda iştirak edən xəstələrdən yazılı məlumatlı razılıq alınmış və tədqiqat protokolları bioetik komitə tərəfindən təsdiqlənmiş və Helsinki Bəyannaməsinə və əlavə araşdırmalara uyğun olmuşdur (Fortaleza, 2013). Xoroideremiya diaqnozu X ilə əlaqəli irsiyyət şübhəsi olan və ya istisna edilməyən və gecə korluğu, periferik görmə itkisi, ümumi göz dibinin orta periferiyasında xorioretinal degenerasiyanın yamaqlı sahələri ilə xarakterik fundus görünüşü olan və skotopik elektroretinoqramma reaksiyasının azalması olan xəstələrdə müəyyən edilmişdir. Həyata keçirilən oftalmik testlərə Beynəlxalq Görmə Kliniki Elektrofiziologiya Cəmiyyətinin (ISCEV) Standartlarına uyğun olaraq ən yaxşı düzəldilmiş görmə kəskinliyi (BCVA), daxili və xarici hərəkətlilik, ön dirək və göz dibi müayinəsi, statik perimetriya, rəng testi və Qanzfeld elektroretinoqrafiyası daxildir. Bütün xəstələrin DNT nümunələri əvvəllər təsvir edildiyi kimi çıxarıldı [6].

Birbaşa ardıcıllıq CHM gen

Bütün ekzonlar CHM gen, bitişik intronik ardıcıllıqla birlikdə, daha əvvəl təsvir edilən primerlərdən və şərtlərdən istifadə edərək, genomik DNT-dən PCR vasitəsilə gücləndirildi [6].

Nömrə dəyişikliyinin (CNV) təhlili

CNV analizi ilkin olaraq kəmiyyət flüoresan PCR (qF-PCR) və/yaxud Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) istifadə edilərək aparılmışdır. qF-PCR üçün multipleks gücləndirmə aşağıdakı kimi yerinə yetirildi: hər bir nümunə üçün iki reaksiya təyin edildi, müvafiq olaraq cüt və ya tək nömrəli eksonları gücləndirmək üçün primerləri ehtiva edən A seti və B dəsti quruldu. Dəstlərin hər birində X xromosomu boyunca (nəzarət-A və E), həmçinin xromosoma bitişik bölgələrdə nəzarət primerləri CHM CHM xəstələrində əvvəllər aşkar edilmiş bəzi yenidənqurmalarda iştirak edən gen (nəzarət-B, C və D) daxil edilmişdir. Bütün hallarda, irəli primerlər FAM fluorochrome ilə etiketlənmişdir. Gücləndirici məhsullar elektroforez (ABI Prism 3130 Applied Biosystems) ilə ayrılmış və proqram paketi (GeneMapper v3.5 Applied Biosystems) ilə təhlil edilmişdir. MLPA üçün 250 ng genomik DNT istehsalçının təlimatlarına uyğun olaraq MRC Holland, Amsterdam (www.mrc-holland.com) saytından əldə edilə bilən SALSA P366-A1 CHM-RP2-RPGR MLPA dəsti ilə başlanğıc material kimi istifadə edilmişdir. Tam xarakterizə etmək CHM silmələr zamanı biz Agilent Human Genome CGH Microarray 244K (median interval 8.9kb) və Agilent SurePrint G3 CGH+SNP 2x400k Microarray dəstlərindən (292.097 CGH zondundan və 119.091 median2b probdan ibarətdir) istifadə etdik. Qismən xarakterizə etmək CHM silmələrdə biz Agilent SurePrint G3 CGH-dən istifadə edərək xüsusi aCGH 8X60k istifadə etdik ki, bu da 150 bp-də bir zondun orta paylanmasını təmsil edir. CHM gen. Qısaca, xəstələr və cinsə uyğun gələn nəzarət nümunələri həzmdən sonra Sure Tag DNT Labeling Kit (Agilent Technologies) istifadə edərək Cy3-dUTP və Cy5-dUTP flüoroxromları ilə etiketlənmişdir. Etiketlənmiş məhsullar Agilent protokollarına uyğun olaraq təmizlənmiş, hibridləşdirilmiş və yuyulmuşdur. 8X60k, 2X400k və 244k dəstlərinin nəticələri Agilent CytoGenomics v.2.7 və Agilent DNA Analytics 4.0 proqramları ilə, müvafiq olaraq, ADM-2 aberasiya və ADM1 aberasiya alqoritmləri ilə defolt analiz metodlarından - CGH v2-dən istifadə etməklə təhlil edilmişdir.

Sitogenetik tədqiqatlar

Karyotip və sitogenetik tədqiqatlar əvvəllər təsvir edildiyi kimi aparılmışdır[7].

Haplotip analizi

X ilə əlaqəli miras nümunəsini və təsirini müəyyən etmək CHM, haplotip analizi yan tərəfdəki mikrosatellit markerlərindən istifadə edilərək aparıldı CHM gen (DXS1002-DXS8076) və üç gendaxili polimorf marker (ekson 5-də bir tək nukleotid polimorfizmi (SNP), intron 9-da bir dəyişən nömrəli tandem təkrarı (VNTR) və intron 14-də bir qısa tandem təkrarı (STR)). Bir neçə ailənin ortaq əcdadı paylaşıb paylaşmadığını müəyyən etmək üçün haplotiplər iki intragenik polimorfik markerdən (ekson 5-də bir SNP və intron 14-də bir STR) və ailəni yaxından əhatə edən dörd əlavə mikropeyk markerindən istifadə etməklə yaradıldı. CHM gen (TEL-DXS990-DXS1002-REP1-DXS8076-DXS986). Ekson 5-də SNP-nin genotip analizi üçün birbaşa ardıcıllıq aparıldı. İstifadə olunan qalan markerlər ayrıca gücləndirildi. Hər bir irəli primer flüoresan etiketli idi və gücləndirmə məhsulları elektroforez (ABI Prism 3130 Applied Biosystems) ilə ayrıldı və proqram paketi (GeneMapper v3.5 Applied Biosystems) ilə təhlil edildi. Haplotiplərin yenidən qurulması üçün informatika proqramından istifadə edilmişdir (Kiril versiyası 2.1 Kiril Proqramı, Wallingford, Böyük Britaniya).

Növbəti Nəsil Sıralama (NGS)

Tam Ekzom Ardıcıllığı (WES) üçün genomik DNT, kitabxana və ardıcıllıq əvvəllər təsvir edildiyi kimi həyata keçirildi [8]. O cümlədən retinal distrofiyalarda iştirak edən 37 gendən ibarət xüsusi NGS paneli CHM geni aşağıdakı kimi hazırlanmışdır: DesignStudio proqram təminatına (Illumina) cəmi 588 hədəf bölgə (1,472 amplikon) daxil edilmişdir. Oliqonukleotid zondları sintez edildikdən sonra kitabxanalar quruldu və TruSeq Amplicon Index Kit (Illumina) olan ümumi primerlərdən istifadə edərək PCR vasitəsilə indeksləşdirildi. Nəhayət, NextSeq500 sistemində (Illumina) ardıcıllıqdan əvvəl kitabxanalar normallaşdırıldı və birləşdi.

Fibroblast mədəniyyətləri

Xəstələrin dəri biyopsisini daşıyan bir silmə CHM gen, UAA cəfəngiyyat mutasiyası və UGA cəfəngiyyat mutasiyası Genetik Həssas Bozukluklar üçün Referans Mərkəzində (CHRU Montpellier, Fransa) məlumatlı razılıq əsasında həyata keçirilmişdir. Eyni mərkəzdə aparılan 8-ci ekson delesiyasını daşıyan xəstənin biopsiyası daha əvvəl bildirilmişdi [9]. UAG cəfəngiyat mutasiyasını daşıyan xəstənin dəri biopsiyası IIS-Fundacion Jimenez Diazda (Madrid, İspaniya) aparılıb. Dəri biopsiyaları və yaranan fibroblastlar AmnioMAX C100 bazal mühitində 10% dekomplementasiya edilmiş FCS (Lonza, Verviers, Belçika), 1% penisilin-streptomisin-amfoterisin (amfoterisin) olan L-qlutamin (Invitrogen, Life Technologies, Saint Aubin, Fransa) ilə becərildi. Lonza) və 2% AmnioMax-C100 əlavəsi (Invitrogen, Life Technologies) təsvir edildiyi kimi 5% CO2 altında 37°C-də. Bu iş 2014-A00549-38 saylı biotibbi tədqiqat icazəsi əsasında həyata keçirilib.

In vitro prenilyasiya analizi

Birləşdikdə, 6 quyu boşqabda becərilmiş xəstənin fibroblastları soyuq PBS-də yuyuldu, antiproteazları olan PBS-də kazındı və 5 dəqiqə ərzində 3000 q-da qranullandı. Qranul soyuq, təzə hazırlanmış deqazlaşdırılmış prenilləşmə/lizis tamponunda yenidən dayandırıldı və in vitro prenilyasiya təsvir edildiyi kimi həyata keçirilmişdir [9]. Western blot aşkarlanması təkmilləşdirilmiş kimilüminesans sistemi ECL (Life Technologies) istifadə edərək həyata keçirilib. Biotinləşdirilmiş Rab zülallarının miqdarı daha sonra Image J proqram təminatından istifadə edərək densitometriyanın skan edilməsi yolu ilə ölçüldü və β-aktin siqnalının funksiyası kimi ifadə edildi. Təcrübələr üç nüsxədə aparıldı. Kiçik nümunə ölçülərinə görə qeyri-parametrik Mann-Whitney testindən istifadə etməklə 2x2 müqayisə aparıldı.


DNT mövqe tutur

www.fathom.com 2006_2_54

1986-cı ilin iyulunda İngiltərənin Narboro kəndinin sakinləri öyrəndilər ki, kimsə Dawn Ashworth adlı 15 yaşlı məktəbli qızı zorlayıb və öldürüb. Bu, Londondan təxminən yüz mil şimalda yerləşən bukolik icma üçün ikinci şok idi. Eyni dərəcədə dəhşətli cinayət üç ildən az bir müddət əvvəl ərazini sarsıtmışdı. 1983-cü ilin sonlarında yoldan keçən biri 15 yaşlı Lynda Mannın pozulmuş cəsədini tapdı. Son vəhşilik xəbərləri yerli vətəndaşları qorxutdu və qəzəbləndirdi və polisi çarəsiz qoydu.

Səlahiyyətlilər təhqiqatlarını intensiv sorğu-sual zamanı Ashworth-u öldürdüyünü etiraf edən 17 nəfərdən ibarət, yavaş-yavaş bir xəstəxana qapıçısı üzərində cəmləşdirdilər. O, Mannın öldürülməsində hər hansı əli olduğunu inkar etdi, lakin prokurorlar onun yalan danışdığına əmin idilər. Onu hər iki cinayətlə qəti şəkildə əlaqələndirməli idilər.

İki il əvvəl, yaxınlıqdakı Leicester Universitetinin genetika professoru Dr. Alec Jeffreys, hər bir hüceyrənin nüvəsində yerləşən DNT olan dezoksiribonuklein turşusunun nümunələrində unikal kimyəvi atributları müəyyən etmək üçün bir üsul hazırlamışdı. Onun metodu artıq Qanadan olan gənc oğlanın Britaniyadakı bir qadının oğlu olduğunu sübut edərək, immiqrasiya məsələsini həll etməyə kömək etmişdi. DNT analizi hələ cinayət sübutu kimi təqdim edilməsə də, polis Jeffreysdən onun metodunu əsəbi Narboro işində tətbiq etməyi xahiş etdi.

Qızların cəsədlərində tapılan sperma hüceyrələrindən və şübhəli şəxsdən alınan ağ qan hüceyrələrindən DNT çıxarmaq üçün incə addımlar atarkən həftələrlə gözlədilər. O, məhdudlaşdırıcı fermentlər kimi tanınanları, hədəflənmiş yerlərdə DNT zəncirlərini dəqiq şəkildə kəsən bakteriyalardan çıxarılan kimyəvi maddələri əlavə etdi. Elektrik cərəyanı parçaları yavaş-yavaş məsaməli geldən keçirdi. Gel daha tez hərəkət edən qısaları daha uzun olanlardan ayıraraq bir ələk rolunu oynadı.

Sonra onları sabitləşdirmək üçün parçaları membrana köçürdü. O, güclü qələvi istifadə edərək, DNT ikiqat sarmalının iki zəncirini kimyəvi yolla ayırdı. Əsas addım, müəyyən bir hədəf fraqmentlə bağlanmaq üçün hazırlanmış sintetik DNT-nin bir hissəsi olan bir zond olan bir məhlul ilə nəticələnən massivni yumaq idi. Hər bir zond radioaktiv izotopdan ibarət idi. O, membranı rentgen filminin vərəqinə qoyduqda, şüalanma onu hədəflənmiş fraqmentlərin cəmləşdiyi yerlərdə qaraldır, qeyri-səlis çubuqlar nümunəsi yaradırdı. Membrananı bir-birinin ardınca zondla yuyaraq, Jeffreys müxtəlif növ fraqmentlərin uzunluğunu göstərən bir sıra çubuqlar yaratdı.

Onun metodu "məhdudiyyət fraqmentinin uzunluğu polimorfizmi" və ya RFLP (sahədə çoxlu abreviaturalar) üzərində qurulmuşdu. Termin, DNT-nin müəyyən müəyyən edilə bilən hissələrinin fərdlər arasında dəyişdiyinə istinad edirdi. Bəzilərində daha qısa, bəzilərində daha uzun olurlar. Onun texnikası təcrid etmək (məhdudiyyət fermentlərindən istifadə etməklə), ayırmaq (elektroforez vasitəsilə) və sonra vizual olaraq (radioaktiv zondlar vasitəsilə) təqdim etmək üçün nəzərdə tutulmuşdur. Dəyişən bölmələrin bir neçəsini təhlil edərkən o, virtual əminliklə tək bir şəxsə işarə edə bildi. Bununla belə, ciddi laboratoriya işinin sonunda o, səhv etdiyini düşündü.

"Mənim ilk reaksiyam" Aman Tanrım, texnologiyada səhv bir şey var " oldu" dedi. Onun testi bir kişinin həqiqətən hər iki qızı zorladığını göstərdi. Amma etirafına baxmayaraq, həbsdə olan gənc günahkar deyildi.

Əlavə testlər nəticələri təsdiqlədi və əsəbiləşən polis şübhəlini azad etməli oldu, əgər DNT sübutları olmasaydı, şübhəli bilinə bilərdi. Polis daha sonra görünməmiş addım ataraq 4000-dən çox yerli kişidən qan tələb etdi. Qan qrupu dəlillərə uyğun gələnlərin nümunələri - təxminən 10 faiz - Jeffreysin DNT analizinə məruz qaldı. Zəhmətli prosedur altı ay çəkdi və dalanda başa çatdı. Nümunələrin heç biri qatilin profilinə uyğun gəlmirdi.

İşdə fasilə 1987-ci ilin avqustunda, bir qadın işlədiyi çörək sexindən bir həmkarının polisə qan nümunəsi verərkən özünü iş yoldaşı kimi göstərdiyini etiraf etdiyini eşitdikdə baş verdi. Qadın söhbəti polisə bildirdikdə, onlar iş yoldaşı Kolin Piçforku götürüblər. Jeffreysin testləri bu adamın DNT profilinin hər iki qətlin sübutlarına uyğun olduğunu müəyyən etdi. Pitchfork etiraf etdi və 1988-ci ildə ömürlük həbs cəzasına məhkum edildi.

Jeffreys öz prosedurunu "DNT barmaq izi" adlandırdı (indi daha çox DNT profili və ya analizi adlanır). Bu ilk hadisə texnikanın potensialını vurğuladı. Bu, günahsız bir insanı bəraət qazandırdı və polisə günahkar birinə qarşı iddia qaldırmağa kömək etdi. Kütləvi yoxlama bu gün milyonlarla insanın profilini daxil edən DNT nümunələrinin məlumat banklarını əvvəlcədən müəyyənləşdirdi. Lakin prosesin ləng və çətin xarakterinə görə, az adam zənn edirdi ki, on il ərzində DNT analizi indiyə qədər icad edilmiş ən vacib məhkəmə tibbi alətə çevriləcək. Məhkəmə ekspertizasına "əyləncəli təxribat" adlandırdıqdan sonra, Jeffreys əsas araşdırmasına qayıtdı və qeyd etdi ki, "indi gələn şey texnoloji zəriflikdir və bu mənim işim deyil". Daha sonra elmə verdiyi töhfələrə görə cəngavər oldu.

Müstəntiqlər uzun müddətdir ki, təqsirkarları müəyyən etmək üçün sadə (və çox vaxt etibarsız) şahid ifadələrindən başqa üsullar axtarırlar. Bir populyasiyadan fərd seçməyin üç sistemi XIX əsrin sonlarında ortaya çıxmağa başladı.

1880-ci illərdə Alphonse Bertillon adlı bir Fransız polis məmuru cinayətkarları izləmək və residivistləri təsadüfi cinayətkarlardan ayırmaq üçün şəxslərin etibarlı şəkildə müəyyən edilməsi problemini öz üzərinə götürdü. O, qol aralığı, yanaq eni, oturma hündürlüyü və sağ qulaq uzunluğu daxil olmaqla 11 ölçü hazırladı. Birləşdirilmiş, onlar dəqiqliklə bir insanı müəyyən edə bilərdilər. Sistem iki insanın bir fiziki xüsusiyyəti paylaşa bildiyi halda, onların bir sıra ölçmələr üçün eyni dəyərə malik olma ehtimalının zəif olduğuna əsaslanırdı. Kifayət qədər əlamətlər əlavə edin və təsadüfi uyğunlaşma şansı demək olar ki, yox idi. Bu yanaşma elmi hesab olunurdu, çünki o, həm dəqiq, həm də sistemli idi, ona şifahi təsvir və ya fotoqrafiya üzərində üstünlük verirdi.

Bertillon konsepsiyasının zəif tərəfi onun tətbiqi idi. Ölçmələr aparmaq çətin idi və kiçik səhvlər sistemin dəqiqliyini azaldır. Buna baxmayaraq, 1920-ci illərdə ABŞ-ın bir çox polis idarələri tərəfindən istifadə edilmişdir. O vaxta qədər daha sadə, daha sürətli və potensial olaraq daha faydalı bir üsul gəldi: barmaq izi.

Barmaqların uclarında bir adamdan digərinə dəyişən silsilə naxışları olduğu çoxdan məlum idi. 1892-ci ildə ingilis alimi Frensis Qalton müəyyən etdi ki, bu izlər fərdlərə xasdır və insanın həyatı boyu qalıcıdır. Üstəlik, insanın toxunduğu əşyalarda qalan ifrazatlarda onun barmaq izlərinin qeydi ola bilər və daha sonra onu cinayət yeri ilə əlaqələndirmək üçün istifadə edilə bilər. Galton müxtəlif nümunələri təsnif etmək üçün bir üsul hazırladı. Onun 1897-ci ildə yenidən işlənmiş konsepsiyası bu gün də istifadə olunur.

ABŞ-da səlahiyyətlilər ilk dəfə 1910-cu ildə Çikaqolu bir qatilin məhkum edilməsinə kömək etmək üçün barmaq izi identifikasiyasını işə saldılar. Federal Təhqiqat Bürosu 1924-cü ildə barmaq izi qeydlərini birləşdirməyə başladı və İkinci Dünya Müharibəsinin sonuna qədər 100 milyon nümunə topladı. Onilliklər ərzində barmaq izləri şəxsiyyəti müəyyənləşdirmək üçün əsas vasitə kimi hökm sürdü.

Üçüncü məhkəmə identifikatoru, qan qrupu, 1901-ci ildə mövcud oldu. Avstriyalı tədqiqatçı Karl Landsteiner, uyğun olmayan qan növlərində antigenlərin reaksiyasının topaqlar əmələ gətirdiyini və transfuziyanın qarşısını aldığını aşkar etdi. O, A, B, AB və O tiplərini qeyd etdi. Hər biri müəyyən bir genetik qəribəliyin təzahürü idi.

Polis istisna xarakterli dəlillər təqdim etmək üçün cinayət araşdırmalarında qan qrupu sübutlarından istifadə edib. Yəni cinayətkar hadisə yerində A qrup qan qoyubsa, digər qan qruplarına malik şübhəlilər istisna edilib. Lakin sadəcə olaraq A növünə sahib olmaq şübhəlinin günahkar olması demək deyildi, çünki əhalinin böyük bir hissəsi bu xüsusiyyəti bölüşürdü.

İllər keçdikcə müstəntiqlər məhkəmə-tibbi identifikasiyaya kömək etmək üçün fərqli serum zülalları və fermentləri ilə yanaşı digər qan faktorlarını da əlavə etdilər. Birlikdə onlar ayrı-seçkiliyi artıra bilər. Yüz nəfərdən biri müəyyən bir qan profilinə malik ola bilər. Atalığın müəyyən edilməsi üçün bu cür sübutlar inandırıcı ola bilər. Lakin cinayət işində qan qrupuna aid sübutlar yalnız şübhəliləri istisna edə bilərdi ki, bu, əsaslı şübhələri aradan qaldırmaq üçün kifayət qədər spesifik deyildi.

DNT profilləşdirməsi bu köhnə identifikasiya vasitələrinin hər üçü ilə əlaqəyə malik idi. Qanın qruplaşdırılması kimi, kimyəvi analizə əsaslanırdı. Barmaq izi kimi, o, fərd üçün xas olan fərqli, lakin məqsədsiz fiziki xüsusiyyətə əsaslanırdı. Bertillon metodu kimi, təsadüfi uyğunlaşma ehtimalını azaltmaq üçün bir sıra atributları müqayisə etdi. Ancaq insan dəyişkənliyinin mənbəyinə gedərək, DNT profili bir insanı müəyyən etmək və ya şübhəlini sübuta uyğunlaşdırmaq üçün bütün əvvəlki üsulları üstələmək potensialına sahib idi.

İngilis səlahiyyətliləri iki yeniyetmənin qətlini açmaq üçün mübarizə apararkən belə, Florida ştatının Orlando şəhərindəki detektivlər öz serial təcavüzkarlarının izində idilər. O, ilk dəfə 1986-cı ilin mayında hücum edib və ilin sonuna kimi 23 qadına təcavüz edib. Əksər hallarda o, evə girib, bıçağı göstərib, şəxsiyyətini müəyyənləşdirməkdən yayındırmaq üçün qurbanın üzünü örtüb və sürücülük vəsiqəsi kimi şəxsi əşyaları oğurlayıb.

1987-ci ilin fevralında o, iki uşağı qonşu otaqda yatarkən gənc anaya təcavüz etdi. Bu dəfə o, iki barmaq izini qoyub. Mart ayında polis ərazidə izləri uyğunlaşdıran bir ovçunu yaxaladı. O, 24 yaşlı anbar işçisi Tommi Li Endryus idi.

Barmaq izi sübutu, ehtimal ki, Andrews-i bu cinayətə görə məhkum edə bilərdi, lakin səlahiyyətlilər onu ən azı bir başqa zorlama ilə əlaqələndirmək istədi. Bu, bir neçə il həbslə həyat arasındakı fərq demək olardı. Bununla belə, yalnız bir qurban onu tanıya bildi və onun dəlilləri təqsirli hökm çıxarmağa zəmanət vermədi.Florida prokurorları ABŞ məhkəmə zalında ilk dəfə istifadə edilən DNT profilinə müraciət etdilər. Bu gün DNT analizi adi haldır, lakin 20 il əvvəl Endryusun qanından götürülmüş DNT ilə zorlama qurbanının üzərində tapılan sperma izlərini birləşdirməyə başlayan elm adamları iki mürəkkəb molekulun içərisindən kiçik molekulu ayırmaqda çətin bir problemlə üzləşdilər. fərdin özünəməxsus variasiyaları.

Bir tədqiqatçı tərəfindən molekulların kralı adlandırılan DNT, onun təbiətini anlamaq cəhdlərinə uzun müddət müqavimət göstərmişdir. Hələ 1869-cu ildə isveçrəli həkim və kimyaçı Fridrix Mişer irindən götürülmüş ağ qan hüceyrələrinin nüvələrində bir az turşulu birləşmə aşkar etmişdi. Molekulun funksiyası 1944-cü ilə qədər, Osvald Averi və Nyu-Yorkun Rokfeller Tibbi Tədqiqatlar İnstitutundakı həmkarları DNT-nin genetik məlumatın daşıyıcısı olduğunu müəyyən edənə qədər müəyyən edilmədi. Lakin elm adamları bu çətin molekulun həyatın asılı olduğu bütün təlimatları necə ötürdüyü üzərində baş sındırmağa davam edirdilər. Sıçrayış 1953-cü ildə amerikalı tədqiqatçı Ceyms Uotson və onun britaniyalı həmkarı Frensis Krik DNT-nin həm strukturunu, həm də onun məlumat daşıma mexanizmini müəyyən etdikdə baş verdi. Onlar aşkar ediblər ki, sadə kimyəvi alt strukturların əlifbası hüceyrədəki fəaliyyəti tənzimləyən genetik sözlərə düzülüb.

DNT heyrətamiz dərəcədə uzun atom silsiləsindən ibarət idi. Tək bir hüceyrədə DNT sarğıları açılsaydı, onlar altı fut uzanardı. Biz molekulu burulmuş nərdivan, məşhur qoşa spiral kimi təsəvvür edə bilərik. İnsan DNT-si 23 cüt xromosomda düzülmüş 46 molekuldan ibarətdir (hər cütdən biri hər valideyndən miras alınır). Bu nərdivanların cəmi altı milyard pilləsi həyatın şifrəli məlumatlarını daşıyır. Hər bir pillə, A, T, G və C kimi adlandırılan dörd kimyəvi strukturdan birindən ibarətdir və digər zəncirdə tamamlayıcı bir quruluşa (A-dan T, G-dən C-yə) bağlanır və “əsas cütü” təşkil edir. Hüceyrənin DNT-sindəki əsas cütlərin - genlərin yalnız təxminən 2 faizi məlumat daşıyır. Molekulun qalan hissəsinin məlum funksiyası yoxdur (baxmayaraq ki, bəzi funksiyalar hələ kəşf oluna bilər) və tez-tez kodlaşdırılmayan və ya “zibil” DNT adlanır.

1980-ci illərin əvvəllərində, oksigen daşıyan zülal istehsal edən genin xəritəsini çıxarmaq üçün bir yol axtaran Jeffreys, "tamamilə təsadüfi" olduğunu etiraf etdiyi bir kəşf etdi. O, DNT ardıcıllığında kəkələmələri, baza cütlərinin bir nümunəsinin təkrarlandığı, əksəriyyəti molekulun “zibil” bölmələrində olan yerləri araşdırmağa başladı. O, müəyyən etdi ki, onlar fərdlər arasında ardıcıllığın təkrarlanma sayına görə dəyişir. Müəyyən bir yerdə, 28 əsas cütdən ibarət nümunə bir fərddə 46 dəfə, digərində 127 dəfə təkrarlana bilər. Hər bir sayt bir cüt xromosomun hər birində meydana gəldiyi üçün, bir adam adətən təkrarlar üçün iki fərqli dəyərə sahib olacaq. 1984-cü ilin sentyabrında Jeffreysin kimyəvi manipulyasiyası müxtəlif uzunluqdakı seqmentləri ayırmaq və onları rentgenoqrafiyada vizuallaşdırmaq üçün bir yol yaratmağa müvəffəq oldu.

“Bu, “Evrika!” anı idi” dedi. Jeffreys DNT molekulunun fərd üçün xas olan cəhətini müəyyən etmək üçün bir yol tapmışdı. "Biz dərhal məhkəmə-tibbi araşdırma potensialını görə bildik."

Bu, böyük bir kəşf idi. DNT insanı unikal edən bütün fiziki xüsusiyyətləri idarə etsə də, onu məhkəmə-tibb alətinə çevirmək asan məsələ deyildi, çünki insan DNT-sinin 99,9 faizi hamı üçün eynidir. Məhz Jeffreysin dəyişən say tandeminin təkrarları (VNTR) kimi tanınan şeyi müəyyən etmək və ölçmək üçün bir yol kəşfi daha da irəliləyişə səbəb oldu.

DNT-nin məhkəmə tətbiqləri üçün faydalı edən keyfiyyətlərindən biri də bütün həyat kodunun bədənin demək olar ki, hər bir hüceyrəsinin nüvəsində olması idi. Bu o demək idi ki, əgər müstəntiqlər sperma ləkəsini şübhəli şəxsin qanı ilə müqayisə edə bilsələr, uyğunlaşma mümkün olacaq.

1987-ci ildə Nyu-Yorkdakı Lifecodes laboratoriyasının texniki işçiləri Tommi Li Endryus işindəki DNT nümunələrini təhlil edərkən bunu etməyə çalışırdılar. Onlar DNT molekullarını hüceyrələrdən azad etmək üçün kimyəvi yuyucu vasitələrdən və zülal parçalayıcılardan istifadə ediblər. DNT-ni cəmləşdirib təmizlədikdən sonra onu çox əziyyətli analiz prosesinə məruz qoydular.

Onların cəhdləri uzun DNT molekullarından tandem təkrarlarının nümunələrini ehtiva edən xüsusi bölmələri kəsmək idi. Təkrarlanan seqment, məsələn, 20 əsas cüt uzunluğunda ola bilər. Bir adam 12 təkrar, digəri isə 80 təkrar edə bilərdi. Seqmentlər qatardakı vaqonlara bənzəyirdi və texniklərin məqsədi mühərriklə kabus arasındakı uzunluğu müəyyən etmək idi.

Məhdudiyyət fermenti DNT molekulundan hədəf seqmenti kəsdi (həmçinin testə aidiyyatı olmayan bir çox digər fraqmentlər də əmələ gətirdi). Elektroforez prosesində uzun seqmentlərin qısa seqmentlərdən daha yavaş hərəkət etməsi üçün ələk kimi agaroz geldən (dəniz yosunlarından əldə edilir) istifadə edilirdi. Texniklər indi ölçülərinə görə düzülmüş fraqmentləri neylon membrana köçürdülər və yerində bərkiddilər. Güclü qələvi məhlulu iki ipi bir yerdə saxlayan kövrək bağları parçaladı.

Onların istifadə etdikləri DNT zondları təkrarların hədəflənmiş sahəsini tamamlayan DNT-nin sintez edilmiş hissələri idi. Onlar DNT-nin əsas prinsipinə əsaslanırdılar ki, A əsası yalnız T ilə və G yalnız C ilə birləşir (GATC ardıcıllığının tamamlayıcısı CTAG-dır). Texniklər neylon membran boyunca zondları olan məhlulu yuyanda, zondlar DNT-nin müxtəlif fraqmentləri ilə deyil, onların tamamlayıcıları olan hədəf bölmələrlə kimyəvi bağlar yaratdı. Birdən çox zonddan istifadə edərək, onlar bir neçə fərqli təkrarlanan yerin uzunluğunu müəyyən edə bildilər.

Texniklər hər birində radioaktiv izotop daxil etməklə zondları "etiketləmişdilər". Onların cəmləşdiyi bölgələrdə hədəf DNT-yə qoşulan zondlar membranın qoyulduğu rentgen filmini qaraldırdı. Beləliklə, əldə edilən rentgenoqrafiya (baqqal məhsullarının ştrix kodlarına bənzəyirdi) hədəf fraqmentlərin nisbi uzunluqlarına uyğun olan mövqelərini göstərdi.

Tommie Lee Andrews işində dəlil DNT-si ilə şübhəlinin qanından alınan çubuqlar eyni idi. Münsiflər heyəti öz hökmünə çatmaq üçün bir çox yeni elmi araşdırmaqda ittiham edildi, lakin 1988-ci ilin fevralında Andrews-in həqiqətən serial təcavüzkar olduğuna qərar verdi. O, ümumilikdə 115 il həbs cəzası alıb.

1989-cu ildə ölüm hökmündən qaçmaq üçün Virciniya ştatında zorlama və qətl törətməkdə günahını etiraf edən David Vazquez DNT profili əsasında bəraət qazanan ilk amerikalı oldu. Bu vaxt FTB DNT-yə həsr olunmuş öz laboratoriyasını qurmuşdu. Məhkəmə-tibbi DNT dövrü, deyəsən, gedirdi.

Bununla belə, texnika hələ də bir sıra çatışmazlıqlara görə mane olurdu. RFLP profilinin yaradılması çətin iş idi: vasvası, vaxt aparan və zəhmət tələb edən. Bahalı testləri yerinə yetirmək həftələr, bəzən aylar çəkdi. Nəticələr mütəxəssislər tərəfindən diqqətlə təhlil edilməli idi. Üstəlik, müstəntiqlərə testi başa çatdırmaq üçün kifayət qədər DNT çıxarmaq üçün nisbətən böyük bir nümunə, bir qəpik ölçüsündə qan ləkəsi lazım idi.

Hər şey dəyişmək üzrə idi. Kaliforniyalı bir biokimyaçının kəşfi artıq məhkəmə DNT analizində devrim yaratma prosesində idi. Tezliklə molekulyar biologiyanın bütün sahəsini sarsıdacaq.

1983-cü ildə Kary Mullis oraq hüceyrəli anemiyanın genetik köklərini kəşf etmək üçün biotexnologiyanın yeni sahəsini tədqiq edən bir şirkət olan Cetus Korporasiyasında bir komanda ilə işləyirdi. Bir cümə axşamı Berklidən şimala, Mendosino qraflığındaki həftə sonu kottecinə doğru sürərkən Mullis elə heyrətləndirici bir fikirlə qarşılaşdı ki, avtomobilini yoldan çəkdi və fikrini zərfin üzərinə cızdı.

"Mən bunun bir illüziya olduğunu düşündüm" dedi. O, DNT-nin "qaranlıqda maşının döşəməsində açılmış və dolaşıq səs yazısı kimi" işləmək üçün yöndəmsiz bir molekul olduğunu başa düşdü. O, bilirdi ki, onunla faydalı bir şey etmək üçün elm adamları idarə olunan seqmentlərə diqqət yetirməlidirlər. Problem onda idi ki, molekulun hər hansı bir qısa seqmenti o qədər kiçik idi ki, o, dəyərsiz idi. Əgər…

O, molekulun bir seqmentini kopyalamaq üçün DNT-nin özünü çoxaltmaq üçün təbii qabiliyyətindən istifadə etməyin bir yolunu təsəvvür etdi. Prosesi təkrar-təkrar təkrarlayın və nüsxələrin sayı həndəsi şəkildə artacaq, əvvəlcə 2, sonra 4, 8, 16 və 20 dövrədən sonra bir milyon. O, “seçdiyim hər hansı DNT ardıcıllığından istədiyim qədər nüsxə çıxarmağın” yolunu tapmışdı.

O, bütün gecəni oyaq qalıb hesablamalar aparıb. Önümüzdəki aylarda o, polimeraza zəncirvari reaksiyasının (PZR) əsas elementlərini qurdu, baxmayaraq ki, laboratoriya üsullarını mükəmməlləşdirmək üçün illər lazımdır. O, 1993-cü ildə bütün dünyada detektivlərin cinayətlə mübarizə arsenalına əlavə olunsa da, biokimyaçılar tərəfindən müsbət qarşılanan bir ixtiraya görə Nobel Mükafatını qazandı.

Mullisin texnikası üç addımdan ibarət idi. Əvvəlcə o, iki zəncirini ayırmaq üçün DNT nümunəsini suyun qaynama nöqtəsinə qədər qızdırdı. Sonra o, qarışığı soyudu və təkrarlamaq istədiyi zəncirin unikal hissəsini qeyd etmək üçün "primerlərə", sintetik DNT fraqmentlərinə etibar etdi. Problar kimi, primerlər də nümunənin uzunluğu boyunca tamamlayıcıları ilə bağlanır. Onlar kompüterdə “tap” funksiyası kimi çıxış edərək, müəyyən bir əsas ardıcıllığını yerləşdirdilər.

Kritik üçüncü addım, polimeraza fermentini primerlərə sərbəst üzən G, A, T və C əsas elementlərini əlavə etməyə təşviq etmək üçün məhlulun bir qədər qızdırılması və bununla da hədəflənmiş sahə boyunca tamamlayıcı DNT zəncirinin yazılması idi. Qarışığı yenidən qızdırdıqda, yeni ip öz şablonundan qopdu və iki seqment yenidən kopyalanmağa hazır oldu. Bu qarışığın temperaturunu dəfələrlə yüksəltmək və azaltmaq - bir dövrə təxminən beş dəqiqə çəkdi - vurma prosesini davam etdirdi.

Məhkəmə analizində istifadə edildikdə, PCR təxminən 25 və ya 30 sikldən sonra kifayət qədər DNT istehsal etdi. Daha sonra texniki işçilər RFLP metodunda olduğu kimi elektroforezdən istifadə edərək parçaları uzunluğa görə ayırmağa davam etdilər. Texniklər daha yavaş radioaktiv göstəriciləri aradan qaldıraraq elektroforezdən sonra fraqmentləri vizuallaşdırmaq üçün flüoresan etiketlərdən və ya boyalardan istifadə etməyə başladılar.

PCR əvvəlki üsuldan daha sürətli, asan və daha ucuz idi. Konnektikut ştatının keçmiş baş kriminalçısı Henri Linin sözlərinə görə, PCR “məhkəmə alimlərinin fərdin DNT-sini yazmaq qabiliyyətini xeyli genişləndirən” texnologiya idi.

1991-ci ildə Hyustondakı Baylor Tibb Kollecinin tədqiqatçısı Thomas Caskey DNT seqmentlərinin Cefrisin istifadə etdiyi dəyişən say tandem təkrarlarından çox daha qısa istifadəni təklif etdikdə PCR daha da faydalı oldu. Bu qısa tandem təkrarları (STR) yalnız üç-beş əsas cütdən ibarət olan nümunələrin təkrarlarından ibarət idi. Təkrarlar silsiləsi 50 əsas cüt uzunluğunda ola bilər, Jeffreys tərəfindən hədəflənən bölmələr minlərlə əsas cütdən ibarət idi.

RFLP-də olduğu kimi, fərd hər hansı bir STR saytı üçün hər bir valideyndən miras qalmış iki variantı (alellər kimi tanınır) göstərəcək. Bəzən nömrə hər biri üçün eyni idi, lakin adətən fərqli idi. Beləliklə, bir saytın PCR testi iki zolaq yaradar. Biri 5 təkrarı, digəri isə 12 təkrarı göstərə bilər. Bu, sübut nümunəsi üzərində eyni testin nəticələri ilə asan müqayisə üçün yaradılmışdır.

Fraqmentlər qısa olduğundan, RFLP-də istifadə edilən daha uzun fraqmentlərə nisbətən ayrıldıqda daha aydın bir nümunə yaratdılar. Nəticələr birmənalı idi və şərh etmək daha asan idi. Proses həmçinin müstəntiqlərin minlərlə nümunəni özündə birləşdirən verilənlər bazası yaratmağa başladığı zaman mühüm amil olan avtomatlaşdırmaya da öz töhfəsini verdi.

PCR əsaslı analizin ən mühüm üstünlüyü ondan ibarət idi ki, müstəntiqlər RFLP texnikasından istifadə edə bildiklərindən daha kiçik nümunələri öyrənə bildilər. Bir dəqiqəlik miqdardan başlayaraq, yalnız bir neçə hüceyrə, materialdan DNT-ni "gücləndirə" və lazım olan qədər yarada bildilər. Bu o demək idi ki, kiçik qan ləkələri, siqaret kötüklərindəki tüpürcək və ya xizək maskasının üzərindəki dəri hüceyrələrinin bir dəqiqəlik çökməsi şübhəli şəxsi müəyyən edə bilər.

Texniklər həmçinin köhnə və pisləşmiş nümunələrlə işləmək üçün PCR-ni ideal hesab etdilər. Qısa tandem təkrarlarını təşkil edən kiçik DNT seqmentlərinin DNT yaşlandıqca parçalanma ehtimalı daha böyük olanlara nisbətən daha az idi. Bu vacib idi. DNT davamlı kimyəvi maddədir, lakin istilik, ultrabənövşəyi işıq və digər amillər onun parçalanmasına səbəb ola bilər. Sübut izləri nadir hallarda təmiz olur, buna görə də detektivlər sınmış DNT-ni idarə edə biləcək bir üsulu alqışlayırdılar. Onlar bilirdilər ki, yalançı tapıntı təhlükəsi yoxdur. Həddindən artıq deqradasiya profilin əldə edilməsinə mane ola bilər, lakin o, heç vaxt fərqli profil yaratmadı.

Metodun üstünlükləri o demək idi ki, 1990-cı illərin ortalarında PCR bir çox laboratoriyalarda orijinal RFLP texnikasını əvəz etməyə başlamışdır.

PCR yalnız 1993-cü ilin fevralında Dünya Ticarət Mərkəzinin qarajında ​​bomba partlayanda məhkəmə tibbi ayaqlarını tapırdı. Partlayış nəticəsində 6 nəfər ölüb, 1000-dən çox insan yaralanıb. Dörd gün sonra The New York Times qəzetinin redaktorları hücuma görə məsuliyyəti öz üzərinə götürən məktub aldılar.

Terrorçulardan biri, Məhəmməd Salameh, tezliklə partlayıcını daşıyan yük maşını üçün depozit götürməyə gedəndə həbs edildi. Səlahiyyətlilər tez bir zamanda Salamehin tərəfdaşı Nidal Ayyada diqqət yetirdilər. Onu bombardmanla əlaqələndirən dəlillərə Times qəzetinin aldığı məktubun zərfinin qapağında tüpürcək izi də daxildir. O zaman istifadə edilən PCR texnikası sonradan olduğu kimi ayrı-seçkilik yaratmırdı, lakin ekspertlər 50 nəfərdən yalnız birinin zərfdə tapılan profillə uyğunlaşacağını təxmin edirdilər və Əyyad da onlardan biri idi. Sübutlar münsiflər heyətinə onu məhkum etməyə kömək etdi.

DNT analizinin yeni forması daha qısa təkrarlanan seqmentlərə əsaslandığı və buna görə də Jeffreysin orijinal metodunun ayrı-seçkilik gücünə malik olmadığı üçün tədqiqatçılar gücləndirmə üçün molekul boyunca daha çox STR sahələrini hədəf almağa başladılar (minlərlə insanın mövcud olduğu bilinir). Bunun üçün onlar müxtəlif DNT bölgələrinə yapışmaq üçün hazırlanmış primerləri əlavə etdilər. İki şübhəli şəxs bir sayt üçün eyni nümunəni göstərə bilər, lakin hər bir sayt əlavə edildikdə təsadüfi uyğunlaşma şansı eksponent olaraq azalır. FTB nəhayət, indi standart DNT profilini təşkil edən 13 sayta yerləşdi.

PCR-nin əsas çatışmazlığı onun çirklənməyə həssaslığı idi. Laboratoriya işçisinin bir neçə dəri hüceyrəsi RFLP metodu ilə analiz edilməli olan bir damla qana düşərsə, onların DNT-si nümunənin özündən daha böyük miqdarda DNT-də itiriləcək. Lakin PCR analizi üçün nəzərdə tutulmuş kiçik bir dəlil izinə çirkləndirici əlavə olunarsa, proses çirkləndiricidən DNT-ni, eləcə də dəlilləri gücləndirər və çaşdırıcı və ya yanıltıcı nəticə ilə nəticələnərdi. PCR ciddi sübutlarla işləməyi və super təmiz laboratoriya üsullarını tələb edirdi.

Başqa bir çətinlik, müəyyən bir nümunənin nə qədər ümumi ola biləcəyini dəqiq müəyyənləşdirmək idi. DNT analizi heç vaxt dəqiqliklə deyil, yalnız ehtimallarla məşğul olur. Nəticələr göstərir ki, müəyyən bir insanın DNT nümunəsi sübut nümunəsinin nümunəsinə uyğun gəlir. Bundan sonra statistiklər təsadüfi seçilmiş şəxsin oxşar matça sahib olma şansını hesablamalıdırlar. Mində bir, milyonda bir, yoxsa milyardda bir?

Bu nömrələr məhsul qaydası ilə əldə edilir. Sadəlik üçün deyək ki, hər bir STR saytında təkrarların sayında 10 mümkün variant var (faktiki rəqəm adətən daha yüksəkdir). Variantlar təsadüfi paylanırsa, bir saytda uyğunlaşma şansı 10-da 1-dir. İki saytda uyğunlaşma şansı üçdə 100-də 1, dörddə 1000-də 1, 10.000-də 1-dir. Hər bir əlavə sahə təsadüfi uyğunlaşma ehtimalını 10-un gücü ilə azaldır. Tədqiqatçılar bütün 13 STR saytını tənliyə daxil edərək, indi iki DNT nümunəsi arasında təsadüfi uyğunlaşma şansını 575 trilyonda heyrətamiz bir səviyyəyə qoyurlar. Prokurorlar bu cür rəqəmləri münsiflər heyətinə izah etdikdə, DNT sübutları çox güclü olur.

1994-cü ildə məhkəmə DNT profilini milyonlarla insana tanış edəcək bir hadisə başlıqlara çevrildi. Kaliforniya prokurorları təqaüdçü futbolçu Orental Ceyms Simpsonu keçmiş həyat yoldaşı Nikol Braunu və onun dostu Ronald Qoldmanı bıçaqlayaraq öldürməkdə ittiham edib. Sonrakı sınaqda DNT əsas məsələ oldu. Münsiflər heyəti DNT analizində qəza kursuna bərabər oturdu və bu texnika stenoqramda 10.000-dən çox dəfə qeyd olundu.

Təhlillər təqsirləndirilən şəxslərə qarşı lənətləyən dəlillər ortaya çıxarıb. Hər iki qurbanın qanı Simpsonun evinin kənarında tapılan əlcəyi ləkələdi. Simpson's Ford Bronco-dan alınan bir ləkə üzərində aparılan sınaqlar onun tərkibində Qoldmanın qanının olduğunu aşkar etdi. Simpsonun yataq otağının döşəməsində tapılan corabda qan Nikol Braunun olduğu müəyyən edilib. Görünürdü ki, yeni elm sirri açmaqda təqdirəlayiq iş görüb.

Lakin müdafiə tərəfi DNT sübutlarının məqbul olmasına etiraz etməsə də, Simpsonun vəkillərdən ibarət “arzu komandası” sübutları toplamaq və emal etmək üçün istifadə edilən üsullarla bağlı narahatedici suallar qaldıra bildi. Sınaqların çoxu laboratoriya səhvinə və şərhinə məruz qalan orijinal RFLP texnikasına əsaslanırdı. Digər tərəfdən daha yeni PCR üsulu çirklənməyə kəskin həssas idi. Texniklər nümunələrin toplanması və rəftar edilməsində xüsusilə diqqətsiz idilər. Bir laboratoriya işçisi Simpsondan götürülmüş istinad qanını tökdükdən dərhal sonra sübutları sınaqdan keçirdi. Bu prosessual çatışmazlıqlar, Simpsonun müstəntiqlər tərəfindən tərtib edildiyinə dair təkliflərlə yanaşı, münsiflər heyətinin təqsirsizlik hökmü çıxarmasına kömək etdi.

Prokurorlar və polislər başa düşdülər ki, DNT sübutlarının yoxlanılmasından sağ çıxması üçün dəlillərin ciddi şəkildə idarə edilməsi və ciddi laboratoriya üsullarına ehtiyac var. 1998-ci ildə Nyu-York şəhərinin polis komissarı Howard Safir, "O. J. Simpson işinə əsaslanaraq, daha az problemə məruz qalan laboratoriya və prosedurlar hazırlamalı olduq" dedi.

1996-cı ildə federal hökumət DNT Laboratoriyasını Təkmilləşdirmə Proqramı vasitəsilə dövlətlərə qrantlar verməyə başladı. Vəsaitlər prosedurları təkmilləşdirmək və standartlaşdırmaq üçün getdi və laboratoriyalara RFLP-dən PCR texnologiyasına keçməyə kömək etdi. Elə həmin il Milli Tədqiqat Şurası DNT sübutlarına təsdiq möhürü verdi və bəyan etdi ki, sınaq üsulları və statistik məlumatlar “düzgün toplanmış və təhlil edilmiş məlumatların məqbulluğuna şübhə doğurmayacaq qədər irəliləmişdir”. Münsiflər tezliklə müntəzəm olaraq DNT analizinə əsaslanan həlledici sübut kimi qəbul etdilər.

1990-cı illərin sonlarında DNT profili iki Amerika prezidenti ilə bağlı qalmaqallara dəlil gətirərək xəbərləri yenidən gündəmə gətirdi. Birincinin təxminən 200 yaşı var idi. Hələ 1802-ci ildə Tomas Ceffersonun düşmənləri onu qulu Sally Heminqsdən uşaq atası olmaqda ittiham etmişdilər. Bu və ya digər şəkildə sübut etmək 1998-ci ilə qədər qeyri-mümkün görünürdü. Tomas Ceffersonun əmisi nəslinin (Ceffersonun özündə heç bir məlum kişi varisləri yox idi) və Heminqin nəslinin DNT-sinin tədqiqi Ceffersonun ən azı övladlarından birini dünyaya gətirdiyini göstərirdi.

Barmağını tarixə qaytararkən belə, DNT sübutları Ağ Evin o vaxtkı sakini Bill Klintonun yalanını tutdu. Klinton xalqı əmin etmişdi ki, o, “həmin qadın” Ağ Evdə təcrübə keçən Monika Levinski ilə cinsi əlaqədə olmayıb. Xüsusi prokuror Kennet Starr tərəfindən sifariş edilən DNT profili əksini sübut etdi və Levinskinin mavi paltarındakı sperma ləkələrini Prezidentdən alınan qanla əlaqələndirdi. Təkzibedilməz dəlillər biabırçı etirafa gətirib çıxardı və 130 ildə ilk dəfə Amerika prezidentinin impiçmenti üçün zəmin yaratdı.

Şübhəli şəxsi istisna etmək qabiliyyətinə görə, DNT həmişə bəraət qazandırmaq üçün güclü bir vasitə olmuşdur. 1981-ci ildə 20 yaşlı Robert Klark Corciya ştatının Şərqi Atlanta şəhərində baş verən cinayətə görə zorlama, adam oğurluğu və silahlı soyğunçuluqda ittiham olunurdu. O, təqsirsiz olduğunu elan etdi, hətta Klarkın oğurladığı ehtimal edilən qurbanın avtomobilini aldığı adamın adını çəkdi. Lakin qurban onu sıradan çıxarıb. O, təqsirli bilinərək iki ömürlük və 20 il müddətinə azadlıqdan məhrum edilib.

2003-cü ildə Klark, hüquqşünaslar Barry Scheck və Peter Neufeldin 1992-ci ildə Nyu-York Universitetinin Benjamin N. Cardozo Hüquq Məktəbində qurduqları İnnocence Project təşkilatı ilə əlaqə saxladı. Qeyri-kommersiya qrupu təqsirkarlıq məsələsi olduğu hallarda məhkumluqdan sonrakı DNT testini təmin edir.

Prokurorların etirazına görə, Layihə vəkilləri Klark işində DNT analizi təşkil etdilər. Test sübut etdi ki, Robert Klark mühakimə olunduğu cinayətin icraçısı deyil. Bunun əvəzinə, bu, Klarkın iyirmi il əvvəl adlandırdığı adamı cəlb etdi. 2005-ci ilin dekabrında, demək olar ki, 25 illik həbsdən sonra Klark azadlığa çıxdı.

DNT testinin haqsız yerə məhkum edilmiş şəxslərin bəraət qazanmasında rolu onun ədalətə verdiyi ən mühüm töhfə olmuşdur. Hər bir səhv mühakimə ikiqat ədalətsizliyə səbəb olur: günahsız bir insan həbsdədir, cinayətkar cəzasızdır. Robert Klark indiyədək Məsumluq Layihəsi tərəfindən təmizlənmiş 175 digər müttəhimə qoşulub. Bu uğur bir çox oxşar səylərə səbəb oldu. Bu, etiraflar və şahidlərin şəxsiyyəti daxil olmaqla, digər məhkəmə-tibbi sübutların etibarlılığı ilə bağlı suallar doğurdu. 2003-cü ildə İllinoys ştatının qubernatoru Corc Ryan, DNT testi və digər üsullarla 13 nəfərin günahsız olduğu aşkar edildikdən sonra ştatının bütün edam məhbuslarının cəzalarını yüngülləşdirdi. Ölkə miqyasında təkcə DNT testi haqsız yerə ölümə məhkum edilmiş ondan çox insanı təmizlədi.

Hələ 1977-ci ildə, DNT profilinin çıxarılması xəyal edilməzdən illər əvvəl, Richmond, Virciniya, Shakey's Pizza Salonu adlı bir iş yeri quldurluq etdi. Hadisə şiddətə çevrilib və oğru mağaza sahibini öldürüb. Mübarizə zamanı təcavüzkar öz qanının damcılarını qoyub. Çox az əlavə dəlil və heç bir şübhəli olmadığı üçün polis işi, yəqin ki, heç vaxt həll etməyəcəkləri şəxslərin siyahısına qoydu.

DNT profili şübhəlini cinayətlə əlaqələndirə və ya onu istisna edə bilər. Bəs şübhəli olmayan hallar haqqında nə demək olar? Ştat və federal səlahiyyətlilər cinayət yerində naməlum şəxsin izi tapılarsa, uyğunluq tapmağa çalışa bilmələri üçün cinayətkarların və başqalarının barmaq izlərinin qeydlərini uzun müddət saxladılar. Onlar başa düşdülər ki, DNT profillərini ehtiva edən oxşar verilənlər bazası onlara cinayət yerindən sübutları potensial şübhəlilərin profilləri ilə əlaqələndirməyə cəhd etməyə imkan verəcək.

1998-ci ildə FTB dövlətlərin DNT profillərini milli reyestrdə birləşdirən Kombinə DNT İndeks Sistemi və ya CODIS kimi tanınan proqrama başladı. Nümunələrin toplanması meyarları ştatdan asılı olaraq dəyişir. PCR texnikası təhlil edilən 13 DNT sahəsinin hər birinə təkrarların sayını göstərən iki rəqəm təyin edir. Bir rəqəm saytın anadan, digəri isə atadan miras qalan versiyasının ölçüsüdür. Bu 26 rəqəm insanın DNT-sinin tam, yığcam profilini təmsil edir və asanlıqla axtarılan verilənlər bazasına imkan verir.

Sistem müstəntiqlərə 30.000-dən çox açıq işdə cinayət yeri sübutlarını potensial şübhəlinin DNT-si ilə uyğunlaşdırmağa imkan verib. Bu, onilliklər boyu olan cinayətlərin açılmasına kömək etdi. 2006-cı ilə qədər FTB açılmamış cinayətlərdən 136.000 sübut nümunəsi ilə birlikdə 3,2 milyon profil topladı.

Virciniyadakı pizza salonunda qətlə yetirilən qan dəlili 1996-cı ildə bu ştatın DNT məlumat bazasına daxil edilib. Daha sonra, 2004-cü ildə polis ağır silah ittihamı ilə həbs edilmiş bir adamdan DNT-nin yazılması üçün qan nümunəsi verməsini tələb etdi. İki nümunə uyğun gəlirdi. 2006-cı ilin fevralında indi 61 yaşlı Benjamin Richard Johnson 29 yaşlı qətldə ittiham olundu.

DNT verilənlər bazası məxfilik və ədalətlə bağlı sualları qaldırır. Kimin DNT-si daxil edilməlidir? Yalnız məhkum edilmiş cinayətkarlar? hamının? DNT nümunəsi analiz edildikdən sonra onunla nə baş verməlidir? Əgər verilənlər bazasındakı şəxs mükəmməl uyğun gəlirsə, onun oxşar profili paylaşa biləcək qohumları şübhəli olmalıdırmı?

Bu gün DNT profili şübhəli şəxs haqqında heç bir genetik məlumat vermir. Barmaq izi kimi, unikal, lakin mənasız bir xüsusiyyətə diqqət yetirir. Lakin genetik elmin sürətli təkamülü analitiklərin tezliklə DNT-nin göz və dəri rəngi, təxmini boy, xəstəliklərə meyl və etnik mənsubiyyət kimi fiziki xüsusiyyətlərindən nəticə çıxara biləcəkləri ehtimalını artırır. Hətta psixoloji profildən də söhbət gedə bilməz. İnsan qəzəbli və ya zorakı hərəkətlərə meyllidirmi? Bu imkanlar cəmiyyətdən yeni etik suallarla mübarizə aparmağı tələb edəcək, lakin onlar həm də günahkarları ədalətə çatdırmaq üçün elmdən səmərəli istifadə etmək üçün vəd verirlər.

Molekulyar biologiyada kəşflər dalğasına minərək və insan genomunun xəritəsini çıxarmaq üçün hazırlanmış alətləri götürərək, DNT profilinin yaradılması son on ildə sürətlə inkişaf edib. Mexanikləşdirmə DNT analizinin bütün aspektlərini getdikcə avtomatik hala gətirdi. Başlanğıcda saatlar və ya günlər tələb olunan işlər indi bir neçə dəqiqə ərzində edilə bilər. Müstəntiqlər bir anda bir hədəf bölməsini gücləndirmək və təhlil etmək əvəzinə, eyni vaxtda bütün 13 standart sayta baxa bilərlər. Ştrix qrafikləri yaratmaq əvəzinə, onlar lazer detektoruna seqmentləri profilləməyə imkan verir, çünki DNT fraqmentləri dar bir borudan keçir və kompüterlərə məlumatı təhlil etməyə imkan verir. Bir neçə il ərzində polis cinayətin baş verdiyi yerdə əl qurğularından istifadə edərək dəqiqələr ərzində sübutları təhlil edə və profil yarada biləcək. Kompüterləşdirilmiş verilənlər bazasına daxil olmaqla, onlar demək olar ki, dərhal müəyyən bir şəxsi cəlb edə bilərlər.

DNT analizi o qədər güclüdür ki, bu gün barmaq izi təkcə cinayətkarın şəxsiyyətinə dair bir ipucu üzə çıxara bilməz, həm də müstəntiqlərə DNT çıxara, profil yarada və qəti şəkildə günahkarı mismarlamaq üçün istifadə edə biləcək bir neçə soyulmuş dəri hüceyrəsi verə bilər. .

İxtira və Texnologiyaya tez-tez töhfə verən Cek Kelli Barıt: Alchemy, Bombards & Pyrotechnics (Əsas Kitablar, 2005) kitabının müəllifidir.


Müəllif məlumatı

Əlaqələr

Material Ölçmə Laboratoriyası, Milli Standartlar və Texnologiya İnstitutu, Gaithersburg, MD, ABŞ

Justin M. Zook, Nathan D. Olson və Lesley Chapman

Milli İnsan Genomu Tədqiqat İnstitutu, Milli Sağlamlıq İnstitutu, Rockville, MD, ABŞ

Nancy F. Hansen, James C. Mullikin, Sergey Koren və Adam M. Phillippy

Milli Biotexnologiya Məlumat Mərkəzi, Milli Tibb Kitabxanası, Milli Sağlamlıq İnstitutu, Bethesda, MD, ABŞ

Chunlin Xiao və Stephen Sherry

İnsan Genetikası Departamenti, Kaliforniya Universiteti, Los Angeles, Los Angeles, CA, ABŞ

Roche Sequencing Solutions, Belmont, CA, ABŞ

Sayed Mohammad E. Sahraeian

Ontario Xərçəng Araşdırmaları İnstitutu, Toronto, Ontario, Kanada

Charles-Bruneau Xərçəng Mərkəzi, Hematologiya-Onkologiya Bölməsi, CHU Sainte-Justine, Monreal, Kvebek, Kanada

Molekulyar Biologiya İnstitutu, Kaliforniya Universiteti, Los Anceles, Los Anceles CA, ABŞ

Fiziologiya və Biofizika Departamenti, Hesablamalı Biotibb İnstitutu, Weill Cornell Medicine, Nyu-York, NY, ABŞ

Christopher E. Mason, Iman Hajirasouliha və Camir Ricketts

HRH Şahzadəsi Əl-Valid Bin Talal Bin Əbdüləziz Alsaud Hesablama Biotibb İnstitutu, Weill Cornell Medicine, Nyu-York, NY, ABŞ

The World Quant Initiative for Quantitative Prodiction, Weill Cornell Medicine, New York, NY, USA

Feil Ailəsi Beyin və Ağıl Araşdırma İnstitutu, Weill Cornell Medicine, Nyu-York, NY, ABŞ

Bionano Genomics, Inc., San Dieqo, CA, ABŞ

Davies Araşdırma Mərkəzi, Heyvan və Baytarlıq Elmləri Məktəbi, Adelaide Universiteti, Roseworthy, SA, Avstraliya

10× Genomics, Pleasanton, CA, ABŞ

Ian T. Fiddes və Alvaro Martinez Barrio

Harvard və MIT Geniş İnstitutu, Kembric, MA, ABŞ

Google, Mountain View, CA, ABŞ

Kompüter Elmləri Departamenti, Roy G. Perry Mühəndislik Kolleci, Prairie View A&M Universiteti, Prairie View, TX, ABŞ

Genetika və Genomik Elmlər Bölməsi, Sina dağındakı Icahn Tibb Məktəbi, Nyu-York, NY, ABŞ

Oscar L. Rodriguez və Əli Bəşir

BC Xərçəng Genomu Elmləri Mərkəzi, Vankuver, Britaniya Kolumbiyası, Kanada

Biotibbi Genetika, Tibb Fakültəsi, Boston Universiteti Tibb Məktəbi, Boston, MA, ABŞ

Pacific Biosciences, Menlo Park, CA, ABŞ

Bilkent Universiteti, Kompüter Mühəndisliyi Bölümü, Ankara, Türkiyə

Konya Qida və Kənd Təsərrüfatı Universiteti, Kompüter Mühəndisliyi Bölümü, Konya, Türkiyə

Kompüter Elmləri və Biologiya Departamentləri, Con Hopkins Universiteti, Baltimor, MD, ABŞ

Genetika şöbəsi, Harvard Tibb Məktəbi, Boston, MA, ABŞ

Shilpa Garg və George Kilsəsi

Heinrich Heine Universiteti, Tibb Fakültəsi, Düsseldorf, Almaniya

Bioinformatika və hesablama biologiyası şöbəsi, MD Anderson Xərçəng Mərkəzi, Hyuston, TX, ABŞ

Kompüter Elmləri Bölməsi, Rays Universiteti, Hyuston, TX, ABŞ

Bioinformatika R&D, Spiral Genetika, Seattle, WA, ABŞ

Rutgers Xərçəng İnstitutu, Nyu Cersi, Nyu-Brunsvik, NJ, ABŞ

Patologiya şöbəsi, Robert Vud Conson Tibb Məktəbi, Nyu-Brunsvik, NJ, ABŞ

Hesablama Tibb və Bioinformatika Departamenti, Miçiqan Universiteti Tibb Məktəbi, Ann Arbor, MI, ABŞ

Weichen Zhou və Ryan E. Mills

Nabsys 2.0, LLC, Providence, RI, ABŞ

Jay M. Sage, Jennifer R. Davis, Michael D. Kaiser, John S. Oliver və Anthony P. Catalano

Kəmiyyət və Hesablama Biologiyası, Cənubi Kaliforniya Universiteti, Los Anceles, CA, ABŞ

Biologiyada Metrologiya üzrə Birgə Təşəbbüs, SLAC National Accelerator Lab, Stanford Universiteti, Stanford, CA, ABŞ

İnsan Genomu Sıralama Mərkəzi, Baylor Tibb Kolleci, Hyuston, TX, ABŞ

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Töhfələr

J.M.Z. layihə dizaynına, əlyazmaların yazılmasına, SV daxiletmə zənglərinin yaradılmasına və SV zənglərinin inteqrasiyasına töhfə verdi. N.D.O. SV inteqrasiyasına və rəqəmlərə töhfə verdi. L.M.C. benchmark qiymətləndirməsinə töhfə verdi. N.F.H. SV zəng dəstləri, müqayisəli qiymətləndirmə, SV inteqrasiyası və əlyazma redaktəsinə töhfə verdi. J.C.M. SV zəng dəstləri və SV inteqrasiyasına töhfə verdi. C.X. məlumatların idarə edilməsi, SV zəng dəstləri, müqayisəli qiymətləndirmə və əlyazma redaktəsinə töhfə verdi. SS məlumatların idarə edilməsinə və SV zəng dəstlərinə töhfə verdi. S.K. de novo məclislərə töhfə verdi. A.M.P. de novo məclislərə töhfə verdi. P.C.B. əlyazmaların yazılmasına, SV zəng dəstlərinin və etalon qiymətləndirilməsinə töhfə verdi. S.M.E.S. SV daxiletmə zəngləri, etalon qiymətləndirilməsi və əlyazmaların redaktəsi. V.H. SV zəng dəstləri və müqayisəli qiymətləndirməyə töhfə verdi. A.R. SV zəng dəstləri və müqayisəli qiymətləndirməyə töhfə verdi. N.A. etalon qiymətləndirməyə töhfə verdi. C.E.M. layihənin dizaynına, əlyazmaların redaktəsinə və müqayisəli qiymətləndirməyə töhfə verdi. İ.H. layihə dizaynı, əlyazmaların redaktəsi və SV zəng dəstləri. C.R. SV zəng dəstlərinə töhfə verdi. J.L. SV zəng dəstləri və müqayisəli qiymətləndirməyə töhfə verdi. R.T. Tam Genomik məlumatların və formatların təmin edilməsinə və şərhinə töhfə verdi. İ.T.F. SV zəng dəstləri, etalon qiymətləndirmə və de novo yığıncaqlarına töhfə verdi. A.M.B. SV zəng dəstləri, etalon qiymətləndirmə və de novo yığıncaqlarına töhfə verdi. J.W. töhfə verən SV zəng dəstləri. A.C. SV zəng dəstləri və müqayisəli qiymətləndirməyə töhfə verdi. N.G. Aşkenazi üçlüyünün genom birləşməsinə, DISCOVER de novo və əlyazma redaktəsinə töhfə verdi. O.L.R. SV zəng dəstləri və de novo yığıncaqlarına töhfə verdi. A.B. SV zəng dəstləri və de novo yığıncaqlarına töhfə verdi. S.J. de novo məclislərə töhfə verdi. J.J.F. töhfə verən SV zəng dəstləri. A.M.W. SV zəng dəstləri və müqayisəli qiymətləndirməyə töhfə verdi. C.A. töhfə verən SV zəng dəstləri. A.S. töhfə verən SV zəng dəstləri. M.C.S. layihə dizaynı və əlyazma redaktəsinə töhfə verdi. S.G. inteqrativ mərhələli qısa variant zənglərinə töhfə verdi. G.C. inteqrativ mərhələli qısa variant zənglərinə töhfə verdi. T.M. haplotip fazasına töhfə verdi. K.C. töhfə verən SV zəng dəstləri. X.F. töhfə verən SV zəng dəstləri. A.C.E. SV zəng dəstləri, etalon qiymətləndirmələr və SV inteqrasiyasına töhfə verdi. BANKA. SV zəng dəstləri və layihə dizaynına töhfə verdi. W.Z. töhfə verən SV zəng dəstləri. R.E.M. töhfə verən SV zəng dəstləri. J.M.S. məlumatların toplanması, SV zəng dəstləri və benchmark qiymətləndirilməsi. J.R.D. məlumatların toplanması, SV zəng dəstləri və benchmark qiymətləndirilməsi. M.D.K. SV zəng dəstləri, etalon qiymətləndirmə və SV-Verify inkişafına töhfə verdi. J.S.O. SV zəng dəstləri və müqayisəli qiymətləndirməyə töhfə verdi. A.P.C. məlumatların toplanmasına töhfə verdi. N.S. SV inteqrasiyasına töhfə verdi (svviz2 inkişafı). M.J.P.C. töhfə verən SV zəng dəstləri. F.J.S. SV zəng dəstləri, əlyazmaların redaktəsi və SV inteqrasiyası. XANIM. layihə dizaynına və əlyazma yazısına töhfə verdi.

Müəllif


DNT Barmaq İzi Tədqiqatına Diqqət Edin [PDF]

DNT barmaq izi tədqiqatına diqqət 02 Dekabr 2020 Göndərən Kyotaro Nishimura Ltd MƏTN ID 536d1f47 Onlayn PDF Ebook Epub Kitabxanası DNT barmaq izi tədqiqatına diqqət yetirir Marina 2006-cı ildə oxuya bilər. PCR) xüsusi bir DNT nümunəsinin milyonlarla milyardlarla nüsxəsini sürətlə düzəltmək üçün geniş şəkildə istifadə edilən bir üsuldur, elm adamlarına çox kiçik bir DNT nümunəsi götürməyə və ətraflı öyrənmək üçün onu kifayət qədər böyük miqdarda gücləndirməyə imkan verir. PCR 1983-cü ildə Cetus Corporation-da amerikalı biokimyaçı Kary Mullis tərəfindən icad edilmişdir.

DNT Barmaq İzi - Genome.gov

DNT barmaq izi bioloji sübut ilə cinayət təhqiqatında şübhəli şəxs arasında əlaqə yaratmaq üçün istifadə edilən laboratoriya üsuludur. Cinayət yerindən götürülmüş DNT nümunəsi şübhəli şəxsin DNT nümunəsi ilə müqayisə edilir. Əgər iki DNT profili uyğun gəlirsə, o zaman dəlil həmin şübhəlidən gəlib. Kanalıma xoş gəlmisiniz 'Kaushik Biologiya Riyaziyyat Dərsliyi'. Bu video Vahid Genetikasının irsiyyətinin Ch-6 Molekulyar Əsasındandır. Öyrənməyə davam edin. #DNT_Barmaq.

DNT Barmaq İzi - FingerprintZone.com

1985-ci ildə DNT barmaq izinin kəşfindən sonra DNT nümunələrinin müqayisəsi metodologiyasında böyük irəliləyiş əldə edilmişdir. Məhkəmə elmində istifadə olunan DNT Barmaq İzi Metodlarının əsas növləri haqqında daha çox oxumağa davam edin: RFLP, PCR, AmpFLP və STR. DNT barmaq izi tədqiqatına diqqət yetirin 06 dekabr 2020 Göndərən Yasuo Uchida Nəşriyyatı TEXT ID 536d1f47 Onlayn PDF Ebook Epub Library Mikro və minipeyk polimorfizmlərinə əsaslanan multilocus DNT barmaq izi genotipləməsi

Mycobacterium tuberculosis-in DNT ilə Ştat İdentifikasiyası.

Mycobacterium tuberculosis-in DNT-nin barmaq izinin alınmasının güclü epidemioloji vasitə olduğu sübut edilmişdir. Ştama spesifik nümunələr yaratmaq üçün IS6110-un həm sayında, həm də genomik mövqeyində dəyişkənlikdən istifadə edən standartlaşdırılmış bir texnika təklif edirik. Bu texnikanın ümumi istifadəsi nəticələri müxtəlif laboratoriyalar arasında müqayisə etməyə imkan verəcəkdir. 20-ci əsrin sonlarının ən böyük kəşflərindən biri olan DNT barmaq izi məhkəmə-tibbi araşdırmalarda inqilab etdi.Bu icmal cinayətkarları məhkum etməyə, haqsız olaraq təqsirləndirilən şəxsləri bəraət qazandırmağa və cinayət, fəlakət və müharibə qurbanlarının müəyyən edilməsinə kömək edən məhkəmə DNT analizində 30 illik irəliləyişi qısaca təsvir edir. Qısa tandem təkrarlarına (STRs) və nəsillərə əsaslanan cari standart üsullar.

Qarğıdalı Açıqını Ayırmaq üçün DNT Barmaq İzi Metodologiyası.

Qarğıdalı açıq tozlanan sortları ayırd etmək üçün DNT barmaq izi metodologiyası Giriş Toxum relyefi hökumətlərin, donorların və qeyri-hökumət təşkilatlarının (QHT) kiçik fermerlərə quraqlıqdan və digər fəlakətlərdən sağalmalarına kömək edə biləcəyi müdaxilələrdən biridir. Böyük miqdarda açıq tozlanan qarğıdalı sortları (OPVs) əldə edilir. Bundan əlavə, klassik DNT barmaq izində məhdudlaşdırıcı fermentlər nümunələrdən DNT-ni kiçik parçalara ayırır. Daha sonra həzm olunan DNT gel elektroforezi ilə ayrıla bilər və əldə edilən fraqmentlər Southern blot vasitəsilə membrana yapışdırıla bilər. Bundan sonra bu fraqmentlər tərkibində mini peyk olan radio işarəli DNT zondları ilə hibridləşə bilər. DNT barmaq izi tədqiqatına diqqət yetirin, 07 dekabr 2020-ci il Göndərən Irving Wallace Kitabxanası TEXT ID 6361c220 Onlayn PDF Ebook Epub Kitabxanasının DNT barmaq izi dəlilləri üzrə sənədləri adi barmaq izi sübutları ilə DNT barmaq izi sübutları arasındakı fərqi izah edir və cinayət ədliyyəsi ekspertlərinin diqqət mərkəzində olan şeylərə diqqət yetirir.

DNT barmaq izi | Tərif, Nümunələr və Faktlar.

DNT barmaq izi, genetikada, DNT-nin əsas cüt ardıcıllığı daxilində dəyişən elementləri təcrid etmək və müəyyən etmək üsulu. Texnika 1984-cü ildə britaniyalı genetik Alek Ceffreys tərəfindən hazırlanmışdır. Bu məqalədə DNT barmaq izinin tarixi və prosesi haqqında daha çox məlumat əldə edin. DNT Barmaq İzi Tətbiqləri. Daha əvvəl müzakirə edildiyi kimi, barmaq izi texnikası məhkəmə-tibbi testlərdə və atalıq testlərində DNT analizi üçün istifadə olunur. Bu iki sahədən başqa, müxtəlifliyə səbəb olan bir populyasiyada müəyyən bir genin tezliyini təyin etmək üçün də istifadə olunur. Hal-hazırda, DNT barmaq izinin ən populyar üsulu qısa tandem təkrarları və ya qısaca STRsdir. 9-80 baza cütlüyünün təkrar ardıcıllığına malik minipeykləri təhlil edən VNTR-lərdən fərqli olaraq, STR-lər yalnız 2-5 baza cütlüyünün təkrar ardıcıllığına malik olan mikropeyklərdən istifadə edərək, DNT barmaq izi dünyasına “azdır, çox” fəlsəfəsini təqdim edir.


Zehni geriliyi öyrənmək üçün subtelomerik zondların istifadəsi

Bu fəsildə zehni geriliyin (MR) genetik əsaslarına, xüsusən idiopatik MR-də yeni diaqnozların qoyulması üçün subtelomerik zondların istifadəsinə diqqət yetirilir. Telomer bütövlüyünü yoxlamaq üçün istifadə edilən üsullar submikroskopik balanssız translokasiyaları (monosomiyalar və trisomiyalar) və balanslaşdırılmış translokasiyaları mümkün qədər yüksək dəqiqliklə aşkar etmək qabiliyyətinə əsaslanır. Bu fəsil flüoresan in situ hibridləşməyə əsaslanan (FISH-əsaslı) və qeyri-FISH-əsaslı metodların əsas nəzəriyyəsini müzakirə edir. FISH əsaslı üsullar telomerik bölgələrin birbaşa vizuallaşdırılmasına/görüntülənməsinə imkan verir (flüoresan mikroskopiya və ya görüntüləmə vasitəsilə). FISH-ə əsaslanmayan metodologiyalar balanslaşdırılmış translokasiyaları aşkar edə bilməz və FISH tərəfindən təsdiqlənməni tələb edir, lakin balanssız yenidən təşkillər üçün yoxlama alətləri kimi effektiv və dəyərli olduğunu sübut etmişdir. Fəsildə məhdudiyyətlər, tələlər və hər bir metodologiya üçün məlumatların yanlış təfsirinə aid məsələlər ümumiləşdirilir. Üstünlükləri və mənfi cəhətləri də müzakirə olunur. Bu fəsil MR subtelomerik tədqiqatlarının icmalı və subtelomerik testin klinik diaqnostika laboratoriyalarında, xüsusən izah olunmayan MR-nin diaqnostikasında, həm də klinik təbabətin digər sahələrində necə geniş istifadə edilən vasitəyə çevrilməsi ilə yekunlaşır.


5. Nəticələr

Nimav-1_LVa kimi təyin edilmiş 279 Kb bitişik konsensus ardıcıllığı ağayaqlı krevet Penaeus vannamei cinsi Kehai No. 1-in genom ardıcıllığından uğurla rekonstruksiya edilmişdir. Konsensus, ehtimala görə, genrimaşda endogenləşdirilmiş nimavirusun tam genomunu təmsil edirdi. 117 zülal genindən Nimav-1_LVa host-patogen qarşılıqlı əlaqədə iştirak edən onlarla geni kodlaşdırdı, baxmayaraq ki, bəziləri ev sahibi genlər idi. Məlumatlar, Nimav-1_LVa virusunun ev sahibi ilə uzunmüddətli və ya xeyirxah bir əlaqəni hədəfləyən WSSV-dən fərqli bir strategiya seçə biləcəyini təklif etdi. Nimav-1_LVa genomu Nimaviridae virus ailəsində təkamülün daha yaxşı başa düşülməsini asanlaşdıra bilər və həmçinin karides yetişdirilməsi, əkilmiş karideslərin izlənilməsi, WSSV diaqnozu və WSD [26,87] müalicəsində tətbiq oluna bilər.



Şərhlər:

  1. Bramuro

    Həqiqətən çox yüksəkdir!

  2. Goltigrel

    I completely agree

  3. Cary

    Nə uyğun sözlər... əla, parlaq fikirdir

  4. Eri

    Çox dəyərli ifadədir



Mesaj yazmaq