Məlumat

Funksional diseksiya nədir?

Funksional diseksiya nədir?



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Oxuyarkən [1] cümləni tapdım:

Ardıcıl olaraq, siçan və insan vəhşi tipli və mutant RAS izogen leykemiya hüceyrələrinin funksional disseksiyası metotreksat müqavimətinin induksiyasını nümayiş etdirdi, eyni zamanda mutant RAS-ifadə edən limfoblastlarda vinkristinə cavabı yaxşılaşdırdı.

Mən hələ onlayn tərif tapmadım. Bu kontekstdə funksional parçalanmanın mənası nədir?

[1] K. Oshima et al., “Mutasiya mənzərəsi, klonal təkamül nümunələri və relapsed kəskin limfoblastik leykemiyada RAS mutasiyalarının rolu,” Proc Natl Acad Sci USA, cild. 113, yox. 40, səh. 11306-11311, oktyabr 2016.


Bu kontekstdə “funksional” termini mexaniki anlayışı təmin edə bilən bir növ təhlili nəzərdə tutur.

Müəlliflər əvvəlcə bəzi genləri və mutasiyalarını müəyyən etdikləri kəşfiyyat yanaşmalarını təsvir edirlər əlaqəli kəskin lenfoblastik leykemiyada xəstənin residivi ilə. Sonra siçanlarda mutasiyaya uğramış KRAS-ı ifadə edərək sistemə müdaxilə etməyə davam edirlər. Onlar bunu etdikdə həmin siçanlarda bir neçə residiv əlamətləri müşahidə etdilər. Beləliklə, onlar bu genin bir mutasiyasının iştirak etdiyi qənaətinə gələ bilərlər mexanizmi relapsın əsasını qoyan budur.

Beləliklə, bu müəlliflərin 'funksional analiz'/'funksional disseksiya' terminindən istifadə tərzi korrelyasiya yanaşma.


Əsas fərziyyə ondan ibarətdir ki, sistemin hissələrini təcrid etməklə, onların xassələrini və təsirlərini öyrənməklə biz fiziki dünyanı dərk edə biləcəyik. Bu, reduksionizm adlanan fəlsəfi (metafizik) tezisdir ki, bu da təbii elmlərdə üstünlük təşkil edən fikirdir.

"Funksional diseksiya" termininin ilk istifadəsini 1971-ci ildə kiçik molekulların immunoloji reaksiyasına dair bir məqalədə tapa bildim. Onların bu məqalədəki məqsədi iribuynuzlu qlükaqon kimi kiçik molekulların antikor istehsalına qarşı antikor spesifikliyinə təsirini ayırmaq (və ya parçalamaq) idi. Onlar aşkar ediblər ki, bu molekulun müxtəlif hissələri antigen spesifikliyinə (bütün antikorlar N-terminalını tanıyır) və hüceyrə toxunulmazlığına (əsasən molekulun C-terminalı DNT sintezi ilə bağlı idi) cavabdehdir.


Funksional pozğunluq

A funksional pozğunluq müayinə, parçalanma və hətta mikroskop altında böyük ölçüdə aşkar edilməyən bədən proseslərinin normal fəaliyyətini pozan tibbi vəziyyətdir. Xarici olaraq, heç bir anormallıq görünmür. Bu, a ilə ziddiyyət təşkil edir struktur pozğunluğu (bədənin bəzi hissələrinin anormal göründüyü) və ya psixosomatik pozğunluq (simptomların psixoloji və ya psixiatrik xəstəlik nəticəsində yarandığı). Təriflər tibb sahələri arasında bir qədər fərqlidir.

Ümumiyyətlə, funksional pozğunluğa səbəb olan mexanizm məlum deyil, zəif başa düşülür və ya bəzən müalicə məqsədləri üçün əhəmiyyətsizdir. Çox vaxt beyin və ya sinirlərin iştirak etdiyinə inanılır. Bir funksional pozğunluğu olan bir insanın başqalarına sahib olması adi haldır.


İçindəkilər

Bitki və heyvan bədənləri onun komponentlərinin quruluşunu və funksiyasını təhlil etmək üçün parçalanır. Disseksiya tələbələr tərəfindən biologiya, botanika, zoologiya və baytarlıq kurslarında, bəzən isə sənətşünaslıqda aparılır. Tibb fakültələrində tələbələr anatomiyanı öyrənmək üçün insan cəsədlərini parçalayırlar. [1]

Yarılma zamanı (digər heyvanlarda nekropsiya adlanır) ölümün səbəbini müəyyən etməyə kömək etmək üçün istifadə olunur və məhkəmə tibbinin ayrılmaz hissəsidir. [2]

İnsan cəsədinin parçalanmasında əsas prinsip insan xəstəliyinin dissektora keçməsinin qarşısının alınmasıdır. Transmissiyanın qarşısının alınmasına qoruyucu vasitələrin taxılması, ətraf mühitin təmizliyinin təmin edilməsi, parçalanma texnikası [3] və HİV və hepatit viruslarının mövcudluğu üçün nümunələrə parçalanmadan əvvəl testlər daxildir. [4] Nümunələr meyitxanalarda və ya anatomiya laboratoriyalarında parçalanır. Təmin edildikdə, onlar "təzə" və ya "hazırlanmış" nümunə kimi istifadə üçün qiymətləndirilir. [4] Təlim məqsədləri üçün canlı nümunənin xüsusiyyətlərini saxlayaraq "təzə" nümunə bir neçə gün ərzində parçalana bilər. "Hazırlanmış" nümunə formalin kimi məhlullarda saxlanıla bilər və təcrübəli anatomist tərəfindən, bəzən dinerin köməyi ilə əvvəlcədən parçalana bilər. [4] Bu hazırlıq bəzən proseksiya adlanır. [5]

Ən çox parçalanma Virchow texnikası adlanan fərdi orqanların diqqətlə təcrid edilməsini və çıxarılmasını əhatə edir. [3] [6] Alternativ daha ağır texnika Letulle texnikası adlanan bütün orqan gövdəsinin çıxarılmasını nəzərdə tutur. Bu texnika, ayrı-ayrı orqanların bəzən çox vaxt aparan kəsilməsini gözləmədən cəsədi dəfn rəhbərinə göndərməyə imkan verir. [3] Rokitansky metodu bir daxildir yerində orqan blokunun parçalanması və Ghon texnikası üç ayrı orqan blokunun - döş qəfəsi və boyun nahiyələrinin, mədə-bağırsaq və qarın orqanlarının və sidik-cinsiyyət orqanlarının parçalanmasını əhatə edir. [3] [6] Ayrı-ayrı orqanların kəsilməsi orqanın yerləşdiyi əraziyə daxil olmaq və sistemli şəkildə həmin orqanın ətrafdakı anatomik əlaqələrini aradan qaldırmaqdan ibarətdir. Məsələn, ürəyi çıxararkən yuxarı vena kava və aşağı vena kava kimi bağlayıcılar ayrılır. Əgər lifli perikard kimi patoloji əlaqələr varsa, bu orqanla birlikdə qəsdən parçalana bilər. [3]

Klassik antik dövr redaktə

Eramızdan əvvəl III əsrin əvvəllərində Yunan həkimləri Xalkedonlu Herofil və Saqqızlı Erasistrat tərəfindən insan parçalanması aparılmışdır. [7] Bu dövrdə, "problem həlli" araşdırmasından əldə edilən əsas bilik deyil, tam insan anatomiyasına dair ilk araşdırma aparıldı. [8] Yunan mədəniyyətində insanın parçalanması ilə bağlı dərin bir tabu mövcud olsa da, o zaman Ptolemey hökuməti tərəfindən İsgəndəriyyəni elmi tədqiqat mərkəzinə çevirmək üçün güclü təkan var idi. [8] Bir müddət Roma hüququ insan bədəninin parçalanmasını və yarılmasını qadağan etdi, [9] buna görə də həkimlər başqa cəsədlərdən istifadə etməli oldular. Məsələn, Galen Barbary makakasını və digər primatları parçaladı, onların anatomiyasının insanların anatomiyası ilə eyni olduğunu fərz etdi. [10] [11] [12]

Hindistan Redaktə

Kökləri Hindistanda olan qədim cəmiyyətlər ov zamanı heyvanların necə öldürülməsinə dair sənət əsərlərini geridə qoyublar. [13] Ovlanan ovdan asılı olaraq ən effektiv şəkildə öldürmə üsulunu göstərən şəkillər həm xarici, həm də daxili anatomiya, eləcə də orqanların nisbi əhəmiyyəti haqqında intim biliklər verir. [13] Bilik daha çox ovçuların bu yaxınlarda ələ keçirilmiş ovunu hazırlaması vasitəsilə əldə edilirdi. Rouminq həyat tərzinə ehtiyac qalmadıqdan sonra onu qismən Hind vadisində formalaşan sivilizasiya əvəz etdi. Təəssüf ki, bu zamandan bəri parçalanmanın baş verib-vermədiyini göstərmək üçün çox az şey var, sivilizasiya köç edən Aryan xalqı tərəfindən itirildi. [13]

Hindistan tarixinin əvvəllərində (2-ci əsrdən 3-cü əsrə qədər) Arthashastra ölümün baş verə biləcəyi 4 yolu və onların əlamətlərini təsvir etdi: boğulma, asılma, boğulma və ya boğulma. [14] Həmin mənbəyə görə, hər hansı bir vaxtsız ölüm halında yarılma aparılmalıdır. [14]

Parçalanma təcrübəsi 7-8-ci əsrlərdə çiçəkləndi. Onların hakimiyyəti dövründə tibb təhsili standartlaşdırılırdı. Bu, savadlı cərrahların olması üçün insan anatomiyasını daha yaxşı başa düşməyə ehtiyac yaratdı. İnsan bədənini kəsmək dini tabu ilə parçalanma məhdudlaşdırıldı. Bu, məqsədə çatmaq üçün qəbul edilən yanaşmanı dəyişdi. Proses, əzələlərə çatmaq üçün xarici təbəqələr yumşaq alətlərlə kəsilmədən əvvəl su axınlarında toxumaların boşaldılmasını əhatə edirdi. Dilimləmə texnikasını təkmilləşdirmək üçün gələcək tələbələr balqabaq və balqabaqdan istifadə etdilər. Bu disseksiya üsulları anatomiya haqqında qabaqcıl anlayışa səbəb oldu və bu gün istifadə edilən rinoplastika kimi prosedurları tamamlamağa imkan verdi. [13]

Orta əsrlərdə Hindistandan gələn anatomik təlimlər bütün dünyaya yayıldı, lakin parçalanma təcrübəsi İslam tərəfindən ləngidi. [13] Universitet səviyyəsində parçalanma təcrübəsi 1827-ci ildə tələbə Pandit Madhusudan Qupta tərəfindən icra edilənə qədər bir daha görülmədi. [13] 1900-cü illərdə universitet müəllimləri, təqribən 1850-ci ilə qədər, universitetlər hind həkimlərini Britaniyadan gətirməkdənsə, onları yetişdirməyin daha sərfəli olduğuna qərar verənə qədər, disseksiyanın sosial tabularına qarşı durmalı oldular. [13] Bununla belə, Hindistan tibb məktəbləri İngiltərədəkilərdən çox əvvəl qadın həkimlər hazırlayırdı. [13]

Hindistanda diseksiyonun hazırkı vəziyyəti pisləşir. Tibb fakültəsi zamanı disseksiya laboratoriyalarında sərf olunan saatların sayı son iyirmi il ərzində əhəmiyyətli dərəcədə azalmışdır. [13] Anatomiya təhsilinin gələcəyi, yəqin ki, ənənəvi metodlar və inteqrativ kompüter öyrənməsinin zərif qarışığı olacaqdır. [13] Tibbi təlimin ilkin mərhələlərində disseksiyadan istifadə, onların simulyasiya edilmiş həmkarlarına nisbətən nəzərdə tutulan məlumatın saxlanmasında daha effektiv göstərilmişdir. [13] Bununla belə, kompüter tərəfindən yaradılan təcrübənin sonrakı mərhələlərdə nəzərdən keçirilməsi kimi istifadəsi var. [13] Bu üsulların birləşməsi tələbələrin mənimsəməsi çox çətin olan anatomiyanı başa düşmək və inamını gücləndirmək məqsədi daşıyır. [13] Anatomiya üzrə təhsilin uzun ənənələrini davam etdirmək üçün anatomiya laboratoriyalarının əksəriyyətinin anatomiya üzrə dərəcələri başa vurmağa ümid edən məzunlar tərəfindən tədris edildiyini nəzərə alaraq anatomistə artan ehtiyac var. [13]

İslam dünyası redaktə

Hicri 610-cu ildə İslam inancının başlanğıcından [15] şəriət qanunları az və ya çox dərəcədə müsəlman ölkələrində tətbiq edilir [15], Əl-Qəzali kimi İslam alimləri tərəfindən dəstəklənir. [16] Əndəlusda İbn Zuhr (Avenzoar) (1091-1161), [17] XII əsrdə Səlahəddinin həkimi İbn Cumay, Misirdə Əbd əl-Lətif kimi İslam həkimləri c. 1200, [18] və 13-cü əsrdə Suriya və Misirdə İbn ən-Nəfis disseksiya ilə məşğul olmuş ola bilər, [16] [19] [20], lakin insan disseksiyasının tətbiq edilib-edilməməsi müəmmalı olaraq qalır. Həkim və müsəlman hüquqşünası İbn ən-Nəfis, “İslam hüququnun hökmləri xasiyyətimizdə olan hər cür mərhəmətlə birlikdə bizi parçalamaqdan çəkindirdi” [4], buna qarşı heç bir qanun olmadığını ifadə etdi. , buna baxmayaraq qeyri-adi idi. İslam dini bayramlar istisna olmaqla, cənazənin mümkün qədər tez dəfn edilməsini və kremasiya kimi başqa bir utilizasiya vasitəsinin olmamasını diktə edir. [15] 10-cu əsrə qədər insan cəsədlərində parçalanma aparılmırdı. [15] Kitab Əl-Təsrif, 1000-ci ildə Əl-Zəhravi tərəfindən yazılmış, əvvəlki standartlardan fərqli olan cərrahi əməliyyatın təfərrüatları. [21] Kitab təfərrüatlı illüstrasiyaları özündə cəmləşdirən tibb və cərrahiyyə üzrə təhsil mətni idi. [21] Sonradan tərcümə edildi və İbn Sinanın yerini aldı Tibb Kanonu 12-ci əsrdən 17-ci əsrə qədər Avropada əsas tədris vasitəsi kimi. [21] Bəziləri var idi ki, 12-ci əsrə qədər öyrənmək xatirinə insanları parçalamağa hazır idilər, sonra isə qadağan edildi. Bu münasibət 1952-ci ilə qədər sabit qaldı, Misirdəki İslam fiqh məktəbi "zərurətin haramlara icazə verdiyini" hökm etdi. [15] Bu qərar şübhəli ölümlərin yarılma yolu ilə araşdırılmasına imkan verdi. [15] 1982-ci ildə fətva ilə qərar verildi ki, əgər ədalətə xidmət edirsə, yarılma zərərlərə dəyər. [15] İslam indi meyitin yarılmasını təsdiqləsə də, İslam ictimaiyyəti hələ də bunu qəbul etmir. Əksər müsəlman ölkələrində tibbi və məhkəmə məqsədləri üçün yarılma geniş yayılmışdır. [15] Misirdə məhkəmə strukturunda mühüm yer tutur və ölkənin bütün tibb universitetlərində tədris olunur. [15] Qanunu tamamilə şəriət tərəfindən diktə edilən Səudiyyə Ərəbistanında yarılma əhali tərəfindən pis baxılır, lakin cinayət işlərində məcbur edilə bilər [15] bəzən universitet səviyyəsində insan parçalanmasına rast gəlinir. [15] Qətər və Tunisdə məhkəmə məqsədləri üçün yarılma aparılır. [15] İnsan parçalanması müasir İslam dünyasında mövcuddur, lakin dini və sosial stiqma səbəbindən nadir hallarda nəşr olunur. [15]

Tibet Edit

Tibet təbabəti insan parçalanması ilə bağlı uzunmüddətli təcrübədən əldə edilən kifayət qədər mürəkkəb anatomiya biliklərini inkişaf etdirdi. Tibetlilər ölkənin sərt torpaqları, ilin çox hissəsi donmuş və kremasiya üçün odun olmaması səbəbindən göydə dəfn etmə təcrübəsini qəbul etmişdilər. Göydə dəfn mərasimi mərhumun ritual parçalanması ilə başlayır və sonra hissələrin təpələrin zirvələrində qarğalara qidalanması ilə davam edir. Zamanla Tibet anatomik bilikləri Ayurvedaya [22] və daha az dərəcədə Çin təbabətinə yol tapdı. [23] [24]

Xristian Avropa redaktəsi

Xristian Avropasının bütün tarixi boyunca tibb təhsili üçün insan cəsədlərinin parçalanması müxtəlif ölkələrdə müxtəlif qanuniləşdirmə və qadağan dövrlərini yaşamışdır. Orta əsrlərdə parçalanma nadir idi, lakin ən azı 13-cü əsrə aid sübutlarla [25] tətbiq edilmişdir. [26] [27] [28] Orta əsr Qərbi Avropasında yarılma təcrübəsi "çox zəif tanınır", çünki bir neçə cərrahi mətn və ya konservləşdirilmiş insan parçalanması sağ qalmışdır. [29] Müasir bir yezuit alimi, xristian ilahiyyatının insan cəsədinin artıq müqəddəs sayılmadığı yeni sosial-dini və mədəni kontekst təmin etməklə, insanın parçalanması və yarılma işlərinin canlanmasına əhəmiyyətli töhfə verdiyini iddia etdi. [26]

1163-cü il tarixli Turlar Şurasının fərmanı və 14-cü əsrin əvvəllərində Papa Bonifas VIII-in fərmanı səhvən müəyyən edilmişdir ki, parçalanma və yarılma, bu fərmanların anlaşılmazlığı və ya ekstrapolyasiyası qadağan edilmişdir. [30] [a] Orta əsrlər tibbi tədqiqatlara, o cümlədən insanın parçalanması və yarılmalarına marağın canlanmasının şahidi oldu. [31]

Müqəddəs Roma imperatoru II Fridrix (1194-1250) qərar verdi ki, həkim və ya cərrah olmaq üçün təhsil alan hər kəs beş ildən bir keçirilən insan disseksiyasında iştirak etməlidir. [8] Bəzi Avropa ölkələri 13-cü əsrin sonu və 14-cü əsrin əvvəllərində təhsil məqsədilə edam edilmiş cinayətkarların parçalanmasını qanuniləşdirməyə başladılar. Mondino de Luzzi 1315-ci ildə ilk qeydə alınmış ictimai disseksiyanı həyata keçirdi. [8] Bu zaman yarılmalar mühazirə oxuyan Lektor, diseksiyonu edən Sektor və xüsusiyyətləri göstərən Ostensordan ibarət qrup tərəfindən həyata keçirilirdi. maraq doğurur. [8]

İtalyan Galeazzo di Santa Sofia 1404-cü ildə Vyanada Alp dağlarının şimalında ilk ictimai parçalanma etdi. [32]

16-cı əsrdə Vesalius geniş anatomik tədqiqatlarında çoxsaylı parçalanmalar həyata keçirdi. Qalenin insan anatomiyası ilə bağlı fikirləri ilə razılaşmadığı üçün tez-tez hücuma məruz qalırdı. Vesalius eyni vaxtda mühazirə oxuyan və cəsədi parçalayan ilk idi. [8] [33]

Katolik Kilsəsinin 1533-cü ildə Hispaniolada birləşmiş əkizlər Joana və Melchiora Ballestero-nun bir ruha sahib olub-olmadığını müəyyən etmək üçün yarılma əmri verdiyi bilinir. Qədim yunan filosofu Empedokla əsaslanaraq, ruhun ürəkdə olduğuna inanan iki fərqli ürək və deməli, iki ruh olduğunu aşkar etdilər. [34]

İnsan parçalanması İntibah dövrü rəssamları tərəfindən də tətbiq edilmişdir. Əksəriyyəti bədənin xarici səthlərinə diqqət yetirməyi seçsələr də, Mikelancelo Buonarotti, Antonio del Pollaiolo, Baccio Bandinelli və Leonardo da Vinçi kimi bəziləri daha dərin bir anlayışa can atırdılar. Bununla belə, sənətçilərin cəsəd əldə etmələri üçün heç bir müddəa yox idi, buna görə də onlar anatomistlərin bəzən etdiyi kimi, qəbir qarətləri, cəsədlərin oğurlanması və qətl kimi icazəsiz vasitələrə əl atmalı oldular. [8]

Anatomizasiya, məsələn, 1806-cı ildə Massaçusets ştatının Northampton şəhərində ictimaiyyət qarşısında asıldıqdan sonra 1806-cı ildə James Halligan və Dominic Daley-ə olduğu kimi, bəzən bir cəza növü kimi əmr edildi. [35]

Müasir Avropada bioloji tədqiqat və təhsildə, tibb fakültələrində və yarılmada ölümün səbəbini müəyyən etmək üçün disseksiya müntəzəm olaraq tətbiq olunur. O, ümumiyyətlə öyrənmənin zəruri hissəsi hesab olunur və buna görə də mədəni şəkildə qəbul edilir. Odense Zooparkı şir cəsədlərini ictimaiyyət qarşısında "özünün seçdiyi tamaşaçı" qarşısında parçalamaq qərarına gəldiyi kimi, bəzən mübahisələrə səbəb olur. [36] [37]

Britaniya redaktəsi

Britaniyada, Roma fəthinin sonundan və Orta əsrlər boyunca, bir sıra kral fərmanlarının müəyyən həkim və cərrah qruplarına cəsədləri parçalamaq üçün bəzi məhdud hüquqlar verdiyi 16-cı əsrə qədər parçalanma tamamilə qadağan edildi. İcazə kifayət qədər məhdud idi: 18-ci əsrin ortalarında Kral Həkimlər Kolleci və Bərbər-Cərrahlar Şirkəti disseksiya aparmağa icazə verilən yeganə iki qrup idi və onlar arasında illik on cəsəd kvotasına sahib idi. Xüsusilə sürətlə böyüyən tibb fakültələrində anatomistlərin təzyiqi nəticəsində 1752-ci il tarixli Qətl Aktı edam edilmiş qatillərin cəsədlərinin anatomik tədqiqatlar və təhsil üçün parçalanmasına icazə verdi. 19-cu əsrə qədər bu cəsəd ehtiyatı qeyri-kafi oldu, çünki dövlət tibb məktəbləri böyüyürdü və özəl tibb məktəblərində meyitlərə qanuni giriş yox idi. Kadavralarda və bədən hissələrində inkişaf edən qara bazar yarandı, bu, bədən oğurluğu peşəsinin yaranmasına və 1828-ci ildə 16 nəfərin cəsədlərinə görə öldürüldüyü zaman anatomistlərə satılmaq üçün məşhur Burke və Hare cinayətlərinin yaranmasına səbəb oldu. Nəticədə ortaya çıxan ictimai etiraz 1832-ci il Anatomiya Qanununun qəbul edilməsinə səbəb oldu və bu, parçalanma üçün meyitlərin qanuni təchizatını artırdı. [38]

21-ci əsrdə interaktiv kompüter proqramlarının mövcudluğu və ictimai əhval-ruhiyyənin dəyişməsi tibb təhsilində cəsədlərin istifadəsi ilə bağlı yenidən müzakirələrə səbəb oldu. Böyük Britaniyada 2000-ci ildə qurulan Peninsula Tibb və Stomatologiya Kolleci anatomiya təhsilini parçalanmadan həyata keçirən ilk müasir tibb məktəbi oldu. [39]

Amerika Birləşmiş Ştatları Redaktə etmək

ABŞ-da 1920-ci illərdən etibarən kollec biologiya dərslərində qurbağaların parçalanması adi hala çevrildi və təhsilin əvvəlki mərhələlərində tədricən tətbiq olundu. 1988-ci ilə qədər Amerika orta məktəbi biologiyası tələbələrinin təxminən 75-80 faizi ibtidai məktəblərdə tətbiqetmə tendensiyası ilə qurbağanın parçalanmasında iştirak edirdi. Qurbağalar ən çox cinsdəndir Rəna. Həmin sorğu zamanı orta məktəbdə disseksiya üçün digər məşhur heyvanlar onurğalılar, döl donuzları, perch və pişiklər, onurğasızlar, yer qurdları, çəyirtkələr, xərçəngkimilər və dəniz ulduzları arasında idi. [40] Amerika Birləşmiş Ştatlarının orta məktəblərində tibbi təhsil və tədqiqatlar nəzərə alınmadan hər il təxminən altı milyon heyvan (2016) parçalanır. Bunların əksəriyyəti kəsimxanalardan və fermalardan artıq ölü halda alınır. [41]

ABŞ orta məktəblərində diseksiyon 1987-ci ildə Kaliforniya tələbəsi Jenifer Graham, məktəbindən alternativ bir layihəni tamamlamasına icazə verməsini tələb edən məhkəməyə müraciət etdikdə diqqəti cəlb etdi. Məhkəmə məcburi parçalanmalara icazə verildiyinə qərar verdi, lakin Qrem təbii səbəblərdən ölmüş qurbağanın əldə edilməsinin praktiki olaraq qeyri-mümkünlüyünü kəsmək üçün öldürülən qurbağanı yox, təbii səbəblərdən ölmüş qurbağanın parçalanmasını istəyə bilər. Graham tələb olunan parçalanmadan imtina etsin. Kostyum disseksiya əleyhinə müdafiəçilərə reklam verdi. Qrem 1987-ci ildə “Apple Computer” reklamında “Operation Frog” virtual disseksiya proqramı üçün çəkilib. [42] [43] Kaliforniya ştatı 1988-ci ildə etiraz edən tələbələrə alternativ layihələri tamamlamağa icazə verilməsini tələb edən Tələbə Hüquqları Qanununu qəbul etdi. [44] Diseksiyondan imtina 1990-cı illərdə artdı. [45]

Birləşmiş Ştatlarda 17 ştat [b] Vaşinqtonla birlikdə ibtidai və orta təhsildə olan tələbələrə disseksiyadan imtina etməyə imkan verən disseksiya seçimi qanunları və ya siyasətləri qəbul etmişdir. Arizona, Havay, Minnesota, Texas və Yuta da daxil olmaqla digər ştatlar əxlaqi, dini və ya etik əsaslarla imtina etmək üçün daha ümumi siyasətlərə malikdir. [46] Bu narahatlıqları aradan qaldırmaq üçün Florida ştatının New Port Richey şəhərindəki J. W. Mitchell Liseyi 2019-cu ildə öz elm dərslərində qorunub saxlanılmış real qurbağalar əvəzinə sintetik qurbağalardan istifadə edən ilk ABŞ orta məktəbi oldu. [47] [48] [49]

Bakalavr və tibb fakültəsində cəsədlərin parçalanmasına gəlincə, ənənəvi disseksiya professorlar və tələbələr tərəfindən dəstəklənir, bəzi müxalifət isə diseksiyonun mövcudluğunu məhdudlaşdırır. Professorları ilə birlikdə bu üsulu təcrübədən keçirmiş yuxarı səviyyəli tələbələr "Rəngarəng cədvəllərlə insan anatomiyasını öyrənmək bir şeydir. Neştərdən və faktiki, yaxınlarda yaşayan bir insandan istifadə etmək tamam başqa məsələdir" fikri ilə razılaşırlar. [50]

Kadavra nümunələrinin əldə edilmə üsulu ölkəyə görə çox fərqlidir. [51] Böyük Britaniyada cəsədin bağışlanması tamamilə könüllüdür. Məcburi donorluq ABŞ-dakı nümunələrin təxminən 20 faizində və Cənubi Afrika və Zimbabve kimi bəzi ölkələrdə bağışlanan nümunələrin demək olar ki, hamısında rol oynayır. [51] Məcburi donorluğu tətbiq edən ölkələr parçalanma məqsədləri üçün ölmüş cinayətkarların cəsədlərini və ya tələb olunmamış və ya naməlum cəsədləri təqdim edə bilər. [51] Bu cür təcrübələr yoxsulların, evsizlərin və sosial təcrid olunmuşların daha çox hissəsinin qeyri-ixtiyari olaraq ianə edilməsinə səbəb ola bilər. [51] Bir yurisdiksiyada bağışlanan cəsədlər həm ABŞ-da [4] ştatlar arasında, istərsə də Liviya kimi digər ölkələrdən idxal edilən digər ölkədə parçalanma məqsədləri üçün istifadə edilə bilər. [51] Kadavrın könüllü olaraq necə bağışlandığına misal olaraq, cənazə evi könüllü ianə proqramı ilə birlikdə proqramın bir hissəsi olan cəsədi müəyyən edir. Diplomatik şəkildə yaxınları ilə söhbət etdikdən sonra cəsəd qeydiyyatdan keçmiş obyektə aparılır. Bədəndə HİV və hepatit viruslarının olması yoxlanılır. Sonra "təzə" və ya "hazırlanmış" nümunə kimi istifadə üçün qiymətləndirilir. [4]

Parçalanma üçün meyit nümunələri, ümumiyyətlə, kremasiya yolu ilə məhv edilir. Bundan sonra mərhum yerli qəbiristanlıqda dəfn oluna bilər. Ailə istəsə, mərhumun külü daha sonra ailəyə qaytarılır. [4] Bir çox institutların donorları cəlb etmək, dəstəkləmək və qeyd etmək üçün yerli siyasətləri var. Bu, qəbiristanlıqda yerli abidələrin qoyulmasını əhatə edə bilər. [4]

İnsan cəsədləri tibbdə anatomiya və ya cərrahi təlimatları öyrətmək üçün tez-tez istifadə olunur. [4] [51] Kadavralar anatomiyasına və mövcudluğuna görə seçilir. Mümkün qədər real olmaq üçün, məsələn, cərrahlara təlim keçirərkən, onlar "təzə" nümunəni əhatə edən disseksiya kurslarının bir hissəsi kimi istifadə edilə bilər. [4] Kadavralar həmçinin təlim keçmiş təlimatçılar tərəfindən əvvəlcədən parçalana bilər. Bu parçalanma forması nümunələrin daha uzun müddətə hazırlanmasını və saxlanmasını nəzərdə tutur və ümumiyyətlə anatomiyanın tədrisi üçün istifadə olunur. [4]

Parçalanmaya bəzi alternativlər, qəbul edilən etik problemləri aradan qaldırarkən, heyvan cəsədlərinin istifadəsi ilə müqayisədə təhsil üstünlükləri təqdim edə bilər. [52] Bu alternativlərə kompüter proqramları, mühazirələr, üç ölçülü modellər, filmlər və digər texnologiya formaları daxildir. Heyvanların rifahı ilə bağlı narahatlıq çox vaxt heyvanların parçalanmasına etirazların kökündə dayanır. [53] Tədqiqatlar göstərir ki, bəzi tələbələr müəllimləri və həmyaşıdları tərəfindən real və ya dərk edilən cəza və ya kənarlaşdırılma qorxusundan heyvanların parçalanmasında könülsüz iştirak edirlər və bir çoxları öz etik etirazları barədə danışmırlar. [54] [55]

Kadavraların istifadəsinə alternativlərdən biri kompüter texnologiyasıdır. Stanford Tibb Məktəbində proqram stolun üstündəki bədən ölçüsündə ekranda nümayiş etdirmək üçün rentgen, ultrasəs və MRT görüntülərini birləşdirir. [56] Bunun bir variantında, Nyu York Universitetində inkişaf etdirilən "virtual anatomiya" yanaşmasında tələbələr üç ölçülü eynək taxırlar və onun bölmələri canlı kimi parlaq rəngli "virtual bədəndən keçmək" üçün işarə cihazından istifadə edə bilərlər. toxuma." Bu metodun "Imax [kino] qədər dinamik" olduğu iddia edilir. [57]

Heyvanlardan azad tədris metodologiyasının tərəfdarları iddia edirlər ki, heyvanların parçalanmasına alternativlər müəllimlərə təlimin effektivliyini artırmaq və təlimat xərclərini azaltmaqla müəllimlərə fayda verə bilər, eyni zamanda müəllimlərə təlim məşqlərinin fərdiləşdirilməsi və təkrarlanma qabiliyyəti üçün inkişaf etmiş potensial verir. Parçalanma alternativlərinin tərəfdarları kompüter əsaslı tədris metodlarının "akademik və qeyri-akademik işçilərin vaxtına qənaət etdiyini... daha az bahalı və effektiv və əyləncəli tələbə öyrənmə üsulu hesab edildiyini [və] ... əhəmiyyətli dərəcədə azaldılmasına töhfə verdiyini göstərən araşdırmalara diqqət çəkirlər. heyvanların istifadəsində" çünki heç bir quraşdırma və ya təmizləmə vaxtı, məcburi təhlükəsizlik dərsləri və heyvanların cəsədləri, qayçı və neştər ilə davranışlarının monitorinqi yoxdur. [58] [59] [60]

Proqram təminatı və digər qeyri-heyvan üsulları ilə avadanlıqların bahalı atılması və ya təhlükəli materialın çıxarılması da yoxdur. Bəzi proqramlar həmçinin müəllimlərə dərsləri fərdiləşdirməyə imkan verir və şagird performansını izləyə bilən daxili test və viktorina modullarını daxil edir. Bundan əlavə, heyvanlar (ölü və ya diri) yalnız bir dəfə istifadə oluna bilər, qeyri-heyvan resursları isə uzun illər istifadə edilə bilər - bu əlavə fayda müəllimlər, məktəb rayonları və dövlət təhsil sistemləri üçün əhəmiyyətli xərclərə qənaətlə nəticələnə bilər. [58]

Heyvanları parçalayan tələbələrin və alternativ təlimat metodundan istifadə edənlərin məlumat saxlama qabiliyyətini və performansını araşdıran bir sıra nəzərdən keçirilmiş müqayisəli tədqiqatlar belə nəticəyə gəldi ki, qeyri-heyvan metodlarından istifadə etməklə əsas və qabaqcıl biotibbi anlayışlar və bacarıqlar öyrədilən tələbələrin təhsil nəticələri ekvivalentdir və ya heyvan disseksiyası kimi heyvan əsaslı laboratoriyalardan istifadə edən həmyaşıdlarından üstündür. [61] [62]

Bəzi hesabatlar göstərir ki, tələbələrin inamı, məmnunluğu və məlumatı əldə etmək və çatdırmaq bacarığı, disseksiya ilə müqayisədə alternativ fəaliyyətlərdə iştirak edənlər üçün daha yüksəkdir. Birləşmiş Ştatlardakı universitetlərdə aparılan üç ayrı araşdırma, bədən sistemlərini gildən modelləşdirən tələbələrin insan anatomiyasının tərkib hissələrini müəyyən etməkdə heyvanların parçalanması ilə məşğul olan sinif yoldaşlarına nisbətən daha yaxşı olduqlarını göstərdi. [63] [64] [65]

Başqa bir araşdırma, tələbələrin heyvanların parçalanması ilə müqayisədə gil modelləşdirmədən istifadə etməyi üstün tutduqlarını və heyvanları parçalayan kohortları kimi yaxşı performans göstərdiklərini göstərdi. [66]

2008-ci ildə Biologiya Müəllimlərinin Milli Assosiasiyası (NABT) sinif heyvanlarının disseksiyasına dəstəyini təsdiqləyərək, "Şagirdlərin yaşı və yetkinlik səviyyəsinə uyğun olaraq sinifdə canlı heyvanların olmasını təşviq edin ...NABT müəllimləri disseksiyaya alternativlərin öz məhdudiyyətləri olduğunu bilir. NABT bu materialların təhsil prosesinə əlavələr kimi istifadəsini dəstəkləyir, lakin faktiki orqanizmlərin istifadəsi üçün müstəsna əvəzedicilər kimi deyil. [67]

Milli Elm Müəllimləri Assosiasiyası (NSTA) "K-12 fənn sinfində təlimin bir hissəsi kimi canlı heyvanların daxil edilməsini dəstəkləyir, çünki heyvanları birbaşa müşahidə etmək və onlarla işləmək tələbələrin elmə marağını, eləcə də əsas anlayışları gücləndirərkən həyata ümumi hörməti artıra bilər. "biologiya elmləri. NSTA həmçinin təcrübəyə etiraz edən tələbələrə diseksiyon alternativləri təklif etməyi dəstəkləyir. [68]

NORINA verilənlər bazası təhsil və təlimdə heyvanların istifadəsinə alternativ və ya əlavə kimi istifadə oluna bilən 3000-dən çox məhsulu sadalayır. [69] Bunlara məktəblərdə diseksiyona alternativlər daxildir. InterNICHE-nin oxşar məlumat bazası və kreditlər sistemi var. [70]


ASJC Scopus mövzu sahələri

  • APA
  • Standart
  • Harvard
  • Vankuver
  • Müəllif
  • BIBTEX
  • RIS

Genetik qarşılıqlı əlaqə xəritəsindən istifadə edərək maya xromosom biologiyasında iştirak edən protein komplekslərinin funksional parçalanması. / Collins, Sean R. Miller, Kyle M. Maas, Nency L. Roguev, Assen Fillingham, Jeffrey Chu, Clement S. Schuldiner, Maya Gebbia, Marinella Recht, Judith Shales, Michael Ding, Huiming Xu, Hong Han, Junhong Ingvarsdottir, Kristin Çenq, Bencamin Endryus, Brenda Bun, Çarlz Berqer, Şelli L. Hiter, Fil Çjanq, Zhiquo Braun, Qrant U. İnqlz, C. Ceyms Emili, Endryu Allis, C. Devid Toçiski, Devid P. Vaysman, Conatan S. Qrinblatt , Jack F. Krogan, Nevan J.

In: Nature, Vol. 446, No 7137, 12.04.2007, s. 806-810.

Tədqiqatın nəticəsi : Jurnalın töhfəsi › Məqalə › ekspert rəyi

T1 - Genetik qarşılıqlı əlaqə xəritəsindən istifadə edərək maya xromosom biologiyasında iştirak edən protein komplekslərinin funksional parçalanması

AU - Ingvarsdottir, Kristin

N2 - Zülallar arasında funksional əlaqələrin müəyyən edilməsi hüceyrə biologiyasının faktiki olaraq bütün aspektlərini başa düşmək üçün vacibdir. Zülal komplekslərinin geniş miqyaslı identifikasiyası bu məqsədə doğru mühüm bir addım atdı, lakin hətta zülal-zülal qarşılıqlı əlaqəsinin stoxiometriyası, yaxınlığı və ömrü haqqında bilik belə komplekslər arasında və daxilində funksional əlaqələri aşkar edə bilməz. Genetik qarşılıqlı əlaqə zülal-zülal qarşılıqlı əlaqə məlumat dəstləri üçün böyük ölçüdə görünməyən funksional məlumat verə bilər. Burada xromosom biologiyasının müxtəlif aspektlərində iştirak edən 743 Saccharomyces cerevisiae geni arasında (DNT replikasiyası/təmiri, xromatidlərin seqreqasiyası və transkripsiya tənzimləməsi daxil olmaqla) genetik qarşılıqlı əlaqənin kəmiyyətcə cüt-cüt ölçülməsindən ibarət olan epistatik miniarray profilini (E-MAP) təqdim edirik. Bu E-MAP göstərir ki, fiziki qarşılıqlı təsirlər ayrı-ayrı zülalların ümumi funksiyanı yerinə yetirmək üçün ardıcıl hərəkət edib etməməsi ilə fərqlənən iki yaxşı təmsil olunan sinifə bölünür. Beləliklə, genetik qarşılıqlı əlaqə məlumatları Vasitəçi də daxil olmaqla funksional çox protein komplekslərini parçalamağa və fərqli protein komplekslərini yollara təşkil etməyə imkan verir. Burada müəyyən edilmiş yollardan birində biz göstəririk ki, Rtt109 histon H3-ün lizin 56-da Asf1-dən asılı asetilasiyasına cavabdeh olan histon asetiltransferazaların yeni sinfinin qurucu üzvüdür. Bu modifikasiya, öz növbəsində, cullin Rtt101-i ehtiva edən ubiquitin ligaza kompleksinə imkan verir. DNT replikasiyası zamanı genomik bütövlüyü təmin etmək.

AB - Zülallar arasında funksional əlaqələrin müəyyən edilməsi hüceyrə biologiyasının faktiki olaraq bütün aspektlərini başa düşmək üçün vacibdir. Zülal komplekslərinin geniş miqyaslı identifikasiyası bu məqsədə doğru mühüm bir addım atdı, lakin hətta zülal-zülal qarşılıqlı əlaqəsinin stoxiometriyası, yaxınlığı və ömrü haqqında bilik belə komplekslər arasında və daxilində funksional əlaqələri aşkar edə bilməz. Genetik qarşılıqlı əlaqə zülal-zülal qarşılıqlı əlaqə məlumat dəstləri üçün əsasən görünməyən funksional məlumat verə bilər. Burada xromosom biologiyasının müxtəlif aspektlərində iştirak edən 743 Saccharomyces cerevisiae geni arasında (DNT replikasiyası/təmiri, xromatidlərin seqreqasiyası və transkripsiya tənzimləməsi daxil olmaqla) genetik qarşılıqlı əlaqənin kəmiyyətcə cüt-cüt ölçülməsindən ibarət olan epistatik miniarray profilini (E-MAP) təqdim edirik. Bu E-XARİTADA fiziki qarşılıqlı təsirlərin ayrı-ayrı zülalların ümumi bir funksiyanı yerinə yetirmək üçün əlaqəli şəkildə hərəkət edib etməməsi ilə fərqlənən iki yaxşı təmsil olunan sinifə bölündüyünü göstərir. Beləliklə, genetik qarşılıqlı əlaqə məlumatları Vasitəçi də daxil olmaqla funksional çox proteinli kompleksləri parçalamağa və fərqli protein komplekslərini yollara təşkil etməyə imkan verir. In one pathway defined here, we show that Rtt109 is the founding member of a novel class of histone acetyltransferases responsible for Asf1-dependent acetylation of histone H3 on lysine 56. This modification, in turn, enables a ubiquitin ligase complex containing the cullin Rtt101 to ensure genomic integrity during DNA replication.


Functional dissection of protein complexes involved in yeast chromosome biology using a genetic interaction map

Defining the functional relationships between proteins is critical for understanding virtually all aspects of cell biology. Large-scale identification of protein complexes has provided one important step towards this goal however, even knowledge of the stoichiometry, affinity and lifetime of every protein-protein interaction would not reveal the functional relationships between and within such complexes. Genetic interactions can provide functional information that is largely invisible to protein-protein interaction data sets. Here we present an epistatic miniarray profile (E-MAP) consisting of quantitative pairwise measurements of the genetic interactions between 743 Saccharomyces cerevisiae genes involved in various aspects of chromosome biology (including DNA replication/repair, chromatid segregation and transcriptional regulation). This E-MAP reveals that physical interactions fall into two well-represented classes distinguished by whether or not the individual proteins act coherently to carry out a common function. Thus, genetic interaction data make it possible to dissect functionally multi-protein complexes, including Mediator, and to organize distinct protein complexes into pathways. In one pathway defined here, we show that Rtt109 is the founding member of a novel class of histone acetyltransferases responsible for Asf1-dependent acetylation of histone H3 on lysine 56. This modification, in turn, enables a ubiquitin ligase complex containing the cullin Rtt101 to ensure genomic integrity during DNA replication.


What is functional dissection? - Biologiya

a Centre for Gene Regulation and Expression, School of Life Sciences, University of Dundee, Dundee, UK
E-mail: [email protected]

b Institute for Molecular Precision Medicine, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China

Mücərrəd

Protein O-GlcNAcylation is an abundant post-translational modification of intracellular proteins with the monosaccharide N-acetylglucosamine covalently tethered to serines and threonines. Modification of proteins with O-GlcNAc is required for metazoan embryo development and maintains cellular homeostasis through effects on transcription, signalling and stress response. While disruption of O-GlcNAc homeostasis can have detrimental impact on cell physiology and cause various diseases, little is known about the functions of individual O-GlcNAc sites. Most of the sites are modified sub-stoichiometrically which is a major challenge to the dissection of O-GlcNAc function. Here, we discuss the application, advantages and limitations of the currently available tools and technologies utilised to dissect the function of O-GlcNAc on individual proteins and sites in vitroin vivo. Additionally, we provide a perspective on future developments required to decipher the protein- and site-specific roles of this essential sugar modification.


Identification and Functional Dissection of Stress-responsive Genes in Cotton

Cotton is one of the most important fiber and oil crops. Abiotic stress (salt stress, drought stress, heat stress and chilling stress) and biotic stress (Verticillium wilt, fusarium wilt, pests) severely threaten cotton productivity. Most commercial cotton cultivars show poor resistance to Verticillium wilt, .

Cotton is one of the most important fiber and oil crops. Abiotic stress (salt stress, drought stress, heat stress and chilling stress) and biotic stress (Verticillium wilt, fusarium wilt, pests) severely threaten cotton productivity. Most commercial cotton cultivars show poor resistance to Verticillium wilt, resulting in decreased fiber quality and annual crop yield, with losses reaching 30%-80% in severe disease outbreaks. Additionally, global climate change, drought, heat, and chilling stress dramatically suppress cotton growth and productivity. To develop germplasm that are abiotic and biotic stress resistant remains enigmatic. For sustained cotton breeding, it is essential to develop elite cotton varieties with enhanced tolerance to biotic and abiotic stress, without reduction in quality.

The location of elite alleles and loci with increased tolerance to biotic and abiotic stress will accelerate cotton breeding. It is also possible to study such elite genes originating from wild cotton, sea island cotton, other stress-tolerant plants, or microorganisms to enhance cotton stress tolerance. The function of these candidate genes or loci can be verified by genetic and biochemical processes. Genetic and biochemical analyses confirm the function of these candidate genes or loci, which are aggregated to produce elite cotton germplasm material.

The goal of this Research Topic is to summarize the advances in elite gene screening and the production of germplasm material for cotton tolerance to abiotic and biotic stress.

Specific themes include, but not limited to:
• Summary of the progress about cotton abiotic and biotic stress study, present the main challenges faced by cotton stress tolerant breeding, as well as the solutions, and future breeding strategies (reviews on invitation)
• Identification and functional characterization of elite alleles controlling abiotic stress including drought, salt stress, and elite germplasm materials creation with improved stress tolerance but without production penalty
• Identification and functional characterization of effector from Verticillium wilt, fusarium wilt and interacted proteins in plants, creation disease-resistant materials using transgenic technology and gene editing
• Identification and functional characterization of elite alleles and loci related to abiotic and biotic stress through population, omics, and other analysis,

We specifically welcome field-based studies studying the effects of cotton stress in the field as supposed to the lab.

Studies falling into the categories below will not be considered for review, unless they are expanded and provide insight into the biological system or process being studied:

i) Descriptive collection of transcripts, proteins or metabolites, including comparative sets as a result of different conditions or treatments
ii) Descriptive studies that define gene families using basic phylogenetics and the assignment of cursory functional attributions (e.g. expression profiles, hormone or metabolites levels, promoter analysis, informatic parameters)
ii) Descriptive studies using -omics approaches

The Topic Editors would like to acknowledge Dr. Xiaoyang Ge from State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research of CAAS for his contribution in the organization of this Research Topic.

Açar sözlər: Abiotic and Biotic Stress, Cotton, Verticillium wilt, Germplasm creation, Resistance

Vacib Qeyd: All contributions to this Research Topic must be within the scope of the section and journal to which they are submitted, as defined in their mission statements. Frontiers reserves the right to guide an out-of-scope manuscript to a more suitable section or journal at any stage of peer review.


Təşəkkürlər

We are grateful to K. Tipton and M. Bassik for critically reading the manuscript, S. Gasser, B. Frey and Vincent Cheung for discussion, and G. Narlikar for reagents. We thank N. Datta, T. Punna, N. Thompson, M. Ballantine, N. Gabovic, A. Wind, K. Chin, Y. Xue, A. Chan, Y. Xue, T. Chan, M. Xan, M. Lim, H. Dalgleish, K. Vachon, L. Le, C. Sun, Z. Hassam, J. Rilestone and K. Takhar for technical assistance. We also thank S. Jackson, Z. Zhang, Vanessa Cheung, F. Winston, J. Erkmann and P. Kaufman for communicating results before publication. This research was supported by grants from Genome Canada and the Ontario Genomics Institute (J.F.G., A.E., C.B. and B.A.), the NIH (D.P.T.), the Howard Hughes Medical Institute (J.S.W.) and the Canadian Institute of Health Research (N.J.K., C.J.I. and G.W.B.). S.R.C. was funded by a fellowship from the Burroughs Wellcome Fund. N.J.K. is a Sandler Family Fellow.


SPECIFIC TARGETING OF GLUTAMATERGIC AND GABAERGIC BNST SUBPOPULATIONS

Glutamate and gamma-aminobutyric acid (GABA) are the principal excitatory and inhibitory neurotransmitters in the brain, respectively. The anterior and dorsal parts of the BNST are mostly comprised of GABAergic neurons, while the posterior and ventral parts of the BNST contain significant numbers of both glutamatergic and GABAergic neurons (Poulin et al., 2009). To target glutamatergic or GABAergic BNST subpopulations, most studies used the Vglut2 və ya Vgat gene (that encodes vesicular glutamate transporter 2 or vesicular GABA transporter, respectively) as the genetic marker, respectively (Bhatti et al., 2020 Jennings et al., 2013a 2013b), while some used Gad2 (encoding 65 kDa isoform of glutamic acid decarboxylase) to gain genetic access to GABAergic BNST neurons (Hao et al., 2019). Specifically, these studies used knock-in mouse lines expressing a bacterial recombinase Cre under the promoter of Vglut2, Vgat, və ya Gad2 in combination with viral tools that allow Cre-dependent expression of optogenetic or chemogenetic tools or fluorescent calcium indicators. Notably, all the studies have demonstrated that optogenetic stimulation of each neural population indeed evoked the anticipated excitatory or inhibitory responses in the postsynaptic neurons, confirming the tight correspondence between molecular and electrophysiological phenotypes.


Functional dissection of the NuA4 histone acetyltransferase reveals its role as a genetic hub and that Eaf1 is essential for complex integrity

The Saccharomyces cerevisiae NuA4 histone acetyltransferase complex catalyzes the acetylation of histone H4 and the histone variant Htz1 to regulate key cellular events, including transcription, DNA repair, and faithful chromosome segregation. To further investigate the cellular processes impacted by NuA4, we exploited the nonessential subunits of the complex to build an extensive NuA4 genetic-interaction network map. The map reveals that NuA4 is a genetic hub whose function buffers a diverse range of cellular processes, many not previously linked to the complex, including Golgi complex-to-vacuole vesicle-mediated transport. Further, we probe the role that nonessential subunits play in NuA4 complex integrity. We find that most nonessential subunits have little impact on NuA4 complex integrity and display between 12 and 42 genetic interactions. In contrast, the deletion of EAF1 causes the collapse of the NuA4 complex and displays 148 genetic interactions. Our study indicates that Eaf1 plays a crucial function in NuA4 complex integrity. Further, we determine that Eaf5 and Eaf7 form a subcomplex, which reflects their similar genetic interaction profiles and phenotypes. Our integrative study demonstrates that genetic interaction maps are valuable in dissecting complex structure and provides insight into why the human NuA4 complex, Tip60, has been associated with a diverse range of pathologies.

Rəqəmlər

Synthetic genetic-interaction map of five…

Synthetic genetic-interaction map of five NuA4 subunits. Genome-wide SL-SGA screens were performed using…

Eaf1-TAP purifies the NuA4 complex.…

Eaf1-TAP purifies the NuA4 complex. SDS-PAGE (gradient gel) and silver staining comparing NuA4…

NuA4 function impacts vesicle-mediated transport.…

NuA4 function impacts vesicle-mediated transport. (A) eaf1 Δ, yaf9 Δ, yng2 Δ, and…

NuA4 physically interacts with Msn4…

NuA4 physically interacts with Msn4 but does not regulate Msn4 binding to the…

Eaf1 is required for NuA4…

Eaf1 is required for NuA4 complex integrity. SDS-PAGE (gradient gel) and silver staining…

Eaf5 and Eaf7 form a subcomplex within NuA4. (A) Two-dimensional, hierarchical clustering of…


ASJC Scopus subject areas

  • APA
  • Standart
  • Harvard
  • Vankuver
  • Müəllif
  • BIBTEX
  • RIS

Functional dissection of protein complexes involved in yeast chromosome biology using a genetic interaction map. / Collins, Sean R. Miller, Kyle M. Maas, Nancy L. Roguev, Assen Fillingham, Jeffrey Chu, Clement S. Schuldiner, Maya Gebbia, Marinella Recht, Judith Shales, Michael Ding, Huiming Xu, Hong Han, Junhong Ingvarsdottir, Kristin Cheng, Benjamin Andrews, Brenda Boone, Charles Berger, Shelley L. Hieter, Phil Zhang, Zhiguo Brown, Grant W. Ingles, C. James Emili, Andrew Allis, C. David Toczyski, David P. Weissman, Jonathan S. Greenblatt, Jack F. Krogan, Nevan J.

In: Nature , Vol. 446, No. 7137, 12.04.2007, p. 806-810.

Research output : Contribution to journal › Article › peer-review

T1 - Functional dissection of protein complexes involved in yeast chromosome biology using a genetic interaction map

AU - Ingvarsdottir, Kristin

N1 - Funding Information: Acknowledgements We are grateful to K. Tipton and M. Bassik for critically reading the manuscript, S. Gasser, B. Frey and Vincent Cheung for discussion, and G. Narlikar for reagents. We thank N. Datta, T. Punna, N. Thompson, M. Ballantine, N. Gabovic, A. Wind, K. Chin, Y. Xue, A. Chan, Y. Xue, T. Chan, M. Xan, M. Lim, H. Dalgleish, K. Vachon, L. Le, C. Sun, Z. Hassam, J. Rilestone and K. Takhar for technical assistance. We also thank S. Jackson, Z. Zhang, Vanessa Cheung, F. Winston, J. Erkmann and P. Kaufman for communicating results before publication. This research was supported by grants from Genome Canada and the Ontario Genomics Institute (J.F.G., A.E., C.B. and B.A.), the NIH (D.P.T.), the Howard Hughes Medical Institute (J.S.W.) and the Canadian Institute of Health Research (N.J.K., C.J.I. and G.W.B.). S.R.C. was funded by a fellowship from the Burroughs Wellcome Fund. N.J.K. is a Sandler Family Fellow. Copyright: Copyright 2015 Elsevier B.V., All rights reserved.

N2 - Defining the functional relationships between proteins is critical for understanding virtually all aspects of cell biology. Large-scale identification of protein complexes has provided one important step towards this goal however, even knowledge of the stoichiometry, affinity and lifetime of every protein-protein interaction would not reveal the functional relationships between and within such complexes. Genetic interactions can provide functional information that is largely invisible to protein-protein interaction data sets. Here we present an epistatic miniarray profile (E-MAP) consisting of quantitative pairwise measurements of the genetic interactions between 743 Saccharomyces cerevisiae genes involved in various aspects of chromosome biology (including DNA replication/repair, chromatid segregation and transcriptional regulation). This E-MAP reveals that physical interactions fall into two well-represented classes distinguished by whether or not the individual proteins act coherently to carry out a common function. Thus, genetic interaction data make it possible to dissect functionally multi-protein complexes, including Mediator, and to organize distinct protein complexes into pathways. In one pathway defined here, we show that Rtt109 is the founding member of a novel class of histone acetyltransferases responsible for Asf1-dependent acetylation of histone H3 on lysine 56. This modification, in turn, enables a ubiquitin ligase complex containing the cullin Rtt101 to ensure genomic integrity during DNA replication.

AB - Defining the functional relationships between proteins is critical for understanding virtually all aspects of cell biology. Large-scale identification of protein complexes has provided one important step towards this goal however, even knowledge of the stoichiometry, affinity and lifetime of every protein-protein interaction would not reveal the functional relationships between and within such complexes. Genetic interactions can provide functional information that is largely invisible to protein-protein interaction data sets. Here we present an epistatic miniarray profile (E-MAP) consisting of quantitative pairwise measurements of the genetic interactions between 743 Saccharomyces cerevisiae genes involved in various aspects of chromosome biology (including DNA replication/repair, chromatid segregation and transcriptional regulation). This E-MAP reveals that physical interactions fall into two well-represented classes distinguished by whether or not the individual proteins act coherently to carry out a common function. Thus, genetic interaction data make it possible to dissect functionally multi-protein complexes, including Mediator, and to organize distinct protein complexes into pathways. In one pathway defined here, we show that Rtt109 is the founding member of a novel class of histone acetyltransferases responsible for Asf1-dependent acetylation of histone H3 on lysine 56. This modification, in turn, enables a ubiquitin ligase complex containing the cullin Rtt101 to ensure genomic integrity during DNA replication.