Məlumat

T kolifajlarında T və rəqəmlər nə deməkdir?

T kolifajlarında T və rəqəmlər nə deməkdir?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Mən nomenklaturalar və ya faqlarla bağlı bir sıra vebsaytları və məqalələri axtardım, lakin T-4,5,6-da T-nin nə demək olduğunu izah edən heç bir şey tapmadım… Kolifaqlarda faqlar. Həmçinin, rəqəm nə deməkdir? Mən dəfələrlə görmüşəm ki, T - hətta bir kimi qruplaşdırılıb, niyə belədir? Çox sağ ol.


"T" hərfi 1-ci tip, 2-ci tip və s. kimi "Növ" deməkdir.

Bakteriofaqlar ilk dəfə 1915-ci ildə ingilis alimi Frederik Tvort və 1917-ci ildə Feliks d'Herelle tərəfindən kəşf edilmişdir. 1930-cu illərin sonunda TL Rakieten iki tədqiqatçıya ya xam kanalizasiya qarışığı, ya da xam kanalizasiya ilə yoluxmuş E. coli-dən lizat təklif etmişdir. Demerec və Uqo Fano. Bu iki tədqiqatçı E.coli-dən T3, T4, T5 və T6-nı təcrid etdi. Həmçinin, 1932-ci ildə tədqiqatçı J. Bronfenbrenner T2 faqının virusdan təcrid olunduğu T2 faqını öyrənmiş və üzərində işləmişdir.[39] Bu izolyasiya kanalizasiyadan deyil, nəcis materialından hazırlanmışdır. Hər halda, Maks Delbrük T cüt faqların kəşfində iştirak edirdi. Onun hissəsi bakteriofaqları Tip 1 (T1), Tip 2 (T2), Tip 3 (T3) və s. adlandırmaq idi.

Məlum oldu ki, Vikipediya yanlışdır: Type-ın bu viruslar üçün təyinatı kimi ilkin istifadəsi M Demeric və U Fano tərəfindən 1945-ci ildə nəşr olunmuş məqalədən (PDF) gəlir: ESCHERICHIA COLI-DA BAKTERİOFAJA DAVAMLI MUTANTLAR Genetika 30:119. Bu yazıda onlar başqaları arasında Luria (LB/Luria Bulyonundan (əslində lizogen bulyonu kimi tanınır)) və Delbrukdan faqlar topladılar və müqayisə üçün hamısını topladılar. Delbruk 1945-ci ildən etibarən öz icmal məqaləsində (PDF, mümkün ödəniş divarı, xülasə burada) onlara istinad edir.

Mən faqların niyə olduğu kimi nömrələndiyinə dair heç bir dəlil tapa bilmədim, baxmayaraq ki, Luria (əslində əvvəllər onun rəhbəri tərəfindən P28 və PC kimi) ştammları T1 (Luria alfa) və T2 (Luria qamma) kimi etiketlənmişdi, buna görə də mümkündür ki, Bu, sadəcə olaraq onların qəbul edilməsi və ya bəlkə də bu viruslar üzərində işləyən bir neçə qrup arasında kəşf edilməsi üçün idi.

T-hətta faqlar struktur oxşarlıqlarına görə qruplaşdırılmışdır və indi növlərin ştammlarıdır. escherichia virus T4 cinsdə Tekvatrovirus (taksonomiya üçün linkə baxın).


  • Virulentlik, ölüm halları və/və ya orqanizmin ev sahibinin toxumalarını işğal etmək qabiliyyəti ilə göstərilən bir qrup və ya parazit növləri daxilində patogenlik dərəcəsidir. Bir orqanizmin patogenliyi onun virulentlik faktorları ilə müəyyən edilir.
  • Litik və lizogen faq dövrləri arasındakı əsas fərq, litik faqda viral DNT-nin bakteriya hüceyrəsində ayrıca molekul kimi mövcud olması və ev sahibi bakterial DNT-dən ayrıca təkrarlanmasıdır.
  • T-4-ün quyruq lifləri ana hüceyrəyə bağlanmağa imkan verir, T4-ün quyruğu isə boşdur ki, qoşma zamanı yoluxduğu hüceyrəyə öz nuklein turşusunu ötürə bilsin. T4 yalnız litik həyat dövründən keçə bilir, lizogen həyat dövrü deyil.
  • litik dövr: Hüceyrə membranının nüfuz etməsi, nuklein turşusu sintezi və ev sahibi hüceyrənin lizisini əhatə edən normal virus çoxalma prosesi.
  • virulentlik: ölüm halları və/yaxud orqanizmin ev sahibinin toxumalarını zəbt etmək qabiliyyəti ilə göstərildiyi kimi bir qrup və ya parazit növləri daxilində patogenlik dərəcəsi.

Virulentlik, ölüm halları və/və ya orqanizmin ev sahibinin toxumalarını işğal etmək qabiliyyəti ilə göstərilən bir qrup və ya parazit növləri daxilində patogenlik dərəcəsidir. Bir orqanizmin patogenliyi onun virulentlik faktorları ilə müəyyən edilir. Virusun virulentlik faktorları infeksiyanın baş verib-verməyəcəyini və nəticədə ortaya çıxan virus xəstəliyinin simptomlarının nə qədər ağır olduğunu müəyyən edir. Viruslar tez-tez xüsusi olaraq bağlandıqları ana hüceyrələrdə reseptor zülallarına ehtiyac duyurlar. Tipik olaraq, bu ev sahibi hüceyrə zülalları endositozlanır və bağlanmış virus sonra ev sahibi hüceyrəyə daxil olur. QİÇS-ə səbəb olan HİV kimi virulent viruslar ev sahibinin müdafiəsindən yayınma mexanizmlərinə malikdir.

Bəzi viral virulentlik faktorları, virusun səbəb olduğu qızdırma zamanı kimi ev sahibinin müdafiəedici iltihab reaksiyaları zamanı təkrarlanma qabiliyyətini təmin edir. Bir çox viruslar ev sahibinin içərisində uzun müddət mövcud ola bilər, bu müddət ərzində az zərər verilir. Həddindən artıq virulent suşlar nəhayət, ev sahibinin içərisində virus populyasiyası daxilində mutasiya və təbii seçim yolu ilə inkişaf edə bilər. &ldquoneurovirulent&rdquo termini sinir sistemini zəbt edə və orada xəstəliyə səbəb ola bilən quduzluq və herpes simplex kimi viruslar üçün istifadə olunur.

Geniş şəkildə tədqiq edilmiş virulent virusların model orqanizmlərinə Escherichia coli və bir sıra əlaqəli Bakteriyaları yoluxduran virus T4 və digər T-hətta bakteriofaqlar daxildir.

Litik dövr viral çoxalmanın iki dövründən biridir, digəri isə lizogen dövrdür. Litik dövr adətən virusun təkrarlanmasının əsas üsulu hesab olunur, çünki bu, yoluxmuş hüceyrənin məhvi ilə nəticələnir. Litik və lizogen faq dövrləri arasındakı əsas fərq, litik faqda viral DNT-nin bakteriya hüceyrəsində ayrıca molekul kimi mövcud olması və ev sahibi bakterial DNT-dən ayrıca təkrarlanmasıdır. Lizogen faq dövründə viral DNT-nin yeri ev sahibi DNT-nin daxilindədir, buna görə də hər iki halda virus/faq ev sahibi DNT mexanizmindən istifadə edərək çoxalır, lakin litik faq dövründə faq ev sahibi DNT üçün sərbəst üzən ayrıca molekuldur. .

Şəkil: Viral çoxalma dövrləri: Bakteriofaqların lizogen və litik dövrlərinin müqayisəsi.

Litik dövr altı mərhələli dövrdür. Birinci mərhələdə &ldquopenetration&rdquo virus öz nuklein turşularını ev sahibi hüceyrəyə yeridir. Sonra viral turşular hüceyrənin mərkəzində bir dairə meydana gətirir. Hüceyrə daha sonra səhvən öz nuklein turşularının yerinə viral turşuları kopyalayır. Sonra viral DNT özlərini hüceyrə daxilində viruslar kimi təşkil edirlər. İçindəki virusların sayı hüceyrənin tuta bilməyəcəyi qədər çox olduqda, membran parçalanır və viruslar digər hüceyrələrə yoluxmaqda sərbəst olur. Bəzi viruslar hüceyrə membranını partlamadan ev sahibi hüceyrədən qaçır, membranın bir hissəsini özləri ilə götürərək oradan qönçələnirlər. Başqa cür digər addımlardakı litik dövr üçün xarakterik olduğundan, bəzən Məhsuldar Dövr adlandırılsa da, yenə də bu kateqoriyaya aiddir. İİV, qrip və eukaryotik orqanizmləri yoluxduran digər viruslar ümumiyyətlə bu üsuldan istifadə edirlər.

T-4 bakteriofaq E.coli bakteriyalarını yoluxduran bakteriofaqdır. Onun ikiqat zəncirli DNT genomu təxminən 169 kbp uzunluğundadır və kapsid olaraq da bilinən ikozahedral başda saxlanılır. T4 təxminən 90 nm enində və 200 nm uzunluğunda (əksər faqların uzunluğu 25 ilə 200 nm arasında dəyişir) nisbətən böyük bir faqdır. Onun quyruq lifləri ana hüceyrəyə bağlanmağa imkan verir və T4-ün quyruğu boşdur ki, bağlanma zamanı öz nuklein turşusunu yoluxduğu hüceyrəyə ötürə bilsin. T4 yalnız litik həyat dövründən keçə bilir, lizogen həyat dövrü deyil.

T4 Phage, uzun quyruq lifləri (LTF) ilə ev sahibinin hüceyrə səthi reseptorlarını tanıyaraq E. coli infeksiyasını başlatır. Tanınma siqnalı LTF-lər vasitəsilə əsas lövhəyə göndərilir. Bu, E. coli hüceyrə səthinə dönməz şəkildə bağlanan qısa quyruq liflərini (STF) açır. Baza lövhəsi konformasiyanı dəyişir və quyruq qabığı büzülür və quyruq borusunun sonundakı GP5-in hüceyrənin xarici membranını deşməsinə səbəb olur. GP5-in lizozim sahəsi aktivləşir və periplazmik peptidoqlikan təbəqəsini parçalayır. Membranın qalan hissəsi parçalanır və sonra fagın başından DNT quyruq borusundan keçərək E. coli-yə daxil ola bilər.

Litik həyat dövrü (bakteriyanın daxil olmasından onun məhvinə qədər) təxminən 30 dəqiqə çəkir (37°C-də) və aşağıdakılardan ibarətdir:

  • Adsorbsiya və penetrasiya (dərhal başlayır)
  • Ev sahibi gen ifadəsinin tutulması (dərhal başlayır)
  • Ferment sintezi (5 dəqiqədən sonra başlayır)
  • DNT replikasiyası (10 dəqiqədən sonra başlayır)
  • Yeni virus hissəciklərinin əmələ gəlməsi (12 dəqiqədən sonra)

Həyat dövrü başa çatdıqdan sonra ana hüceyrə partlayır və yeni qurulmuş virusları ətraf mühitə ataraq ana hüceyrəni məhv edir. T4 hər yoluxmuş ev sahibi üçün təxminən 100-150 virus hissəciklərinin partlama ölçüsünə malikdir. Tamamlama, silmə və rekombinasiya testləri T4-dən istifadə edərək rII gen lokusunun xəritəsini çıxarmaq üçün istifadə edilə bilər. Bu bakteriofaqlar öz məlumatı ilə bir ana hüceyrəni yoluxdurur və sonra ana hüceyrəni partladaraq özlərini çoxaldırlar.


Kolifaqların və kolifaj DNT-nin molekulyar çəkiləri: I. Bakteriofaq T7-nin molekulyar çəkisinin yüksək sürətli tarazlıq sentrifuqasiyası ilə ölçülməsi☆

Yphantisin (1964) yüksək sürətli tarazlıq mərkəzdənqaçma metodunun faydalılıq diapazonu molekulyar çəkisini ölçmək üçün genişləndirilmişdir. Escherichia coli faq T7. T7, T5 və T4 faqlarının ̄ gn üçün dəyərləri piknometriya yolu ilə əldə edilmiş, faqların konsentrasiyası azot və fosforun tərkibini, amin turşusu və nukleotid tərkibini ölçməklə müəyyən edilmişdir. ̄ gn dəyərləri bunlardır: T7, 0,639 T5, 0,658 və T4, 0,618. Azot və fosfor ölçmələrindən hər bir faq tipində DNT faizi hesablanmışdır. Bu dəyərlər: T7, 51.2 T5, 61.7 və T4, 54.9. T7 faqının və T7 DNT-nin molekulyar çəkiləri müvafiq olaraq 49,4 və 25,3 milyon daltondur. Növbəti məqalədə (Dubin, Benedek, Bancroft & Freifelder, 1970) başqa bir texnika ilə müəyyən edilmiş T7, T5 və T4 molekulyar çəkilərinin dəyərləri bildirilir. T7-nin molekulyar çəkisi üçün iki texnikanın verdiyi dəyərlər mükəmməl uyğun gəlir. Molekulyar çəkinin ölçülməsinin ümumi probleminin müzakirəsi Freifelderdə (1970) verilmişdir. ‡

Bu nəşr nömrəsidir. 742, Brandeis Universitetinin Biyokimya Məzun Departamentindən.

Hazırkı ünvan: Biologiya Elmləri Departamenti, Kolumbiya Universiteti, Nyu-York, N.Y. 10027, ABŞ.

Bu tapıntıların ilkin hesabatı hazırlanmışdır (Bancroft & amp Freifelder, 1969)


TRNT növləri

Bir tRNT daşıdığı amin turşusuna görə təsnif edilə bilər və 20 fərqli tRNA meydana gətirir. Alternativ olaraq, onlar da antikodonlarına görə qruplaşdırıla bilərlər. Dörd nukleotidin birləşməsindən yaranan 64 mümkün kodon var. Bunlardan 3-ü tərcümənin bitdiyini bildirən dayanma kodonlarıdır. Bu, bir amin turşusunun çoxlu kodonlar və AATS ilə təmsil olunduğu bir vəziyyətə səbəb olur, həmçinin tRNA-ların bu ehtiyata uyğunlaşması lazımdır. Bununla belə, çox az növdə tam olaraq 61 tRNA var ki, bu da hər bir kodonun xüsusi bir tRNT tərəfindən necə tanındığı sualını doğurur. Bir çox növlərdə onların sayı 61-i çox ötür və eyni antikodonu daşıyan müxtəlif tRNA-lar zülal sintezi prosesinə tənzimləmə qatını əlavə edərək, tərcümədə müxtəlif effektivlik göstərə bilər.

tRNA-lar mRNT-dəki kodonlarla antikodon halqası vasitəsilə qarşılıqlı əlaqədə olurlar. Kodon və antikodon arasında əsas cütləşmə tərcümə zamanı spesifikliyi təmin edir. Bununla belə, antikodonun birinci bazası, kodonda “yırğalanma” və ya üçüncü mövqe ilə cütləşən tRNT-nin bir əsas əvəzinə üç ilə hidrogen bağı qurmasına imkan vermək üçün tez-tez dəyişdirilir. Beləliklə, tək bir tRNT eyni amin turşusunu kodlayan üç kodonla tanınma və əsas cütləşmə seçiminə malikdir. Hər amin turşusu üçün bir olan 20 AATS var. Bu fermentlər qrupu müəyyən bir amin turşusunu təmsil edən bütün antikodonları tanıya bilər və buna görə də genetik kodun artıqlığını idarə edən mexanizmin ikinci qolu kimi fəaliyyət göstərir.

Nəhayət, bu molekulları da üç kateqoriyaya bölmək olar – düzgün tRNT-yə bağlanmış kanonik amin turşularını daşıyanlar, yanlış bağlanmış olanlar və qeyri-kanonik uzanma üçün selenosistein kimi dəyişdirilmiş amin turşularını daşıyanlar.

TRNT-nin Post-Transkripsiya Modifikasiyası

İnsan genomunda tRNT-ləri kodlayan 500-ə yaxın gen və bu RNT ilə əlaqəli 300 gen fraqmenti var. Bu genlər RNT polimeraza III tərəfindən transkripsiya edilir və transkript xüsusilə eukariotlarda geniş modifikasiyaya məruz qalır. İntronlar birləşir, intron-ekson sərhədinə endonükleazlar təsir edir, RNT-nin 5' və 3' ucları işlənir və fermentlər tRNT-nin 3' ucuna terminal CCA qalıqlarını əlavə edirlər. CCA qalıqları nüvənin özündə aminoasilləşə bilər və bu yüklü tRNT daha sonra nüvədən ixrac edilə bilər.

Bundan əlavə, tRNT-də bir çox əsaslar, xüsusən də metilləşmə (bir metil qrupunun əlavə edilməsi) və deamidasiya (amid qrupunun çıxarılması) ilə dəyişdirilir. Xüsusilə, antikodonun kodondakı "yırğalanma" mövqeyi ilə cütləşən ilk bazası qeyri-adi əsas cütləşməsinə imkan vermək üçün dəyişdirilir. Adenin urasil, sitozin və adenini daxil etmək üçün cütləşmə imkanlarını genişləndirən inozin meydana gətirmək üçün dəyişdirilə bilər. Pseudouridin, ferment vasitəsi ilə izomerləşmə yolu ilə uridin qalıqlarından əldə edilən başqa bir ümumi dəyişdirilmiş əsasdır. Onun tRNT molekulunun struktur bütövlüyündə rol oynadığı, yaxınlıqdakı şəkər-fosfat onurğasının sərtləşməsində iştirak etdiyi və həmçinin proksimal bölgələrin baza yığılmasına təsir etdiyi deyilir. Lisidin, lizin amin turşusu sitidin qalığına bağlandıqda əmələ gələn qeyri-adi əsasdır. Lisidin, tərcümənin spesifikliyini təmin etmək üçün izolösin tRNA tərəfindən istifadə edilən bir xüsusiyyət olan adenozin ilə xüsusi olaraq cütləşir.

AATS, antikodon əsasında tRNT molekullarına müvafiq amin turşusu əlavə edir. Bu fermentlər amin turşusu, tRNT, eləcə də ATP üçün bağlayıcı yerləri ehtiva edir və ATP-ni AMP-yə hidroliz edir və amin turşusunu tRNT-də sonuncu nukleotidin riboza şəkərinə bağlayır. tRNT indi ‘yüklü’ hesab olunur və ribosomda zülal sintezi reaksiyalarında iştirak edə bilir. Bu reaksiya tez-tez sitoplazmada baş verir, baxmayaraq ki, nüvədə də müşahidə edilmişdir.

Reaksiyada yüksək spesifikliyi təmin etmək üçün ferment tRNT-nin bir çox bölgələrinə bağlanır və hətta bir çox amin turşularının oxşar quruluşa malik olduğu üçün öz reaksiyasını yoxlayır.

Yetkin tRNT daha sonra RanGTP sistemindən istifadə edərək onu nüvədən ixrac edən xüsusi ixrac amillərini bağlayır. Akseptor qolu və T-qolu bu prosesdə mühüm rol oynayır və ixrac faktorları ilə RNT molekulu arasında geniş qarşılıqlı əlaqə mövcuddur ki, bu da yalnız tam işlənmiş, tam tRNT-lərin sitoplazmaya keçməsinə imkan verir.


Viral Genomlar | Xromosom

Viruslar, yalnız elektron mikroskop altında baxıla bilən o qədər kiçik olan yoluxucu agentlərin xüsusi bir sinfidir. Tam bir “viral hissəcik” və ya “virion zülal örtüyü və bəzən əlavə membran zərfi ilə əhatə olunmuş genetik material blokundan (DNT və ya RNT) ibarətdir.

Virusların tərkibində nə sitoplazma var, nə də böyümə və ya metabolik fəaliyyət göstərmir. Lakin onların genetik materialı uyğun bir ana hüceyrəyə daxil olduqda, viral xromosomun virusa xas protein sintezi replikasiyası baş verir, bu proseslər həm hüceyrə (ev sahibi), həm də viral fermentlərdən istifadə edir.

Ev sahibi orqanizmlərə görə viruslar üç əsas qrupa bölünür:

Virusların morfoloji xüsusiyyətləri:

Viral xromosom kapsid adlanan zülal qabığının içərisinə daxil edilmişdir. Viral xromosom və onun zülal örtüyü birlikdə nukleokapsid adlanır. Viruslar morfoloji xüsusiyyətlərinə görə xeyli fərqlənir (Cədvəl 5.4).

1. İkosaedral virionlar:

Onların kapsidi ikosahedraldır, yəni virion 20 üçbucaqlı üzü və 12 küncü olan müntəzəm polihedrondur. Nümunələr adenoviruslar və bakteriofaq φX174.

2. Spiral virionlar:

Bu cür virionların nuklein turşusu silindrik, çubuq formalı kapsidlə bağlanır və bu, spiral quruluşa malikdir, məsələn, TMV, bakteriofaq M13.

3. Bəzi hallarda nukleokapsid ikosahedral, digərlərində isə bəzi komponentlərdə spiralvari olur. Belə viruslar örtülüdür.

Bu virusların dəqiq müəyyən edilə bilən kapsidi yoxdur. Viral nuklein turşusu zülal molekullarından ibarət olan qabığın mərkəzində yerləşir. Bəzi qabıqlar mürəkkəb, digərləri isə sadədir. Genetik material olaraq DNT-ni ehtiva edən bir heyvan virusu olan Herpesdə kapsidin diametri 1000A, diametri 1500A olan bir zərflə əhatə olunmuşdur. (Şəkil 5.19).

Kapsid bir ikosahedron meydana gətirən zülal alt bölmələrinin (kapsomerlərin) bir rejimidir.

Bakteriofaqlar nisbətən mürəkkəb strukturlara malikdirlər: onların tərkibində baş, quyruq, əsas lövhə və bir neçə quyruq lifi var (şək. 5.20). Baş altıbucaqlıdır (yan tərəf) və viral DNT-ni ehtiva edir. Quyruğun bir qabığı ilə əhatə olunmuş bir nüvə borusu var. Quyruq ucunda 6 quyruq lifi çıxan 6 sünbüllü bazal boşqab var.

İnfeksiya zamanı quyruq lifləri ana hüceyrənin xüsusi reseptor sahələrinə bağlanır. Baza lövhəsi hüceyrə səthinə çəkilir və əsas lövhənin tıxacının çıxarılması ilə birlikdə boru qabığının büzülməsi baş verir. Quyruğun nüvəsi fajda və virus quyruğunda mövcud olan bəzi hidrolitik fermentlər tərəfindən zəiflədilmiş hüceyrə divarına nüfuz edir. DNT quyruğun əsas borusu vasitəsilə ana hüceyrəyə daxil olur.

Tütün mozaika virusu (tütün bitkisi hüceyrələrində çoxalır TMV) və bəzi kiçik bakterial viruslar (məsələn, F2, R17, QB) vəziyyətində zülal qabığı tək bir növ protein ehtiva edir. Bu zülal molekulları ya spiral simmetriyada, ya da kub simmetriyada düzülür.

TMV-nin qabığı eyni olan təxminən 2150 protein molekulunu ehtiva edir, hər molekulun molekulyar çəkisi -17.000-dir. Bu molekullar 6000 nukleotiddən ibarət olan RNT genomunun ətrafında spiral şəklində düzülmüşdür.

İnfeksiyadan sonra ana hüceyrəni parçalayan və ya pozan viruslara litik viruslar deyilir. İnfeksiya zamanı nuklein turşusu ev sahibi hüceyrəyə enjekte edilir. Viral DNT replikasiyası üçün lazım olan fermentlər daha sonra sintez edilir ki, DNT-nin replikasiyası viral xromosomun çoxsaylı nüsxələrini əmələ gətirir.

Kapsidin zülal komponentləri sonrakı mərhələlərdə sintez olunur və baş və quyruqların meydana gəlməsinə səbəb olur, viral DNT daha sonra başlara yığılır. Sonda hüceyrə divarı qırılır və nəsil faj hissəcikləri sərbəst buraxılır (şək. 5.21).

Lizogen viruslar (mülayim faqlar):

Lizogenez mülayim faqla onun bakteriya sahibi arasında simbiotik əlaqəni əhatə edir. Viral xromosom bakteriya xromosomuna daxil olur, burada qalır və sonuncu ilə birlikdə təkrarlanır. Bakteriya genomuna inteqrasiya olunmuş viral DNT provirus və ya profaq adlanır (Şəkil 5.22). Tərkibində profaq olan bakteriya eyni virusun infeksiyasına qarşı immunitetlidir.

Viral xromosomlar:

Virusların genetik materialı olaraq ya DNT, ya da RNT var. Bu nuklein turşuları tək və ya iki zəncirli ola bilər (Cədvəl 5.5). Kiçik viruslar 3 kb (kb =, kilo-baza = 1000 baza), böyük viruslar isə təxminən 300 kb tuta bilər. onların genomunda. Beləliklə, viral genomdakı genlərin sayı yalnız 3 ilə yüzlərlə arasında dəyişə bilər. Retroviruslar qövs diploiddir (hər kapsiddə genomun iki nüsxəsi var), digərləri isə haploiddir.

Bəzi viruslar genetik material olaraq ikiqat zəncirli DNT-yə malikdirlər. Müxtəlif virusların əsas tərkibi DNT-nin fiziki xassələrinin dəyişməsinə səbəb olur, məsələn, ərimə temperaturu, sezium xloriddə (CsCl) üzmə sıxlığı və s.

kimi virusların bəzilərində. T-hətta kolifajlar, sitozin (C) 5-hidroksimetil-sitozinə (HMC) dəyişdirilir. Bəzi hallarda timin 5-hidroksi-metil urasil və ya 5-di-hidroksimetilurasilə çevrilir, məsələn, B. subtilisbacteriophges. DNT-nin müəyyən fiziki xassələri, məsələn, CsCl-də üzmə sıxlığı və ya ərimə temperaturu bu əvəzləmələr səbəbindən dəyişir.

Virusların bəzilərində xətti DNT, digərlərində isə dairəvi (siklik) DNT var (Cədvəl 5.5). Fag lambda (λ) vəziyyətində DNT həm xətti, həm də siklik formalarda mövcud ola bilər. Viral hissəcikdən təcrid edildikdə, λ DNT xətti olur, lakin ana hüceyrəyə daxil olduqda dairəvi olur. Lakin o, xətti formada ana hüceyrəyə daxil olur.

A. xromosomu 47.000 nukleotiddən ibarət ikiqat zəncirli DNT molekuludur, uzunluğu 17 pmdir. Hər 5 ucda 12 nukleotidin tək zəncirli proyeksiyası var ki, bu proyeksiyalar bir-birini tamamlayır və buna görə də onlar birləşən uclar adlanır.

Bu birləşən uclar xromosomun dairəviləşməsindən məsuldur. Xromosomun sirkulyarlaşması onu ev sahibi eksonükleazlar tərəfindən deqradasiyadan qoruyur. Bundan əlavə, xətti DNT vegetativ şəkildə dövrəni təkrarlaya bilməz, buna görə də replikasiyada üstünlük təmin edir.

Tək zəncirli DNT çox kiçik bakteriofaqlarda olur (Cədvəl 5.4). Virionda tapılan tək zəncirli DNT müsbət (+) zəncir adlanır, bir qayda olaraq faq hissəciklərində yalnız artı (+) zəncir tapılır. Bununla belə, adeno ilə əlaqəli viruslarda müxtəlif virionlarda iki tamamlayıcı zəncir mövcuddur. Tək zəncirli DNT saç sancaqlarını meydana gətirən tərs təkrarlanan ardıcıllıqları ehtiva edir. Saç sancağı strukturları xətti tellərin dairəvi formalaşdırılmasında və təkrarlanmasında mühüm rol oynayır.

Cüt zəncirli RNT-lər heyvan və bitkilərin bir neçə ikozahedral viruslarında olur. Belə virusların genomları seqmentlərə bölünür (Cədvəl 5.5). Müxtəlif seqmentlər əsas cütlərin qısa uzantıları ilə birləşdirilə bilər. Hər bir seqmentin transkripsiyası ayrıca baş verir və iştirak edən ferment “Çift zəncirli RNT transkriptazasıdır”. Hər bir mRNT tərcümə zamanı ayrı bir polipeptid zənciri əmələ gətirir.

Bir zəncirli RNT bir sıra virusların genetik materialıdır (Cədvəl 5.5). Bəzi virusların genomunda bir RNT molekulu var, bəzi digər viruslar isə bir neçə seqmentdən ibarətdir, məsələn, qrip virusunun 8 seqmenti var. Virusların kapsidlərində müsbət (+) və ya mənfi (-) RNT zəncirləri olur.

Ev sahibi hüceyrədə mRNT kimi fəaliyyət göstərən virus RNT zəncirinə artı (+) zəncir və ya müsbət zəncir deyilir. Heyvan viruslarının RNT genomlarının 5' ucunda qapaq və 3' ucunda poli (A) ardıcıllığı var. Bununla belə, Picornavirus RNT-də kiçik bir zülalın kovalent şəkildə bağlandığı 5′- ucunda xüsusi bir ardıcıllıq var.

Bitki viruslarının RNT genomlarının 5-ucunda qapağı var, lakin onların 3-ucunda poli (A) yoxdur, 3-ucu tRNT-yə bənzəyir. Hər bir retrovirus hissəciyi onun genomunu təmsil edən (+) RNT zəncirinin iki nüsxəsini ehtiva edir, bu nüsxələr 5′-sonuna yaxın bir yerdə saxlanılır.

Bu RNT-lərdə qapaq yoxdur, lakin 5 uclarında nukleozid trifosfata çevrilir. Bu iplər birbaşa mRNT kimi fəaliyyət göstərmir. Bunun əvəzinə, mRNT istehsal etmək üçün virionda mövcud olan "tək zəncirli RNT transkriptazı" fermenti tərəfindən transkripsiya edilir.

Viruslarda nuklein turşularının qablaşdırılması:

Viral genom (DNT/RNT) zülal qabığına (kapsid) sıx şəkildə yığılmışdır. Zülal qabığında nuklein turşusunun sıxlığı 500 mq/ml-dən yüksəkdir ki, bu da digər orqanizmlərdəki DNT-nin sıxlığından xeyli çoxdur. Məsələn, bakteriyada DNT sıxlığı təxminən 10 mq/ml, eukaryotik nüvədə isə təxminən 100 mq/ml-dir. Bu, nuklein turşusunun viral hissəciklərdə çox sıx şəkildə qablaşdırıldığını göstərir.

TMV-nin genetik materialı 6400 nukleotiddən ibarət tək zəncirli RNT-dir və uzunluğu 2 pm təşkil edir. Bu RNT 0,3 x 0,008 pm ölçülü çubuq formalı bölməyə qablaşdırılır. Adenoviruslar 35,000 bp-dən ibarət 23 pm uzunluğunda ikiqat zəncirli DNT ehtiva edir: bu, 0,07 pm diametrli ikosahedron tipli kapsidə qablaşdırılır.

Phage T4, 170.000 bp olan çox uzun ikiqat zəncirli DNT molekuluna (55 pm) malikdir. Bu kifayət qədər uzun DNT-ni ehtiva edən kapsid 1,0 x 0,065 pm ölçülərinə malik bir ikosahedrdir. Eukaryotik nüvədən və bakterial nukleoiddən fərqli olaraq, kapsidin həcmi tam olaraq nuklein turşusu ilə qablaşdırılır.

Bir nukleokapsid yaratmaq üçün nuklein turşusunun qablaşdırılması iki ümumi şəkildə baş verir. Bir mexanizmdə zülal molekulları nuklein turşusu ətrafında toplanır, məsələn, TMV-də. Digər mexanizmdə əvvəlcə zülal qabığı əmələ gəlir və sonra onun içinə nuklein turşusu daxil edilir. TMV-də RNT-də dupleks saç tıxacı quruluşu meydana gəlir.

Zülal monomerlərinin yığılması bu nüvələşmə mərkəzindən başlayır və hər iki istiqamətdə davam edərək uclara çatır. Cəmi 17 zülal vahidi dairəvi təbəqə əmələ gətirir və iki belə təbəqə birlikdə kapsid vahidini təşkil edir. Bu quruluş, qabığın içərisində bir spiral meydana gətirmək üçün qıvrılan RNT ilə qarşılıqlı əlaqə qurur.

Bakteriofaq T4 və λ və s.-də əvvəlcə zülal qabığı əmələ gəlir. Nuklein turşusu paltoya bir ucundan daxil edilir və sonra quyruq başla birləşdirilir. Dairəvi DNT vəziyyətində əvvəlcə qablaşdırma üçün xətti molekula çevrilməlidir.

Lambda (λ) genomu dairəvidir və iki “cos” saytı, cosL və cosR ehtiva edir. λ DNT-də sərbəst son cosL yerində enzimatik parçalanma nəticəsində əmələ gəlir. DNT-nin daxil edilməsi bu sondan baş verir və cosR sahəsi kapsidə daxil olana qədər davam edir, sonra λ genomunun digər ucunu yaratmaq üçün cosR yerində bir parçalanma meydana gəlir.

Bəzi viruslar, məsələn, faq T4 və λ. genomlarında terminal artıqlığı var. Bu viruslarda çoxlu genomlar istehsal etmək üçün başdan-ayağa birləşirlər “concatemeric strukturu.” T4 vəziyyətində, viral xromosomun daxil edilməsi a-dan başlayır “təsadüfi” nöqtəsinə çatır və lazımi miqdarda DNT baş daxil edilənə qədər davam edir. Başa daxil edilən DNT-nin terminal artıqlığı var.

Bir ehtimal mənşəyi “concatermeric” DNT rekombinasiyadır. İki xromosom arasında rekombinasiya iki genomu başdan-ayağa birləşdirir. Sonra üçüncü genomla rekombinasiya ardıcıl rekombinasiya yolu ilə konkatemer yaradır (Şəkil 5.23).

Konkamerlərin əmələ gəlməsi üçün təklif olunan digər mexanizm yuvarlanan dairənin təkrarlanmasıdır. Spesifik endonükleaza “tələb olunan uzunluqda genomu yaradan nöqtələrdə konkatemeri kəsir.”. Genomik DNT-nin terminal artıqlığına görə homoloji ucları var. Buna görə də bəzi xromosomlar terminal genlər üçün heterozigot ola bilər.

Lizogen və Litik Yolların Mexanizmləri:

Bakteriofaq λ, bakteriya sahibi ilə lizogen əlaqə saxlayan mülayim faqdır. Bununla birlikdə, litik dövrə də keçə bilər. İnfeksiya, bir qayda olaraq, xətti formada baş verir, lakin xromosom ev sahibi hüceyrəyə daxil olduqdan sonra dairəvi birinə çevrilir. Müxtəlif funksiyaları göstərən X xromosomunun ümumiləşdirilmiş xəritəsi Şəkil 5.24-də verilmişdir.

Oxşar funksiyalara aid genlər qruplaşdırılıb. Xətti xromosomda baş əmələ gəlməsi üçün genlər sol ucunda, lizis üçün genlər isə sağ tərəfdə yerləşir. Tənzimləyici bölgə rekombinasiya üçün bölgə ilə təkrarlama üçün bölgə arasında yerləşir. Tənzimləyici bölgədə mövcud olan genlər, X-in ev sahibi ilə lizogen əlaqəyə girəcəyini və ya litik yolu izləyəcəyini müəyyən etməkdən məsuldur.

Tənzimləyici genlər çoxluq təşkil edir və onların sol tərəfində rekombinasiya üçün genlər və sağ tərəfdə replikasiya üçün genlər ilə əhatə olunur (Şəkil 5.25). Genlər N (anti-terminator) və era (anti-repressor) tənzimləmə bölgəsində yerləşir. Bu genlər “dərhal erkən genlər” adlanır, onlar ev sahibi RNT polimeraza tərəfindən transkripsiya edilir.

Anti-sonlanma faktorunun (p N) olması halında, hər iki genin (N və era) transkripsiyası davam edir. Bu iki gen fərqli DNT zəncirlərindən əks istiqamətdə transkripsiya edilir, N geni sola, era isə sağa doğru transkripsiya edilir.

Transkripsiya müxtəlif funksiyalar üçün genomun digər bölgəsinə qədər uzanır (Şəkil 5.25). Cl repressor zülalı olmadıqda, ev sahibi RNT polimeraza P-yə bağlanırL/OL saytlarda “gec genlərin” transkripsiyası başlanır ki, nəticədə faj hissəcikləri əmələ gəlir və hüceyrə parçalanır.

Tənzimləyici bölgə lizogen yoldan məsul olan cl genini ehtiva edir. Bu bölgədəki mutasiya faqın litik dövrə keçməsinə səbəb olur.

cl geni mRNT istehsal etmək üçün transkripsiya edilir, transkripsiyada iştirak edən ferment, repressorun saxlanması üçün promotorla bağlanan RNT polimerazdır (P).RM). Transkripsiya sağdan sola baş verir. Bu cl mRNA repressor monomerini istehsal etmək üçün tərcümə olunur (Şəkil 5.25).

P-yə bağlanan repressor dimerləri əmələ gəlirL/OR və PL/OL saytlar, beləliklə RNT polimerazının bu promotorlara bağlanmasının qarşısını alır. Bu, N və cro genlərinin transkripsiyasının inhibə edilməsinə gətirib çıxarır. Daha sonra X xromosomu bakterial xromosoma inteqrasiya olunur, onun gecikmiş erkən genləri ifadə olunmur və faj “provirus” kimi qalır. Gecikmiş erkən genlər rekombinasiya, replikasiya və Q (anti-terminator) genləridir. Gec genlər quyruq, baş və lizis genləridir.

Cl repressoru 0-a bağlandıqdaL və 0R yerlərdə, RNT polimeraza cl geninin transkripsiyasına başlayır və repressor zülalının sintezi davam edir. Lakin repressor olmadıqda, RNT polimeraza P-yə bağlanırL/OL və Pr/Or saytları və N və cro genlərinin transkripsiyası başlayır.

Beləliklə, onun sintezi üçün cl repressorun özünün olması lazımdır. Lizogenin saxlanması üçün cl repressorunun davamlı istehsalı lazımdır. Bu müddət ərzində OL və OR saytlar həmişə repressorla bağlıdır.

Lizogenləşdirilmiş hüceyrə başqa bir faq X ilə yoluxduqda, “prophage” tərəfindən istehsal olunan cl repressor zülalı dərhal O-ya bağlanır.L və 0R yoluxmuş X genomunun yerləri. Beləliklə, yoluxduran X genlərinin funksiyası inhibə edilir və hüceyrə X infeksiyasına qarşı immunitetini qoruyur.


Mücərrəd

Bu tədqiqatın məqsədi çirkab suların təmizlənməsi zamanı dörd F-spesifik RNT (F-RNT) kolifaj genoqrupunun (GI-GIV) davranışındakı fərqləri müəyyən etməkdir. Xam çirkab suları, aerasiya çənlərinin tullantıları, ikincil təmizlənmiş çirkab suları və geri qaytarılmış aktiv lil 2011-ci ilin mart və dekabr ayları arasında aylıq fasilələrlə (hər biri n = 10) Yaponiyada çirkab su təmizləyici qurğudan toplanmışdır. F-spesifik kolifajlar, − 0,10 ilə 3,66 log arasında dəyişən konsentrasiya ilə bütün sınaqdan keçirilmiş nümunələrdə lövhə analizi ilə aşkar edilmişdir.10 lövhə əmələ gətirən vahidlər/ml. Sonradan hər bir nümunədən səkkiz lövhə təcrid olundu, ardınca F-RNT kolifajları üçün genoqrupa məxsus əks transkripsiya kəmiyyət PCR (qPCR) və F-spesifik DNT (F-DNT) kolifajları üçün qPCR. GI F-RNT kolifajları ikinci dərəcəli təmizlənmiş kanalizasiya nümunələrində (lövhə izolatlarının 73%-i), digər üç nümunə tipində isə GII F-RNT kolifajları ən çox olmuşdur (nümunədən asılı olaraq 41-81%) növü). Kəmiyyət təyini və genotipləşdirmənin nəticələrinə əsasən, hər bir F-spesifik kolifaj tipinin illik orta konsentrasiyası hesablanmış və tullantı sularının təmizlənməsi zamanı onların azalma əmsalları göstərici bakteriyaların (ümumi koliformalar və Escherichia coli) və bağırsaq virusları (insan adenovirusları və GI və GII norovirusları). GI F-RNT kolifajlarının orta azalma nisbəti ən aşağı idi (0,93 log10), followed by those of the indicator bacteria and enteric viruses (1.59–2.43 log10), GII–GIV F-RNA coliphages (> 2.60–3.21 log10), and F-DNA coliphages (> 3.41 log10). These results suggest that GI F-RNA coliphages may be used as an appropriate indicator of virus reduction during wastewater treatment.


Correlated (or Paired) T-Test

The correlated t-test is performed when the samples typically consist of matched pairs of similar units, or when there are cases of repeated measures. For example, there may be instances of the same patients being tested repeatedly—before and after receiving a particular treatment. In such cases, each patient is being used as a control sample against themselves.

This method also applies to cases where the samples are related in some manner or have matching characteristics, like a comparative analysis involving children, parents or siblings. Correlated or paired t-tests are of a dependent type, as these involve cases where the two sets of samples are related.

The formula for computing the t-value and degrees of freedom for a paired t-test is:

The remaining two types belong to the independent t-tests. The samples of these types are selected independent of each other—that is, the data sets in the two groups don’t refer to the same values. They include cases like a group of 100 patients being split into two sets of 50 patients each. One of the groups becomes the control group and is given a placebo, while the other group receives the prescribed treatment. This constitutes two independent sample groups which are unpaired with each other.


MATERİALLAR VƏ METODLAR

Study sites and sample collection.

Human and animal wastewater, freshly voided animal fecal samples, and surface waters potentially impacted by waste discharges or runoff from a variety of well-defined land uses were collected and analyzed by The University of North Carolina (UNC) Department of Environmental Sciences and Engineering and the University of Massachusetts (UMass) Department of Civil and Environmental Engineering. Samples were collected from surface water sites monthly for 40 months. A subset of surface water samples was also collected during or just following precipitation events (storm samples). At UNC, storm samples were collected with ISCO (Lincoln, Nebr.) automatic samplers that were triggered when the stream height increased by 0.5 in. Analyzed storm samples represented a composite of the storm hydrograph. Storm samples were collected manually at UMass within 24 h of a precipitation event that exceeded 0.1 in.

Freshly voided feces (50 g) and liquid wastewater samples (500 ml) were collected aseptically from a variety of feral and domestic animals, from cattle and swine waste lagoons, and from human wastewater treatment plants (WWTP). In addition, surface waters (2-liter samples) were collected from sites identified as being potentially impacted by urban or rural human land use (municipal sewage effluents or septic systems, respectively) or agricultural land use (swine or cattle farms). For each surface water study site, an upstream or background station was identified and sampled on the same day. All samples were collected and transported to the laboratory in sterile, wide-mouth, high-density polyethylene bottles on ice or commercial freezer packs and analyzed within 24 h (WWTP, waste lagoon, and surface water samples) or 72 h (solid wastes) of sample collection. Data recorded at the time of analysis included the sampling site, animal species, or waste source associated with the sample or sampling site, the date of collection, and whether the sample was collected during a storm event.

F+ coliphage isolation and serotyping.

F+ coliphages were enumerated by direct plating of serial dilutions (wastes and wastewater) or cellulose membrane filter adsorption-elution concentration (surface water), followed by double or single agar layer plaque assay methods (U.S. Environmental Protection Agency method 1602) (29, 30). When available, up to 10 coliphage isolates were removed from the sample agar, suspended in phosphate-buffered saline (PBS) containing 20% glycerol, and stored at �ଌ until further analysis. F+ RNA and DNA coliphages were distinguished by spotting (5 μl) and incubation of serial dilutions (10 𢄢 , 10 𢄤 , and 10 𢄦 ) of the isolated F+ coliphage suspended in PBS on nutrient agar-host (E. coli Famp) plates (control) or nutrient agar-host plates containing RNase (experimental) for 12 to 16 h. Phage growth on both the control and experimental plates at all dilutions was indicative of F+ DNA phage. A type strain group I coliphage, MS2 (previously molecularly characterized), was used as a positive F+ RNA control, and PBS was used as a negative control. F+ RNA phage isolates were serotyped to group phages into the following categories: group I (MS2), group II (GA), group III (Qβ), and group IV (SP). Briefly, serial dilutions of the field F+ RNA isolate were plated in 5-μl spots on nutrient agar-E. coli Famp host plates containing neutralizing antisera to MS2, GA, Qβ, or SP coliphages. Failure to propagate at all dilutions in the presence of an antiserum was recorded as a positive serogroup identification.

Statistical analysis.

The results of all isolate evaluations were entered into a database and examined for bivariate associations with recorded sample data. When stream data were entered into the database, zero was entered when F+ coliphages were below the detection limit. When the density of coliphages detected exceeded the countable range, no density entry was made in the database however, a second variable was assigned that recorded whether phages were detected or not. The distribution of the stream coliphage density data (PFU per liter) was evaluated for log normalcy with a Kolmogorov Smirnov test prior to statistical testing. This distribution was used to estimate the density of coliphages among samples that exceeded the countable range. Paired t tests were used to compare the log10 geometric means of the density data grouped by land use impact. A chi-square or Fisher exact test was used to evaluate potentially significant associations between frequencies of coliphage detection and proportions of coliphage serogroups among land use categories. All statistical tests were evaluated at the 95% confidence level.


Presenting the results of a t-test

When reporting your t-test results, the most important values to include are the t-dəyər, the səh-dəyər, və degrees of freedom for the test. These will communicate to your audience whether the difference between the two groups is statistically significant (a.k.a. that it is unlikely to have happened by chance).

You can also include the summary statistics for the groups being compared, namely the mean and standard deviation. In R, the code for calculating the mean and the standard deviation from the data looks like this:

flower.data %>%
group_by(Species) %>%
summarize(mean_length = mean(Petal.Length),
sd_length = sd(Petal.Length))

In our example, you would report the results like this:


Luria-Delbrück & the Fluctuation Test

A phenomenon that was observed from the very early days of d'Herelle's work was the occurrence, on bacterial plates that were infected with high amounts of phages so as to completely lyse the bacteria, of bacterial colonies that were resistant to phage infection. Ultimately, the question became “Are these bacterial mutants that exist prior to phage infection, or is the resistance somehow caused by the infection process itself, in a few of the bacteria?”

Salvador Luria (1984) conceived of an experiment that would distinguish these possibilities. Luria reasoned that if he divided a bacterial culture into multiple aliquots and grew them individually, then, if mutation happened to bacteria without the presence of phages, the process would occur randomly some of these cultures would have no mutations, but in others mutation might occur soon after growth began, and those mutants would reproduce throughout the incubation of the culture, producing a clone of phage-resistant bacteria. If he then plated these separate cultures along with high numbers of phages, cultures that had no or late-occurring mutations would show, on average, only a few resistant colonies. However, any cultures in which mutation occurred early in the incubation period would show a large number of phage-resistant colonies because the early-forming mutants had time to produce many descendants during the incubation.

If, on the other hand, resistance to phage lysis occurred only by interaction with the phage, those events would be rare and independent, and their distribution among the bacterial plates would follow the Poisson distribution – with no plates showing large numbers of phage-resistant colonies. Luria performed the experiment multiple times, and the distribution showed occasional plates with very large numbers of phage-resistant colonies, the expected result for the hypothesis that bacteria mutate to phage resistance independent of the presence of phages. Delbrück, with whom Luria had been collaborating, formalized the mathematical treatment and published the work, now known as the “fluctuation test” (Luria & Delbrück, 1943). This paper was a watershed in the development of molecular biology because it showed the existence of independent mutation in bacteria (Luria, 2007).


Transgender Ideology Is Riddled With Contradictions. Here Are the Big Ones.

COMMENTARY BY

Former Senior Research Fellow

Now, activists claim that gender identity is destiny, while biological sex is the social construct. itakdalee/Getty Images

People say that we live in a postmodern age that has rejected metaphysics. That’s not quite true.

We live in a postmodern age that promotes an alternative metaphysics. As I explain in “When Harry Became Sally,” at the heart of the transgender moment are radical ideas about the human person—in particular, that people are what they claim to be, regardless of contrary evidence. A transgender boy is a boy, not merely a girl who identifies as a boy.

It’s understandable why activists make these claims. An argument about transgender identities will be much more persuasive if it concerns who someone is, not merely how someone identifies. And so the rhetoric of the transgender moment drips with ontological assertions: People are the gender they prefer to be. That’s the claim.

Transgender activists don’t admit that this is a metaphysical claim. They don’t want to have the debate on the level of philosophy, so they dress it up as a scientific and medical claim. And they’ve co-opted many professional associations for their cause.

Thus the American Psychological Association, in a pamphlet titled “Answers to Your Questions about Transgender People, Gender Identity, and Gender Expression,” tells us, “Transgender is an umbrella term for persons whose gender identity, gender expression, or behavior does not conform to that typically associated with the sex to which they were assigned at birth.”

Notice the politicized language: A person’s sex is “assigned at birth.” Back in 2005, even the Human Rights Campaign referred instead to “birth sex” and “physical sex.”

The phrase “sex assigned at birth” is now favored because it makes room for “gender identity” as the real basis of a person’s sex.

In an expert declaration to a federal district court in North Carolina concerning H.B. 2, Dr. Deanna Adkins stated, “From a medical perspective, the appropriate determinant of sex is gender identity.” Adkins is a professor at Duke University School of Medicine and the director of the Duke Center for Child and Adolescent Gender Care (which opened in 2015).

Adkins argues that gender identity is not only the preferred basis for determining sex, but “the only medically supported determinant of sex.” Every other method is bad science, she claims: “It is counter to medical science to use chromosomes, hormones, internal reproductive organs, external genitalia, or secondary sex characteristics to override gender identity for purposes of classifying someone as male or female.”

This is a remarkable claim, not least because the argument recently was that gender is only a social construct, while sex is a biological reality. Now, activists claim that gender identity is destiny, while biological sex is the social construct.

Adkins doesn’t say if she would apply this rule to all mammalian species. But why should sex be determined differently in humans than in other mammals? And if medical science holds that gender identity determines sex in humans, what does this mean for the use of medicinal agents that have different effects on males and females? Does the proper dosage of medicine depend on the patient’s sex or gender identity?

But what exactly is this “gender identity” that is supposed to be the true medical determinant of sex? Adkins defines it as “a person’s inner sense of belonging to a particular gender, such as male or female.”

Note that little phrase “such as,” implying that the options are not necessarily limited to male or female. Other activists are more forthcoming in admitting that gender identity need not be restricted to the binary choice of male or female, but can include both or neither. The American Psychological Association, for example, defines “gender identity” as “a person’s internal sense of being male, female, or something else.”

Adkins asserts that being transgender is not a mental disorder, but simply “a normal developmental variation.” And she claims, further, that medical and mental health professionals who specialize in the treatment of gender dysphoria are in agreement with this view.

Transgender Catechism

These notions about sex and gender are now being taught to young children. Activists have created child-friendly graphics for this purpose, such as the “Genderbread Person.” The Genderbread Person teaches that when it comes to sexuality and gender, people have five different characteristics, each of them falling along a spectrum.

There’s “gender identity,” which is “how you, in your head, define your gender, based on how much you align (or don’t align) with what you understand to be the options for gender.” The graphic lists “4 (of infinite)” possibilities for gender identity: “woman-ness,” “man-ness,” “two-spirit,” or “genderqueer.”

The second characteristic is “gender expression,” which is “the way you present gender, through your actions, dress, and demeanor.” In addition to “feminine” or “masculine,” the options are “butch,” “femme,” “androgynous,” or “gender neutral.”

Third is “biological sex,” defined as “the physical sex characteristics you’re born with and develop, including genitalia, body shape, voice pitch, body hair, hormones, chromosomes, etc.”

The final two characteristics concern sexual orientation: “sexually attracted to” and “romantically attracted to.” The options include “Women/Females/Femininity” and “Men/Males/Masculinity.” Which seems rather binary.

The Genderbread Person tries to localize these five characteristics on the body: gender identity in the brain, sexual and romantic attraction in the heart, biological sex in the pelvis, and gender expression everywhere.

The Genderbread Person espouses the latest iteration of transgender ideology. (Photo: Sam Killerman/It’s Prounounced Metrosexual)

The Genderbread Person presented here is version 3.3, incorporating adjustments made in response to criticism of earlier versions. But even this one violates current dogma. Some activists have complained that the Genderbread Person looks overly male.

A more serious fault in the eyes of many activists is the use of the term “biological sex.” Time magazine drew criticism for the same transgression in 2014 after publishing a profile of Laverne Cox, the “first out trans person” to be featured on the cover.

At least the folks at Time got credit for trying to be “good allies, explaining what many see as a complicated issue,” wrote Mey Rude in an article titled “It’s Time for People to Stop Using the Social Construct of ‘Biological Sex’ to Defend Their Transmisogyny.” (It’s hard to keep up with the transgender moment.)

But Time was judged guilty of using “a simplistic and outdated understanding of biology to perpetuate some very dangerous ideas about trans women,” and failing to acknowledge that biological sex “isn’t something we’re actually born with, it’s something that doctors or our parents assign us at birth.”

Today, transgender “allies” in good standing don’t use the Genderbread Person in their classrooms, but opt for the “Gender Unicorn,” which was created by Trans Student Educational Resources. It has a body shape that doesn’t appear either male or female, and instead of a “biological sex” it has a “sex assigned at birth.”

Those are the significant changes to the Genderbread Person, and they were made so that the new graphic would “more accurately portray the distinction between gender, sex assigned at birth, and sexuality.”

According to Trans Student Education Resources, “Biological sex is an ambiguous word that has no scale and no meaning besides that it is related to some sex characteristics. It is also harmful to trans people. Instead, we prefer ‘sex assigned at birth’ which provides a more accurate description of what biological sex may be trying to communicate.”

The Gender Unicorn is the graphic that children are likely to encounter in school. These are the dogmas they are likely to be catechized to profess.

The Gender Unicorn is used to avoid using a male or female body as default. (Photo: Landyn Pan and Anna Moore/Trans Student Educational Resources)

While activists claim that the possibilities for gender identity are rather expansive—man, woman, both, neither—they also insist that gender identity is innate, or established at a very young age, and thereafter immutable.

Dr. George Brown, a professor of psychiatry and a three-time board member of the World Professional Association for Transgender Health, stated in his declaration to the federal court in North Carolina that gender identity “is usually established early in life, by the age of 2 to 3 years old.”

Addressing the same court, Adkins asserted that “evidence strongly suggests that gender identity is innate or fixed at a young age and that gender identity has a strong biological basis.” (At no point in her expert declaration did she cite any sources for any of her claims.)

Transgender Contradictions

If the claims presented in this essay strike you as confusing, you’re not alone. The thinking of transgender activists is inherently confused and filled with internal contradictions. Activists never acknowledge those contradictions. Instead, they opportunistically rely on whichever claim is useful at any given moment.

Here I’m talking about transgender activists. Most people who suffer from gender dysphoria are not activists, and many of them reject the activists’ claims. Many of them may be regarded as victims of the activists, as I show in my book.

Many of those who feel distress over their bodily sex know that they aren’t really the opposite sex, and do not wish to “transition.” They wish to receive help in coming to identify with and accept their bodily self. They don’t think their feelings of gender dysphoria define reality.

But transgender activists do. Regardless of whether they identify as “cisgender” or “transgender,” the activists promote a highly subjective and incoherent worldview.

On the one hand, they claim that the real self is something other than the physical body, in a new form of Gnostic dualism, yet at the same time they embrace a materialist philosophy in which only the material world exists. They say that gender is purely a social construct, while asserting that a person can be “trapped” in the wrong gender.

They say there are no meaningful differences between man and woman, yet they rely on rigid sex stereotypes to argue that “gender identity” is real, while human embodiment is not. They claim that truth is whatever a person says it is, yet they believe there’s a real self to be discovered inside that person.

They promote a radical expressive individualism in which people are free to do whatever they want and define the truth however they wish, yet they try ruthlessly to enforce acceptance of transgender ideology.

It’s hard to see how these contradictory positions can be combined. If you pull too hard on any one thread of transgender ideology, the whole tapestry comes unraveled. But here are some questions we can pose:

If gender is a social construct, how can gender identity be innate and immutable? How can one’s identity with respect to a social construct be determined by biology in the womb? How can one’s identity be unchangeable (immutable) with respect to an ever-changing social construct? And if gender identity is innate, how can it be “fluid”?

The challenge for activists is to offer a plausible definition of gender and gender identity that is independent of bodily sex.

Is there a gender binary or not? Somehow, it both does and does not exist, according to transgender activists. If the categories of “man” and “woman” are objective enough that people can identify as, and be, men and women, how can gender also be a spectrum, where people can identify as, and be, both, or neither, or somewhere in between?

What does it even mean to have an internal sense of gender? What does gender feel like? What meaning can we give to the concept of sex or gender—and thus what internal “sense” can we have of gender—apart from having a body of a particular sex?

Apart from having a male body, what does it “feel like” to be a man? Apart from having a female body, what does it “feel like” to be a woman? What does it feel like to be both a man and a woman, or to be neither?

The challenge for the transgender activist is to explain what these feelings are like, and how someone could know if he or she “feels like” the opposite sex, or neither, or both.

Even if trans activists could answer these questions about feelings, that still wouldn’t address the matter of reality. Why should feeling like a man—whatever that means—make someone a man? Why do our feelings determine reality on the question of sex, but on little else? Our feelings don’t determine our age or our height. And few people buy into Rachel Dolezal’s claim to identify as a black woman, since she is clearly not.

If those who identify as transgender are the sex with which they identify, why doesn’t that apply to other attributes or categories of being? What about people who identify as animals, or able-bodied people who identify as disabled? Do all of these self-professed identities determine reality? Yoxdursa, niyə də olmasın?

And should these people receive medical treatment to transform their bodies to accord with their minds? Why accept transgender “reality,” but not trans-racial, trans-species, and trans-abled reality?

The challenge for activists is to explain why a person’s “real” sex is determined by an inner “gender identity,” but age and height and race and species are not determined by an inner sense of identity.

Of course, a transgender activist could reply that an “identity” is, by definition, just an inner sense of self. But if that’s the case, gender identity is merely a disclosure of how one feels. Saying that someone is transgender, then, says only that the person has feelings that he or she is the opposite sex.

Gender identity, so understood, has no bearing at all on the meaning of “sex” or anything else. But transgender activists claim that a person’s self-professed “gender identity” is that person’s “sex.”

The challenge for activists is to explain why the mere feeling of being male or female (or both or neither) makes someone male or female (or both or neither).

Gender identity can sound a lot like religious identity, which is determined by beliefs. But those beliefs don’t determine reality. Someone who identifies as a Christian believes that Jesus is the Christ. Someone who identifies as a Muslim believes that Muhammad is the final prophet. But Jesus either is or is not the Christ, and Muhammad either is or is not the final prophet, regardless of what anyone happens to believe.

So, too, a person either is or is not a man, regardless of what anyone—including that person—happens to believe. The challenge for transgender activists is to present an argument for why transgender beliefs determine reality.

Determining reality is the heart of the matter, and here too we find contradictions.

On the one hand, transgender activists want the authority of science as they make metaphysical claims, saying that science reveals gender identity to be innate and unchanging. On the other hand, they deny that biology is destiny, insisting that people are free to be who they want to be.

Hansıdır? Is our gender identity biologically determined and immutable, or self-created and changeable? If the former, how do we account for people whose gender identity changes over time? Do these people have the wrong sense of gender at some time or other?

And if gender identity is self-created, why must other people accept it as reality? If we should be free to choose our own gender reality, why can some people impose their idea of reality on others just because they identify as transgender?

The challenge for the transgender activist is to articulate some conception of truth as the basis for how we understand the common good and how society should be ordered.

As I document in depth in “When Harry Became Sally,” the claims of transgender activists are confusing because they are philosophically incoherent. Activists rely on contradictory claims as needed to advance their position, but their ideology keeps evolving, so that even allies and LGBT organizations can get left behind as “progress” marches on.

At the core of the ideology is the radical claim that feelings determine reality. From this idea come extreme demands for society to play along with subjective reality claims. Trans ideologues ignore contrary evidence and competing interests, they disparage alternative practices, and they aim to muffle skeptical voices and shut down any disagreement.

The movement has to keep patching and shoring up its beliefs, policing the faithful, coercing the heretics, and punishing apostates, because as soon as its furious efforts flag for a moment or someone successfully stands up to it, the whole charade is exposed. That’s what happens when your dogmas are so contrary to obvious, basic, everyday truths.

A transgender future is not the “right side of history,” yet activists have convinced the most powerful sectors of our society to acquiesce to their demands. While the claims they make are manifestly false, it will take real work to prevent the spread of these harmful ideas.


Videoya baxın: Niyə rəqəmlər gördüyümüz kimidir (Iyul 2022).


Şərhlər:

  1. Louden

    Düşünürəm ki, bu artıq müzakirə olunub.

  2. Nantres

    Təbrik edirəm, doğru sözlər nədir ... gözəl fikir

  3. Tuketu

    Siz mütəxəssis deyilsiniz?

  4. Coleman

    Author, where can you find such a design? I really liked ...

  5. Iasius

    Bravo, bu ifadə yalnız doğru yerdə gəldi

  6. Oakley

    Səlahiyyətli yazı :)



Mesaj yazmaq