Məlumat

4.2: Lipidlər - Biologiya

4.2: Lipidlər - Biologiya


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Lipidlər yağlar, yağlar, mumlar, fosfolipidlər və steroidlər kimi molekulları ehtiva edən müxtəlif hidrofobik birləşmələr qrupudur. Əksər lipidlər öz karbohidrogenləri, çoxlu qeyri-polar karbon-karbon və ya karbon-hidrogen bağlarını ehtiva edən molekullardır. Qeyri-qütblü funksional qrupların bolluğu lipidlərə bir dərəcədə hidrofobik (“sudan qorxan”) xarakter verir və əksər lipidlərin suda aşağı həlli olur. Fiziki xüsusiyyətlərindən asılı olaraq (kimyəvi quruluşu ilə kodlanır) lipidlər bioloji sistemlərdə enerji saxlama, izolyasiya, maneə əmələ gəlməsi, hüceyrə siqnalı daxil olmaqla bir çox funksiyaya xidmət edə bilər. Lipid molekullarının müxtəlifliyi və onların bioloji fəaliyyət spektri biologiyanın yeni tələbələrinin əksəriyyəti üçün bəlkə də təəccüblü dərəcədə böyükdür. Bu biomolekullar sinfi haqqında əsas anlayışı inkişaf etdirməklə başlayaq.

Yağlar və yağlar

Ümumi bir yağ molekulu və ya trigliserid. Bu tip molekullar ümumiyyətlə hidrofobikdir və çoxsaylı funksiyaları olsa da, yəqin ki, ən yaxşı bədən yağlarında və bitki yağlarında rolları ilə tanınırlar. İki növ molekulyar komponentdən - qütb "baş" qrupu və qeyri-qütblü "quyruq" qrupundan əldə edilən trigliserid molekulu. "Baş" qrupu a trigliserid tək qliserin molekulundan əldə edilir. Karbohidrat olan qliserin üç karbon, beş hidrogen və üç hidroksil (-OH) funksional qrupundan ibarətdir. Qeyri-qütblü yağ turşusu "quyruq" qrupu üç karbohidrogendən (CH-H bağlarından ibarət funksional qrup) ibarətdir ki, onlar da qütb karboksil funksional qrupuna malikdirlər (buna görə də "yağ turşusu" termini - karboksil qrupu bioloji cəhətdən ən uyğun pH-da turşudur). Yağ turşusunda karbonların sayı 4-36 arasında dəyişə bilər; ən çox 12-18 karbon ehtiva edənlərdir.

Şəkil 1. Triasilgliserol üç yağ turşusunun qliserin onurğasına birləşərək susuzlaşdırma reaksiyasında əmələ gəlir. Proses zamanı üç molekul su ayrılır. Atribut: Marc T. Facciotti (öz işi)

Qeyd: mümkün müzakirə

Yuxarıda göstərilən trigliseridlərin modelləri təsvir edilmişdir qohum atomların molekuldakı yerləri. Əgər Google-da trigliseridlərin şəkillərini axtarsanız, yuxarıda təsvir edilənlərdən fərqli mövqelərdə fosfolipid quyruqlarını göstərən bəzi modellər tapa bilərsiniz. İntuisiyanızdan istifadə edərək, hansı modelin real həyatın daha düzgün təsviri olduğunu düşündüyünüz barədə fikir bildirin. Niyə?

Şəkil 2. Stearin turşusu ümumi doymuş yağ turşusudur; oleik turşusu və linolenik turşusu ümumi doymamış yağ turşularıdır. Facciotti (öz işi)

Qeyd: mümkün müzakirə

Kərə yağı, kanola yağı və s. kimi təbii yağlar əsasən trigliseridlərdən ibarətdir. Bu müxtəlif yağların fiziki xüsusiyyətləri iki amildən asılı olaraq dəyişir:

  1. Karbohidrogen zəncirlərindəki karbonların sayı;
  2. Karbohidrogen zəncirlərində desaturasiyaların və ya ikiqat bağların sayı.

Birinci amil bu molekulların bir-biri ilə və su ilə qarşılıqlı əlaqəsinə, ikinci amil isə onların formasına kəskin şəkildə təsir edir. İkiqat istiqrazın tətbiqi Şəkil 3-də bir qədər şişirdilmiş şəkildə təsvir edilmiş, əksinə nisbətən "düz" karbohidrogendə "kıvrılmaya" səbəb olur.

Bu qısa təsvirdən başa düşdüyünüzə əsaslanaraq, bitki yağı maye olduğu halda, otaq temperaturunda kərə yağının niyə bərk olduğunu izah etmək üçün əsaslandırma təklif edin - öz sözlərinizlə.

Sualın həllində sizə kömək edə biləcək vacib bir məlumat: kərə yağının trigliseridlərində bitki yağı ilə müqayisədə daha uzun və doymuş karbohidrogenlər var.

Şəkil 3. Düz doymuş yağ turşusu "əyilmiş"/"bükülmüş" doymamış yağ turşusuna qarşı. Facciotti (öz işi)

Sterollar

Steroidlər əridilmiş halqa quruluşuna malik lipidlərdir. Onlar burada müzakirə edilən digər lipidlərə bənzəməsələr də, lipidlər kimi təyin olunurlar, çünki onlar da əsasən karbon və hidrogenlərdən ibarətdir, hidrofobikdirlər və suda həll olunmurlar. Bütün steroidlərdə dörd əlaqəli karbon halqası var. Bir çox steroid də onları sterolların spirt təsnifatına daxil edən -OH funksional qrupuna malikdir. Xolesterol kimi bir neçə steroidin qısa quyruğu var. Xolesterol ən çox yayılmış steroiddir. Əsasən qaraciyərdə sintez olunur və testosteron kimi bir çox steroid hormonun xəbərçisidir. O, həmçinin vitamin D və öd duzlarının sələfidir emulsifikasiya yağların və onların hüceyrələr tərəfindən sonradan udulması. Xolesteroldan tez-tez mənfi mənada danışılsa da, bir çox heyvan hüceyrəsinin düzgün işləməsi üçün, xüsusən də membranın quruluşunu, təşkilini və axıcılığını modulyasiya etdiyi bilinən plazma membranının bir komponenti rolunda lazımdır.

Şəkil 4. Xolesterol heyvan hüceyrələri tərəfindən sintez edilən və hüceyrə membranlarının əsas struktur elementi olan dəyişdirilmiş lipid molekuludur. Kortizol tez-tez stresə cavab olaraq salınan bir hormondur (siqnal molekuludur). Facciotti (öz işi)

Qeyd: mümkün müzakirə

Yuxarıdakı kortizol molekulunda molekulun hansı hissələrini funksional qruplar kimi təsnif edərdiniz? Funksional qrupa nələrin daxil edilməli və nəyin daxil edilməməsi ilə bağlı fikir ayrılığı varmı?

Fosfolipidlər

Fosfolipidlər hüceyrə membranının əsas tərkib hissəsi, hüceyrələrin ən xarici təbəqəsidir. Yağlar kimi, onlar da qliserin molekuluna bağlı yağ turşusu zəncirlərindən ibarətdir. Triasilgliserollardan fərqli olaraq, fosfolipidlərin iki yağ turşusu quyruğu və şəkərə bağlı bir fosfat qrupu var. Buna görə də fosfolipidlər var amfipatik molekullar, yəni onların hidrofobik hissəsi və hidrofilik hissəsi var. Qliseroldan uzanan iki yağ turşusu zənciri hidrofobikdir və su ilə qarşılıqlı əlaqədə ola bilməz, fosfat tərkibli baş qrupu isə hidrofilikdir və su ilə qarşılıqlı əlaqədədir. Aşağıdakı fosfolipiddə fosfolipidin hər bir hissəsinə öz xüsusiyyətlərini verən funksional qrupları müəyyən edə bilərsinizmi?

Qeyd

Şəkil 5-də fosfat qrupunun oksigen atomlarından birinə bağlı R qrupuna malik olduğunu qeyd etməyinizə əmin olun. R bu tip diaqramlarda başqa bir atom və ya molekulun həmin mövqedə bağlı olduğunu göstərmək üçün geniş istifadə olunan dəyişəndir. Molekulun bu hissəsi müxtəlif fosfolipidlərdə fərqli ola bilər və bütün molekula fərqli kimya verəcəkdir. Hal-hazırda, siz ümumi əsas elementlər - qliserin onurğası, fosfat qrupu və iki karbohidrogen quyruğu sayəsində bu tip molekulu (R qrupunun nə olmasından asılı olmayaraq) tanımaq üçün məsuliyyət daşıyırsınız.

Şəkil 5. Fosfolipid iki yağ turşusu və qliserin onurğasına bağlanmış dəyişdirilmiş fosfat qrupu olan bir molekuldur. Fosfat yüklü və ya polar kimyəvi qrupların əlavə edilməsi ilə dəyişdirilə bilər. Bir neçə kimyəvi R qrupları fosfatı dəyişdirə bilər. Kolin, serin və etanolamin burada göstərilir. Bunlar hidroksil qrupları vasitəsilə R ilə işarələnmiş mövqedə fosfat qrupuna bağlanır.
Atribut: Marc T. Facciotti (öz işi)

Suyun varlığında bəzi fosfolipidlər kortəbii olaraq misel şəklində düzülür (Şəkil 6). Lipidlər elə düzüləcək ki, onların qütb qrupları miselin xarici tərəfində, qeyri-qütblü quyruqları isə daxili tərəfdə olacaq. Digər şərtlərdə lipid ikiqatlı da əmələ gələ bilər. Cəmi bir neçə nanometr qalınlığında olan bu quruluş fosfolipidlərin iki əks təbəqəsindən ibarətdir ki, bütün hidrofobik quyruqlar ikiqatlı təbəqənin mərkəzində üz-üzə düzülür və hidrofilik baş qrupları ilə əhatə olunur. Bir fosfolipid billayeri əksər hüceyrə membranlarının əsas strukturu kimi əmələ gəlir və plazma membranının dinamik təbiətindən məsuldur.

Şəkil 6. Suyun varlığında bəzi fosfolipidlər kortəbii olaraq misel şəklində təşkil olunacaqlar. Mənbə: Erin Easlon tərəfindən hazırlanmışdır (öz işi)

Qeyd: mümkün müzakirə

Yuxarıda qeyd edildiyi kimi, bəzi təmiz fosfolipidləri götürüb onları suya atsanız, fosfolipidlərin bir hissəsi özbaşına misellərə çevrilər. Bu, Enerji Hekayəsi ilə təsvir edilə bilən bir proses kimi səslənir.

Enerji Hekayəsi rubrikasına qayıdın və bu proses üçün Enerji Hekayəsi yaratmağa çalışın — gözləyirəm ki, enerjinin təsviri ilə bağlı addımlar bu nöqtədə çətin ola bilər (buna daha sonra qayıdacayıq), lakin siz bunu bacarmalısınız. ən azı ilk üç addımı yerinə yetirin. Optimallaşdırılmış hekayə yaratmaq üçün bir-birinizin işini konstruktiv şəkildə tənqid edə bilərsiniz.

Fosfolipid membranı sonrakı modulda ətraflı müzakirə olunur. Hüceyrə membranının funksiyasını başa düşmək üçün fosfolipiddəki funksional qruplarla əlaqəli kimyəvi xassələri xatırlamaq vacib olacaqdır.


Lipid

Redaktorlarımız təqdim etdiyinizi nəzərdən keçirəcək və məqaləyə yenidən baxılıb-bağlanmayacağını müəyyənləşdirəcək.

Lipid, piylər, yağlar, hormonlar və su ilə əhəmiyyətli dərəcədə qarşılıqlı əlaqədə olmadığı üçün birlikdə qruplaşdırılmış membranların müəyyən komponentləri daxil olmaqla müxtəlif üzvi birləşmələr qrupundan hər hansı biri. Lipidlərin bir növü, trigliseridlər, orqanizmlər üçün enerji anbarı kimi xidmət edən və həmçinin istilik izolyasiyasını təmin edən yağ hüceyrələrində yağ kimi saxlanılır. Steroid hormonlar kimi bəzi lipidlər hüceyrələr, toxumalar və orqanlar arasında kimyəvi xəbərçi kimi xidmət edir, digərləri isə tək bir hüceyrə daxilində biokimyəvi sistemlər arasında siqnallar ötürür. Hüceyrələrin və orqanoidlərin membranları (hüceyrələrdəki strukturlar) iki qat fosfolipid molekullarından əmələ gələn mikroskopik olaraq nazik strukturlardır. Membranlar ayrı-ayrı hüceyrələri ətraf mühitdən ayırmaq və hüceyrənin daxili hissəsini xüsusi funksiyaları yerinə yetirən strukturlara bölmək funksiyasını yerinə yetirir. Bu bölmə funksiyası o qədər vacibdir ki, membranlar və onları əmələ gətirən lipidlər həyatın özü üçün vacib olmalıdır.

Lipid nədir?

Lipid suda həll olunmayan müxtəlif üzvi birləşmələrdən hər hansı biridir. Bunlara yağlar, mumlar, yağlar, hormonlar və membranların müəyyən komponentləri daxildir və enerji saxlama molekulları və kimyəvi xəbərçilər kimi fəaliyyət göstərir. Zülallar və karbohidratlarla birlikdə lipidlər canlı hüceyrələrin əsas struktur komponentlərindən biridir.

Lipidlər niyə vacibdir?

Lipidlər müxtəlif birləşmələr qrupudur və bir çox müxtəlif funksiyaları yerinə yetirir. Hüceyrə səviyyəsində fosfolipidlər və xolesterin hüceyrəni ətraf mühitdən ayıran membranların əsas komponentlərindəndir. Lipid mənşəli hormonlar, steroid hormonlar kimi tanınan, əhəmiyyətli kimyəvi xəbərçilərdir və testosteron və estrogenləri ehtiva edir. Orqanizm səviyyəsində yağ hüceyrələrində saxlanılan trigliseridlər enerji saxlama anbarı kimi xidmət edir və həmçinin istilik izolyasiyasını təmin edir.

Lipid salları nədir?

Lipid salları yüksək konsentrasiyalarda xolesterol və qlikosfinqolipidləri ehtiva edən hüceyrə membranının mümkün sahələridir. Lipid salların mövcudluğu qəti şəkildə müəyyən edilməmişdir, baxmayaraq ki, bir çox tədqiqatçılar belə salların həqiqətən mövcud olduğundan və membranın axıcılığında, hüceyrədən hüceyrəyə əlaqədə və virusların yoluxmasında rol oynaya biləcəyindən şübhələnirlər.

Su bioloji mühitdir - həyatı mümkün edən maddədir və canlı hüceyrələrin demək olar ki, bütün molekulyar komponentləri, istər heyvanlarda, bitkilərdə və ya mikroorqanizmlərdə olsun, suda həll olunur. Zülallar, nuklein turşuları və karbohidratlar kimi molekullar suya yaxındır və hidrofilik (“su sevən”) adlanır. Lipidlər isə hidrofobikdir (“sudan qorxan”). Bəzi lipidlər amfipatikdir - onların strukturunun bir hissəsi hidrofilikdir, digər hissəsi, adətən daha böyük bir hissəsi hidrofobikdir. Amfipatik lipidlər suda özünəməxsus davranış nümayiş etdirirlər: onlar kortəbii qaydada nizamlı molekulyar aqreqatlar əmələ gətirirlər, hidrofilik ucları xaricdə su ilə təmasda olur, hidrofobik hissələri isə sudan qorunur. Bu xüsusiyyət onların hüceyrə və orqanoid membranlarının əsas komponentləri kimi rolunun açarıdır.

Bioloji lipidlər böyük makromolekulyar polimerlər olmasa da (məsələn, zülallar, nuklein turşuları və polisaxaridlər), bir çoxları bir neçə kiçik tərkib molekulunun kimyəvi birləşməsindən əmələ gəlir. Bu molekulyar tikinti bloklarının çoxu quruluşca oxşar və ya homologdur. Homologiyalar lipidləri bir neçə əsas qrupa təsnif etməyə imkan verir: yağ turşuları, yağ turşusu törəmələri, xolesterol və onun törəmələri və lipoproteinlər. Bu məqalə əsas qrupları əhatə edir və bu molekulların enerji saxlama molekulları, kimyəvi xəbərçilər və hüceyrələrin struktur komponentləri kimi necə fəaliyyət göstərdiyini izah edir.


Lipiddə həll olunan vitaminlər

Yağda həll olunan vitaminlər yağ toxumasında və qaraciyərdə saxlanılır. Bədəndən suda həll olunan vitaminlərdən daha yavaş xaric olurlar. Yağda həll olunan vitaminlərə A, D, E və K vitaminləri daxildir. Vitamin A görmə, həmçinin dəri, diş və sümük sağlamlığı üçün vacibdir. D vitamini kalsium və dəmir də daxil olmaqla digər qida maddələrinin udulmasına kömək edir. E vitamini antioksidant rolunu oynayır və həmçinin immunitet funksiyasına kömək edir. K vitamini qan laxtalanması prosesinə kömək edir və sümükləri möhkəm saxlayır.


Mumlar

Şəkil 7. Bəzi yarpaqlardakı mumlu örtüklər lipidlərdən ibarətdir. (Kredit: Roger Griffith)

mum bəzi su quşlarının tüklərini və bəzi bitkilərin yarpaq səthlərini əhatə edir. Mumların hidrofobik olması səbəbindən suyun səthə yapışmasının qarşısını alır (Şəkil 7). Mumlar uzun zəncirli spirtlərə esterləşmiş uzun yağ turşusu zəncirlərindən ibarətdir.


4.2: Lipidlər - Biologiya

Lipidlər üzvi molekulların dörd əsas qrupundan biridir, digər üçü zülallar, nuklein turşuları (DNT) və karbohidratlar (şəkərlər). Lipidlər karbohidratlarla eyni elementlərdən ibarətdir: karbon, hidrogen və oksigen. Bununla belə, lipidlər oksigen atomlarından daha çox hidrogen atomunu ehtiva edirlər.

Lipidlərə yağlar, steroidlər, fosfolipidlər və mumlar daxildir. Lipidlərin əsas xüsusiyyətlərindən biri suda həll olmamalarıdır.

Lipidlər canlı orqanizmlərdə mühüm rol oynayır. Onların əsas funksiyalarından bəzilərinə enerji saxlama, hormonlar və hüceyrə membranları daxildir.

  • Doymuş yağlar - Doymuş yağlar otaq temperaturunda bərk maddələrdir. Bu yağlar qırmızı ət, pendir və yağ kimi qidalardan gəlir. Doymuş yağlar bəzən "pis" yağlar adlanır, çünki onların yüksək xolesterola səbəb olduğu, damarları tıxandığı və hətta bəzi xərçəng növlərinin riskini artırdığı bilinir.
  • Doymamış yağlar - Doymamış yağlar otaq temperaturunda mayelərdir. Bu yağlar qoz-fındıq, tərəvəz və balıq kimi qidalardan gəlir. Doymamış yağlar sizin üçün doymuş yağlardan daha yaxşı hesab olunur və bəzən "yaxşı" yağlar adlanır.

Mumlar kimyəvi tərkibinə görə yağlara bənzəyir, lakin onların yalnız bir uzun yağ turşusu zənciri var. Mumlar otaq temperaturunda yumşaq və plastikdir. Onlar heyvanlar və bitkilər tərəfindən istehsal olunur və adətən qorunmaq üçün istifadə olunur. Bitkilər su itkisinin qarşısını almaq üçün mumlardan istifadə edirlər. İnsanların qulaq pərdələrini qorumaq üçün qulaqlarımızda mum var.

Steroidlər lipidlərin başqa bir əsas qrupudur. Steroidlərə xolesterin, xlorofil və hormonlar daxildir. Bədənimiz testosteron (kişi hormonları) və estrogen (qadın hormonları) hormonlarını istehsal etmək üçün xolesteroldan istifadə edir. Xlorofil bitkilər tərəfindən fotosintez üçün işığı udmaq üçün istifadə olunur.

Steroidlər sizin üçün pisdirmi?

Bütün steroidlər pis deyil. Bədənimiz yaşamaq üçün xolesterol və kortizol kimi steroidlərə ehtiyac duyur, buna görə də bəzi steroidlər bizim üçün faydalıdır. Həkimlərin xəstə insanlara kömək etmək üçün istifadə etdiyi bir çox steroid də var.

Bununla belə, idmanda eşitdiyiniz steroid növü, anabolik steroidlər sizin üçün çox pis ola bilər. Vücudunuza hər cür zərər verə bilər, o cümlədən vuruşlar, böyrək çatışmazlığı, qan laxtalanması və qaraciyərin zədələnməsi.

Fosfolipidlər lipidlərin dördüncü əsas qrupunu təşkil edir. Onlar kimyəvi tərkibinə görə yağlara çox bənzəyirlər. Fosfolipidlər bütün hüceyrə membranlarının əsas struktur komponentlərindən biridir.


Hüceyrə funksiyalarını anlamaq üçün kimyəvi və sintetik biologiya yanaşmaları - C hissəsi

Marcus J.C. Long,. Yimon Aye, Enzimologiyada Metodlar, 2020

2.2 Kvazi-endogen, uzun müddətli məruz qalma: Endojen RES-biosintezin simulyasiyası

Marnett laboratoriyasının son yeniliyi hüceyrələrin lipiddən əldə edilən elektrofillərin xəbərçisi olan linoleik turşu (LA) ilə qidalanması üzərində qurulub (Beavers et al., 2017). Sonra LA terminal alkin ilə dəyişdirildi, hüceyrələr 24 saat ərzində mikromolyar konsentrasiyalarda LA(alkin) ilə stimullaşdırıldı, ardınca saxarolipid qlikan, Kdo2-lipid A, daha 24 saat (Şəkil 1 C). SILAC-əsaslı proteomika analizi ilə birlikdə qeyri-alkin-funksionallaşdırılmış-LA-dan istifadə edilən paralel sınaq kəmiyyət hədəf identifikatoruna imkan verir. Bu yanaşmadan istifadə edərək 3816 ümumi zülaldan 3300 zülal HNE həssas olduğu müəyyən edildi. Məlumat çıxışları, Wang laboratoriyası tərəfindən bildirilmiş (Chen et al., 2018) tərəfindən bildirilən birbaşa tutma üsulları ilə əldə edilənlərə bənzəyir (HNEylated zülalların adətən Michael adduksiyasından sonra reaktiv aldehid ehtiva etməsi əsasında işləyir). Hər iki üsul üç qaçışda əldə edilən məlumat dəstləri arasında əhəmiyyətli dəyişikliklər gördü. Bu məlumatlardan bir nəticə, mitoxondrial zülalların bu şərtlər altında ən reaktiv olması idi. Bununla belə, bu orqanel spesifikliyinin nə qədər lokallaşdırılmış stress yaranması və ya gizli hissetmə qabiliyyəti ilə bağlı olduğu bilinmir.


Zülallar

Nuklein turşuları hüceyrənin genetik məlumatını daşıyarkən, zülalların əsas vəzifəsi bu məlumatın verdiyi vəzifələri yerinə yetirməkdir. Zülallar bütün makromolekullar arasında ən müxtəlifdir və hər bir hüceyrədə müxtəlif funksiyaları yerinə yetirən bir neçə min müxtəlif zülal var. Zülalların rollarına hüceyrə və toxumaların struktur komponentləri kimi xidmət etmək, kiçik molekulların daşınmasında və saxlanmasında (məsələn, hemoglobin vasitəsilə oksigenin daşınmasında) fəaliyyət göstərmək, hüceyrələr arasında məlumat ötürmək (məsələn, protein hormonları) və infeksiya (məsələn, antikorlar). Zülalların ən əsas xüsusiyyəti isə, sonrakı hissədə müzakirə edildiyi kimi, bioloji sistemlərdə demək olar ki, bütün kimyəvi reaksiyaları kataliz edən fermentlər kimi fəaliyyət göstərmək qabiliyyətidir. Beləliklə, zülallar hüceyrənin faktiki olaraq bütün fəaliyyətlərini istiqamətləndirir. Bioloji kimyada zülalların mərkəzi əhəmiyyəti yunan sözündən götürülən adları ilə göstərilir zülallar, “of birinci dərəcə deməkdir.”

Zülallar 20 müxtəlif amin turşusunun polimerləridir. Hər bir amin turşusu bir karboksil qrupuna (COO - ), bir amin qrupuna (NH) bağlanmış bir karbon atomundan ("karbon adlanır") ibarətdir.3 + ), hidrogen atomu və fərqli yan zəncir (Şəkil 2.13). Müxtəlif amin turşusu yan zəncirlərinin spesifik kimyəvi xassələri hər bir amin turşusunun zülal strukturunda və funksiyasındakı rollarını müəyyənləşdirir.

Şəkil 2.13

Amin turşularının quruluşu. Hər bir amin turşusu bir hidrogen atomu, bir karboksil qrupu, bir amin qrupu və xüsusi bir yan zəncirdən (R ilə işarələnmiş) bağlanmış mərkəzi karbon atomundan (≈x003b1 karbon) ibarətdir. Fizioloji pH-da həm karboksil, həm də amin (daha çox)

Amin turşuları yan zəncirlərinin xüsusiyyətlərinə görə dörd geniş kateqoriyaya qruplaşdırıla bilər (Şəkil 2.14). On amin turşusu su ilə qarşılıqlı təsir göstərməyən qeyri-polyar yan zəncirlərə malikdir. Glisin ən sadə amin turşusudur, yan zənciri yalnız bir hidrogen atomundan ibarətdir. Alanin, valin, lösin və izolösin dördə qədər karbon atomundan ibarət karbohidrogen yan zəncirlərinə malikdir. Bu amin turşularının yan zəncirləri hidrofobikdir və buna görə də su ilə təmasda olmayan zülalların daxili hissəsində yerləşməyə meyllidirlər. Prolin də eyni şəkildə karbohidrogen yan zəncirinə malikdir, lakin onun unikallığı ondan ibarətdir ki, onun yan zənciri amin qrupunun azotu ilə, eləcə də α karbonla birləşərək siklik bir quruluş yaradır. İki amin turşusunun, sistein və metioninin yan zəncirlərində kükürd atomları var. Metionin olduqca hidrofobikdir, lakin sistein sulfhidril (SH) qrupuna görə daha azdır. Daha sonra müzakirə edildiyi kimi, sisteinin sulfhidril qrupu zülal strukturunda mühüm rol oynayır, çünki müxtəlif sistein qalıqlarının yan zəncirləri arasında disulfid bağları yarana bilər. Nəhayət, iki qeyri-polyar amin turşusu, fenilalanin və triptofan, çox hidrofobik aromatik halqaları ehtiva edən yan zəncirlərə malikdir.

Şəkil 2.14

Amin turşuları. Hər bir amin turşusu üçün üç hərfli və bir hərfli abbreviatura göstərilir. Amin turşuları yan zəncirlərinin xüsusiyyətlərinə görə dörd kateqoriyaya bölünür: qeyri-polar, qütb, əsas və turşu.

Beş amin turşusu yüksüz, lakin qütb yan zəncirlərinə malikdir. Bunlara yan zəncirlərində hidroksil qrupları olan serin, treonin və tirozin, həmçinin qütb amidi (O=C—NH) olan asparagin və glutamin daxildir.2) qrupları. Bu amin turşularının qütb yan zəncirləri su ilə hidrogen bağları yarada bildiyi üçün bu amin turşuları hidrofilikdir və zülalların kənarında yerləşməyə meyllidirlər.

Lizin, arginin və histidin amin turşuları yüklü əsas qrupları olan yan zəncirlərə malikdir. Lizin və arginin çox əsas amin turşularıdır və onların yan zəncirləri hüceyrədə müsbət yüklüdür. Nəticədə, onlar çox hidrofilikdirlər və zülalların səthində su ilə təmasda olurlar. Histidin fizioloji pH-da yüksüz və ya müsbət yüklü ola bilər, buna görə də aşağıdakı bölmədə müzakirə olunan fermentativ kataliz nümunəsində göstərildiyi kimi, hidrogen ionlarının mübadiləsini əhatə edən fermentativ reaksiyalarda tez-tez aktiv rol oynayır.

Nəhayət, iki amin turşusu, aspartik turşu və glutamik turşu, karboksil qruplarında bitən turşu yan zəncirlərinə malikdir. Bu amin turşuları hüceyrə daxilində mənfi yüklüdür və buna görə də tez-tez aspartat və qlutamat adlanır. Əsas amin turşuları kimi, bu turşu amin turşuları da çox hidrofilikdir və adətən zülalların səthində yerləşir.

Amin turşuları bir amin turşusunun 'x003b1 amin qrupu ilə ikincinin 'x003b1 karboksil qrupu arasında peptid bağları ilə birləşir (Şəkil 2.15). Polipeptidlər amin turşularının xətti zəncirləridir, uzunluğu adətən yüzlərlə və ya minlərlə amin turşusudur. Hər bir polipeptid zəncirinin iki fərqli ucu var, biri α amin qrupunda (amino və ya N, son), digəri isə α karboksil qrupunda (karboksi və ya C, son) sonlanır. Polipeptidlər amindən karboksi sonuna qədər sintez olunur və polipeptiddəki amin turşularının ardıcıllığı (konvensiya ilə) eyni ardıcıllıqla yazılır.

Şəkil 2.15

Peptid bağının formalaşması. Bir amin turşusunun karboksil qrupu ikincinin amin qrupuna bağlıdır.

Zülalların müəyyənedici xüsusiyyəti onların spesifik amin turşusu ardıcıllığına malik polipeptidlər olmasıdır. 1953-cü ildə Frederik Sanqer ilk dəfə bir zülalın, hormon insulinin tam amin turşusu ardıcıllığını təyin etdi. İnsulinin sistein qalıqları arasında disulfid bağları ilə birləşən iki polipeptid zəncirindən ibarət olduğu aşkar edilmişdir (Şəkil 2.16). Ən əsası, Sangerin təcrübəsi hər zülalın müəyyən bir amin turşusu ardıcıllığından ibarət olduğunu ortaya qoydu. Hal-hazırda zülallar avtomatlaşdırılmış üsullardan istifadə etməklə ardıcıllıqla sıralanır və 100.000-dən çox zülalın tam amin turşusu ardıcıllığı artıq məlumdur. Hər biri bir gendəki nukleotidlərin sırası ilə təyin olunan unikal amin turşuları ardıcıllığından ibarətdir (3-cü Fəsilə baxın).

Şəkil 2.16

İnsulinin amin turşusu ardıcıllığı. İnsulin iki polipeptid zəncirindən ibarətdir, biri 21, digəri isə 30 amin turşusudur (burada onların bir hərfli kodları ilə göstərilir). Üç cüt sistein qalığının yan zəncirləri disulfid bağları ilə birləşir, ikisi (daha çox).

Zülalın amin turşusu ardıcıllığı onun strukturunun yalnız ilk elementidir. Zülallar amin turşularının uzadılmış zəncirləri olmaq əvəzinə, funksiyaları üçün kritik olan fərqli üçölçülü konformasiyaları qəbul edirlər. Zülalların bu üçölçülü konformasiyaları onların tərkib hissəsi olan amin turşuları arasındakı qarşılıqlı təsirlərin nəticəsidir, buna görə də zülalların formaları onların amin turşusu ardıcıllığı ilə müəyyən edilir. Bu, ilk dəfə Kristian Anfinsenin zülalların üçölçülü strukturlarını denaturasiya adlanan qeyri-kovalent bağları qıran istilik kimi müalicələrlə pozduğu təcrübələri ilə nümayiş etdirildi (Şəkil 2.17). Daha yumşaq şəraitdə inkubasiyadan sonra belə denatürasiya olunmuş zülallar tez-tez kortəbii olaraq öz yerli konformasiyalarına qayıdırdılar və bu, bu konformasiyaların birbaşa amin turşusu ardıcıllığı ilə təyin olunduğunu göstərir.

Şəkil 2.17

Protein denatürasiyası və yenidən qatlanması. Ribonukleaza (RNase) 124 amin turşusundan ibarət zülaldır (rəqəmlərlə göstərilir). Zülal normal olaraq dörd disulfid bağını ehtiva edən yerli konformasiyasına bükülür (daha çox. )

Zülalların üçölçülü quruluşu ən çox molekulda ayrı-ayrı atomların düzülməsini təyin edə bilən yüksək ayırdetmə üsulu olan rentgen kristaloqrafiyası ilə təhlil edilir. X-şüalarının şüası analiz ediləcək zülalın kristallarına yönəldilir və zülal kristalından keçən rentgen şüalarının nümunəsi rentgen filmində aşkar edilir. X-şüaları kristala dəydikdə, onlar molekuldakı atomların düzülüşü ilə müəyyən edilən xarakterik nümunələrdə səpələnirlər. Buna görə də molekulun quruluşunu səpələnmiş rentgen şüalarının nümunəsindən (difraksiya nümunəsi) çıxarmaq olar.

1958-ci ildə Con Kendrew 153 amin turşusundan ibarət nisbətən sadə zülal olan mioqlobinin üçölçülü quruluşunu ilk dəfə təyin etdi (Şəkil 2.18). O vaxtdan bəri bir neçə min zülalın üçölçülü strukturları təhlil edilmişdir. Əksəriyyəti, miyoqlobin kimi, kompakt strukturlara bükülmüş polipeptid zəncirləri olan qlobal zülallardır, baxmayaraq ki, bəziləri (məsələn, birləşdirici toxumaların struktur zülalları) uzun lifli molekullardır. Bu zülalların üçölçülü strukturlarının təhlili zülalların qatlanmasını idarə edən bir neçə əsas prinsipi ortaya qoydu, baxmayaraq ki, zülal strukturu o qədər mürəkkəbdir ki, zülalın üçölçülü strukturunu birbaşa onun amin turşusu ardıcıllığından proqnozlaşdırmaq mümkün deyil.

Şəkil 2.18

Mioqlobinin üçölçülü quruluşu. Mioqlobin oksigen nəqlində iştirak edən 153 amin turşusundan ibarət zülaldır. Polipeptid zənciri oksigen bağlayan yer kimi xidmət edən bir heme qrupu ətrafında bükülür.

Protein quruluşu ümumiyyətlə dörd səviyyəli olaraq təsvir edilir. Zülalın əsas quruluşu onun polipeptid zəncirindəki amin turşularının ardıcıllığıdır. İkinci dərəcəli quruluş, polipeptidin lokallaşdırılmış bölgələri daxilində amin turşularının müntəzəm düzülüşüdür. İlk dəfə 1951-ci ildə Linus Pauling və Robert Corey tərəfindən təklif edilən iki növ ikinci dərəcəli quruluş xüsusilə geniş yayılmışdır: α sarmal və β təbəqə. Bu ikinci dərəcəli strukturların hər ikisi peptid bağlarının CO və NH qrupları arasında hidrogen bağları ilə bir yerdə saxlanılır. Polipeptid zəncirinin bir bölgəsi öz ətrafında dolandıqda, bir peptid bağının CO qrupu xətti polipeptid zəncirində dörd qalıq aşağıda yerləşən peptid bağının NH qrupu ilə hidrogen bağı əmələ gətirdikdə α sarmal əmələ gəlir (Şəkil 2.19). ). Bunun əksinə olaraq, bir polipeptid zəncirinin iki hissəsi aralarında hidrogen bağları ilə yan-yana yatdıqda β təbəqəsi əmələ gəlir. Belə vərəqlər bir-birinə paralel və ya antiparalel istiqamətləndirilə bilən bir neçə polipeptid zəncirinin arasında əmələ gələ bilər.

Şəkil 2.19

Zülalların ikincil quruluşu. İkinci dərəcəli quruluşun ən çox yayılmış növləri α spiral və β təbəqədir. Bir spiralda dörd amin turşusu qalığı ilə ayrılmış peptid bağlarının CO və NH qrupları arasında hidrogen bağları əmələ gəlir. (daha çox.)

Üçüncü quruluş ilkin ardıcıllığın müxtəlif bölgələrində yerləşən amin turşularının yan zəncirləri arasında qarşılıqlı təsir nəticəsində polipeptid zəncirinin bükülməsidir (Şəkil 2.20). Əksər zülallarda polipeptid zəncirinin döngə bölgələri ilə birləşən α spiral və β təbəqələrinin birləşmələri üçüncü quruluşun əsas vahidləri olan domen adlanan yığcam qlobulyar strukturlara qatlanır. Ribonükleaza və ya mioqlobin kimi kiçik zülallar yalnız bir domendən ibarətdir, daha böyük zülallar tez-tez fərqli funksiyalarla əlaqəli olan bir sıra müxtəlif domenləri ehtiva edə bilər.

Şəkil 2.20

Ribonükleazanın üçüncü quruluşu. Döngə bölgələri ilə birləşən α-heliks və β-vərəqli ikinci dərəcəli strukturların bölgələri zülalın təbii konformasiyasına bükülür. Polipeptid zəncirinin bu sxematik təsvirində (daha çox.)

Üçüncü quruluşun kritik təyinedicisi hidrofobik amin turşularının zülalın daxili hissəsində və hidrofilik amin turşularının su ilə qarşılıqlı əlaqədə olduğu səthdə lokalizasiyasıdır. Beləliklə, qatlanmış zülalların daxili hissələri əsasən spiral və təbəqələrdə düzülmüş hidrofob amin turşularından ibarətdir, bu ikinci dərəcəli strukturlar zülalların hidrofobik nüvələrində olur, çünki hidrogen bağı polipeptidin CO və NH qruplarının qütb xarakterini neytrallaşdırır. onurğa sütunu. İkinci dərəcəli quruluşun elementlərini birləşdirən döngə bölgələri qatlanmış zülalların səthində yerləşir, burada peptid bağlarının qütb komponentləri su ilə və ya hidrofilik amin turşularının qütb yan zəncirləri ilə hidrogen bağları yaradır. Zülal səthində qütblü amin turşusu yan zəncirləri (hidrogen bağları və ion bağları) arasındakı qarşılıqlı təsirlər də üçüncü quruluşun mühüm təyinediciləridir. Bundan əlavə, sistein qalıqlarının sulfhidril qrupları arasında kovalent disulfid bağları bir çox hüceyrə səthinin və ya ifraz olunan zülalların qatlanmış strukturlarını sabitləşdirir.

Protein quruluşunun dördüncü səviyyəsi, dördüncü quruluş, birdən çox polipeptiddən ibarət zülallarda müxtəlif polipeptid zəncirləri arasındakı qarşılıqlı təsirlərdən ibarətdir. Hemoqlobin, məsələn, üçüncü quruluşu saxlayan eyni növ qarşılıqlı təsirlərlə bir yerdə saxlanılan dörd polipeptid zəncirindən ibarətdir (Şəkil 2.21).

Şəkil 2.21

Hemoqlobinin dördüncü quruluşu. Hemoqlobin dörd polipeptid zəncirindən ibarətdir, bunların hər biri bir heme qrupuna bağlıdır. İki α zəncir və iki β zəncir eynidir.

Beləliklə, 20 müxtəlif amin turşusunun fərqli kimyəvi xüsusiyyətləri qatlanmış zülalların üçölçülü konformasiyalarında əhəmiyyətli dəyişikliklərə səbəb olur. Nəticə etibarilə, zülallar hüceyrə biologiyasında yerinə yetirdikləri müxtəlif vəzifələrə uyğun gələn son dərəcə mürəkkəb və müxtəlif makromolekullar qrupunu təşkil edir.

Əsas Təcrübə: Polipeptid zəncirlərinin qatlanması.

Nəşriyyatçı ilə razılaşma əsasında bu kitaba axtarış funksiyası ilə daxil olmaq mümkündür, lakin onu nəzərdən keçirmək mümkün deyil.


Mücərrəd

Saxlama yağının triaçilqliserol (TAG) şəklində çökməsi enerji mövcudluğundakı dalğalanmaların və metabolik stressin öhdəsindən gəlmək üçün təkamüllə qorunan strategiyadır. Xüsusi piy toxumalarında orqanizmin TAG saxlanması heyvanlara inkişaf və aclıq zamanı sağ qalmağı təmin edən metabolik ehtiyat təmin edir. Digər tərəfdən, piylənmə kimi təyin olunan yağ TAG-nin həddindən artıq yığılması insan metabolik xəstəliklərinin artması ilə əlaqələndirilir. Son on ildə meyvə milçəyi Drosophila melanogasterGenetika və inkişaf biologiyasında ənənəvi olaraq istifadə edilən TAG metabolizmasını və lipidlərlə əlaqəli metabolik xəstəliklərin etiologiyasını öyrənmək üçün çox yönlü model sistem kimi yaradılmışdır. İnsanlar kimi, Drosophila TAG homeostazı hormonların və messencer molekulların endokrin şəbəkəsi ilə birləşən lipidlərin qəbulu, sintezi və emalında ixtisaslaşmış orqan sistemlərinin qarşılıqlı əlaqəsinə əsaslanır. Şəkərdən və ya pəhriz lipidindən TAG-ın fermentativ əmələ gəlməsi, onun lipid damlacıqlarında saxlanması və lipolizlə mobilizasiyası böyük ölçüdə qorunan mexanizmlər vasitəsilə baş verir. Drosophila və insanlar. Xüsusilə, disfunksiyalı Drosophila TAG homeostasis occurs in the context of aging, overnutrition, or defective gene function, and entails tissue-specific and organismal pathologies that resemble human disease. In this review, we summarize the physiology and biochemistry of TAG in Drosophila and outline the potential of this organism as a model system to understand the genetic and dietary basis of TAG storage and TAG-related metabolic disorders.


Finkel, T. The metabolic regulation of aging. Nat. Med. 21, 1416–1423 (2015).

Imai, S. & Guarente, L. NAD + and sirtuins in aging and disease. Trends Cell Biol. 24, 464–471 (2014).

Johnson, S. C., Rabinovitch, P. S. & Kaeberlein, M . mTOR is a key modulator of ageing and age-related disease. Təbiət 493, 338–345 (2013).

Yoshino, J., Mills, K. F., Yoon, M. J. & Imai, S. Nicotinamide mononucleotide, a key NAD + intermediate, treats the pathophysiology of diet- and age-induced diabetes in mice. Cell Metab. 14, 528–536 (2011).

Kenyon, C., Chang, J., Gensch, E., Rudner, A. & Tabtiang, R . A C. elegans mutant that lives twice as long as wild type. Təbiət 366, 461–464 (1993).

Hamilton, B. et al. A systematic RNAi screen for longevity genes in C. elegans. Genes Dev. 19, 1544–1555 (2005).

Garigan, D. et al. Genetic analysis of tissue aging in Caenorhabditis elegans: a role for heat-shock factor and bacterial proliferation. Genetika 161, 1101–1112 (2002).

Evason, K., Huang, C., Yamben, I., Covey, D. F. & Kornfeld, K. Anticonvulsant medications extend worm life-span. Elm 307, 258–262 (2005).

Petrascheck, M., Ye, X. & Buck, L. B. An antidepressant that extends lifespan in adult Caenorhabditis elegans. Təbiət 450, 553–556 (2007).

Bachovchin, D. A. et al. Superfamily-wide portrait of serine hydrolase inhibition achieved by library-versus-library screening. Proc. Natl akad. Sci. ABŞ 107, 20941–20946 (2010).

Backus, K. M. et al. Proteome-wide covalent ligand discovery in native biological systems. Təbiət 534, 570–574 (2016).

Grüner, B. M. et al. An in vivo multiplexed small-molecule screening platform. Nat. Metodlar 13, 883–889 (2016).

Roberts, A. M. et al. Chemoproteomic screening of covalent ligands reveals UBA5 as a novel pancreatic cancer target. ACS Chem. Biol. 12, 899–904 (2017).

Hsu, K. L. et al. DAGLβ inhibition perturbs a lipid network involved in macrophage inflammatory responses. Nat. Kimya. Biol. 8, 999–1007 (2012).

Cognetta, A. B. et al. Selective N-hydroxyhydantoin carbamate inhibitors of mammalian serine hydrolases. Kimya. Biol. 22, 928–937 (2015).

Liu, Y., Patricelli, M. P. & Cravatt, B. F. Activity-based protein profiling: the serine hydrolases. Proc. Natl akad. Sci. ABŞ 96, 14694–14699 (1999).

Niphakis, M. J. & Cravatt, B. F. Enzyme inhibitor discovery by activity-based protein profiling. Annu. Rev. Biochem. 83, 341–377 (2014).

Lucanic, M. et al. N-acylethanolamine signalling mediates the effect of diet on lifespan in Caenorhabditis elegans. Təbiət 473, 226–229 (2011).

Lin, Y. H. et al. Diacylglycerol lipase regulates lifespan and oxidative stress response by inversely modulating TOR signaling in DrosophilaC. elegans. Yaşlı hüceyrə 13, 755–764 (2014).

Wang, M. C., O’Rourke, E. J. & Ruvkun, G. Fat metabolism links germline stem cells and longevity in C. elegans. Elm 322, 957–960 (2008).

Folick, A. et al. Yaşlanma. Lysosomal signaling molecules regulate longevity in Caenorhabditis elegans. Elm 347, 83–86 (2015).

Rangaraju, S. et al. Suppression of transcriptional drift extends C. elegans lifespan by postponing the onset of mortality. eLife 4, e08833 (2015).

Adibekian, A. et al. Click-generated triazole ureas as ultrapotent in vivo-active serine hydrolase inhibitors. Nat. Kimya. Biol. 7, 469–478 (2011).

Chang, J. W., Cognetta, A. B. III, Niphakis, M. J. & Cravatt, B. F. Proteome-wide reactivity profiling identifies diverse carbamate chemotypes tuned for serine hydrolase inhibition. ACS Chem. Biol. 8, 1590–1599 (2013).

Kamat, S. S. et al. Immunomodulatory lysophosphatidylserines are regulated by ABHD16A and ABHD12 interplay. Nat. Kimya. Biol. 11, 164–171 (2015).

Arantes-Oliveira, N., Apfeld, J., Dillin, A. & Kenyon, C. Regulation of life-span by germ-line stem cells in Caenorhabditis elegans. Elm 295, 502–505 (2002).

Long, J. Z. et al. Selective blockade of 2-arachidonoylglycerol hydrolysis produces cannabinoid behavioral effects. Nat. Kimya. Biol. 5, 37–44 (2009).

Grabner, G. F., Zimmermann, R., Schicho, R. & Taschler, U. Monoglyceride lipase as a drug target: at the crossroads of arachidonic acid metabolism and endocannabinoid signaling. Pharmacol. Ther. 175, 35–46 (2017).

Kathuria, S. et al. Modulation of anxiety through blockade of anandamide hydrolysis. Nat. Med. 9, 76–81 (2003).

Shin, S. et al. Characterization of a novel Ser-cisSer-Lys catalytic triad in comparison with the classical Ser-His-Asp triad. J. Biol. Kimya. 278, 24937–24943 (2003).

Cravatt, B. F. et al. Molecular characterization of an enzyme that degrades neuromodulatory fatty-acid amides. Təbiət 384, 83–87 (1996).

Giang, D. K. & Cravatt, B. F. Molecular characterization of human and mouse fatty acid amide hydrolases. Proc. Natl akad. Sci. ABŞ 94, 2238–2242 (1997).

Curnow, A. W. et al. Glu-tRNAGln amidotransferase: a novel heterotrimeric enzyme required for correct decoding of glutamine codons during translation. Proc. Natl akad. Sci. ABŞ 94, 11819–11826 (1997).

Chang, J. W. et al. Highly selective inhibitors of monoacylglycerol lipase bearing a reactive group that is bioisosteric with endocannabinoid substrates. Kimya. Biol. 19, 579–588 (2012).

Dai, D. F., Chiao, Y. A., Marcinek, D. J., Szeto, H. H. & Rabinovitch, P. S. Mitochondrial oxidative stress in aging and healthspan. Longev. Healthspan 3, 6 (2014).

Greer, E. L. & Brunet, A. Different dietary restriction regimens extend lifespan by both independent and overlapping genetic pathways in C. elegans. Yaşlı hüceyrə 8, 113–127 (2009).

Altenhoff, A. M. et al. The OMA orthology database in 2018: retrieving evolutionary relationships among all domains of life through richer web and programmatic interfaces. Nuklein turşuları Res. 46, D477–D485 (2017).

Dolinski, K. & Botstein, D. Orthology and functional conservation in eukaryotes. Annu. Rev Genet. 41, 465–507 (2007).

Omelchenko, M. V., Galperin, M. Y., Wolf, Y. I. & Koonin, E. V. Non-homologous isofunctional enzymes: a systematic analysis of alternative solutions in enzyme evolution. Biol. Direct 5, 31 (2010).

Bandyopadhyay, S., Sharan, R. & Ideker, T. Systematic identification of functional orthologs based on protein network comparison. Genom Res. 16, 428–435 (2006).

Kurnasov, O. et al. NAD biosynthesis: identification of the tryptophan to quinolinate pathway in bacteria. Kimya. Biol. 10, 1195–1204 (2003).

Martell, J. et al. Global cysteine-reactivity profiling during impaired insulin/IGF-1 signaling in C. elegans identifies uncharacterized mediators of longevity. Hüceyrə Kimyası. Biol. 23, 955–966 (2016).

Han, S. et al. Mono-unsaturated fatty acids link H3K4me3 modifiers to C. elegans lifespan. Təbiət 544, 185–190 (2017).

O’Rourke, E. J., Kuballa, P., Xavier, R. & Ruvkun, G. ω-6 Polyunsaturated fatty acids extend life span through the activation of autophagy. Genes Dev. 27, 429–440 (2013).

Shmookler Reis, R. J. et al. Modulation of lipid biosynthesis contributes to stress resistance and longevity of C. elegans mutantlar. Aging (Albany NY) 3, 125–147 (2011).

Oakes, M. D., Law, W. J., Clark, T., Bamber, B. A. & Komuniecki, R. Cannabinoids activate monoaminergic signaling to modulate key C. elegans behaviors. J. Neurosci. 37, 2859–2869 (2017).

Ogasawara, D. et al. Rapid and profound rewiring of brain lipid signaling networks by acute diacylglycerol lipase inhibition. Proc. Natl akad. Sci. ABŞ 113, 26–33 (2016).

Fagan, S. G. & Campbell, V. A. The influence of cannabinoids on generic traits of neurodegeneration. Br. J. Pharmacol. 171, 1347–1360 (2014).

Bilkei-Gorzo, A. The endocannabinoid system in normal and pathological brain ageing. Phil. Trans. R. Soc. London. B 367, 3326–3341 (2012).

Piyanova, A. et al. Age-related changes in the endocannabinoid system in the mouse hippocampus. Mex. Yaşlanma Dev. 150, 55–64 (2015).

Paix, A., Folkmann, A., Rasoloson, D. & Seydoux, G. High efficiency, homology-directed genome editing in Caenorhabditis elegans using CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein complexes. Genetika 201, 47–54 (2015).

Rangaraju, S., Solis, G. M. & Petrascheck, M. High-throughput small-molecule screening in Caenorhabditis elegans. Metodlar Mol. Biol. 1263, 139–155 (2015).

Hulce, J. J., Cognetta, A. B., Niphakis, M. J., Tully, S. E. & Cravatt, B. F. Proteome-wide mapping of cholesterol-interacting proteins in mammalian cells. Nat. Metodlar 10, 259–264 (2013).

Rostovtsev, V. V., Green, L. G., Fokin, V. V. & Sharpless, K. B. A stepwise huisgen cycloaddition process: copper(i)-catalyzed regioselective “ligation” of azides and terminal alkynes. Angew.Kimya. Int. Edn Engl. 41, 2596–2599 (2002).

Weerapana, E. et al. Quantitative reactivity profiling predicts functional cysteines in proteomes. Təbiət 468, 790–795 (2010).

Solis, G. M. et al. Translation attenuation by minocycline enhances longevity and proteostasis in old post-stress-responsive organisms. eLife 7, e40314 (2018).

Jessani, N. et al. A streamlined platform for high-content functional proteomics of primary human specimens. Nat. Metodlar 2, 691–697 (2005).

Gomez-Amaro, R. L. et al. Measuring food intake and nutrient absorption in Caenorhabditis elegans. Genetika 200, 443–454 (2015).

Bar-Peled, L. et al. A Tumor suppressor complex with GAP activity for the Rag GTPases that signal amino acid sufficiency to mTORC1. Elm 340, 1100–1106 (2013).

Patricelli, M. P., Giang, D. K., Stamp, L. M. & Burbaum, J. J. Direct visualization of serine hydrolase activities in complex proteomes using fluorescent active site-directed probes. Proteomika 1, 1067–1071 (2001).


5. Nəticə

The field of lipidomics has made rapid progress on many fronts over the past two decades although it has still to achieve the same level of advancement and knowledge as genomics and proteomics. The diversity of lipid chemical structures presents a challenge both from the experimental and informatics standpoints. The need for a robust, scalable bioinformatics infrastructure is high at a number of different levels: (a) establishment of a globally accepted classification system, creation of databases of lipid structures, lipid-related genes and proteins, (c) efficient analysis of experimental data, (d) efficient management of metadata and protocols, (e) integration of experimental data and existing knowledge into metabolic and signaling pathways, (f) development of informatics software for efficient searching, display and analysis of lipidomic data. The study of mammalian lipdomes has been complemented in recent years by comprehensive lipidomic analyses of yeast, mycobacteria, archaebacteria and plants, each with its own set of challenges and insights which will need to be addressed by collaborative efforts between biology, chemistry and bioinformatics.


Videoya baxın: Биология. Тема: Получение Рекомбинантной ДНК (Iyul 2022).


Şərhlər:

  1. Aonghus

    Üzr istəyirəm, amma səhv etdiyinizi düşünürəm.Mən əminəm. Mən mövqeyimizi müdafiə edə bilərəm. PM-də mənə e-poçt göndərin, müzakirə edəcəyik.

  2. Matthieu

    Sözünüzü kəsdiyim üçün üzr istəyirəm, amma başqa yolla getməyi təklif edirəm.

  3. Bahn

    Maybe, I will agree with your opinion

  4. Jakeem

    Qoşuluram. Buna görə də olur. Bu mövzuda ünsiyyət qura bilərik. Burada və ya axşam.



Mesaj yazmaq