Məlumat

Hesablama molekulyar təkamülünə dair kitab təklifi

Hesablama molekulyar təkamülünə dair kitab təklifi


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Hazırda Yangın Hesablamalı Molekulyar Təkamül kitabını oxuyuram. Alternativ kitablar tövsiyə edə bilərsinizmi?

Mən bunu konseptual müzakirədə çatışmazlıq hesab edirəm (daha çox riyaziyyat və statistik incəliklərə yönəlib). Mən bunları nə üçün etdiyimizi və Yang kitabında təqdim olunan ideyaların güclü və zəif tərəflərini müzakirə edən bir şey tapmaq istərdim ki, bunlar həddindən artıq mütəxəssis olmasa da - daha çox sahəyə giriş mətni.

Filogenetik kitablara giriş varmı?


Coursera.org kursunu təklif edərdim:

Hesablamalı Molekulyar Təkamül

Anders Gorm Pedersen tərəfindən

Danimarka Texniki Universiteti (DTU)

PS: Daha yaxşı kitab tapmısınızsa, bizə deyin!


Kitabın rəyləri

  • Xülasə, Ziheng Yang, bu sahəyə digər töhfələrdə qeyd olunmayan hesablama molekulyar təkamülün aspektlərini vurğulayan çox maraqlı və oxunaqlı bir kitab təqdim etdi. O, həmçinin gələcək tədqiqatlar üçün geniş yer təmin edən açıq problemlərə işarə edir. Kitab oxucunu tədricən maarifləndirmək üçün əsas mövzuları məntiqi ardıcıllıqla əhatə edir. O, mövzuları müvafiq bioloji motivlərlə yüksək səviyyədə təfərrüatlı şəkildə təsvir edir və dəyərli müzakirələrlə doludur.
    Kitab məzun kompüter alimləri, riyaziyyatçılar və bioloqlar üçün çox tövsiyə olunur. Bununla belə, bu sahədə yeni başlayan hər bir şəxs bilməlidir ki, kitabdakı arqumentasiyaya əməl etmək üçün böyük riyazi, statistik və bioloji biliklər lazımdır. Ziheng Yang hesablama molekulyar təkamülünə bəzən çox fərdi bir baxış təqdim etsə də, kitab bu sahənin düşündürücü aspektlərinin dəyərli mənbəyidir.

Le Sy Vinh və Arndt von Haeseler Sistematik Biologiya 56: 1024-1026 (2007)

  • Bu kitabı fərqləndirən, onun yazıldığı səlahiyyət və düşüncəliliyi, müvafiq ədəbiyyatın hərtərəfli əhatə olunması və eyni məlumat toplusunda müxtəlif üsulların müqayisəsi və təqdim edilməsi üçün hesablama nümunələrində göstərilən böyük diqqətdir. nəticələr aydındır. . Bu həm yeni aspirantlar, həm də köklü tədqiqatçılar üçün əvəzsiz mənbə olacaqdır. . Molekulyar təkamül sahəsində bu cilddə əhatə olunan mövzular mərkəzi yer tutmuşdur. Bu, fikir üçün əsas mənbə olacaq və molekulyar filogeniyaları anlamaq istəyən hər kəs üçün çox faydalı olacaq.

Joe Felsenstein daxil Biologiyanın Rüblük İcmalı 83: 205-206 (2008)


Mündəricat (23 fəsil)

Mutasiyaların zülal qatlanmasına və zülal-zülal qarşılıqlı təsirinə təsirinin proqnozlaşdırılması

Amin Turşu Mutasiyası zamanı Sərbəst Enerji Dəyişikliklərinin Dəqiq Hesablanması

Membran zülal geninin dublikatlarının molekulyar təkamül təhlili üçün protokollar

De Novo ortaya çıxan zülal kodlaşdıran genlərin hesablama proqnozu

Protein Native Konformasiyalarının proqnozlaşdırılması üçün birgə təkamül siqnalları və struktur əsaslı modellər

Santos, Ricardo Nascimento (və başqaları)

Bayes qrafik modelləri ilə amin turşularının birgə təkamülünün aşkarlanması

Zülallarda kontekstdən asılı mutasiya effektləri

Əcdadlardan qalma zülal ardıcıllığının, strukturunun və molekulyar funksiyasının yüksək məhsuldarlıqlı rekonstruksiyası

Ataların ardıcıllığının yenidən qurulması mərhələli təkamül uyğunlaşmasının aydınlaşdırılması üçün bir vasitə kimi

Struktur Məlumatdan İstifadə Edərək Statistik Çox Ardıcıllıq Alignmentinin və Ağac Nəticəsinin Təkmilləşdirilməsi

Zülal sabitliyinin ardıcıllığın təkamülünə təsiri: filogenetik nəticəyə tətbiqlər

Protein məkanında məlum strukturlar arasında naviqasiya

Yüksək dərəcədə ayrılmış təkrar zülal ailələrində ardıcıllığın homologiyasını aşkar etmək üçün qrafik əsaslı yanaşma

Ardıcıllıq, struktur və funksiyadakı dəyişikliklərdən fermentlərin təkamülünün tədqiqi

Protein Homoloqlarının və Domen Sərhədlərinin İterativ Ardıcıllıq Hizalanması ilə Müəyyənləşdirilməsi

Domen əsaslı proteomikaya yol xəritəsi

Təkamül məlumatlarına əsasən zülalların üçüncü və dördüncü strukturlarının modelləşdirilməsi

Yeni Host-Patogen Qarşılıqlı Əlaqələrin İnterfeys Əsaslı Struktur Proqnozu

MoRFpred ilə pozulmuş zülalların funksiyalarının proqnozlaşdırılması

Oldfield, Christopher J. (və başqaları)

Protein Konformasiya Müxtəlifliyinin Tədqiqi

Monzon, Alexander Miguel (və başqaları)

ABodyBuilder istifadə edərək yüksək məhsuldarlıqlı antikor strukturunun modelləşdirilməsi və dizaynı

CADEE istifadə edərək Silico-Yönləndirilmiş Təkamüldə

Düzəliş: Struktur Məlumatdan istifadə edərək Statistik Çoxsaylı Ardıcıl Düzəlişin və Ağac Nəticəsinin Təkmilləşdirilməsi


Mündəricat (25 fəsil)

Genom Biologiyası və Müxtəlifliyə Giriş

Ehtimal, Statistika və Hesablama Elmləri

Hesablamalı molekulyar təkamülə çox da uzun olmayan bir giriş

Aris-Brosou, Stéphane (və başqaları)

Nəticə Orfologiya və Paralogiya

Köçürülə bilən elementlər: təsnifat, identifikasiya və onların müqayisəli genomika aləti kimi istifadəsi

Makałowski, Wojciech (və başqaları)

Müasir Filogenomika: Çoxnövlü Koalessensiya Modelindən istifadə edərək Filogenetik Ağacların Tikintisi

Filogenetik Ağacların Genom Geniş Müqayisəli Təhlili: Həyatın Prokaryotik Meşəsi

Şəbəkə düşüncəsinin arxasındakı metodologiya: mikrob mürəkkəbliyi və təkamülü təhlil etmək üçün qrafiklər

Genom miqyaslı verilənlər toplusundan istifadə edən Bayes molekulyar saatı

Aseksual Növlərə qarşı Özünə qarşı Outcrossingdə Genom Təkamülü

Genomlara təsir edən seleksiya

Genomik Ardıcıllıqda Darvinin Axtarılması: Etibarlılıq və Müvəffəqiyyət Model və Məlumat Arasındakı Əlaqədən asılıdır

Jones, Christopher T. (və b.)

Viral genomların təkamülü: seçim, rekombinasiya və digər qüvvələr arasında qarşılıqlı əlaqə

Spielman, Stephanie J. (və başqaları)

Protein Domeni Memarlıqlarının Təkamülü

Genom məzmununun təkamülünə dair yeni anlayışlar: milçəklərdə və insanlarda köçürülə bilən elementlərin populyasiya dinamikası

Assosiasiya Xəritəçəkmə və Xəstəlik: Təkamül Perspektivləri

Əcdadların populyasiya genomikası

Ətraf Mühit ardıcıllığının təhlilinə giriş: MEGAN ilə metagenomika

Metagenomik Tədqiqatlar və Klinik Sınaqlardan əldə edilən məlumatların təhlili üçün çoxsaylı məlumatların təhlili və statistik yanaşmalar

Təkamül Tədqiqatları üçün Sistem Genetikası

Heterojen bioloji verilənlər bazalarının semantik inteqrasiyası və zənginləşdirilməsi

BEAGLE istifadə edərək Bayesian Filogenetika və Filodinamikada Yüksək Performanslı Hesablama


Hesablama molekulyar təkamülünə dair kitab təklifi - Biologiya

[Ev] Brenner Hesablama Biologiyası Tədqiqat Qrupu Hesablama biologiyası kitablar

Aşağıda başlığa görə sıralanmış hesablama biologiyası kitablarının siyahısı verilmişdir. Bu siyahıya əlavələr xoş olardı.

Bioloqlar üçün bioinformatikaya ən yaxşı qısa girişlərdən biri də budur Bioinformatikaya meyllər bələdçisi (pulsuz, qeydiyyat tələb olunur).

Mark Ptashne. Genetik keçid: faq və ali orqanizmlər. 1992. Blackwell Science, Inc.. 0865422095.

Greg Gibson, Spencer Muse. Genom Elminin Başçısı. Sinauer Associates. 0878932348.

Dan Gusfield. Sətirlər, ağaclar və ardıcıllıqlar üzrə alqoritmlər: kompüter elmləri və hesablama biologiyası. 1997. Cambridge University Press. 0521585198.

Bradley Efron, Robert J. Tibshirani, Brad Efron. Bootstrap-a giriş, cild 57. 1994. CRC Press. 0412042312.

Marqaret O. Dayhoff. Zülal ardıcıllığı və quruluşu atlası, cild 5 əlavə 1 . 1973. Milli Akademiya Mətbuatı. 0912466049.

Marqaret O. Dayhoff. Zülal ardıcıllığı və quruluşu atlası, cild 5 əlavə 3 . 1978. Milli Akademiya Mətbuatı. 0912466073.

James Tisdall. Bioinformatika üçün Perl başlanğıcı. 2001. O'Reilly. 0596000804.

Jeffries Wyman, Stanley J. Gill. Bağlama və əlaqə: Bioloji Makromolekulların Funksional Kimyası. 1990. Universitet Elmi Kitabları. 0935702563.

Donald Voet, Judith G. Voet. Biokimya. 1998. John Wiley & Sons, Inc.. 047132213X.

Christopher K. Mathews, Chris Matthews, Kensal E. Van Holde. Biokimya. 1995. Benjamin-Cummings Publishing. 0805339310.

Lubert Stryer. Biokimya (4E & CDR Media) . 1995. WH Freeman and Co.. 071673687X.

Donald Voet, Judith G. Voet. Biokimya, 2E, Həllər üzrə Təlimatlar. 1995. John Wiley & Sons, Inc.. 0471058610.

Douglas W. Smith. Biocomputing: informatika və genom layihələri. 1994. Akademik Mətbuat. 0126530351.

Migel Andrade. Bioinformatika və genomlar: Mövcud Perspektivlər. 2003. Horizon Scientific Press. 1898486476.

Andreas Baxevanis, B.F.Francis Ouellette. Bioinformatika: genlərin və zülalların təhlili üçün praktiki bələdçi. 1998. John Wiley & Sons, Inc.. 0471191965.

Stenli Letovski. Bioinformatika: verilənlər bazası və sistemlər. 1999. Kluwer Academic Publishers. 079238573X.

Jean-Michel Claverie, Sedric Notredame. Dummies üçün bioinformatika. 2003. Wiley-Liss. 0764516965.

Pierre Baldi, Soren Brunak. Bioinformatika: Maşın öyrənmə yanaşması (Adaptiv hesablama və maşın öyrənməsi). 1998. MIT Press. 026202442X.

MY Gaplerin, EV Koonin. Bioinformatika və genomika. 2003. Springer-Verlag New York, Inc.. 1898486409.

Human H. Rəşidi, Lukas K. Buehler. Biologiya Elmində və Tibbdə Bioinformatikanın Əsasları Tətbiqləri. 1999. CRC Press. 0849323754.

Genetiklər üçün bioinformatika. 2003. Wiley-Liss. 0470843934.

Stephen Misener, Stephen A. Krawetz. Bioinformatika metodları və protokolları. 2000. Humana Press. 0896037320.

Stuart M. Braun. Bioinformatika: biokompüter və internet üçün bioloqun bələdçisi. 2000. Eaton Nəşriyyatı. 188129918X.

Bioinformatika: Genomlardan Narkotiklərə. 2002. Wiley-Liss. 3527299882.

David W. Mount. Bioinformatika: Ardıcıllıq və Genom Analizi. 2001. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 0879695978.

S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison. Bioloji ardıcıllığın təhlili: zülalların və nuklein turşularının ehtimal modelləri. 1999. Cambridge University Press. 0521629713.

Kempbell, Reece. Biologiya - 6-cı nəşr. 2002. Benjamin-Cummings Publishing. 0805366245.

Davison və başqaları. Bootstrap Metodları və Onların Tətbiqləri. 2002. Cambridge University Press. 0521574714.

Həyatın sirlərinin hesablanması: riyaziyyat elmlərinin molekulyar biologiyada tətbiqi. 1995. Milli Akademiya Mətbuatı. 0309048869.

Eberhard O. Voit. Biokimyəvi Sistemlərin Hesablama Analizi. 2000. Cambridge University Press. 0521785790.

Həmid Bolouri. James M. Bower. Biokimyəvi Şəbəkələrin Modelləşdirilməsi üçün Hesablama Metodları (Hesablama Molekulyar Biologiya Seriyası) . 2001. MIT Press. 0262024810.

Molekulyar Biologiyada Hesablama Metodları. 1998. Elsevier Science. 0444502041.

Geyl Rodos. Kristalloqrafiya Crystal Clear etdi. 2000. Akademik Mətbuat. 0125870728.

CSB2002 Bioinformatika Prosedurları. 2002. IEEE Computer Society Press. 0-7695-1653-x.

Bioinformatikada Mövcud Protokollar. 2002. Wiley-Liss.

Soraya de Çadarevyan. Həyat üçün dizaynlar: İkinci Dünya Müharibəsindən sonra Molekulyar Biologiya. 2002. Cambridge University Press. 0521570786.

Cynthia Gibas və Per Jambeck. Bioinformatika kompüter bacarıqlarının inkişafı. 2001. O'Reilly. 1565926641.

A. Malcolm Campbell, Laurie J. Heyer. Genomikanı, Proteomikanı və Bioinformatikanı kəşf etmək. 2003. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 0805347224.

Baldi və başqaları. DNT mikroarrayları və gen ifadəsi. 2002. Cambridge University Press. 0521800226.

DNT Microarrays: praktik yanaşma. 1999. TeleChem Int'l. Inc.. 0199637768.

Bruce Alberts, Dennis Bray, Alexander Johnson, Julian Lewis, Peter Walter, Keith Roberts, Martin Raff. Əsas Hüceyrə Biologiyası: Hüceyrənin Molekulyar Biologiyasına Giriş. 1997. Garland nəşriyyatı. 0815320450.

George M. Malacinski, David Freifelder. Molekulyar Biologiyanın Əsasları. 1998. Jones & Bartlett Pub.. 0867208600.

Karl Zimmer. Təkamül: İdeyanın Zəfəri. 2002. HarperCollins Publishers. 0060958502.

Leonard J. Banaszak. Struktur biologiyanın əsasları. 2000. Akademik Mətbuat. 0120777002.

Sistem Biologiyasının Əsasları. 2002. TriLiteral MMC. 0262112663.

MY Gaplerin, EV Koonin. Hesablama genomikasında sərhədlər. 2003. Caister Academic Press. 0954246446.

Dan E. Krane, Michael L. Raymer. Bioinformatikanın əsas konsepsiyası. 2003. Benjamin-Cummings Publishing. 0805346333.

Donald Voet, Judith G. Voet, Charlotte Amerley Pratt. Biokimyanın əsasları. 1999. John Wiley & Sons, Inc.. 0471586501.

Graur və Li. Molekulyar təkamülün əsasları. 1999. Sinauer Associates. 0878932666.

Benjamin Lewin. Gen VII. 1999. Oxford University Press. 0198792778.

Martin yepiskop. Genetik verilənlər bazaları. 1999. Akademik Mətbuat. 0121016250.

Genetik Xəritəçəkmə və DNT ardıcıllığı. 1996. Springer-Verlag New York, Inc.. 0387948031.

Matt Ridley. Genom: 24 fəsildə bir növün tərcümeyi-halı. 2004.

T. A. Braun, Austen Braun. Genomlar 2-ci Nəşr. 2002. Wiley-Liss. 0471250465.

Reks A. Dwyer. Genomik Perl. 2003. Cambridge University Press. 052180177. HarperCollins Publishers. 0060932902.

Genomik Texnologiyalar: İndiki və Gələcək. 2002. Horizon Scientific Press. 095424642x.

Sandor Suhai. Genomika və Proteomika: Funksional və Hesablama Aspektləri. 2000. Kluwer Academic Publishers. 0306463121.

Tom Strachan, Andrew P. Oxu. İnsan molekulyar genetikası. 1999. John Wiley & Sons, Inc.. 0471330612.

Maks Perutz. Kaş ki, səni daha əvvəl qəzəbləndirəydim. 1998. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 0879695242.

Artur M. Lesk. Bioinformatikaya giriş. 2002. Oxford University Press. 0199251967.

Teresa K. Attwood, David J. Parry-Smith. Bioinformatikaya giriş. 1999. Longman Ali Təhsili. 0582327881.

Michael S. Waterman. Hesablama biologiyasına giriş: xəritələr, ardıcıllıqlar və genomlar. 1995. Chapman and Hall. 0412993910.

Joao Carlos Setubal, Joao Meidanis, Joao C. Setabal. Hesablama molekulyar biologiyasına giriş. 1997. Brooks/Cole Pub. Co.. 0534952623.

Karl-İvar Branden, Con Tuz. Protein strukturuna giriş. 1999. Garland nəşriyyatı. 0815323050.

Janos Podani. Çoxvariantlı Bioloji Məlumatların Tədqiqatına Giriş. 2000. Backhuys Publishers. 9057820676.

Richard C. Lewontin. Mütləq belə deyil: insan genomunun xəyalı və digər illüziyalar. 2000. New York Review of Books. 0940322102.

David Flanagan. Qısaca Java, 3-cü Nəşr. 1999. O'Reilly. 1565924878.

Vladimir S. Cherkassky, Filip M. Mulier. Məlumatlardan öyrənmək: anlayışlar, nəzəriyyə və üsullar. 1998. John Wiley & Sons, Inc.. 0471154938.

Niemeyer, Knudsen. Java öyrənmək. 2002. O'Reilly. 0596002858.

Randal Schwartz və Tom Phoenix. Perl öyrənmək, 3-cü nəşr. 2001. O'Reilly. 0596001320.

Anthony William Fairbank Edwards. Ehtimal. 1992. Johns Hopkins University Press. 0801844436.

WR Gilks, S Richardson, DJ Spiegelhalter. Markov Chain Monte Carlo Təcrübədə. 1996. CRC Press. 0412055511.

DNT ardıcıllığı üçün riyazi üsullar. 1989. CRC Press. 084936664X.

Molekulyar Biologiya üçün Riyazi Dəstək: 1994-1998-ci illərdə Molekulyar Biologiyaya Riyazi Dəstəkdə Xüsusi İllə Əlaqədar Sənədlər (Dimacs Series) DIMACS/47. 1999. Amerika Riyaziyyat Cəmiyyəti. 0821808265.

Enzimologiyada üsullar: ədədi kompüter üsulları. 1992. Akademik Mətbuat. 0121821110.

Enzimologiyada üsullar: ədədi kompüter üsulları, B hissəsi. 1994. Akademik Mətbuat. 0121821412.

Methods in Enzimology vol. 266. 1996. Akademik Mətbuat. 0121821676.

Mark Şena. Mikroarray Bioçip Texnologiyası. 2000. TeleChem Int'l. Inc.. 1881299376.

Kohane, Kho, Butte. İnteqrativ Genomika üçün Mikroarraylar. 2000. MIT Press. 026211271x.

Dennis Bray, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, James D. Watson. Hüceyrənin Molekulyar Biologiyası. 1994. Garland nəşriyyatı. 0815316194.

Alberts, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. Hüceyrənin Molekulyar Biologiyası - 4-cü Ed. . 2002. Garland nəşriyyatı. 0815332181.

John Wilson, Tim Hunt. Hüceyrənin Molekulyar Biologiyası 3 Problemlər Kitabı. 1994. Garland nəşriyyatı. 0815316216.

Harvey Lodiş, Arnold Berk, S. Lourens Zipurski, Pol Matsudaira. Molekulyar Hüceyrə Biologiyası (CdRom ilə). 1999. WH Freeman and Co.. 071673706X.

Wen-Hsiung Li. Molekulyar təkamül. 1997. Sinauer Associates. 0878934634.

Roderik D. M. Page, Edvard C. Holms. Molekulyar təkamül: Filogenetik yanaşma. 1998. Blackwell Science, Inc.. 0865428891.

Molekulyar Təkamül: Zülalın Kompüter Təhlili (meth enz cild 183). 1990. Akademik mətbuat. 012182084X.

Molekulyar sistematika. 1996. Sinauer Associates. 0878932828.

C. H. Wu, J. W. McLarty. Neyron şəbəkələri və genom informatikası. 2000. Elsevier Elm. 0080428002.

Christopher M. Bishop. Nümunələrin tanınması üçün neyron şəbəkələri. 1995. Oxford University Press. 0198538642.

J. Zupan, J. Gasteiger. Kimya və Dərman Dizaynında Neyron Şəbəkələri. 1999. Wiley-VCH. 3527297790.

Russell F. Doolittle. URF və ORF-lərin: törəmə amin turşusu ardıcıllığının necə təhlil ediləcəyinə dair primer. 1987. Universitet Elmi Kitabları. 0935702547.

Jason T. L. Wang, Bruce A. Shapiro, Dennis Elliot Shasha. Biomolekulyar məlumatlarda nümunə kəşfi: Alətlər, Texnikalar və Tətbiqlər. 1999. Oxford University Press. 0195119401.

Barry G. Hall. Filogenetik ağac asanlaşdırıldı. 2001. Sinauer Associates. 0878933115.

Minoru Kanehisa. Post-Genom İnformatika. 2000. Oxford University Press. 0198503261.

Genom Analizi və Genomika Prinsipləri. Blackwell Science, Inc.. 1405101202.

Proseslər - Molekulyar Biologiya üçün İntellektual Sistemlər üzrə 1-ci Beynəlxalq Konf. 1993. AAAI Press. 0929280474.

Proseslər - Molekulyar Biologiya üçün İntellektual Sistemlər üzrə 2-ci Beynəlxalq Konf. 1994. AAAI Press. 0929280687.

Proceedings - Molekulyar Biologiya üçün Ağıllı Sistemlər üzrə 3-cü Beynəlxalq Konf. 1995. AAAI Press. 0929280830.

Proseslər - Molekulyar Biologiya üçün Kəşfiyyat Sistemləri üzrə 4-cü Beynəlxalq Konf. 1996. AAAI Press. 15573500022.

Proceedings - Molekulyar Biologiya üçün Ağıllı Sistemlər üzrə 6-cı Beynəlxalq Konf. AAAI Press. 01577350537.

Proseslər - Molekulyar Biologiya üçün Ağıllı Sistemlər üzrə 7-ci Beynəlxalq Konf. 1999. AAAI Press. 01577350839.

Proseslər - Molekulyar Biologiya üçün İntellektual Sistemlər üzrə 8-ci Beynəlxalq Konf. 2000. AAAI Press. 01577351150.

Larry Wall, Tom Christiansen və Jon Orwant. Proqramlaşdırma Perl, 3-cü Nəşr. 2000. O'Reilly. 0596000278.

Laszlo Patti. Protein təkamülü. 1999. Blackwell Science, Inc.. 0632047747.

Marqaret O. Dayhoff. Zülal seqmenti lüğəti 78: Zülal ardıcıllığı və quruluşu Atlasından, cild 5 və əlavələr 1, 2 və 3. 1978. Milli Akademiya Mətbuatı. 0912466081.

Protein strukturunun proqnozu: praktik yanaşma. 1997. IRL Press, Oxford University Press. 0199634963.

Gregory Petsko və Dagmar Ringe. Zülallar: Ardıcıllıqdan Quruluşa. New Science Press Ltd.

M. R. Wilkins, K. L. Williams, R. D. Appel, D. F. Hochstrasser. Proteom Tədqiqatı: Funksional Genomikada Yeni Sərhədlər (Prinsiplər və Təcrübə). 1997. Springer-Verlag New York, Inc.. 3540627537.

Li Silver. Edenin yenidən qurulması: Genetik Mühəndislik və Klonlaşdırma Amerika Ailəsini Necə Dəyişdirəcək. 1998. HarperCollins Publishers. 0380792435.

E.V. Koonin və M.Y. Qalperin. Ardıcıllıq - Təkamül - Funksiya: Müqayisəli Genomikada hesablama yanaşmaları. 2003. Kluwer Academic Publishers. 1402072740.

Darryl Leon, Scott Markel.Qısaca ardıcıllıq təhlili. 2003. O'Reilly. 059600494X.

Gunnar von Heijne. Molekulyar biologiyada ardıcıllıq təhlili: xəzinə və ya əhəmiyyətsiz axtarış. 1987. Akademik mətbuat. 0127251308.

Geoffrey C. Bowker, Susan Leigh Star. Şeylərin çeşidlənməsi: təsnifat və onun nəticələri. 2000. MIT Press. 0262522950.

Ben-Hui Liu. Statistik genomika: əlaqə, xəritəçəkmə və QTL analizi. 1997. CRC Press. 0849331668.

Philip E. Bourne, Helge Weissig. Struktur bioinformatika. 2002. Wiley-Liss. 0471201995.

Donald Ervin Knuth, Donald E. Knuth. Kompüter proqramlaşdırma sənəti, cildlər 1-3 qutulu . 1997. Addison-Wesley. 0201896834, 0201896842, 0201896850.

Horace Freeland Judson. Səkkizinci yaradılış günü. 1996. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 0879694785.

Charles R. Cantor, Cassandra L. Smith, İnsan Genomu Layihəsi. Genomika: İnsan Genomu Layihəsinin arxasındakı Elm və Texnologiya. 1999.John Wiley & Sons, Inc.. 0471599085.

Clark Kerr. Qızıl və Mavi. 2001. Kaliforniya Universiteti Mətbuatı. 0520223675.

Patwardhan, Siever, Spainhur. Perl CD Bookshelf Version 3.0. 2002. O'Reilly. 0596003897.

Jared Diamond. Üçüncü Şimpanze: İnsan Heyvanının Təkamülü və Gələcəyi. 1992. Harpercollins Publisher. 006098403.

Clark Kerr. Universitetin İstifadələri. 2001. Harvard Universiteti Nəşriyyatı. 0674005325.

Genom Tədqiqatında Nəzəri və Hesablama Metodları. 1997. Plenum Pub. Corp.. 030645503X.

David Sankoff, Cozef Kruskal. Zaman əyilmələri, simli düzəlişlər və makromolekullar: ardıcıllığın müqayisəsinin nəzəriyyəsi və təcrübəsi. 1983. Addison-Wesley. 0201078090.

Maksim D. Frank-Kamenetskii, Lev Liapin (tərcüməçi). DNT-nin açılması: Həyatın Ən Əhəmiyyətli Molekulu. 1997. Perseus Pub.. 0201155842.


Hesablama molekulyar təkamülünə dair kitab təklifi - Biologiya

Laboratoriya və ya sinifiniz üçün toplu endirimlər mövcuddur. Sorğu üçün bura klikləyin.

Elektron kitablar Adobe Digital Editions proqram təminatından istifadə edir. Ətraflı məlumat üçün bura klikləyin.

Təsvir

Biologiya daha kəmiyyətli və hesablamalı olduqca, artan sayda fiziki alim, riyaziyyatçı və mühəndis genomika, inkişaf biologiyası, nevrologiya və sistem biologiyası kimi sahələrə keçir. Molekulyar biologiya elmi bütün bu mövzuların əsasını təşkil edir və onun əsas anlayışlarını və istifadə olunan əsas eksperimental üsulları başa düşmək vacibdir.

Bu kitab riyaziyyatçılar, fiziklər və hesablama alimləri üçün xüsusi olaraq hazırlanmış molekulyar biologiyaya giriş kursunu təqdim edir. Orqanizmin inkişafına, genetik xüsusiyyətlərə və insanın təkamülünə keçməzdən əvvəl DNT, gen, zülal və hüceyrələrin əsas xüsusiyyətlərini təqdim etməklə başlayır. Hər bir halda əsas anlayışlar yeni nəsil ardıcıllıq, kütləvi spektrometriya və yüksək məhsuldarlıqlı ekranlar kimi son texnoloji nailiyyətlər kontekstində təsvir edilir. Beləliklə, kitab oxuculara molekulyar biologiyanın əsaslarından hüceyrə və inkişaf biologiyasında, genomikada və sintetik biologiyada istifadə olunan qabaqcıl üsulları dərk etməyə sürətlə keçməyə imkan verir.

İçindəkilər

Rəylər

“. yüksək əlçatandır. molekulyar biologiyaya tez, lakin tam giriş əldə etmək istəyən hər kəs üçün əvəzolunmazdır.”
Seçim


Müəlliflər üçün bələdçi

Molekulyar Filogenetika və Təkamül Darvinin arzusunu "təbiətin hər bir böyük krallığının kifayət qədər həqiqi şəcərə ağaclarına sahib olmaq" arzusuna çatdırmağa həsr edilmişdir." Jurnal bizim filogeniya və təkamül haqqında anlayışımızı inkişaf etdirən, filogenetik cəhətdən daha dəqiq taksonomik təsnifatların inkişafı üçün molekulyar tədqiqatlar üçün forum təqdim edir. və nəticədə həyatın bütün şaxələndirici xətləri üçün vahid təsnifat gətirir. MƏSTƏSNA nəzəri və ya empirik irəliləyişlər təklif edərsə, filocoğrafi tədqiqatlar nəşr üçün nəzərdən keçiriləcəkdir.

Jurnal sistematik və təkamüllü bioloqlar cəmiyyətini maraqlandıran, xüsusən bioinformatika, hesablama biologiyası, molekulyar biologiya və orqanizm biologiyası kimi sahələrdə multidissiplinar məqalələri təşviq edir. Bundan əlavə, molekulyar səviyyədə ifadə edilən təkamül prosesləri və mexanizmləri ilə bağlı yeni tapıntıların təqdimatları və təkamül tarixinin molekulyar məlumatlardan (məsələn, yeni və ya daha güclü kompüter alqoritmlərinin təsviri kimi) yenidən qurulması metodologiyası ilə məşğul olanların təqdimatı xoşdur. ortoloji nukleotid və ya amin turşusu ardıcıllığından filogenetik ağacların qurulması üçün). Molekulyar təkamülün mexanizm və proseslərini daha dərindən başa düşmək molekulyar təkamülün daha dəqiq modellərinə gətirib çıxarmalıdır ki, bu da öz növbəsində ardıcıllıq məlumatlarından təkamül tarixinin yenidən qurulması üçün daha yaxşı alqoritmlərin işlənib hazırlanmasını asanlaşdırmalıdır.

Bir neçə takson, tək molekulyar markerlərə əsaslanan və ya müsbət Darvin seçimini yoxlamaq üçün kodon əsaslı metodlardan istifadə edən, lakin iddia edilən seçilmiş amin turşusu dəyişikliklərinin adaptiv fenotipik təsirə səbəb olduğuna dair eksperimental sübutlar olmadığı halda sənədlər qəbul edilməyəcək.

Müəlliflər üçün faydalar
Biz həmçinin pulsuz PDF sənədləri, liberal müəllif hüquqları siyasəti, Elsevier nəşrlərində xüsusi endirimlər və sair kimi bir çox müəllif üstünlükləri təqdim edirik. Müəllif xidmətlərimiz haqqında ətraflı məlumat üçün bura klikləyin.

Məqalələrin təqdim edilməsi ilə bağlı məlumat üçün Müəlliflər üçün Bələdçimizə baxın. Əlavə məlumat və ya köməyə ehtiyacınız varsa, lütfən, Dəstək Mərkəzimizə müraciət edin

GİRİŞ
Molekulyar Filogenetika və Təkamül Darvinin arzusunu həyata keçirməyə həsr edilmişdir - "Təbiətin hər bir böyük krallığının kifayət qədər həqiqi şəcərə ağaclarına sahib olmaq". Jurnal, filogeniya və təkamül haqqında anlayışımızı inkişaf etdirən, filogenetik cəhətdən daha dəqiq taksonomik təsnifatların inkişafını və nəticədə həyatın bütün şaxələndirici xətləri üçün vahid təsnifat gətirən molekulyar tədqiqatlar üçün forum təqdim edir. Müstəsna nəzəri və ya empirik irəliləyişlər təklif edərsə, filocoğrafi tədqiqatlar nəşr üçün nəzərdən keçiriləcəkdir.

Jurnal sistematik və təkamüllü bioloqlar cəmiyyətini maraqlandıran, xüsusən bioinformatika, hesablama biologiyası, molekulyar biologiya və orqanizm biologiyası kimi sahələrdə multidissiplinar məqalələri təşviq edir. Bundan əlavə, molekulyar səviyyədə ifadə edilən təkamül prosesləri və mexanizmləri ilə bağlı yeni tapıntıların təqdimatları və təkamül tarixinin molekulyar məlumatlardan (məsələn, yeni və ya daha güclü kompüter alqoritmlərinin təsviri kimi) yenidən qurulması metodologiyası ilə məşğul olanların təqdimatı xoşdur. ortoloji nukleotid və ya amin turşusu ardıcıllığından filogenetik ağacların qurulması üçün). Molekulyar təkamülün mexanizm və proseslərini daha dərindən başa düşmək molekulyar təkamülün daha dəqiq modellərinə gətirib çıxarmalıdır ki, bu da öz növbəsində ardıcıllıq məlumatlarından təkamül tarixinin yenidən qurulması üçün daha yaxşı alqoritmlərin işlənib hazırlanmasını asanlaşdırmalıdır.

Bir neçə taksa, tək molekulyar markerlərə əsaslanan və ya müsbət Darvin seçimini yoxlamaq üçün kodon əsaslı metodlardan istifadə edən, lakin iddia edilən seçilmiş amin turşusu dəyişikliklərinin adaptiv fenotipik təsirə səbəb olduğuna dair eksperimental sübutlar olmadığı halda, sənədlər qəbul edilməyəcək.

Adi məqalələrə əlavə olaraq, Baxış-icmal sənədlər də qəbul olunur. İcmal sənədləri mütləq yeni məlumatları ehtiva etmir, onlar molekulyar filogenetikada müəyyən bir sahənin status hesabatıdır.
Adi məqalələr və ya Review sənədləri üçün səhifə məhdudiyyəti yoxdur.

Müəlliflər taksonomik qrup/adları ümumi adlarla əlaqələndirərək molekulyar filogeniyanı daha geniş auditoriyaya aid etməlidirlər ki, məqalələr daha ümumi cəlbedici olsun.

Qısa ünsiyyətlər təxminən 3000 söz də qəbul edilir. Bu sənədlərdə ən çox iki rəqəm, iki cədvəl və otuz istinad olmalıdır. 200 sözdən az qısa xülasə qəbul edilir.

Redaktora məktublar 1000-ə yaxın sözdən ibarət olmalı və cədvəllər, rəqəmlər və yeni məlumatlar olmamalıdır. Əlyazmalar aşağıdakı üslub qaydalarına uyğun hazırlanmalıdır. Bu qaydalardan kənara çıxmaq nəşrin gecikməsinə səbəb olur.

Təqdimatınızı jurnala baxılmaq üçün göndərməzdən əvvəl son yoxlamanı həyata keçirmək üçün bu siyahıdan istifadə edə bilərsiniz. Daha ətraflı məlumat üçün bu Müəlliflər üçün Təlimatın müvafiq bölməsini yoxlayın.

Aşağıdakı maddələrin mövcud olduğundan əmin olun:

Bir müəllif əlaqə məlumatları ilə müvafiq müəllif kimi təyin edilmişdir:
&bull E-poçt ünvanı
&bull Tam poçt ünvanı

Bütün lazımi fayllar yükləndi:
Əlyazma:
&bull Açar sözlər daxil edin
&bull Bütün rəqəmlər (müvafiq başlıqlar daxildir)
&bull Bütün cədvəllər (başlıqlar, təsvir, qeydlər daxil olmaqla)
&bull Mətndəki bütün rəqəm və cədvəl sitatlarının təqdim olunan fayllara uyğun olduğundan əmin olun
&bull Çapda hər hansı bir rəqəm üçün rəngin istifadə olunmalı olub-olmadığını aydın şəkildə göstərin
Qrafik Abstraktlar / Vurğulama faylları (mümkün olduqda)
Əlavə fayllar (mümkün olduqda)

Əlavə mülahizələr
&bull Əlyazması 'orfoqrafiya yoxlanıldı' və 'qrammatika yoxlanıldı'
&bull İstinad Siyahısında qeyd olunan bütün istinadlar mətndə göstərilir və əksinə
&bull Digər mənbələrdən (İnternet daxil olmaqla) müəllif hüquqları ilə qorunan materialın istifadəsi üçün icazə alınmışdır
&bull Müəlliflərin bəyan etmək üçün rəqabət aparan maraqları olmasa belə, rəqabətli maraqlar bəyanatı verilir.
&bull Bu təlimatda təfərrüatlı olan Jurnal siyasətləri nəzərdən keçirilmişdir
&bull Jurnal tələblərinə əsaslanaraq, hakim təklifləri və əlaqə məlumatları təqdim olunur

Əlavə məlumat üçün Dəstək Mərkəzimizə müraciət edin.

Nəşriyyatda etika haqqında məlumatımıza baxın.

Bütün müəlliflər digər insanlar və ya təşkilatlarla onların işinə qeyri-adekvat təsir göstərə bilən (qərəzli) hər hansı maliyyə və şəxsi münasibətləri açıqlamalıdırlar. Potensial rəqabətli maraqlara misal olaraq məşğulluq, məsləhətlər, səhm sahibliyi, qonorar, ödənişli ekspert ifadəsi, patent müraciətləri/qeydiyyatları və qrantlar və ya digər maliyyələşdirmə daxildir. Müəlliflər hər hansı maraqlarını iki yerdə açıqlamalıdırlar: 1. Başlıq səhifəsi faylında (əgər ikiqat anonimləşdirilibsə) və ya əlyazma faylında (əgər tək anonimləşdirilibsə) maraqların xülasəsi bəyannaməsi. Əgər bəyan ediləcək maraqlar yoxdursa, lütfən bunu qeyd edin: “Maraq bəyannamələri: yoxdur”. 2. Jurnalın rəsmi qeydlərinin bir hissəsini təşkil edən ayrıca Maraq Bəyannaməsi formasının bir hissəsi kimi təfərrüatlı açıqlamalar. Potensial maraqların hər iki yerdə bəyan edilməsi və məlumatların üst-üstə düşməsi vacibdir. Ətraflı məlumat.

Təqdimat bəyannaməsi və yoxlanılması

Məqalənin təqdim edilməsi təsvir olunan işin əvvəllər nəşr olunmamasını nəzərdə tutur (referat, çap olunmuş mühazirə və ya akademik tezis formasında istisna olmaqla, daha çox məlumat üçün “Çoxlu, artıq və ya paralel nəşr”ə baxın), onun nəzərdən keçirilmədiyini bildirir. başqa yerdə dərc üçün, onun nəşrinin bütün müəlliflər tərəfindən və işin aparıldığı məsul orqanlar tərəfindən gizli və ya açıq şəkildə təsdiqləndiyini və qəbul edildiyi təqdirdə başqa yerdə eyni formada, ingilis dilində və ya hər hansı digər dildə dərc olunmayacağını dildə, o cümlədən müəllif hüququ sahibinin yazılı razılığı olmadan elektron şəkildə. Orijinallığı yoxlamaq üçün məqaləniz orijinallığın aşkarlanması xidməti Crossref oxşarlıq yoxlaması tərəfindən yoxlana bilər.

Əvvəlcədən çaplar
Nəzərə alın ki, hazır çaplar Elsevier-in paylaşma siyasətinə uyğun olaraq istənilən vaxt istənilən yerdə paylaşıla bilər. Əvvəlcədən çaplarınızı paylaşmaq, məsələn. əvvəlcədən çap serverində əvvəlki nəşr sayılmayacaq (ətraflı məlumat üçün “Birdən çox, lazımsız və ya paralel nəşrə” baxın).

İnklüziv dilin istifadəsi

İnklüziv dil müxtəlifliyi qəbul edir, bütün insanlara hörmət bəsləyir, fərqlərə həssasdır və bərabər imkanları təşviq edir. Məzmun hər hansı bir oxucunun inancları və ya öhdəlikləri ilə bağlı heç bir fərziyyəyə yol verməməlidir və bir şəxsin yaş, cins, irq, etnik mənsubiyyət, mədəniyyət, cinsi oriyentasiya, əlillik və ya sağlamlıq vəziyyətinə görə digərindən üstün olduğunu ifadə edə biləcək heç bir şey ehtiva etməməlidir və inklüziv dildən istifadə etməlidir. boyu. Müəlliflər yazının qərəz, stereotip, jarqon, dominant mədəniyyətə istinad və/və ya mədəni fərziyyələrdən azad olmasını təmin etməlidir. Biz "he, o" və ya "he/she" istifadə etməmək üçün defolt olaraq/mümkün olan yerlərdə cəm isimlərdən ("klinisyenler, xəstələr/müştərilər") istifadə edərək gender neytrallığını axtarmağı məsləhət görürük. Yaş, cins, irq, etnik mənsubiyyət, mədəniyyət, cinsi oriyentasiya, əlillik və ya sağlamlıq vəziyyəti kimi şəxsi atributlara istinad edən deskriptorlardan istifadə etməməyi tövsiyə edirik, əgər onlar uyğun və etibarlıdır. Bu təlimatlar müvafiq dili müəyyən etməyə kömək etmək üçün istinad nöqtəsi kimi nəzərdə tutulub, lakin heç bir halda tam və ya qəti deyil.

Şəffaflıq üçün biz müəllifləri müvafiq CRediT rollarından istifadə edərək məqaləyə fərdi töhfələrini əks etdirən müəllif bəyanatı faylı təqdim etməyə təşviq edirik: Konseptuallaşdırma Məlumatların kurasiyası Formal təhlil Maliyyələşdirmənin əldə edilməsi Tədqiqat Metodologiyası Layihənin idarə edilməsi Resurslar Proqram Təminatına Nəzarət Qiymətləndirmə Vizuallaşdırma Rolları/Yazı - orijinal layihənin yazılması - baxış & redaktə. Müəlliflik bəyanatları ilk olaraq müəlliflərin adları və sonrakı CRediT rol(lar)ı ilə formatlaşdırılmalıdır. Daha ətraflı və bir nümunə

Müəlliflərdən əlyazmalarını təqdim etməzdən əvvəl müəlliflərin siyahısını və sırasını diqqətlə nəzərdən keçirmələri və orijinal təqdimat zamanı müəlliflərin qəti siyahısını təqdim etmələri gözlənilir. Müəllif adlarının müəllif siyahısına əlavə edilməsi, silinməsi və ya dəyişdirilməsi yalnız əlyazma qəbul edilməmişdən əvvəl və yalnız jurnalın redaktoru tərəfindən təsdiqləndiyi halda edilməlidir. Belə bir dəyişikliyi tələb etmək üçün Redaktor müvafiq müəllifdən aşağıdakıları almalıdır: (a) müəllif siyahısındakı dəyişikliyin səbəbi və (b) bütün müəlliflərdən əlavə ilə razılaşdıqları barədə yazılı təsdiq (e-poçt, məktub) , aradan qaldırılması və ya yenidən təşkili. Müəlliflərin əlavə edilməsi və ya çıxarılması halında, bu, əlavə olunan və ya çıxarılan müəllifin təsdiqini əhatə edir.
Yalnız müstəsna hallarda, əlyazma qəbul edildikdən sonra Redaktor müəlliflərin əlavə edilməsini, silinməsini və ya dəyişdirilməsini nəzərdən keçirəcək. Redaktor sorğuya baxdığı müddətdə əlyazmanın nəşri dayandırılacaq. Əgər əlyazma artıq onlayn buraxılışda dərc olunubsa, Redaktor tərəfindən təsdiqlənmiş hər hansı sorğu korrigendumla nəticələnəcək.

Məqalə köçürmə xidməti
Bu jurnal Məqalə köçürmə xidmətimizin bir hissəsidir. Bu o deməkdir ki, əgər Redaktor məqalənizin digər iştirakçı jurnallarımızdan birində daha uyğun olduğunu düşünürsə, sizdən məqaləni onlardan birinə köçürmək barədə düşünməyiniz xahiş oluna bilər. Razısınızsa, məqaləniz yenidən formatlamağa ehtiyac olmadan sizin adınıza avtomatik olaraq köçürüləcək. Nəzərə alın ki, məqaləniz yeni jurnal tərəfindən yenidən nəzərdən keçiriləcək. Ətraflı məlumat.

Məqalə qəbul edildikdən sonra müəlliflərdən “Jurnalın Nəşriyyat Müqaviləsi”ni doldurmaları istəniləcək (bu barədə daha çox məlumata bax). “Jurnalın Nəşriyyat Müqaviləsi” forması və ya bu müqavilənin onlayn versiyasına keçid ilə birlikdə əlyazmanın alınmasını təsdiq edən müvafiq müəllifə e-poçt göndəriləcək.

Abunəçilər öz qurumları daxilində daxili dövriyyə üçün mündəricat və ya məqalələrin siyahısı, o cümlədən tezislər hazırlaya bilərlər. Təşkilatdan kənarda yenidən satış və ya paylama və bütün digər törəmə əsərlər, o cümlədən kompilyasiya və tərcümələr üçün Nəşriyyatçının icazəsi tələb olunur. Müəllif hüququ ilə qorunan digər əsərlərdən çıxarışlar daxil edilərsə, müəllif(lər) müəllif hüquqları sahiblərindən yazılı icazə almalı və məqalədə mənbə(lər)i qeyd etməlidirlər. Elsevier bu hallarda müəlliflər tərəfindən istifadə üçün əvvəlcədən çap olunmuş formalara malikdir.

Qızıl açıq girişli məqalələr üçün: Məqalə qəbul edildikdən sonra müəlliflərdən “Lisenziya Müqaviləsi”ni (ətraflı məlumat) tamamlamaları xahiş olunacaq. Qızıl açıq məqalələrin üçüncü tərəfin icazə verilən təkrar istifadəsi müəllifin istifadəçi lisenziyası seçimi ilə müəyyən edilir.

Müəllif hüquqları
Müəllif olaraq sizin (və ya işəgötürəninizin və ya təşkilatınızın) əsərinizdən təkrar istifadə etmək üçün müəyyən hüquqlarınız var. Ətraflı məlumat.

Elsevier məsuliyyətli paylaşımı dəstəkləyir
Elsevier jurnallarında dərc olunmuş tədqiqatınızı necə paylaşa biləcəyinizi öyrənin.

Maliyyə mənbəyinin rolu

Sizdən tədqiqatın aparılmasına və/və ya məqalənin hazırlanmasına kimin maliyyə dəstəyi verdiyini müəyyən etməyiniz və məlumatların toplanması, təhlili və şərhində tədqiqatın dizaynında sponsor(lar)ın, əgər varsa, rolunu qısaca təsvir etməyiniz xahiş olunur. məruzənin yazılmasında və məqalənin dərcə təqdim edilməsi haqqında qərarda. Əgər maliyyələşdirmə mənbələrinin (mənbələrinin) belə bir iştirakı yoxdursa, bu barədə məlumat verilməlidir.

Əlavə məlumat üçün Açıq Giriş səhifəmizə daxil olun.

Elsevier Tədqiqatçı Akademiyası
Tədqiqatçı Akademiyası erkən və orta karyera tədqiqatçılarını tədqiqat səyahətləri boyunca dəstəkləmək üçün nəzərdə tutulmuş pulsuz e-tədris platformasıdır. Tədqiqatçı Akademiyasındakı "Öyrən" mühiti sizə tədqiqat üçün yazmaq və həmyaşıdların rəyindən keçmək prosesində sizə bələdçilik etmək üçün bir neçə interaktiv modullar, vebinarlar, yüklənə bilən bələdçilər və resurslar təklif edir. Təqdimatınızı təkmilləşdirmək və nəşr prosesini asanlıqla idarə etmək üçün bu pulsuz resurslardan istifadə etməkdən çekinmeyin.

Dil (istifadə və redaktə xidmətləri)
Zəhmət olmasa, mətninizi yaxşı ingilis dilində yazın (Amerika və ya Britaniya istifadəsi qəbul edilir, lakin bunların qarışığı deyil). İngilis dilində olan əlyazmalarının mümkün qrammatik və ya orfoqrafik səhvləri aradan qaldırmaq və elmi ingilis dilini düzəltmək üçün redaktə tələb oluna biləcəyini düşünən müəlliflər Elsevier-in Müəllif Xidmətlərində mövcud olan İngilis Dili Redaktə xidmətindən istifadə etmək istəyə bilərlər.

Onlayn təqdimetmə sistemimiz məqalənizin təfərrüatlarını daxil etmək və fayllarınızı yükləmək prosesində sizə addım-addım rəhbərlik edir. Sistem məqalə fayllarınızı nəzərdən keçirmə prosesində istifadə olunan tək PDF faylına çevirir. Məqalənizi son nəşr üçün çap etmək üçün redaktə edilə bilən fayllar (məsələn, Word, LaTeX) tələb olunur. Bütün yazışmalar, o cümlədən redaktorun qərarı barədə bildiriş və yenidən baxılması üçün müraciətlər elektron poçtla göndərilir.

Əlavə informasiya
Əlavə materialın hazırlanması
Əlavə fayllar müəllifə dəstəkləyici proqramlar, filmlər, animasiya ardıcıllığı, yüksək ayırdetmə təsvirləri, fon məlumat dəstləri, səs klipləri və s. dərc etmək üçün əlavə imkanlar təklif edir. Təqdim olunan əlavə fayllar məqalənin elektron versiyası ilə yanaşı Elsevier Veb məhsullarında, o cümlədən ScienceDirect-də onlayn dərc olunacaq: http://www.sciencedirect.com. Təqdim olunan materialın birbaşa istifadəyə yararlı olmasını təmin etmək üçün tövsiyə etdiyimiz fayl formatlarından birində məlumatları təqdim edin. Materialı məqalə ilə birlikdə elektron formatda təqdim edin və hər bir fayl üçün qısa və təsviri başlıq təqdim edin. Daha ətraflı təlimatlar üçün, lütfən, https://www.elsevier.com/artworkinstructions ünvanında olan sənət əsərlərinə dair təlimat səhifələrimizə daxil olun.

Redaksiya prosesi ilə bağlı suallarınız (o cümlədən nəzərdən keçirilən əlyazmaların statusu) və ya təqdimatlar üzrə texniki dəstək üçün Dəstək Mərkəzimizə müraciət edin.

Bu jurnal tək anonim nəzərdən keçirmə prosesini həyata keçirir. Bütün töhfələr jurnala uyğunluğu üçün ilkin olaraq redaktor tərəfindən qiymətləndiriləcəkdir.Uyğun hesab edilən məqalələr daha sonra yazının elmi keyfiyyətini qiymətləndirmək üçün adətən minimum iki müstəqil ekspert rəyçiyə göndərilir. Redaktor məqalələrin qəbulu və ya rədd edilməsi ilə bağlı yekun qərara görə məsuliyyət daşıyır. Redaktorun qərarı qətidir. Redaktorlar özlərinin yazdıqları və ya ailə üzvləri və ya həmkarları tərəfindən yazılan və ya redaktorun maraq göstərdiyi məhsul və ya xidmətlərə aid olan məqalələrlə bağlı qərarların qəbulunda iştirak etmirlər. İstənilən belə təqdimat jurnalın bütün adi prosedurlarına tabedir, həmyaşıdların rəyi müvafiq redaktordan və onların tədqiqat qruplarından asılı olmayaraq həyata keçirilir. Peer-nəzarət növləri haqqında daha çox məlumat.

Söz emal proqramından istifadə
Faylın istifadə olunan söz prosessorunun yerli formatında saxlanması vacibdir. Mətn tək sütunlu formatda olmalıdır. Mətnin tərtibatını mümkün qədər sadə saxlayın. Məqalənin işlənməsi zamanı əksər formatlaşdırma kodları silinəcək və dəyişdiriləcək. Xüsusilə, mətni əsaslandırmaq və ya sözləri tireləmək üçün söz prosessorunun seçimlərindən istifadə etməyin. Bununla belə, qalın üz, kursiv, alt yazı, yuxarı işarə və s. istifadə edin. Cədvəlləri hazırlayarkən, əgər siz cədvəl şəbəkəsindən istifadə edirsinizsə, hər bir fərdi cədvəl üçün yalnız bir tordan istifadə edin, hər cərgə üçün şəbəkədən istifadə edin. Heç bir şəbəkə istifadə edilmirsə, sütunları hizalamaq üçün boşluqlardan deyil, nişanlardan istifadə edin. Elektron mətn adi əlyazmalara çox oxşar şəkildə hazırlanmalıdır (həmçinin Elsevier ilə Nəşriyyat Təlimatına baxın). Nəzərə alın ki, rəqəmlərinizi mətnə ​​daxil edib-etmədiyinizdən asılı olmayaraq, rəqəmlərin, cədvəllərin və mətn qrafiklərinin mənbə faylları tələb olunacaq. Elektron sənət əsərləri bölməsinə də baxın.
Lazımsız xətaların qarşısını almaq üçün sizə söz prosessorunuzun "orfoqrafiya yoxlaması" və "qrammatika yoxlaması" funksiyalarından istifadə etməyiniz tövsiyə olunur.

Bölmə - nömrələnmiş bölmələr
Məqalənizi aydın şəkildə müəyyən edilmiş və nömrələnmiş bölmələrə bölün. Yarımbölmələr 1.1 (sonra 1.1.1, 1.1.2, . ), 1.2 və s. nömrələnməlidir (referat bölmənin nömrələnməsinə daxil edilmir). Bu nömrələməni daxili çarpaz istinad üçün də istifadə edin: sadəcə “mətnə” istinad etməyin. İstənilən alt bölməyə qısa başlıq verilə bilər. Hər bir başlıq öz ayrıca sətirində göstərilməlidir.

Giriş
Ətraflı ədəbiyyat sorğusundan və ya nəticələrin xülasəsindən qaçaraq, işin məqsədlərini qeyd edin və adekvat məlumat verin.

Material və üsullar
Əsərin müstəqil tədqiqatçı tərəfindən təkrar istehsalına icazə vermək üçün kifayət qədər təfərrüat verin. Artıq dərc edilmiş metodlar ümumiləşdirilməli və istinadla göstərilməlidir. Əvvəllər dərc edilmiş metoddan birbaşa sitat gətirirsinizsə, dırnaq işarələrindən istifadə edin və mənbəyə istinad edin. Mövcud metodlara edilən hər hansı dəyişikliklər də təsvir edilməlidir.

Nəzəriyyə/hesablama
Nəzəriyyə bölməsi Girişdə artıq bəhs olunan məqalənin fonunu təkrar etməməli, genişləndirməli və gələcək iş üçün əsas yaratmalıdır. Bunun əksinə olaraq, Hesablama bölməsi nəzəri əsasdan praktiki inkişafı təmsil edir.

Nəticələr
Nəticələr aydın və qısa olmalıdır.

Müzakirə
Bu, işin nəticələrinin əhəmiyyətini araşdırmalıdır, onları təkrarlamamalıdır. Birləşdirilmiş Nəticələr və Müzakirə bölməsi çox vaxt uyğundur. Geniş sitatlardan və nəşr olunmuş ədəbiyyatın müzakirəsindən çəkinin.

Nəticələr
Tədqiqatın əsas nəticələri qısa Nəticələr bölməsində təqdim edilə bilər ki, bu da tək başına dayana və ya Müzakirə və ya Nəticələr və Müzakirə bölməsinin alt bölməsini təşkil edə bilər.

Lüğət
Zəhmət olmasa məqalənizdə istifadə olunan sahəyə aid terminlərin təriflərini ayrıca siyahı kimi təqdim edin.

Əlavələr
Birdən çox əlavə varsa, onlar A, B və s. kimi müəyyən edilməlidir. Əlavələrdəki düsturlar və tənliklər ayrıca nömrələnməlidir: Eq. (A.1), Eq. (A.2) və s. sonrakı əlavədə, tənlik. (B.1) və s. Eynilə cədvəllər və rəqəmlər üçün: Cədvəl A.1 Şəkil A.1 və s.

Əsas səhifə məlumatı

&öküz Başlıq. Qısa və məlumatlandırıcı. Başlıqlar tez-tez informasiya-axtarış sistemlərində istifadə olunur. Mümkünsə, abreviatura və düsturlardan çəkinin.
&öküz Müəllif adları və mənsubiyyətləri. Lütfən, hər bir müəllifin ad(lar)ını və soyadını (adlarını) aydın şəkildə göstərin və bütün adların düzgün yazıldığını yoxlayın. Siz öz skriptinizdə ingilis transliterasiyasının arxasına adınızı mötərizələr arasına əlavə edə bilərsiniz. Adların altında müəlliflərin mənsubiyyət ünvanlarını (faktiki işin görüldüyü yer) göstərin. Bütün mənsubiyyətləri müəllifin adından dərhal sonra və müvafiq ünvanın qarşısında kiçik hərflə yuxarı hərflə qeyd edin. Ölkə adı və əgər varsa, hər bir müəllifin e-poçt ünvanı daxil olmaqla, hər bir mənsubiyyətin tam poçt ünvanını təqdim edin.
&öküz Müəllif. Hakimlik və nəşrin bütün mərhələlərində, həmçinin nəşrdən sonra yazışmaları kimin idarə edəcəyini aydın şəkildə göstərin. Bu məsuliyyətə Metodologiya və Materiallarla bağlı gələcək sorğuların cavablandırılması daxildir. E-poçt ünvanının göstərildiyinə və əlaqə məlumatlarının müvafiq müəllif tərəfindən yeniləndiyinə əmin olun.
&öküz İndiki/daimi ünvan. Əgər müəllif məqalədə təsvir olunan iş görüləndən sonra köçübsə və ya həmin vaxt səfər edibsə, həmin müəllifin adına dipnot kimi “Hazırkı ünvan” (və ya “Daimi ünvan”) göstərilə bilər. Əsas, mənsubiyyət ünvanı kimi müəllifin həqiqətən əsəri gördüyü ünvan saxlanmalıdır. Belə qeydlər üçün yuxarı işarəli ərəb rəqəmlərindən istifadə olunur.

Əsas məqamlar bu jurnal üçün məcburidir, çünki onlar axtarış motorları vasitəsilə məqalənizin aşkarlığını artırmağa kömək edir. Onlar tədqiqatınızın yeni nəticələrini, eləcə də tədqiqat zamanı istifadə edilmiş yeni metodları (əgər varsa) əks etdirən qısa bir toplu nöqtədən ibarətdir. Zəhmət olmasa buradakı nümunələrə nəzər salın: Nümunə Vurğulamalar.

Vurğulananlar onlayn təqdimetmə sistemində ayrıca redaktə edilə bilən faylda təqdim edilməlidir. Lütfən, fayl adında "Vurğulananlar"dan istifadə edin və 3-5 işarə nöqtəsi daxil edin (hər marker nöqtəsi üçün boşluqlar daxil olmaqla maksimum 85 simvol).

Qrafik abstrakt
Qrafik abstrakt bu jurnal üçün məcburidir. O, onlayn geniş oxucu kütləsinin diqqətini cəlb etmək üçün nəzərdə tutulmuş qısa, şəkilli formada məqalənin məzmununu ümumiləşdirməlidir. Müəlliflər məqalədə təsvir olunan işi aydın şəkildə əks etdirən şəkillər təqdim etməlidirlər. Qrafik tezislər onlayn təqdimetmə sistemində ayrıca fayl kimi təqdim edilməlidir. Şəklin ölçüsü: lütfən, minimum 531 &x1328 piksel (saat və dəfə w) və ya mütənasib olaraq daha çox şəkil təqdim edin. Şəkil 96 dpi adi ekran qətnaməsindən istifadə etməklə 5 və dəfə 13 sm ölçüdə oxunaqlı olmalıdır. Üstünlük verilən fayl növləri: TIFF, EPS, PDF və ya MS Office faylları. Nümunə Qrafik Abstraktlara məlumat saytımızda baxa bilərsiniz.
Müəlliflər öz şəkillərinin bütün texniki tələblərə uyğun olaraq ən yaxşı təqdimatını təmin etmək üçün Elsevier-in İllüstrasiya Xidmətlərindən istifadə edə bilərlər.

Mücərrəddən dərhal sonra Amerika orfoqrafiyasından istifadə edərək, ümumi və cəm terminlərdən və çoxlu anlayışlardan (məsələn, 'və', 'of'dan) qaçaraq maksimum 6 açar söz təqdim edin. İxtisarlar ilə ehtiyatlı olun: yalnız bu sahədə möhkəm qurulmuş abbreviaturalar uyğun ola bilər. Bu açar sözlər indeksləşdirmə məqsədləri üçün istifadə olunacaq.

İxtisarlar
Bu sahədə standart olmayan abbreviaturaları məqalənin birinci səhifəsində yerləşdiriləcək qeyddə müəyyən edin. Abstraktda qaçınılmaz olan bu cür abbreviaturalar ilk qeyd olunanda, eləcə də dipnotda müəyyən edilməlidir. Məqalədə abreviaturaların ardıcıllığını təmin edin.

Təşəkkürlər
Təşəkkürləri məqalənin sonunda ayrıca bölmədə istinadlardan əvvəl birləşdirin və buna görə də onları başlıq səhifəsinə, başlığa haşiyə kimi və ya başqa şəkildə daxil etməyin. Tədqiqat zamanı yardım göstərən şəxsləri burada sadalayın (məsələn, dil yardımı, yazı yardımı və ya məqaləni oxumaq üçün sübut və s.).

Maliyyələşdirmə mənbələrinin formatlaşdırılması
Maliyyələşdiricinin tələblərinə uyğunluğu asanlaşdırmaq üçün maliyyə mənbələrini bu standart şəkildə sadalayın:

Maliyyələşdirmə: Bu iş Milli Sağlamlıq İnstitutları [qrant nömrələri xxxx, yyyy] Bill və Melinda Qeyts Fondu, Seattle, WA [qrant nömrəsi zzzz] və Amerika Birləşmiş Ştatları Sülh İnstitutu [qrant sayı aaaa] tərəfindən dəstəklənib.

Proqrama və ya qrant və mükafatların növünə dair ətraflı təsvirləri daxil etmək lazım deyil. Maliyyələşdirmə blok qrant və ya universitet, kollec və ya digər tədqiqat müəssisəsi üçün mövcud olan digər resurslardan olduqda, maliyyəni təmin edən institut və ya təşkilatın adını təqdim edin.

Tədqiqat üçün heç bir maliyyə ayrılmayıbsa, aşağıdakı cümləni daxil edin:

Bu tədqiqat ictimai, kommersiya və ya qeyri-kommersiya sektorlarında maliyyələşdirmə agentliklərindən heç bir xüsusi qrant almamışdır.

Vahidlər
Beynəlxalq qəbul edilmiş qaydalara və konvensiyalara əməl edin: beynəlxalq vahidlər sistemindən (SI) istifadə edin. Digər vahidlər qeyd edilirsə, lütfən, onların SI-də ekvivalentini verin.

Riyaziyyat düsturları
Riyaziyyat tənliklərini şəkillər kimi deyil, redaktə edilə bilən mətn kimi təqdim edin. Mümkünsə, sadə düsturları normal mətnə ​​uyğun olaraq təqdim edin və kiçik fraksiya şərtləri üçün üfüqi xətt əvəzinə solidus (/) işarəsindən istifadə edin, məsələn, X/Y. Prinsipcə, dəyişənlər kursivlə təqdim edilməlidir. e-nin səlahiyyətləri çox vaxt daha rahat şəkildə exp ilə işarələnir. Mətndən ayrıca göstərilməli olan hər hansı tənlikləri ardıcıl olaraq nömrələyin (əgər mətndə açıq şəkildə istinad edilirsə).

Haşiyələr
Dipnotlardan az istifadə edilməlidir. Məqalə boyu onları ardıcıl olaraq nömrələyin. Bir çox mətn prosessorları mətnə ​​alt qeydlər yarada bilər və bu xüsusiyyətdən istifadə edilə bilər. Əks halda, lütfən, mətndə qeydlərin yerini göstərin və məqalənin sonunda qeydlərin özlərini ayrıca sadalayın. İstinad siyahısına alt qeydləri daxil etməyin.

Elektron sənət əsəri
Ümumi məqamlar
&bull Orijinal sənət əsərinizin vahid hərfindən və ölçüsündən istifadə etdiyinizə əmin olun.
&bull Əgər proqram bu seçimi təmin edirsə, istifadə edilmiş şriftləri daxil edin.
&bull İllüstrasiyalarınızda aşağıdakı şriftlərdən istifadə etməyi hədəfləyin: Arial, Courier, Times New Roman, Symbol və ya oxşar görünən şriftlərdən istifadə edin.
&bull İllüstrasiyaları mətndəki ardıcıllığa görə nömrələyin.
&bull Rəsm fayllarınız üçün məntiqi adlandırma konvensiyasından istifadə edin.
&bull İllüstrasiyalara ayrıca başlıqlar təqdim edin.
&bull İllüstrasiyaları dərc edilmiş versiyanın istədiyiniz ölçülərinə yaxın ölçüdə ölçün.
&bull Hər illüstrasiyanı ayrıca fayl kimi təqdim edin.
&bull Rəngli təsvirlərin rəng görmə qabiliyyəti zəif olanlar da daxil olmaqla hamı üçün əlçatan olmasını təmin edin.

Elektron sənət əsərlərinə dair ətraflı təlimat mövcuddur.
Sizi bu sayta daxil olmağa çağırırıq, burada ətraflı məlumatdan bəzi çıxarışlar verilir.
Formatlar
Elektron sənət əsəriniz Microsoft Office proqramında (Word, PowerPoint, Excel) yaradılıbsa, lütfən, yerli sənəd formatında "olduğu kimi" təqdim edin.
Microsoft Office-dən başqa istifadə olunan proqramdan asılı olmayaraq, elektron rəsm işiniz tamamlandıqda, lütfən, "Fərqli saxla" düyməsini basın və ya şəkilləri aşağıdakı formatlardan birinə çevirin (aşağıda verilmiş xətt təsvirləri, yarımtonlar və xətt/yarım ton birləşmələri üçün ayırdetmə tələblərinə diqqət yetirin) ):
EPS (və ya PDF): Vektor təsvirləri, istifadə olunan bütün şriftləri yerləşdirin.
TIFF (və ya JPEG): Rəngli və ya boz tonlu fotoşəkillər (yarım tonlar), minimum 300 dpi-ə qədər saxlayın.
TIFF (və ya JPEG): Bitmapped (təmiz qara və ağ piksellər) xətt təsvirləri, minimum 1000 dpi-ə qədər saxlayın.
TIFF (və ya JPEG): Bitmaplanmış xətt/yarım ton (rəng və ya boz ton) birləşmələri, minimum 500 dpi-də saxlayın.
Zəhmət olmasa:
&bull Ekran istifadəsi üçün optimallaşdırılmış Supply faylları (məsələn, GIF, BMP, PICT, WPG) bunlar adətən az sayda pikselə və məhdud rəng dəstinə malikdir
&bull Rezolyusiyada çox aşağı olan faylları təmin edin
&bull Məzmun üçün qeyri-mütənasib şəkildə böyük olan qrafikləri təqdim edin.

Rəngli sənət əsəri
Rəsm fayllarının məqbul formatda (TIFF (və ya JPEG), EPS (və ya PDF) və ya MS Office faylları) və düzgün təsvir ölçüsündə olduğundan əmin olun. Əgər siz qəbul etdiyiniz məqalə ilə birlikdə istifadəyə yararlı rəng rəqəmləri təqdim etsəniz, Elsevier bu illüstrasiyaların rəngli olub-olmamasından asılı olmayaraq, əlavə ödəniş etmədən bu rəqəmlərin onlayn rəngdə (məsələn, ScienceDirect və digər saytlarda) görünməsini təmin edəcək. çap variantında. Çapda rəngli reproduksiya üçün qəbul edilmiş məqalənizi aldıqdan sonra Elsevier-dən xərclər barədə məlumat alacaqsınız. Rəngə üstünlük verdiyinizi qeyd edin: çap və ya yalnız onlayn. Elektron sənət əsərlərinin hazırlanması haqqında əlavə məlumat.

İllüstrasiya xidmətləri
Elsevier's Author Services əlyazmasını təqdim etməyə hazırlaşan, lakin məqaləni müşayiət edən şəkillərin keyfiyyətindən narahat olan müəlliflərə İllüstrasiya Xidmətləri təklif edir. Elsevier-in ekspert illüstratorları elmi, texniki və tibbi üslubda təsvirlər, eləcə də bütün diaqramlar, cədvəllər və qrafiklər yarada bilər. Təsvirin "cilalanması" da mövcuddur, burada bizim illüstratorlarımız şəkillərinizi çəkir və onları peşəkar standarta çatdırır. Daha çox məlumat əldə etmək üçün vebsayta daxil olun.

Şəkil başlıqları
Hər illüstrasiyada başlıq olduğundan əmin olun. Başlıqları ayrıca təqdim edin, rəqəmə əlavə olunmur. Başlıq qısa başlıqdan (şəklin özündə deyil) və təsvirin təsvirindən ibarət olmalıdır. İllüstrasiyalardakı mətni minimuma endirin, lakin istifadə olunan bütün simvolları və abreviaturaları izah edin.

Cədvəlləri şəkillər kimi deyil, redaktə edilə bilən mətn kimi təqdim edin. Cədvəllər ya məqalədəki müvafiq mətnin yanında, ya da sonunda ayrıca səhifə(lər)də yerləşdirilə bilər. Cədvəlləri mətndəki görünüşünə uyğun olaraq ardıcıl olaraq nömrələyin və istənilən cədvəl qeydlərini cədvəlin gövdəsinin altına qoyun. Cədvəllərdən istifadə edərkən ehtiyatlı olun və onlarda təqdim olunan məlumatların məqalənin başqa yerində təsvir olunan nəticələri təkrarlamadığından əmin olun. Cədvəl xanalarında şaquli qaydalardan və kölgələrdən istifadə etməyin.

Mətndə sitat
Zəhmət olmasa, mətndə göstərilən hər bir istinadın da istinadlar siyahısında olmasına əmin olun (və əksinə). Abstraktda istinad edilən bütün istinadlar tam şəkildə göstərilməlidir. Dərc olunmamış nəticələr və şəxsi ünsiyyətlər istinad siyahısında tövsiyə edilmir, lakin mətndə qeyd oluna bilər. Əgər bu istinadlar istinad siyahısına daxil edilibsə, onlar jurnalın standart istinad üslubuna əməl etməli və nəşr tarixinin ya “Dərc olunmamış nəticələr” və ya “Şəxsi əlaqə” ilə əvəzlənməsini daxil etməlidir. İstinadın “mətbuatda” kimi göstərilməsi məqalənin dərc üçün qəbul edildiyini bildirir.

İstinad bağlantıları
Tədqiqatın artan aşkarlığı və yüksək keyfiyyətli ekspert rəyi istinad edilən mənbələrə onlayn bağlantılarla təmin edilir. Scopus, CrossRef və PubMed kimi abstraktlaşdırma və indeksləşdirmə xidmətlərinə keçidlər yaratmağımıza icazə vermək üçün, lütfən, istinadlarda göstərilən məlumatların düzgün olduğundan əmin olun. Nəzərə alın ki, yanlış soyadlar, jurnal/kitab adları, nəşr ili və səhifələmə linkin yaradılmasına mane ola bilər. İstinadları kopyalayarkən ehtiyatlı olun, çünki onlarda artıq xətalar ola bilər. DOI-dən istifadə yüksək dərəcədə təşviq olunur.

DOI heç vaxt dəyişməyəcəyinə zəmanət verilir, ona görə də siz onu istənilən elektron məqaləyə daimi keçid kimi istifadə edə bilərsiniz. Hələ buraxılışda olmayan məqalə üçün DOI istifadə edən sitat nümunəsi: VanDecar J.C., Russo R.M., James D.E., Ambeh W.B., Franke M. (2003). Venesuelanın şimal-şərqinin altındakı Kiçik Antil adalarının seysmik davamı. Journal of Geophysical Research, https://doi.org/10.1029/2001JB000884. Nəzərə alın ki, bu cür sitatların formatı məqalədəki bütün digər istinadlarla eyni üslubda olmalıdır.

Veb istinadları
Minimum olaraq tam URL və istinadın sonuncu dəfə əldə edildiyi tarix verilməlidir. Əgər məlumdursa, hər hansı əlavə məlumat (DOI, müəllif adları, tarixlər, mənbə nəşrinə istinad və s.) da verilməlidir. İstənilən halda veb istinadlar ayrı-ayrılıqda (məsələn, istinad siyahısından sonra) başqa başlıq altında verilə bilər və ya istinad siyahısına daxil edilə bilər.

Məlumat istinadları
Bu jurnal əlyazmanızda əsas və ya müvafiq verilənlər toplusunu mətninizdə göstərərək və İstinad Siyahınızda məlumat arayışı daxil etməklə onlara istinad etməyə təşviq edir. Məlumat istinadlarına aşağıdakı elementlər daxil edilməlidir: müəllif adı(lar), verilənlər bazası başlığı, məlumat anbarı, versiya (mövcud olduqda), il və qlobal davamlı identifikator. İstinaddan dərhal əvvəl [dataset] əlavə edin ki, onu məlumat istinadı kimi düzgün müəyyən edək. [Dataset] identifikatoru dərc edilmiş məqalənizdə görünməyəcək.

Xüsusi buraxılışda istinadlar
Lütfən, 'bu məsələ' sözlərinin siyahıdakı istənilən istinadlara (və mətndəki hər hansı sitatlara) eyni Xüsusi Buraxılışdakı digər məqalələrə əlavə olunduğundan əmin olun.

Referans idarəetmə proqramı
Əksər Elsevier jurnallarının istinad şablonu ən məşhur istinad idarəetmə proqram məhsullarının bir çoxunda mövcuddur. Bunlara Mendeley kimi Citation Style Language üslublarını dəstəkləyən bütün məhsullar daxildir. Bu məhsullardan sitat plaginlərindən istifadə edərək, müəlliflər məqalələrini hazırlayarkən yalnız müvafiq jurnal şablonunu seçməlidirlər, bundan sonra sitatlar və biblioqrafiyalar jurnalın üslubunda avtomatik formatlaşdırılacaq. Bu jurnal üçün hələ şablon yoxdursa, lütfən, bu Təlimatda göstərildiyi kimi nümunə istinad və sitatların formatına əməl edin. Əgər siz istinad idarəetmə proqramından istifadə edirsinizsə, elektron əlyazmanı təqdim etməzdən əvvəl bütün sahə kodlarını sildiyinizə əmin olun. Sahə kodlarını müxtəlif istinad idarəetmə proqramından necə silmək barədə ətraflı məlumat.

Mendeley Desktop istifadəçiləri aşağıdakı linkə klikləməklə bu jurnal üçün istinad üslubunu asanlıqla quraşdıra bilərlər:
http://open.mendeley.com/use-citation-style/molecular-phylogenetics-and-evolution
Əlyazmanızı hazırlayarkən siz Microsoft Word və ya LibreOffice üçün Mendeley plaginlərindən istifadə edərək bu üslubu seçə biləcəksiniz.

İstinad formatı
Təqdimat zamanı istinad formatına dair ciddi tələblər yoxdur. İstinadlar üslub uyğun olduğu müddətcə istənilən üslubda və ya formatda ola bilər. Müvafiq hallarda müəllif(lər)in adı, jurnalın adı/kitabın adı, fəslin adı/məqalənin adı, nəşr ili, cild nömrəsi/kitab fəsli və məqalə nömrəsi və ya səhifələr göstərilməlidir. DOI-dən istifadə yüksək dərəcədə təşviq olunur. Jurnalın istifadə etdiyi istinad üslubu sübut mərhələsində Elsevier tərəfindən qəbul edilmiş məqaləyə tətbiq ediləcək. Qeyd edək ki, çatışmayan məlumatlar müəllifin düzəltməsi üçün sübut mərhələsində vurğulanacaq. Əgər siz istinadları özünüz formatlaşdırmaq istəyirsinizsə, onlar aşağıdakı nümunələrə uyğun tərtib edilməlidir:

İstinad tərzi
Mətn: Mətndəki bütün sitatlar aşağıdakılara istinad etməlidir:
1. Tək müəllif: müəllifin adı (müəyyənlik yoxdursa, inisialsız) və nəşr ili
2. İki müəllif: həm müəlliflərin adları, həm də nəşr ili
3. Üç və ya daha çox müəllif: ilk müəllifin adı və ardınca 'et al.' və nəşr ili.
Sitatlar birbaşa (və ya mötərizədə) edilə bilər. İstinad qrupları əvvəlcə əlifba sırası ilə, sonra xronoloji ardıcıllıqla və ya əksinə sıralana bilər.
Nümunələr: 'nümayiş olunduğu kimi (Allan, 2000a, 2000b, 1999 Allan və Jones, 1999)&hellip. Və ya nümayiş etdirildiyi kimi (Jones, 1999 Allan, 2000)&hellip Kramer et al. (2010) bu yaxınlarda göstərdi &hellip'
Siyahı: İstinadlar əvvəlcə əlifba sırası ilə düzülməli, sonra lazım olduqda xronoloji ardıcıllıqla sıralanmalıdır. Eyni ildə eyni müəllif(lər)dən birdən çox istinad nəşr ilindən sonra qoyulmuş “a”, “b”, “c” və s. hərflərlə müəyyən edilməlidir.
Nümunələr:
Jurnal nəşrinə istinad:
Van der Geer, J., Hanraads, J.A.J., Lupton, R.A., 2010. Elmi məqalə yazma sənəti. J. Sci. Kommun. 163, 51&ndash59. https://doi.org/10.1016/j.Sc.2010.00372.
Məqalə nömrəsi ilə jurnal nəşrinə istinad:
Van der Geer, J., Hanraads, J.A.J., Lupton, R.A., 2018. Elmi məqalə yazma sənəti. Heliyon. 19, e00205. https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2018.e00205.
Kitaba istinad:
Strunk Jr., W., White, E.B., 2000. The Elements of Style, dördüncü nəşr. Longman, Nyu-York.
Redaktə edilmiş kitabın fəslinə istinad:
Mettam, G.R., Adams, L.B., 2009. Məqalənizin elektron versiyasını necə hazırlamaq olar: Jones, B.S., Smith, R.Z. (Red.), Elektron əsrə giriş. E-Publishing Inc., New York, s. 281&ndash304.
Veb saytına istinad:
Xərçəng Araşdırmaları Böyük Britaniya, 1975. Böyük Britaniya üçün xərçəng statistikası hesabatları. http://www.cancerresearchuk.org/aboutcancer/statistics/cancerstatsreport/ (13 mart 2003-cü ildə əldə edilib).
Məlumat dəstinə istinad:
[məlumat toplusu] Oguro, M., Imahiro, S., Saito, S., Nakashizuka, T., 2015. Yapon palıd solğunluğu xəstəliyi və ətraf meşə kompozisiyaları üçün ölüm məlumatları. Mendeley Data, v1. https://doi.org/10.17632/xwj98nb39r.1.
Proqram təminatına istinad:
Coon, E., Berndt, M., Jan, A., Svyatsky, D., Atchley, A., Kikinzon, E., Harp, D., Manzini, G., Shelef, E., Lipnikov, K., Garimella, R., Xu, C., Moulton, D., Karra, S., Painter, S., Jafarov, E., & Molins, S., 2020. Qabaqcıl Yer Simulyatoru (ATS) v0.88 (Versiya 0.88 ). Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.3727209.

Jurnal abbreviatura mənbəyi
Jurnal adları Başlıq Sözlərinin İxtisarları Siyahısına uyğun olaraq ixtisar edilməlidir.

Elsevier elmi tədqiqatlarınızı dəstəkləmək və təkmilləşdirmək üçün video material və animasiya ardıcıllığını qəbul edir. Məqalələri ilə birlikdə təqdim etmək istədikləri video və ya animasiya faylları olan müəlliflərə məqalənin mətnində bunlara keçidlər əlavə etmək tövsiyə olunur. Bu, video və ya animasiya məzmununa istinad etməklə və əsas mətndə onun harada yerləşdirilməli olduğunu qeyd etməklə, rəqəm və ya cədvəllə eyni şəkildə edilə bilər. Təqdim olunan bütün fayllar düzgün etiketlənməlidir ki, onlar birbaşa video faylın məzmununa aid olsun. Video və ya animasiya materialınızın birbaşa istifadəyə yararlı olmasını təmin etmək üçün, lütfən, tövsiyə etdiyimiz fayl formatlarından birində faylı hər bir fayla üstünlük verilən maksimum ölçüsü 150 MB, cəmi 1 GB ilə təmin edin. Təchiz edilən video və animasiya faylları məqalənizin elektron versiyasında Elsevier Web məhsullarında, o cümlədən ScienceDirect-də onlayn dərc olunacaq. Lütfən, fayllarınızla birlikdə "foto çəkilişləri" təmin edin: siz video və ya animasiyadan istənilən çərçivəni seçə və ya ayrıca şəkil yarada bilərsiniz. Bunlar standart nişanlar əvəzinə istifadə olunacaq və video məlumatlarınıza keçidi fərdiləşdirəcək. Daha ətraflı təlimatlar üçün video təlimat səhifələrimizə daxil olun. Qeyd: jurnalın çap versiyasına video və animasiya daxil edilə bilmədiyi üçün məqalənin bu məzmuna istinad edən hissələri üçün həm elektron, həm də çap versiyası üçün mətn təqdim edin.

Nəşrinizə interaktiv məlumat vizualizasiyasını daxil edin və oxucularınızın qarşılıqlı əlaqədə olmasına və tədqiqatınızla daha yaxından məşğul olmasına icazə verin. Mövcud məlumatların vizuallaşdırılması variantları və onları məqalənizə necə daxil edəcəyinizi öyrənmək üçün buradakı təlimatları izləyin.

Tətbiqlər, şəkillər və səs klipləri kimi əlavə materiallar onu artırmaq üçün məqalənizlə birlikdə dərc edilə bilər. Təqdim edilmiş əlavə maddələr alındıqları kimi dərc olunur (Excel və ya PowerPoint faylları onlayn olaraq belə görünəcək). Zəhmət olmasa materialınızı məqalə ilə birlikdə təqdim edin və hər bir əlavə fayl üçün qısa, təsviri başlıq təqdim edin. Əgər prosesin istənilən mərhələsində əlavə materiala dəyişiklik etmək istəyirsinizsə, lütfən, yenilənmiş fayl təqdim etdiyinizə əmin olun. Əvvəlki versiyaya heç bir düzəliş əlavə etməyin. Microsoft Office fayllarında 'Dəyişiklikləri izlə' seçimini söndürün, çünki bunlar nəşr edilmiş versiyada görünəcək.

Araşdırma məlumatları
Bu jurnal sizə lazım olduqda tədqiqat nəşrinizi dəstəkləyən məlumatları tələb edir və paylaşmağa imkan verir və məlumatları dərc edilmiş məqalələrinizlə əlaqələndirməyə imkan verir. Tədqiqat məlumatları tədqiqat nəticələrini təsdiq edən müşahidələrin və ya təcrübələrin nəticələrinə aiddir. Təkrarlanma qabiliyyətini və məlumatların təkrar istifadəsini asanlaşdırmaq üçün bu jurnal sizi həmçinin layihə ilə bağlı proqram təminatı, kod, modellər, alqoritmlər, protokollar, metodlar və digər faydalı materialları paylaşmağa təşviq edir.

Aşağıda məlumatlarınızı məqalənizlə əlaqələndirə və ya əlyazmanızı təqdim edərkən məlumatlarınızın mövcudluğu barədə bəyanat verə biləcəyiniz bir sıra yollar verilmişdir. Əgər məlumatı bu yollardan biri ilə paylaşırsınızsa, əlyazma və istinad siyahınızdakı məlumatları sitat gətirmək tövsiyə olunur. Məlumat sitatı haqqında daha çox məlumat üçün "İstinadlar" bölməsinə müraciət edin. Tədqiqat məlumatlarının və digər müvafiq tədqiqat materiallarının yerləşdirilməsi, paylaşılması və istifadəsi haqqında daha çox məlumat üçün tədqiqat məlumatları səhifəsinə daxil olun.

Məlumatların əlaqələndirilməsi
Əgər siz tədqiqat məlumatlarınızı verilənlər bazasında əlçatan etmisinizsə, məqalənizi birbaşa verilənlər bazasına bağlaya bilərsiniz. Elsevier, ScienceDirect-dəki məqalələri müvafiq repozitoriyalarla əlaqələndirmək üçün bir sıra repozitoriyalarla əməkdaşlıq edərək, oxuculara təsvir edilən tədqiqatı daha yaxşı başa düşmək imkanı verən əsas məlumatlara çıxış imkanı verir.

Məlumat dəstlərinizi məqalənizlə əlaqələndirməyin müxtəlif yolları var. Mövcud olduqda, təqdimetmə sistemində müvafiq məlumatları təqdim etməklə, məlumat dəstinizi birbaşa məqalənizlə əlaqələndirə bilərsiniz. Ətraflı məlumat üçün verilənlər bazası əlaqə səhifəsinə daxil olun.

Dəstəklənən məlumat anbarları üçün anbar banneri avtomatik olaraq ScienceDirect-də dərc edilmiş məqalənizin yanında görünəcək.

Bundan əlavə, siz aşağıdakı formatdan istifadə edərək əlyazmanızın mətnindəki identifikatorlar vasitəsilə müvafiq məlumat və ya obyektlərə keçid edə bilərsiniz: Verilənlər bazası: xxxx (məsələn, TAIR: AT1G01020 CCDC: 734053 PDB: 1XFN).

Mendeley Məlumatları
Bu jurnal Mendeley Data-nı dəstəkləyir və əlyazmanızla əlaqəli istənilən tədqiqat məlumatını (xam və işlənmiş məlumat, video, kod, proqram təminatı, alqoritmlər, protokollar və metodlar daxil olmaqla) istifadə etmək üçün pulsuz, açıq giriş repozitoriyasına yerləşdirməyə imkan verir. Təqdimat prosesi zamanı əlyazmanızı yüklədikdən sonra müvafiq məlumat dəstlərinizi birbaşa bura yükləmək imkanınız olacaq. Mendeley Məlumatları. Məlumat dəstləri siyahıya alınacaq və onlayn olaraq dərc edilmiş məqalənizin yanında oxucular üçün birbaşa əlçatan olacaq.

Qısaca məlumat
Əlavə və ya əlavə xam məlumatınızın hər hansı və ya bütün hissələrini burada dərc edilmiş məlumat məqaləsinə çevirmək seçiminiz var. Qısaca məlumat. Məlumat məqaləsi məlumatlarınızın aktiv şəkildə nəzərdən keçirilməsini, seçilməsini, formatlaşdırılmasını, indeksləşdirilməsini, DOI verilməsini və dərc edildikdən sonra hamı üçün açıq olmasını təmin edən yeni məqalə növüdür (məlumatlarınızı burada dərc etməyin faydalarını təsvir edən bu videoya baxın) Qısaca məlumat). Sizə məlumat məqalənizi təqdim etmək tövsiyə olunur Qısaca məlumat əlyazmanızın yenidən işlənmiş versiyasının yanında əlavə maddə kimi. Tədqiqat məqaləniz qəbul edilərsə, məlumat məqaləniz avtomatik olaraq buraya köçürüləcək Qısaca məlumat redaktor olaraq nəzərdən keçiriləcək, açıq girişi dərc ediləcək və ScienceDirect-də tədqiqat məqalənizlə əlaqələndiriləcək. Nəşr üçün açıq giriş haqqı ödənilir Qısaca məlumat. Tam təfərrüatları Data in Brief saytında tapa bilərsiniz. Zəhmət olmasa, öz yazınızı yazmaq üçün bu şablondan istifadə edin Qısaca məlumat məlumat məqaləsi.

Məlumat bəyanatı
Şəffaflığı gücləndirmək üçün məlumatlarınız daxil olmaq üçün əlçatmazdırsa və ya dərc etmək üçün yararsızdırsa, təqdimatınızda məlumatınızın mövcudluğunu qeyd etməyi tələb edirik. Bu, həm də maliyyələşdirən orqan və ya qurumun tələbi ola bilər. Təqdimat prosesində məlumat bəyanatını təqdim etmək imkanınız olacaq. Bəyanat ScienceDirect-də dərc edilmiş məqalənizlə birlikdə görünəcək. Əlavə məlumat üçün Məlumat Bəyannaməsi səhifəsinə daxil olun.

Məqalənin sürətlə dərc olunmasını təmin etmək üçün müəlliflərdən xahiş edirik ki, iki gün ərzində bizə sübut düzəlişlərini təqdim etsinlər. Müvafiq müəlliflər onlayn yoxlama sistemimizə keçidi olan e-poçt məktubu alacaqlar ki, bu da sübutların onlayn qeydinə və düzəlişinə imkan verir. Mühit MS Word-ə bənzəyir: mətni redaktə etməklə yanaşı, siz həmçinin rəqəmlər/cədvəllərə şərh verə və Kopyalama Redaktorunun suallarına cavab verə bilərsiniz. Veb-əsaslı yoxlama, səhvlərin potensial tətbiqini aradan qaldıraraq, birbaşa düzəlişlərinizi yazmağa imkan verməklə daha sürətli və daha az səhvə meylli bir proses təmin edir.
Tercih edilərsə, siz hələ də annotasiya etməyi və redaktələrinizi PDF versiyasında yükləməyi seçə bilərsiniz. Təsdiqlə bağlı bütün təlimatlar müəlliflərə göndərdiyimiz e-poçtda, o cümlədən onlayn versiyaya və PDF-ə alternativ üsullarla veriləcək.
Məqalənizin tez və dəqiq dərc olunması üçün əlimizdən gələni edəcəyik. Zəhmət olmasa, bu sübutdan yalnız mətnin, cədvəllərin və rəqəmlərin çapını, redaktəsini, tamlığını və düzgünlüyünü yoxlamaq üçün istifadə edin. Məqalədə dərc üçün qəbul edilən əhəmiyyətli dəyişikliklər yalnız bu mərhələdə Redaktorun icazəsi ilə nəzərdən keçiriləcək. Bütün düzəlişlərin bir əlaqədə bizə geri göndərilməsini təmin etmək vacibdir. Cavab verməzdən əvvəl diqqətlə yoxlayın, çünki sonrakı düzəlişlərin daxil edilməsinə zəmanət verilmir. Düzəltmə yalnız sizin məsuliyyətinizdir.

Müvafiq müəllif heç bir ödəniş etmədən məqalənin ScienceDirect-də dərc edilmiş yekun versiyasına 50 gün pulsuz girişi təmin edən fərdiləşdirilmiş Paylaşım Linki alacaq. Share Link məqaləni e-poçt və sosial media da daxil olmaqla istənilən kommunikasiya kanalı vasitəsilə paylaşmaq üçün istifadə edilə bilər. Əlavə ödəniş müqabilində, məqalə çap üçün qəbul edildikdən sonra göndərilən çapdan kənar sifariş forması vasitəsilə kağız çapları sifariş etmək olar. Həm müvafiq, həm də həmmüəlliflər istənilən vaxt Elsevier-in Müəllif Xidmətləri vasitəsilə çapdan çıxma sifariş edə bilərlər. Məqaləsini dərc etmiş müvafiq müəlliflər "Qızıl açıq giriş" əldə etmirlər, çünki məqalənin son dərc edilmiş versiyası ScienceDirect-də açıq girişə malikdir və məqalə DOI linki vasitəsilə paylaşıla bilər.

Lazım olan cavabları tapmaq üçün Elsevier Dəstək Mərkəzinə baş çəkin. Burada siz Tez-tez verilən suallardan tutmuş əlaqə qurma yollarına qədər hər şeyi tapa bilərsiniz.
Siz həmçinin təqdim etdiyiniz məqalənin statusunu yoxlaya və ya qəbul olunmuş məqalənizin nə vaxt dərc olunacağını öyrənə bilərsiniz.


Molekulyar Struktur Biologiyanın Əsasları

Molekulyar Struktur Biologiyanın Əsasları molekulyar struktur biologiyasının riyazi və fiziki əsaslarını nəzərdən keçirir. Bu fundamental anlayışlara əsaslanaraq, daha sonra molekulyar quruluşu təsvir edir və əsas genetik mexanizmləri izah edir. Tədqiqatın getdikcə daha çox fənlərarası xarakterini nəzərə alaraq, erkən karyera tədqiqatçıları və onlara bitişik sahəyə keçənlər, müəyyən bir sahənin əsaslarını sürətləndirmək üçün tez-tez "fundamentals" kitabına ehtiyac duyurlar. Bu kitab həmin yeri doldurur.

Molekulyar Struktur Biologiyanın Əsasları molekulyar struktur biologiyasının riyazi və fiziki əsaslarını nəzərdən keçirir. Bu fundamental anlayışlara əsaslanaraq, daha sonra molekulyar quruluşu təsvir edir və əsas genetik mexanizmləri izah edir. Tədqiqatın getdikcə daha çox fənlərarası xarakterini nəzərə alaraq, erkən karyera tədqiqatçıları və onlara bitişik sahəyə keçənlər, müəyyən bir sahənin əsaslarını sürətləndirmək üçün tez-tez "fundamentals" kitabına ehtiyac duyurlar. Bu kitab həmin yeri doldurur.


Hesablama molekulyar təkamülünə dair kitab təklifi - Biologiya

Laboratoriya və ya sinifiniz üçün toplu endirimlər mövcuddur. Sorğu üçün bura klikləyin.

Elektron kitablar Adobe Digital Editions proqram təminatından istifadə edir. Ətraflı məlumat üçün bura klikləyin.

Təsvir

Biologiya daha kəmiyyətli və hesablamalı olduqca, artan sayda fiziki alim, riyaziyyatçı və mühəndis genomika, inkişaf biologiyası, nevrologiya və sistem biologiyası kimi sahələrə keçir. Molekulyar biologiya elmi bütün bu mövzuların əsasını təşkil edir və onun əsas anlayışlarını və istifadə olunan əsas eksperimental üsulları başa düşmək vacibdir.

Bu kitab riyaziyyatçılar, fiziklər və hesablama alimləri üçün xüsusi olaraq hazırlanmış molekulyar biologiyaya giriş kursunu təqdim edir. Orqanizmin inkişafına, genetik xüsusiyyətlərə və insanın təkamülünə keçməzdən əvvəl DNT, gen, zülal və hüceyrələrin əsas xüsusiyyətlərini təqdim etməklə başlayır. Hər bir halda əsas anlayışlar yeni nəsil ardıcıllıq, kütləvi spektrometriya və yüksək məhsuldarlıqlı ekranlar kimi son texnoloji nailiyyətlər kontekstində təsvir edilir. Beləliklə, kitab oxuculara molekulyar biologiyanın əsaslarından hüceyrə və inkişaf biologiyasında, genomikada və sintetik biologiyada istifadə olunan qabaqcıl üsulları dərk etməyə sürətlə keçməyə imkan verir.

İçindəkilər

Rəylər

“. yüksək əlçatandır. molekulyar biologiyaya tez, lakin tam giriş əldə etmək istəyən hər kəs üçün əvəzolunmazdır.”
Seçim


Hesablamalı Molekulyar Biologiya Təlimatı.Srinivas Aluru tərəfindən redaktə edilmişdir

Srinivas Aluru tərəfindən redaktə edilən "Hesablamalı Molekulyar Biologiya Təlimatları" 1104 səhifədən ibarətdir və 60-dan çox müəllifin işini təmsil edir. Mükəmməl bir sorğu və bir çox mövzuya ümumi baxış təqdim etməklə yanaşı, mətn təfərrüatları araşdırmaqdan çəkinmir. Bu, kitabçanı bu sahədə yeni başlayanlar, eləcə də daha təcrübəli tədqiqatçılar üçün dəyərli edir.

Əlbətdə ki, istifadəyə yararlılığı və oxunaqlılığı qoruyarkən bir çox müxtəlif sahələri əhatə etmək asan deyil. Kitab nə qədər böyük olsa da, istər-istəməz kənarda qalan mövzular da olacaq. Və əlbəttə ki, sahənin inkişafı ilə mövzular dəbdən düşəcək və yeni mövzular ortaya çıxacaq. Bu qaçılmaz görünən faktların heç biri hərtərəfli resursa ehtiyacı azaltmır. Təlimat yaxşı təşkil edilmiş strukturu qoruyub saxlamaqla bu sahədə əsas sahələri inkişaf etdirmək üçün yaxşı iş görüb.

Təlimat səkkiz ayrı bölməyə/hissələrə bölünmüş 38 fəsildən ibarətdir. Hər bölmə bu sahədə fərqli nisbətən geniş ərazini əhatə edir və müstəqil oxuna bilər. Hər bölmədəki fəsillər əvvəlki fəsillərdəki daha çox giriş materialından sonrakı fəsillərdə daha təkmil və son mövzulara keçir. Bu struktur, hətta nisbətən az məlumatlı oxucunun belə geniş sahələrin hər birindən material əldə edə bilməsini təmin edir, daha təkmil mövzular isə daha təcrübəli tədqiqatçının kitabçanı faydalı hesab edəcəyini təmin edir.

İstinadlar hər fəslin sonunda verilmişdir. Həqiqətən də, görünür, müəlliflər geniş istinad siyahısını təqdim etmək üçün çox diqqətli olublar. Bir neçə bölmədə ümumi olan anlayışları tapmağa imkan verən qlobal indeks də mövcuddur. Çox vaxt müəlliflər müzakirə etdikləri alqoritmlərin psevdokod versiyalarını daxil edirlər. Bu xüsusiyyət alqoritmlərin öz versiyasını həyata keçirməkdə maraqlı olan oxucuya çox kömək edir. Müəlliflər həmçinin təhlil etmək istədikləri məlumatları olan oxucular üçün müzakirə olunan alqoritmlərdən istifadə edən mövcud proqram təminatına istinadların daxil edilməsinə böyük diqqət yetirirlər (bu icmalda daha sonra qeyd olunacaq).

Təlimatdan dərslik kimi istifadə etməkdə maraqlı olanlar üçün Srinivas Aluru ön sözdə kitabın bu məqsədlə uyğunlaşdırılması ilə bağlı təkliflər verir. Əhatə olunan mövzuların müxtəlifliyi və dərinliyi o deməkdir ki, mətn həm giriş, həm də təkmil kurs üçün istifadə oluna bilər. Təlimlər formal olaraq daxil edilməsə də, alqoritmlərin psevdokodu kompüter elmləri kursu üçün yaxşı başlanğıc nöqtəsini təmin edir, mövcud proqram təminatının tədqiqi isə proqramlaşdırmaya daha az diqqət yetirən kurs üçün faydalı olacaqdır.

Mətn hesablama biologiyası sahəsində təcrübəsi olmayan oxucular üçün nəzərdə tutulsa da, informatika sahəsində təcrübəsi olanlar, xüsusən də kitabçanın II və VII hissələrində (müvafiq olaraq sətirli məlumat strukturlarını, bioinformatika verilənlər bazalarını və verilənlərin mədən işini əhatə edən) üstünlük təşkil edəcəklər. ). (Məsələn, bu bölmələrdəki bir neçə fəsil dinamik proqramlaşdırma ilə müəyyən qədər tanışlığı nəzərdə tutur.) Bu hissələrdəki giriş bölmələrinin müəllifləri daha az təcrübəli oxucuya kömək etmək üçün illüstrativ rəqəmlər və nümunələr təqdim etməyə diqqət yetirirlər.

Mətnin I hissəsi Sequence Alignment haqqındadır, birinci fəsildə molekulyar biologiyaya qısa giriş daxildir. Kitab boyu bioloji anlayışlar lazım gəldikdə işlənib hazırlansa da, hesablama biologiyasına yeni başlayan bir oxucu daha dolğun girişə istinad etməklə faydalana bilər. Bu birinci bölmənin əvvəlki fəsilləri nukleotid və zülal ardıcıllığı üçün qlobal və yerli uyğunlaşmanın ətraflı öyrənilməsini verir. Sonrakı fəsillər oxşarlığa əsaslanan gen tanınması və çoxlu və parametrik ardıcıllığın uyğunlaşdırılması sahəsində daha yeni işləri araşdırır. I hissənin sonrakı fəsillərində Gizli Markov Modelləri (HMMs) nəzəriyyəsi işlənib hazırlanmışdır. HMM-lərlə təcrübəsi olmayan oxucular (yaxud daha ətraflı maraqlananlar) üçün daha dolğun nəzəriyyəyə istinadlar verilir.

İkinci hissə simli verilənlər strukturlarını və onların hesablama biologiyasına tətbiqlərini əhatə edir. Bütün oxucular şəkilçi ağacları və şəkilçi massivləri kimi məlumat strukturları ilə tanış olmasa da, müəlliflər lazımi xüsusiyyətlərin sübutlarını təqdim etməyə diqqət yetirirlər. Bu məlumat strukturlarından istifadə edən proqramlar, məsələn, təşviqatçıların təkrar aşkarlanması və identifikasiyası və tənzimləyici ardıcıllıqlar yaxşı işlənib hazırlanmışdır. Bu bölmədə, eləcə də bütün mətndə müzakirə olunan alqoritmlər üçün psevdokod verilir. Bunlar maraqlı tədqiqatçıya və ya tələbəyə öz proqram təminatını yazmaqda çox kömək edəcək. Öz kodunu inkişaf etdirməyi planlaşdırmayan oxucular üçün bu strukturları həyata keçirən MUMmer və REP-uter kimi mövcud proqram paketlərinə istinadlar verilir.

Üçüncü hissədə genom yığılması və ifadə edilmiş ardıcıllıq etiketlərinin (EST) qruplaşdırılması müzakirə olunur. Bu bölmə genom birləşməsində mövcud alqoritmlərin tədqiqi ilə başlayır və müqayisəli montaj və genomun yenidən qurulması kimi daha yeni mövzulara davam edir. Genom montajı üzrə fəsil bu gün istifadə edilən səkkiz montaj proqramının üsullarını müqayisə edir, həmçinin ov tüfəngi ardıcıllığının montajının arxasında duran nəzəriyyəni inkişaf etdirir. Bu bölmənin ikinci fəslində insan genomunun yığılması təfərrüatları verilir. Bakterial süni xromosomların (BACs) və xromosomların fiziki xəritələrinin istifadəsini müzakirə edərək, bu fəsil genom birləşməsinə geniş miqyasda “real dünya” baxışını verir. Bu bölmənin son fəsillərində EST-lər və ardıcıllığın yığılması üçün klasterləşdirmə alqoritmləri müzakirə olunur.

IV hissə genom miqyaslı analizdə nisbətən yeni mövzuları əhatə edir.Qlobal uyğunlaşma və uzun ardıcıllığın çoxsaylı qlobal uyğunlaşması müzakirə edilir və (genom montaj paketlərində olduğu kimi) mövcud proqram vasitələri müqayisə edilir. Maraqlanan oxucu təkcə ərazidəki bəzi əsas hesablama məsələlərini başa düşməyəcək, həm də hansı proqram təminatından istifadə etmək barədə daha məlumatlı seçim edə biləcək. Bu hissənin sonrakı fəsillərində alternativ birləşmənin hesablama təhlili, insan genetik əlaqəsi təhlili və haplotip nəticəsinə baxılır.

Beşinci bölmə hesablama biologiyasının, filogenetikanın nisbətən uzun müddət davam edən başqa bir sahəsinə aid müxtəlif mövzuları araşdırır. Bu bölmənin birinci fəslində filogenetik rekonstruksiya probleminə geniş ümumi baxış verilmişdir. Maksimum ehtimal və maksimum parsimoniya üsulları işlənib hazırlanır və müqayisə edilir. Konsensus ağacları və superağaclar kimi filogenetik ağaclar haqqında daha ümumiləşdirilmiş anlayışlar hazırlanmışdır. Sonrakı fəsillərdə geniş miqyaslı filogenetik rekonstruksiya problemi müzakirə olunur.

Təlimatın növbəti iki hissəsində sistem biologiyası sahəsində hesablama biologiyasındakı son mövzular müzakirə olunur. VI hissə mikroarray dizaynı, verilənlərin təhlili, məlumatların saxlanması və axtarışı kimi mikroarraylarla bağlı nəzəriyyəni inkişaf etdirir. Klasterləşdirmə alqoritmlərinə həsr olunmuş iki fəsil var, ikincisi iki qruplaşma alqoritmlərinin tədqiqidir. Son iki fəsildə mikroarray məlumatlarından gen tənzimləyici şəbəkələrin identifikasiyasının sürətlə genişlənən sahəsi və bu cür şəbəkələrin modelləşdirilməsi müzakirə olunur. Həm deterministik, həm də stoxastik modellər hazırlanmışdır. Müzakirə olunan modellər adi diferensial tənliklər sistemləridir (baxmayaraq ki, qismən diferensial tənlik modelinin nümunəsi verilmişdir). Bundan əlavə, diferensial tənliklər sistemini formal olaraq inkişaf etdirmədən bioloji sistem biliklərindən tədqiqatçılar tərəfindən istifadə edilə bilən modelləşdirmə paketlərinin (məsələn, CellML və E-Cell kimi) sorğusu mövcuddur.

Yeddi hissədəki fəsillər hesablama struktur biologiyasının müxtəlif mövzularını əhatə edir. Bu bölmədəki fəsillər əvvəlki bölmələrə nisbətən daha az vahiddir. İlk üçü protein strukturunun proqnozunu müzakirə edir. Digər fəsillərdə molekulyar komplekslərin yenidən qurulmuş 3D xəritələrinin emalı, uzaq homoloqların aşkarlanması və biomoleulyar modelləşdirmədə paralel superkompüterlərin istifadəsi müzakirə olunur. RNT strukturunun proqnozlaşdırılmasının daha yeni problemi bu bölmədə müzakirə edilmir.

Yenə son bölmə bəlkə də kompüter alimi üçün ən çox maraqlı olacaq. Mətnin bu son dörd fəsli verilənlər bazasında sorğu sətirinin təxmini uyğunluqlarının tapılması, ardıcıllıqla motivlərin axtarışı və verilənlərin öyrənilməsi kimi klassik simli axtarış problemlərini əhatə edir.

Çox sayda mövzunun əhatə olunmasına baxmayaraq, RNT ikincil quruluşu və genom təkamülünün modelləşdirilməsi kimi sahəsi kənarda qalanlar olacaq. Kitabça tədqiqatçının maraqlandığı konkret mövzunu əhatə etməsə də, təsirli dərinlik və nəfəs bu mətni demək olar ki, bu sahə ilə maraqlanan hər kəs üçün faydalı edir. Hesablama molekulyar biologiyası biologiya elmləri, riyaziyyat, fizika və kompüter elmlərindən olan tələbələr və tədqiqatçılar arasında sürətlə inkişaf edən bir sahədir. Bu sahənin həm fənlərarası təbiəti, həm də sürətli inkişafı ilə birlikdə geniş auditoriya üçün əlçatan olan və tədqiqatçılar üçün faydalı olacaq qədər təkmil dərsliklərin tapılmasında çətinlik yaradır. 'Hesablamalı Molekulyar Biologiya üçün Təlimatlar' bu maraqlı sahə ilə maraqlananlar üçün əla mənbə olacaq.


Videoya baxın: Ən yaxşı kitablar #sorğu (Iyul 2022).


Şərhlər:

  1. Finnobarr

    Bu səhvdir.

  2. Maza Blaska

    Sizinlə danışmaq istərdim, deyəcəklərim var.



Mesaj yazmaq