Məlumat

15.21C: Normal Genitourinary Microbiota - Biologiya

15.21C: Normal Genitourinary Microbiota - Biologiya


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Vaginal mikroflora əsasən müxtəlif laktobacillus növlərindən ibarətdir.

Öyrənmə Məqsədləri

  • Vaginal mikroflorada mövcud olan bakteriyaların növlərini tanıyın

Əsas Nöqtələr

  • Mikrobların sayı tipik diapazondan kənara çıxarsa (çox vaxt zəifləmiş immunitet sistemi səbəbindən) və ya mikroblar bədənin atipik bölgələrində məskunlaşarsa (məsələn, pis gigiyena və ya zədə nəticəsində), xəstəlik yarana bilər.
  • Vaginal floranın pozulması bakterial vaginoza səbəb ola bilər.

Əsas Şərtlər

  • sidik yollarının infeksiyası: Kliniki simptomları olan və ya olmayan, böyrək xəstəliyi olan və ya olmayan sidik kisəsi sidikində maya kimi bakteriya və ya digər mikroorqanizmlərin tapılması.

Genitouriya Mikrobiomu

İnsan mikrobiomu və ya insan mikrobiotası dərinin səthində və dərin qatlarında, tüpürcək və ağız mukozasında, konyunktivada və mədə-bağırsaq traktında yaşayan mikroorqanizmlərin məcmusudur. Bunlara bakteriyalar, göbələklər və arxeya daxildir. Bu orqanizmlərin bəziləri insan ev sahibi üçün faydalı olan vəzifələri yerinə yetirirlər. Bununla belə, əksəriyyətin məlum faydalı və ya zərərli təsiri yoxdur. Mövcud olması gözlənilən və normal şəraitdə xəstəliyə səbəb olmayan, əksinə sağlamlığın qorunmasında iştirak edənlər normal floranın üzvləri sayılırlar.

Mikrob populyasiyaları dəri və selikli qişada yaşayır. Onların rolu normal, sağlam insan fiziologiyasının bir hissəsini təşkil edir; lakin, əgər mikrobların sayı tipik diapazondan kənara çıxarsa (çox vaxt zəifləmiş immunitet sistemi səbəbindən) və ya mikroblar bədənin atipik bölgələrində məskunlaşarsa (məsələn, pis gigiyena və ya zədə nəticəsində), xəstəlik yarana bilər.

Mikrobların nisbətləri

İnsan bağırsağında 500-dən 1000-ə qədər bakteriya növü və dəridə təxminən eyni sayda yaşadığı təxmin edilir. Bakterial hüceyrələr insan hüceyrələrindən çox kiçikdir və orqanizmdə insan hüceyrələrindən ən azı on dəfə çox bakteriya var (təxminən 10).14 10-a qarşı13). Normal flora bakteriyaları immunitetin aşağı düşməsi zamanı fürsətçi patogenlər kimi çıxış edə bilər. Vaginal mikroflora əsasən müxtəlif laktobacillus növlərindən ibarətdir. Uzun müddətdir ki, bu növlərin ən çox yayılmış növünün Lactobacillus acidophilus olduğu düşünülürdü, lakin sonradan məlum oldu ki, ən çox yayılmış növ L. iners və sonra L. crispatusdur. Vaginada tapılan digər laktobasillər L. jensenii, L. delbruekii və L. gasseridir. Vaginal floranın pozulması bakterial vaginoza səbəb ola bilər.


Vaginal flora

Kashif J. Piracha, MD, kəskin terapiya xəstəxanalarında və reabilitasiya müəssisələrində xəstələri müalicə edən 14 ildən artıq təcrübəyə malik şura tərəfindən sertifikatlaşdırılmış həkimdir.

Vaginal flora vaginada yaşayan bakteriyalardır. Normal vaginal florada müxtəlif laktobacillus növləri üstünlük təşkil edir.

Laktobasillər laktik turşu, hidrogen peroksid və maya və digər arzuolunmaz orqanizmlərin böyüməsini maneə törədən digər maddələr istehsal edərək vajinanın sağlam qalmasına kömək edir. Onlar vajinanı təxminən 4 sağlam pH səviyyəsində saxlayırlar.

Bu yumşaq asidik mühit infeksiyadan qorunmağa kömək edir. Onların istehsal etdikləri digər maddələr də. Bu bakteriyalar sağlam vaginal ekosistemin vacib hissəsidir.


İçindəkilər

kimi tanınsa da flora və ya mikroflora, bu kök sözündən bəri texniki baxımdan yanlış addır flora bitkilərə aiddir və biota müəyyən bir ekosistemdəki orqanizmlərin ümumi kolleksiyasına aiddir. Son zamanlarda daha uyğun bir termin mikrobiota tətbiq edilir, baxmayaraq ki, onun istifadəsi köklü istifadə və tanınmasını kölgədə qoymayıb flora bakteriya və digər mikroorqanizmlərə münasibətdə. Hər iki termin müxtəlif ədəbiyyatda istifadə olunur. [4]

2014-cü ildən bəri məşhur mediada və elmi ədəbiyyatda insan orqanizmində insan hüceyrələrindən təxminən 10 dəfə çox mikrob hüceyrəsi olduğu tez-tez bildirilirdi. hüceyrələr və yetkin bir insanda adətən təxminən 10 trilyon insan hüceyrəsi var. [8] 2014-cü ildə Amerika Mikrobiologiya Akademiyası mikrob hüceyrələrinin sayının və insan hüceyrələrinin sayının həm təxminlər olduğunu vurğulayan tez-tez verilən sualları dərc etdi və həm də son araşdırmaların insan hüceyrələrinin sayına dair yeni bir təxminlərə çatdığını qeyd etdi - təqribən 37,2 trilyon, yəni 100 trilyon bakterial hüceyrənin ilkin təxminləri düzgündürsə, mikrob-insan hüceyrələrinin nisbəti 3:1-ə yaxındır. [8] [9] 2016-cı ildə başqa bir qrup nisbətin təqribən 1:1 (1.3:1) olması ilə bağlı yeni bir qiymətləndirmə dərc etdi, "qeyri-müəyyənlik 25% və standart 70 kq-lıq kişilərin əhalisinə görə 53% variasiya ilə) "). [10] [3]

Daha yeni bir hesablama, hər bir insan hüceyrəsi üçün 1,3 bakteriya hüceyrəsinin nisbətidir, halbuki fagların və virusların sayı bakteriya hüceyrələrini ən azı bir miqdar daha çox sayar. Bakteriya genlərinin sayı (hər növdə 2000 gen olan bağırsaqda 1000 bakteriya növünü fərz etsək) təxminən 20.000 insan geninin sayından 100 dəfə çox olan 2.000.000 gen olduğu təxmin edilir. [11]

İnsan mikrobiomunun aydınlaşdırılması problemi əsasən bakteriya, eukariotlar və virusları əhatə edən mikrob icmasının üzvlərini müəyyən etməkdir. [12] Bu, ilk növbədə DNT əsaslı tədqiqatlardan istifadə etməklə həyata keçirilir, baxmayaraq ki, RNT, protein və metabolit əsaslı tədqiqatlar da aparılır. [12] [13] DNT əsaslı mikrobiom tədqiqatları adətən ya hədəflənmiş amplikon tədqiqatları və ya daha yaxınlarda ov tüfəngi ilə metagenomik tədqiqatlar kimi təsnif edilə bilər. Birincisi xüsusi məlum marker genlərinə diqqət yetirir və ilk növbədə taksonomik cəhətdən informativdir, ikincisi isə cəmiyyətin funksional potensialını öyrənmək üçün də istifadə oluna bilən bütöv bir metagenomik yanaşmadır. [12] İnsan mikrobiomu tədqiqatlarında mövcud olan, lakin digər metagenomik tədqiqatlarda olmayan problemlərdən biri tədqiqata ev sahibi DNT-ni daxil etməkdən çəkinməkdir. [14]

İnsan mikrobiomunun tərkibini sadə şəkildə izah etməkdən başqa, insan mikrobiomunu əhatə edən əsas suallardan biri də "nüvənin" olub-olmamasıdır, yəni cəmiyyətin əksər insanlar arasında paylaşılan alt qrupunun olub-olmamasıdır. [15] [16] Əgər bir nüvə varsa, o zaman müəyyən icma kompozisiyalarını xəstəlik halları ilə əlaqələndirmək mümkün olardı ki, bu da İnsan Mikrobiomu Layihəsinin məqsədlərindən biridir. Məlumdur ki, insan mikrobiomu (məsələn, bağırsaq mikrobiotası) həm tək subyekt daxilində, həm də müxtəlif fərdlər arasında çox dəyişkəndir, bu fenomen siçanlarda da müşahidə olunur. [4]

13 iyun 2012-ci ildə NIH direktoru Frensis Kollinz İnsan Mikrobiomu Layihəsinin (HMP) mühüm mərhələ olduğunu elan etdi. [7] Elan eyni gündə Nature [17] [18] və Elm Kitabxanasında (PLoS) bir neçə jurnalda dərc edilmiş bir sıra əlaqələndirilmiş məqalələrlə müşayiət olundu. HMP-nin tədqiqatçıları genom sıralama üsullarından istifadə edərək sağlam insanların normal mikrob tərkibinin xəritəsini çəkərək, insanlarda normal mikrob variasiyasının sərhədlərini və istinad məlumat bazası yaratdılar. 242 sağlam ABŞ könüllüsündən ağız, burun, dəri, aşağı bağırsaq (nəcis) və vajina kimi 15 (kişi) ilə 18 (qadın) bədən yerindən toxumalardan 5000-dən çox nümunə toplanıb. Bütün DNT, insan və mikrob, DNT sıralama maşınları ilə təhlil edildi. Mikrob genomu məlumatları bakteriya spesifik ribosomal RNT, 16S rRNT-ni müəyyən etməklə çıxarılmışdır. Tədqiqatçılar hesabladılar ki, 10.000-dən çox mikrob növü insan ekosistemini tutur və onlar cinsin 81-99%-ni müəyyən ediblər.

Ov tüfənginin ardıcıllığı Redaktə edin

Bakteriyaların, arxeyaların və virusların laboratoriya icmalarında yetişdirmək çox vaxt çətindir, buna görə də ardıcıllıq texnologiyaları metagenomikada da istifadə edilə bilər. Həqiqətən də, xüsusi mikrob suşlarının funksiyaları və səciyyələndirilməsi haqqında tam bilik terapevtik kəşf və insan sağlamlığı üçün böyük potensial təklif edir. [19]

Nümunələrin toplanması və DNT çıxarılması Edit

Əsas məqam, ardıcıllığı yerinə yetirmək üçün kifayət qədər miqdarda mikrobial biokütlə toplamaq və bu səbəbdən nümunənin çirklənməsini minimuma endirmək üçün zənginləşdirmə üsullarından istifadə edilə bilər. Xüsusən də DNT çıxarma üsulu hər bakteriya ştammı üçün yaxşı olmalıdır, lizisi asan olanların genomlarına malik olmamalıdır. Kimyəvi lizizdən daha çox mexaniki lizisə üstünlük verilir və muncuqların döyülməsi kitabxananı hazırlayarkən DNT itkisi ilə nəticələnə bilər. [19]

Kitabxananın hazırlanması və ardıcıllığının düzəldilməsi

Ən çox istifadə edilən platformalar Illumina, Ion Torrent, Oxford Nanopore MinION və Pacific Bioscience Sequel-dir, baxmayaraq ki, Illumina platforması geniş əlçatanlığı, yüksək məhsuldarlığı və dəqiqliyi səbəbindən ən cəlbedici seçim hesab olunur. İstifadə ediləcək nümunənin düzgün miqdarı ilə bağlı heç bir əlamət yoxdur. [19]

Metagenom montajı Redaktə edin

De novo yanaşmadan istifadə edilir, lakin aradan qaldırılmalı olan bəzi çətinliklər var. Əhatə onun spesifik icmasındakı hər bir genom bolluğundan asılıdır, əgər ardıcıllıq dərinliyi boşluqların əmələ gəlməsinin qarşısını almaq üçün kifayət qədər deyilsə, az bol genomlar parçalanmaya məruz qala bilər. Xoşbəxtlikdən, kömək etmək üçün metagenom-spesifik montajçılar var, çünki yüzlərlə suş varsa, ardıcıllıq dərinliyini maksimuma çatdırmaq lazımdır. [19]

Contig binning Redaktə edin

Nə hər bir kontigin hansı genomdan əldə edildiyi, nə də nümunədə mövcud olan genomların sayı məlum deyil. a priori bu addımın məqsədi kontigləri növlərə bölməkdir. Bu cür təhlili yerinə yetirmək üçün üsullar nəzarət altında (məlum ardıcıllıqla verilənlər bazası) və ya nəzarətsiz (toplanmış məlumatlarda sıx qrupların birbaşa axtarışı) ola bilər. Bununla belə, hər iki üsul müəyyən kontig və onun qoyulmalı olduğu qrup arasında oxşarlıq xalını müəyyən etmək üçün bir növ metrikanı və oxşarlıqları qruplardakı bölgülərə çevirmək üçün alqoritmləri tələb edir. [19]

Təhlil işlənməsindən sonra Edit

Statistik təhlil əldə edilmiş nəticələri təsdiqləmək üçün vacibdir (ANOVA qruplar arasındakı fərqləri ölçmək üçün istifadə edilə bilər), əgər o, qrafik alətlərlə birləşdirilərsə, nəticə asanlıqla vizuallaşdırılır və başa düşülür. [19]

Metagenom yığıldıqdan sonra mikrobiomun funksional potensialı haqqında nəticə çıxarmaq mümkündür. Bu tip analiz üçün hesablama çətinlikləri tək genomlara nisbətən daha böyükdür, çünki adətən metagenomların montajçıları keyfiyyətsiz olur və bir çox bərpa edilmiş genlər tam deyil və ya parçalanmışdır. Gen identifikasiyası addımından sonra verilənlər, ortoloqlar verilənlər bazasına qarşı hədəf genlərin çoxsaylı uyğunlaşdırılması vasitəsilə funksional annotasiya aparmaq üçün istifadə edilə bilər. [20]

Marker gen analizi Redaktə edin

Bu, müəyyən bir genetik bölgəni hədəf almaq üçün primerlərdən istifadə edən və mikrobların filogeniyalarını təyin etməyə imkan verən bir texnikadır. Genetik bölgə yüksək dəyişkən bir bölgə ilə xarakterizə olunur ki, bu da ətraflı identifikasiyanı təmin edə bilər, o, PCR-də istifadə olunan primerlər üçün bağlayıcı yerlər kimi fəaliyyət göstərən qorunan bölgələrlə ayrılır. Bakteriyaları və arxeyləri xarakterizə etmək üçün istifadə olunan əsas gen 16S rRNA genidir, göbələklərin identifikasiyası isə Daxili Transkripsiya edilmiş Spacerə (ITS) əsaslanır. Texnika sürətli və o qədər də bahalı deyil və mikrob nümunəsinin aşağı rezolyusiyaya malik təsnifatını əldə etməyə imkan verir, bu, ev sahibinin DNT-si ilə çirklənmiş nümunələr üçün optimaldır. Primer yaxınlığı bütün DNT ardıcıllıqları arasında dəyişir və bu, gücləndirmə reaksiyası zamanı qərəzliliyə səbəb ola bilər, həqiqətən də, aşağı bolluq nümunələri həddindən artıq gücləndirmə xətalarına həssasdır, çünki digər çirkləndirici mikroorqanizmlər PCR dövrlərinin artması halında həddindən artıq təmsil olunur. Buna görə də, primer seçiminin optimallaşdırılması bu cür səhvləri azaltmağa kömək edə bilər, baxmayaraq ki, nümunədə mövcud olan mikroorqanizmlər və onların nisbi bolluğu haqqında tam bilik tələb olunur. [21]

Marker gen analizi bu cür analizdə əsas seçimdən təsirlənə bilər, yaxşı təsdiqlənmiş protokoldan (məsələn, Yer Mikrobiomu Layihəsində istifadə olunan protokoldan) istifadə etmək məqsədəuyğundur. Bir marker gen amplikon analizində ediləcək ilk şey, ardıcıllıq səhvlərini aradan qaldırmaqdır. Bu fenomeni azaltmaq üçün ilk yanaşma ardıcıllıqları Əməliyyat taksonomik vahidinə (OTU) klaster etməkdir: bu proses oxşar ardıcıllıqları (bir qayda olaraq 97% oxşarlıq həddi qəbul edilir) bir xüsusiyyətə birləşdirərək sonrakı analiz addımlarında istifadə edilə bilər, lakin bu metod SNP-ləri atın, çünki onlar tək bir OTU-ya yığılacaqlar. Başqa bir yanaşma kiçik nukleotid variasiyalarını aşkar etmək və yaxından əlaqəli fərqli taksonlar arasında ayrı-seçkilik etmək üçün 16s rRNT ardıcıllığından mövqeyə aid xüsusi məlumatları ehtiva edən Oliqotipləşdirmədir. Bu üsullar çıxış olaraq OTU deyil, DNT ardıcıllıqlarının cədvəlini və nümunə başına müxtəlif ardıcıllıqların sayını verir. [21]

Təhlildə digər mühüm addım verilənlərdəki mikrob ardıcıllığına taksonomik ad təyin etməkdir. Bu, təxminən 80% cins səviyyəsində dəqiqliyə çata bilən maşın öyrənmə yanaşmalarından istifadə etməklə edilə bilər. Digər populyar analiz paketləri istinad verilənlər bazalarına dəqiq uyğunluqlardan istifadə edərək taksonomik təsnifat üçün dəstək verir və daha böyük spesifiklik, lakin zəif həssaslıq təmin etməlidir. Təsnifatlaşdırılmamış mikroorqanizm orqanel ardıcıllığı üçün əlavə yoxlanılmalıdır. [21]

Filogenetik Analiz Redaktəsi

Filogenetik nəticədən istifadə edən bir çox üsullar Arxeya və Bakteriyalar üçün 16SRNA genindən və Eukaryotlar üçün 18SRNA genindən istifadə edir. Filogenetik müqayisəli metodlar (FKS) mikroorqanizmlər arasında çoxsaylı əlamətlərin müqayisəsinə əsaslanır: onlar nə qədər yaxından əlaqəlidirlərsə, paylaşdıqları əlamətlərin sayı bir o qədər çox olur. Adətən PCS daha əhəmiyyətli nəticələr əldə etmək üçün filogenetik ümumiləşdirilmiş ən kiçik kvadrat (PGLS) və ya digər statistik analiz ilə birləşdirilir. Əcdadların dövlət rekonstruksiyası mikrobiom tədqiqatlarında xüsusiyyətləri məlum olmayan taksonlar üçün əlamət dəyərlərini təyin etmək üçün istifadə olunur. Bu, adətən mövcud verilənlər bazalarına əsaslanan PICRUSt ilə həyata keçirilir. Filogenetik dəyişənlər tədqiqatçılar tərəfindən tədqiqatın növünə görə seçilir: əhəmiyyətli bioloji məlumatlara malik bəzi dəyişənlərin seçilməsi ilə təhlil ediləcək məlumatların ölçüsünü azaltmaq mümkündür. [22]

Filogenetik məlumatlı məsafə adətən UniFrac və ya Soresen indeksi və ya Rao D kimi oxşar alətlərlə müxtəlif icmalar arasındakı fərqləri ölçmək üçün həyata keçirilir. Bütün bu üsullar üfüqi gen ötürülməsindən (HGT) mənfi təsirlənir, çünki səhvlər yarada bilər və uzaq növlərin korrelyasiyasına səbəb ola bilər. HGT-nin mənfi təsirini azaltmağın müxtəlif yolları var: ehtimal olunan HGT hadisələrinin ehtimalını qiymətləndirmək üçün çoxlu genlərin və ya hesablama vasitələrinin istifadəsi. [22]

Bakteriyaların redaktəsi

Mikrobların populyasiyaları (məsələn, bakteriya və mayalar) bədənin müxtəlif yerlərində dəri və selikli qişalarda məskunlaşır. Onların rolu normal, sağlam insan fiziologiyasının bir hissəsini təşkil edir, lakin əgər mikrobların sayı tipik diapazondan kənara çıxırsa (çox vaxt zəifləmiş immunitet sistemi səbəbindən) və ya mikroblar məskunlaşırsa (məsələn, pis gigiyena və ya zədə nəticəsində) bədənin normal olaraq kolonizasiya olunmayan və ya steril (qan, aşağı tənəffüs yolları və ya qarın boşluğu kimi) xəstəlik (müvafiq olaraq, bakteriemiya/sepsis, pnevmoniya və peritonit) ilə nəticələnə bilər. [ tibbi sitat lazımdır ]

İnsan Mikrobiomu Layihəsi müəyyən etdi ki, fərdlər minlərlə bakteriya növünə, fərqli bədən sahələrinə sahibdirlər. Dəri və vaginal yerlər ağız və bağırsaqdan daha kiçik müxtəliflik göstərdi, bunlar ən böyük zənginliyi göstərirdi. Bədəndə müəyyən bir sahə üçün bakterial makiyaj insandan insana dəyişir, yalnız növü ilə deyil, həm də bolluğu ilə. Ağız boyunca tapılan eyni növdən olan bakteriyalar, ağızda fərqli yerlərdə yaşamağa üstünlük verən bir çox alt tipə malikdir. Əvvəllər yaxşı başa düşüldüyü düşünülən insan bağırsağındakı enterotiplər belə, takson sərhədləri bulanıq olan geniş icmalardandır. [23] [24]

İnsan bağırsağında 500-1000 növ bakteriya yaşadığı təxmin edilir, lakin yalnız bir neçə filaya aiddir: Firmicutes və Bacteroidetes üstünlük təşkil edir, lakin Proteobakteriyalar, Verrucomicrobia, Actinobacteria, Fusobacteria və Cyanobacteria da var. [25]

kimi bakteriyaların bir sıra növləri Actinomyces viscosusA. naeslundii, ağızda yaşayırlar, burada lövhə adlanan yapışqan bir maddənin bir hissəsidirlər. Bu fırçalama ilə aradan qaldırılmırsa, o, daş daşına (həmçinin diş daşı adlanır) sərtləşir. Eyni bakteriyalar diş minasını əridən turşuları da ifraz edərək diş çürüməsinə səbəb olur.

Vaginal mikroflora əsasən müxtəlif laktobacillus növlərindən ibarətdir. Uzun müddətdir ki, bu növlərin ən çox yayılmış olduğu düşünülürdü Lactobacillus acidophilus, lakin sonradan məlum oldu ki L. iners əslində ən çox yayılmışdır, ondan sonra gəlir L. crispatus. Vajinada aşkar edilən digər laktobasillər də var L. jensenii, L. delbruekiiL. gasseri. Vaginal floranın pozulması bakterial vaginoz və ya kandidoz ("maya infeksiyası") kimi infeksiyalara səbəb ola bilər.

Archaea Redaktə

Arxeya insan bağırsağında mövcuddur, lakin bu orqandakı bakteriyaların böyük müxtəlifliyindən fərqli olaraq, arxeal növlərin sayı daha məhduddur. [26] Dominant qrup xüsusilə metanogenlərdir Methanobrevibacter SmithiiMethanosphaera stadtmanae. [27] Bununla belə, metanogenlərin kolonizasiyası dəyişkəndir və insanların yalnız 50%-də bu orqanizmlərin asanlıqla aşkar edilə bilən populyasiyaları var. [28]

2007-ci ilə kimi, arxeal patogenlərin heç bir aydın nümunəsi məlum deyildi [29] [30], baxmayaraq ki, bəzi metanogenlərin mövcudluğu ilə insan periodontal xəstəlikləri arasında əlaqə təklif edilmişdir. [31]

Göbələklərin redaktəsi

Göbələklər, xüsusən də mayalar insan bağırsaqlarında mövcuddur. [32] [33] [34] [35] Bunlardan ən yaxşı öyrənilənlərdir Candida immun çatışmazlığı olan və hətta sağlam sahiblərdə patogen olmaq qabiliyyətinə görə növlər. [33] [34] [35] Dəridə mayalar da mövcuddur, [32] kimi. Malassezia yağ bezlərindən ifraz olunan yağları istehlak etdikləri növlər. [36] [37]

Viruslar Edit

Viruslar, xüsusilə bakterial viruslar (bakteriofaqlar) bədənin müxtəlif yerlərini koloniyalaşdırırlar. Bu kolonizasiya sahələrinə dəri, [38] bağırsaq, [39] ağciyərlər, [40] və ağız boşluğu daxildir. [41] Virus icmaları bəzi xəstəliklərlə əlaqələndirilmişdir və sadəcə olaraq bakterial icmaları əks etdirmir. [42] [43] [44]

Dəri Redaktəsi

On sağlam insanın hər birində 20 dəri sahəsinin öyrənilməsi 19 bakteriya filasında 205 müəyyən edilmiş cins tapdı, əksər ardıcıllıqlar dörd filaya təyin edildi: Actinobakteriyalar (51,8%), Firmicutes (24,4%), Proteobakteriyalar (16,5%) və Bacteoides ( 6,3%). [45] Sağlam insan dərisində çoxlu sayda göbələk cinsləri mövcuddur, bədənin bölgələrinə görə bəzi dəyişkənliklər var, lakin patoloji şəraitdə müəyyən cinslər təsirlənmiş bölgədə üstünlük təşkil edir. [32] Məsələn, Malassezia atopik dermatitdə dominantdır və Akremonium kəpəkdən əziyyət çəkən baş dərilərində üstünlük təşkil edir. [32]

Dəri patogen mikrobların işğalını dayandırmaq üçün bir maneə rolunu oynayır. İnsan dərisi dərinin içində və ya üzərində yaşayan mikroblardan ibarətdir və yaşayış yeri və ya keçici ola bilər. Rezident mikroorqanizm növləri insan orqanizmində dəri tipinə görə dəyişir. Mikrobların əksəriyyəti dərinin səthi hüceyrələrində yaşayır və ya bezlərlə birləşməyə üstünlük verir. Yağ və ya tər vəziləri kimi bu bezlər mikrobları su, amin turşuları və yağ turşuları ilə təmin edir. Bundan əlavə, yağ bezləri ilə əlaqəli rezident bakteriyalar çox vaxt qram-müsbət olur və patogen ola bilər. [2]

Konyunktiva Edit

Normalda konyunktivada az sayda bakteriya və göbələk olur. [32] [46] Bakteriya siniflərinə qram-müsbət kokklar (məsələn, Stafilokok və Streptococcus) və qram-mənfi çubuqlar və kokklar (məsələn, hemofilNeisseria) mövcuddur. [46] Göbələk cinsləri daxildir Candida, Aspergillus, və Penicillium. [32] Göz yaşı vəziləri konyunktivanı nəm saxlayaraq davamlı olaraq ifraz edir, ara-sıra yanıb-sönmə konyunktivanı yağlayır və yad materialı yuyur. Göz yaşlarının tərkibində lizozim kimi bakterisidlər vardır ki, mikroorqanizmlər lizozimdən sağ qalmaqda və epiteliya səthlərində yerləşməkdə çətinlik çəkirlər.

Mədə-bağırsaq traktının redaktəsi

İnsanlarda mədə-bağırsaq mikrobiomunun tərkibi doğuş zamanı qurulur. [51] Qeysəriyyə əməliyyatı və ya vaginal yolla doğuş da bağırsağın mikrob tərkibinə təsir göstərir. Vaginal kanaldan doğulan körpələr anada aşkar olunanlara bənzər patogen olmayan, faydalı bağırsaq mikrobiotasına malikdir. [52] Bununla belə, C-bölməsi ilə doğulan körpələrin bağırsaq mikrobiotası Escherichia coli və Staphylococcus kimi daha çox patogen bakteriyaları ehtiva edir və qeyri-patogen, faydalı bağırsaq mikrobiotasının inkişafı daha uzun çəkir. [53]

Bəzi bağırsaq florası ilə insanlar arasındakı əlaqə sadəcə komensal deyil (zərərsiz birgəyaşayış), əksinə qarşılıqlı əlaqədir. [2] Bəzi insan bağırsağı mikroorqanizmləri pəhriz lifini sirkə turşusu və butirik turşu kimi qısa zəncirli yağ turşularına (SCFAs) fermentləşdirməklə ev sahibinə fayda verir, sonra onlar ev sahibi tərəfindən udulur. [4] [54] Bağırsaq bakteriyaları həmçinin B vitamini və K vitamininin sintezində, öd turşularının, sterolların və ksenobiotiklərin metabolizə edilməsində də rol oynayır. [2] [54] SCFA-ların və onların istehsal etdikləri digər birləşmələrin sistemli əhəmiyyəti hormonlara bənzəyir və bağırsaq florasının özü endokrin orqan kimi fəaliyyət göstərir [54] və bağırsaq florasının nizamsızlığı bir sıra iltihablı xəstəliklərlə əlaqələndirilir. və otoimmün şərtlər. [4] [55]

İnsan bağırsaq florasının tərkibi zamanla, pəhriz dəyişdikdə və ümumi sağlamlıq dəyişdikcə dəyişir. [4] [55] 2016-cı ilin iyul ayından etibarən 15 insanda aparılan randomizə nəzarətli sınaqların sistematik nəzərdən keçirilməsi müəyyən etdi ki, probiotik bakteriyaların kommersiya baxımından əldə edilən bəzi ştammları BifidobakteriyaLactobacillus nəsil (B. longum, B. breve, B. infantis, L. helveticus, L. rhamnosus, L. plantarum, və L. casei), 1-2 ay ərzində 10 9-10 10 koloniya əmələ gətirən vahid (CFU) gündəlik dozalarında ağızdan qəbul edildikdə, müəyyən mərkəzi sinir sisteminin pozğunluqlarında - narahatlıq, depressiya, autizm də daxil olmaqla, müalicə effektivliyinə malikdir (yəni davranış nəticələrini yaxşılaşdırır). spektr pozğunluğu və obsesif-kompulsif pozğunluq - və yaddaşın müəyyən aspektlərini yaxşılaşdırır. [56] Bununla belə, bağırsaq mikrobiotasının tərkibindəki dəyişikliklərin sağlamlığa zərərli təsirləri ilə də əlaqəli olduğu aşkar edilmişdir. Musso və digərləri tərəfindən nəşr olunan bir məqalədə, obez şəxslərin bağırsaq mikrobiotasında sağlam fərdlərə nisbətən daha çox Firmicutes və daha az Bacteroides olduğu aşkar edilmişdir. [57] Mikrob nisbətindəki bu dəyişikliyin qidadan enerji çıxarmaqda daha səmərəli bakteriyaların artmasına kömək edə biləcəyinə inanılır. Tədqiqatçılar şişman siçanların mikrobiotasını arıq siçanlarla müqayisə etmək üçün ov tüfənginin ardıcıllığından istifadə ediblər. Onlar aşkar ediblər ki, obez siçanların genomları təkcə insan orqanizmi tərəfindən həzm olunmayan polisaxaridləri parçalaya bilən fermentləri kodlayan çoxlu genlərdən ibarətdir. [58]

Bundan əlavə, Gordon və digərləri tərəfindən edilən bir araşdırma, piylənməyə səbəb olanın əksinə deyil, mikrobiotanın tərkibi olduğunu təsdiqlədi. Bu, pəhrizə bağlı piylənmə (DIO) siçanlarından və ya arıq nəzarət siçanlarından bağırsaq mikrobiotasının mikrobiomu olmayan arıq mikrobsuz siçanlara köçürülməsi ilə həyata keçirilib. Onlar müəyyən ediblər ki, DIO siçan bağırsaq mikrobiotası ilə nəql edilən siçanların eyni pəhrizlə qidalandığı zaman arıq siçan mikrobiotası ilə transplantasiya edilən siçanlara nisbətən ümumi bədən yağının əhəmiyyətli dərəcədə yüksək olduğunu müəyyən ediblər. [59]

Ridaura və digərləri tərəfindən tamamlanan ayrı bir araşdırma. 2013-cü ildə insan nəcisinin mikrobsuz siçanlara ilk nəqlini həyata keçirdi. Yığılan insan nəcisi, bədən yağ nisbəti nəzərəçarpacaq dərəcədə fərqli olan yetkin qadın əkizlərindən əmələ gəlmişdir. Tədqiqatçılar əsasən piylənmə fenotipini və arıq fenotipi siçanlara ötürə bildilər, hər ikisi də az yağlı siçan yemi ilə qidalanırdılar. Şişman əkizdən əldə edilən nəcisi olan siçanlar ümumi bədən və yağ kütləsini artırdı, daha arıq əkizdən əldə edilən nəcisi olan siçanlar isə piylənməyə bənzər əlamətlər və ya simptomlar inkişaf etdirmədi. [60]

Uretra və sidik kisəsi Edit

Genitouriya sistemində mikrobiota olduğu görünür, [61] [62] bu, insanlarda sidik yolları infeksiyası əlamətləri göstərdikdə sidikdə bakteriyaları aşkar etmək üçün standart klinik mikrobioloji mədəniyyət üsullarının uzun müddət istifadəsi fonunda gözlənilməz bir tapıntıdır. bu testlər üçün adi bir bakteriya yoxdur. [63] Göründüyü kimi, ümumi kultura üsulları adətən mövcud olan bir çox növ bakteriya və digər mikroorqanizmləri aşkar etmir. [63] 2017-ci ildən etibarən sidik yollarında problemi olan insanlarla sağlam olanlar arasında mikrobiotada fərqlərin olub-olmadığını müəyyən etmək üçün bu mikroorqanizmləri müəyyən etmək üçün ardıcıllıq metodlarından istifadə edilmişdir. [61] [62] Sidik kisəsinin mikrobiomunu sidik-cinsiyyət sistemindən fərqli olaraq düzgün qiymətləndirmək üçün sidik nümunəsi bilavasitə sidik kisəsindən götürülməlidir ki, bu da çox vaxt kateterlə aparılır. [64]

Vagina Edit

Vaginal mikrobiota vajinanı kolonizasiya edən növlərə və nəsillərə aiddir. Bu orqanizmlər infeksiyalardan qorunmaqda və vaginal sağlamlığın qorunmasında mühüm rol oynayır. [65] Premenopozal qadınlarda ən çox rast gəlinən vaginal mikroorqanizmlər cinsindəndir. Lactobacillus, hidrogen peroksid və laktik turşu istehsal edərək patogenləri boğur. [34] [65] [66] Bakterial növlərin tərkibi və nisbətləri menstruasiya dövrünün mərhələsindən asılı olaraq dəyişir. [67] [68] [ yeniləmə lazımdır ] Etnik mənsubiyyət də vaginal floraya təsir göstərir. Hidrogen peroksid istehsal edən laktobakteriyaların meydana gəlməsi Afrikalı Amerikalı qadınlarda daha azdır və vaginal pH daha yüksəkdir. [69] Cinsi əlaqə və antibiotiklər kimi digər təsiredici amillər laktobasillərin itirilməsi ilə əlaqələndirilmişdir. [66] Üstəlik, tədqiqatlar müəyyən etmişdir ki, prezervativlə cinsi əlaqə laktobasillərin səviyyəsini dəyişir və onun səviyyəsini artırır. Escherichia coli vaginal flora daxilində. [66] Normal, sağlam vaginal mikrobiotada dəyişikliklər kandidoz və ya bakterial vaginoz kimi [70] infeksiyaların göstəricisidir. [66] Candida albicans böyüməsini maneə törədir Lactobacillus növ, isə Lactobacillus hidrogen peroksid istehsal edən növlərin böyüməsini və virulentliyini maneə törədir Candida albicans həm vaginada, həm də bağırsaqda. [32] [34] [35]

Vajinada aşkar edilmiş göbələk cinsləri daxildir Candida, Pichia, Avrotium, Alternaria, Rodotorula, və Cladosporium, başqaları arasında. [32]

Plasenta Edit

Son vaxtlara qədər plasenta steril bir orqan hesab olunurdu, lakin plasenta toxumasında yaşayan kommensal, patogen olmayan bakterial növlər və cinslər müəyyən edilmişdir. [71] [72] [73]

Uterus Redaktəsi

Son vaxtlara qədər qadınların yuxarı reproduktiv sistemi steril mühit hesab olunurdu. Reproduktiv yaşda olan sağlam, asemptomatik qadınların uterusunda müxtəlif mikroorqanizmlər yaşayır. Uterusun mikrobiomu vajina və mədə-bağırsaq traktından əhəmiyyətli dərəcədə fərqlənir. [74]

Ağız boşluğu Redaktə

İnsan ağzında mövcud olan mühit orada tapılan xarakterik mikroorqanizmlərin böyüməsinə imkan verir. Su və qida mənbəyi, eləcə də orta temperatur təmin edir. [2] Ağızın rezident mikrobları, turşuya həssas mikrobların xlorid turşusu tərəfindən məhv edildiyi ağızdan mədəyə mexaniki yuyulmağa müqavimət göstərmək üçün dişlərə və diş ətlərinə yapışır. [2] [34]

Ağız boşluğunda anaerob bakteriyalara aşağıdakılar daxildir: Aktinomislər, Araxniya, Bakteroidlər, Bifidobakteriya, Eubacterium, Fusobacterium, Lactobacillus, Leptotrixiya, Peptokokk, Peptostreptokokk, Propionibakteriya, Selenomonas, Treponema, və Veillonella. [75] [ yeniləmə lazımdır ] Ağızda tez-tez rast gəlinən göbələklər daxildir Candida, Cladosporium, Aspergillus, Fusarium, Glomus, Alternaria, Penicillium, və Kriptokokk, başqaları arasında. [32]

Bakteriyalar biofilmdə həm sərt, həm də yumşaq ağız toxumalarında toplanır ki, bu da onların ətraf mühit amillərindən və antimikrob agentlərdən qorunaraq ağız mühitində yapışmasına və mübarizə aparmasına imkan verir. [76] Tüpürcək bakteriyaların formalaşması üçün yenidən kolonizasiyasına imkan verən əsas biofilm homeostatik rolunu oynayır və biofilm yığılmasını ayıraraq böyüməyə nəzarət edir. [77] O, həmçinin qida və temperatur tənzimləmə vasitəsini təmin edir. Biofilmin yeri onun qəbul etdiyi məruz qalmış qida maddələrinin növünü müəyyən edir. [78]

Ağız bakteriyaları ətraf mühiti hiss etmək və ev sahibini ondan yayındırmaq və ya dəyişdirmək üçün mexanizmlər inkişaf etdirmişdir. Bununla belə, yüksək effektiv anadangəlmə müdafiə sistemi bakterial kolonizasiyanı daim izləyir və yerli toxumaların bakterial işğalının qarşısını alır. Diş lövhəsi bakteriyaları ilə anadangəlmə müdafiə sistemi arasında dinamik tarazlıq mövcuddur. [79]

Ağız boşluğu və ağız mikrobları arasındakı bu dinamika orqanizmə daxil olmağı təmin etdiyi üçün sağlamlıq və xəstəlikdə əsas rol oynayır. [80] Sağlam tarazlıq simbiotik əlaqəni təqdim edir, burada ağız mikrobları patogenlərin böyüməsini və yapışmasını məhdudlaşdırır, ev sahibi isə onların çiçəklənməsi üçün mühit təmin edir. [80] [76] İmmunitet statusunun dəyişməsi, rezident mikrobların yerdəyişməsi və qida maddələrinin mövcudluğu kimi ekoloji dəyişikliklər qarşılıqlı əlaqədən parazitar əlaqəyə keçidlə nəticələnir ki, bu da ev sahibinin ağız və sistem xəstəliklərinə meylli olması ilə nəticələnir. [76] Diabet və ürək-damar xəstəlikləri kimi sistemli xəstəliklər ağız sağlamlığının pis olması ilə əlaqələndirilmişdir. [80] Ağız mikroorqanizmlərinin iki əsas diş xəstəliyində rolu xüsusi maraq doğurur: diş kariyesi və periodontal xəstəlik. [79] Periodontda patogen kolonizasiya həddindən artıq immun reaksiyaya səbəb olur və nəticədə periodontal cib - diş və diş əti arasında dərinləşmiş boşluq yaranır. [76] Bu, anaerob patogenlər üçün qida maddələri ilə qorunan qanla zəngin rezervuar rolunu oynayır. [76] Bədənin müxtəlif yerlərində sistemli xəstəlik ağızdan mikrobların periodontal cibləri və ağız membranlarını keçərək qana daxil olması nəticəsində yarana bilər. [80]

Daimi düzgün ağız gigiyenası ağız və sistem xəstəliklərinin qarşısının alınması üçün əsas üsuldur. [80] O, biofilmin sıxlığını və xəstəliyə səbəb olan potensial patogen bakteriyaların çoxalmasını azaldır. [78] Bununla belə, düzgün ağız gigiyenası kifayət olmaya bilər, çünki ağız mikrobiomu, genetika və immun cavab dəyişiklikləri xroniki infeksiyaların inkişafında faktor rolunu oynayır. [78] Antibiotiklərin istifadəsi artıq yayılan infeksiyanı müalicə edə bilər, lakin biofilmlərdəki bakteriyalara qarşı təsirsizdir. [78]

Ağciyər Redaktəsi

Ağız boşluğunda olduğu kimi, yuxarı və aşağı tənəffüs sistemləri də mikrobları çıxarmaq üçün mexaniki maneələrə malikdir. Goblet hüceyrələri mikrobları tutan və davamlı hərəkət edən kirpikli epitel hüceyrələri vasitəsilə onları tənəffüs sistemindən çıxaran selikli qişa istehsal edir. [2] Bundan əlavə, tərkibində lizozim fermenti olan burun mucusunda bakterisid təsir yaranır. [2] Üst və aşağı tənəffüs yollarının öz mikrobiota dəsti var. [81] Ağciyər bakteriyasının mikrobiotası 9 əsas bakteriya cinsinə aiddir: Prevotella, Sfinqomonalar, Pseudomonas, Acinetobacter, Fusobacterium, Meqasfera, Veillonella, Stafilokok, və Streptokokk. Tənəffüs yollarında "normal biota" hesab edilən bəzi bakteriyalar, xüsusən də immuniteti zəif olan insanlarda ciddi xəstəliklərə səbəb ola bilər. Streptococcus pyogenes, Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, və Staphylococcus aureus. [ sitat lazımdır ] Ağciyər mikobiomunu təşkil edən göbələk cinslərinə daxildir Candida, Malassezia, Neosartoriya, Sakkaromislər, və Aspergillus, başqaları arasında. [32]

Kistik fibrozlu insanlarda tənəffüs yollarında bakterial və göbələk cinslərinin qeyri-adi yayılması müşahidə olunur. [32] [82] Onların bakterial florasında tez-tez antibiotiklərə davamlı və yavaş böyüyən bakteriyalar var və bu patogenlərin tezliyi yaşa bağlı olaraq dəyişir. [82]

Öd yollarının redaktəsi

Ənənəvi olaraq öd yolları normal olaraq steril sayılır və öddə mikroorqanizmlərin olması patoloji prosesin göstəricisidir. Bu fərziyyə normal öd axarından bakteriya ştammlarının ayrıla bilməməsi ilə təsdiqləndi. Normal öd mikrobiotasının öd yollarını ekzogen mikroorqanizmlər tərəfindən kolonizasiyadan qoruyan ayrıca funksional təbəqə olduğunu göstərən sənədlər 2013-cü ildə ortaya çıxmağa başladı. [83]

İnsan bədəni əsas qida maddələrinin mənbəyi kimi saysız-hesabsız bakteriya genlərinə güvənir. [84] Həm metagenomik, həm də epidemioloji tədqiqatlar insan mikrobiomunun 2-ci tip diabet və piylənmədən tutmuş iltihablı bağırsaq xəstəliyinə, Parkinson xəstəliyinə və hətta depressiya kimi psixi sağlamlıq vəziyyətlərinə qədər geniş spektrli xəstəliklərin qarşısının alınmasında mühüm rol oynadığını göstərir. [85] Bağırsaq mikrobiotası ilə müxtəlif bakteriyalar arasında simbiotik əlaqə fərdin immun reaksiyasına təsir göstərə bilər. [86] Körpəlik dövründə olsa da, mikrobioma əsaslı müalicə də vəd verir, xüsusən də dərmana davamlı müalicə üçün C. difficile infeksiya [87] və diabet müalicəsində. [88]

Clostridioides difficile infeksiya Redaktə edin

Bakteriyaların həddindən artıq olması, C. difficile, mədə-bağırsaq traktının infeksiyasına gətirib çıxarır, adətən antibiotiklərin qəbulu nəticəsində yarandığı güman edilən mikrobiota ilə dysbiosis ilə əlaqələndirilir. Antibiotiklərin istifadəsi mədə-bağırsaq traktında faydalı bağırsaq florasını məhv edir, bu da normal olaraq patogen bakteriyaların üstünlük təşkil etməsinə mane olur. [89] Ənənəvi müalicə üçün C. difficile infeksiyalara antibiotiklərin əlavə rejimi daxildir, lakin effektivlik nisbətləri orta hesabla 20-30% arasındadır. [90] Sağlam bağırsaq bakteriyalarının əhəmiyyətini dərk edən tədqiqatçılar nəcis mikrobiotasının transplantasiyası kimi tanınan prosedura müraciət etdilər, burada xəstələrin mədə-bağırsaq xəstəlikləri, məsələn C. difficile infeksiya, normal fəaliyyət göstərən bağırsaq mikrobiotasını bərpa etmək ümidi ilə sağlam bir şəxsdən nəcis tərkibini qəbul edin. [91] Nəcis mikrobiotasının transplantasiyası, antibiotiklərin işləmədiyi və ya antibiotiklərdən sonra xəstəliyin təkrarlandığı CDI olan insanlarda təxminən 85-90% effektivdir. [92] [93] CDI olan insanların əksəriyyəti bir FMT müalicəsi ilə sağalır. [94] [95] [96]

Xərçəng Edit

Xərçəng ümumiyyətlə ev sahibi genetika və ətraf mühit faktorları ilə əlaqəli bir xəstəlik olsa da, insan xərçənglərinin təxminən 20% -ində mikroorqanizmlər iştirak edir. [97] Xüsusilə kolon xərçəngində potensial faktorlar üçün bakterial sıxlıq nazik bağırsaqdakından bir milyon dəfə yüksəkdir və nazik bağırsaqla müqayisədə təxminən 12 qat daha çox xərçəng meydana gəlir ki, bu da kolonda mikrobiotanın patogen rolunu müəyyən edir. və rektal xərçənglər. [98] Mikrob sıxlığı kolorektal xərçənglərin qiymətləndirilməsində proqnostik vasitə kimi istifadə edilə bilər. [98]

Mikrobiota kanserogenezə üç geniş şəkildə təsir edə bilər: (i) şiş hüceyrələrinin çoxalması və ölümü tarazlığını dəyişdirmək, (ii) immun sisteminin funksiyasını tənzimləmək və (iii) ev sahibi tərəfindən istehsal olunan amillərin, qidaların və əczaçılıq vasitələrinin metabolizminə təsir göstərmək. [97] Dəri, ağız-udlaq və tənəffüs, həzm və sidik-cinsiyyət yolları kimi sərhəd səthlərində əmələ gələn şişlər mikrobiota saxlayır. Şiş yerində əhəmiyyətli mikrobların olması assosiasiya və ya səbəb əlaqəsi yaratmır. Bunun əvəzinə, mikroblar şiş oksigen gərginliyini və ya qida profilini dəstəkləyən tapa bilər. Xüsusi mikrobların populyasiyasının azalması və ya səbəb olan oksidləşdirici stress də riskləri artıra bilər. [97] [98] Yer üzündəki təxminən 10 30 mikrobdan 10-u Beynəlxalq Xərçəng Araşdırmaları Agentliyi tərəfindən insan kanserogenləri olaraq təyin edilmişdir. [97] Mikroblar zülallar və ya digər faktorlar ifraz edə bilər və ya ev sahibinin hüceyrə proliferasiyasına birbaşa təkan verə bilər və ya kanserogenezə töhfə verən yollarla kəskin və ya xroniki iltihabı idarə etmək də daxil olmaqla, ev sahibi immun sistemini yuxarı və ya aşağı tənzimləyə bilər. [97]

İmmunitet funksiyası və iltihabın inkişafı arasındakı əlaqəyə gəldikdə, selikli qişanın səthi maneələri ekoloji risklərə məruz qalır və homeostazı qorumaq üçün sürətlə təmir edilməlidir. Təhlükəli ev sahibi və ya mikrobiota müqaviməti də bədxassəliliyə qarşı müqaviməti azaldır, ehtimal ki, iltihab və xərçəngə səbəb olur. Baryerlər pozulduqda, mikroblar müxtəlif yollarla proinflamatuar və ya immunosupressiv proqramlar yarada bilər. [97] Məsələn, xərçənglə əlaqəli mikroblar şiş mikromühitində NF-κΒ siqnalını aktivləşdirir. Digər nümunə tanıma reseptorları, məsələn, nukleotid bağlayan oliqomerləşmə domeninə bənzər reseptor (NLR) ailə üzvləri NOD-2, NLRP3, NLRP6NLRP12, kolorektal xərçəngin vasitəçiliyində rol oynaya bilər. [97] Eynilə Helicobacter pylori mədədə xroniki iltihablı reaksiyaya səbəb olduğu üçün mədə xərçəngi riskini artırır. [97] [98]

İltihabi bağırsaq xəstəliyi Redaktə edin

İltihabi bağırsaq xəstəliyi iki fərqli xəstəlikdən ibarətdir: xoralı kolit və Crohn xəstəliyi və bu xəstəliklərin hər ikisi bağırsaq mikrobiotasında (disbioz kimi də tanınır) pozulmalarla özünü göstərir.Bu dysbiosis bağırsaqda mikrob müxtəlifliyinin azalması şəklində özünü göstərir [99] [100] və fərdlərdə anadangəlmə immun reaksiyasını dəyişdirən ev sahibi genlərindəki qüsurlarla əlaqələndirilir. [99]

İnsan immunçatışmazlığı virusu Redaktə edin

HİV xəstəliyinin inkişafı bağırsaq mikrobiotasının tərkibinə və funksiyasına təsir edir, İİV-mənfi, HİV-müsbət və ART sonrası İİV-müsbət populyasiyalar arasında nəzərəçarpacaq fərqlər var. [ sitat lazımdır ] HİV sıx birləşmələrə təsir edərək bağırsaq epitelial maneə funksiyasının bütövlüyünü azaldır. Bu parçalanma, HİV-ə yoluxmuş insanlarda görülən iltihabın artmasına kömək etdiyi düşünülən bağırsaq epiteli boyunca translokasiyaya imkan verir. [101]

Vaginal mikrobiota HİV-in yoluxmasında rol oynayır, qadında vaginal bakteriyaların anormal balansı ilə xarakterizə olunan bir vəziyyət olan bakterial vaginoz zamanı infeksiya və ötürülmə riski artır. [102] Artan yoluxuculuq vajinada iltihaba qarşı sitokinlərin və CCR5 + CD4+ hüceyrələrinin artması ilə müşahidə olunur. Bununla birlikdə, vaginal səviyyələrin artması ilə yoluxuculuğun azalması müşahidə olunur laktobacillus, antiinflamatuar vəziyyəti təşviq edən. [101]

Ölüm Redaktəsi

Ölümlə birlikdə canlı orqanizmin mikrobiomu çökür və mikroorqanizmlərin fərqli tərkibi adlanır nekrobiom mürəkkəb fiziki parçalanma prosesinin mühüm fəal tərkib hissəsi kimi özünü təsdiqləyir. Onun zamanla proqnozlaşdırıla bilən dəyişikliklərinin ölüm vaxtını təyin etmək üçün faydalı olduğu düşünülür. [103] [104]

2009-cu ildə aparılan tədqiqatlar insan müdaxiləsi nəticəsində biotanın (mikrofauna da daxil olmaqla) azalmasının insan sağlamlığına, xəstəxana təhlükəsizliyi prosedurlarına, qida məhsullarının dizaynına və xəstəliklərin müalicəsinə mane olub-olmadığını soruşdu. [105]

İlkin araşdırmalar göstərir ki, insan bir ölkədən digərinə miqrasiya etdikdə, məsələn, Taylandlı mühacirlər ABŞ-da məskunlaşdıqda [106] və ya Latın Amerikalılar ABŞ-a köçdükdə, mikrobiotada dərhal dəyişikliklər baş verə bilər. [107] Mikrobiota müxtəlifliyinin itkiləri obez fərdlərdə və immiqrantların uşaqlarında daha çox olmuşdur. [106] [107]


Kursun xülasəsi

  • Təklif olunan AKTS krediti: 1.5 AKTS (bunu öz universitetinizlə müzakirə etmək lazımdır)
  • Səviyyə: PhD kursu və ya postdocs
  • Dil: İngilis dili

Mikrobiota çoxhüceyrəli orqanizmlərlə əlaqəli müxtəlif mikrob icmalarıdır. Kurs mühazirələrinin əksəriyyəti ev sahibi kimi insanlara yönəldilir. Kənd təsərrüfatı heyvanları və bitkiləri ilə əlaqəli mikrobiota haqqında iki mühazirə təqdim olunur.

Əlaqədar mikrob genləri ev sahibi orqanizmin genlərindən xeyli çoxdur. Mikrobların bu icmaları və onların genomları, mikrobiom, ev sahibinin fizioloji proseslərinə təsir göstərir. Mikrobiotanın ev sahibi ilə necə qarşılıqlı əlaqədə olduğunu başa düşmək ev sahibinin biologiyasını və ev sahibinin yoluxucu və xroniki xəstəliklərə həssaslığını və dərmanlara reaksiyalarını anlamaq üçün vacibdir. Normal ev sahibi mikrobiomların dəyişməsi immun disfunksiya və bağırsaq iltihabi xəstəlikləri, xərçəng, piylənmə, diabet və nevroloji, ürək-damar və tənəffüs xəstəlikləri ilə əlaqəli metabolik şərtlər kimi xroniki xəstəliklərlə əlaqələndirilir.

Bu kurs sağlamlığa diqqət yetirməklə ev sahibi mikrobiomlar sahəsini təqdim edir və mikrobiom tədqiqatları və məlumatların təhlili üsullarını müzakirə edir. Kurs insan bağırsağı, sidik-cinsiyyət sistemi, ağız və dəri ilə əlaqəli mikrobiota, eləcə də immunitet sistemi ilə qarşılıqlı əlaqə haqqında ümumi məlumat verir. Ev sahibinin immun disfunksiyasında və xroniki xəstəliklərdə mikrobiom pozğunluqlarının rolu və mikrobioma əsaslı terapiya imkanları müzakirə olunur.

Kursu bitirdikdən sonra tələbə öyrənməlidir:

  • mikrobiomları öyrənmək və məlumatların təhlili üçün hansı üsullardan istifadə olunur
  • bağırsaq, genitouriya sistemi, ağız və dəri ilə əlaqəli mikrobiota
  • mikrobiotanın immun sistemi ilə qarşılıqlı əlaqəsi
  • pəhriz və yaşın mikrobiotaya təsiri
  • mikrobiotanın insan sağlamlığında və xəstəliklərində əhəmiyyəti
  • əkinçilik heyvanlarında və bitkilərdə mikrobiotanın əhəmiyyəti
  • mikrobiotanın dərmanlarla qarşılıqlı təsiri
  • Mikrobiotanın modifikasiyasında müasir tendensiyalar

Onlayn mühazirələrdən əlavə, iştirakçılar həmçinin:


Bakterial Vaginozlu və Bakterial Vaginozsuz 15 Əlcəzairli Hamilə Qadında Mədəniyyətdən Müstəqil Metoddan istifadə etməklə Vaginal Süd Turşusu Bakterial Mikrobiotasının Müxtəlifliyi

Giriş: Bakterial vaginoz (BV) reproduktiv yaşda olan (hamilə və hamilə olmayan) qadınlar arasında ən çox rast gəlinən aşağı genital traktın pozulmasıdır. Lactobacillus Bakterial vaginozun qarşısını almağa kömək edəcək normal floranın saxlanmasını təşviq etmək üçün daha yaxşı probiotik məhsulların səmərəli şəkildə dizayn edilməsi üçün sağlam və yoluxmuş vaginal mikrobiotada növ zənginliyi lazımdır.

Məqsəd: BV olan və olmayan hamilə qadınlarda laktik turşu bakteriya növlərinin müxtəlifliyini qiymətləndirmək və müqayisə etmək.

Materiallar və metodlar: 2014-cü ilin noyabrından 2015-ci ilin martına qədər Əlcəzairin Annaba şəhərində yerləşən Badji Mokhtar Universitetində pilot tədqiqat aparılmışdır. Əlcəzairin şərqində yaşayan 19-35 yaş arası (ortalama 27,6 yaş n=15) 15 hamilə qadından vaginal çubuqlar Ginekologiya xidmətinə, Abdallah Nouaouria- El Bouni, Annaba xəstəxanasına baş çəkdi. Vaginal nümunələr qramla boyandı və Nugent üsulu ilə qiymətləndirildi. Kohorta sağlam "normal" vaginal florası olan qadınlar, bakterial vaginozlu yoluxmuş flora və "aralıq" florası olan qadınlar daxildir. Hamilə qadınların vaginal LAB icması 16S rRNA gen ardıcıllığı ilə Denaturing Gradient Gel Elektroforezinə (DGGE) əsaslanan mədəniyyətdən asılı olmayan üsulla müəyyən edilmişdir.

Nəticələr: LAB-ın əksəriyyəti bu cinsə bağlıdır Lactobacillus "normal" və "aralıq" florada (müvafiq olaraq 87,5% və 43,75%) tapıldı, LAB-ın əksəriyyəti isə cinsinə aid idi. Enterokok bakterial vaginozlu və ara florası olan qadınlarda (müvafiq olaraq 60% və 46,75%) müəyyən edilmişdir. Nəticələrimiz varlığını göstərdi Lactobacillus inersLactobacillus delbruekii vaginal mikrobiotanın sabitliyini təşviq edir.

Nəticə: Bu nəticə, daha əvvəl edilən araşdırmaların tapıntılarını təsdiqləyir ki, meydana gəlməsinin üstünlük təşkil edir Lactobacillus bakterial vaginoz halları və onların probiyotiklər kimi cari istifadəsi ilə mənfi əlaqə yaradır. Lactobacillus inersLactobacillus delbruekii vajinanın müdafiəsi üçün kritik olaraq təyin edilə bilər. Əlavə olaraq, Enterococcus feacalis vaginal ekosistemin balanssızlığının göstəricisi kimi qəbul edilə bilər.

Açar sözlər: DGGE Enterococcus Laktik turşu bakteriyaları Lactobacillus Vaginal infeksiyalar.


Urogenital infeksiyaların ümumi əlamətləri və simptomları

Sidik yollarının infeksiyaları ən çox sidik kisəsinin iltihabına səbəb olur (sistit) və ya uretradan (uretrit). Uretrit sistit ilə əlaqəli ola bilər, lakin cinsi yolla ötürülən infeksiyalar da səbəb ola bilər. Kişilərdə uretritin simptomlarına sidik edərkən yanma hissi, penisdən axıntı, sperma və ya sidikdə qan daxildir. Qadınlarda uretrit ağrılı və tez-tez sidiyə getmə, vaginal axıntı, qızdırma, titrəmə və qarın ağrısı ilə müşayiət olunur. Sistitin simptomları uretrit simptomlarına bənzəyir. Uretrit cinsi yolla ötürülən bir patogendən qaynaqlandıqda, cinsiyyət orqanlarını əhatə edən əlavə simptomlar baş verə bilər. Bunlara ağrılı veziküllər (blisterlər), ziyillər və xoralar daxil ola bilər. Ureterit, sidik axarının nadir bir infeksiyası, sistit ilə də baş verə bilər. Bu infeksiyalar kəskin və ya xroniki ola bilər.

Piyelonefritqlomerulonefrit potensial ciddi olan böyrək infeksiyalarıdır. Pielonefrit bir və ya hər iki böyrəyin infeksiyasıdır və aşağı sidik yollarının infeksiyasından inkişaf edə bilər, sidik axarları da daxil olmaqla, tez-tez yuxarı sidik yolları təsirlənir. Pielonefritin əlamətləri və simptomları arasında qızdırma, titrəmə, ürəkbulanma, qusma, bel ağrısı və tez-tez ağrılı sidiyə getmə daxildir. Piyelonefrit adətən yalnız böyrəklərində qüsurları olan və ya zədələnmiş şəxslərdə xroniki olur.

Qlomerulonefrit nefronların glomerulinin iltihabıdır. Simptomlara sidikdə həddindən artıq protein və qan, artan qan təzyiqi və üzün, əllərin və ayaqların ödeminə səbəb olan mayenin tutulması daxildir. Qlomerulonefrit kəskin infeksiya ola bilər və ya xroniki ola bilər.

Kişilərin reproduktiv strukturlarında baş verən infeksiyalara epididimit, orxit və prostatit daxildir. Bakterial infeksiyalar epididimin iltihabına səbəb ola bilər epididimit. Bu iltihab xayada ağrılara səbəb olur, xaya və qasıqda şişkinlik, qızartı və bu bölgələrdə dərinin istiləşməsi də müşahidə edilə bilər. Xayanın iltihabı, adlanır orxit, adətən epididimdən yayılan bakterial infeksiyadan qaynaqlanır, lakin bu, viral xəstəlik olan parotit xəstəliyinin ağırlaşması da ola bilər. Semptomlar epididimitin simptomlarına bənzəyir və hər ikisinin birlikdə baş verməsi qeyri-adi deyil, bu vəziyyətdə vəziyyət epididimo-orxit adlanır. Prostat vəzinin iltihabı, adlanır prostatit, bakterial infeksiya nəticəsində yarana bilər. Prostatitin əlamətlərinə qızdırma, titrəmə, sidik kisəsində, xayalarda və penisdə ağrı daxildir. Xəstələr həmçinin sidik ifrazı zamanı yanma, sidik kisəsini boşaltmada çətinlik və ağrılı boşalma hiss edə bilərlər.

Xarici tərəfə yaxın olduğu üçün vajina qadınlarda infeksiyalar üçün ümumi bir yerdir. Vajinanın hər hansı iltihabı üçün ümumi termindir vaginit. Vaginit tez-tez vaginal mikrobiotada məskunlaşan bakteriya və ya göbələklərin həddindən artıq çoxalması nəticəsində inkişaf edir, baxmayaraq ki, bu da keçici patogenlərin infeksiyası nəticəsində də ola bilər. Vajinanın bakterial infeksiyalarına bakterial deyilir vaginoz, halbuki göbələk infeksiyaları (adətən daxildir Candida spp.) adlanır maya infeksiyasıs. Normal mikrobiotaya, turşu istehsalına və pH dəyişikliklərinə təsir edən dinamik dəyişikliklər mikrobların həddindən artıq çoxalmasının başlamasına və vaginitin inkişafına səbəb ola bilər. Bəzi insanlarda heç bir əlamət olmasa da, vaginoz və vaginit axıntı, qoxu, qaşınma və yanma ilə əlaqələndirilə bilər.

Pelvik iltihabi xəstəlik (PID) uşaqlıq, uşaqlıq boynu, fallopiya boruları və yumurtalıqlar daxil olmaqla qadın reproduktiv orqanlarının infeksiyasıdır. Ən çox yayılmış iki patogen cinsi yolla keçən bakterial patogenlərdir Neisseria gonorrhoeaeChlamydia trachomatis. Fallopiya borularının iltihabı, adlanır salpinqit, PID-nin ən ciddi formasıdır. PID simptomları qadınlar arasında dəyişə bilər və qarın altındakı ağrı, vaginal axıntı, qızdırma, titreme, ürəkbulanma, ishal, qusma və ağrılı sidik ifrazını əhatə edir.

  • Sidik sisteminə təsir edən infeksiyalar hansı şərtlərlə nəticələnə bilər?
  • Qadınlarda vaginitin ümumi səbəbləri hansılardır?

İçindəkilər

kimi tanınsa da flora və ya mikroflora, bu kök sözündən bəri texniki baxımdan yanlış addır flora bitkilərə aiddir və biota müəyyən bir ekosistemdəki orqanizmlərin ümumi kolleksiyasına aiddir. Son zamanlarda daha uyğun bir termin mikrobiota tətbiq edilir, baxmayaraq ki, onun istifadəsi köklü istifadə və tanınmasını kölgədə qoymayıb flora bakteriya və digər mikroorqanizmlərə münasibətdə. Hər iki termin müxtəlif ədəbiyyatda istifadə olunur. [4]

2014-cü ildən bəri məşhur mediada və elmi ədəbiyyatda insan orqanizmində insan hüceyrələrindən təxminən 10 dəfə çox mikrob hüceyrəsi olduğu tez-tez bildirilirdi. hüceyrələr və yetkin bir insanda adətən təxminən 10 trilyon insan hüceyrəsi var. [8] 2014-cü ildə Amerika Mikrobiologiya Akademiyası mikrob hüceyrələrinin sayının və insan hüceyrələrinin sayının həm təxminlər olduğunu vurğulayan tez-tez verilən sualları dərc etdi və həm də son araşdırmaların insan hüceyrələrinin sayına dair yeni bir təxminlərə çatdığını qeyd etdi - təqribən 37,2 trilyon, yəni 100 trilyon bakterial hüceyrənin ilkin təxminləri düzgündürsə, mikrob-insan hüceyrələrinin nisbəti 3:1-ə yaxındır. [8] [9] 2016-cı ildə başqa bir qrup nisbətin təqribən 1:1 (1.3:1) olması ilə bağlı yeni bir qiymətləndirmə dərc etdi, "qeyri-müəyyənlik 25% və standart 70 kq-lıq kişilərin əhalisinə görə 53% variasiya ilə) "). [10] [3]

Daha yeni bir hesablama, hər bir insan hüceyrəsi üçün 1,3 bakteriya hüceyrəsinin nisbətidir, halbuki fagların və virusların sayı bakteriya hüceyrələrini ən azı bir miqdar daha çox sayar. Bakteriya genlərinin sayı (hər növdə 2000 gen olan bağırsaqda 1000 bakteriya növünü fərz etsək) təxminən 20.000 insan geninin sayından 100 dəfə çox olan 2.000.000 gen olduğu təxmin edilir. [11]

İnsan mikrobiomunun aydınlaşdırılması problemi əsasən bakteriya, eukariotlar və virusları əhatə edən mikrob icmasının üzvlərini müəyyən etməkdir. [12] Bu, ilk növbədə DNT əsaslı tədqiqatlardan istifadə etməklə həyata keçirilir, baxmayaraq ki, RNT, protein və metabolit əsaslı tədqiqatlar da aparılır. [12] [13] DNT əsaslı mikrobiom tədqiqatları adətən ya hədəflənmiş amplikon tədqiqatları və ya daha yaxınlarda ov tüfəngi ilə metagenomik tədqiqatlar kimi təsnif edilə bilər. Birincisi xüsusi məlum marker genlərinə diqqət yetirir və ilk növbədə taksonomik cəhətdən informativdir, ikincisi isə cəmiyyətin funksional potensialını öyrənmək üçün də istifadə oluna bilən bütöv bir metagenomik yanaşmadır. [12] İnsan mikrobiomu tədqiqatlarında mövcud olan, lakin digər metagenomik tədqiqatlarda olmayan problemlərdən biri tədqiqata ev sahibi DNT-ni daxil etməkdən çəkinməkdir. [14]

İnsan mikrobiomunun tərkibini sadə şəkildə izah etməkdən başqa, insan mikrobiomunu əhatə edən əsas suallardan biri də "nüvənin" olub-olmamasıdır, yəni cəmiyyətin əksər insanlar arasında paylaşılan alt qrupunun olub-olmamasıdır. [15] [16] Əgər bir nüvə varsa, o zaman müəyyən icma kompozisiyalarını xəstəlik halları ilə əlaqələndirmək mümkün olardı ki, bu da İnsan Mikrobiomu Layihəsinin məqsədlərindən biridir. Məlumdur ki, insan mikrobiomu (məsələn, bağırsaq mikrobiotası) həm tək subyekt daxilində, həm də müxtəlif fərdlər arasında çox dəyişkəndir, bu fenomen siçanlarda da müşahidə olunur. [4]

13 iyun 2012-ci ildə NIH direktoru Frensis Kollinz İnsan Mikrobiomu Layihəsinin (HMP) mühüm mərhələ olduğunu elan etdi. [7] Elan eyni gündə Nature [17] [18] və Elm Kitabxanasında (PLoS) bir neçə jurnalda dərc edilmiş bir sıra əlaqələndirilmiş məqalələrlə müşayiət olundu. HMP-nin tədqiqatçıları genom sıralama üsullarından istifadə edərək sağlam insanların normal mikrob tərkibinin xəritəsini çəkərək, insanlarda normal mikrob variasiyasının sərhədlərini və istinad məlumat bazası yaratdılar. 242 sağlam ABŞ könüllüsündən ağız, burun, dəri, aşağı bağırsaq (nəcis) və vajina kimi 15 (kişi) ilə 18 (qadın) bədən yerindən toxumalardan 5000-dən çox nümunə toplanıb. Bütün DNT, insan və mikrob, DNT sıralama maşınları ilə təhlil edildi. Mikrob genomu məlumatları bakteriya spesifik ribosomal RNT, 16S rRNT-ni müəyyən etməklə çıxarılmışdır. Tədqiqatçılar hesabladılar ki, 10.000-dən çox mikrob növü insan ekosistemini tutur və onlar cinsin 81-99%-ni müəyyən ediblər.

Ov tüfənginin ardıcıllığı Redaktə edin

Bakteriyaların, arxeyaların və virusların laboratoriya icmalarında yetişdirmək çox vaxt çətindir, buna görə də ardıcıllıq texnologiyaları metagenomikada da istifadə edilə bilər. Həqiqətən də, xüsusi mikrob suşlarının funksiyaları və səciyyələndirilməsi haqqında tam bilik terapevtik kəşf və insan sağlamlığı üçün böyük potensial təklif edir. [19]

Nümunələrin toplanması və DNT çıxarılması Edit

Əsas məqam, ardıcıllığı yerinə yetirmək üçün kifayət qədər miqdarda mikrobial biokütlə toplamaq və bu səbəbdən nümunənin çirklənməsini minimuma endirmək üçün zənginləşdirmə üsullarından istifadə edilə bilər. Xüsusən də DNT çıxarma üsulu hər bakteriya ştammı üçün yaxşı olmalıdır, lizisi asan olanların genomlarına malik olmamalıdır. Kimyəvi lizizdən daha çox mexaniki lizisə üstünlük verilir və muncuqların döyülməsi kitabxananı hazırlayarkən DNT itkisi ilə nəticələnə bilər. [19]

Kitabxananın hazırlanması və ardıcıllığının düzəldilməsi

Ən çox istifadə edilən platformalar Illumina, Ion Torrent, Oxford Nanopore MinION və Pacific Bioscience Sequel-dir, baxmayaraq ki, Illumina platforması geniş əlçatanlığı, yüksək məhsuldarlığı və dəqiqliyi səbəbindən ən cəlbedici seçim hesab olunur. İstifadə ediləcək nümunənin düzgün miqdarı ilə bağlı heç bir əlamət yoxdur. [19]

Metagenom montajı Redaktə edin

De novo yanaşmadan istifadə edilir, lakin aradan qaldırılmalı olan bəzi çətinliklər var. Əhatə onun spesifik icmasındakı hər bir genom bolluğundan asılıdır, əgər ardıcıllıq dərinliyi boşluqların əmələ gəlməsinin qarşısını almaq üçün kifayət qədər deyilsə, az bol genomlar parçalanmaya məruz qala bilər. Xoşbəxtlikdən, kömək etmək üçün metagenom-spesifik montajçılar var, çünki yüzlərlə suş varsa, ardıcıllıq dərinliyini maksimuma çatdırmaq lazımdır. [19]

Contig binning Redaktə edin

Nə hər bir kontigin hansı genomdan əldə edildiyi, nə də nümunədə mövcud olan genomların sayı məlum deyil. a priori bu addımın məqsədi kontigləri növlərə bölməkdir. Bu cür təhlili yerinə yetirmək üçün üsullar nəzarət altında (məlum ardıcıllıqla verilənlər bazası) və ya nəzarətsiz (toplanmış məlumatlarda sıx qrupların birbaşa axtarışı) ola bilər. Bununla belə, hər iki üsul müəyyən kontig və onun qoyulmalı olduğu qrup arasında oxşarlıq xalını müəyyən etmək üçün bir növ metrikanı və oxşarlıqları qruplardakı bölgülərə çevirmək üçün alqoritmləri tələb edir. [19]

Təhlil işlənməsindən sonra Edit

Statistik təhlil əldə edilmiş nəticələri təsdiqləmək üçün vacibdir (ANOVA qruplar arasındakı fərqləri ölçmək üçün istifadə edilə bilər), əgər o, qrafik alətlərlə birləşdirilərsə, nəticə asanlıqla vizuallaşdırılır və başa düşülür. [19]

Metagenom yığıldıqdan sonra mikrobiomun funksional potensialı haqqında nəticə çıxarmaq mümkündür. Bu tip analiz üçün hesablama çətinlikləri tək genomlara nisbətən daha böyükdür, çünki adətən metagenomların montajçıları keyfiyyətsiz olur və bir çox bərpa edilmiş genlər tam deyil və ya parçalanmışdır. Gen identifikasiyası addımından sonra verilənlər, ortoloqlar verilənlər bazasına qarşı hədəf genlərin çoxsaylı uyğunlaşdırılması vasitəsilə funksional annotasiya aparmaq üçün istifadə edilə bilər. [20]

Marker gen analizi Redaktə edin

Bu, müəyyən bir genetik bölgəni hədəf almaq üçün primerlərdən istifadə edən və mikrobların filogeniyalarını təyin etməyə imkan verən bir texnikadır. Genetik bölgə yüksək dəyişkən bir bölgə ilə xarakterizə olunur ki, bu da ətraflı identifikasiyanı təmin edə bilər, o, PCR-də istifadə olunan primerlər üçün bağlayıcı yerlər kimi fəaliyyət göstərən qorunan bölgələrlə ayrılır.Bakteriyaları və arxeyləri xarakterizə etmək üçün istifadə olunan əsas gen 16S rRNA genidir, göbələklərin identifikasiyası isə Daxili Transkripsiya edilmiş Spacerə (ITS) əsaslanır. Texnika sürətli və o qədər də bahalı deyil və mikrob nümunəsinin aşağı rezolyusiyaya malik təsnifatını əldə etməyə imkan verir, bu, ev sahibinin DNT-si ilə çirklənmiş nümunələr üçün optimaldır. Primer yaxınlığı bütün DNT ardıcıllıqları arasında dəyişir və bu, gücləndirmə reaksiyası zamanı qərəzliliyə səbəb ola bilər, həqiqətən də, aşağı bolluq nümunələri həddindən artıq gücləndirmə xətalarına həssasdır, çünki digər çirkləndirici mikroorqanizmlər PCR dövrlərinin artması halında həddindən artıq təmsil olunur. Buna görə də, primer seçiminin optimallaşdırılması bu cür səhvləri azaltmağa kömək edə bilər, baxmayaraq ki, nümunədə mövcud olan mikroorqanizmlər və onların nisbi bolluğu haqqında tam bilik tələb olunur. [21]

Marker gen analizi bu cür analizdə əsas seçimdən təsirlənə bilər, yaxşı təsdiqlənmiş protokoldan (məsələn, Yer Mikrobiomu Layihəsində istifadə olunan protokoldan) istifadə etmək məqsədəuyğundur. Bir marker gen amplikon analizində ediləcək ilk şey, ardıcıllıq səhvlərini aradan qaldırmaqdır. Bu fenomeni azaltmaq üçün ilk yanaşma ardıcıllıqları Əməliyyat taksonomik vahidinə (OTU) klaster etməkdir: bu proses oxşar ardıcıllıqları (bir qayda olaraq 97% oxşarlıq həddi qəbul edilir) bir xüsusiyyətə birləşdirərək sonrakı analiz addımlarında istifadə edilə bilər, lakin bu metod SNP-ləri atın, çünki onlar tək bir OTU-ya yığılacaqlar. Başqa bir yanaşma kiçik nukleotid variasiyalarını aşkar etmək və yaxından əlaqəli fərqli taksonlar arasında ayrı-seçkilik etmək üçün 16s rRNT ardıcıllığından mövqeyə aid xüsusi məlumatları ehtiva edən Oliqotipləşdirmədir. Bu üsullar çıxış olaraq OTU deyil, DNT ardıcıllıqlarının cədvəlini və nümunə başına müxtəlif ardıcıllıqların sayını verir. [21]

Təhlildə digər mühüm addım verilənlərdəki mikrob ardıcıllığına taksonomik ad təyin etməkdir. Bu, təxminən 80% cins səviyyəsində dəqiqliyə çata bilən maşın öyrənmə yanaşmalarından istifadə etməklə edilə bilər. Digər populyar analiz paketləri istinad verilənlər bazalarına dəqiq uyğunluqlardan istifadə edərək taksonomik təsnifat üçün dəstək verir və daha böyük spesifiklik, lakin zəif həssaslıq təmin etməlidir. Təsnifatlaşdırılmamış mikroorqanizm orqanel ardıcıllığı üçün əlavə yoxlanılmalıdır. [21]

Filogenetik Analiz Redaktəsi

Filogenetik nəticədən istifadə edən bir çox üsullar Arxeya və Bakteriyalar üçün 16SRNA genindən və Eukaryotlar üçün 18SRNA genindən istifadə edir. Filogenetik müqayisəli metodlar (FKS) mikroorqanizmlər arasında çoxsaylı əlamətlərin müqayisəsinə əsaslanır: onlar nə qədər yaxından əlaqəlidirlərsə, paylaşdıqları əlamətlərin sayı bir o qədər çox olur. Adətən PCS daha əhəmiyyətli nəticələr əldə etmək üçün filogenetik ümumiləşdirilmiş ən kiçik kvadrat (PGLS) və ya digər statistik analiz ilə birləşdirilir. Əcdadların dövlət rekonstruksiyası mikrobiom tədqiqatlarında xüsusiyyətləri məlum olmayan taksonlar üçün əlamət dəyərlərini təyin etmək üçün istifadə olunur. Bu, adətən mövcud verilənlər bazalarına əsaslanan PICRUSt ilə həyata keçirilir. Filogenetik dəyişənlər tədqiqatçılar tərəfindən tədqiqatın növünə görə seçilir: əhəmiyyətli bioloji məlumatlara malik bəzi dəyişənlərin seçilməsi ilə təhlil ediləcək məlumatların ölçüsünü azaltmaq mümkündür. [22]

Filogenetik məlumatlı məsafə adətən UniFrac və ya Soresen indeksi və ya Rao D kimi oxşar alətlərlə müxtəlif icmalar arasındakı fərqləri ölçmək üçün həyata keçirilir. Bütün bu üsullar üfüqi gen ötürülməsindən (HGT) mənfi təsirlənir, çünki səhvlər yarada bilər və uzaq növlərin korrelyasiyasına səbəb ola bilər. HGT-nin mənfi təsirini azaltmağın müxtəlif yolları var: ehtimal olunan HGT hadisələrinin ehtimalını qiymətləndirmək üçün çoxlu genlərin və ya hesablama vasitələrinin istifadəsi. [22]

Bakteriyaların redaktəsi

Mikrobların populyasiyaları (məsələn, bakteriya və mayalar) bədənin müxtəlif yerlərində dəri və selikli qişalarda məskunlaşır. Onların rolu normal, sağlam insan fiziologiyasının bir hissəsini təşkil edir, lakin əgər mikrobların sayı tipik diapazondan kənara çıxırsa (çox vaxt zəifləmiş immunitet sistemi səbəbindən) və ya mikroblar məskunlaşırsa (məsələn, pis gigiyena və ya zədə nəticəsində) bədənin normal olaraq kolonizasiya olunmayan və ya steril (qan, aşağı tənəffüs yolları və ya qarın boşluğu kimi) xəstəlik (müvafiq olaraq, bakteriemiya/sepsis, pnevmoniya və peritonit) ilə nəticələnə bilər. [ tibbi sitat lazımdır ]

İnsan Mikrobiomu Layihəsi müəyyən etdi ki, fərdlər minlərlə bakteriya növünə, fərqli bədən sahələrinə sahibdirlər. Dəri və vaginal yerlər ağız və bağırsaqdan daha kiçik müxtəliflik göstərdi, bunlar ən böyük zənginliyi göstərirdi. Bədəndə müəyyən bir sahə üçün bakterial makiyaj insandan insana dəyişir, yalnız növü ilə deyil, həm də bolluğu ilə. Ağız boyunca tapılan eyni növdən olan bakteriyalar, ağızda fərqli yerlərdə yaşamağa üstünlük verən bir çox alt tipə malikdir. Əvvəllər yaxşı başa düşüldüyü düşünülən insan bağırsağındakı enterotiplər belə, takson sərhədləri bulanıq olan geniş icmalardandır. [23] [24]

İnsan bağırsağında 500-1000 növ bakteriya yaşadığı təxmin edilir, lakin yalnız bir neçə filaya aiddir: Firmicutes və Bacteroidetes üstünlük təşkil edir, lakin Proteobakteriyalar, Verrucomicrobia, Actinobacteria, Fusobacteria və Cyanobacteria da var. [25]

kimi bakteriyaların bir sıra növləri Actinomyces viscosusA. naeslundii, ağızda yaşayırlar, burada lövhə adlanan yapışqan bir maddənin bir hissəsidirlər. Bu fırçalama ilə aradan qaldırılmırsa, o, daş daşına (həmçinin diş daşı adlanır) sərtləşir. Eyni bakteriyalar diş minasını əridən turşuları da ifraz edərək diş çürüməsinə səbəb olur.

Vaginal mikroflora əsasən müxtəlif laktobacillus növlərindən ibarətdir. Uzun müddətdir ki, bu növlərin ən çox yayılmış olduğu düşünülürdü Lactobacillus acidophilus, lakin sonradan məlum oldu ki L. iners əslində ən çox yayılmışdır, ondan sonra gəlir L. crispatus. Vajinada aşkar edilən digər laktobasillər də var L. jensenii, L. delbruekiiL. gasseri. Vaginal floranın pozulması bakterial vaginoz və ya kandidoz ("maya infeksiyası") kimi infeksiyalara səbəb ola bilər.

Archaea Redaktə

Arxeya insan bağırsağında mövcuddur, lakin bu orqandakı bakteriyaların böyük müxtəlifliyindən fərqli olaraq, arxeal növlərin sayı daha məhduddur. [26] Dominant qrup xüsusilə metanogenlərdir Methanobrevibacter SmithiiMethanosphaera stadtmanae. [27] Bununla belə, metanogenlərin kolonizasiyası dəyişkəndir və insanların yalnız 50%-də bu orqanizmlərin asanlıqla aşkar edilə bilən populyasiyaları var. [28]

2007-ci ilə kimi, arxeal patogenlərin heç bir aydın nümunəsi məlum deyildi [29] [30], baxmayaraq ki, bəzi metanogenlərin mövcudluğu ilə insan periodontal xəstəlikləri arasında əlaqə təklif edilmişdir. [31]

Göbələklərin redaktəsi

Göbələklər, xüsusən də mayalar insan bağırsaqlarında mövcuddur. [32] [33] [34] [35] Bunlardan ən yaxşı öyrənilənlərdir Candida immun çatışmazlığı olan və hətta sağlam sahiblərdə patogen olmaq qabiliyyətinə görə növlər. [33] [34] [35] Dəridə mayalar da mövcuddur, [32] kimi. Malassezia yağ bezlərindən ifraz olunan yağları istehlak etdikləri növlər. [36] [37]

Viruslar Edit

Viruslar, xüsusilə bakterial viruslar (bakteriofaqlar) bədənin müxtəlif yerlərini koloniyalaşdırırlar. Bu kolonizasiya sahələrinə dəri, [38] bağırsaq, [39] ağciyərlər, [40] və ağız boşluğu daxildir. [41] Virus icmaları bəzi xəstəliklərlə əlaqələndirilmişdir və sadəcə olaraq bakterial icmaları əks etdirmir. [42] [43] [44]

Dəri Redaktəsi

On sağlam insanın hər birində 20 dəri sahəsinin öyrənilməsi 19 bakteriya filasında 205 müəyyən edilmiş cins tapdı, əksər ardıcıllıqlar dörd filaya təyin edildi: Actinobakteriyalar (51,8%), Firmicutes (24,4%), Proteobakteriyalar (16,5%) və Bacteoides ( 6,3%). [45] Sağlam insan dərisində çoxlu sayda göbələk cinsləri mövcuddur, bədənin bölgələrinə görə bəzi dəyişkənliklər var, lakin patoloji şəraitdə müəyyən cinslər təsirlənmiş bölgədə üstünlük təşkil edir. [32] Məsələn, Malassezia atopik dermatitdə dominantdır və Akremonium kəpəkdən əziyyət çəkən baş dərilərində üstünlük təşkil edir. [32]

Dəri patogen mikrobların işğalını dayandırmaq üçün bir maneə rolunu oynayır. İnsan dərisi dərinin içində və ya üzərində yaşayan mikroblardan ibarətdir və yaşayış yeri və ya keçici ola bilər. Rezident mikroorqanizm növləri insan orqanizmində dəri tipinə görə dəyişir. Mikrobların əksəriyyəti dərinin səthi hüceyrələrində yaşayır və ya bezlərlə birləşməyə üstünlük verir. Yağ və ya tər vəziləri kimi bu bezlər mikrobları su, amin turşuları və yağ turşuları ilə təmin edir. Bundan əlavə, yağ bezləri ilə əlaqəli rezident bakteriyalar çox vaxt qram-müsbət olur və patogen ola bilər. [2]

Konyunktiva Edit

Normalda konyunktivada az sayda bakteriya və göbələk olur. [32] [46] Bakteriya siniflərinə qram-müsbət kokklar (məsələn, Stafilokok və Streptococcus) və qram-mənfi çubuqlar və kokklar (məsələn, hemofilNeisseria) mövcuddur. [46] Göbələk cinsləri daxildir Candida, Aspergillus, və Penicillium. [32] Göz yaşı vəziləri konyunktivanı nəm saxlayaraq davamlı olaraq ifraz edir, ara-sıra yanıb-sönmə konyunktivanı yağlayır və yad materialı yuyur. Göz yaşlarının tərkibində lizozim kimi bakterisidlər vardır ki, mikroorqanizmlər lizozimdən sağ qalmaqda və epiteliya səthlərində yerləşməkdə çətinlik çəkirlər.

Mədə-bağırsaq traktının redaktəsi

İnsanlarda mədə-bağırsaq mikrobiomunun tərkibi doğuş zamanı qurulur. [51] Qeysəriyyə əməliyyatı və ya vaginal yolla doğuş da bağırsağın mikrob tərkibinə təsir göstərir. Vaginal kanaldan doğulan körpələr anada aşkar olunanlara bənzər patogen olmayan, faydalı bağırsaq mikrobiotasına malikdir. [52] Bununla belə, C-bölməsi ilə doğulan körpələrin bağırsaq mikrobiotası Escherichia coli və Staphylococcus kimi daha çox patogen bakteriyaları ehtiva edir və qeyri-patogen, faydalı bağırsaq mikrobiotasının inkişafı daha uzun çəkir. [53]

Bəzi bağırsaq florası ilə insanlar arasındakı əlaqə sadəcə komensal deyil (zərərsiz birgəyaşayış), əksinə qarşılıqlı əlaqədir. [2] Bəzi insan bağırsağı mikroorqanizmləri pəhriz lifini sirkə turşusu və butirik turşu kimi qısa zəncirli yağ turşularına (SCFAs) fermentləşdirməklə ev sahibinə fayda verir, sonra onlar ev sahibi tərəfindən udulur. [4] [54] Bağırsaq bakteriyaları həmçinin B vitamini və K vitamininin sintezində, öd turşularının, sterolların və ksenobiotiklərin metabolizə edilməsində də rol oynayır. [2] [54] SCFA-ların və onların istehsal etdikləri digər birləşmələrin sistemli əhəmiyyəti hormonlara bənzəyir və bağırsaq florasının özü endokrin orqan kimi fəaliyyət göstərir [54] və bağırsaq florasının nizamsızlığı bir sıra iltihablı xəstəliklərlə əlaqələndirilir. və otoimmün şərtlər. [4] [55]

İnsan bağırsaq florasının tərkibi zamanla, pəhriz dəyişdikdə və ümumi sağlamlıq dəyişdikcə dəyişir. [4] [55] 2016-cı ilin iyul ayından etibarən 15 insanda aparılan randomizə nəzarətli sınaqların sistematik nəzərdən keçirilməsi müəyyən etdi ki, probiotik bakteriyaların kommersiya baxımından əldə edilən bəzi ştammları BifidobakteriyaLactobacillus nəsil (B. longum, B. breve, B. infantis, L. helveticus, L. rhamnosus, L. plantarum, və L. casei), 1-2 ay ərzində 10 9-10 10 koloniya əmələ gətirən vahid (CFU) gündəlik dozalarında ağızdan qəbul edildikdə, müəyyən mərkəzi sinir sisteminin pozğunluqlarında - narahatlıq, depressiya, autizm də daxil olmaqla, müalicə effektivliyinə malikdir (yəni davranış nəticələrini yaxşılaşdırır). spektr pozğunluğu və obsesif-kompulsif pozğunluq - və yaddaşın müəyyən aspektlərini yaxşılaşdırır. [56] Bununla belə, bağırsaq mikrobiotasının tərkibindəki dəyişikliklərin sağlamlığa zərərli təsirləri ilə də əlaqəli olduğu aşkar edilmişdir. Musso və digərləri tərəfindən nəşr olunan bir məqalədə, obez şəxslərin bağırsaq mikrobiotasında sağlam fərdlərə nisbətən daha çox Firmicutes və daha az Bacteroides olduğu aşkar edilmişdir. [57] Mikrob nisbətindəki bu dəyişikliyin qidadan enerji çıxarmaqda daha səmərəli bakteriyaların artmasına kömək edə biləcəyinə inanılır. Tədqiqatçılar şişman siçanların mikrobiotasını arıq siçanlarla müqayisə etmək üçün ov tüfənginin ardıcıllığından istifadə ediblər. Onlar aşkar ediblər ki, obez siçanların genomları təkcə insan orqanizmi tərəfindən həzm olunmayan polisaxaridləri parçalaya bilən fermentləri kodlayan çoxlu genlərdən ibarətdir. [58]

Bundan əlavə, Gordon və digərləri tərəfindən edilən bir araşdırma, piylənməyə səbəb olanın əksinə deyil, mikrobiotanın tərkibi olduğunu təsdiqlədi. Bu, pəhrizə bağlı piylənmə (DIO) siçanlarından və ya arıq nəzarət siçanlarından bağırsaq mikrobiotasının mikrobiomu olmayan arıq mikrobsuz siçanlara köçürülməsi ilə həyata keçirilib. Onlar müəyyən ediblər ki, DIO siçan bağırsaq mikrobiotası ilə nəql edilən siçanların eyni pəhrizlə qidalandığı zaman arıq siçan mikrobiotası ilə transplantasiya edilən siçanlara nisbətən ümumi bədən yağının əhəmiyyətli dərəcədə yüksək olduğunu müəyyən ediblər. [59]

Ridaura və digərləri tərəfindən tamamlanan ayrı bir araşdırma. 2013-cü ildə insan nəcisinin mikrobsuz siçanlara ilk nəqlini həyata keçirdi. Yığılan insan nəcisi, bədən yağ nisbəti nəzərəçarpacaq dərəcədə fərqli olan yetkin qadın əkizlərindən əmələ gəlmişdir. Tədqiqatçılar əsasən piylənmə fenotipini və arıq fenotipi siçanlara ötürə bildilər, hər ikisi də az yağlı siçan yemi ilə qidalanırdılar. Şişman əkizdən əldə edilən nəcisi olan siçanlar ümumi bədən və yağ kütləsini artırdı, daha arıq əkizdən əldə edilən nəcisi olan siçanlar isə piylənməyə bənzər əlamətlər və ya simptomlar inkişaf etdirmədi. [60]

Uretra və sidik kisəsi Edit

Genitouriya sistemində mikrobiota olduğu görünür, [61] [62] bu, insanlarda sidik yolları infeksiyası əlamətləri göstərdikdə sidikdə bakteriyaları aşkar etmək üçün standart klinik mikrobioloji mədəniyyət üsullarının uzun müddət istifadəsi fonunda gözlənilməz bir tapıntıdır. bu testlər üçün adi bir bakteriya yoxdur. [63] Göründüyü kimi, ümumi kultura üsulları adətən mövcud olan bir çox növ bakteriya və digər mikroorqanizmləri aşkar etmir. [63] 2017-ci ildən etibarən sidik yollarında problemi olan insanlarla sağlam olanlar arasında mikrobiotada fərqlərin olub-olmadığını müəyyən etmək üçün bu mikroorqanizmləri müəyyən etmək üçün ardıcıllıq metodlarından istifadə edilmişdir. [61] [62] Sidik kisəsinin mikrobiomunu sidik-cinsiyyət sistemindən fərqli olaraq düzgün qiymətləndirmək üçün sidik nümunəsi bilavasitə sidik kisəsindən götürülməlidir ki, bu da çox vaxt kateterlə aparılır. [64]

Vagina Edit

Vaginal mikrobiota vajinanı kolonizasiya edən növlərə və nəsillərə aiddir. Bu orqanizmlər infeksiyalardan qorunmaqda və vaginal sağlamlığın qorunmasında mühüm rol oynayır. [65] Premenopozal qadınlarda ən çox rast gəlinən vaginal mikroorqanizmlər cinsindəndir. Lactobacillus, hidrogen peroksid və laktik turşu istehsal edərək patogenləri boğur. [34] [65] [66] Bakterial növlərin tərkibi və nisbətləri menstruasiya dövrünün mərhələsindən asılı olaraq dəyişir. [67] [68] [ yeniləmə lazımdır ] Etnik mənsubiyyət də vaginal floraya təsir göstərir. Hidrogen peroksid istehsal edən laktobakteriyaların meydana gəlməsi Afrikalı Amerikalı qadınlarda daha azdır və vaginal pH daha yüksəkdir. [69] Cinsi əlaqə və antibiotiklər kimi digər təsiredici amillər laktobasillərin itirilməsi ilə əlaqələndirilmişdir. [66] Üstəlik, tədqiqatlar müəyyən etmişdir ki, prezervativlə cinsi əlaqə laktobasillərin səviyyəsini dəyişir və onun səviyyəsini artırır. Escherichia coli vaginal flora daxilində. [66] Normal, sağlam vaginal mikrobiotada dəyişikliklər kandidoz və ya bakterial vaginoz kimi [70] infeksiyaların göstəricisidir. [66] Candida albicans böyüməsini maneə törədir Lactobacillus növ, isə Lactobacillus hidrogen peroksid istehsal edən növlərin böyüməsini və virulentliyini maneə törədir Candida albicans həm vaginada, həm də bağırsaqda. [32] [34] [35]

Vajinada aşkar edilmiş göbələk cinsləri daxildir Candida, Pichia, Avrotium, Alternaria, Rodotorula, və Cladosporium, başqaları arasında. [32]

Plasenta Edit

Son vaxtlara qədər plasenta steril bir orqan hesab olunurdu, lakin plasenta toxumasında yaşayan kommensal, patogen olmayan bakterial növlər və cinslər müəyyən edilmişdir. [71] [72] [73]

Uterus Redaktəsi

Son vaxtlara qədər qadınların yuxarı reproduktiv sistemi steril mühit hesab olunurdu. Reproduktiv yaşda olan sağlam, asemptomatik qadınların uterusunda müxtəlif mikroorqanizmlər yaşayır. Uterusun mikrobiomu vajina və mədə-bağırsaq traktından əhəmiyyətli dərəcədə fərqlənir. [74]

Ağız boşluğu Redaktə

İnsan ağzında mövcud olan mühit orada tapılan xarakterik mikroorqanizmlərin böyüməsinə imkan verir. Su və qida mənbəyi, eləcə də orta temperatur təmin edir. [2] Ağızın rezident mikrobları, turşuya həssas mikrobların xlorid turşusu tərəfindən məhv edildiyi ağızdan mədəyə mexaniki yuyulmağa müqavimət göstərmək üçün dişlərə və diş ətlərinə yapışır. [2] [34]

Ağız boşluğunda anaerob bakteriyalara aşağıdakılar daxildir: Aktinomislər, Araxniya, Bakteroidlər, Bifidobakteriya, Eubacterium, Fusobacterium, Lactobacillus, Leptotrixiya, Peptokokk, Peptostreptokokk, Propionibakteriya, Selenomonas, Treponema, və Veillonella. [75] [ yeniləmə lazımdır ] Ağızda tez-tez rast gəlinən göbələklər daxildir Candida, Cladosporium, Aspergillus, Fusarium, Glomus, Alternaria, Penicillium, və Kriptokokk, başqaları arasında. [32]

Bakteriyalar biofilmdə həm sərt, həm də yumşaq ağız toxumalarında toplanır ki, bu da onların ətraf mühit amillərindən və antimikrob agentlərdən qorunaraq ağız mühitində yapışmasına və mübarizə aparmasına imkan verir. [76] Tüpürcək bakteriyaların formalaşması üçün yenidən kolonizasiyasına imkan verən əsas biofilm homeostatik rolunu oynayır və biofilm yığılmasını ayıraraq böyüməyə nəzarət edir. [77] O, həmçinin qida və temperatur tənzimləmə vasitəsini təmin edir. Biofilmin yeri onun qəbul etdiyi məruz qalmış qida maddələrinin növünü müəyyən edir. [78]

Ağız bakteriyaları ətraf mühiti hiss etmək və ev sahibini ondan yayındırmaq və ya dəyişdirmək üçün mexanizmlər inkişaf etdirmişdir. Bununla belə, yüksək effektiv anadangəlmə müdafiə sistemi bakterial kolonizasiyanı daim izləyir və yerli toxumaların bakterial işğalının qarşısını alır. Diş lövhəsi bakteriyaları ilə anadangəlmə müdafiə sistemi arasında dinamik tarazlıq mövcuddur. [79]

Ağız boşluğu və ağız mikrobları arasındakı bu dinamika orqanizmə daxil olmağı təmin etdiyi üçün sağlamlıq və xəstəlikdə əsas rol oynayır. [80] Sağlam tarazlıq simbiotik əlaqəni təqdim edir, burada ağız mikrobları patogenlərin böyüməsini və yapışmasını məhdudlaşdırır, ev sahibi isə onların çiçəklənməsi üçün mühit təmin edir. [80] [76] İmmunitet statusunun dəyişməsi, rezident mikrobların yerdəyişməsi və qida maddələrinin mövcudluğu kimi ekoloji dəyişikliklər qarşılıqlı əlaqədən parazitar əlaqəyə keçidlə nəticələnir ki, bu da ev sahibinin ağız və sistem xəstəliklərinə meylli olması ilə nəticələnir.[76] Diabet və ürək-damar xəstəlikləri kimi sistemli xəstəliklər ağız sağlamlığının pis olması ilə əlaqələndirilmişdir. [80] Ağız mikroorqanizmlərinin iki əsas diş xəstəliyində rolu xüsusi maraq doğurur: diş kariyesi və periodontal xəstəlik. [79] Periodontda patogen kolonizasiya həddindən artıq immun reaksiyaya səbəb olur və nəticədə periodontal cib - diş və diş əti arasında dərinləşmiş boşluq yaranır. [76] Bu, anaerob patogenlər üçün qida maddələri ilə qorunan qanla zəngin rezervuar rolunu oynayır. [76] Bədənin müxtəlif yerlərində sistemli xəstəlik ağızdan mikrobların periodontal cibləri və ağız membranlarını keçərək qana daxil olması nəticəsində yarana bilər. [80]

Daimi düzgün ağız gigiyenası ağız və sistem xəstəliklərinin qarşısının alınması üçün əsas üsuldur. [80] O, biofilmin sıxlığını və xəstəliyə səbəb olan potensial patogen bakteriyaların çoxalmasını azaldır. [78] Bununla belə, düzgün ağız gigiyenası kifayət olmaya bilər, çünki ağız mikrobiomu, genetika və immun cavab dəyişiklikləri xroniki infeksiyaların inkişafında faktor rolunu oynayır. [78] Antibiotiklərin istifadəsi artıq yayılan infeksiyanı müalicə edə bilər, lakin biofilmlərdəki bakteriyalara qarşı təsirsizdir. [78]

Ağciyər Redaktəsi

Ağız boşluğunda olduğu kimi, yuxarı və aşağı tənəffüs sistemləri də mikrobları çıxarmaq üçün mexaniki maneələrə malikdir. Goblet hüceyrələri mikrobları tutan və davamlı hərəkət edən kirpikli epitel hüceyrələri vasitəsilə onları tənəffüs sistemindən çıxaran selikli qişa istehsal edir. [2] Bundan əlavə, tərkibində lizozim fermenti olan burun mucusunda bakterisid təsir yaranır. [2] Üst və aşağı tənəffüs yollarının öz mikrobiota dəsti var. [81] Ağciyər bakteriyasının mikrobiotası 9 əsas bakteriya cinsinə aiddir: Prevotella, Sfinqomonalar, Pseudomonas, Acinetobacter, Fusobacterium, Meqasfera, Veillonella, Stafilokok, və Streptokokk. Tənəffüs yollarında "normal biota" hesab edilən bəzi bakteriyalar, xüsusən də immuniteti zəif olan insanlarda ciddi xəstəliklərə səbəb ola bilər. Streptococcus pyogenes, Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, və Staphylococcus aureus. [ sitat lazımdır ] Ağciyər mikobiomunu təşkil edən göbələk cinslərinə daxildir Candida, Malassezia, Neosartoriya, Sakkaromislər, və Aspergillus, başqaları arasında. [32]

Kistik fibrozlu insanlarda tənəffüs yollarında bakterial və göbələk cinslərinin qeyri-adi yayılması müşahidə olunur. [32] [82] Onların bakterial florasında tez-tez antibiotiklərə davamlı və yavaş böyüyən bakteriyalar var və bu patogenlərin tezliyi yaşa bağlı olaraq dəyişir. [82]

Öd yollarının redaktəsi

Ənənəvi olaraq öd yolları normal olaraq steril sayılır və öddə mikroorqanizmlərin olması patoloji prosesin göstəricisidir. Bu fərziyyə normal öd axarından bakteriya ştammlarının ayrıla bilməməsi ilə təsdiqləndi. Normal öd mikrobiotasının öd yollarını ekzogen mikroorqanizmlər tərəfindən kolonizasiyadan qoruyan ayrıca funksional təbəqə olduğunu göstərən sənədlər 2013-cü ildə ortaya çıxmağa başladı. [83]

İnsan bədəni əsas qida maddələrinin mənbəyi kimi saysız-hesabsız bakteriya genlərinə güvənir. [84] Həm metagenomik, həm də epidemioloji tədqiqatlar insan mikrobiomunun 2-ci tip diabet və piylənmədən tutmuş iltihablı bağırsaq xəstəliyinə, Parkinson xəstəliyinə və hətta depressiya kimi psixi sağlamlıq vəziyyətlərinə qədər geniş spektrli xəstəliklərin qarşısının alınmasında mühüm rol oynadığını göstərir. [85] Bağırsaq mikrobiotası ilə müxtəlif bakteriyalar arasında simbiotik əlaqə fərdin immun reaksiyasına təsir göstərə bilər. [86] Körpəlik dövründə olsa da, mikrobioma əsaslı müalicə də vəd verir, xüsusən də dərmana davamlı müalicə üçün C. difficile infeksiya [87] və diabet müalicəsində. [88]

Clostridioides difficile infeksiya Redaktə edin

Bakteriyaların həddindən artıq olması, C. difficile, mədə-bağırsaq traktının infeksiyasına gətirib çıxarır, adətən antibiotiklərin qəbulu nəticəsində yarandığı güman edilən mikrobiota ilə dysbiosis ilə əlaqələndirilir. Antibiotiklərin istifadəsi mədə-bağırsaq traktında faydalı bağırsaq florasını məhv edir, bu da normal olaraq patogen bakteriyaların üstünlük təşkil etməsinə mane olur. [89] Ənənəvi müalicə üçün C. difficile infeksiyalara antibiotiklərin əlavə rejimi daxildir, lakin effektivlik nisbətləri orta hesabla 20-30% arasındadır. [90] Sağlam bağırsaq bakteriyalarının əhəmiyyətini dərk edən tədqiqatçılar nəcis mikrobiotasının transplantasiyası kimi tanınan prosedura müraciət etdilər, burada xəstələrin mədə-bağırsaq xəstəlikləri, məsələn C. difficile infeksiya, normal fəaliyyət göstərən bağırsaq mikrobiotasını bərpa etmək ümidi ilə sağlam bir şəxsdən nəcis tərkibini qəbul edin. [91] Nəcis mikrobiotasının transplantasiyası, antibiotiklərin işləmədiyi və ya antibiotiklərdən sonra xəstəliyin təkrarlandığı CDI olan insanlarda təxminən 85-90% effektivdir. [92] [93] CDI olan insanların əksəriyyəti bir FMT müalicəsi ilə sağalır. [94] [95] [96]

Xərçəng Edit

Xərçəng ümumiyyətlə ev sahibi genetika və ətraf mühit faktorları ilə əlaqəli bir xəstəlik olsa da, insan xərçənglərinin təxminən 20% -ində mikroorqanizmlər iştirak edir. [97] Xüsusilə kolon xərçəngində potensial faktorlar üçün bakterial sıxlıq nazik bağırsaqdakından bir milyon dəfə yüksəkdir və nazik bağırsaqla müqayisədə təxminən 12 qat daha çox xərçəng meydana gəlir ki, bu da kolonda mikrobiotanın patogen rolunu müəyyən edir. və rektal xərçənglər. [98] Mikrob sıxlığı kolorektal xərçənglərin qiymətləndirilməsində proqnostik vasitə kimi istifadə edilə bilər. [98]

Mikrobiota kanserogenezə üç geniş şəkildə təsir edə bilər: (i) şiş hüceyrələrinin çoxalması və ölümü tarazlığını dəyişdirmək, (ii) immun sisteminin funksiyasını tənzimləmək və (iii) ev sahibi tərəfindən istehsal olunan amillərin, qidaların və əczaçılıq vasitələrinin metabolizminə təsir göstərmək. [97] Dəri, ağız-udlaq və tənəffüs, həzm və sidik-cinsiyyət yolları kimi sərhəd səthlərində əmələ gələn şişlər mikrobiota saxlayır. Şiş yerində əhəmiyyətli mikrobların olması assosiasiya və ya səbəb əlaqəsi yaratmır. Bunun əvəzinə, mikroblar şiş oksigen gərginliyini və ya qida profilini dəstəkləyən tapa bilər. Xüsusi mikrobların populyasiyasının azalması və ya səbəb olan oksidləşdirici stress də riskləri artıra bilər. [97] [98] Yer üzündəki təxminən 10 30 mikrobdan 10-u Beynəlxalq Xərçəng Araşdırmaları Agentliyi tərəfindən insan kanserogenləri olaraq təyin edilmişdir. [97] Mikroblar zülallar və ya digər faktorlar ifraz edə bilər və ya ev sahibinin hüceyrə proliferasiyasına birbaşa təkan verə bilər və ya kanserogenezə töhfə verən yollarla kəskin və ya xroniki iltihabı idarə etmək də daxil olmaqla, ev sahibi immun sistemini yuxarı və ya aşağı tənzimləyə bilər. [97]

İmmunitet funksiyası və iltihabın inkişafı arasındakı əlaqəyə gəldikdə, selikli qişanın səthi maneələri ekoloji risklərə məruz qalır və homeostazı qorumaq üçün sürətlə təmir edilməlidir. Təhlükəli ev sahibi və ya mikrobiota müqaviməti də bədxassəliliyə qarşı müqaviməti azaldır, ehtimal ki, iltihab və xərçəngə səbəb olur. Baryerlər pozulduqda, mikroblar müxtəlif yollarla proinflamatuar və ya immunosupressiv proqramlar yarada bilər. [97] Məsələn, xərçənglə əlaqəli mikroblar şiş mikromühitində NF-κΒ siqnalını aktivləşdirir. Digər nümunə tanıma reseptorları, məsələn, nukleotid bağlayan oliqomerləşmə domeninə bənzər reseptor (NLR) ailə üzvləri NOD-2, NLRP3, NLRP6NLRP12, kolorektal xərçəngin vasitəçiliyində rol oynaya bilər. [97] Eynilə Helicobacter pylori mədədə xroniki iltihablı reaksiyaya səbəb olduğu üçün mədə xərçəngi riskini artırır. [97] [98]

İltihabi bağırsaq xəstəliyi Redaktə edin

İltihabi bağırsaq xəstəliyi iki fərqli xəstəlikdən ibarətdir: xoralı kolit və Crohn xəstəliyi və bu xəstəliklərin hər ikisi bağırsaq mikrobiotasında (disbioz kimi də tanınır) pozulmalarla özünü göstərir. Bu dysbiosis bağırsaqda mikrob müxtəlifliyinin azalması şəklində özünü göstərir [99] [100] və fərdlərdə anadangəlmə immun reaksiyasını dəyişdirən ev sahibi genlərindəki qüsurlarla əlaqələndirilir. [99]

İnsan immunçatışmazlığı virusu Redaktə edin

HİV xəstəliyinin inkişafı bağırsaq mikrobiotasının tərkibinə və funksiyasına təsir edir, İİV-mənfi, HİV-müsbət və ART sonrası İİV-müsbət populyasiyalar arasında nəzərəçarpacaq fərqlər var. [ sitat lazımdır ] HİV sıx birləşmələrə təsir edərək bağırsaq epitelial maneə funksiyasının bütövlüyünü azaldır. Bu parçalanma, HİV-ə yoluxmuş insanlarda görülən iltihabın artmasına kömək etdiyi düşünülən bağırsaq epiteli boyunca translokasiyaya imkan verir. [101]

Vaginal mikrobiota HİV-in yoluxmasında rol oynayır, qadında vaginal bakteriyaların anormal balansı ilə xarakterizə olunan bir vəziyyət olan bakterial vaginoz zamanı infeksiya və ötürülmə riski artır. [102] Artan yoluxuculuq vajinada iltihaba qarşı sitokinlərin və CCR5 + CD4+ hüceyrələrinin artması ilə müşahidə olunur. Bununla birlikdə, vaginal səviyyələrin artması ilə yoluxuculuğun azalması müşahidə olunur laktobacillus, antiinflamatuar vəziyyəti təşviq edən. [101]

Ölüm Redaktəsi

Ölümlə birlikdə canlı orqanizmin mikrobiomu çökür və mikroorqanizmlərin fərqli tərkibi adlanır nekrobiom mürəkkəb fiziki parçalanma prosesinin mühüm fəal tərkib hissəsi kimi özünü təsdiqləyir. Onun zamanla proqnozlaşdırıla bilən dəyişikliklərinin ölüm vaxtını təyin etmək üçün faydalı olduğu düşünülür. [103] [104]

2009-cu ildə aparılan tədqiqatlar insan müdaxiləsi nəticəsində biotanın (mikrofauna da daxil olmaqla) azalmasının insan sağlamlığına, xəstəxana təhlükəsizliyi prosedurlarına, qida məhsullarının dizaynına və xəstəliklərin müalicəsinə mane olub-olmadığını soruşdu. [105]

İlkin araşdırmalar göstərir ki, insan bir ölkədən digərinə miqrasiya etdikdə, məsələn, Taylandlı mühacirlər ABŞ-da məskunlaşdıqda [106] və ya Latın Amerikalılar ABŞ-a köçdükdə, mikrobiotada dərhal dəyişikliklər baş verə bilər. [107] Mikrobiota müxtəlifliyinin itkiləri obez fərdlərdə və immiqrantların uşaqlarında daha çox olmuşdur. [106] [107]


Prostat vəzinin iltihabında və prostat xərçəngində mikrobiom

İnsan mikrobiomu həm birbaşa, həm də dolayı qarşılıqlı təsirlər vasitəsilə prostat xərçənginin başlanmasına və/və ya irəliləməsinə təsir göstərə bilər. Bu günə qədər tədqiqatların əksəriyyəti birbaşa qarşılıqlı təsirlərə, o cümlədən prostat infeksiyalarının prostat xərçəngi riskinə təsiri və daha yaxınlarda prostat xərçəngi ilə əlaqəli sidik mikrobiomunun tərkibinə yönəlmişdir. Mikrobiomun prostat xərçəngi ilə dolayı qarşılıqlı təsirləri, məsələn, mədə-bağırsaq və ya ağız boşluğunun mikrobiotasının pro- və ya antikanserogen ksenobiotik maddələr mübadiləsinə təsiri və müalicəyə reaksiyası daha az başa düşülür.

Metodlar

Mikrobiomun prostat vəzinin iltihabı və prostat xərçəngi ilə birbaşa və dolayı qarşılıqlı əlaqəsi haqqında bu günə qədər ədəbiyyatı nəzərdən keçiririk.

Nəticələr

İnkişaf etməkdə olan tədqiqatlar göstərir ki, mikrobiom prostatit/xroniki çanaq ağrıları sindromu və xoşxassəli prostat hiperplaziyası, həmçinin prostat xərçəngi kimi xoşxassəli prostat şərtləri ilə əlaqədar prostat vəzinin iltihabına təsir göstərə bilər. Çoxsaylı anatomik yerlərdə (sidik yolları, mədə-bağırsaq traktları, ağız boşluğu və s.) mövcud olan insan mikrobiomunun prostat sağlamlığı və xəstəliklərində mühüm rol oynaya biləcəyinə dair sübutlar təqdim edirik.

Nəticələr

Sağlamlıqda mikrobiom homeostazı təşviq edir və immunitet sistemini öyrətməyə kömək edir. Disbiozda, xərçəng də daxil olmaqla, uzaq anatomik yerləri xəstəliyə meylləndirən sistemik bir iltihablı vəziyyət yarana bilər. Mikrobiomun sistem hormon səviyyələrinə təsir etmək qabiliyyəti, xüsusilə estrogen və androgen səviyyələrindən ikili təsirlənən prostat xərçəngi kimi bir xəstəlikdə də vacib ola bilər. Prostat xərçəngi və mikrobiom arasında potensial qarşılıqlı əlaqənin mürəkkəbliyinə görə, əlaqəli olan əlaqələri daha da araşdırmaq və anlamaq çox vacibdir.


Aşağıdakı mövzularda normal flora nümunələri:

Bacteroides və Flavobacterium

  • tərkibində bakterioidlərin olması normalflora məməlilərin sayı onun mürəkkəb molekulların ev sahibi tərəfindən istifadə oluna bilən daha sadə molekullara çevrilməsindəki rolunun göstəricisidir.
  • Bakteroidlərin rolu normalflora daha böyük mürəkkəb molekulları parçalamaq qabiliyyətindən kənara çıxır və qoruyucu funksiya göstərə bilər.
  • Bakteroidlərin rolunu təsvir edin normalflora insanın mədə-bağırsaq traktının və şirin su balıqlarında xəstəliyə səbəb olan Flavobacteriumun rolu

Normal genitouriya mikrobiotası

  • Hazır olması gözlənilənlər və aşağıda olanlar normal şərtlər xəstəliyə səbəb olmur, əksinə sağlamlığın qorunmasında iştirak edir, üzvləri sayılır normalflora.
  • Onların rolu bir hissəsini təşkil edir normal, sağlam insan fiziologiyası, lakin, əgər mikrobların sayı tipik diapazondan kənara çıxarsa (çox vaxt zəifləmiş immunitet sistemi səbəbindən) və ya mikroblar bədənin atipik bölgələrində məskunlaşarsa (məsələn, pis gigiyena və ya zədə nəticəsində), xəstəlik yarana bilər.
  • Normalflora bakteriyalar immunitetin aşağı düşdüyü vaxtlarda fürsətçi patogenlər kimi çıxış edə bilər. Vaginal mikroflora əsasən müxtəlif laktobacillus növlərindən ibarətdir.
  • Vaginal boşluğun pozulması flora bakterial vaginoza səbəb ola bilər.

Anadangəlmə Müqavimət

  • Mövcud olması gözlənilənlər və aşağıda normal Vəziyyətlər xəstəliyə səbəb olmur, əksinə sağlamlığın qorunmasında iştirak edir, üzvləri sayılır normalflora.
  • Onların rolu bir hissəsini təşkil edir normal, sağlam insan fiziologiyası.
  • Normalflora bakteriyalar toxunulmazlığın aşağı düşdüyü vaxtlarda fürsətçi patogenlər kimi çıxış edə bilər.
  • Az sayda bakteriya var normal olaraq konjonktivada mövcuddur.
  • bağırsaq flora insandır flora mikroorqanizmlərin ki normal olaraq həzm sistemində yaşayır və sahibləri üçün bir sıra faydalı funksiyaları yerinə yetirə bilirlər.

Normal Göz Mikrobiotası

  • Az sayda bakteriya var normal olaraq konjonktivada mövcuddur.
  • Mövcud olması gözlənilən və xəstəliyə səbəb olmayanlar (alt normal hallar), lakin bunun əvəzinə sağlamlığın qorunmasında iştirak edən üzvlər hesab olunur normalflora.
  • Az sayda bakteriya var normal olaraq konjonktivada mövcuddur.
  • Tərkibində olan mikroorqanizmlərə nümunələr verin normal göz mikrobiotası

Bakterial Dəri Xəstəlikləri

  • Xəstəliyin simptomları bir və ya iki gün ərzində aradan qalxsa da, dərinin bərpası həftələr çəkə bilər normal.
  • Selülit səbəb ola bilər normal dəri flora və ya ekzogen bakteriyalar tərəfindən və tez-tez dərinin əvvəllər qırıldığı yerlərdə baş verir.
  • A qrupu streptokoklar və stafilokoklar bu bakteriyaların ən çox yayılmışlarıdır. normalflora dəri, lakin normal olaraq dərinin xarici səthində olarkən heç bir faktiki infeksiyaya səbəb olmur.

Nüfuz edən Host Müdafiəsi

  • Mövcud olması gözlənilən və altında olan orqanizmlər normal hallar xəstəliyə səbəb olmur, ancaq sağlamlığın qorunmasında iştirak edir, üzvləri sayılır normalflora.
  • Həzm sistemindəki bir çox bakteriya, birlikdə bağırsaq adlanır flora, insanların başqa cür həzm edə bilmədiyi karbohidratlar kimi müəyyən qidaları parçalaya bilir.
  • Normalflora bakteriyalar toxunulmazlığın aşağı düşdüyü dövrlərdə fürsətçi patogenlər kimi çıxış edə bilər.

Normal mədə-bağırsaq mikrobiotası

  • bağırsaq flora heyvanların həzm sistemlərində yaşayan və insanın ən böyük anbarı olan mikroorqanizmlərdən ibarətdir. flora.
  • bağırsaq flora heyvanların həzm sistemlərində yaşayan mikroorqanizmlərdən ibarətdir və insanın ən böyük anbarıdır. flora .
  • Bu bağırsaq olduğu təxmin edilir flora insan genomunda olduğundan təxminən 100 dəfə çox gen var.
  • Bakteriyalar çoxunu təşkil edir flora kolonda və nəcisin quru kütləsinin 60% -ə qədər.
  • Göbələklər və protozoa da bağırsağın bir hissəsini təşkil edir flora, lakin onların fəaliyyəti haqqında az şey məlumdur.

Antimikroblar tərəfindən Mikrobiotanın bastırılması və dəyişdirilməsi

  • İnsan orqanizmində mikrob kimi tanınan minlərlə müxtəlif növ mikrob orqanizmi var flora və ya mikrobiota.
  • Misal bağırsaqdır flora bədənin qan dövranına daxil olur.
  • Bağırsaq vəziyyətində flora, bu, xəstənin qidanı düzgün metabolizə etmək qabiliyyətini poza bilər.
  • Bağırsaq kimi zəruri funksiyanı yerinə yetirməklə yanaşı flora Qida mübadiləsinə görə bədənimizdəki bəzi mikrobiota patogen mikrobların yaşamaqdan və ya digərlərində üstünlük təşkil etməsindən qorumaq funksiyasını yerinə yetirir. flora bədənimizdəki yerlərdə.
  • C. albicans edir normal olaraq zərərsizdir, lakin qadınlar bəzi antibiotiklər qəbul etdikdə bu, vulvo-vaginal bölgədəki faydalı bakteriyaları, xüsusən də laktobasilləri öldürə bilər.

Nazokomial infeksiyalara nəzarət

  • Tibb işçilərinin əllərində mikroorqanizmlərin iki kateqoriyası ola bilər: keçici flora və rezident flora.
  • Sakinləri təşkil edən mikroblar flora bunlardır: Staphylococcus epidermidis, S. hominis və Microccocus, Propionibacterium, Corynebacterium, Dermobacterium və Pitosporum spp., keçid dövründə isə S. aureus və Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter, Candi spp. və Enterobacter tapıla bilər.
  • Əl gigiyenasının məqsədi keçiciliyi aradan qaldırmaqdır flora hər ikisi də müxtəlif növ sabunlardan istifadə edərək əl yumanın diqqətli və düzgün icrası ilə normal və antiseptik və spirt əsaslı gellər.

İnsan-Mikrob Reaksiyalarına Baxış

  • bağırsaq flora heyvanların həzm sistemlərində yaşayan mikroorqanizmlərdən ibarətdir və insanın ən böyük anbarıdır. flora.
  • Bakteriyalar çoxunu təşkil edir flora kolonda və nəcisin quru kütləsinin 60% -ə qədər.
  • Göbələklər və protozoa da bağırsağın bir hissəsini təşkil edir flora, lakin onların fəaliyyəti haqqında az şey məlumdur.
  • Dəri flora adətən qeyri-patogendir və ya kommensal, ya da qarşılıqlıdır.
  • İbtidai patogenlər, onların içərisində mövcudluğu və ya fəaliyyəti nəticəsində xəstəliyə səbəb olur normal, sağlam ev sahibi.
Fənlər
  • Mühasibat uçotu
  • Cəbr
  • İncəsənət Tarixi
  • Biologiya
  • Biznes
  • Hesablama
  • kimya
  • Rabitə
  • İqtisadiyyat
  • Maliyyə
  • İdarəetmə
  • Marketinq
  • Mikrobiologiya
  • Fizika
  • Fiziologiya
  • Siyasi Elm
  • Psixologiya
  • Sosiologiya
  • Statistika
  • ABŞ tarixi
  • Dünya tarixi
  • yazı

Qeyd edilən hallar istisna olmaqla, bu saytdakı məzmun və istifadəçi töhfələri CC BY-SA 4.0 altında lisenziyalaşdırılır və atribut tələb olunur.


Digər treponematozlar

Yaws, səbəb T solğunluq subsp pertenue, Afrikanın tropik ərazilərində, Cənubi Amerikada, Hindistanda, İndoneziyada və Sakit okean adalarında üstünlük təşkil edir. Onun yüksək yoluxucu təbiəti dünyada təxminən 50 milyon hadisə ilə ifadə edilir. Yoluxma insandan insana qeyri-cinsi əlaqə yolu ilə baş verir. Əksər hallarda uşaqlar və yeniyetmələr olur. Endemik ərazilərdə əhalinin 75 faizi 20 yaşına çatmamış əsnəkdən əziyyət çəkir.

Birincili lezyon və ya ana yaw, 2-4 həftə ərzində dəriyə daxil olan yerdə ağrısız eritematoz papula və ya papüllər qrupu şəklində inkişaf edir. Lezyonlar böyüyür və ülserləşir, orqanizmlərlə dolu olan qanlı bir çalarlı seroz mayeni çıxarır. Bu lezyonlar bir aydan bir neçə aya qədər sağalır, atrofik, depressiv çapıq qalır. Treponemlər yayılır və 1-12 ay ərzində ana yaw ilə olduqca oxşar olan ikincil lezyonlar inkişaf edir. Bu lezyonların bitkiləri əvvəlcə üzdə və bədənin nəm bölgələrində inkişaf edir, sonra gövdə və qollara yayılır. Daban və ovucların infeksiyası sifilisdə olduğu kimi xarakterikdir. Yüksək qranulomatoz papüllər 5 sm diametrə qədər böyüyə bilər və sonra depiqmentasiya sahələrini tərk edərək sağalır. Bu lezyonların ardıcıl məhsulu bir neçə ay ərzində baş verir. Histopatologiya sifilisdə müşahidə edilənə bənzəyir, minimal damar dəyişiklikləri və endotel hüceyrələrinin proliferasiyası yoxdur. Gec dağıdıcı mərhələ, bəzən üçüncü dərəcəli yaws adlanır, sümüklərin və periosteumun, xüsusən də ayaqların və ön kolların uzun sümüklərinin, ayaqların və əllərin sümüklərinin treponemal infeksiyasını əhatə edir. Patoloji tapıntılar sifilisin üçüncü mərhələsində müşahidə olunanlara bənzəyir. Sümüklərdə və yumşaq toxumalarda yüksək dərəcədə dağıdıcı diş ətləri də yarana bilər. Diaqnoz coğrafi mövqedən, klinik təzahürlərdən, ekssudatlarda treponemlərin nümayişindən və müsbət serologiyadan asılıdır. Sifilis və yawların birgə mövcud olduğu bölgələrdə qəti diaqnoz lazım deyil, çünki hər ikisi penisillin tərəfindən asanlıqla aradan qaldırıla bilər.

Pinta

Pinta, səbəb oldu T karateum, Mərkəzi və Cənubi Amerikanın tropik ərazilərində endemikdir. Son zamanlar ümumi iş sayının 500.000 olduğu təxmin edilir. Yoluxma insandan insana qeyri-cinsi əlaqə yolu ilə baş verir. Əksər hallarda ilk növbədə uşaqlarda və yeniyetmələrdə baş verir.

Birincili lezyon 2-6 ay ərzində dəriyə daxil olan yerdə düz, eritematoz papula və ya papüllər qrupu şəklində inkişaf edir. Bu lezyonlar və təsadüfi peyk lezyonları bir neçə ay ərzində böyüyür və pullu səthləri olan lövhələr əmələ gətirir. İkincil lezyonlar 2-18 ay və ya daha uzun müddət sonra baş verir və xora və hiperxrom yamaqları ehtiva edir. Adətən əllər, ayaqlar və baş dərisi yoluxur. Pintanın gec mərhələlərində hiperxromiya və akromiya yamaqları, nizamsız akantoz və epidermal atrofiya daxildir. Lezyonlar əvvəlcə hiperpiqmentasiya ilə sağalır, lakin zaman keçdikcə çapıqlar səbəbindən depiqmentasiya və hiperkeratotik olur. Treponemlər normal melanin piqmentasiyasını pozur və 2-5 il ərzində xarakterik dəri təzahürlərini yaradır.

Bu xəstəliyin müxtəlif mərhələləri aydın şəkildə ayrılmır və təzahürlərin üst-üstə düşməsi çox yaygındır. Diaqnoz coğrafi mövqeyə, klinik təzahürlərə, ekssudatlarda orqanizmlərin nümayişinə və müsbət serologiyaya əsaslanır. Penisilin seçilən antibiotikdir. Antibiotik müalicəsindən sonra lezyonların sürətlə sağaldığı sifilis və yawlardan fərqli olaraq, pinta lezyonlarının tam aradan qaldırılması üçün 1 il tələb oluna bilər. Birincili və ya erkən ikincili təzahürlərdən sonra dəri piqmentasiyası normala qayıdır. Sonrakı təzahürlərdə isə piqmentasiya daimi olaraq dəyişməkdə qalır.

Endemik Sifilis

Endemik sifilis, səbəb T solğunluq subsp endemik, Yaxın Şərq və Mərkəzi və Cənubi Afrikanın səhra ərazilərində rast gəlinir. İnsandan insana qeyri-cinsi əlaqə yolu ilə ötürülür. Əksər hallarda iki yaşdan yuxarı uşaqlar yoluxur. Yaws və pinta kimi endemik sifilisin ötürülməsi pis gigiyena ilə əlaqələndirilir. Klinik təzahürlər sifilis və yaws ilə olduqca oxşar ola bilər. Giriş yeri adətən gözlərin və ağızın selikli qişasıdır. Birincili lezyon, kiçik bir papula, halların yalnız bir faizində aşkar edilir. İki-üç aydan sonra selikli qişalarda, dəridə, əzələlərdə və sümükdə ikincil lezyonlar və ya lövhələr əmələ gəlir. Bu sızan papüllər aşınır, sərtləşir, kondilomatoz olur və nəticədə sağalır. Daha sonra klinik təzahürlər 5-15 il ərzində görünmür (latentlik). Gec endemik sifilis dəri və skelet sistemində inkişaf edir. Dəri lezyonları səthi, düyünlü və ya yumrulu ola bilər və ya çox dağıdıcı, dərin diş ətləri ola bilər. Dağıdıcı sümük lezyonları tez-tez tibiada lokallaşdırılır. Diaqnoz coğrafi mövqedən, klinik təzahürlərdən, ekssudatdakı treponemlərdən və müsbət serologiyadan asılıdır. Penisilin endemik sifilisi aradan qaldırır.



Şərhlər:

  1. Shet

    Tamamilə yararsızdır.

  2. Gamble

    Səhv edirsən. Mən əminəm. Müzakirə etməliyik. PM-də mənə yazın, sizinlə danışır.

  3. Franklin

    Əlbətdə bir neçə gözəl an var, amma daha çox şey gözlədim !!!

  4. Adalwin

    Bağışlayın, sözünüzü kəsdiyim üçün mən də öz fikrimi bildirmək istərdim.

  5. Freowine

    Çox gülməli mesaj



Mesaj yazmaq