Məlumat

Nə üçün dəri hüceyrələrində bağlanma yeri olmayan gen çatışmazlığı ifadə oluna bilər?

Nə üçün dəri hüceyrələrində bağlanma yeri olmayan gen çatışmazlığı ifadə oluna bilər?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Məməlinin hüceyrələrində xüsusi bir genin ifadə olunması üçün genin bütün bağlanma yerləri transkripsiya aktivatorları ilə bağlanmalıdır. Məməlinin dəri hüceyrələrində B, D və E sahələrinə bağlanan aktivatorlar var, məməlinin qaraciyər hüceyrələrində isə A, C və E sahələrinə bağlanan aktivatorlar var. (Xan Akademiyasından)

Nə üçün həm Gen 2, həm də Gen 4 dəri hüceyrələrində ifadə oluna bilər? Düşünürəm ki, E saytı olmadığı üçün Gene 4 edə bilməz.


Bunu səhv başa düşürsən: Hamısı indiki genin gücləndiriciləri gücləndirici amillə bağlanmalıdır, müəyyən hüceyrə tiplərinin bütün amilləri bağlanmamalıdır. Beləliklə, dəri hüceyrələrində B, D və E üçün aktivatorlar olduqda, onlar sizin nümunənizdə 2 və 4-cü genləri aktivləşdirə bilər, lakin A və C üçün aktivatorlar olmadığından 3-cü geni aktivləşdirə bilməzlər.

Beləliklə, B, D və E-nin hər hansı bir birləşməsini ehtiva edən bir geniniz olduqda, onun dəri hüceyrələrində aktivləşməsi bu modelə görə mümkündür. Eyni şey qaraciyər hüceyrələri üçün A, C və E-nin istənilən kombinasiyası üçün də keçərlidir. Xüsusi hal, tək gücləndirici olaraq E olan bir gen olardı, çünki bu, həm qaraciyərdə, həm də dəri hüceyrələrində aktivləşdirilə bilər.


Eritrojenik toksin

Eritrojenik toksinlər, streptokokların pirojenik ekzotoksinləri də adlanır, bakteriya ştammları tərəfindən ifraz olunur. Streptococcus pyogenes. [1] [2] SpeA və speC qeyri-spesifik olaraq T hüceyrələrini aktivləşdirərək və iltihablı sitokinlərin istehsalını stimullaşdıraraq iltihaba səbəb olan superantigenlərdir. [3] SpeB, ən çox yayılmış streptokokk hüceyrədənkənar protein, sistein proteazıdır. [4] [5] Pirojenik ekzotoksinlər skarlatina və streptokok zəhərli şok sindromunun törədicisi kimi göstərilir. [2] Pirojenik ekzotoksinlərin dəqiq sayı ilə bağlı konsensus yoxdur. A-C serotipləri [ aydınlaşdırma tələb olunur ] ən geniş şəkildə öyrənilmiş və bütün mənbələr tərəfindən tanınmışdır, lakin digərləri speM vasitəsilə speF-ni əlavə superantigenlər kimi təsnifləşdirərək on üçə qədər fərqli növü qeyd edirlər. [1] [2] [6] [7]

Eritrojenik toksinlərin dəri altındakı qan kapilyarlarının plazma membranlarını zədələdiyi və qırmızı dəri döküntüsü (skarlatina üçün xarakterik) əmələ gətirdiyi məlumdur. [8] Keçmiş tədqiqatlar göstərmişdir ki, eritrogen toksinlərin ştammından asılı olaraq bir çox variant istehsal oluna bilər. S. pyogenes sual altında. Bəzi suşlar ümumiyyətlə aşkar edilə bilən toksin istehsal etməyə bilər. [9] Bakteriofaq T12 infeksiyası S. pyogenes speA istehsalına imkan verir və virulentliyi artırır. [10]


Şəkil 2.6.1:lak Operon

  • lakZ üçün kodlar b-qalaktosidaza, b-qalaktozidləri (məsələn, laktoza) parçalayan bir fermentdir.
  • lakY üçün kodlar nüfuz etmək, b -qalaktozidlərin hüceyrəyə daşınmasında iştirak edir.
  • lakA üçün kodlar b -qalaktozid transasetilaz, b -qalaktozidləri asetilləşdirir.
  • Hər ikisində mutasiya lak Z və ya lak Y a səbəb ola bilər lak - genotip, yəni. b-qalaktozidlərdən qida kimi istifadə edə bilməyən hüceyrələr.
  • A lak Transasetilaz aktivliyi olmayan A- mutant hələ də b-qalaktozidlərdən istifadə edə bilir (hələ də lak+ genotipdir). Onun b&şiqalaktozidlərin metabolizmində rolu aydın deyil.

Promoter

transkripsiyaya başlamaq üçün RNT polimerazının bağlanmasında iştirak edən DNT bölgəsi.

Terminator

RNT polimerazanın transkripsiyanı dayandırmasına səbəb olan DNT ardıcıllığı.

  • Üç genin çoxluğu, lakZYA, tək mRNT-yə transkripsiya olunur (polikistronik mesaj) a təşviqatçı yalnız yuxarı axın lak Z geni.
  • İçində yoxluq bir induktor gen klasteridir yox transkripsiya edilmişdir.
  • Nə vaxt bir induktor əlavə olunur (məs. laktoza və ya hidroliz olunmayan analoq izopropil tioqalaktozid - IPTG) transkripsiya bir promotordan başlayır (lakP) və lac ZYA genləri vasitəsilə aşağı axınında yerləşən terminator ardıcıllığına keçir lak A gen.

Lac ZYA mRNA-nın yarı ömrü var

3 dəqiqə, bu, induksiyanın nisbətən sürətlə geri qaytarılmasına imkan verir (yəni induksiya dayandıqdan sonra hüceyrələr sürətlə ferment istehsal etməyi dayandırır).

Transkripsiya tənzimlənməsinə (yəni, lak operonun induksiyası) təsir etmək üçün induktor (laktoza) hansı molekulla qarşılıqlı təsir göstərir?

Bu, b-qalaktosidaza, permaz və ya transasetilaz deyil, repressor zülalı adlanan ayrıca bir proteindir.

  • Lak genləri adlı mexanizm tərəfindən idarə olunur mənfi tənzimləmə.
    • Bu o deməkdir ki tənzimləyici zülal tərəfindən söndürülmədikcə onlar transkripsiya edilir .
    • Bir mutasiya tənzimləyici proteini təsirsiz hala gətirir səbəb olur lakZYA genləri olacaq davamlı olaraq ifadə edilir.

    Lac operonda iki növ gen var:

    1. Struktur genlər - onlar bəzi biokimyəvi yol üçün tələb olunan fermentləri kodlayırlar (məsələn, lac Z, Y və A).
    2. Tənzimləyici genlər - onlar struktur genlərin tənzimlənməsində iştirak edən zülalları kodlayırlar.

    lak I lak operonun tənzimləyici genidir.

    • Bu gen lak struktur genləri üçün promotor bölgənin yuxarı hissəsində yerləşir.
    • The lak Mən geninin özünəməxsusluğu var təşviqatçı (konstitutiv) və terminator.
    • O, monosistronik bir mesaj verir və bir proteini kodlayır lak repressor protein.
    1. Transkripsiyaya mane ola bilər
    2. Kiçik molekul induktorunu (laktoza və ya IPTG) tanıya və bağlaya bilər.

    Lak repressor tərəfindən transkripsiyanın qarşısının alınması

    • lak repressor (a kimi aktivdir tetramerik zülal) adlı DNT ardıcıllığına bağlanır operator (lak O bölgə).
      • Operator bölgəsi arasında yerləşir lak promotor bölgəsi (RNT polimerazanın bağlanması və transkripsiyanın başlanması yeri) və lak Z geni.
      • İlk 26 baza cütü lak Z geni operator bölgəsini təşkil edir.
      • Söhbət ondan getmir ki, repressor zülal RNT polimerazanın hərəkətini "bloklayır" lak Z geni.
      • Repressor bağlanması və RNT polimeraz bağlanması (promotorla) olur bir-birini istisna edən da, də lak promotor/operator (lak PO) bölgə.

      İnduktor molekulunun iştirakı ilə repressor/operator qarşılıqlı təsiri necə dəyişir?

      • The induktor əmələ gətirmək üçün repressorla birləşə bilər operatorla artıq əlaqəli olmayan repressor/induktor kompleksi .
        • Bu qarşılıqlı əlaqənin əsas xüsusiyyəti ondan ibarətdir ki repressor zülalının iki bağlanma yeri var , biri üçün induktor və operator üçün bir.
        • İnduktor öz yerində bağlandıqda, repressor zülalının konformasiyasını elə dəyişir ki, operatorun bağlanma sahəsi DNT operatoru bölgəsinə çox azaldılmış yaxınlığa malikdir.
        • Bu növ nəzarət adlanır allosterik nəzarət .
        • Nəticə belədir induktor əlavə edildikdə repressor operatordan buraxılan formaya çevrilir .

        Şəkil 2.6.2:İnduktor

        Lak operonun müsbət nəzarəti cAMP-CAP kompleksi tərəfindən həyata keçirilir

        • E. coli üstünlük verir qlükoza digər karbon mənbələri üzərində.
        • Nə vaxt E. coli başqa şəkər (məsələn, laktoza) əlavə edilərsə, qlükoza üzərində yetişdirilir Digər şəkərdən istifadə etmək üçün fermentlərin induksiyası qlükoza tükənənə qədər baş vermir.
        • E. coli qlükoza ac qaldıqda qeyri-adi bir nukleotid sintez edir: siklik 3'5' adenozin monofosfat (tsiklik AMP və ya cAMP ):

        Şəkil 2.6.3:cAMP

        1. Bakteriyalarda cAMP səviyyəsində artım aşağı qlükoza səviyyəsini göstərən "alert" siqnalı kimi görünür:

        Şəkil 2.6.4:cAMP səviyyəsinin və lak operonun qarşılıqlı əlaqəsi

        Dibutiril cAMP

        • bir analoq keçə bilən cAMP E. coli membrana və hüceyrəyə daxil olur.
        • Bu, tərkibində qlükoza və laktoza olan mühitə əlavə olunarsa, bu, nəticə verəcəkdir induksiya -nin lak operon.
        • Beləliklə, o, aldadan kimyəvi mesajı təqlid edir E. coli qlükoza səviyyələri olduğu kimi cavab vermək aşağı.
        • mutantları E. coli metabolizə oluna bilməyən təcrid edilmişdir hər hansı qlükozadan başqa şəkər. Mutantların iki ümumi kateqoriyası var idi:
        1. I sinif. Fermentdə qüsur adenilat siklaza. Bu mutantlar qlükoza konsentrasiyası aşağı olduqda belə cAMP yarada bilmirlər.
        2. II sinif. kimi tanınan xüsusi bir protein yoxdur cAMP reseptor zülalı (CRP) və ya katabolit reseptor zülalı (CRP) kimi də tanınır.
        • Maksimum transkripsiya lak operon a varlığını tələb edir cAMP/CRP kompleks.
          • cAMP/CRP kompleksi lak nəzarət bölgəsində " adlanan xüsusi ardıcıllıqla bağlanırCAP" saytı.
          • CAP saytı sadəcə yuxarı RNT polimerazanın bağlanma yerindən.
          • cAMP-CRP-nin bağlanmasına mane olan CAP sahəsindəki mutasiyalar həm də yüksək səviyyəli ifadənin qarşısını alır lak operon.
          • cAMP/CRP kompleksi DNT və RNT pol üçün yaxınlığa malikdir.
          • DNT promotor bölgəsi ilə RNT polunun kompleks formalaşmasını gücləndirir.

          Induksiyası lak laktoza analoqları ilə operon

          • The lak operon ilə induksiya edilə bilər laktoza
            • b-qalaktosidaza (lakZ gen məhsulu) laktoza metabolizə edir
            • Laktoza səviyyəsi azaldıqda lak operon yenidən repressiyaya məruz qalır lak repressor (lakmən gen məhsulum)
            • izopropil b -tioqalaktozid və ya IPTG, metabolizə olunmayan laktoza analoqudur

            DNT "ayaq izi" təcrübələri

            • Əgər zülal DNT-nin bir bölgəsinə bağlanırsa, DNT-nin həmin bölgəsini dnase tərəfindən həzmdən qoruya bilər (DNTaz I: pirimidin nukleotidlərinə bitişik yerlərdə endonükleaz).
              • DNT fraqmenti 5' uclarında 32 P ilə etiketlənə bilər və sonra müvafiq məhdudlaşdırıcı endonükleaz vasitəsilə etiket üstünlük olaraq bir ucundan (yəni genin 3' ucu) çıxarıla bilər.
              • Bu DNT fraqmenti, bir xüsusi ucunda etiketlə, DNT bağlayıcı zülal ilə kompleks əmələ gətirirsə, zülal bağlandığı DNT bölgəsini DNTaz I həzmindən qoruyacaqdır.
              • Həzm tam olmamaq üçün həyata keçirilir, bu müzakirənin məqsədləri üçün hər bir DNT molekulunun yalnız bir dəfə parçalandığını təsəvvür edin. Bundan əlavə, parçalanma yeri mövcud yerlərdən təsadüfi olaraq seçilir.
              • Həzm edildikdən sonra ölçüsünə görə ayrılan və təhlil edilən (gel elektroforezindən istifadə etməklə) DNT fraqmentləri qorunan bölgəni göstərəcək:

              Şəkil 2.6.5:DNT izi

              İzləmə təcrübələrinin nəticələri

              lak cAMP/CAP zülalı və ya RNT polimeraza və ya lac I repressor zülalı ilə inkubasiya edilmiş DNT:

              Şəkil 2.6.6:cAMP ilə lak repressor

              RNT polimeraza xüsusi promotor ardıcıllığı ilə qarşılıqlı əlaqədə olur və bir bölgə üzərində "ayaq izi" əmələ gətirir.

              • Bu qorunmanın bir teldə digərinə nisbətən daha aydın olduğu müşahidə edildi (yəni, digər tel etiketlənsəydi, nəticələr o qədər də qorunma göstərmədi).
              • DNT-azanın qorunmasının bu bölgəsinə DNT-də mutagenez eksperimentləri nəticəsində promotor gücünün ya "up" tənzimləməsi və ya "down" tənzimlənməsi əmələ gələn sahələr daxildir.
              • Promotorun gücünə təsir edən bu mutagen "hot" ləkələri transkripsiyanın başlanğıc yerindən yuxarı axın -10 və ya -30 mövqelərində yerləşirdi (yuxarıdakı diaqramda mövqe +1):

              Şəkil 2.6.7:Promoter Gücü Mutasiyalar

              • Promouterləri "güclərinə" görə təsnif etmək olar.
              • Bu qohuma aiddir transkripsiyanın başlama tezliyi (dəqiqədə transkripsiya başlanğıc hadisələri) və ilə əlaqədardır RNT polimerazanın promotor bölgəyə yaxınlığı.
              • Bir çox promouterlər E. coli səciyyələndirilmiş və "consensus" təşviqat ardıcıllığı müəyyən edilmişdir:

              Şəkil 2.6.8:Konsensus Promoter Gücü


              Eukaryotik Transkripsiya Gen Tənzimlənməsi

              Prokaryotik hüceyrələr kimi, eukariotlarda genlərin transkripsiyası transkripsiyaya başlamaq üçün genin yuxarı axınında bir ardıcıllığa bağlanmaq üçün RNT polimerazın hərəkətlərini tələb edir. Bununla birlikdə, prokaryotik hüceyrələrdən fərqli olaraq, eukaryotik RNT polimeraza transkripsiyanın başlamasını asanlaşdırmaq üçün digər zülallara və ya transkripsiya faktorlarına ehtiyac duyur. Transkripsiya faktorları ilə bağlanan zülallardır təşviqatçı hədəf genin transkripsiyasına nəzarət etmək üçün ardıcıllıq və digər tənzimləyici ardıcıllıqlar. RNT polimeraza özü eukaryotik hüceyrələrdə transkripsiyaya başlaya bilməz. Transkripsiya faktorları əvvəlcə promotor bölgəyə bağlanmalı və transkripsiyanın qurulması üçün RNT polimerazanı sahəyə cəlb etməlidir.

              DNT şablonundan RNT-nin transkripsiyası və hazırlanması prosesinə baxın:

              YouTube elementi mətnin bu versiyasından çıxarılıb. Onu onlayn olaraq buradan görə bilərsiniz: pb.libretexts.org/biowm/?p=196

              Promoter və Transkripsiya Maşınları

              Şəkil 3. Gücləndirici transkripsiyanı təşviq edən DNT ardıcıllığıdır. Hər bir gücləndirici distal nəzarət elementləri adlanan qısa DNT ardıcıllığından ibarətdir. Distal nəzarət elementlərinə bağlı aktivatorlar vasitəçi zülallar və transkripsiya faktorları ilə qarşılıqlı əlaqədə olurlar. İki fərqli gen eyni promotora malik ola bilər, lakin diferensial gen ifadəsini təmin edən fərqli distal nəzarət elementləri ola bilər.

              Genlər, gen ifadəsinə nəzarəti asanlaşdırmaq üçün təşkil edilir. The təşviqat bölgəsi kodlaşdırma ardıcıllığının dərhal yuxarı axınındadır. Promotorun məqsədi transkripsiyanın başlamasına nəzarət edən transkripsiya faktorlarını bağlamaqdır.

              Gücləndiricilər və Transkripsiya

              Bəzi eukaryotik genlərdə transkripsiyanı artırmağa və ya gücləndirməyə kömək edən bölgələr var. Bu bölgələrə deyilir gücləndiricilər, gücləndirdikləri genlərə mütləq yaxın deyil. Onlar genin yuxarı axınında, genin kodlaşdırma bölgəsində, genin aşağı axınında və ya minlərlə nukleotid məsafəsində yerləşə bilər. Gücləndirici bölgələr transkripsiya amilləri üçün məcburi ardıcıllıqlar və ya saytlardır. DNT əyilmə zülalı bağlandıqda, DNT-nin forması dəyişir (Şəkil 3). Bu forma dəyişikliyi qarşılıqlı əlaqə yaratmağa imkan verir aktivatorlar promotor bölgəsinə və RNT polimerazına bağlı transkripsiya faktorları ilə gücləndiricilərə bağlanır.

              Genləri söndürmək: Transkripsiya Repressorları

              Prokaryotik hüceyrələr kimi, eukaryotik hüceyrələr də transkripsiyanın qarşısını alan mexanizmlərə malikdir. Transkripsiya repressorlar promotor və ya gücləndirici bölgələrə bağlana və transkripsiyanı bloklaya bilər. Transkripsiya aktivatorları kimi, repressorlar da aktivləşdirici transkripsiya faktorlarının bağlanmasının qarşısını almaq üçün xarici stimullara cavab verirlər.

              Transkripsiyaya başlamaq üçün transkripsiya faktorları əvvəlcə promotora bağlanmalı və RNT polimerazanı həmin yerə cəlb etməlidir. Promotor ardıcıllığına əlavə olaraq, gücləndirici bölgələr transkripsiyanı artırmağa kömək edir. Gücləndiricilər yuxarı, aşağı axın, genin özündə və ya digər xromosomlarda ola bilər. Transkripsiya faktorları transkripsiyanı artırmaq və ya qarşısını almaq üçün gücləndirici bölgələrə bağlanır.

              Transkripsiyanın başlaması üçün ________-nin bağlanması tələb olunur.

              [reveal-answer q=&rdquo670222&Prime]Cavabı göstər[/reveal-answer]
              [gizli-cavab a=&rdquo670222&Prime]Cavab c. Transkripsiyanın başlaması üçün RNT polimerazının bağlanması lazımdır.

              Transkripsiya faktorunun gücləndirici bölgəyə bağlanması nə ilə nəticələnəcək?

              1. bitişik genin transkripsiyasının azalması
              2. uzaq bir genin transkripsiyasının artması
              3. bitişik genin tərcüməsinin dəyişdirilməsi
              4. RNT polimerazanın işə salınmasının başlanması

              [reveal-answer q=&rdquo829037&Prime]Cavabını göstər[/reveal-answer]
              [gizli-cavab a=&rdquo829037&Prime]Cavab b. Uzaq genin transkripsiyasının artması transkripsiya faktorunun gücləndirici bölgəyə bağlanması nəticəsində baş verəcəkdir.

              Promotor bölgəsindəki mutasiya bir genin transkripsiyasını dəyişə bilər. Bunun necə baş verə biləcəyini təsvir edin.

              [təcrübə sahəsi sətirləri=&rdquo2&Prime][/təcrübə sahəsi]
              [reveal-answer q=&rdquo332179&Prime]Cavabını göstər[/reveal-answer]
              [gizli cavab a=&rdquo332179&Prime]Promotor bölgəsindəki mutasiya transkripsiyanı artırmaq üçün adətən bağlanan transkripsiya faktorunun bağlanma yerini dəyişə bilər. Mutasiya ya transkripsiya faktorunun bağlanma qabiliyyətini azalda, bununla da transkripsiyanı azalda bilər, ya da transkripsiya faktorunun bağlanma qabiliyyətini artıraraq transkripsiyanı artıra bilər.

              Hüceyrədə həddindən artıq aktivləşdirici transkripsiya faktoru varsa nə baş verə bilər?

              [təcrübə sahəsi sətirləri=&rdquo2&Prime][/təcrübə sahəsi]
              [reveal-answer q=&rdquo162780&Prime]Cavabını göstər[/reveal-answer]
              [gizli-cavab a=&rdquo162780&Prime]Əgər aktivləşdirici transkripsiya faktorunun çoxu varsa, o zaman hüceyrədə transkripsiya artırılacaq. Bu, hüceyrə funksiyasında dramatik dəyişikliklərə səbəb ola bilər. [/gizli-cavab]


              DNT Təmir Fermentləri: Hüceyrə, Molekulyar və Kimyəvi Biologiya

              Jaklin K. Barton,. Elizabeth Oɻrien, Enzimologiyada Metodlar, 2017

              3.2 TBP Bağlama Fəaliyyətinin Aşkarlanması

              Transkripsiya aktivatoru TBP, TBP-nin bağlanması ilə bağlı DNT yığılmasında böyük pozğunluğu nəzərə alaraq, DNT ilə dəyişdirilmiş elektrodlarda asanlıqla aşkar edilmişdir. TBP DNT-də TATA ardıcıllığına bağlanır və həmin yerdə spiral 80 dərəcə əyilir, bu da DNT vasitəçiliyi ilə siqnalın əhəmiyyətli dərəcədə zəifləməsinə səbəb olur. Xüsusi TBP bağlama yerinə (5′-TATAAAG-3') bağlanan və DNT-ni bükən TBP varlığında, yük yığılması əhəmiyyətli dərəcədə zəifləyir (Furst et al., 2013). Protein bağlanması, DNT-ni bükməkdə, DNT CT-ni söndürən açar rolunu oynayır. DNT-yə bağlanmayan BSA heç bir siqnal dəyişikliyi göstərmir.

              TBP bağlama yerləri (5′-TATAAAG-3') ilə MB-dəyişdirilmiş DNT

              Birləşmə üçün dəyişdirilmiş MB boyası daha əvvəl təsvir edildiyi kimi sintez edilmişdir (Peeney & Barton, 2012)

              TBP (ProteinOne), istifadə olunana qədər - 80°C-də saxlanılır

              BSA (New England Biolabs), istifadə olunana qədər - 20°C-də saxlanılır

              On altı elektrodlu multipleks çip

              CH760B Elektrokimyəvi Analizator və 16 kanallı multipleksor modulu (CH Alətləri)

              Ag/AgCl istinad elektrodu

              Pt tel sayğac elektrodu

              Tris tamponu (10 mM Tris, 100 mM KCl, 2,5 mM MgCl2, 1 mM CaCl2, pH 7.6)

              DNT fosfat tamponu (5 mM natrium fosfat, 50 mM NaCl, pH 7.0)

              TBP bağlama tamponu (5 mM natrium fosfat, 50 mM NaCl, 4 mM MgCl2, 4 mM spermidin, 50 μM EDTA, 10% qliserin, pH 7.0)

              16 elektrodlu multipleks çipin təmizlənməsi və TBP bağlama testinə hazırlıq üçün Bölmə 2.2.1-ə baxın.

              Bütün elektrokimya üçün CV skanları 0 mV-dən - 500 mV-ə qədər olan potensial pəncərədə 100 mV/s tarama sürətində aparılmışdır. SWV eyni potensial diapazonda 15 Hz-də yerinə yetirildi. Siqnal ölçüsü CV katodik pik sahəsi və ya SWV pik sahəsi kimi ölçüldü.

              Bütün zülal bağlama təcrübələri üçün, merkaptoheksanol ilə doldurulduqdan sonra elektrodlar 3 μ ilə dolduruldu.M Otaq temperaturunda 45 dəqiqə ərzində fosfat tamponunda BSA. Tampon mübadiləsi ilə hərtərəfli yuyulduqdan sonra TBP bufer TBP-də fon skanları aparıldı. Boş TBP tamponunu elektrodlar üzərindəki ümumi quyudan çıxardıqdan sonra, bağlama tamponunda hədəf zülalın məhlulu əlavə edildi (ümumi həcm 200 μL).

              Bu elektrokimyəvi zülal aşkarlama sxemində zülal bağlayan bufer eyni zamanda elektrokimyəvi işləyən tampondur.


              Prokaryotik hüceyrələrdə gen ifadəsinin tənzimlənməsi transkripsiya səviyyəsində baş verir. Operonun transkripsiyasına nəzarət etməyin üç yolu var: repressiv nəzarət, aktivator nəzarəti və induksiya olunan nəzarət. Repressiv nəzarət, ilə xarakterizə olunur trp operon, RNT polimerazanın bağlanmasının və transkripsiyanın aktivləşdirilməsinin fiziki olaraq qarşısını almaq üçün operator ardıcıllığına bağlı zülallardan istifadə edir. Buna görə də, triptofana ehtiyac yoxdursa, repressor operatora bağlanır və transkripsiya sönür. CAP-ın təsiri ilə xarakterizə olunan aktivator nəzarəti, CAP bağlandıqda RNT polimerazanın promotorla bağlanma qabiliyyətini artırır. Bu halda qlükoza səviyyəsinin aşağı olması cAMP-nin CAP-a bağlanması ilə nəticələnir. CAP daha sonra promotoru bağlayır, bu da RNT polimerazanın promotorla daha yaxşı bağlanmasına imkan verir. Son misalda - the lak operon - transkripsiyaya başlamaq üçün iki şərt yerinə yetirilməlidir. Qlükoza mövcud olmamalıdır və laktoza üçün mövcud olmalıdır lak transkripsiya ediləcək operon. Qlükoza yoxdursa, CAP operatora bağlanır. Əgər laktoza varsa, repressor zülalı onun operatoruna bağlanmır. Yalnız hər iki şərt yerinə yetirildikdə, RNT polimeraza transkripsiyaya səbəb olmaq üçün promotorla birləşəcəkdir.

              Şəkil In E. coli, the trp operon defolt olaraq aktivdir lak operon söndürülüb. Sizcə niyə belədir?

              Şəkil Triptofan zülalların istehsalı üçün vacib olan bir amin turşusudur, buna görə də hüceyrənin hər zaman əlində bir az olması lazımdır. Ancaq çox miqdarda triptofan varsa, daha çox istehsal etmək israfçılıqdır və trp reseptor repressiya olunur. Süddə olan şəkər olan laktoza həmişə mövcud deyil. Mövcud olmayan bir enerji mənbəyini həzm etmək üçün lazım olan fermentləri etmək mənasızdır lak operon yalnız laktoza mövcud olduqda işə salınır.


              Gen tənzimlənməsi

              Hüceyrələr öz genlərinin yalnız bir hissəsini ifadə edir (transkripsiya edir və tərcümə edir). Hüceyrələr uyğun genlərin ifadəsini yandıraraq və ya söndürməklə ətraf mühit siqnallarına cavab verir və uyğunlaşır. Çoxhüceyrəli orqanizmlərdə müxtəlif toxuma və orqanlarda hüceyrələr fərqləndirmək, və ya bədəndəki bütün hüceyrələr (bir neçə istisna olmaqla) eyni genomlara malik olsa da, müxtəlif zülal dəstləri yaradaraq ixtisaslaşın. Gen ifadəsində belə dəyişikliklər və ya diferensial gen ifadəsi hüceyrələr arasında ən çox transkripsiya səviyyəsində tənzimlənir.
              Gen ifadəsini tənzimləyən üç geniş səviyyə var:

              • transkripsiya nəzarəti (bir genin mRNT-yə transkripsiya edilib-edilməməsi və nə qədər olması)
              • tərcümə nəzarəti (mRNT-nin zülala çevrilib-çevrilməməsi və nə qədər olması)
              • post-translational nəzarət (zülalın aktiv və ya qeyri-aktiv formada olması və zülalın sabit və ya deqradasiyası)

              Ortaq təkamül mənşəyimizə əsasən, prokaryotların və eukaryotların gen ifadəsini tənzimləmə yollarında bir çox oxşarlıqlar var, lakin bir çox fərqlər də var. Həyatın hər üç sahəsi gen ifadəsini idarə etmək üçün müsbət tənzimləmədən (gen ifadəsini açmaq), mənfi tənzimləmədən (gen ifadəsini söndürmək) və birgə tənzimləmədən (birdən çox geni birlikdə yandırmaq və ya söndürmək) istifadə edir., lakin bu işlərin prokaryotlar və eukaryotlar arasında necə həyata keçirildiyinə dair bəzi fərqlər var.

              Prokaryotlar və eukaryotlar arasındakı oxşarlıqlar: promotorlar və tənzimləyici elementlər

              Promouterlər transkripsiyaya başlamaq üçün RNT polimerazanın bağlandığı DNT-də yerlərdir. Təşviqçilər həmçinin onların yanında bağlayıcı saytları ehtiva edir transkripsiya amilləri, RNT polimerazanı işə götürməyə və ya dəf etməyə kömək edə bilən DNT bağlayıcı zülallardır. A tənzimləyici element RNT polimerazanı işə götürmək və ya dəf etmək üçün müəyyən transkripsiya faktorlarının tanıdığı və bağlandığı DNT ardıcıllığıdır. Promotor yaxınlıqdakı transkripsiya faktorunu bağlayan elementlərlə birlikdə gen transkripsiyasını tənzimləyir.
              Tənzimləyici elementlərdən hər ikisi üçün istifadə edilə bilər müsbətmənfi transkripsiya nəzarəti. Bir gen müsbət transkripsiya nəzarətinə məruz qaldıqda, müəyyən bir transkripsiya amilinin tənzimləyici elementə bağlanması transkripsiyaya kömək edir. Bir gen mənfi transkripsiya nəzarətinə məruz qaldıqda, spesifik transkripsiya amilinin tənzimləyici elementlərə bağlanması transkripsiyanı sıxışdırır. Tək bir gen müxtəlif transkripsiya faktorları ilə həm müsbət, həm də mənfi transkripsiya nəzarətinə məruz qala bilər və çoxlu tənzimləmə qatları yaradır.

              Bəzi genlər tənzimlənməyə tabe deyil: onlar konstitutiv olaraq ifadə etdi, yəni onlar həmişə transkripsiya edilir. Ətraf mühitdən və vəziyyətdən asılı olmayaraq bir hüceyrənin hər zaman hansı genlərə sahib olması lazım olduğunu təsəvvür edərdiniz?

              Prokaryotlar və eukariotlar arasındakı fərqlər: birgə tənzimləmə mexanizmləri

              Çox vaxt müəyyən bir stimula cavab vermək və ya müəyyən bir funksiyanı yerinə yetirmək üçün (məsələn, bir çox metabolik yollar) birlikdə bir zülal dəsti lazımdır. Çox vaxt belə genləri birgə tənzimləyən mexanizmlər mövcuddur ki, onların hamısı eyni stimula cavab olaraq transkripsiya edilir. Həm prokaryotik, həm də eukaryotik hüceyrələrin genləri birgə tənzimləmə yolları var, lakin bu məqsədə çatmaq üçün çox fərqli mexanizmlərdən istifadə edirlər.
              Prokaryotlarda birgə tənzimlənən genlər çox vaxt bir formada təşkil olunur operon, burada iki və ya daha çox funksional əlaqəli gen bir promotordan bir uzun mRNT-yə birlikdə transkripsiya edilir. Bu mRNT operondakı genlər tərəfindən kodlanan bütün zülalları etmək üçün tərcümə olunur. Ribosomlar 5′ sonunda başlayır, ilk AUG kodonunda tərcümə etməyə başlayır, dayanma kodonuna daxil olduqda sona çatır və sonra növbəti AUG kodonunda yenidən başlayır.

              Prokaryotlarda ümumi operon. R = tənzimləyici zülal (transkripsiya faktoru) P = promotor Pol = RNT polimeraza

              Bir neçə istisna ilə (C. elegans və əlaqəli nematodlar), eukaryotik genomlarda operonlarda düzülmüş genlər yoxdur. Bunun əvəzinə, birgə tənzimlənən eukaryotik genlər, hətta bu genlər tamamilə fərqli xromosomlarda yerləşsələr də, hər bir genlə əlaqəli eyni DNT tənzimləyici element ardıcıllığına malik olurlar. Bu o deməkdir ki, eyni transkripsiya aktivatoru və ya repressoru onunla əlaqəli xüsusi DNT tənzimləyici elementi olan hər bir genin transkripsiyasını tənzimləyə bilər. Məsələn, eukaryotik HSP (istilik şoku zülalı) genləri müxtəlif xromosomlarda yerləşir. HSP-lər hüceyrələrin sağ qalmasına və istilik şokundan (hüceyrə stressinin bir növü) bərpasına kömək edir. Bütün HSP genləri istilik stresinə cavab olaraq eyni vaxtda transkripsiya edilir, çünki onların hamısı istilik şokuna cavab transkripsiya faktorunu bağlayan DNT ardıcıllığı elementinə malikdir.

              Eukaryotik genlərin tənzimlənməsinə xas olan əlavə mürəkkəbliklər: xromatin və alternativ birləşmə

              Prokaryotik gen tənzimlənməsi ilə eukaryotik gen tənzimlənməsi arasındakı digər əsas fərq, eukaryotik (lakin prokaryotik deyil) DNT cüt spiralının zülallar ətrafında təşkil edilməsidir. histonlar DNT-ni təşkil edən nukleosomlar. DNT + histonların bu birləşməsinə deyilir xromatin.
              Xromatin 30 nm-lik lif formalaşmasında (sıx sıxılmış nukleosomlar) kondensasiya oluna bilər və ya nukleosomlar arasında və ətrafında olan DNT-nin daha əlçatan olduğu “muncuqlar” şəklində sərbəst şəkildə düzülə bilər. Bu sıxılma nukleosomlardakı histonlara əlavə edilən post-translational modifikasiyalarla idarə olunur. Histonlara histon asetil transferazları (HATs) adlanan fermentlər tərəfindən əlavə edilmiş asetil qrupları olduqda, asetil qrupları nukleosomların çox sıx şəkildə yığılmasına fiziki olaraq mane olur və xromatin strukturunu daha da açan digər fermentləri işə cəlb etməyə kömək edir. Əksinə, asetil qrupları histon deasetilazlar (HDACs) tərəfindən xaric edildikdə, xromatin transkripsiya faktorlarının DNT-yə daxil olmasına mane olan kondensasiya olunmuş formalaşmanı qəbul edir. Aşağıdakı şəkildə, 30 nm-lik lifin (yuxarıda) simli muncuq meydana gəlməsinə (aşağıda) nisbətən nə qədər yığcam və əlçatmaz olduğunu aydın görə bilərsiniz.

              Xromatin müsbət və mənfi gen tənzimlənməsində əsas rol oynayır, çünki xromatin kompakt formada olduqda transkripsiya aktivatorları və RNT polimeraza DNT tənzimləyici elementlərinə fiziki olaraq daxil ola bilmir.
              Prokaryotik DNT-də genomları təşkil etməyə kömək edən bəzi əlaqəli zülallar var, lakin o, xromatin prokaryotik DNT-dən əsaslı şəkildə fərqlidir, eukaryotik xromatinlə müqayisədə mahiyyətcə “çılpaq” hesab edilə bilər, ona görə də prokaryotik hüceyrələrdə bu gen tənzimlənməsi təbəqəsi yoxdur.
              Prokaryotik və eukaryotik gen tənzimlənməsi arasındakı başqa bir fərq, eukaryotik mRNA-ların 5′ qapağının əlavə edilməsi, intronların ayrılması və 3′poli(A) quyruğunun əlavə edilməsi ilə düzgün işlənməsidir (burada daha ətraflı müzakirə olunur). Bu emal addımlarının hər biri də tənzimlənməyə tabedir və onlardan hər hansı biri düzgün tamamlanmazsa, mRNT pozulacaq. mRNT-lərin nüvədən sitoplazmaya ixracı, həmçinin sitoplazmada düzgün işlənmiş mRNT-nin sabitliyi də tənzimlənir.
              Nəhayət, eukaryotik genlər tez-tez fərqli birləşmə variantlarına malikdirlər, burada müxtəlif ekzonlar eyni gendən transkripsiya edilmiş müxtəlif mRNT-lərə daxil edilə bilər. Burada rəng kodlu eksonları olan bir genin cizgi filmini və bu gendən transkripsiya edilmiş iki fərqli mRNT molekulunu görə bilərsiniz. Fərqli mRNA-lar müxtəlif zülalları kodlayır, çünki onların tərkibində müxtəlif ekzonlar var. Bu proses adlanır alternativ birləşmə və biz burada daha çox müzakirə edəcəyik.


              Tez-tez müxtəlif toxumalarda müxtəlif növ hüceyrələr eyni genin müxtəlif splice variantlarını ifadə edirlər, belə ki, müəyyən bir genin ürəyə spesifik transkripti və böyrəklərə xas transkript var.
              Ümumiyyətlə, eukaryotik genlərin tənzimlənməsi prokaryotik genlərin tənzimlənməsindən daha mürəkkəbdir. Eukaryotik genlərin yuxarı axını tənzimləyici bölgələri transkripsiyanın səviyyəsini müəyyən etmək üçün birlikdə işləyən həm müsbət tənzimləyicilər, həm də mənfi tənzimləyicilər olan çoxsaylı transkripsiya faktorları üçün məcburi yerlərə malikdir. Gücləndiricilər və səsboğucular adlanan bəzi transkripsiya faktorunu bağlayan yerlər promouterdən minlərlə baza cütü uzaqda, kifayət qədər məsafədə işləyirlər. Aktivləşdiricilər müsbət tənzimləmə nümunələridir və repressorlar mənfi tənzimləmə nümunələridir.

              Biology.kenyon.edu saytından eukaryotik transkripsiya başlanğıcı (Tjiandan sonra)

              Ümumi fərqlər və oxşarlıqlar

              Əgər siz eukaryotik və prokaryotik genlərin tənzimlənməsindəki oxşarlıqları və fərqləri başa düşürsünüzsə, onda siz aşağıdakı proseslərdən hansının hər ikisində baş verən prokaryotlara xas olan eukariotlara xas olduğunu və hər birinin necə həyata keçirildiyini bilirsiniz:

              • birləşdirilmiş transkripsiya və tərcümə
              • 5′ qapaq və 3′ poly(A) quyruğu
              • AUG tərcümə başlanğıc kodonu kimi
              • DNT tənzimləyici elementlərə bağlanan zülallarla gen ifadəsinin tənzimlənməsi
              • alternativ mRNT-nin birləşdirilməsi
              • xromatin əlçatanlığı vasitəsilə gen ifadəsinin tənzimlənməsi

              Hamısını bir araya gətirmək: the lak operon daxil E. coli

              The lak operon yaxşıdır model gen gen tənzimlənməsini anlamaq üçün. Yuxarıda təsvir edilən gen tənzimlənməsinin bütün təfərrüatlarını xüsusi bir gen modelinə tətbiq edə bildiyinizə əmin olmaq üçün aşağıdakı məlumatdan istifadə etməlisiniz.
              E. coli lak operon: ikili müsbət və mənfi tənzimləmə

              lacI lak Repressor zülalını kodlayan gendir CAP = katabolit aktivator zülalı O = Operator P = promotor lacZ = beta-qalaktosidazanı kodlayan gen lacY permeaz lacA transasetilazanı kodlayır. Mənbə: Wikimedia Commons (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Lac_operon-2010-21-01.png)

              The lak operonu E. coli Süddə yüksək səviyyədə olan disakarid olan laktoza mübadiləsi üçün tələb olunan 3 struktur genə malikdir:

              • lacZ laktozanı qlükoza və qalaktoza parçalayan beta-qalaktosidaza fermentini kodlayır.
              • lacY, laktozanın hüceyrəyə asan diffuziyası üçün membran zülalı olan permeazanı kodlayır.
              • lacA laktozanı dəyişdirən bir ferment olan transasetilazanı kodlayır

              Bütün 3 zülalları kodlayan mRNT yalnız laktoza mövcud olduqda və qlükoza olmadıqda yüksək səviyyədə transkripsiya edilir.
              Repressor tərəfindən mənfi tənzimləmə – Laktoza olmaması ilə, lak Repressor zülalı, tərəfindən kodlanır. lacI həmişə aktiv olan, DNT-dəki Operator ardıcıllığına bağlanan ayrıca promotorlu gen. Operator ardıcıllığı yuxarıda təsvir olunduğu kimi DNT tənzimləyici elementin bir növüdür. Operatorla əlaqəli repressor zülalı RNT polimerazanın transkripsiyaya başlamasının qarşısını alır.
              Laktoza mövcud olduqda, laktozadan əldə edilən induktor molekul allosterik olaraq Repressorla birləşir və Repressorun Operator sahəsini tərk etməsinə səbəb olur. RNT polimeraza müvəffəqiyyətlə bağlanarsa, transkripsiyaya başlamaq üçün sərbəstdir lac təşviqatçı.
              CAP tərəfindən müsbət tənzimləmə – Qlükoza enerji mübadiləsi üçün üstünlük verilən substratdır. Qlükoza mövcud olduqda hüceyrələr onları transkripsiya edir lak operon yalnız çox aşağı səviyyədədir, buna görə də hüceyrələr enerjilərinin çoxunu qlükoza mübadiləsindən alırlar. RNT polimeraza özü ilə kifayət qədər zəif bağlanır lak təşviqatçı.
              Qlükoza aclığı hüceyrədaxili həyəcan siqnalı olan siklik adenozin monofosfat (cAMP) səviyyəsinin artmasına səbəb olur. Tsiklik AMP katabolit aktivator proteininə (CAP) bağlanır. CAP+cAMP kompleksi yaxınlıqdakı CAP bağlanma yerinə bağlanır lak promotor edir və RNT polimerazanı promotora cəlb edir.
              Lac operonunun yüksək səviyyəli transkripsiyası həm CAP+cAMP-nin CAP bağlama sahəsinə bağlanmasını, həm də Repressorun Operatorda olmamasını tələb edir. Bu vəziyyətlər normal olaraq yalnız qlükoza və laktoza olmadıqda baş verir.

              The lak operon daxil E. coli həm müsbət, həm də mənfi tənzimlənməyə tabe olan prokaryotik operonun klassik nümunəsidir. Müsbət tənzimləmə və mənfi tənzimləmə həm prokaryotlarda, həm də eukaryotlarda gen tənzimlənməsi üçün universal mövzulardır.


              İstinadlar

              Stratton MR, Campbell PJ, Futreal PA. Xərçəng genomu. Təbiət. 2009458(7239):719–24. https://doi.org/10.1038/nature07943.

              Vogelstein B, Papadopulos N, Velculescu VE, Zhou S, Diaz LA, Kinzler KW. Xərçəng genomunun mənzərələri. Elm. 2013339(6127):1546–58. https://doi.org/10.1126/science.1235122.

              ICGC-TCGA Bütün Genomlar Konsorsiumunun Pan-Xərçəng Təhlili. Bütün genomların pan-xərçəng analizi. Təbiət. 2020578:82–93. https://doi.org/10.1038/s41586-020-1969-6.

              Rheinbay E və başqaları. 2693 xərçəng genomunda kodlaşdırılmayan somatik sürücülərin təhlili. Təbiət. 2020578(7793):102–11. https://doi.org/10.1038/s41586-020-1965-x.

              Bailey MH, et al. Xərçəng sürücü genlərinin və mutasiyalarının hərtərəfli xarakteristikası. Hüceyrə. 2018174(4):1034–5. https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.07.034.

              Kumar S, et al. 2500-dən çox xərçəng genomunda sərnişin mutasiyaları: ümumi molekulyar funksional təsir və nəticələr. Hüceyrə. 2020180:915–927 e916. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.01.032.

              Gerstung M, Jolly C, Leshchiner I, et al. 2658 xərçəngin təkamül tarixi. Təbiət. 2020578:122–8. https://doi.org/10.1038/s41586-019-1907-7.

              Supek F, Lehner B. İnsan genomunda somatik mutasiya dərəcəsi dəyişməsinin tərəziləri və mexanizmləri. DNT Təmiri (Amst). 2019: 102647. https://doi.org/10.1016/j.dnarep.2019.102647.

              Lawrence MS, et al. Xərçəngdə mutasiya heterojenliyi və xərçənglə əlaqəli yeni genlərin axtarışı. Təbiət. 2013499(7457):214–8. https://doi.org/10.1038/nature12213.

              Reijns MAM, Kemp H, Ding J, Marion de Procé S, Jackson AP, Taylor MS. Lagging-strand replikasiyası genomun mutasiya mənzərəsini formalaşdırır. Təbiət. 2015518(7540):502–6. https://doi.org/10.1038/nature14183.

              Schuster-Bockler B, Lehner B. Xromatin təşkilatı insan xərçəng hüceyrələrində regional mutasiya nisbətlərinə böyük təsir göstərir. Təbiət. 2012488(7412):504–7. https://doi.org/10.1038/nature11273.

              Polak P, Karlić R, Koren A, Thurman R, Sandstrom R, Lawrence MS, Reynolds A, Rynes E, Vlahoviček K, Stamatoyannopoulos JA, Sunyaev SR. Hüceyrə mənşəli xromatin quruluşu xərçəngin mutasiya mənzərəsini formalaşdırır. Təbiət. 2015518(7539):360–4. https://doi.org/10.1038/nature14221.

              Aleksandrov L.B., və s. İnsan xərçəngində mutasiya proseslərinin imzaları. Təbiət. 2013500(7463):415–21. https://doi.org/10.1038/nature12477.

              Aleksandrov L.B., və s. İnsan xərçəngində mutasiya imzalarının repertuarı. Təbiət. 2020578(7793):94–101. https://doi.org/10.1038/s41586-020-1943-3.

              Kucab JE, et al. Ətraf Mühit Agentlərinin Mutasion İmzalarının Toplusu. Hüceyrə. 2019177:821–836 e816. https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.03.001.

              Pich O, Muiños F, Lolkema MP, Steeghs N, Gonzalez-Perez A, Lopez-Bigas N. Xərçəng müalicələrinin mutasiya izləri. Nat Genet. 201951(12):1732–40. https://doi.org/10.1038/s41588-019-0525-5.

              Priestley P, Baber J, Lolkema MP, Steeghs N, de Bruijn E, Shale C, Duyvesteyn K, Haidari S, van Hoeck A, Onstenk W, Roepman P, Voda M, Bloemendal HJ, Tjan-Heijnen VCG, van Herpen CML, Labots M, Witteveen PO, Smit EF, Sleijfer S, Voest EE, Cuppen E. Metastatik bərk şişlərin pan-xərçəng bütün genom analizləri. Təbiət. 2019575(7781):210–6. https://doi.org/10.1038/s41586-019-1689-y.

              Kübler K, et al. Şiş mutasiya mənzərəsi bədxassəli vəziyyətə qədərki vəziyyətin qeydidir. bioRxiv. 2019: 517565. https://doi.org/10.1101/517565.

              Jiao W, et al. Dərin öyrənmə sistemi sərnişin mutasiya modellərindən istifadə edərək ilkin və metastatik xərçəngləri dəqiq şəkildə təsnif edir. Nat Commun. 202011(1):728. https://doi.org/10.1038/s41467-019-13825-8.

              Gonzalez-Perez A, Sabarinathan R, Lopez-Bigas N. İnsan genomunun mutasiya mənzərəsinin yerli təyinediciləri. Hüceyrə. 2019177(1):101–14. https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.02.051.

              Kaiser VB, Taylor MS, Semple CA. Mutasion qərəzlər xərçəng növləri arasında tənzimləyici yerlərdə yüksək əvəzetmə nisbətlərini artırır. PLoS Genet. 201612(8):e1006207. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1006207.

              Yazdi PG, Pedersen BA, Taylor JF, Khattab OS, Chen YH, Chen Y, Jacobsen SE, Wang PH.Artan nukleosom doluluğu, DNT təmiri mexanizmləri bütöv olduğu müddətcə artan mutasiya dərəcəsi ilə əlaqələndirilir. PLoS One. 201510(8):e0136574. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0136574.

              Hara R, Mo J, Sancar A. Nukleosom nüvəsindəki DNT zədəsi insan ekssizyonu nukleazı ilə təmirə davamlıdır. Mol Cell Biol. 200020(24):9173–81. https://doi.org/10.1128/mcb.20.24.9173-9181.2000.

              Sabarinathan R, Mularoni L, Deu-Pons J, Gonzalez-Perez A, Lopez-Bigas N. Nukleotid eksizyonunun təmiri transkripsiya faktorlarının DNT-yə bağlanması ilə pozulur. Təbiət. 2016532(7598):264–7. https://doi.org/10.1038/nature17661.

              Perera D, Poulos RC, Shah A, Beck D, Pimanda JE, Wong JWH. Diferensial DNT təmiri xərçəng genomlarında aktiv promotorlarda mutasiya qaynar nöqtələrinin əsasını təşkil edir. Təbiət. 2016532(7598):259–63. https://doi.org/10.1038/nature17437.

              Hnisz D, Weintraub AS, Day DS, Valton AL, Bak RO, Li CH, Goldmann J, Lajoie BR, Fan ZP, Sigova AA, Reddy J, Borges-Rivera D, Lee TI, Jaenisch R, Porteus MH, Dekker J, Gənc RA. Xromosom məhəllələrinin pozulması ilə proto-onkogenlərin aktivləşməsi. Elm. 2016351(6280):1454–8. https://doi.org/10.1126/science.aad9024.

              Katainen R, Dave K, Pitkänen E, Palin K, Kivioja T, Välimäki N, Gylfe AE, Ristolainen H, Hänninen UA, Cajuso T, Kondelin J, Tanskanen T, Mecklin JP, Järvinen H, Renkonen-Sinisalo L, Lepistö A, Kaasinen E, Kilpivaara O, Tuupanen S, Enge M, Taipale J, Aaltonen LA. Xərçəngdə CTCF/kohezin bağlayan yerlər tez-tez mutasiyaya uğrayır. Nat Genet. 201547(7):818–21. https://doi.org/10.1038/ng.3335.

              Guo YA, Chang MM, Huang W, Ooi WF, Xing M, Tan P, Skanderup AJ. Mədə-bağırsaq xərçənglərində xromosom qeyri-sabitliyi ilə birləşən CTCF bağlanma yerlərində mutasiya qaynar nöqtələri. Nat Commun. 20189(1):1520. https://doi.org/10.1038/s41467-018-03828-2.

              Polak P, Lawrence MS, Haugen E, Stoletzki N, Stojanov P, Thurman RE, Garraway LA, Mirkin S, Getz G, Stamatoyannopoulos JA, Sunyaev SR. Xərçəng genomlarının tənzimləyici DNT-də yerli mutasiya sıxlığının azalması DNT təmiri ilə əlaqələndirilir. Nat Biotexnol. 201432(1):71–5. https://doi.org/10.1038/nbt.2778.

              Frigola J, Sabarinathan R, Mularoni L, Muiños F, Gonzalez-Perez A, López-Bigas N. Diferensial uyğunsuzluğun təmiri səbəbindən ekzonlarda mutasiya nisbətinin azalması. Nat Genet. 201749(12):1684–92. https://doi.org/10.1038/ng.3991.

              Bell RJ və başqaları. Transkripsiya faktoru GABP xərçəngdə mutant TERT promotorunu seçici şəkildə bağlayır və aktivləşdirir. Elm. 2015348(6238):1036–9. https://doi.org/10.1126/science.aab0015.

              Huang FW, Hodis E, Xu MJ, Kryukov GV, Chin L, Garraway LA. İnsan melanomasında yüksək təkrarlanan TERT promotor mutasiyaları. Elm. 2013339(6122):957–9. https://doi.org/10.1126/science.1229259.

              Fredriksson NJ, Ny L, Nilsson JA, Larsson E. 14 şiş növü üzrə kodlaşdırılmayan somatik mutasiyaların və gen ifadə dəyişikliklərinin sistematik təhlili. Nat Genet. 201446(12):1258–63. https://doi.org/10.1038/ng.3141.

              Zhu H, Uusküla-Reimand L, Isaev K, Wadi L, Əlizadə A, Shuai S, Huang V, Aduluso-Nwaobasi D, Paczkowska M, Abd-Rabbo D, Ocsenas O, Liang M, Thompson JD, Li Y, Ruan L , Krassowski M, Dzneladze I, Simpson JT, Lupien M, Stein LD, Boutros PC, Wilson MD, Reimand J. Distal tənzimləyici elementlərdə və uzun müddətli xromatin qarşılıqlı şəbəkələrində namizəd xərçəng sürücüsü mutasiyaları. Mol hüceyrəsi. 202077(6):1307–1321.e10. https://doi.org/10.1016/j.molcel.2019.12.027.

              Corona RI, Seo JH, Lin X, Hazelett DJ, Reddy J, Fonseca MAS, Abassi F, Lin YG, Mhawech-Fauceglia PY, Shah SP, Huntsman DG, Gusev A, Karlan BY, Berman BP, Freedman ML, Gayther SA, Lawrenson K. Kodlaşdırılmayan somatik mutasiyalar yumurtalıq xərçəngində PAX8 yolunda birləşir. Nat Commun. 202011(1):2020. https://doi.org/10.1038/s41467-020-15951-0.

              Liu EM, et al. 1,962 Bütün Genomda CTCF İzolyatorlarında Xərçəng Sürücülərinin Müəyyənləşdirilməsi. Hüceyrə sistemi. 20198: 446–455 e448. https://doi.org/10.1016/j.cels.2019.04.001.

              Reyna MA, et al. 2500-dən çox xərçəng genomunun yol və şəbəkə təhlili. Nat Commun. 202011(1):729. https://doi.org/10.1038/s41467-020-14367-0.

              Mazrooei P, et al. Cistrome bölməsi ilkin prostat şişlərində somatik mutasiyaların və risk variantlarının master transkripsiya tənzimləyicilərində yaxınlaşmasını aşkar edir. Xərçəng Hüceyrəsi. 201936:674–689 e676. https://doi.org/10.1016/j.ccell.2019.10.005.

              Layihə Konsorsiumunu kodlayın. İnsan genomunda DNT elementlərinin inteqrasiya olunmuş ensiklopediyası. Təbiət. 2012489:57–74. https://doi.org/10.1038/nature11247.

              Corces MR, et al. İlkin insan xərçənglərinin xromatinə əlçatanlıq mənzərəsi. Elm. 2018362 https://doi.org/10.1126/science.aav1898.

              Roadmap Epigenomics Consortium, et al. 111 istinad insan epigenomunun inteqrativ təhlili. Təbiət. 2015518:317–30. https://doi.org/10.1038/nature14248.

              Dvorak K, Payne CM, Chavarria M, Ramsey L, Dvorakova B, Bernstein H, Holubec H, Sampliner RE, Guy N, Condon A, Bernstein C, Green SB, Prasad A, Garewal HS. Aşağı pH ilə birlikdə öd turşuları oksidləşdirici stresə və oksidləşdirici DNT zədələnməsinə səbəb olur: Barrett özofagusunun patogenezinə uyğunluq. bağırsaq. 200756(6):763–71. https://doi.org/10.1136/gut.2006.103697.

              Tomkova M, Tomek J, Kriaucionis S, Schuster-Bockler B. Mutasion imza paylanması DNT replikasiyasının vaxtı və zəncir asimmetriyası ilə dəyişir. Genom Biol. 201819(1):129. https://doi.org/10.1186/s13059-018-1509-y.

              Dellino GI, Palluzzi F, Chiariello AM, Piccioni R, Bianco S, Furia L, de Conti G, Bouwman BAM, Melloni G, Guido D, Giacò L, Luzi L, Cittaro D, Faretta M, Nicodemi M, Crosetto N, Pelicci PG. Fasilə edilmiş RNT polimeraza II-nin xüsusi lokuslarda sərbəst buraxılması DNT-nin ikiqat zəncirinin qırılmasının yaranmasına kömək edir və xərçəng translokasiyasını təşviq edir. Nat Genet. 201951(6):1011–23. https://doi.org/10.1038/s41588-019-0421-z.

              PCAWG Transcriptome Core Group, Calabrese C, Davidson NR, et al. Xərçəngdə RNT dəyişikliklərinin genomik əsasları. Təbiət. 2020578:129–36. https://doi.org/10.1038/s41586-020-1970-0.

              Jung I, Schmitt A, Diao Y, Lee AJ, Liu T, Yang D, Tan C, Eom J, Chan M, Chee S, Chiang Z, Kim C, Masliah E, Barr CL, Li B, Kuan S, Kim D , Ren B. İnsan genomunda promotor mərkəzli uzunmüddətli xromatin qarşılıqlı təsirlərinin toplusu. Nat Genet. 201951(10):1442–9. https://doi.org/10.1038/s41588-019-0494-8.

              Reimand J, Isserlin R, Voisin V, Kucera M, Tannus-Lopes C, Rostamianfar A, Wadi L, Meyer M, Wong J, Xu C, Merico D, Bader GD. g:profiler, GSEA, Cytoscape və EnrichmentMap istifadə edərək, yolun zənginləşdirilməsi təhlili və omik məlumatların vizuallaşdırılması. Nat Protoc. 201914(2):482–517. https://doi.org/10.1038/s41596-018-0103-9.

              Rao SS, et al. Kilobaza rezolyusiyasında insan genomunun 3D xəritəsi xromatin dövrəsinin prinsiplərini ortaya qoyur. Hüceyrə. 2014159(7):1665–80. https://doi.org/10.1016/j.cell.2014.11.021.

              Wendt KS, Yoshida K, Itoh T, Bando M, Koch B, Schirghuber E, Tsutsumi S, Nagae G, Ishihara K, Mishiro T, Yahata K, Imamoto F, Aburatani H, Nakao M, Imamoto N, Maeshima K, Shirahige K , Peters JM. Kohezin CCCTC-məcburi faktoru ilə transkripsiya izolyasiyasına vasitəçilik edir. Təbiət. 2008451(7180):796–801. https://doi.org/10.1038/nature06634.

              Kaiser VB, Semple CA. Xromatin döngə ankerləri xərçəngdə genomun qeyri-sabitliyi və germ xəttindəki rekombinasiya qaynar nöqtələri ilə əlaqələndirilir. Genom Biol. 201819(1):101. https://doi.org/10.1186/s13059-018-1483-4.

              Pinoli P, Stamoulakatou E, Nguyen AP, Rodriguez Martinez M, Ceri S. İzolyasiya edilmiş qonşuluq sərhədlərində somatik mutasiyalar və epigenetik dəyişikliklərin pan-xərçəng təhlili. PLoS One. 202015(1):e0227180. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0227180.

              Khoury A, Achinger-Kawecka J, Bert SA, Smith GC, French HJ, Luu PL, Peters TJ, du Q, Parry AJ, Valdes-Mora F, Taberlay PC, Stirzaker C, Statham AL, Clark SJ. Konstruktiv olaraq bağlı CTCF saytları 3D xromatin arxitekturasını və uzunmüddətli epigenetik olaraq tənzimlənən domenləri saxlayır. Nat Commun. 202011(1):54. https://doi.org/10.1038/s41467-019-13753-7.

              Li Y, Roberts ND, Wala JA, et al. İnsan xərçəngi genomlarında somatik struktur dəyişikliyinin nümunələri. Təbiət. 2020578:112–21. https://doi.org/10.1038/s41586-019-1913-9.

              Wu RC, Wang TL, Shih Ie M. Şişlərin bastırılmasında ARID1A-nın ortaya çıxan rolları. Xərçəng Biol Ther. 201415(6):655–64. https://doi.org/10.4161/cbt.28411.

              Dykhuizen EC, Hargreaves DC, Miller EL, Cui K, Korshunov A, Kool M, Pfister S, Cho YJ, Zhao K, Crabtree GR. BAF kompleksləri topoizomeraz IIalfa ilə DNT-nin dekatenasiyasını asanlaşdırır. Təbiət. 2013497(7451):624–7. https://doi.org/10.1038/nature12146.

              Park JH, Park EJ, Lee HS, Kim SJ, Hur SK, Imbalzano AN, Kwon J. Mammalian SWI/SNF kompleksləri qamma-H2AX induksiyasını təşviq etməklə DNT-nin iki zəncirli qırılma təmirini asanlaşdırır. EMBO J. 200625(17):3986–97. https://doi.org/10.1038/sj.emboj.7601291.

              Zhao Q və başqaları. Məməli SWI/SNF xromatin-remodeling kompleksi ilə nukleotid eksizyon təmirinin modulyasiyası. J Biol Chem. 2009284:30424–32. https://doi.org/10.1074/jbc.M109.044982.

              Trizzino M, Barbieri E, Petracovici A, Wu S, Welsh SA, Owens TA, Licciulli S, Zhang R, Gardini A. Şiş bastırıcı ARID1A RNT polimeraza II-nin dayandırılması ilə qlobal transkripsiyaya nəzarət edir. Cell Rep. 201823(13):3933–45. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.05.097.

              Xərçəng Geome Atlas Şəbəkəsi. Pankreas duktal adenokarsinomanın inteqrasiya olunmuş genomik xarakteristikası. Xərçəng Hüceyrəsi. 201732:185–203 e113. https://doi.org/10.1016/j.ccell.2017.07.007.

              Xərçəng Genomu Atlas Şəbəkəsi. Dəri melanomasının genomik təsnifatı. Hüceyrə. 2015161:1681–96. https://doi.org/10.1016/j.cell.2015.05.044.

              Chapman PB, Hauschild A, Robert C, Haanen JB, Ascierto P, Larkin J, Dummer R, Garbe C, Testori A, Maio M, Hogg D, Lorigan P, Lebbe C, Jouary T, Schadendorf D, Ribas A, O' Day SJ, Sosman JA, Kirkwood JM, Eggermont AMM, Dreno B, Nolop K, Li J, Nelson B, Hou J, Lee RJ, Flaherty KT, McArthur GA. BRAF V600E mutasiyası ilə melanomada vemurafenib ilə sağ qalma müddətini yaxşılaşdırdı. N Engl J Med. 2011364(26):2507–16. https://doi.org/10.1056/NEJMoa1103782.

              Sheu JJ və başqaları. Mutant BRAF DNT zəncirinin qırılmasına səbəb olur, DNT-nin zədələnməsinə cavab yolunu aktivləşdirir və transformasiya olunmamış epitel hüceyrələrində qlükoza daşıyıcı-1-i tənzimləyir. J Pathol. 2012180(3):1179–88. https://doi.org/10.1016/j.ajpath.2011.11.026.

              Fredriksson NJ, Elliott K, Filges S, van den Eynden J, Ståhlberg A, Larsson E. Melanomada təkrarlanan promotor mutasiyaları genişləndirilmiş kontekstdə xüsusi mutasiya imzası ilə müəyyən edilir. PLoS Genet. 201713(5):e1006773. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1006773.

              Karczewski KJ və başqaları. Mutasion məhdudiyyət spektri 141,456 insanda variasiya əsasında ölçüldü. Təbiət. 2020581(7809):434–43. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2308-7.

              Martincorena I, Roshan A, Gerstung M, Ellis P, van Loo P, McLaren S, Wedge DC, Fullam A, Alexandrov LB, Tubio JM, Stebbings L, Menzies A, Widaa S, Stratton MR, Jones PH, Campbell PJ. Şişin təkamülü. Normal insan dərisində somatik mutasiyaların yüksək yükü və geniş yayılmış müsbət seçimi. Elm. 2015348(6237):880–6. https://doi.org/10.1126/science.aaa6806.

              Fornes O, Castro-Mondragon JA, Khan A, van der Lee R, Zhang X, Richmond PA, Modi BP, Correard S, Gheorghe M, Baranašić D, Santana-Garcia W, Tan G, Cheneby J, Ballester B, Parcy F , Sandelin A, Lenhard B, Wasserman WW, Mathelier A. JASPAR 2020: transkripsiya faktoru bağlama profillərinin açıq giriş məlumat bazasının yenilənməsi. Nuklein turşuları Res. 202048: D87–92. https://doi.org/10.1093/nar/gkz1001.

              Grant CE, Bailey TL, Noble WS. FIMO: verilmiş motivin baş verməsinin skan edilməsi. Bioinformatika. 201127(7):1017–8. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btr064.

              Ashburner M, Ball CA, Blake JA, Botstein D, Butler H, Cherry JM, Davis AP, Dolinski K, Dwight SS, Eppig JT, Harris MA, Hill DP, Issel-Tarver L, Kasarskis A, Lewis S, Matese JC, Richardson JE, Ringwald M, Rubin GM, Sherlock G. Gen ontology: biologiyanın birləşdirilməsi üçün alət. Gen Ontologiyası Konsorsiumu. Nat Genet. 200025(1):25–9. https://doi.org/10.1038/75556.

              Fabregat A, Jupe S, Matthews L, Sidiropoulos K, Gillespie M, Qarapati P, Haw R, Jassal B, Korninger F, May B, Milacic M, Roca CD, Rothfels K, Sevilla C, Shamovsky V, Shorser S, Varusai T , Viteri G, Weiser J, Wu G, Stein L, Hermjakob H, D'Eustachio P. The Reactome Pathway Knowledgebase. Nuklein turşuları Res. 201846(D1):D649–55. https://doi.org/10.1093/nar/gkx1132.

              Reimand J, Kull M, Peterson H, Hansen J, Vilo J. g:Profiler - geniş miqyaslı təcrübələrdən gen siyahılarının funksional profilinin yaradılması üçün veb əsaslı alətlər dəsti. Nuklein turşuları Res. 200735(əlavə_2):W193–200. https://doi.org/10.1093/nar/gkm226.

              Merico D, Isserlin R, Stueker O, Emili A, Bader GD. Zənginləşdirmə xəritəsi: gen dəsti zənginləşdirmənin vizuallaşdırılması və şərhi üçün şəbəkə əsaslı bir üsul. PLoS One. 20105(11):e13984. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0013984.

              Futreal PA, Coin L, Marshall M, Down T, Hubbard T, Wooster R, Rahman N, Stratton MR. İnsan xərçəng genlərinin siyahıya alınması. Nat Rev Xərçəng. 20044(3):177–83. https://doi.org/10.1038/nrc1299.

              Hudson TJ və başqaları. Xərçəng genom layihələrinin beynəlxalq şəbəkəsi. Təbiət. 2010464(7291):993–8. https://doi.org/10.1038/nature08987.

              Reimand J. RM2 - lokallaşdırılmış mutasiyalar üçün reqressiya modelləri. GitHub, https://github.com/reimandlab/RM2 (2021).

              Reimand J. RM2 - lokallaşdırılmış mutasiyalar üçün reqressiya modelləri. Zenodo, https://doi.org/10.5281/zenodo.4530813 (2021).

              ICGC/TCGA Bütün Genomlar Konsorsiumunun Pan-xərçəng Təhlili. Bütün Genomların Pan-Xərçəng Təhlili. ICGC Məlumat Portalı, https://dcc.icgc.org/releases/PCAWG (2020).


              İnsan Leykosit Antigen (HLA) Sistemi

              İnsan leykosit antigeni (HLA) sistemi (insanlarda əsas histouyğunluq kompleksi [MHC]) immun sisteminin mühüm hissəsidir və 6-cı xromosomda yerləşən genlər tərəfindən idarə olunur. O, antigenik peptidləri T-yə təqdim etmək üçün ixtisaslaşmış hüceyrə səthi molekullarını kodlayır. -T hüceyrələri üzərində hüceyrə reseptoru (TCR). (Həmçinin İmmunitet Sisteminin İcmalına baxın.)

              Antigen (Ag) təqdim edən MHC molekulları 2 əsas sinifə bölünür:

              I sinif MHC molekulları bütün nüvəli hüceyrələrin səthində transmembran qlikoproteinlər şəklində mövcuddur. Dözülməmiş sinif I molekulları beta-2 mikroqlobulin molekuluna bağlanmış alfa ağır zəncirindən ibarətdir. Ağır zəncir 2 peptid bağlayan domendən, immunoqlobulinə (Ig) bənzər domendən və sitoplazmatik quyruğu olan transmembran bölgədən ibarətdir. I sinif molekulunun ağır zənciri HLA-A, HLA-B və HLA-C lokuslarındakı genlər tərəfindən kodlanır. CD8 molekullarını ifadə edən T hüceyrələri sinif I MHC molekulları ilə reaksiya verir. Bu limfositlər tez-tez sitotoksik funksiyaya malikdirlər və onlardan hər hansı bir yoluxmuş hüceyrəni tanımaq qabiliyyətinə malik olmalarını tələb edirlər. Hər nüvəli hüceyrə sinif I MHC molekullarını ifadə etdiyinə görə, bütün yoluxmuş hüceyrələr CD8 T hüceyrələri üçün antigen təqdim edən hüceyrələr kimi çıxış edə bilər (CD8 sinif I ağır zəncirinin polimorfik olmayan hissəsinə bağlanır). Bəzi sinif I MHC genləri HLA-G (dölün ananın immun reaksiyasından qorunmasında rol oynaya bilər) və HLA-E (təbii öldürücü [NK] hüceyrələrindəki müəyyən reseptorlara peptidlər təqdim edən) kimi qeyri-klassik MHC molekullarını kodlayır. .

              II sinif MHC molekulları adətən yalnız peşəkar antigen təqdim edən hüceyrələrdə (B hüceyrələri, makrofaqlar, dendritik hüceyrələr, Langerhans hüceyrələri), timus epitelində və aktivləşdirilmiş (lakin istirahətdə olmayan) T hüceyrələrində olurlar. IFN)-qamma. II sinif MHC molekulları 2 polipeptid (alfa [α] və beta [β]) zəncirindən ibarətdir, hər bir zəncirdə peptid bağlayan domen, Ig-ə bənzər domen və sitoplazmatik quyruğu olan transmembran bölgə var. Hər iki polipeptid zəncirləri 6-cı xromosomun HLA-DP, -DQ və ya -DR bölgəsindəki genlər tərəfindən kodlanır. II sinif molekullarına reaktiv olan T hüceyrələri CD4-ü ifadə edir və çox vaxt köməkçi hüceyrələrdir.

              The MHC sinif III bölgəsi genomun iltihabda vacib olan bir neçə molekulunu kodlayır, bunlara C2, C4 komplement komponentləri və faktor B şiş nekrozu faktoru (TNF)-alfa limfotoksin və üç istilik şoku zülal daxildir.

              HLA sistemində I və II sinif gen lokusları ilə kodlanmış fərdi seroloji olaraq müəyyən edilmiş antigenlərə standart təyinatlar verilir (məsələn, HLA-A1, -B5, -C1, -DR1). DNT ardıcıllığı ilə müəyyən edilən allellər geni müəyyən etmək üçün adlandırılır, ardınca ulduz işarəsi, allel qrupunu təmsil edən nömrələr (çox vaxt həmin allel tərəfindən kodlanan seroloji antigenə uyğun gəlir), kolon və xüsusi alleli təmsil edən nömrələr (məsələn, A*02) :01, DRB1*01:03, DQA1*01:02). Bəzən eyni zülalları kodlayan allel variantları müəyyən etmək üçün kolondan sonra əlavə nömrələr əlavə edilir və başqa iki nöqtədən sonra intronlarda və ya 5'39 və ya 3' tərcümə olunmamış bölgələrdə polimorfizmləri ifadə etmək üçün başqa nömrələr əlavə olunur (məsələn, A*02:101 :01:02, DRB1*03:01:01:02).

              MHC sinif I və II molekulları allogenik transplantasiyanın rədd edilməsi zamanı tanınan ən immunogen antigenlərdir. Ən güclü determinant HLA-DR, sonra HLA-B və -A-dır. Buna görə də bu 3 lokus donor və alıcının uyğunlaşdırılması üçün ən vacibdir.

              Bəzi otoimmün xəstəliklər xüsusi HLA allelləri ilə əlaqələndirilir, məsələn,


              Nəticələr

              OR-ların yüksək keyfiyyətli tamamlanması barədə məlumat veririk I. tipoqrafiyaXüsusilə cavab verən iki ilk qabıq böcəyi OR-ni funksional olaraq xarakterizə etməyə imkan verdi.S)-(−)-ipsenol və (R)-(−)-ipsdienol. OR-lərdən gələn cavablar əvvəllər xarakterizə olunan OSN siniflərinin cavablarına yaxşı uyğun gəlir və OR ifadə səviyyələri və antenal paylama, xüsusilə ItypOR46 üçün bu OSN-lərin antenal tezliyi və paylanması ilə uyğundur. Liqand-OR qarşılıqlı əlaqəsini araşdırmamız iki diskret bağlanma yerini proqnozlaşdırdı və hidrogen bağının ItypOR46-da ipsenolun bağlanması üçün vacib olduğunu irəli sürdü. Bu ehtimal olunan bağlanma yerlərinin həşərat OR ailəsində qorunub saxlanıb-mühafizə olunmaması və ya proqnozlaşdırılan bağlayıcı yarığın müxtəlif OR-larda davamlı bağlanma yerləri təqdim edə biləcəyi araşdırılmalıdır. Həmçinin, geniş şəkildə tənzimlənmiş OR-ların tək diskret bağlanma yerlərinin olub-olmadığını və ya onların müxtəlif yerlərdə çoxsaylı liqandları ilə qarşılıqlı əlaqədə olub olmadığını araşdırmaq üçün əlavə iş lazımdır.

              Çünki ipsenol feromonların cazibəsinə güclü antaqonist təsir göstərir I. tipoqrafiya, ItypOR46 təbii liganddan daha güclü agonistləri müəyyən etmək məqsədi daşıyan skrininqlərdə istifadə oluna bilər. Belə bir yoxlama indi proqnozlaşdırılan bağlama yerinə yönəldilə bilər və belə agonistlər meşə mühafizəsi üçün daha səmərəli repellentlərin hazırlanmasında istifadə edilə bilər.Həqiqətən, ağcaqanadların karbon dioksidə həssas neyronlarının ultra uzun müddət aktivləşdirilməsinə səbəb olan agonistlər müəyyən edilmişdir ki, bu da ev sahibi axtarış davranışına geniş təsir göstərir [71]. ItypOR46 üçün oxşar birləşmələrin müəyyən edilib-edilməməsi və onların hücumları nə dərəcədə effektiv şəkildə yönləndirəcəkləri hələ də araşdırılmalıdır. Bundan əlavə, ipsenol və ipsdienolun qabıq böcəklərinin bir çox növləri arasında geniş istehsalı həm ItypOR46, həm də ItypOR49-u müxtəlif qabıq böcəklərinin invaziyalarının aşkarlanması üçün həssas biosensorlarda [15] istifadə etmək üçün uyğun namizədlər edir. Bu cür sensorlar tarla şəraitində havada uçan uçucu maddələr üçün istifadə edilməzdən əvvəl aradan qaldırılmalı texniki çətinliklər olsa da, yeni ağaclara yoluxmaq üçün gələcək nəsil ortaya çıxmazdan əvvəl invaziyaların aşkar edilməsi və hücuma məruz qalmış ağacların çıxarılması qabıq böcəyi populyasiyasını və beləliklə, epidemiyaları məhdudlaşdırmaq üçün çox vacibdir. iqtisadi itki.


              Nə üçün dəri hüceyrələrində bağlanma yeri olmayan gen çatışmazlığı ifadə edilə bilər? - Biologiya

              Gen ifadəsinin tənzimlənməsi

              Hüceyrə funksiyası hüceyrə mühitindən təsirlənir. Xüsusi mühitlərə uyğunlaşma müəyyən bir mühitdə yaşamaq üçün lazım olan fermentləri və zülalları kodlayan genlərin ifadəsini tənzimləməklə əldə edilir. Gen ifadəsinə təsir edən amillərə qida maddələri, temperatur, işıq, toksinlər, metallar, kimyəvi maddələr və digər hüceyrələrdən gələn siqnallar daxildir. Gen ifadəsinin tənzimlənməsində nasazlıqlar insanda müxtəlif pozğunluqlara və xəstəliklərə səbəb ola bilər.

              Prokaryotlarda tənzimləmə

              Bakteriyalar bir sıra əlaqəli proseslərdə iştirak edən məhsulları kodlayan genlərin tənzimlənməsini əlaqələndirmək üçün sadə ümumi mexanizmə malikdirlər. Gen klasteri və promotoru, üstəgəl tənzimləmədə birlikdə fəaliyyət göstərən əlavə ardıcıllıqlar operon adlanır.

              Laktoza operonu (lak operon)

              Laktoza operonu E. coli laktozanı qalaktoza və qlükozaya hidroliz edən b-qalaktosidaza fermentini kodlayır.

              The lak operon funksional proteini kodlayan üç sistrondan və ya DNT fraqmentindən ibarətdir. Sistronlar tərəfindən kodlanan zülallar tək və ya daha böyük fermentlərin və ya struktur zülalların alt vahidləri kimi fəaliyyət göstərə bilər.

              Z geni b-qalaktosidazanı kodlayır. Y geni laktozanın bakteriyaya daşınmasını asanlaşdıran keçiriciliyi kodlayır. A geni funksiyası məlum olmayan tioqalaktozid transasetilazanı kodlayır. Bu genin hər üçü tək, polikistronik mRNT kimi transkripsiya edilir. Polikistronik RNT hər birinin öz tərcümə başlanğıc və son siqnallarına malik çoxlu genetik mesajları ehtiva edir.

              tənzimlənməsi lak Operon

              ifadəsinə nəzarət edən promouterin fəaliyyəti lak operon iki fərqli zülal tərəfindən tənzimlənir. Zülallardan biri RNT polimerazanın transkripsiyasının qarşısını alır (mənfi nəzarət), digəri RNT polimerazanın promotorla bağlanmasını gücləndirir (müsbət nəzarət).

              Mənfi nəzarət lak Operon

              transkripsiyasını maneə törədən protein lak operon adlanan dörd eyni alt vahidi olan tetramerdir lak repressor. The lak repressor tərəfindən kodlanır lacI geninin yuxarı hissəsində yerləşir lak operon və öz promotoruna malikdir. ifadəsi lacI gen tənzimlənmir və çox aşağı səviyyədədir lak repressorlar davamlı olaraq sintez olunur. İfadəsi tənzimlənməyən genlərə konstitusiya genləri deyilir.

              Laktoza olmadıqda lak repressor ifadəsini bloklayır lak promotorun aşağı axınında və transkripsiya başlanğıc sahəsinin yuxarı axınında olan operator adlanan bir saytda DNT ilə bağlanaraq operon. Operator repressor tərəfindən tanınan spesifik nukleotid ardıcıllığından ibarətdir və çox sıx bağlanır, transkripsiyanın başlanmasını fiziki olaraq bloklayır (boğur).

              The lak repressor laktoza üçün yüksək yaxınlığa malikdir. Az miqdarda laktoza olduqda lak repressor onu bağlayaraq DNT operatorundan dissosiasiyaya səbəb olur və beləliklə, operonu gen ifadəsi üçün azad edir. Repressorların operatorlarından ayrılmasına səbəb olan substratlar induksiya edənlər, belə repressorlar tərəfindən tənzimlənən genlər isə induksiya olunan genlər adlanır.

              Müsbət nəzarət lak Operon

              Baxmayaraq ki, laktoza ifadəyə səbəb ola bilər lak operon, ifadə səviyyəsi çox aşağıdır. Bunun səbəbi odur ki lak operon katabolit repressiyasına və ya qlükozanın iştirakı ilə böyümə nəticəsində yaranan genlərin ifadəsinin azalmasına məruz qalır. Qlükoza çox asanlıqla metabolizə olunur, buna görə də laktozadan daha çox üstünlük verilən yanacaq mənbəyidir, buna görə də qlükoza ifadəsinin qarşısını almaq məntiqlidir. lak qlükoza mövcud olduqda operon.

              Promotorun gücü onun RNT polimerazanı bağlamaq və açıq kompleks yaratmaq qabiliyyəti ilə müəyyən edilir. üçün promouter lak operon zəifdir və buna görə də lak operon induksiya zamanı zəif transkripsiya olunur. Promotordan yuxarıda, katabolit aktivator zülalı (CAP) adlanan zülal üçün bağlanma yeri var. CAP zülalı bağlandıqda, DNT-ni təhrif edir ki, RNT polimeraza daha effektiv şəkildə bağlana bilsin, beləliklə, transkripsiya baş verir. lak operon çox güclənir. CAP-ı bağlamaq üçün əvvəlcə Adenilat Siklaza fermenti tərəfindən ATP-dən sintez edilən ikinci bir messencer olan siklik AMP-ni (cAMP) bağlamalıdır.

              Qlükoza sirkulyasiyasında cAMP səviyyəsi çox aşağıdır və nəticədə transkripsiyanın başlanğıcı lak operon çox aşağıdır. Qlükoza səviyyəsi azaldıqca cAMP-nin konsentrasiyası aktivləşdirici CAP-ni artırır, bu da öz növbəsində transkripsiyanı stimullaşdıran CAP sahəsinə bağlanır. cAMP-CAP kompleksi müsbət tənzimləyici adlanır.

              Arabinose enerji və karbon mənbəyi kimi xidmət edə bilən beş karbonlu şəkərdir E. coli. Arabinoza metabolizə edilməzdən əvvəl əvvəlcə ribuloza-5-fosfata çevrilməlidir. Arabinoz operonunda üç gen var,ərəbB, araAaraD Bu çevrilməni həyata keçirmək üçün üç fermenti kodlayan. Dördüncü gen, araC, öz promotoru olan C proteini adlanan tənzimləyici faktoru kodlayır.

              Tənzimləyici saytlar ara operona C zülalını bağlayan dörd sahə və bir CAP bağlama sahəsi daxildir. The araO1araO2 saytlar promouterin və CAP bağlama yerlərinin yuxarı axınındadır. Digər iki C zülalının bağlanma yeri adlanır araI1araI2 CAP bağlama yeri ilə promotor arasında yerləşir.

              Mənfi nəzarət araC Operon

              Arabinoza olmadıqda, C zülalının dimerləri bağlanır araO2, araO1araI1. C zülalları ilə bağlıdır araO2araI1 bir-biri ilə birləşmək və onların arasında DNT-nin operonun transkripsiyasını effektiv şəkildə bloklayan bir döngə meydana gətirməsinə səbəb olur.

              Müsbət nəzarət araC Operon

              C zülalı arabinozu bağlayır və ona həm də onu bağlamağa imkan verən konformasiya dəyişikliyinə məruz qalır araO2araI2 saytlar. Bu, C zülallarının qarşılıqlı təsirindən əmələ gələn fərqli bir DNT halqasının yaranması ilə nəticələnir. araO1araO2 saytlar.

              Bu döngənin meydana gəlməsi transkripsiyasını stimullaşdırır araC əlavə C zülal sintezi ilə nəticələnən gen, beləliklə, C zülalı öz sintezini avtomatik tənzimləyir. Qlükoza olmadıqda, CAP sahəsinə bağlanan cAMP-CAP əmələ gəlir. C zülalı ilə bağlanır araI1araI2 saytlar bağlı CAP ilə qarşılıqlı əlaqədə olur və RNT polimerazadan transkripsiyanı başlatmağa imkan verir ara operon promotoru.

              Triptofan operonu

              E. coli 20 təbii amin turşusunun hamısını sintez edə bilir. Amin turşusu sintezi çox enerji sərf edir, buna görə də enerji israfının qarşısını almaq üçün amin turşusu sintezini kodlayan operonlar sıx şəkildə tənzimlənir. The trp operon beş gendən ibarətdir, trpE, trpD, trpC, trpBtrpA, triptofanın sintezi üçün lazım olan fermentləri kodlayan.

              The trp operon iki mexanizmlə tənzimlənir, mənfi corepression və zəifləmə. Amin turşusu sintezində iştirak edən operonların əksəriyyəti bu iki mexanizmlə tənzimlənir.

              Trp operonu mənfi şəkildə idarə olunur trp repressor, məhsulu trpR gen. The trp repressor operatora bağlanır və operonun transkripsiyasını bloklayır. Bununla belə, operatora bağlanmaq üçün repressor ilk növbədə Trp ilə bağlanmalıdır, buna görə də triptofan corepressordur. Trp olmadıqda trp repressor dissosiasiya və transkripsiya trp operon işə salınır.

              Zəifləmə, triptofan konsentrasiyasının bir funksiyası olaraq transkripsiyanın dayandırılmasını tənzimləyir. Aşağı səviyyələrdə trp tam uzunluqda mRNA, yüksək səviyyədə transkripsiya edilir trp operon vaxtından əvvəl dayandırılır. Zəifləmə transkripsiyanı tərcümə ilə birləşdirərək işləyir. Prokaryotik mRNT emal tələb etmir və prokaryotlarda mRNT-nin nüvə tərcüməsi olmadığı üçün transkripsiya tamamlanmazdan əvvəl başlaya bilər. Nəticədə, zəifləmə yolu ilə gen ifadəsinin tənzimlənməsi prokaryotlara xasdır.

              a. Zəifləməyə mRNT-də trp operonunun 5' seqmentində iki mümkün kök döngə strukturundan birinin formalaşması vasitəçilik edir.

              b. Triptofan konsentrasiyası aşağı olarsa, lider peptidinin tərcüməsi yavaş olur və trp operonun transkripsiyası tərcüməni üstələyir. Bu, mRNT-nin 5' seqmentində 2 və 3-cü bölgələr arasında ucsuz-bucaqsız kök döngə quruluşunun əmələ gəlməsi ilə nəticələnir. Daha sonra trp operonunun transkripsiyası tamamlanır.

              c. Triptofan konsentrasiyaları yüksək olarsa, ribosom tez mRNT lider peptidini çevirir. Tərcümə sürətlə baş verdiyi üçün ribosom 2-ci bölgəni əhatə edir ki, 3-cü bölgəyə birləşə bilməyəcək. Nəticədə 3 və 4-cü bölgələr arasında gövdə-halqa quruluşunun əmələ gəlməsi baş verir və transkripsiya dayandırılır.

              Eukariotlarda gen ifadəsinin tənzimlənməsi

              İnsan hüceyrəsinin genetik məlumatı prokaryotik hüceyrəninkindən min dəfə böyükdür. Hüceyrə növlərinin sayı və hər bir hüceyrə tipinin orqanizmlərin inkişafının müxtəlif nöqtələrində müəyyən bir gen alt dəstini ifadə etməli olması faktı ilə işlər daha da mürəkkəbləşir. Müəyyən bir gen alt qrupunun müəyyən bir toxumada inkişafın müəyyən nöqtələrində ifadə edilməsi üçün gen ifadəsini tənzimləmək çox mürəkkəbdir. Tənzimləmədəki bu artan mürəkkəblik xəstəliyə səbəb olan nasazlıqlara səbəb olur. Eukaryotların gen ifadəsini tənzimləməsinin üç yolu müzakirə ediləcək: gen məzmununun və ya mövqeyinin dəyişdirilməsi, transkripsiya tənzimlənməsi və alternativ RNT emalı.

              1. Gen məzmununun və ya mövqeyinin dəyişdirilməsi

              Bir genin surət nömrəsi və ya onun xromosomdakı yeri onun ifadə səviyyəsinə böyük təsir göstərə bilər. Gen məzmunu və ya yeri gen gücləndirilməsi, azaldılması və ya yenidən təşkili ilə dəyişdirilə bilər.

              Müəyyən bir genin ifadəsi onun surət sayını artırmaqla artırıla bilər. Histon zülalları və rRNT demək olar ki, bütün eukaryotik hüceyrələr tərəfindən böyük miqdarda tələb olunur, buna görə də histonları və rRNT-ni kodlayan genlər daimi gücləndirilmiş vəziyyətdə mövcuddur. Genin gücləndirilməsi kemoterapevtik dərmanların istifadəsi ilə bağlı problemlər yarada bilər. Metotreksat, nukleotidlərin sintezində istifadə olunan folatların bərpasına cavabdeh olan ferment olan dihidrofolat reduktazasını inhibə edir. Şiş hüceyrələri tez-tez dərmana davamlı olur, çünki dihidrofolat reduktazı kodlayan gen bir neçə yüz dəfə gücləndirilir və bu, dərmanın idarə edə biləcəyindən daha çox ferment istehsalına səbəb olur.

              İfadəsi yalnız müəyyən bir inkişaf nöqtəsində və ya müəyyən bir toxumada lazım olan bir gen, gen azalması ilə bağlana bilər. Retikulositlər qırmızı qan hüceyrələrinə çevrildikdə, nüvənin parçalanması nəticəsində bütün genləri itirilir.

              Genlərin yenidən təşkili B hüceyrələri tərəfindən istehsal olunan milyonlarla müxtəlif antikorları kodlayan genlərin hər birini yaratmaq üçün istifadə olunur. Bəzən düzgün olmayan gen tənzimlənməsinə səbəb olan pis gen yenidən qurulması baş verir. Bu, tez-tez xərçəng hüceyrələrində olur. Seqmentin 8-ci xromosomdan immunoqlobulinləri kodlayan xromosomlara köçürülməsi sağlam B hüceyrələrini Burkitt limfoma hüceyrələrinə (tənzimlənməyən çoxalmış B hüceyrələri) çevirən genin aktivləşməsinə gətirib çıxarır.

              2. Transkripsiya tənzimləməsi

              Xromosom qablaşdırma vasitəsilə

              Fərqli xromosomların hər birinin bölgələri ya heterokromatin və ya euxromatin kimi qablaşdırılır. Heterokromatində DNT çox sıx şəkildə sıxlaşır və transkripsiya mexanizminə əlçatmaz olur, buna görə də heterokromatin transkripsiya baxımından qeyri-aktivdir. İnsan qadınlarında hər iki X xromosomundan biri Barr cəsədi yaratmaq üçün heterokromatinə qablaşdırılaraq tamamilə təsirsiz hala gətirilir. Heterokromatində DNT-dəki Cys qalıqları ağır şəkildə metilləşir, bu da metilasiyanın heterokromatinin saxlanmasında rol oynaya biləcəyini göstərir. Metilasiyaya mane olan dərmanlar, heterokromatində olan əvvəllər aktiv olmayan genlərin aktivləşməsinə səbəb olur.

              Euxromatində DNT o qədər də qatılaşdırılmış deyil və transkripsiya mexanizmi üçün əlçatandır. Xromosomun hetero- və euxromatin kimi saxlanılan bölgələri hüceyrəyə xas şəkildə dəyişə bilər. Bu, spesifik toxumaların hüceyrələrinə toxuma funksiyası üçün tələb olunan genlərin müəyyən bir hissəsini ifadə etməyə imkan verə bilər.

              Fərdi genlər vasitəsilə

              Gen ifadəsinin tənzimlənməsində iştirak edən zülallara tez-tez trans fəaliyyət göstərən elementlər deyilir. Müəyyən bir genin tənzimlənməsi üçün bir çox spesifik olan ən azı 100 fərqli zülal məlumdur. Digərləri CAP-cAMP kompleksi tərəfindən çoxsaylı prokaryotik genlərin aktivləşdirilməsinə bənzər şəkildə gen ifadəsinin tənzimlənməsində daha ümumi rol oynayır. Trans-fəaliyyət göstərən amillər fəaliyyət üçün tələb olunan çoxsaylı domenlərə malikdir və DNT-ni bağlayan, transkripsiyanı aktivləşdirən və liqand bağlayan domenləri əhatə edə bilər.

              DNT bağlayan domenlər genin tənzimləyici bölgələrində xüsusi DNT ardıcıllığını tanıyır. Tənzimləyici zülalın DNT-ni bağlayan domenləri ümumiyyətlə üç motivdən birindən ibarətdir: spiral döngə, sink barmaq və ya leysin fermuarı. Bu motivlərə malik olan DNT-ni bağlayan zülallar onların tanınma yerlərinə yüksək, digər DNT-yə isə aşağı yaxınlıq ilə bağlanır. Zülalın çox kiçik bir hissəsi DNT-nin əsas yivində və fosfat onurğasında amin turşusu yan zəncirləri ilə funksional qruplar arasında H-bağları və van der Waals qarşılıqlı əlaqəsi vasitəsilə DNT ilə əlaqə qurur. Zülalın qalan hissəsi DNT-ni bağlayan sahənin düzgün yerləşdirilməsində və digər transkripsiya zülalları ilə zülal-zülal əlaqələrinin qurulmasında iştirak edir.

              Bu motivli zülallar simmetrik palindromik DNT ardıcıllığını tanıyan simmetrik dimerlər əmələ gətirir. Dimerin hər bir monomeri, iki a spiralının dörd amin turşusunun növbəsi ilə bir-birinə 90 dərəcə tutulduğu bir bölgəni ehtiva edir. Bir spiral dəsti əsas yivdə təxminən beş baza cütü ilə əlaqə qurur. Digər dəst fosfat onurğasının üstündə oturur və əsas yivə uyğun gələn spiral dəstini düzgün yerləşdirməyə kömək edir.

              Bu motivə malik olan zülalların hər biri tetraedral koordinasiyalı sink ionu üzərində mərkəzləşmiş 2 ilə 9 arasında təkrarlanan domenləri ehtiva edir. Sinklə əlaqələndirilmiş hər bir domen a-heliksdən ibarət bir döngə əmələ gətirir, bu döngəyə sink-barmaq deyilir. Sink barmaqlarının iki növü var: C2H2 barmaq və Cx barmaq.

              Üç barmaq əsas yivlə qarşılıqlı əlaqədə olur və DNT-nin ətrafına sarılır. Bir çox transkripsiya faktoru bu tip domenə malikdir.

              Bu motivli zülallar DNT-nin əsas yivinə dimerlər kimi bağlanır. Bir çox steroid reseptorlarında bu tip domen var.

              Bu tip motivli zülalların karboksil ucunda amfipatik a-spiral var. Spiralın bir tərəfi hidrofobik qruplardan, adətən leysindən ibarətdir, onlar sarmalın bir neçə növbəsi üçün hər yeddinci mövqedə təkrarlanır. Digər üz yüklü və qütb qruplarından ibarətdir.

              Bu motivli zülallar DNT-nin əsas yivinə dimerlər kimi bağlanır. Hər bir qolun iki a-spiralı əsas yivə daxil olur və qoşa sarmal ətrafında sarılır. Bir neçə onkogen bu tip motivdən istifadə edir.

              Transkripsiyanı aktivləşdirən domenlər

              Bu domenlər ümumiyyətlə DNT bağlayan domenlərdən ayrı və müstəqil fəaliyyət göstərir. Transkripsiyanı aktivləşdirən domenlər digər tənzimləyici zülallarla və/yaxud RNT polimeraza ilə fiziki təsirsizliyə məruz qalaraq transkripsiyanı gücləndirir. Bu domenlərin transkripsiyanı aktivləşdirdiyi və ya gücləndirdiyi faktiki mexanizmlər məlum deyil.

              Steroid hormonları, tiroid hormonları və retinoik turşu bir reseptor zülalında xüsusi bir sahəyə bağlanaraq transkripsiyanı aktivləşdirən liqandlara misaldır. Bağlandıqdan sonra reseptor DNT-ni bağlamağa imkan verən bir quruluş dəyişikliyinə məruz qalır. DNT-yə bağlandıqdan sonra reseptor zülalı hədəf genin transkripsiyasını aktivləşdirə və ya repressiya edə bilər.

              Cis-fəaliyyət göstərən elementlər transkripsiyanı tənzimləyən trans-fəal elementlər tərəfindən tanınan və bağlanan DNT ardıcıllığıdır. Cis-fəaliyyət göstərən elementlərin iki əsas növü var: promouterlər və tənzimləyici elementlər.

              Promotorlar transkripsiyaya başlamaq üçün RNT polimerazanın DNT-yə bağlanmalı olduğu yerlərdir (bax "RNTSintezi və Emalı" mühazirəsi). RNT polimeraz tərəfindən promotorun istifadə sürəti və ya səmərəliliyi tənzimləyici elementlərdən təsirlənir.

              Tənzimləyici elementlər müəyyən bir genin ifadəsini stimullaşdıran və ya maneə törədən trans-fəal elementlər tərəfindən tanınan və bağlanan xüsusi DNT ardıcıllığıdır. İki növ var: gücləndiricilər və cavab elementləri.

              Gücləndiricilər gen transkripsiyasının sürətini artıran və ya repressiya edən tənzimləyici elementlərdir.

              Cavab Elementləri bir qrup genin koordinasiyalı tənzimlənməsini asanlaşdıran tənzimləyici ardıcıllıqlardır. Steroid hormonları və cAMP kimi bəzi liqandlar öz reseptorlarına bağlanır, bu da öz növbəsində transkripsiyanı aktivləşdirmək və ya inhibə etmək üçün cavab elementinə bağlanır.

              3. Alternativ emal

              Alternativ başlanğıc yerində transkripsiyaya başlamaq transkriptin 5' sonunda fərqli bir ekson yerləşdirir. Tənzimləmə forması kimi alternativ başlanğıc yerlərindən istifadə edən genlərə misal olaraq amilaz, miyozin və spirt dehidrogenaz daxildir.

              Alternativ poliadenilasiya yerləri

              İmmunoqlobin (antikor) ağır zəncirləri transkriptlərin uzunluğuna təsir etmək üçün alternativ poliadenilasiya yerindən istifadə edir. Daha uzun transkript m-ni kodlayır m limfositlərin hüceyrə membranlarında lokallaşdırılmış forma, daha qısa transkript ifraz olunan formanı kodlayır, m s.

              İzoformlar adlanan toxuma spesifik funksiyaları olan oxşar zülalları yaratmaq üçün alternativ birləşmə yerləri istifadə olunur. Bir çox peptid hormonları, tiroid bezində kalsitonin və neyronlarda kalsitonin geni ilə əlaqəli peptid istehsal etmək üçün diferensial şəkildə birləşdirilmiş kalsitonin geni kimi izoformlar kimi mövcuddur.

              mRNT sabitliyinin tənzimlənməsi

              mRNT-nin sabitliyi gendən genə olduqca dəyişkəndir. Sabitlikdəki bu dəyişikliklər mRNT-nin tərcümə üçün mövcud olduğu müddətin uzunluğunu və beləliklə sintez edilən zülalın miqdarını tənzimləyir. mRNT-nin yarı ömrü 10 saatdan dəqiqəyə qədər dəyişir. mRNT-nin 3' tərcümə edilməmiş bölgəsində sürətli deqradasiya üçün siqnal kimi xidmət edən ardıcıllıqlar bəzi mRNT-lərdə çox qısa yarı ömrü ilə müəyyən edilmişdir. Poli A quyruğunun uzunluğu da mRNT sabitliyinə təsir göstərir, daha uzun quyruqlar daha uzun yarım ömrünə malikdir.


              Videoya baxın: DƏRİ SALLANMASINA QARŞI MASKA!. (Iyul 2022).


Şərhlər:

  1. Barthram

    Ready to debate on the topic?

  2. Stanway

    Bəli, həqiqətən. Və mən buna qaçdım. Gəlin bu məsələni müzakirə edək. Burada və ya PM-də.

  3. Zared

    At all personally go today?

  4. Mac Asgaill

    İnanıram ki, səhv edirsən. Mən mövqeyimizi müdafiə edə bilərəm. PM-də mənə e-poçt göndərin, danışacağıq.

  5. Raedeman

    Bu mesaj müqayisə olunmaz

  6. Reto

    Bəli, düşünmək üçün bir şey var. Ey!

  7. Saebeorht

    Nə sözdür... əladır

  8. Lionell

    Ancaq ümumiyyətlə gülməlidir.



Mesaj yazmaq