Məlumat

İstifadə olunan vektorun qeyri-adi terminologiyası

İstifadə olunan vektorun qeyri-adi terminologiyası


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

pET-28 a(+) adında a+ hərfinin əhəmiyyəti nədir? a,a+,a- arasında hər hansı a- gərginliyi və fərqlər varmı?


Bunun 3 versiyası var (a,b və c). plazmid müxtəlif çoxlu klonlama saytları ilə.

Plazmidlərinizi viruslara qablaşdırmadığınız halda, "(+)" hissəsini təhlükəsiz şəkildə gözardı edə bilərsiniz.

Siz Millipore saytında mövcud olan resurslardan təfərrüatları öyrənə və ardıcıllıqlara baxa bilərsiniz. Bunu "pET-28 a(+)" axtararaq tapdım...


İstifadə olunan vektorun qeyri-adi terminologiyası - Biologiya

Bu sentromerlər ətrafında ləkələnmiş bölgələr yaratmaq üçün bir texnikadır.

C-Dəyər:

Bu haploid genomda DNT-nin ümumi miqdarıdır.

Kalibrator:

İfadə tədqiqatlarında nisbi qat artımı üçün əsas kimi istifadə edilən tək istinad nümunəsi (sabit reaksiya effektivliyini nəzərə alaraq). Bu kalibrator hər bir analizə daxil edilməlidir.

Bütün eukariotlar mesajlarının 5' sonunda mRNT-nin birinci nukleotidi ilə 5'-5' trifosfat əlaqəsində olan 7-metilquanozindən ibarət olan "cap" adlanan struktura malikdirlər. Transkripsiyadan sonra əlavə olunur və DNT-də kodlaşdırılmır.

Cap Site:

Eukariotlarda qapaq yeri transkripsiyanın başladığı gendəki mövqedir və həqiqətən də "transkripsiya başlanğıc yeri" adlandırılmalıdır. Yeni yaranan RNT zəncirini başlamaq üçün ilk nukleotid bu yerdən köçürülür. Həmin nukleotid zəncirin 5' ucu və beləliklə də qapaq quruluşunun bağlı olduğu nukleotid olur.

Kapsid:

Virus hissəciklərinin xarici zülal örtüyüdür.

CAT Təhlili:

Bir ferment analizi. CAT, xloramfenikol asetil transferazı, xloramfenikolunu asetilləşdirərək təsirsiz hala gətirən bir bakterial ferment deməkdir. CAT analizləri tez-tez promotorun funksiyasını yoxlamaq üçün aparılır. CAT üçün kodlaşdıran gen başqa bir gendən olan promotorla (transkripsiyaya nəzarət bölgəsi) əlaqələndirilir və konstruksiya mədəni hüceyrələrə "transfektsiya edilir" İstehsal edilən CAT fermentinin miqdarı promotorun transkripsiya fəaliyyətini göstərmək üçün götürülür (paralel olaraq sınaqdan keçirilməli olan digər promotorlara nisbətən). CAT analizini yerinə yetirmək Northern blot etməkdən daha asandır, buna görə də CAT analizləri ardıcıllıq dəyişikliklərinin promotor funksiyasına təsirini yoxlamaq üçün ümumi üsul idi. Əsasən müxbir geni lusiferaza ilə əvəzlənir.

CCAAT qutusu:

(CAT qutusu, CAAT qutusu, digər variantlar) Effektiv ifadə üçün zəruri olan müəyyən genlərin 5' yan bölgəsində tapılan ardıcıllıq. Transkripsiya faktoru (CCAAT bağlayan protein, CBP) bu sahəyə bağlanır.

CDNA klonu:

"tamamlayıcı DNT" mRNT-dən kopyalanmış DNT parçası. "klon" termini onu göstərir ki, bu cDNT onu yaymaq üçün plazmid və ya başqa vektora birləşdirilib.

Mərkəzi dogma:

Yalnız DNT-dən RNT-yə, zülala doğru gedən məlumat axını anlayışına istinad edən ifadə.

Sentromer:

İki bacı xromatidin birləşdiyi və hüceyrə bölünməsi zamanı mil liflərinin bağlandığı xromosomun xüsusi sıxılmış bölgəsi.

Şaperon zülalları:

Endoplazmik retikulumda zülalların vaxtından əvvəl qatlanmasının qarşısını alan və kompleks bağlanma və sərbəst buraxılma reaksiyaları vasitəsilə ifraz olunan zülalların düzgün qatlanmasına rəhbərlik edən bir sıra zülallar.

Kimyəvi mürəkkəblik:

Bu, kimyəvi analizlə ölçülən DNT komponentinin miqdarıdır.

Xromatid:

Tək, davamlı iki zəncirli DNT molekulu, özünəməxsus, tam genetik məlumat qruplaşması, əlaqəli zülallar, yüksək səviyyəli strukturlar və replikasiyadan sonra ayrılması və saxlanması üçün zəruri olan sentromerik və telomerik bölgələr.

Xromatin İmmunopresipitasiyası:

Bu, maraq doğuran bir zülalın bağlı olduğu bütün genomdan DNT-nin xüsusi hissələrini təcrid etmək və xarakterizə etmək üçün bir üsuldur. Maraqlanan zülal, məsələn, transkripsiya faktoru və ya xüsusi dəyişdirilmiş histon və ya hər hansı digər DNT bağlayıcı zülal ola bilər.

Xromosomlar:

Nukleotid ardıcıllığında genlərin xətti massivini daşıyan hüceyrə DNT-sini ehtiva edən hüceyrələrin sıxlaşmış, fibrilyar, özünü təkrarlayan genetik strukturları. Prokaryotlarda xromosom DNT dairəvidir və bütün genom bir xromosomda aparılır. Eukaryotik genomlar DNT-si müxtəlif növ zülallarla əlaqəli olan bir sıra xromosomlardan ibarətdir.

Xromosom atlaması:

Bir xromosomun bir bölgəsindən bir DNT parçası ilə başlayan və aralarındakı hər şeyi klonlaşdırmadan yaxınlıqdakı bölgələrdən klonlar əldə etdiyi bir texnika (xromosom gəzintisində olduğu kimi aşağıya baxın). Bir tur atlama başlanğıc nöqtəsindən bir neçə onlarla kb məsafədə yeni klonlar verir. Praktikada bu üsul klassik genetika məlum DNT parçasının xromosomda sizin klonlaşdırmaq istədiyiniz genə (məsələn, insan xəstəlik geni) yaxın olduğunu sübut etdikdə istifadə olunur. Məlum fraqmentdən hər iki istiqamətdə müəyyən məsafədə fraqmentləri klonlaşdırmaqla, (1) istənilən gendən daha uzaq fraqmentlər (bunlar atılır) (2) arzu olunan genlə daha da sıx əlaqəli fraqmentlər əldə edilə bilər (bu halda bir atlamanın başqa raundu) və ya (3) istənilən gen daxilindən fraqmentlər - optimal nəticə.

Xromosom gəzintisi:

DNT-nin məlum parçası ətrafında genomdakı hər şeyi klonlaşdırmaq üçün bir texnika. Siz zondla hibridləşən bütün klonlar üçün genomik kitabxananı yoxlayırsınız və sonra hansının ətrafdakı DNT-yə daha çox uzandığını müəyyənləşdirirsiniz. Bu ən distal klonun ən distal hissəsi daha sonra bir zond kimi istifadə olunur ki, daha çox distal bölgələr klonlana bilsin. Bu, müəyyən bir başlanğıc nöqtəsindən 200 kb-ə qədər uzaqlaşmaq üçün istifadə edilmişdir (böyük bir iş). Adətən həmin geni klonlaşdırmaq üçün başlanğıc nöqtəsindən yaxınlıqdakı genlərə doğru "gezmək" üçün istifadə olunur. Bir genin bir hissəsini təcrid etdikdə onun qalan hissəsini əldə etmək üçün də istifadə olunur.

Eyni molekulda yerləşən iki saytın qarşılıqlı təsiri. Bununla belə, cis-təsirli zülal ya yalnız ifadə olunduğu DNT molekuluna təsir edən, ya da özünə təsir edən zülal ola bilər.

Cistron:

Polipeptid zəncirinə uyğun gələn nuklein turşusu seqmenti, o cümlədən müvafiq translyasiya başlanğıc (başlanğıc) və dayandırma (xitam) kodonları.

Klonlar:

Tək əcdaddan əmələ gələn hüceyrələr qrupu.

Klonlama:

Müəyyən bir DNT parçasının kifayət qədər nüsxələrinin yaradılması və ya bir əcdaddan genetik cəhətdən eyni olan hüceyrələr qrupunun (klonların) aseksual olaraq istehsalı prosesi. Rekombinant DNT texnologiyasında, bir genin və ya DNT seqmentinin çoxsaylı nüsxələrini yaratmaq üçün DNT manipulyasiya prosedurlarından istifadə DNT-nin klonlaşdırılması adlanır.

Klonlama vektoru:

Virusdan, plazmiddən və ya daha yüksək bir orqanizmin hüceyrəsindən yaranan DNT molekulu, öz-özünə replikasiya vektorları üçün vektor qabiliyyətini itirmədən müvafiq ölçüdə başqa bir DNT fraqmentinin inteqrasiya oluna biləcəyi, yad DNT-ni ev sahibi hüceyrələrə daxil edir. böyük miqdarda təkrar istehsal olunur. Nümunələr plazmidlər, kosmidlər, bakterial süni xromosomlar (BAC) və maya süni xromosomları (YAC) vektorları çox vaxt bir neçə mənbədən DNT ardıcıllığını ehtiva edən rekombinant molekullardır.

Qapalı Oxu çərçivələri:

Tərkibində zülallara çevrilməsinə mane olan son kodonlar var.

Kodlaşdırma ardıcıllığı:

Bir genin və ya mRNT-nin əslində bir proteini kodlayan hissəsi. İntronlar kodlaşdırma ardıcıllığı deyil cDNA və ya yetkin mRNA-da kodlaşdırma ardıcıllığına AUG (və ya ATG) başlanğıc kodundan tutmuş dayanma kodonuna qədər hər şey daxildir.

Kodlama Strand:

iki zəncirli gendə müəyyən bir zəncirlə əlaqə saxlamaq üçün nəzərdə tutulmuş qeyri-müəyyən termin.

Kodon:

Xəbərçi RNT (mRNA) daxilində ardıcıl üç nukleotiddən ibarət qrup, tərcüməni başlatmaq, artan polipeptid zəncirinə spesifik amin turşusunu daxil etmək və ya tərcüməni dayandırmaq üçün mesajı kodlayır. mRNT-dəki kodonların ardıcıllığı birmənalı olaraq son zülalın ilkin strukturunu müəyyən edir. Əlbəttə ki, mRNT-dəki kodonlar genomik DNT-də də mövcud idi, lakin ardıcıllıq intronlar tərəfindən kəsilə bilər.

Kodon qərəzi:

Bir orqanizmin və ya virusun müəyyən bir amin turşusunu kodlaşdırmaq üçün digərlərindən daha çox müəyyən kodonlardan istifadə etmə meyli. Kodon meylinin mühüm təyinedicisi genomun guanozin-sitozin (GC) tərkibidir. Nisbətən aşağı G+C məzmunu 30% olan bir orqanizmin kodonun üçüncü mövqeyində G və ya C olması ehtimalı A və ya T ilə təmsil oluna bilən amin turşusu ilə müqayisədə daha az olacaq. birdən çox kodon.

Dəyişiklik əmsalı (CV):

Eksperimental variasiya ölçüsü kimi istifadə olunur. CV-nin hesablanması üçün xətti dəyərin istifadə edilməsi vacibdir (lakin loqarifmik olan Ct qiymətləri deyil).

Birgə xəttilik:

DNT-də kodlanmış məlumat ilə DNT-dən hazırlanmış transkriptlərdən tərcümə edilmiş polipeptid məhsulu arasında dəqiq yazışmalara istinad edir. Əksər prokaryotik genlər öz məhsulları ilə eyni xətti olur, eukaryotik genlər çox vaxt belə olmur.

Bacarıqlı:

Xarici xromosom DNT-ni qəbul etməyə qadir olan bakteriya hüceyrələri.

Tamamlayıcı DNT (cDNA):

Əks transkriptaza fermentindən istifadə edərək bir xəbərçi RNT molekulundan sintez edilmiş DNT ardıcıllığı. cDNA-lar, intronları (qeyri-zülal kodlaşdıran bölmələr) ayrıldıqdan sonra messenger RNT-lərin ardıcıllığını müəyyən etmək üçün eksperimental olaraq istifadə edilə bilər. Tək telli forma tez-tez fiziki xəritəçəkmədə zond kimi istifadə olunur.

Tamamlayıcı ardıcıllıqlar:

Baza cütlərini G- T- A- C ilə tamamlayan ardıcıllığı uyğunlaşdırmaqla ikiqat zəncirli struktur yarada bilən nuklein turşusu əsas ardıcıllığı C- A- T- G-dir.

Kompozit transpozonlar:

Onların hər tərəfdən daxiletmə ardıcıllığı ilə birləşmiş mərkəzi bölgə var, bunlardan biri və ya hər ikisi bütün elementin yerini dəyişdirməyə imkan verə bilər.

Əlaqələndirici:

Tamamlayıcı ucları olan monomerik DNT molekullarının tandem massivləri. Bu cür molekulların molekuldaxili reassosiasiyası sirkulyasiyaya səbəb olur, molekullararası reaksiya isə konkamerlər yaradır.

Konformasiya epitopu:

Həmçinin "qlobal epitop" deyilir. İmmunogen molekulun bitişik, lakin fiziki olaraq kəsilməyən komponentlərindən ibarət epitop. Zülallı antigendə bu, bir polipeptid daxilində müxtəlif uzanmalardan və ya hətta müxtəlif polipeptid alt bölmələrindən olan ardıcıllıqlar ola bilər.

Konjuqasiya:

DNT-nin yönəldilmiş ötürülməsinə imkan verən iki fərqli bakteriya hüceyrəsi arasında plazma körpülərinin qurulması ilə fiziki təmas.

Konsensus ardıcıllığı:

Orqanizm daxilindəki müxtəlif genlərə və ya müxtəlif orqanizmlər arasında eyni genə aid olan, müəyyən bir funksiyanı kodlayan ardıcıllıqlara istinad edən termin. Bu termin həm nuklein turşularına, həm də zülallara aid edilə bilər, çünki zülal ardıcıllığı tamamilə nuklein turşusu ardıcıllığından asılıdır.

Qoruma:

İki fərqli orqanizmdə mövcud olan genlərin eyni hissələrinin qorunduğu deyilir. Konservasiya iki ardıcıllığın əsas (RNT və ya DNT) və ya amin turşusu (protein) səviyyəsində oxşarlığını ölçməklə aşkar edilə bilər.

Saxlanılan ardıcıllıq:

DNT molekulunda (və ya zülalda amin turşusu ardıcıllığı) əsas ardıcıllıq təkamül boyu dəyişməz qalmışdır. Nə qədər çox oxşarlıq varsa, iki ardıcıllıq bir o qədər yüksək qorunur.

Mühafizəkar Əvəzetmə:

Zülalın amin turşusu ardıcıllığını dəyişdirən, lakin oxşar yük/qütb xüsusiyyətlərinə malik yan zəncirinə malik bir amin turşusunun digəri ilə əvəzlənməsinə səbəb olan nukleotid mutasiyası.

Tamamlayıcı ardıcıllıqlar:

Baza cütlərini tamamlayan ardıcıllığı G- T- A- C-yə uyğunlaşdırmaqla ikiqat zəncirli struktur yarada bilən nuklein turşusu əsas ardıcıllığı C- A- T- G-dir.

Əlaqələndirici:

Tamamlayıcı ucları olan monomerik DNT molekullarının tandem massivləri. Bu cür molekulların molekuldaxili reassosiasiyası sirkulyasiyaya səbəb olur, molekullararası reaksiya isə konkamerlər yaradır.

Uyğunluq:

Molekulun 3 ölçülü quruluşu.

Konjuqasiya:

DNT-nin yönəldilmiş ötürülməsinə imkan verən iki fərqli bakteriya hüceyrəsi arasında plazma körpülərinin qurulması ilə fiziki təmas.

Qoruma:

İki fərqli orqanizmdə mövcud olan genlərin eyni hissələrinin qorunduğu deyilir. Konservasiya iki ardıcıllığın əsas (RNT və ya DNT) və ya amin turşusu (protein) səviyyəsində oxşarlığını ölçməklə aşkar edilə bilər.

Qurucu ifadə:

Daim müəyyən dərəcədə nəzərə çarpan səviyyədə ifadə edilir.

Qurucu genlər:

Bunlar RNT polimerazanın əlavə promotor olmadan promotorla qarşılıqlı əlaqəsi kimi ifadə edilir.

Contig:

'Contig' DNT-nin bəzi seqmentini tamamilə, bitişik şəkildə əhatə edən bir sıra klonların yerləşdirilməsini göstərən xəritəyə istinad edə bilər. Daha tez-tez 'contig' termini ov tüfənginin ardıcıllığı layihəsinin son məhsuluna istinad etmək üçün istifadə olunur. Daha böyük DNT parçasının ardıcıllığını çıxarmaq üçün ardıcıllıq məlumatının ayrı-ayrı zolaqları birləşdirildikdə, məhsulun konsensus ardıcıllığı “contig” adlanır.

Contig xəritəsi:

Tam xromosom seqmentini təmsil edən kiçik üst-üstə düşən klonların əlaqəli kitabxanasının nisbi sırasını təsvir edən xəritə.

Kosmid:

35-45 kb DNT-nin klonlanması üçün istifadə edilən süni şəkildə qurulmuş vektor növü. Bunlar phagel cos yeri, replikasiya mənşəyi və antibiotik müqavimət genini daşıyan plazmidlərdir. 40 kb-lik bir plazmidi bakteriyalara yerləşdirmək çox çətindir, lakin orada bir dəfə təkrarlana bilər. Bununla belə, kosmidlərin bir cos sahəsi var və beləliklə, bakteriyalara effektiv şəkildə daxil olmaq üçün l-faj başlıqlarına qablaşdırıla bilər.

Keçid:

Bir ana və bir ata xromosomunun meioz zamanı qırılması, DNT-nin müvafiq bölmələrinin mübadiləsi və xromosomların yenidən birləşməsi. Bu proses xromosomlar arasında allel mübadiləsi ilə nəticələnə bilər.

Siklinlər:

Bunlar həyat dövrü boyunca davamlı olaraq toplanan və sonra meioz zamanı proteolizlə məhv edilən zülallardır.

Sitozin (C):

DNT və RNT-də olan pirimidin əsaslarından biri (4-amino-2-hidroksipirimidin). G-C əsas cütünün bir üzvü (guanin və sitozin).

Sitoplazmik irsiyyət:

Bu, mitoxondriya və ya xloroplastlarda yerləşən genlərin bir xüsusiyyətidir.

Ct (ərəfəsində dövr):

Eşik dövrü reaksiya daxilində yaranan flüoresansın həddi keçdiyi dövr nömrəsini əks etdirir. İlkin surət nömrəsinin loqarifmi ilə tərs korrelyasiya olunur. Müəyyən bir quyuya təyin edilmiş Ct dəyəri beləliklə reaksiya zamanı kifayət qədər sayda amplikonların yığıldığı nöqtəni əks etdirir. LightCycler terminologiyasında keçid nöqtəsi (Cp) də adlanır.

Sitozol:

Orqanoidlərin yerləşdiyi sitoplazmanın ümumi həcmini təsvir edir.


Haşiyələr

Məhdudiyyətsiz istifadəyə icazə verən Creative Commons Attribution License http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ şərtlərinə əsasən Royal Society tərəfindən nəşr olunub, orijinal müəllif və mənbə qeyd olunmaqla.

İstinadlar

. 2007 Qərbi Nil virusunun qərb yarımkürəsində davam edən yayılması. Clin. Yoluxdurmaq. Dis. 45, 1039–1046. (doi:10.1086/521911) Crossref, PubMed, Google Scholar

2013 Avropada Qərbi Nil virusu: yaranması, epidemiologiyası, diaqnozu, müalicəsi və qarşısının alınması. Clin. Mikrobiol. Yoluxdurmaq. 19, 699–704. (doi:10.1111/1469-0691.12211) Crossref, PubMed, Google Scholar

2010 Avropada Krım-Konqo hemorragik qızdırması: mövcud vəziyyət hazırlıq tələb edir. Avro müşahidə 15, 48–51. Google Alim

. 2013 Avropada hantavirusun yaranmasına səbəb olan amillər. Curr. Rəy. Virol . 3, 92–99. (doi:10.1016/j.coviro.2013.01.002) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 2009 Avropada Bluetongue: keçmiş, indi və gələcək. Fil. Trans. R. Soc. B 364, 2669–2681. (doi:10.1098/rstb.2009.0091) Link, Google Scholar

. 2016 Zika virusu: əvvəllər yavaş olan pandemiya Amerikada sürətlə yayılır. J. General Virol. 97, 269–273. (doi:10.1099/jgv.0.000381) Crossref, PubMed, Google Scholar

Rizzoli A, Hauffe HC, Carpi G, Vourc'h GI, Neteler M, Rosa R

. 2011 Avropada Lyme borreliozu. Avro müşahidə 16, 2–9. Google Alim

. 2015 Chikungunya virusu və ağcaqanad yoluxucu xəstəliyin qlobal yayılması. N. Engl. J. Med. 372, 1231–1239. (doi:10.1056/NEJMra1406035) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 2016 Cənubi Avropanın gələcək bəlaları: vektorla ötürülən laqeyd tropik xəstəliklər. PLoS Negl. Trop. Dis. 10, e0004243. (doi:10.1371/journal.pntd.0004243) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 2014 İnək vərəminə nəzarət. Baytar. Tövsiyə. 174, 535–536. (doi:10.1136/vr.g3414) Crossref, PubMed, Google Scholar

Roberts T, O'Connor C, Nuñez-Garcia J, de la Rua-Domenech R, Smith NH

. 2014 Qeyri-adi çoxluq Mycobacterium bovis pişiklərdə infeksiya. Baytar. Tövsiyə. 174, 326. (doi:10.1136/vr.102457) Crossref, PubMed, Google Scholar

2016 Hüceyrədən humoral reaksiyalara keçid vektor salyangozunda anadangəlmə immun yaddaşa kömək edir. Biomphalaria glabrata . PLoS Pathog. 12, e1005361. (doi:10.1371/journal.ppat.1005361) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 1958 Şimal-şərq Braziliyada bilharziasis mansoninin ilbiz vektorları üzərində tədqiqatlar. Buğa. Ümumdünya Səhiyyə Təşkilatı. 18, 895–908. PubMed, Google Scholar

. 2005 Arbovirusların bioloji ötürülməsi: komponentlərin, mexanizmlərin və unikal əlamətlərin, eləcə də onların təkamül meyllərinin yenidən araşdırılması və yeni anlayışlar. Clin. Mikrobiol. Rev. 18, 608–637. (doi:10.1128/cmr.18.4.608-637.2005) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Gibson DR, Flynn NM, Perales D

. 2001 İnyeksion narkotik istifadəçiləri arasında İİV riski davranışının və İİV serokonversiyasının azaldılmasında şpris mübadiləsi proqramlarının effektivliyi. QİÇS 15, 1329–1341. (doi:10.1097/00002030-200107270-00002) Crossref, PubMed, Google Scholar

Angelakis E, Azhar EI, Bibi F, Yasir M, Al-Ghamdi AK, Ashshi AM, Elshemi AG, Raoult D

. 2014 Kağız pullar və sikkələr ötürülən xəstəliyin potensial vektorları kimi. Fut. Mikrobiol . 9, 249–261. (doi:10.2217/fmb.13.161) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 2002 Trofik strategiyalar, heyvan müxtəlifliyi və bədən ölçüsü. Trends Ecol. Təkamül. 17, 507–513. (doi:10.1016/s0169-5347(02)02615-0) Crossref, ISI, Google Scholar

. 2009 Avropada iqlim dəyişikliyi və yoluxucu xəstəliklər. Lancet yoluxdurur. Dis. 9, 365–375. (doi:10.1016/S1473-3099(09)70104-5) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2003 Vektor yoluxucu xəstəlik ssenarilərinin dəyişməsində ümumi mövzular. Trans. R Soc. Trop. Med. Hyg. 97, 129–132. (doi:10.1016/S0035-9203(03)90097-6) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 1998 Qlobal sağlamlıq problemi kimi yenidən canlanan vektorla ötürülən xəstəliklər. Emerg. Yoluxdurmaq. Dis J. 4, 442. (doi:10.3201/eid0403.980326) Crossref, PubMed, Google Scholar

2008 İmmunogen tripanosomlarla infeksiyalar çiçəyin reproduktiv qabiliyyətini azaldır: müxtəlif parazit suşlarının vektor populyasiya strukturuna potensial təsiri. PLoS Negl. Trop. Dis. 2, e192. (doi:10.1371/journal.pntd.0000192) Crossref, PubMed, Google Scholar

Cator LJ, George J, Blanford S, Murdock CC, Baker TC, Read AF, Thomas MB

. 2013 Parazitsiz 'Manipulyasiya': ağcaqanadların qidalanma davranışının dəyişdirilməsi malyariya parazitləri ilə infeksiyadan asılı deyil. Proc. R. Soc. B 280, 20130711. (doi:10.1098/rspb.2013.0711) Link, ISI, Google Scholar

Cator LJ, Pietri JE, Murdock CC, Ohm JR, Lewis EE, Read AF, Luckhart S, Thomas MB

. 2015 İmmun reaksiya və insulin siqnalı malyariya ötürülməsi potensialını artırmaq üçün ağcaqanadların qidalanma davranışını dəyişdirir. Sci. Rep. 5. (doi:10.1038/srep11947) Crossref, PubMed, Google Scholar

Sanders CJ, Selby R, Carpenter S, Reynolds DR

. 2011 Yüksək hündürlükdə uçuş Kulikoidlər dişləyən midges. Baytar. Tövsiyə. 169, 208. (doi:10.1136/vr.d4245) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 1998 Gənələr həşərat deyil: ötürülmə potensialı üçün ziddiyyətli vektor biologiyasının nəticələri. Parazit. Bu gün 14, 186–192. (doi:10.1016/S0169-4758(98)01224-1) Crossref, PubMed, Google Scholar

Diekmann O, Heesterbeek JAP, Roberts MG

. 2010 Bölmə epidemiya modelləri üçün yeni nəsil matrislərin qurulması. J. R. Soc. İnterfeys 7, 873–885. (doi:10.1098/rsif.2009.0386) Link, ISI, Google Scholar

Hartemink NA, Randolph SE, Davis SA, Heesterbeek JAP

. 2008 Mürəkkəb xəstəlik sistemləri üçün əsas reproduktiv sayı: müəyyənləşdirilməsi R0 gənə yoluxucu infeksiyalar üçün. am. Nat. 171, 743–754. (doi:10.1086/587530) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 2001 Vəhşi təbiətin ortaya çıxan yoluxucu patogenləri. Fil. Trans. R. Soc. London. B 356, 1001–1012. (doi:10.1098/rstb.2001.0900) Link, ISI, Google Scholar

. 2004 Çoxlu host növləri ilə patogenlərin populyasiya dinamikası. am. Nat. 164, S64–S78. (doi:10.1086/424681) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Fenton A, Streicker DG, Petchey OL, Pedersen AB

. 2015 Bütün hostlar bərabər yaradılmışdır? Çox ev sahibi icmalarda parazitlərin davamlılığına ana növlərin bölünməsi töhfələri. am. Nat. 186, 610–622. (doi:10.1086/683173) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2004 Multihost parazitlərin təkamülü. Təkamül 58, 455–469. (doi:10.1111/j.0014-3820.2004.tb01669.x) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Holt RD, Dobson AP, Begon M, Bowers RG, Schauber EM

. 2003 Ev sahibi icmalarda parazitlərin yaradılması. Ekol. Lett. 6, 837–842. (doi:10.1046/j.1461-0248.2003.00501.x) Crossref, ISI, Google Scholar

. 1991 İnsanların yoluxucu xəstəlikləri: dinamika və nəzarət . Oksford, Böyük Britaniya: Oxford University Press. Google Alim

. 2008 Vektorla ötürülən xəstəliklərdə ötürülmə-virulentlik mübadilələri. Teor. Popul. Biol. 74, 6–15. (doi:10.1016/j.tpb.2008.04.003) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 1978 Ev sahibi-parazit populyasiyasının qarşılıqlı əlaqəsinin tənzimlənməsi və sabitliyi: I. Tənzimləmə prosesləri. J. Anim. Ekol. 47, 219–247. (doi:10.2307/3933) Crossref, ISI, Google Scholar

. 1957 Malyariyanın epidemiologiyası və nəzarəti . London, Böyük Britaniya: Oxford University Press. Google Alim

. 2002 Layme xəstəliyi ekologiyasında rezervuar səriştəsinin pozulmasının və demoqrafik dövriyyənin təsirlərinin modelləşdirilməsi. Ekol. Tətbiq. 12, 1142–1162. (doi:10.2307/3061042) Crossref, Google Scholar

. 2001 Biomüxtəliflik və xəstəlik ekologiyasında seyreltmə effekti. Ekologiya 82, 609–619. (doi:10.2307/2680183) Crossref, ISI, Google Scholar

. 2008 tarixi Toxoplasma gondii- ilk 100 il. J. Eukar. Mikrobiol. 55, 467–475. (doi:10.1111/j.1550-7408.2008.00345.x) Crossref, PubMed, Google Scholar

Begon M, Bennett M, Bowers RG, French NP, Hazel SM, Turner J

. 2002 Host-mikroparazit modellərində ötürülmə şərtlərinin aydınlaşdırılması: ədədlər, sıxlıqlar və sahələr. Epidemiol. Yoluxdurmaq. 129, 147–153. (doi:10.1017/s0950268802007148) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Fenton A, Fairbairn JP, Norman R, Hudson PJ

. 2002 Parazit ötürülməsi: nəzəriyyə və reallığın uzlaşdırılması. J. Anim. Ekol. 71, 893–905. (doi:10.1046/j.1365-2656.2002.00656.x) Crossref, ISI, Google Scholar

McCallum H, Barlow N, Hone J

. 2001 Patogenin ötürülməsi necə modelləşdirilməlidir? Trends Ecol. Təkamül. 16, 295–300. (doi:10.1016/S0169-5347(01)02144-9) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2000 Nematodlara giriş: ümumi nematologiya . Sofiya, Bolqarıstan: Pensoft Publishers. Google Alim

. 2006 Helmintlər onurğalı heyvanlarda patogenlərin vektorları kimi: nəzəri yanaşma. Int. J. Parazitol. 36, 887–894. (doi:10.1016/j.ijpara.2006.04.001) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 1957 yoluxuculuq Heterakis gallinae ilə yumurta Histomonas meleagridis . Exp. Parazit. 6, 189–193. (doi:10.1016/0014-4894(57)90014-0) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 1966 Torpaq qurdunun ötürülməsi HeterakisHistomonas hinduşkalara və toyuqlara. J. Parazitol. 52, 899–902. (doi:10.2307/3276528) Crossref, PubMed, Google Scholar

2002 Endosimbiotikin rolu Wolbachia çay korluğunun patogenezində bakteriyalar. Elm 295, 1892–1895. (doi:10.1126/science.1068732) Crossref, PubMed, Google Scholar

Aitken MM, Jones PW, Hall GA, Hughes DL, Brown GTH

. 1981 Təcrübəli infeksiyaya yoluxmuş və qansız mal-qaranın cavabları Salmonella dublin . Res. Baytar. Sci. 31, 120–126. Crossref, PubMed, Google Scholar

Brady MT, O'Neill SM, Dalton JP, Mills KHG

. 1999 Fasciolaqaraciyər qarşı qoruyucu Th1 reaksiyasını boğur Bordetella boğmaca . Yoluxdurmaq. İmmun. 67, 5372–5378. PubMed, Google Scholar

Randolph SE, Miklisová D, Lysy J, Rogers DJ, Labuda M

. 1999 Təsadüflərdən yaranan insident: gəmiricilərdə gənə invaziyasının nümunələri gənə ensefalit virusunun ötürülməsini asanlaşdırır. Parazitologiya 118, 177–186. (doi:10.1017/s0031182098003643) Crossref, PubMed, Google Scholar

Lacharme-Lora L, Salisbury V, Humphrey TJ, Stafford K, Perkins SE

. 2009 Parazitar nematodlardan təcrid olunmuş bakteriyalar - patogenlərin potensial yeni vektoru? Ətraf. Sağlamlıq 8, S17. (doi:10.1186/1476-069x-8-s1-s17) Crossref, PubMed, Google Scholar

Lacharme-Lora L, Perkins SE, Humphrey TJ, Hudson PJ, Salisbury V

. 2009 Sərbəst yaşayan helmintlərin su anbarları və vektorları kimi rolunu araşdırmaq üçün bioluminescent bakterial biosensorların istifadəsi. Salmonella . Ətraf. Mikrobiol. Rep . 1, 198–207. (doi:10.1111/j.1758-2229.2009.00031.x) Crossref, PubMed, Google Scholar

Kaplan EH, Khoshnood K, Heimer R

. 1994 HİV-ə yoluxmuş iynələrin azalması New Haven-in iynə mübadiləsi proqramına qayıtdı: müştəri dəyişikliyi, yoxsa iynə mübadiləsi? am. J. İctimai Səhiyyə 84, 1991–1994. (doi:10.2105/ajph.84.12.1991) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 1982 Host və parazitlərin birgə təkamülü. Parazitologiya 85, 411–426. (doi:10.1017/S0031182000055360) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 1996 Parazitlərin virulentliyinin modelləri. Q. Rev. Biol . 71, 37–78. (doi:10.1086/419267) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Choisy M, Brown SP, Lafferty KD, Thomas F

. 2003 Parazitlərdə trofik ötürülmənin təkamülü: niyə aralıq sahibləri əlavə etmək lazımdır? am. Nat. 162, 172–181. (doi:10.1086/375681) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 1994 Ev sahibi davranışının parazit manipulyasiyasının təkamülü - nəzəri təhlil. Parazitologiya 109, S109–S118. (doi:10.1017/S0031182000085127) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 2008 Yoluxucu xəstəliklərin təkamül epidemiologiyasında ev sahibi daxilində və arasında dinamikanın əlaqələndirilməsi. Trends Ecol. Təkamül. 23, 511–517. (doi:10.1016/j.tree.2008.05.009) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

. 2008 Malyariyada reproduktiv məhdudiyyətin təkamülü haqqında. Proc. R. Soc. B 275, 1217–1224. (doi:10.1098/rspb.2007.1545) Link, Google Scholar

. 1998 Gametositlərin optimal istehsalı Plasmodium falciparum . J. Teor. Biol. 193, 419–428. (doi:10.1006/jtbi.1998.0710) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 1995 Həyat siklinin iki mərhələsi olan parazitlər üçün optimal replikasiya və ötürülmə modeli. Teor. Popul. Biol. 47, 277–291. (doi:10.1006/tpbi.1995.1012) Crossref, Google Scholar

Bell AS, Huijben S, Paaijmans KP, Sim DG, Chan BHK, Nelson WA, Read AF, Borrmann S

. 2012 Gəmirici malyariyasında dərman müalicəsinin ardından dərmana davamlı parazitlərin ağcaqanadlara ötürülməsi. PLoS BİR 7, e37172. (doi:10.1371/journal.pone.0037172) Crossref, PubMed, Google Scholar

Huijben S, Nelson WA, Wargo AR, Sim DG, Drew DR, Read AF

. 2010 Kimyaterapiya, ev sahibi daxili ekologiya və dərmana davamlı malyariya parazitlərinin uyğunluğu. Təkamül 64, 2952–2968. (doi:10.1111/j.1558-5646.2010.01068.x) PubMed, Google Scholar

Paul REL, Bonnet S, Boudin C, Tchuinkam T, Robert V

. 2007 Malyariya parazitlərində aqreqasiya ağcaqanadlara yoluxma dərəcələrinə məhdudiyyətlər qoyur. Yoluxdurmaq. Genet. Təkamül . 7, 577–586. (doi:10.1016/j.meegid.2007.04.004) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Greischar M, Mideo N, A Read, Bjørnstad O

. 2016 Malyariya parazitlərinə optimal ötürülmə sərmayəsinin proqnozlaşdırılması. Təkamül 70, 1542–1558. (doi:10.1111/evo.12969) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

Pollitt LC, Churcher TS, Dawes EJ, Khan SM, Sajid M, Basáñez MG, Colegrave N, Reece SE

. 2013 Malyariya parazitlərinin ötürülməsi üçün sıxlıq xərcləri. Təkamül. Tətbiq . 6, 617–629. (doi:10.1111/eva.12048) Crossref, PubMed, Google Scholar

2014 Artemisinin davamlı bir molekulyar marker Plasmodium falciparum malyariya. Təbiət 505, 50-55. (doi:10.1038/nature12876) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

2015-ci ildə K13-pervane mutasiyaları artemisinin müqavimətini təmin edir Plasmodium falciparum kliniki izolatlar. Elm 347, 428–431. (doi:10.1126/science.1260867) Crossref, PubMed, Google Scholar

2015 Artemisinin davamlı genetik arxitekturası Plasmodium falciparum . Nat. Genet. 47, 226–234. (doi:10.1038/ng.3189) Crossref, PubMed, Google Scholar

2013 İnsan malyariya paraziti Pfs47 gen ağcaqanadların immun sistemindən yayınmağa vasitəçilik edir. Elm 340, 984–987. (doi:10.1126/science.1235264) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar

2016 Poliklonal infeksiyalarda antimalarial müalicədən sonra klirens dərəcələrini bölmək üçün dərin ardıcıllıq aləti. Təkamül. Med. Xalq Sağlamlığı 2016, 21–36. (doi:10.1093/emph/eov036) Crossref, PubMed, Google Scholar

2015 Artemisinin davamlıdır Plasmodium falciparum kliniki izolatlar Cənub-Şərqi Asiya və Afrikanın müxtəlif ağcaqanad daşıyıcılarını yoluxdura bilər. Nat. Kommun . 6, 8614. (doi:10.1038/ncomms9614) Crossref, PubMed, Google Scholar

. 1980-ci ildə mavi dil virusunun çoxalması Culicoides nubeculosus (meigen) eyni vaxtda virus və mikrofilaria ilə yoluxmuşdur Onchocerca servicalis (Railliet və Henry). Ann. Trop. Med. Parazit. 74, 463–469. (doi:10.1080/00034983.1980.11687368) Crossref, PubMed, Google Scholar

Turell M, Rossignol P, Spielman A, Rossi C, Bailey CL

. 1984 Mikrofilariyaları eyni vaxtda qəbul edən ağcaqanadlar tərəfindən gücləndirilmiş arboviral ötürülmə. Elm 225, 1039–1041. (doi:10.1126/science.6474165) Crossref, PubMed, Google Scholar

2012 Drosophilamelanoqaster bluetongue virus replikasiyası və tropizm üçün model orqanizm kimi. J.Virol . 86, 9015–9024. (doi:10.1128/jvi.00131-12) Crossref, PubMed, Google Scholar

Antonovics J, Wilson AJ, Forbes MR, Hauffe HC, Kallio ER, Leggett HC, Longdon B, Okamura B, Sait SM, Webster JP

. 2017 Transmissiya rejiminin təkamülü. Fil. Trans. R. Soc. B 372, 20160083. (doi:10.1098/rstb.2016.0083) Link, Google Scholar

. 1962 Xəstəlik daşıyıcıları kimi artropodların ittiham edilməsi. In Proc. XIth Int. Entomologiya Konqresi səh. 341–345. Vyana. Google Alim

. 2009 Ağcaqanadların vektorlarında arbovirus virulentliyinin ötürülmə üsulu və təkamülü. Proc. R. Soc. B 276, 1369–1378. (doi:10.1098/rspb.2008.1709) Link, Google Scholar

. 1979 Elmi modelin qurulması strategiyasında möhkəmlik. In Statistikada möhkəmlik (red


Transgen heyvanların yaradılması üçün istifadə olunan üsullar

Bu üsul seçilmiş gen konstruksiyasının (tək gen və ya genlərin kombinasiyası) eyni növün digər üzvündən və ya fərqli bir növün mayalanmış yumurta hüceyrəsinin pro-nüvəsinə birbaşa mikroinyeksiyasını nəzərdə tutur.

Bu, məməlilərdə təsirli olduğunu sübut edən ilk üsullardan biridir. Təqdim edilmiş DNT müəyyən genlərin həddindən artıq və ya az ifadə edilməsinə və ya heyvan növləri üçün tamamilə yeni olan genlərin ifadəsinə səbəb ola bilər (Şəkil 18.2).

Bununla belə, DNT-nin daxil edilməsi təsadüfi bir prosesdir və təqdim edilən genin özünü ev sahibi DNT-də ifadə etməyə imkan verən yerə daxil etməyəcəyi ehtimalı yüksəkdir. Manipulyasiya edilmiş mayalanmış yumurta hüceyrəsi, vazektomiya edilmiş erkək ilə cütləşərək alıcı kimi fəaliyyət göstərməyə təhrik edilmiş resipiyent qadının və ya süd anasının yumurtalıq kanalına köçürülür.

Bu metodun əsas üstünlüyü onun müxtəlif növlərə tətbiq edilməsidir. Digər transfeksiya üsullarına hissəciklərin bombardmanı, ultrasəs və elektroporasiya daxildir.

Metod # 2. Kimyəvi Transfeksiya:

Heyvan hüceyrələri üçün bir neçə kimyəvi transfeksiya texnikası var, lakin hamısı oxşar prinsiplərə əsaslanır. Kalsium fosfat vasitəçiliyi ilə DNT-nin qəbulu, endositozla qəbul edilən birgə çöküntünün əmələ gəlməsini əhatə edir. Məməlilərin hüceyrələrinin mədəni mühitdən ekzogen DNT götürmə qabiliyyəti ilk dəfə 1962-ci ildə bildirilmişdir.

İncə DNT və kalsium fosfat birgə çöküntünün əmələ gəlməsi (təzə hazırlanmalıdır) endositozla DNT-nin qəbulunu asanlaşdırır. Hüceyrəyə daxil olan bəzi DNT fraqmentləri nüvəyə çata və birləşə bilər.

Belə genlərin ifadəsi transfeksiyanı təmin edir. Kalsium çöküntü metodunun çevrilmə tezliyi ümumiyyətlə aşağıdır (1-2%), buna görə də bu vasitələrin içərisində DNT-ni qablaşdırmaq üçün həll olunan komplekslərdən (poliplekslər) və ya liposomlardan və lipoplekslərdən (fuzogen) fosfolipidlərdən istifadə edilir. İstənilən gen plazmiddə köçürülür və o, birbaşa kimyəvi transfeksiya üçün istifadə edilə bilər və ya məməli hüceyrəsinə çatdırılmaq üçün bakteriyaya daxil edilə bilər. Hüceyrə divarı çıxarılan maya hüceyrələrindən (sferoplast) YAC transgen siçanlarının istehsalı üçün liposomlardan və embrion kök hüceyrələrindən istifadə edərək, YAC DNT-ni siçana daxil etmək üçün istifadə edilmişdir.

Metod # 3. Retrovirus vasitəçiliyi ilə gen ötürülməsi:

İfadə ehtimalını artırmaq üçün gen transferi daşıyıcı və ya vektor, ümumiyyətlə virus və ya plazmid vasitəsilə həyata keçirilir. Retroviruslar, ev sahibi hüceyrələri bu şəkildə yoluxdurmaq qabiliyyətindən istifadə edərək, genetik materialı hüceyrəyə köçürmək üçün vektor kimi adətən istifadə olunur. Bu üsuldan əldə edilən nəsillər kimerikdir, yəni bütün hüceyrələr retrovirus daşımır. Transgenin ötürülməsi yalnız o halda mümkündür ki, retrovirus germ hüceyrələrinin bəzilərinə inteqrasiya olunsun və rPIC kompleksi əmələ gətirsin (Şəkil 18.3).

For any of these techniques the success rate in terms of live birth of animals containing the trans-gene is extremely low. Providing that the genetic manipulation does not lead to abortion, the result is a first generation (F1) of animals that need to be tested for the expression of the trans-gene. Depending on the technique used, the F1 generation may result in chimeras.

When the trans-gene has integrated into the germ cells, the so-called germ line chimeras are then inbred for 10 to 20 generations until homozygous transgenic animals are obtained and the trans-gene is present in every cell. At these stage embryos carrying the trans-gene can be frozen and stored for subsequent implantation.

There have been numerous reports and applications of transgenic plants in agriculture, mainly to benefit the producer. However, the realization of genetically engineered livestock has been much slower. The production of transgenic animals has focused mainly on producing models (e.g., the mouse) for basic and medical research.

In terms of commercially important livestock species, work has revolved around specialized non-agricultural purposes such as pharmaceutical production and xenotransplantation and, to a lesser extent, applied agricultural purposes to improve animal production traits and animal-food products. In this case, one of the most important production animals, the dairy cow, was given enhanced resistance to a common and often devastating infection of the mammary gland, a potential benefit to both the producer and the animal’s well-being.

Metod # 4. Virus Vector:

Viruses have a natural ability to absorb to the surface of host cells and infect. This property can be exploited to deliver rDNA into animal cells. The viral system is efficient in transfer, expressed well and replicate rapidly in the host cells. Several classes of viral vectors have been developed for use in human gene therapy and at least eight have been used in clinical trials.

The General Properties of Viral Vector Are:

1. Trans-gene may be incorporated into viral vectors as additional gene or as replacement to certain genes of viral genome by ligation or homology recombination. If virus can propagate independently it is called helper independent. If essential viral genes are replaced by trans-gene then virus need a replication gene in Trans position (another virus similar to binary vectors) and virus is called ‘helper-dependent’.

2. It is necessary to prevent replication as well as recombination of helper virus. Icosahedral viruses such as adenovirus and retroviruses package their genome into preformed capsid, their volume is fixed with defined amount of DNA can be packaged. Rod shaped baculo-viruses form the capsid around the genome, so there are no such size constraints. There is no ideal virus, each has his own advantages or disadvantages.

Adenoviruses are DNA viruses with a linear, double stranded genome of approx. 36 kb. They are used in gene transfer because they show some advantageous features like stability, a high capacity for foreign DNA, a wide host range that includes non dividing cells and the ability to produce high titer stock (up to 10 11 pfu/ml). They are suitable for transient expression in dividing cells because they do not integrate efficiently into the genome.

Adenoviruses are also used as gene therapy vectors because the virions are taken up efficiently by cells in vivo and adenovirus derived vaccines have been used in humans with no reported side effects. Baculo-viruses have large double stranded DNA genomes. They efficiently infect arthropods, particularly insects. Nuclear polyhedrosis viruses, a group of baculoviruses, have an unusual infection cycle that involves the production of nuclear occlusion bodies. These are pro-teinaceous particles in which the virions are embedded allowing the virus to survive harsh environmental conditions such as desiccation.

Baculo-viruses are mainly used for high level transient protein expression in insects and insect cells. Two baculoviruses have been extensively developed as vectors, namely the Autographa calofornica multiple nuclear polyhedrosis virus and the Bombyx mori nuclear polyhedrosis virus.

Metod # 5. DNA Packaged inside a Bacterium (Bactofection):

Generally, Agrobacterium tumefaciens mediated transfer of DNA is a common practice in plant system. It has been shown by Kunik and co -workers (2001) that this bacterium can transfer DNA in cultured human cells. It was established in mid-1990 that several bacteria infect human cells and undergo lysis releasing plasmid in host cells e.g., Salmonella spp., Listeria spp. and Shigella spp. The plasmid DNA then finds its way to the host cell nucleus, where it is integrated in the genome and expressed.

Another method of DNA transfer is by conjugation [the transfer of DNA through a pilus (plural pilli)]. This pilus is formed by bacterial cell. When live bacteria are used, it is necessary that the bacteria are attenuated. This is because the gene transfer system uses the natural ability of bacteria to infect eukaryotic cells. The bacteria may multiply and destroy host cells.

Application Possibilities for Gene Transfer:

In recent years, several application possibilities for gene transfer in domestic animals have been discussed. Until now it has been possible to influence only traits that are based on a single gene or on a limited number of genes. There are only a very limited number of traits of interest to breeders, which are based on a single gene. Various markers used to identify the transgenic animals are presented in Table 18.1.

In these authors’ well-known experiments, growth, one of the classical quantitative traits in animal breeding, was changed to become a quasi-qualitative trait through the transfer of a single growth hormone gene which was related to a feedback independent regulation mechanism. Similar consequences can be expected by application of somatotropins in dairy cattle.

As far as gene transfer in cattle is concerned, there are realistic prospects that it will be possible to influence positively different production traits. Traditional selection programmes using conventional breeding techniques have achieved important results and will continue to do so.

However, it seems preferable to concentrate the very expensive and complex technique of gene transfer to fields which until now could only be improved with limited success through conventional breeding programmes, such as breeding for increased disease resistance.


Vectors Used in Genetic Engineering | Biotexnologiya

In this article we will discuss about vectors used in genetic engineering.

Cloning Vector:

By cloning, one can produce unlimited amounts of any particular fragment of DNA. In principle, the DNA isolated and cut pieces are introduced into a sui­table host cell, usually a bacterium such as Escherichia coli, where it is replicated, as the cell grows and divides.

However, replication will only occur if the DNA contains a sequence which is recognized by the cell as an origin of replication. Since such sequences are infrequent, this will rarely be so, and therefore, the DNA to be cloned, has to be attached to a carrier, or vector DNA which does contain an origin of replication.

Criteria of an Ideal Vector:

Vectors are those DNA molecules that can carry a foreign DNA fragment when inserted into it. A vector must possess certain minimum qualifications to be an efficient agent for the transfer, maintenance and amplification of the passenger DNA.

1. The vector should be small and easy to isolate.

2. They must have one or more origins of replication so that they will stably main­tain themselves within host cell.

3. Vector should have one or more unique restriction sites into which the recombi­nant DNA can be inserted.

4. They should have a selectable marker (antibiotic resistance gene) which allows recognition of transformants.

5. Vector DNA can be introduced into a cell.

6. The vector should not be toxic to host cell.

Types of Vector:

Based on the nature and sources, the vectors are grouped into bacterial plasmids, bacteriophages, cosmids and phagemids (Fig. 22.3).

Plasmids are the extra-chromosomal, self-replicating, and double stranded closed and circular DNA molecules present in the bacterial cell. A number of properties are specified by plasmids such as antibiotic and heavy metal resistance, nitro­gen fixation, pollutant degradation, bacteriocin and toxin production, colicin factors, etc.

Plasmids have following advantages as cloning vehicle (Cohen et a. 1973):

1. It can be readily isolated from the cells.

2. It possesses a single restriction site for one or more restriction enzymes.

3. Insertion of foreign DNA does not alter the replication properties.

4. It can be reintroduced into cell.

5. Selective marker is present.

6. Transformants can be selected easily by using selective medium.

7. Multiple copy numbers are present in a cell.

Some plasmid vectors are pBR 322, pBR 327, pUC vectors, yeast plasmid vector and Ti, Ri plasmids. Ti and Ri Plasmids are widely used in plant system for genetic transfor­mation.

Among higher plants, Ti plasmid of Agrobacterium tumefaciens or Ri plasmid of A. rhizogenes are the best known vectors. T-DNA, from Ti or Ri plasmid of Agrobacte­rium, is considered to be very potential for foreign gene transfer in cloning experiments with higher plants.

pBR 322 and pUC Vectors:

pBR322 is a derived plasmid from a naturally occurring plasmid col El, composed of 4362 bp DNA and its replication may be more faster. The plasmid has a point of origin of replication (ori), two selectable marker genes conferring resistance to antibiotics, e.g., ampicillin (amp r ), tetracycline (tet r ) and unique recognition sites for 20 restriction endonucleases.

Tetracycline resistance gene has a cloning site and insertion of foreign segment of DNA will inactivate the tet r gene. The recombinant plas­mid will allow the cells to grow only in presence of ampicillin but will not protect them against tetracycline .

Another plasmid used in gene cloning is pUC vector available in pairs with reverse orders of restriction sites relative to lac z promoter. This is a synthesized plasmid possess­ing ampicillin resistance gene (amp r ), origin of replication from pBR322(on) and lac z J gene from E. coli. pUC 8 and pUC 9 make one such pair.

The bacteriophage has linear DNA molecule, a single break will generate two fragments, foreign DNA can be inserted to generate chimeric phage parti­cle. But as the capacity of phage head is limited, some segments of phage DNA, not having essential genes, may be removed. This technique has been followed in λ (Lambda) phage vectors to clone large foreign particle.

Plasmid can clone up to 20 to 25 kb long fragments of eukaryotic genome. The examples of different Lambda phage vectors are λ gt 10, λ gt 11, EMBL 3, etc. M-13 is a filamentous bacteriophage of E. coli whose single stranded circular DNA has been modified variously to give rise M-13 series of cloning vectors.

Cosmids are plasmid particles, into which certain specific DNA sequences, namely those for cos sites are inserted which enable the DNA to get packed in X particle. Like plasmids, the cosmids perpetuate in bacteria without lytic develop­ment. The cosmids have high efficiency to produce a complete genomic library

These are prepared artificially by combining features of phages with plasmids. One commonly used phagemid is pBluescript IIKs derived from pUC-19.

(e) Plant and Animal Viruses:

A number of plant and animal viruses have also been used as vectors both for introducing foreign genes into cells and for gene amplification. Cauliflower Mosaic Viruses (CaMV), Tobacco Mosaic Viruses (TMV) and Gemini Virus are three groups of viruses that have been used as vectors for cloning of DNA segments in plant system. SV 40 (Simian Virus 40), human adenoviruses and retroviruses are poten­tial as vectors for gene transfer into animal cells.

(f) Artificial Chromosomes:

Yeast Artificial Chromosome (YAC) or Bacterial Artificial Chromosome (BAC) vectors allow cloning of several hundred kb pairs which may represent the whole chromosome. It can be cloned in yeast or bacteria by ligating them to vector sequences that allow their propagation as linear artificial chromosome.

Transposable elements like Ac-Ds or Mu-1 of Maize, P-element of Drosophila may also be used for cloning vector and transfer of gene among eukaryotes.

A vector that has been constructed in such a way that inserted DNA molecule is put under appropriate promoter and terminator sequences for high level expression through efficient transcription and trans­lation. Example: Use of promoters (‘nos’ from T-DNA) or expression cas­settes (pRT plasmids) (Fig. 22.3d).


Transduksiya

Transduction is not a biology-specific term. The common definition of transduction is ‘leading through or across.’ The term has been used to describe DNA transfer between bacterial cells by bacteriophage. However, in current research, transduction also refers to the infection of mammalian cells with a viral vector.

‘Transduction’ was first used to describe bacterial gene transfer back in the 1950s, decades before the creation of viral vectors. It’s possible that the word has been co-opted to prevent confusion, as ‘transfection’ doesn’t distinguish between the introduction of nucleic acid or viral particles into a cell.

‘Transduction’ is mostly used to describe the introduction of recombinant viral vector particles into target cells, while ‘infection’ refers to natural infections of humans or animals with wild-type viruses. There are no universally accepted differences between these two terms (a quick Google search uncovers all kind of online debate). They are mostly used as a convenient way to differentiate between two biological mechanisms.


Nəticələr

The BioBrick base vector (BBa_I51020)

The process for engineering BioBrick vectors from BioBrick parts is primarily based upon a newly designed BioBrick part: BBa_I51020 [Genbank:EU496089]. The new part is a BioBrick base vector that serves as a scaffold for construction of new BioBrick vectors (Figure 1). Starting from the base vector, new vectors can be built using plasmid replication origins and antibiotic resistance markers that conform to the BioBrick standard for physical composition. Thus, the base vector enables the ready reuse of vector parts available from the Registry of Standard Biological Parts. Use of the base vector to construct BioBrick vectors ensures standardization and uniformity in any resulting BioBrick vectors. For convenience, the base vector includes both a high copy replication origin and ampicillin resistance marker, so the base vector itself is capable of autonomous plasmid replication for easy DNA propagation and purification [37].

The BioBrick base vector (BBa_I51020). Schematic diagram of BBa_I51020: a BioBrick base vector designed to facilitate construction of new BioBrick vectors. Parts from the collection listed in Figure 5 were used to construct BBa_I51020.

All BioBrick vectors derived from the BioBrick base vector have five key features. First, BioBrick vectors include a complete BioBrick cloning site to support the propagation and assembly of BioBrick standard biological parts [9]. Second, BioBrick vectors contain a positive selection marker in the cloning site to ameliorate one of the most common problems during assembly of BioBrick parts: contamination of the ligation reaction with uncut plasmid DNA [38]. Any cells transformed with the BioBrick vector produce the toxic protein CcdB and do not grow [39–41]. Cloning a BioBrick part into the cloning site of the vector removes the toxic ccdB gen. Third, BioBrick vectors contain a high copy origin in the cloning site to facilitate increased yields from plasmid DNA purification [42, 43]. Again, cloning a BioBrick part into the cloning site removes the high copy origin in the cloning site thereby restoring replication control to the vector origin. Fourth, BioBrick vectors include transcriptional terminators and translational stop codons flanking the cloning site to insulate the proper maintenance and propagation of the vector from any possibly disruptive function encoded by inserted BioBrick parts [44–47]. Fifth, BioBrick vectors include verification primer annealing sites sufficiently distant from the cloning site to check the length and sequence of the cloned BioBrick part. The primer annealing sites are identical to those found in commonly used BioBrick vectors, such as pSB1A3-P1010, to support backwards compatibility.

Constructing new BioBrick vectors using the BioBrick base vector

Constructing new BioBrick vectors starting from the BioBrick base vector requires just two assembly steps (Figure 2). The replication origin and antibiotic resistance marker should each be BioBrick standard parts. To construct a BioBrick vector, assemble the origin and antibiotic resistance marker via BioBrick standard assembly (first assembly step). Then, digest the resulting composite part with restriction enzymes XbaI and SpeI, and digest the BioBrick base vector with NheI to excise the ampicillin resistance marker. Next, ligate the composite origin and resistance marker to the linearized base vector (second assembly step). XbaI, SpeI, and NheI all generate compatible DNA ends that, when ligated with a DNA end from one of the other enzymes, produce a non-palindromic sequence that cannot be cut by any of the three enzymes. Thus, proper assembly of the vector eliminates any BioBrick enzyme sites and ensures that the resulting vector adheres to the BioBrick physical composition standard. Finally, transform the ligation product into a strain tolerant of ccdB expression, such as E. coli strain DB3.1 [48, 49].

How to build new BioBrick vectors. Assembly strategy for a new BioBrick vector using the BioBrick base vector BBa_I51020. (A) The replication origin and antibiotic resistance cassette should each be BioBrick standard biological parts. (B) Assemble the desired replication origin and antibiotic resistance cassette via BioBrick standard assembly to construct a composite origin and antibiotic resistance cassette. (C) Digest the resulting BioBrick composite part with XbaI and SpeI. (D) To excise the ampicillin resistance marker, digest the base vector with NheI. XbaI, SpeI, and NheI all generate compatible cohesive DNA ends that, when ligated with a DNA end from a one of the other enzymes, produce a non-palindromic sequence that cannot be cut by any of the three enzymes. Finally, ligate the digested composite origin and resistance marker to the digested base vector. (E) The result is the new BioBrick vector pSB4K5-I52002.

To support the construction of new BioBrick vectors, we built four new antibiotic resistance markers and two replication origins all as BioBrick standard biological parts. The four antibiotic resistance markers express proteins that confer resistance to ampicillin (BBa_P1002 [Genbank:EU496092]), kanamycin (BBa_P1003 [Genbank:EU496093]), chloramphenicol (BBa_P1004 [Genbank:EU496094]), and tetracycline (BBa_P1005 [Genbank:EU496095]), respectively [50–53]. The two replication origins were derived from the pSC101 (BBa_I50042 [Genbank:EU496096]) and p15A (BBa_I50032 [Genbank:EU496097]) replicons, respectively [54, 55]. We used the described procedure, base vector, and new vector parts to construct seven new BioBrick vectors: pSB4A5-I52002, pSB4K5-I52002, pSB4C5-I52002, pSB4T5-I52001, pSB3K5-I52002, pSB3C5-I52001, and pSB3T5-I52001 [Genbank:EU496098–EU496104].

Assembling BioBrick parts using a new BioBrick vector

BioBrick vectors support assembly of new BioBrick standard parts. The new vectors are compatible with prefix or postfix insertions of BioBrick parts as originally described [9]. Alternatively, the new vectors also support three antibiotic based assembly (3A assembly Figure 3 Shetty, Rettberg, and Knight, in preparation) [56]. 3A assembly is a method for assembling one part (the prefix part) upstream or 5' to a second part (the suffix part) in the BioBrick cloning site of a BioBrick vector (the destination vector). 3A assembly favors correct assembly of the prefix and suffix BioBrick parts in the destination vector through a combination of positive and negative selection. Briefly, 3A assembly works as follows: Digest the prefix part with EcoRI and SpeI, the suffix part with XbaI and PstI, and the destination vector with EcoRI and PstI. Then, ligate the two parts and destination vector and transform into competent E. coli. Plate the tranformed cells on LB agar plates supplemented with antibiotic corresponding to the destination vector resistance marker. Most of the resulting colonies should contain the composite BioBrick part cloned into the destination vector.

How to use a new BioBrick vector for standard assembly. Assembly strategy for two BioBrick standard biological parts using a new BioBrick vector. (A) Digest the prefix part with enzymes EcoRI and SpeI. (B) Digest the suffix part with restriction enzymes XbaI and PstI. (C) Digest the destination vector (pSB4K5-I52002) into which the two parts will be assembled with restriction enzymes EcoRI and PstI. Without agarose gel purification of the linearized DNA, ligate the three fragments, transform into E. coli and plate on LB agar plates supplemented with the antibiotic corresponding to the destination vector resistance marker. (D) Most of the resulting colonies contain the composite BioBrick part cloned into the destination vector.

To confirm that our new BioBrick vectors function as expected, we assembled new BioBrick standard biological parts using four of the vectors that we constructed. To demonstrate that the composite BioBrick parts were correctly assembled using our new vectors, we performed a colony PCR amplification of the assembled parts and determined that the PCR product length was correct (Figure 4). Each part was also verified to be correct via sequencing with primers that anneal to the verification primer binding sites (BBa_G00100 and BBa_G00102).

Using the new BioBrick vectors. To verify the function of the new BioBrick vectors, we performed a colony PCR using primers that anneal to the verification primer binding sites. To check the length of the resulting PCR products, we electrophoresed the reactions through an 0.8% agarose gel. Lanes 1–8 are the PCR products resulting from the amplification of the following BioBrick parts cloned into new BioBrick vectors. The desired PCR product lengths are in parentheses. Lane 1 is pSB4A5-I52001 (1370 bp), lane 2 is pSB4K5-T9003 (1883 bp), lane 3 is pSB4C5-E0435 (814 bp), lane 4 is pSB4T5-P20061 (2988 bp), lane 5 is pSB3K5-I52002 (1370 bp), lane 6 is pSB3C5-I52001 (1370 bp), lane 7 is pSB3T5-I6413 (867 bp), and lane 8 is BBa_I51020 (1370 bp). Lane 9 is 1 μ g of 2-log DNA ladder (New England Biolabs, Inc.). The 0.5 kb, 1 kb, and 3 kb DNA fragments in the DNA ladder are annotated.


In physical science and engineering, a vektor is a geometric object which has both magnitude or length and direction. A vector is commonly represented by a line segment in a specific direction, indicated by an arrow. Vectors are typically used to describe physical quantities which have a directional quality in addition to a quantity that could be described by a single number with a unit.

Also Known As: Euclidean vector, spatial vector, geometric vector, mathematical vector

Nümunələr: Velocity and force are vector quantities. In contrast, speed and distance are scalar quantities, which have magnitude but not direction.


Glomerular Disorders

Tadashi Yamamoto , . Visith Thongboonkerd , in Genomic and Personalized Medicine , 2009

GENOMIC MEDICINE FOR GLOMERULAR DISORDERS

Gene therapy may be one of the ideal treatments for hereditary or even for non-hereditary diseases in the future, since the specifically therapeutic effect can be determined, whereas the harmful effects to other tissues can be limited. However, trials of gene therapy in glomerular disorders lag behind because of the low efficiency of gene transfer or delivery and the difficulty in targeting to specific cells in the glomerulus. Several viral vector systems are currently being studied however, they still have limitations for clinical use not only because of the aforementioned difficulties but also due to uncertainty regarding their toxicity and immunogenicity. Adenovirus vector-mediated gene transfer is most commonly used to introduce genes into cells in experimental glomerulonephritis ( El Shemi et al., 2004 ). The introduction of the gene encoding type IV collagen α5 chain into the glomeruli of a swine model of Alport syndrome using an adenoviral vector system has been successful to generate the triple helix of the type IV collagen in the GBM with collagen α3 and α4 chains ( Heikkila et al., 2001 ). However, simple injection of the vector into renal artery or through the ureter does not usually achieve efficient gene introduction into the glomerular cells. Some maneuvers to improve the efficiency of transfer need to be developed.

Viral vectors may elicit immune reactions and have a potential risk of mutagenesis. Therefore, non-viral vectors such as the hemagglutinating virus of Japan (HVJ)-liposome method have been devised. By delivery of TGF- β antisense oligonucleotides in the renal artery, a suppressive effect has been reported on the expression of TGF-β and ECM expansion in the glomerulus ( Akagi et al., 1996 ). Skeletal muscle targeted gene therapy for glomerular disorders seems to be less invasive and more practical if secreting proteins expressed in the muscle are beneficial, because it provides high efficiency and long-lasting gene expression compared with the kidney-targeting methods. The efficiency of gene transfer to the kidney is 10- to 100-fold less compared with that to the skeletal muscle. Decorin derived from skeletal muscle after inoculation of a plasmid vector carrying decorinencoded gene has been reported to inhibit TGF-P expression and ameliorate glomerulosclerosis in rats ( Isaka et al., 1996 ).

Transplantation-based gene therapy using stem cells is also promising. Bone marrow-derived cells can be transduced with an IL-1 receptor antagonist (IL-1ra) gene and transfused into experimental rats with anti-GBM glomerulonephritis ( Yokoo et al., 1999 ). The transduced cells expressing macrophage markers (CD11b and CD18) have been shown to accumulate within the inflamed glomeruli. Prophylactic injection with the cells expressing IL-1ra before induction of the glomerulonephritis can suppress subsequent inflammatory events in the glomeruli and can preserve the renal function and glomerular structure.

The synthetic small interfering RNA (siRNA) duplexes have recently been introduced to suppress gene expression selectively in somatic mammalian cells without nonselective toxic effects of double-stranded RNA (dsRNA). Although a selective In vivo delivery of siRNA to the glomeruli has not been reported, attempts have been made to examine whether injection of synthetic siRNAs via renal artery followed by electroporation can be effective and therapeutic in silencing-specific genes in the glomeruli ( Takabatake et al., 2005 ). siRNA targeting against TGF-β1 significantly suppresses TGF-β1 mRNA and protein expression, and ameliorates the progression of ECM expansion in experimental glomerulonephritis. The effect of siRNA has been compared with that of antisense oligodeoxynucleotide in cultured rat mesangial cells and shown more potent effect (> 1000-fold) in siRNA sequence-specific suppression of transgene expression.

Current therapies for CKD or chronic glomerular disorders by suppression of rennin-angiotensin system may retard the progression of renal failure at some degrees, but can not completely stop their progression to ESRD. Identification of other therapeutic targets with more efficacies is therefore crucially required. There are essentially two ways to search for target genes for the treatment of diseases. One is the research on intervention of known genes that are thought to be involved in the pathogenesis of the disease. Excellent examples in the field of glomerular disorders are genes encoding angiotensin II, TGF-P, MCP-1, and others, since they have been demonstrated as the key molecules involved in some progressive glomerular disorders and their blockade may be valuable as the effective treatment. The other one is the search for the novel target genes as the new molecules for the treatment of glomerular disorders by the comprehensive gene expression profiling. The cDNA and SNP microarray analyses of human glomerular or kidney tissues with glomerular diseases are expected to provide candidate genes for the new therapeutic targets.

Since organ donation for kidney transplantation is limited worldwide, research on kidney regeneration is required for the new therapy of ESRD. To regenerate the kidney, stem cells and growth factors for the kidney have been extensively studied. Because it is presumably difficult or impractical to regenerate a whole mature kidney in an In vitro system, several researchers have considered transplantation of undifferentiated or partially developed kidney precursor, such as metanephros, as a possible alternative. In animal studies, human or pig embryonic metanephros has been transplanted into the immune-deficient mice in the subcapsular space of the kidney, and has subsequently developed to the mature kidney of a small size ( Dekel et al., 2003 ). The developed kidneys can be functional as evidenced by efficient urine production, although the ureter and major renal vessels are not well developed. There are several concerns that remain to be solved for the regeneration of the kidneys including: construction of renal vessels and ureter, immunogenicity of the transplants, methods to induce mesenchymal cells and ureteric buds from stem cells, and methods to propagate them to metanephros and normal size kidney.

It is reasonable to expect that some stem cells contribute to the renal tissue repair after injury, although the presence of tissue stem cells in the kidney has not yet been convincing. Stem cells such as embryonic and bone marrow stem cells are the other candidates for the source to regenerate a part of the kidney. Mouse embryonic stem cells injected into the kidney have been reported to develop into a ureteric bud-like structure and express many genes that are normally expressed in the developing kidney ( Yamamoto et al., 2006 ). Human bone marrow stem cells have been also reported to differentiate into functional complex structures of the new kidney in intact mouse embryos in the whole-embryo culture ( Yokoo et al., 2005 ). However, there are still several problems such as ethical issues for the use of stem cells for renal regeneration, as well as the problem of rejection of the regenerated tissues by the host.

It is conceivable that the kidneys in developmental stages or during the recovery from renal injury express various developmental and growth factors, and that these factors may be potentially useful for induction of the kidney regeneration. Several factors important for renal development and growth including, Pax-2, Pax-8, glial cell line-derived neurotrophic factor (GDNF), hepatocyte growth factor (HGF), WT-1, Wnt-4, and BMP-7, have been identified and deserve further investigations for clinical use in the future.


Videoya baxın: İki vektor arasındakı bucağın tapılmasıtapşırığı yerinə yetir (Iyul 2022).


Şərhlər:

  1. Wells

    axmaq qəzəb!!! super

  2. Neilan

    Dynamic article.

  3. Cesare

    Bravo, the brilliant phrase and it's timely

  4. Wokaihwokomas

    Çox sağ ol! and more posts on this topic will be in the future? I'm really looking forward to it! zpr.

  5. Keifer

    Nə qəşəng cavabdır

  6. Branton

    İnternetdə nə qədər az olsanız, uşaqlar daha sağlam olacaq! İstənilən həyat sonunda başlayır. Üfüqdə n @ yes-dən daha yaxşı salam... İlk Maya olmaq səkkizinci Martadan daha yaxşıdır! .. Mühazirə ereksiya deyil. Gəlin bunu təxirə salaq. (Tələbə müdrikliyi).

  7. Keola

    İnterfere-dən bəhanə gətirin ... Bu yaxınlarda burada. Ancaq bu mövzu mənə çox yaxındır. Kömək etməyə hazırdır.



Mesaj yazmaq