Məlumat

IBD-inbreeding ilə damazlıq dəyəri

IBD-inbreeding ilə damazlıq dəyəri


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

IBD ilə bağlı sualım var. Zəhmət olmasa aşağıdakı rəqəmə baxın. X və Y üçün IBD neçə cüt alleldir və ya X və Y üçün IBD dəyəri nədir. Dörddür (4)? Mən bunun maksimum 2 olduğunu görmüşəm, amma sonra hesab edirik ki, heç bir inbreeding baş vermir, elə deyilmi?


İdentical-By-Descent (IBD) dəyəri ümumi əcdaddan törəmə səbəbindən eyni olan allellərin sayıdır. Hər bir (diploid) fərddə müəyyən (autosomal) gen üçün iki alleli olduğundan, onların başqa bir fərdlə İBH olanların sayı yalnız 0, 1 və ya 2 ola bilər.

Sizin nümunənizdə X və Y öz allellərinin hər birini A-dan miras alırlar2, buna görə də onların İBH dəyəri 2-dir. Qohumluq yalnız ümumi əcdaddan törəmənin ifrat formasıdır; bu, daha az inbred fərdlərin müqayisəsi ilə müqayisədə orta hesabla yüksək İBD dəyərlərinin daha böyük ehtimalına səbəb olur. Daha ətraflı məlumat üçün buradakı keçidə baxın.


Inbreeding ilə damazlıq IBD-dəyəri - Biologiya

Qohum evlilikləri (çiftləşmə, qeyri-insanlar müzakirə olunursa) arasında olanlardır əlaqəli şəxslər, sadəcə olaraq ortaq əcdadı paylaşanlar kimi müəyyən edilir). Damazlıq xəritələrində bunlar ilə göstərilir ikiqat xətlər simvollar arasında.

The Əlaqədarlıq ( r ) iki qohum fərdin bütün lokuslarda paylaşdıqları allellərin hissəsidir. Bu məqsədlə, biz allel ilə paylaşma arasında fərq qoyuruq dövlət və tərəfindən şəxsiyyət Bunu hər hansı bir lokusun təhlili ilə qiymətləndirmək olar. Hər hansı valideyn / nəsil kombinasiya paylaşacaq tam olaraq 1/2 allellərinin hər hansı bir yerində: nəsillər iki valideynin hər birindən bir və ya digər alleli miras alır: (1/2)(1/2) + (1/2)(1/2) = 1/2. Bu, bir nümunə üçün doğrudur hər hansı yer. Hər hansı iki tam qardaşlar paylaşması da gözlənilir 1/2 allellərinin bütün lokuslar üzərində, lakin yox mütləq istənilən vaxt subay yer. Məsələn, qardaşlar #3 & #4 hər biri valideynlərdən dörd allel cütündən birini ala bilər: A1A3, A 1A4, A2A 3, və ya A 2 A 4. Beləliklə, hər hansı bir lokusda bacı-qardaşlar arasında 16 mümkün allel əlaqə mövcuddur (bax Cədvəl). Bunların dördündə hər iki allel var eyni, (r = 1) dörd alleldə var fərqli (r = 0) , və səkkizdə yalnız allel paylaşılır (r = 0.5) : orta hesabla, gözlənilir r = [(4)(1.0) + (4)(0.0) + (8)(0.5)] / (16) = 8/16 = 1/2. Lokusların hər hansı kiçik nümunəsi üçün ölçülür r gözləntisindən kənara çıxa bilər.

Bu, kommersiyadan genetik əlaqənin hesablanmasının bir səbəbidir "DNA.com" DNT testlər qeyri-müəyyən ola bilər. Məsələn, çünki 4-cü & 5-ci əmioğlu var r = 1/641/128, müvafiq olaraq, gözlənti arasında allel mübadiləsi 512 yerlər olardı 8 vs 4, müvafiq olaraq. Paylaşımlar müşahidə edildi 3

9 loci bu əlaqə dərəcələri arasında statistik fərq qoymağa icazə verməzdi.


1/3
1/4
2/3
2/4
1/3
1
0.5
0.5
0
1/4
0.5
1
0
0.5
2/3
0.5
0
1
0.5
2/4
0
0.5
0.5
1

The nəsil qohum cütləşməsi kimi təsvir edilir inbred . The qohumluq əmsalı ( F ) inbred fərd üçün gözlənti fərdin iki alleli olması mənşəyə görə eynidir ( IBD ) hər hansı bir yerdə. Allellər, əgər varsa, mənşəcə eynidir genetik nüsxələr -nin eyni qohum valideynlərin ümumi əcdadında allel. Bu ehtimallar hər bir alleli bir neçə nəsil boyu izləməklə hesablana bilər. [Konseptual IBD kəşfindən çoxdan əvvəldir DNT replikasiya, lakin IBD konkret nəticəsində baş verir dsDNA iki ayrı nəsil boyu özünü təkrarlayan molekul].

Məsələn, №5 fərdin a məhsulunun olması ehtimalını hesablaya bilərik tam qardaş cütləşmə, A lokusunda iki alleli var mənşəyə görə eynidir kimi F = 1/4 = 0.25 . Tipik qohum cütləşmələr üçün digər qohumluq və qohumluq əmsalları aşağıda göstərilmişdir.

QohumluqQohumluq tez-tez qarışıq olurlar. Bir çox insanlar az və ya çox qapalı, məhdud populyasiyalarda mövcud olduğu və evləndiyi üçün hər iki nikah tərəfdaşının az və ya çox uzaq ortaq əcdadı ola bilər və buna görə də qohumluq uzaq qohumlar. Onların nəsil (əsas olaraq) hesablana bilərdi F. Bütün əhali müəyyən dərəcədəinbred," orta ilə ölçülür F populyasiyanın bütün fərdləri üzərində və onun ölçüsü ilə tərs mütənasibdir N. "Qohumluq" yaxın qohumlar arasında nikahların nisbəti olduqda xüsusi maraq doğurur gözləniləndən yüksəkdir. Bu, qəsdən olduğu cəmiyyətlərdə baş verə bilər sib-sib və ya birinci əmioğlu nikahları bəzən dini səbəblərə görə baş verdiyi kimi və ya eyni ailədə əmlak saxlamağa təşviq edilir. Qərb cəmiyyətləri tez-tez birinci əmiuşağı nikahlarına mane olur, lakin ikinci və ya daha yüksək dərəcəli əmiuşağı arasındakı nikahlara heç bir məsuliyyət qoymur, insanların çoxu dördüncü və ya beşinci dərəcə əmiuşağından xəbərsiz ola bilər.

EV TAPŞIRIĞI : Göstər qrafik olaraq ki fərdi №10, məhsulu a birinci qohum evliliyi, var F = 1/16.

Qohumlar və qohum cütləşmələr üçün qohumluq ( r ) və qohumluq ( F ) əmsalları


Qohumluq, eyni itin fərqli nəsillər vasitəsilə iki dəfə göründüyü bir damazlıqda baş verir. Kvant von Arminiusnin şəcərəsində kifayət qədər qohumluq var. Bizim damazlıq hesabatlarımız əcdadın damazlıq hüceyrəsinin içərisində adların sağında rəngli çubuq yerləşdirməklə doğma itləri göstərəcək. Diqqət edin Kvant von Arminius'nin altındakı soyadının yanında rəngli çubuqlar var Visum von Arminius, Ica vom Haus Reiterland, Fedor von Arminius, Uran və Wildsteiger Land, və Odin von Tannenmeise. Barlar rəng kodludur ki, siz uyğun it dəstlərini tez tapa biləsiniz. Bu inbred itlərin hamısı müxtəlif nəsillər vasitəsilə damazlıqda bir dəfədən çox görünür. Diqqət edin Afra vom Haus Reiterland da damazlıqda (5-ci nəsil) bir neçə dəfə görünür, lakin onun adının yanında rəngli çubuq yoxdur. Bunun səbəbi o, yalnız qızı vasitəsilə görünür Ica vom Haus Reiterland (4-cü nəsildə) və damazlıqda başqa itlər yoxdur.

Dəcliyin həm bənd, həm də ata tərəfində görünən doğma itlərə çarpaz dublikatlar deyilir. In Kvant von Arminiusnəsli, Ica vom Haus Reiterland iki dəfə, bir dəfə görünür Dux della Valcuvia's damazlıq (1-ci Nəsil Sire) və bir dəfə Yalnız vom Wutachtalnin şəcərəsi (1-ci Nəsil Dam). Digər tərəfdən, Visum von Arminius (digər vurğulanmış inbred) yalnız görünür Dux della Valcuvianin şəcərəsidir və buna görə də o, çarpaz dublikat deyil. Pedigree Onlayn-da siz damazlıq cədvəlinin yuxarısındakı hesabat menyusunda "Vurğulananlar" açılan menyusundan dəyər seçməklə damazlıq və ya bütün doğma itlərdə çarpaz dublikatları vurğulamağı seçə bilərsiniz. Bu niyə vacibdir? Əhəmiyyətli olmasının səbəbi odur ki, həm ana, həm də bənd oxşar əcdadlara malik olduqda və itin müəyyən əcdadlardan uyğun gələn xromosom dəstlərinə (alellərə) malik ola bildikdə qohumluq əlaqəsi yalnız amildir.


Belmonta qədər uçursunuz?

Frank Mitchell Devil May Care-in klassik yetişdirilməsi haqqında yazanda burada, düşündüm ki, böyük bəlada ola bilərəm. Mən artıq bu vəzifəni tutmuşdum burada ki, qaçışçının yetişdirilməsi üçün müstəsna ola biləcəyi ehtimalını heç vaxt istisna edə bilməsəniz də, Devil May Care həqiqətən Derbi məsafəsini əldə etmək üçün yetişdirilməmişdir.

Əsas problem odur ki, o, cənab Prospector-a 3’s inbred. Bu, ağlabatan nəsil məsafəsidir, lakin yenə də qaçışçını doqquz furlonqdan az məsafələrdə ən yaxşı səylər üçün ixtisaslaşmış kimi qeyd edir. Bu, bütün normalar kimi, ata, ailə və s. kimi digər nəsil faktorlarından asılı olaraq istisnaları qəbul edən bir normadır və Devil May Care artıq doqquz yarışda Bonnie Miss S. (G2) qazanmışdı. . Yenə də, . . . .

İndi aydındır ki, Frenkin cənab Prospektorla yaxın qohumluğa məndən fərqli baxışı var, çünki o, indicə yazıb. burada “Fly Down’s (Mineshaft-Queen Randi, Fly So Free tərəfindən) yetişdirilməsinin Belmont S.-ni öz əhatə dairəsinə necə yaxşı qoyduğu haqqında.” Frank, bir daha fərqli olmağa yalvarmalıyam.

Mineshaft-ın 12 pay qalibi olub, o cümlədən Fly Down, onun damazlıq məsələlərində ata kimi qabiliyyətini qiymətləndirərkən nəzərə alınır. Həmin payların qaliblərindən beşi Cənab Prospektora 3ࡪ-cü ilham verilmişdir. Doğrudur, Cool Coal Man həm Gənclik Fəvvarəsi S. (G2), həm də Böyük Albert S. mükafatını doqquz kürədə qazandı, lakin digər dörd nəfərdən heç biri 8,5 metrlik maneəni aşmayıb və onlardan üçü heç vaxt qalib gəlmədi. mildən artıq bir pay.

Fly Down Mineshaft’s altıncı cənab Prospector-inbred pay qalib, lakin 3ࡪ-də deyil. Onun əlavə mənfi cəhəti var, ən azı məsafə məhdudiyyətləri ilə əlaqədar olaraq, 3ࡩ-də doğulmuşdur, bu, böyük fərqdir.

İntensivlikdən asılı olaraq qohumluq və cins yetişdirmə həmin təkrarlanan əcdadlardan və onların nəsillərindən miras qalmış qabiliyyətlər ətrafında ixtisaslaşma deməkdir. 20-ci əsrin ortalarından başlayaraq əhalinin artan ixtisaslaşması, demək olar ki, cins heyvandarlığın artan yığılmasının nəticəsidir. Bəli, bu ixtisasın bəziləri klassik atlara üstünlük verir, lakin əksəriyyəti yox.

Beləliklə, Frank, əgər Fly Down Belmont-da qalib gəlsə, mən sizə papağımı çıxardacağam, amma onu yeməyəcəyəm, çünki başqa bir cənab Prospektorun Volponi-nin Breeders ilə birlikdə qaçdığını izlədiyimi çox yaxşı xatırlayıram’ Klassik Kubok.

14 may 2010-cu il, cümə günü, saat 12:26-da Roger Lyons tərəfindən göndərildi.

• Permalink • Comments Off Belmont-a qədər uçursunuzmu?


Inbreeding ilə damazlıq IBD-dəyəri - Biologiya

Qohum cütləşmələr arasında olanlardır əlaqəli şəxslər (ortaq əcdadı paylaşanlar) və ilə işarələnir ikiqat xətlər damazlıq simvolları arasında. The qohumluq ( r ) iki fərdin bütün lokuslarda paylaşdıqları allellərin hissəsidir. Qohum cütləşmənin övladları olduğu deyilir inbred . The qohumluq əmsalı ( F ) inbred fərd üçün fərddə iki allelin olması ehtimalıdır mənşəyə görə eynidir bir yerdə. Allellərin genetik nüsxələri olduqda mənşəcə eynidirlər eyni ümumi əcdaddakı allel. Bu ehtimalları bir neçə nəsil ərzində hər bir alleli izləməklə hesablamaq olar.

Məsələn, №5 fərdin a məhsulunun olması ehtimalını hesablaya bilərik tam qardaş cütləşmə, A lokusunda iki alleli var mənşəyə görə eynidir kimi F = 1/4 = 0.25 . Tipik qohum cütləşmələr üçün digər qohumluq və qohumluq əmsalları aşağıda göstərilmişdir.


Nəsli kəsilməkdə olan kritik quşda inbreeding hədlərini tapmaq üçün reqressiya ağacı analizindən istifadə edərək tendensiyalardan meyarlara keçid

Havayda nəsli kəsilməkdə olan quşların mühafizəsi proqramı, Mühafizə Araşdırmaları İnstitutu, San Dieqo Zoo Global, P.O. Box 39, Volcano, HI, 96785 U.S.A.

A. M. Flanagan-a yazışmaları ünvanlayın, [email protected] e-poçtu

Havayda nəsli kəsilməkdə olan quşların mühafizəsi proqramı, Mühafizə Araşdırmaları İnstitutu, San Dieqo Zoo Global, P.O. Box 39, Volcano, HI, 96785 U.S.A.

Həyat və Ətraf Mühit Elmləri Məktəbi, Sidney Universiteti, Sidney, NSW, 2006 Avstraliya

Biologiya şöbəsi, Havay Universitetinin Hilo, Hilo, HI, 96720 U.S.A.

Havayda nəsli kəsilməkdə olan quşların mühafizəsi proqramı, Mühafizə Araşdırmaları İnstitutu, San Dieqo Zoo Global, P.O. Box 39, Volcano, HI, 96785 U.S.A.

A. M. Flanagan-a yazışmaları ünvanlayın, [email protected] e-poçtu

Havayda nəsli kəsilməkdə olan quşların mühafizəsi proqramı, Mühafizə Araşdırmaları İnstitutu, San Dieqo Zoo Global, P.O. Box 39, Volcano, HI, 96785 U.S.A.

Həyat və Ətraf Mühit Elmləri Məktəbi, Sidney Universiteti, Sidney, NSW, 2006 Avstraliya

Biologiya şöbəsi, Havay Universitetinin Hilo, Hilo, HI, 96720 U.S.A.

Məqalənin təsir bəyanatı: : Reqressiya ağacının təhlili insan baxımında populyasiyaların genetik idarə olunması üçün inbreeding hədlərini müəyyən etmək üçün faydalı vasitədir.

Mücərrəd

Qoruyucu heyvandarlıq proqramlarında nəsli kəsilməkdə olan növlərə qohumluq əlaqələrinin necə təsir etdiyini başa düşmək onların bərpası üçün vacibdir. Havay qarğası ('Alala) (Corvus hawaiiensis) dünyanın ən nəsli kəsilməkdə olan quşlarından biridir. 2002-ci ildə vəhşi təbiətdə nəsli kəsildi və 2016-cı ildə başlayan son buraxılış səylərinə qədər, demək olar ki, bütün əhali qoruma yetişdirilməsi üçün insanların himayəsində qaldı. Damazlıq qohumluq əmsallarından istifadə (F), biz inbredinqin Havay qarğası nəslinin sağ qalmasına və reproduktiv müvəffəqiyyətə təsirini qiymətləndirdik. Biz qohumluq səviyyəsini (yəni, qohumluq həddini) müəyyən etmək üçün reqressiya ağacı analizindən istifadə etdik ki, bu da işə qəbul üçün “Alala” nəslinin sağ qalmasının əhəmiyyətli dərəcədə azalmasını izah edir. Alalada qohumluqla bağlı əvvəlki araşdırmaya bənzər olaraq, biz qohumluğun nəslin sağ qalmasına mənfi təsir göstərdiyini, lakin valideyn (süni ilə müqayisədə) yumurta inkubasiyasının nəslin sağ qalmasını işə götürmə üçün yaxşılaşdırdığını aşkar etdik. Bundan əlavə, yetkinlik yaşına qədər sağ qalan nəslin uzaq qohumlarla cins törətdiyi fərziyyəsinə əsaslanaraq, qohum yetişdirmənin nəslin reproduktiv uğuruna əhəmiyyətli dərəcədə təsir etmədiyini aşkar etdik. Bizim yeni reqressiya ağacı analizi tətbiqimiz göstərdi ki, qohumluq səviyyələri ilə nəsillər üstələyir F = 0,098 daha çox yetişmiş nəsillərə nisbətən işə qəbul zamanı sağ qalma ehtimalı 69% az idi və bu, əhalinin davamlı idarə edilməsi üçün xüsusi həddi təmin edir. Nəticələrimiz həyat tarixinin bütün mərhələlərində qohumluq depressiyasının qiymətləndirilməsinin vacibliyini vurğulayır, quşların qorunması proqramlarında süni yumurta inkubasiyasından daha çox valideynlərə üstünlük verilməsinin vacibliyini təsdiqləyir və əgər varsa, qohumluq hədlərini müəyyən etmək üçün bir vasitə kimi reqressiya ağacı analizinin faydasını nümayiş etdirir, damazlıq idarə olunan istənilən populyasiyada.

Mücərrəd

Moverse de las Tendencias a los Referentes Mediante el Analisis de Árbol de Regresión üçün Encontrar los Umbrales de Endogamia de una Ave en Peligro Crítico

Resume

Xüsusiyyətlərin bərpası üçün qorunub saxlanması üçün reproduksiya proqramları ilə endoqamiya və xüsusi növlərə təsir göstərməsi lazımdır. El cuervo hawaiano ('Alala) (Corvus hawaiiensis) es una de las especies de ave que se encuentra en meor peligro de exinción en todo el mundo. Esta especie se extinguió en vida libre en el 2002 y no fue hasta los recientes esfuerzos de liberación que iniciaron en 2016 que casi toda la población permaneció bajo cuidado humano en programas de reproducóa. Usamos los coeficientes de linaje endogámico (F) endoqamiyanı qiymətləndirmək üçün effektiv reproduktiv və yüksək səviyyəli havaya nəzarət edə bilərsiniz. Usamos un aálisis de árbol de regresión para identificar el nivel de endogamia (es decir, el umbral de endogamia) que 'Alala hasta el reclutamiento de la supervivencia de la descendencia de la substancial disminución açıq-aşkardır. Oxşar bir un estudio previo de la endogamia en los ‘Alaā, descubrimos que la endogamia tuvo un impacto negativo sobre la supervivencia de la descendencia pero que la incubación descendencia pero que la incubación parental (vs. la artificial de huevoslación de huevoslación de huevoslación. Además, encontramos que la endogamia no afectó de manera importante al éxito reproductivo de la descendencia, esto basado en la suposición de que los descendientes que sobreviven hasta la edad adulta se reproducen con parejasónaliyalıya. Nuestra applicación novedosa del analisis de árbol de regresión mostró que la descendencia con niveles de endogamia que exceden F = 0,098 tuvieron 69% menor endogamia ilə aquella progenie menos de reclutamiento que aquella progenie, lo que que proporciona un vallor spesifico de umbral para manejo continuo de la población. Endogámica de la depresión de la evaluación de la depresión de la Historia de vida, la incubación validancia de priorizar la incubación validan de la conservances de la depresión de la evaluación de la depresión de la evaluación de la resaltan nuestros results. Endogamianın identifikatoru üçün regresión como herramienta, təqdimatlar, ən yaxşı población manejada por linaje.

Fayl adı Təsvir
cobi13650-sup-0001-SuppMat.docx270.4 KB Əlavə məlumatı onlayn məqalənin sonundakı Dəstəkləyici məlumat bölməsində əldə etmək olar. Müəlliflər bu materialların məzmununa və funksionallığına görə məsuliyyət daşıyırlar. Sorğular (materialın olmaması istisna olmaqla) müvafiq müəllifə ünvanlanmalıdır.

Diqqət edin: Nəşriyyatçı müəlliflər tərəfindən verilən hər hansı dəstəkləyici məlumatın məzmununa və ya funksionallığına görə məsuliyyət daşımır. İstənilən sorğu (çatışmayan məzmundan başqa) məqalə üçün müvafiq müəllifə ünvanlanmalıdır.


Inbreeding ilə damazlıq IBD-dəyəri - Biologiya

İNBREDİNQİN MÜSLÜVLƏRİ VƏ ƏSAS YOLLARI
Müəllif hüququ 1996-2008 Sarah Hartwell

Inbreeding yaxın qohum pişiklərin, məsələn, ana/oğul, ata/qız, bacı/qardaş cütləşməsi və yarı qardaş/bacı-qardaş cütləşməsidir. Orta populyasiyadan daha yaxından əlaqəli olan heyvanların cütləşməsidir. Yetiştiricilər üçün bu, cinsdə əlamətlərin fiksasiyası üçün faydalı bir yoldur - bəzi sərgi pişiklərinin şəcərələri göstərir ki, onların əcdadlarının çoxu yaxından əlaqəlidir. Məsələn, Fan Tee Cee adı (1960 və 1970-ci illərdə göstərilib) getdikcə daha çox Siam cinslərində, bəzən bir neçə dəfə bir damazlıqda meydana çıxdı, çünki seleksiyaçılar öz cinslərini daha tipli etmək üçün narahat idilər. Mükəmməl nümunələr şou münsiflərinin təsdiqini qazanaraq damazlıq xidmətləri və ya nəsillər üçün həmişə çox axtarılır (əgər onlar artıq sterilizasiya olunmayıbsa, klonlaşdırma gələcəkdə bu problemi həll edə bilər).

Cins standartına yaxından cavab verən pişiklər yetişdirmək üçün damazlıqçılar adətən qohum olan və arzu olunan xüsusiyyətləri paylaşan heyvanları cütləşdirirlər. Zamanla, bəzən yalnız bir və ya iki nəsil, bu xüsusiyyətlər homozigot olacaq (genetik cəhətdən vahid) və inbred heyvanın bütün nəsli bu xüsusiyyətlərin genlərini miras alacaq (cins doğru). Yetiştiricilər nəslin necə görünəcəyini təxmin edə bilərlər. “Xətt yetişdirmə” genetiklərin işlətdiyi termin deyil, heyvandarlıqdan gəlir. Qohumluğun daha yumşaq formalarını göstərir. Xətt yetişdirmə hələ də qohumluq formasıdır, yəni bir ailə daxilində yetişdirmə və əmisi oğlu/əmisi oğlu, xala/qardaşı oğlu, qardaşı qızı/əmi və nənə və nənə/nəvə daxildir. Xətt yetişdirmə və qohumluq arasındakı fərq müxtəlif heyvan növləri və hətta eyni növ daxilində müxtəlif cinslər üçün fərqli şəkildə müəyyən edilə bilər. Bu, bir pişiyin ögey qardaşının da atası ola biləcəyi ilə çətinləşir!

Bununla belə, qohumluq əlaqələri potensial problemlərə malikdir. Davamlı qohumluq nəticəsində yaranan məhdud gen fondu zərərli genlərin geniş yayılması və cinsin gücünü itirməsi deməkdir. Laboratoriya heyvan tədarükçüləri immun depressiyaya məruz qalan və ya müəyyən bir xəstəlik üçün doğru olan heyvanların vahid suşlarını yaratmaq üçün bundan asılıdır, məsələn. epilepsiya. Bu cür heyvanlar genetik cəhətdən eyni olacaq (klonlar!), adətən yalnız eyni əkizlərdə müşahidə olunan bir vəziyyətdir. Eynilə, təsərrüfat mal-qarasında arzu olunan əlamətləri düzəltmək üçün nəzarət edilən miqdarda qohumluqdan istifadə edilə bilər, məsələn. süd məhsuldarlığı, yağsız/yağ nisbəti, böyümə sürəti və s. İnsan baxımından, qohumluq insest pişiklərinin insest tabuları olmadığı hesab edilir.

İki valideynin bir-biri ilə əlaqəsi olmadığı zaman qarşıdurma baş verir. Damazlıq heyvanlarda bu, çox vaxt dörd və ya beş nəsil nəsildə ortaq əcdadın heç bir valideynin arxasında olmadığı anlamına gəlir. Kiçik bir təməl genofondu olan heyvanlarda bu vəziyyəti qarşılamaq çətindir.

Qohumluğun metodik istifadəsini sənədləşdirən ilk insanlardan biri Robert Bakewell (1725-ci ildə anadan olub, Lesterşir, Böyük Britaniya) olub, o, öz sistemini “in-and-in” adlandırıb, çünki heyvanların diqqətli seçilməsi hər nəsildə bir cins xüsusiyyəti aşılayır. Bakewellə qədər Britaniya heyvandarlığı erkək və dişi erkəklərin sərbəst şəkildə cütləşdiyi yerli suşlara (land irqlərinə) əsaslanırdı. Kişiləri ayıraraq və "in-and-in" sistemindən istifadə edərək, Bakewell hansı xüsusiyyətlərin sonrakı nəsillərə ötürülməsinə nəzarət etdi. Buraya gələcək nəsli yaxşılaşdırmaq üçün yalnız ən yaxşı qoçların və öküzlərin öz qızlarına və ya nəvələrinə yetişdirilməsi (backcrossing, inbreeding) daxildir. Genetikadan əvvəlki dövrdə, Bakewell Britaniya mal-qaranın simasını (və becərməsini) dəyişdirmək və mal-qaranı daha gəlirli etmək üçün inbreedingdən istifadə etdi.

Əvvəlcə heyvandarların istifadə etdiyi bəzi terminləri müəyyənləşdirəcəyəm. Ümumiyyətlə, mən mütəxəssis terminlərindən qaçmışam, lakin siz bu məqalənin xaricində bu şərtlərə cavab verəcəksiniz.

Homoziqot hər iki valideyndən müəyyən bir əlamət üçün eyni "geni" miras almağı nəzərdə tutur, məsələn. xəz uzunluğu üçün. Təsadüfi mutasiya istisna olmaqla, homozigot fərdin nəslinin 100%-i bu geni miras alacaq. Inbreeding müəyyən bir əlaməti "təsbit etməklə" homozigotluğu artırır. Təmiz cins heyvanlar qarışıq cinslər və təsadüfi cins heyvanlarla müqayisədə yüksək dərəcədə homozigotluq nümayiş etdirirlər. Təmiz cins heyvanların ideyası ondan ibarətdir ki, onlar "doğru" yetişdirməlidirlər. Bir saf cins eyni cinsdən digəri ilə cütləşdikdə, nəsil vahid xüsusiyyətlərə sahib olacaq və valideynlərə bənzəyəcəkdir.

Heterozigot, hər bir valideyndən müəyyən bir xüsusiyyət üçün fərqli bir genin miras alınması deməkdir. Məsələn, uzun xəzin bir geni (resessiv) və qısa xəz üçün bir gen (dominant). Heterozigot fərdlərin nəslinin 50%-i bir formanı, 50%-i isə digər formanı miras alacaq. Diqqətlə idarə olunan "kəsişmə" hibrid nəslə yeni genlər daxil etməklə seçilmiş əlamətlər üçün heterozigotluğu artırır.

Heteroz hibrid güc üçün elmi termindir. Mümkündür ki, homozigot vəziyyətində daha az güclü fərdlər əmələ gətirən “pis” genlər var, çünki yaxşı genlər arzuolunmaz xüsusiyyətlərlə yanaşı nəzəri cəhətdən pis genlər də çıxarıla bilər, lakin praktikada bu, elə görünmür. baş verir. Digər nəzəriyyə sadəcə olaraq ondan ibarətdir ki, istədiyiniz effekti əldə etmək üçün sadəcə olaraq iki fərqli genin qarışığına sahib olmalısınız, çünki onlar bir-birini bir növ tamamlayırlar, çünki yüksək inbrasiyalı heyvanlar bu müxtəlifliyə malik deyillər və immun sistemləri zəifdir.

Cinslə əlaqəli, müəyyən bir cinsdən ötürülən və ya müəyyən edilən xüsusiyyətə aiddir. Həbəş pişiklərində qırmızı rəngin bir neçə versiyası var. Biri cinslə bağlıdır, yəni erkək pişiyə genin yalnız bir nüsxəsi lazımdır, lakin qırmızı rəng yaratmaq üçün dişiyə genin iki nüsxəsi lazımdır.

Homoziqotluq dərəcəsi bir heyvanın homozigot olduğu genlərin sayı deməkdir. Əgər onun genlərinin əksəriyyəti uyğunlaşdırılmış cütlərdirsə, onun genlərinin çoxu uyğun gəlməyən cütlərdirsə, yüksək homozigotluq dərəcəsinə malikdir. Heyvan bəzi əlamətlərə görə homozigot ola bilər, digərləri üçün isə heterozigot ola bilər.

İNBREEDİNGİN TƏBİİ HƏSAS BÜYÜLMƏSİ

Bu o demək deyil ki, qohumluq təbii olaraq baş vermir. Coğrafi və ya digər amillərə görə digər pişiklərdən təcrid olunmuş vəhşi koloniya, xüsusən dominant kişi bacıları ilə, sonra qızları və nəvələri ilə cütləşərsə, çox doğma ola bilər. O, taxtdan salındıqda, çox güman ki, onun öz oğlu və ya nəvəsi olacaq və buna görə də qohumluğu davam etdirir. Hər hansı bir zərərli genin təsiri sonrakı nəsillərdə nəzərə çarpır, çünki nəslin əksəriyyəti bu genləri miras alır. Alimlər çitaların müxtəlif ərazilərdə yaşasalar belə, genetik cəhətdən çox oxşar olduğunu aşkar ediblər. Ola bilsin ki, xəstəlik və ya fəlakət keçmişdə çitaların sayını kəskin şəkildə azaldıb, genetik darboğaz yaradır. Müasir çitaların hamısı sağ qalan tək bir ailə vahidindən törəyə bilər, buna görə də onların genetik vahidliyi.

Çitalarda genetik müxtəlifliyin olmaması onları xəstəliklərə həssas edir, çünki onlar müəyyən viruslara qarşı müqavimət göstərə bilmirlər. Həddindən artıq inbreeding kiçik zibil ölçüləri və yüksək ölüm nisbətləri ilə onların reproduktiv uğurlarına təsir göstərir. Bəzi elm adamları ümid edirlər ki, ləkəli izləri ilə xarakterizə olunan "Kral Çita"nın görünüşü, çitanın mutasiya yolu ilə daha sağlam genofond inkişaf etdirə biləcəyi anlamına gəlir (bir şərtlə ki, insan onları yox etməsə). Bəşəriyyət idmanla məşğul olan çitaların müxtəlifliyini itirməsinə və mövcud cütlərin sayını azaltmağa kömək etdi. Ovçular kubok otağı üçün qeyri-adi nümunələr (yəni genetik cəhətdən müxtəlif olanlar) çəkməyə üstünlük verirdilər və buna əvvəllər uzun saçlı "yunlu çitalar" və keçmişdə daha çox genetik müxtəlifliyi göstərən boz/mavi çitalar daxil idi.

Alimlərin ümidlərinə baxmayaraq, bəzi çita populyasiyaları qohumluq əlamətlərini göstərir. Vəhşi təbiət qoruqları kimi getdikcə daha kiçik ərazilərlə məhdudlaşan populyasiyalar bir-birindən genetik olaraq təcrid olunmuşlar. Bir populyasiyada səhv düzülmüş çənələrin və bükülmüş quyruqların artan tezliyi var. Davamlı inbreeding bu xüsusiyyətləri gücləndirəcək və ya düzəldəcəkdir. Nəhayət, onlar çitanın ov effektivliyini azalda bilər - bükülmüş quyruq onun çevikliyini və döngə qabiliyyətini azaldacaq və səhv düzülmüş çənələr ovdan tuta bilməyəcək.

Canavar bir vaxtlar Şimali Amerikada geniş yayılmışdı, lakin qalan dəstələrin çoxu təcrid olunmuş və doğmalaşmışdır. İzolyasiya/inbreeding problemi o qədər kəskinləşib ki, təbiəti qoruyanlar genofondu canlandırmaq üçün canavarları bir ərazidən götürüb başqa əraziyə yerləşdiriblər. Bəzi ərazilərdə cütlük seçimi o qədər azalıb ki, canavarlar ev itləri ilə cütləşməyə əl atıblar - hibridləşmə adlanan həddindən artıq keçid forması. Şotlandiyada Şotlandiya Vəhşi Pişiyinin ev pişikləri ilə cütləşdiyi oxşar vəziyyət, ev pişiyi genləri daha geniş yayıldıqca vəhşi pişiyi məhv etməklə hədələyir. Bunlar iki haldır ki, krossinq (ardınca və ardınca qohumluq) növün nəslinin kəsilməsinə səbəb ola bilər (ev cinslərində növün itirilməsinə bənzər).

Qohumluğun təsirindən əziyyət çəkən başqa bir heyvan Nəhəng Pandadır. Çitada olduğu kimi, bu, pandalar arasında aşağı məhsuldarlığa və yüksək uşaq ölüm nisbətlərinə səbəb oldu. Panda populyasiyaları bir-birindən daha çox təcrid olunduqca (bir vaxtlar Pandaların bir bölgədən digərinə keçmək üçün istifadə etdiyi marşrutları insanların blokadasına görə) Pandalar fərqli gen qarışığına malik həyat yoldaşı tapmaqda daha çox çətinlik çəkir və daha az müvəffəqiyyətlə çoxalır. Nəhəng Pandanın nəsli kəsiləcək, hətta klonlaşdırma üsulları mövcud olsa belə, demək olar ki, qaçılmazdır, çünki genefond növlərin uzunmüddətli həyat qabiliyyəti üçün çox yoxsuldur. Buna görə də hesab etmək olar ki, bütün saf cins heyvanlar son nəticədə qohumluq yolu ilə həyat qabiliyyətini itirəcək və damazlıqçılar selektiv yetişdirmənin zərərli təsirlərini ləngitməklə növü saxlamaq üçün diqqətlə işləməlidirlər.

Qohumluq və canlılığa dair çoxsaylı tədqiqatlar aparılmışdır. Kanadanın Vankuver yaxınlığındakı Mandarte adası o qədər kiçikdir ki, hər bir mahnı sərçəsini çalmaq, izləmək və cütləşmələri qeyd etmək olar. Tədqiqatçılar hər bir fərdin nə qədər doğma olduğunu dəqiq bilirlər. Şiddətli qış fırtınaları quşların 90% -dən çoxunu məhv edərkən, İsveçrənin Sürix Universitetindən Lukas Keller, bütün doğma fərdlərin öldürüldüyünü aşkar etdi. O, "inbred"i birinci əmiuşağı və ya daha yaxın qohumlar arasında cütləşmə kimi təyin etdi. Loeske Kruuk, Edinburq Universiteti, Şotlandiya, aşkar etdi ki, qardaş-bacı cütlüyündən doğulan yaxalı milçək ovçularının yetkinliyə qədər sağ qalma ehtimalı, qohum olmayan cütləşmələrin nəsillərinə nisbətən 90% daha azdır. Finlandiya, Helsinki Universitetindən İlkka Hanski müəyyən etdi ki, Afrika kəpənəklərinin müəyyən bir növündə qardaş-bacı cütləşməsinin erkək nəslinin 50%-i sterildir.

Təbii təcrid və qohumluq bir adada inkişaf edən Manx kimi yerli pişik cinslərinin yaranmasına səbəb oldu ki, bununla əlaqədar problemlərə baxmayaraq, quyruqsuzluq geni geniş yayıldı. İnsan adasında qəribə pişik tullanan gəmidən başqa, çox az ötüşmə baş verdi və qohumluğun təsiri orta hesabla daha kiçik zibil ölçülərində öz əksini tapdı (genetiklər inanır ki, əvvəllər düşünüldüyündən daha çox Manks pişikləri genetik anormallıq səbəbindən reabsorbsiya olunur), Çalışqan yetişdiricilərin aradan qaldırmaq üçün çox çalışdıqları ölü doğumlar və onurğa anomaliyaları.

Qeyd edildiyi kimi, bəzi vəhşi koloniyalar digər pişiklərdən təcrid olunduqları (məsələn, uzaq fermada) və ya ərazidəki digər potensial cütlüklər onları genofonddan çıxararaq sterilizasiya olunduğu üçün yüksək inbrasiyaya çevrilirlər. Vəhşi heyvanlarla məşğul olan pişik işçilərinin əksəriyyəti qohum yetişdirmənin bəzi təsirləri ilə qarşılaşdılar. Belə koloniyaların daxilində müəyyən əlamətlərin ortadan yuxarı baş verməsi ola bilər. Bəziləri ciddi deyil məsələn. calico naxışlı pişiklərin üstünlük təşkil etməsi. Inbred koloniyalarda orta saydan çox tapıla bilən digər irsi xüsusiyyətlərə polidaktiliya (indiyə qədər bildirilən ən ekstremal hal hər ayağında 9 barmağı olan Amerika pişiyi olub), cırtdanlıq (baxmayaraq ki, cırtdan dişi pişiklər doğuş zamanı problem yaşaya bilər) daxildir. pişiklərin baş ölçüsünə görə pişiklər), digər struktur deformasiyaları və ya müəyyən irsi şərtlərə meyllilik.

Davamlı qohumluq əlaqələrinin son nəticəsi, genofondun büzülməsi, məhsuldarlığın azalması, anormallıqların artması və ölüm nisbətlərinin artması nəticəsində son güc çatışmazlığı və ehtimal olunan məhv olmaqdır. Digər tərəfdən, həddindən artıq aşırma növün itkisinə və buna görə də fərqli bir cinsin itirilməsinə səbəb olacaqdır.

Qohumluq 0-dan 1-ə qədər olan miqyasda Qohumluq əmsalı (COI) kimi ölçülür və ifadə edilir. O, həm ev heyvanlarının, həm də təsərrüfat mallarının yetişdirilməsində geniş istifadə olunur. COI 0 = inbreeding yoxdur COI 0,25 = 25% inbreeding (adətən qardaş-bacı) və COI 0,01 = 1% inbreeding. Heyvandarlıqda və heyvandarlıqda “inbred” yüksək KOİ-yə malik ciddi inbred heyvanlara aiddir.

Süni izolyasiya (selektiv yetişdirmə) oxşar effekt verir. Cəlbedici bir mutasiyadan yeni bir cins yaratarkən, genofond əvvəlcə qohum pişiklər arasında tez-tez cütləşmə ilə mütləq kiçikdir. Kortəbii mutasiya nəticəsində yaranan bəzi cinslər Devon Reksdə spastiklik (serebellar hipoplaziya), Şotlandiya qıvrımlarında skelet problemləri və Mankslarda yarı öldürücü genin (aka təxirə salınmış öldürücü gen) təsiri və ölümcül gen kimi problemlərlə doludur. Ojos Azules. Omba displaziyası və patella luxasiyası kimi problemlər bəzi cinslərdə və yetişdirmə xətlərində digərlərinə nisbətən daha çox rast gəlinir, bu da keçmiş qohumluqların səhv genləri yaydığını göstərir. Uyğun kənarların seçilməsi sağlam genləri bərpa edə bilər, əks halda itə bilər, tipə mənfi təsir göstərmədən.

Təəssüf ki, evtanaziya tələb edən ölümcül deformasiya olan "Birma baş qüsuru" "Müasir" görünüşü ilə əl-ələ verdi. Fan Tee Cee siamların formasını dəyişdirdiyi kimi, bir pişik də Amerika Birmanının formasını orta yad formadan "boksqabənzər" qısa burunlu, yuvarlaq başlı, çəllək sinəli görünüşünə dəyişdi. Amerika birma cinsində geniş yayılmış baş qüsuru Good Fortune Fortunatas (1977-ci ildə Milli Ən Yaxşı Birma) adlı məhsuldar damazlıq pişiklə bağlıdır. Baş qüsuru Good Fortune Fortunatas-dan əvvəl mövcud olsa da, bu gün onun yayılmasına səbəb olan cinsə təsiri idi. Fortunatas, dünyanın başqa yerlərində tanınan tipdən ayrılan, qübbəli, qübbə başlı "müasir" birma üçün əla nümunə kimi qiymətləndirildi. Daha çox insan yetişdirmə xətlərində yeni görünüş istədikcə Fortunatasın ölümcül mirası yayıldı. .

Demək olar ki, hər bir Fortunatas balasında yeni görünüşlə daha çox şou keyfiyyətli nəsillər yetişdirən şou keyfiyyətli nəsillər var idi. 1978-ci ildən bəri, demək olar ki, bütün Birma milli qalibləri öz nəsillərini Fortunatas'a qədər izləyə bilirlər və o, sözün əsl mənasında və öldürücü şəkildə cinsin üzünü dəyişdirdi. Onun adı damazlıq şəcərədə dəfələrlə dəfələrlə ortaya çıxır və ölümcül baş qüsuru resessiv genini gətirir. Bu gen yalnız daşıyıcılar bir-birinə cütləşdikdə və ciddi şəkildə qüsurlu pişiklər doğulduqda ortaya çıxacaq. Bu zamana qədər gen geniş yayılmışdı. Bütün mümkün daşıyıcıların (Fortunatasın bütün nəsilləri) sterilizasiyası Amerika Birma genofondunu məhv edərdi. Only cats that produce deformed offspring are retired from breeding, but by then they may already have passed on the hidden recessive. This is the danger when one individual has excessive influence in a small gene pool. As a result of the new head shape and Fortunatas's lethal legacy, the American Burmese is is prohibited from competion in Europe and American bloodlines may not be introduced into European gene pools. Burmese cats in Europe, Australia and New Zealand were not influenced by the Fortunatus look and remained free of the hereditary fault in addition, occasional outcrossing to introduce new colours has ensured that European lines do not become so inbred. Meanwhile, American Burmese breeders hope a blood test will one day identify the lethal allele and allow carriers to be identified.

Another example of a lethal gene which determines a breed trait is the blue-eyed Ojos Azules. The gene is lethal in the homozygous form causing stillbirth, cranial deformities, white fur and a small curled tail. In the heterozygous form, the Ojos Azules are blue eyed non-white cats. Breeders must therefore breed blue-eyed cats (heterozygous) to non-blue-eyed cats (lacking the gene for the eye colour, but having the conformation) in order to get a roughly 50/50 split of blue-eyed and non-blue-eyed kittens while avoiding deformed dead kittens.

The more that inbreeding is used to get rid of undesirable traits or to fix a desirable trait, the more likely it is that individuals will also inherit the same set of genes for the immune system from both parents, and be born with less vigourous immune systems. The immune system problem is compounded over successive generations as the animals become genetically more uniform (like the cheetah). According to one theory, immunodeficiency may be caused by a simple lack of heterozygosity in the genes that control the immune system. This is why random-bred cats are generally so robust.

Breeder and author Phyllis Lauder wrote in 1981: "Favoured varieties of today have been bred sire to daughter and cousin to cousin until their breeds are ruined [. ] man's insistence on upon breeding in order to perpetuate features approved in the show ring has produced animals of weak constitution, prone to such conditions as skin troubles, lacking in intelligence, no longer mentally alert, eventually stupid and at last breeding with difficulty: a state of affairs leading in the end to the sterility and death of the breed."

Zoos engaged in captive breeding programs are aware of this need to outcross their own stock to animals from other collections. Captive populations are at risk from inbreeding since relatively few mates are available to the animals, hence zoos must borrow animals from each other in order to maintain the genetic diversity of offspring. In sheep, centuries of selective breeding to improve the quality of wool has caused an important trait to be lost. Ancestral sheep could breed more than once per year. Modern sheep breed once per year. Only recently has the importance of the lost gene been realised (i.e. to increase meat yield), but to reintroduce it from primitive sheep would reduce other qualities selectively bred for over centuries.

Most laboratory mice are becoming so highly inbred that they would probably not survive outside of a sterile laboratory due to poor immune systems (they are generally killed before this becomes a problem in the laboratory situation) and some strains become extinct due to reproductive failure. Many are selectively bred to exhibit defects which will kill them.

Inbreeding holds problems for anyone involved in animal husbandry - from canary fanciers to farmers. Early Turkish Vans were reported to be temperamental, a problem apparently rectified by the importation of new stock. Attempts to change the appearance of Burmese cats in America to produce a cat with a rounder head resulted in cats with congenital problems. Siamese cats have become progressively finer-boned as breeders strive to emphasise the foreign look, resulting in frailer cats in some breeding lines.

In the dog world, a number of breeds now exhibit hereditary faults due to the over-use of a particularly "typey" stud which was later found to carry a gene detrimental to health. By the time the problems came to light they had already become widespread as the stud had been extensively used to "improve" the breed. In the past some breeds were crossed with dogs from different breeds in order to improve type, but nowadays the emphasis is on preserving breed purity and avoiding mongrels.

Those involved with minority breeds (rare breeds) of livestock face a dilemma as they try to balance purity against the risk of genetic conformity. Enthusiasts preserve minority breeds because their genes may prove useful to farmers in the future, but at the same time the low numbers of the breed involved means that it runs the risk of becoming unhealthily inbred. When trying to bring a breed back from the point of extinction, the introduction of "new blood" through crossing with an unrelated breed is usually a last resort because it can change the very character of the breed being preserved (as noted by cat fanciers when Russian Blues were crossed to Blue Point Siamese after World War II). In livestock, successive generations of progeny must be bred back to a purebred ancestor for 6 - 8 generations before the offspring can be considered purebred themselves.

In the cat fancy, breed purity is equally desirable, but can be taken to ridiculous lengths. Some fancies will not recognise "hybrid" breeds such as the Tonkinese because it produces variants (yet Manxes are recognised and also produce variants). Breeds which cannot produce some degree of variability among their offspring risk finding themselves in the same predicament as Cheetahs and Giant Pandas. Such fancies have lost sight of the fact that they are registering "pedigree" cats, not "pure-bred" cats, especially since they may recognise breeds which require occasional outcrossing to maintain type!

The breed purity debate goes along these lines: should a breed be based on genotype (what genes it inherited) or phenotype (appearance, despite an out-cross four generations ago) A Tabby-point Siamese is phenotypically Siamese, but because the tabby pattern was introduced from non-Siamese cats, genotype-followers consider it "not Siamese" and are worried it will pollute their purebred breeding lines. In some registries, Exotic Longhairs are identical to Persians, but may not be bred with Persians. Likewise, some registries do not allow chocolate or lilac Persians to be classed as Persians because the colours were introduced from Siamese cats (via the Himalayan breed) umpteen generations ago and are therefore "tainted". Those "tainted" genes may be bundled with whole lot of healthy genes by not outcrossing "purebreds" to "tainted" cats, the opportunity to increase the heterozygosity of the immune system is lost (there is a footnote on phenotype/genotype/purebred/pedigree philosophies).

One formula to reduce inbreeding and slow down the loss of vigour is to line-breed for 2-3 generation and then out-cross to an unrelated line (or occasionally another breed) to get back hybrid vigour and genetic diversity. However with the emphasis on breeding for type and competitiveness on the showbench (and when making a sale), the typey studs get used more and more often and there is less and less chance of finding a truly unrelated line.

See The Pros and Cons of Cloning for further discussion on inbreeding hazards should cloning of typey animals become permissible.

EFFECT OF SELECTIVE BREEDING ON GENETIC DIVERSITY

In their study comparing the genetics of several breeds (Lipinski MJ, et al., The ascent of cat breeds: genetic evaluations of breeds and worldwide random-bred populations, Genomics (2007), researchers found artificial selection had reduced genetic diversity within single breeds. The study confirmed that cat breeds are less genetically diverse than random-bred cats. Lipinski et al, found that loss of diversity did not correlate with breed popularity or age, but did correlate with the number of foundation animals from which a breed was established (and the degree of permitted outcrossing). The Burmese, Havana Brown, Singapura, and Sokoke were least genetically diverse.

The Burmese and Singapura breeds were the least genetically diverse of the breeds sampled, reflectting the most intense inbreeding . The Burmese was descended from a Tonkinese-type female called Wong Mau. The Singapura is largely a derivative of the Burmese in spite of a fanciful mythology about it being an indigenous Singaporean cat (in Holland there are cats identical to the Singapura that have been bred from wholly Burmese lines). The Sokoke is a recent breed being developed from a small pool of distinctive looking cats found in the Sokoke forest region of Kenya. Outside of the USA, the Havana brown is a colour variant of Oriental cats.

The Siberian was the most genetically diverse and comparable to the genetic diversity in random-bred cats due to having a broad foundation stock. The Norwegian Forest Cat, Persian (and related Exotic) and British Shorthair were also genetically diverse, reflecting multiple lineages (the Persian was developed in the 19th century from a mix of Turkish, Russian and British longhairs and other genes have crept in along the way during the development of other breeds including Siamese genes and even rex genes).

IMPLICATIONS OF INBREEDING FOR THE CAT BREEDER

Most cat breeders are well aware of potential pitfalls associated with inbreeding although it is tempting for a novice to continue to use one or two closely related lines in order to preserve or improve type. Breeding to an unrelated line of the same breed (where possible) or outcrossing to another breed (where permissible) can ensure vigour. Despite the risk of importing a few undesirable traits which may take a while to breed out, outcrossing can prevent a breed from stagnating by introducing fresh genes into the gene pool. It is important to outcross to a variety of different cats, considered to be genetically "sound" (do any of their previous offspring exhibit undesirable traits?) and preferably not closely related to each other. Outcrossing is made difficult by the amount of inbreeding in previous generations - it becomes hard to find cats which are not related, sometimes several times over.

How can you tell if a breed or line is becoming too closely inbred? One sign is that of reduced fertility in either males or females. Male Cheetahs are known to have a low fertility rate. Failure to conceive, small litter sizes and high kitten mortality on a regular basis indicates that the cats may be becoming too closely related. The loss of a large proportion of cats to one disease (e.g. enteritis) indicates that the cats are losing/have lost immune system diversity. If 50% of individuals in a breeding program die of a simple infection, there is cause for concern.

Highly inbred cats also display abnormalities on a regular basis as "bad" genes become more widespread. These abnormalities can be simple undesirable characteristics such as misaligned jaws (poor bite) or more serious deformities. Sometimes a fault can be traced to a single stud or queen which should be removed from the breeding program even if it does exhibit exceptional type. If its previous progeny are already breeding it's tempting to think "Pandora's Box is already open and the damage done so I'll turn a blind eye". Ignoring the fault and continuing to breed from the cat will cause the faulty genes to become even more widespread in the breed, causing problems later on if its descendants are bred together.

One breed which was almost lost because of inbreeding is the American Bobtail. Inexperienced breeders tried to produce a colourpoint bobtailed cat with white boots and white blaze and which bred true for type and colour, but only succeeded in producing unhealthy inbred cats with poor temperaments. A later breeder had to outcross the small fine-boned cats she took on, at the same time abandoning the rules governing colour and pattern, in order to reproduce the large, robust cats required by the standard and get the breed on a sound genetic footing.

INBREEDING
(Mating of closely related individuals)

Produces uniform or predictable offspring.
Hidden (recessive) genes show up and can be eliminated.
Individuals will "breed true" and are "pure."
Doubles up good genes.
Eliminates unwanted traits.

Doubles up on faults and weaknesses.
Progressive loss of vigor and immune response.
Increased reproductive failures, fewer offspring.
Emphasis on appearance means accidental loss of "good" genes for other attributes.
Genetically impoverished individuals.

LINE-BREEDING
(Mating of less closely related individuals)

Avoid inbreeding of very closely-related cats, but cats are still "pure".
Produces uniform or predictable offspring.
Slows genetic impoverishment.

Require excellent individuals.
Does not halt genetic impoverishment, only slows it down.

OUTCROSSING (Mating of unrelated individuals within the same breed)

Brings in new qualities or reintroduces lost qualities.
Increases vigor.
Cats are still "pure".

Less consistency and predictability of offspring.
May have to breed out unwanted genes accidentally introduced at same time.
May be hard to find individuals which are true outcrosses.

HYBRIDIZATION (Mating of unrelated individuals of different breeds)

Brings in new qualities or reintroduces lost qualities.
Increases vigor, may improve immune system and reproductive capacity.
Introduces totally new traits e.g. color. Fur type.
May result in new breeds.
The offspring are considered "impure" for many generations.

Unpredictable - new traits may not all be desirable.
Must choose outcross breed whose qualities complement or match own breed.
May take years to eliminate unwanted traits/loss of type.
May take years to get consistent offspring.
Produces many variants not suitable for use in breeding program.

As well as recording matings and tracing pedigrees, modern biologists can look for genetic evidence of inbreeding in an individual's genome (genomics). Zoologist Bill Amos at Cambridge University, England analyses genetic markers to assess how closely related an individual's parents are. This allows them to look at the effect of inbreeding in wild populaitons, something previously difficult or impossible as it was not possible to trace pedigrees. Although not foolproof, blood testing and genetic analysis can indicate how closely animals are related.

As well as inheriting copies of genes from each parent, animals inherit sections of non-coding ("junk") DNA which can be used as genetic markers and are known as microsatellites. As well as being homozygous or heterozygous for genes, animals can be homozygous or heterozygous for these microsatellites. Even without inbreeding, some markers are naturally more widespread in a population than others. Looking at several markers at a time gives a better measure of relatedness (the more markers which can be tracked, the better the results). Some of those markers may be next door to beneficial or harmful genes (or, because many genes work in association with other genes, next door to genes which are influenced by other "good" or "bad" genes elsewhere in the genome) - in the absence of artificial selection by breeders, markers next to "good" genes will be more widespread than those next to "bad" genes because the "bad" genes make the animal less likely to survive.

The technique is not foolproof, but if Amos's currently controversial calculations do turn out to be correct, inbreeding is more damaging than previously realised and even cousin-cousin matings may result in inbreeding depression. His studies suggest inbreeding is more important than environmental challenges in determining an individual's chances of survival. The "degree of microsatellite homozygosity" (what Amos calls "internal relatedness") means the number of identical markers. Animals with high microsatellite homozygosity fare worse than highly heterozygous individuals. In island-living wild Soay sheep, those with higher homozygosity also had more parasitic worms and were more likely to be sick.

Amos suggests that the disadvantages of inbreeding are more pervasive than previous suspected. In the past, inbreeding was considered relatively unimportant compared to environmental challenges such as finding food, finding mates or avoiding predators. Amos suggests that animals with higher internal relatedness produce fewer young and suffer more from disease, parasites or cancer. In nature, inbred individuals tend not to survive this removes harmful mutations from the population. Inbreeding depression is known to affect the immune system. Artificial selection by breeders means genetically weak individuals, which would normally be weeded out by natural selection, get a chance to pass on their mutations to another generation and, being more prone to disease, will need more medical care during their lifetimes than less inbred individuals.

As well as selecting animals for physical traits, it is important to select them for health traits as the prevalence of Polycystic Kidney Disease in Persians and Exotics demonstrates. Registries may have to permit more outcrossing between breeds to ensure the vigour of any single breed. Currently, many gene pools are closed (no more outcrossing) when the desired traits are fixed and a certain population level is reached.

Inbreeding is a two-edged sword. On the one hand a certain amount of inbreeding can fix and improve type to produce excellent quality animals. On the other hand, excessive inbreeding can limit the gene pool so that the breed loses vigour. Breeds in the early stages of development are most vulnerable as numbers are small and the cats may be closely related to one another. It is up to the responsible breeder to balance inbreeding against crossings with unrelated cats in order to maintain the overall health of the line or breed concerned.

In January 2003, India announced plans to clone cheetahs to help restore the Indian sub-continent's now extinct cheetah population. India plan to clone cheetahs from Iran where about 50 Asiatic Cheetahs remain.

Cloning creates genetically identical individuals. However, cheetahs are already so highly inbred that individuals are already almost genetically identical so the impact of clones on the population will be to increase numbers rather than further decease genetic variation. If it uses the leopard's own egg cells it would introduce the leopard's mitochondrial DNA (the DNA found in an egg cell) into the cheetah population.

FOOTNOTE: PUREBRED VS PEDIGREE PHENOTYPE VS GENOTYPE

There is a long-running and often bitter in several cat registries about recognising and perpetuating breeds based on phenotype or on genotype. Phenotype means "what it looks like" while genotype means "its genetic make-up". The latter requires a cat's pedigree to be known over several generations and for the pedigree to contain only cats of the same breed.

The debate has been a long-running one among breeders of Persian and Siamese cats this is hardly surprising as recognition of these two breeds dates back to the dawn of the cat fancy in the 1870s and 1880s. Should the "new" colours of Siamese (red points, tortie points etc) be recognised as Siamese or should they be kept separate e.g. as Javanese, because their bloodlines are not pure the same applies to self chocolate and self lilac in Persians since these colours came from the Siamese via the colourpoint Persian (Himalayan). Among rare breed livestock breeders, the 7 th generation offspring of an outcross is considered purebred if each generation of offpring have been backcrossed to a pure bred animal following the initial outcross. In cat breeding, the only remaining trait from the outcross might be the new colour, but among extremely pro-genotype cat breeders, that bloodline is considered forever tainted by the outcross and will never produce "purebred" cats. Some pro-genotype breeders admit to wanting cat fancying to remain an elite hobby, with only "purebred" cats tracing back to original stock being accepted for breeding.

Among pro-phenotype breeders, the situation is somewhat different. If it looks like a Siamese in all respects, apart from the new colour, then it is accepted as a Siamese regardless of mixed ancestry several generations back. They accuse the pro-genotype breeders of unnecessary snobbery and point out the dangers of inbreeding. The separation of the new colours of Siamese and Persians is considered artificial since the cats' conformation is unchanged.

As mentioned earlier, pro-genotype cat fanciers lose sight of the fact that they are registering pedigree cats - pedigree does not mean the same as purebred! All breeds began based on phenotype i.e. what they looked like. For example, naturally occurring cats with a particular "look" might gathered together and called a breed e.g. the British Shorthair or Maine Coon. These are considered natural breeds. Even where the foundation cats are pedigree members of different breeds, the new breed is selected for, and refined, according to its appearance. In the early days of a breed it sometimes becomes necessary to accept cats of unknown ancestry but appropriate appearance into the breed to expand the bloodlines and prevent a dangerous level of inbreeding. All breeds have to start somewhere - and that somewhere has a phenotypic basis.

One danger, pointed out by pro-genotype breeders is that accepting "lookalike" cats into a breed with a known genotype can introduce unwelcome unknown genes which could become widespread and result in undesirable traits later on. If the two faction, pro-genotype and pro-phenotype, diverge any further, it will result in different variants of breeds being recognised - not just a split along tradition vs classic vs contemporary lines, but a split along the lines of "Phenotypic Siamese" and "Genotypic Siamese" with the two strains no longer being interbred for fear of taining the genotypically "pure" variety. Isolating a strain to keep its genotype pure means it will inevitably become inbred.

There needs to be a sensible balance. When enough generations have elapsed, a descendant far removed from the original outcross is, to all intents and purposes, purebred. The variation in its genes from the outcross is probably no greater than the variation due to natural mutation. Breeds in their infancy may need to pursue phenotypic breeding programs until the gene pool is wide enough to support breeding along genotypic lines. To revisit the example of Siamese cats - the early imports may have been seal and the earliest colours seal, blue, chocolate and lilac, but in their homeland, as I have witnessed on the streets of Malaysia and Thailand, colourpoint cats occur in all colours! It is only a quirk of cat fancy history that has led to those first four colours being declared true Siamese colours and the others being considered "introduced" colours.


Sex-Biased Inbreeding Effects on Reproductive Success and Home Range Size of the Critically Endangered Black Rhinoceros

A central premise of conservation biology is that small populations suffer reduced viability through loss of genetic diversity and inbreeding. However, there is little evidence that variation in inbreeding impacts individual reproductive success within remnant populations of threatened taxa, largely due to problems associated with obtaining comprehensive pedigree information to estimate inbreeding. In the critically endangered black rhinoceros, a species that experienced severe demographic reductions, we used model selection to identify factors associated with variation in reproductive success (number of offspring). Factors examined as predictors of reproductive success were age, home range size, number of nearby mates, reserve location, and multilocus heterozygosity (a proxy for inbreeding). Multilocus heterozygosity predicted male reproductive success (p< 0.001, explained deviance >58%) and correlated with male home range size (səh < 0,01, r 2 > 44%). Such effects were not apparent in females, where reproductive success was determined by age (səh < 0.01, explained deviance 34%) as females raise calves alone and choose between, rather than compete for, mates. This first report of a 3-way association between an individual male's heterozygosity, reproductive output, and territory size in a large vertebrate is consistent with an asymmetry in the level of intrasexual competition and highlights the relevance of sex-biased inbreeding for the management of many conservation-priority species. Our results contrast with the idea that wild populations of threatened taxa may possess some inherent difference from most nonthreatened populations that necessitates the use of detailed pedigrees to study inbreeding effects. Despite substantial variance in male reproductive success, the increased fitness of more heterozygous males limits the loss of heterozygosity. Understanding how individual differences in genetic diversity mediate the outcome of intrasexual competition will be essential for effective management, particularly in enclosed populations, where individuals have restricted choice about home range location and where the reproductive impact of translocated animals will depend upon the background distribution in individual heterozygosity.

Efectos de la Endogamia Sesgada por el Sexo sobre el Éxito Reproductivo y el Rango del Tamaño de Hábitat del Rinoceronte Negro, Especie en Peligro Crítico

Resume

Una premisa central de la biología de la conservación es que las poblaciones pequeñas padecen de viabilidad reducida por medio de la pérdida de la diversidad genética y la endogamia. Sin embargo hay poca evidencia de que la variación en la endogamia impacta el éxito reproductivo individual dentro de las poblaciones remanentes de un taxón amenazado, principalmente debido a los problemas asociados con la obtención de información integral del linaje para estimar la endogamia. Con el rinoceronte negro, especie en peligro crítico que sufrió reducciones demográficas severas, usamos un modelo de selección para identificar factores asociados con el éxito reproductivo (número de descendientes). Los factores que se examinaron como indicadores del éxito reproductivo fueron la edad, el tamaño del hábitat, el número de parejas cercanas, ubicación en la reserva y heterocigocidad multilocus (un indicador de endogamia). La heterocigocidad multilocus predijo el éxito reproductivo de los machos (səh < 0.01, desviación explicada >58%) y tuvo correlación con el tamaño de hábitat de los machos (səh < 0,01, r 2 > 44%). Tales efectos no fueron aparentes con las hembras, donde el éxito reproductivo estuvo determinado por la edad (səh < 0.01, desviación explicada 34%), ya que las hembras crían solas a los becerros y escogen a su pareja, en lugar de luchar por ella. El primer reporte de una asociación de tres vías entre la heterocigocidad de un macho individual, la salida reproductiva y el tamaño del territorio en un vertebrado de gran tamaño es consistente con una asimetría en el nivel de competencia intrasexual y resalta la relevancia de la endogamia con sesgo de sexo para el manejo de muchas especies con prioridad de conservación. Nuestros resultados contrastan con la idea de que las poblaciones silvestres de un taxón amenazado pueden poseer alguna diferencia inherente de la mayoría de las poblaciones no amenazadas que exige el uso de linajes detallados para estudiar los efectos de la endogamia. A pesar de la varianza sustancial en el éxito reproductivo de los machos, la aptitud incrementada de más machos heterocigotos limita la pérdida de la heterocigocidad. Entender cómo las diferencias individuales en la diversidad genética moderan el resultado de la competencia intrasexual será esencial para un manejo efectivo, particularmente en poblaciones adjuntas, donde los individuos tienen opciones restringidas de tamaño de hábitat y donde el impacto reproductivo de animales translocados dependerá del trasfondo de la distribución en la heterocigocidad individual.


IBD-value in pedigree with inbreeding - Biology

MDPI tərəfindən nəşr olunan bütün məqalələr açıq giriş lisenziyası altında dərhal bütün dünyada əlçatan edilir. Şəkillər və cədvəllər daxil olmaqla, MDPI tərəfindən dərc edilmiş məqalənin hamısının və ya bir hissəsinin təkrar istifadəsi üçün xüsusi icazə tələb olunmur. Açıq giriş Creative Common CC BY lisenziyası altında dərc olunan məqalələr üçün məqalənin hər hansı bir hissəsi orijinal məqaləyə aydın şəkildə istinad etmək şərti ilə icazəsiz təkrar istifadə edilə bilər.

Feature Papers sahədə yüksək təsir üçün əhəmiyyətli potensiala malik ən qabaqcıl tədqiqatları təmsil edir. Bədii məqalələr elmi redaktorlar tərəfindən fərdi dəvət və ya tövsiyə əsasında təqdim olunur və dərc edilməzdən əvvəl ekspert rəyindən keçir.

Bədii məqalə ya orijinal tədqiqat məqaləsi, tez-tez bir neçə texnika və ya yanaşmanı əhatə edən əsaslı yeni tədqiqat araşdırması, ya da elmi sahədə ən maraqlı irəliləyişləri sistematik şəkildə nəzərdən keçirən sahədəki ən son irəliləyişlərə dair qısa və dəqiq yeniləmələri olan hərtərəfli icmal sənədi ola bilər. ədəbiyyat. Bu tip kağız tədqiqatın gələcək istiqamətləri və ya mümkün tətbiqlər haqqında dünyagörüşünü təmin edir.

Redaktorun Seçimi məqalələri dünyanın hər yerindən MDPI jurnallarının elmi redaktorlarının tövsiyələrinə əsaslanır. Redaktorlar jurnalda bu yaxınlarda dərc edilmiş az sayda məqaləni seçirlər ki, onlar müəlliflər üçün xüsusilə maraqlı və ya bu sahədə vacib olacaq. Məqsəd jurnalın müxtəlif tədqiqat sahələrində dərc olunmuş ən maraqlı işlərdən bəzilərinin şəklini təqdim etməkdir.


Nəticələr

Except for (_) (which ranges from 0 to 1), values for the genomic coefficients investigated here are outside the ranges of Malécot’s and Wright’s definitions of coefficient of inbreeding. When using a third interpretation of inbreeding in terms of loss or gain of variability, (_) gives sensible values but (_) , (_) , and (_) do not. In fact, the expectations derived here at the population level show some inconsistencies for these three coefficients. These include indications that (i) more variability than what initially existed can be lost ( (_) , (_) , and (_) ) (ii) variability has decreased when in reality it has increased ( (_) , (_) , and (_) ) (iii) variability has increased when in reality it has decreased ( (_) və (_) ) and (iv) it is not possible to gain more variability than what existed initially ( (_) ). The expectations developed here clearly explain the different patterns of these coefficients obtained for a highly inbred pig population when using thousands of SNP genotypes.


Videoya baxın: Inbreeding. Biomolecules. MCAT. Khan Academy (Iyul 2022).


Şərhlər:

  1. Thuan

    Buna aldanmayın.

  2. Rider

    Məncə, doğru deyilsən. Əminəm. Gəlin müzakirə edək.

  3. Sonny

    məntiqli deyil

  4. Dalen

    Maraqlıdır. Bəlkə RSS-ə abunə olacam. :)

  5. Arnwolf

    Magnificent idea

  6. Gokus

    Yaxşı fikirdir. Mən onu saxlayıram.

  7. Zukora

    İndi hər şey aydın oldu, bu məsələdə köməyə görə çox sağ olun.



Mesaj yazmaq