Məlumat

Müəyyən bir bölgədə çip-seq etmək mümkündürmü?

Müəyyən bir bölgədə çip-seq etmək mümkündürmü?



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Genomun müəyyən bölgəsində Chip-Seq etmək mümkündürmü? İdeya, daha çox həssaslığa sahib olmaq üçün ardıcıllıq addımından əvvəl zənginləşdirməkdir.


Əgər burada sual yalnız genomun müəyyən bir seqment toplusundan ardıcıllıqlar aparan bir analiz aparmaqdırsa, yəqin ki, edə bilərsiniz, lakin bu, çox iş olacaq və bu problemdən keçmək üçün yaxşı səbəbə ehtiyacınız olacaq.

Genomun müəyyən bir bölgəsinə qayıtdığınız nukleotidləri necə məhdudlaşdıracağınızdan əmin deyilsiniz. CHP-Seq təcrübəsinin bütün məqsədi bir sıra nukleotidlər dəstini qərəzsiz oxumaqdır və buna görə də yalnız müəyyən bir genom dəstinə qarşı hazırlanmış xüsusi primerlərdən istifadə etmək çətin olacaq.

Adətən CHP təcrübələri, məsələn, yalnız müəyyən bir transkripsiya faktoruna diqqət yetirməklə əldə etdikləri oxunuşlara diqqət yetirir. Adətən çıxan qısa bağlama ardıcıllığının variantlarının sayı ardıcıllıq zolağı tərəfindən asanlıqla oxunacaq. Bütün məlumat genomunu geniş götürməmək üçün güclü səbəbiniz olmalıdır. Ümumiyyətlə, bir çox belə açılma ardıcıllığının nəticələri olduqca qısadır və tez-tez genomda unikal şəkildə tapıla bilməz, xüsusən də zülalın tapılması üçün çoxlu bağlayıcı yerlər varsa.

Mən fərz edə bilərəm ki, bir şəkildə klonladığınız bir xromosom seqmentindən gələn kəsilmiş kitabxananın təsadüfi seqmentlərindən etiketli primerləri sintez edə bilərsiniz. Yenə də bunu etmək üçün böyük bir səbəb olmadan təcrübədən əldə etdiyiniz məlumatları azaltmaq üçün çox iş kimi görünür.

Yalnız müəyyən bölgələri döşənmiş CHP-CHP təcrübəsindən istifadə bu kimi bir şey edə bilər - bu, çipin özünü daha qənaətcil edir və təcrübəni daha əlçatan edir.

Ümid edirəm kömək edər…


Gücü artırmağın bir yolu (əgər bu sizin məqsədinizdirsə) xəritələmə addımınızı məhdudlaşdırmaqdır: siz yalnız genomun bir alt çoxluğu ilə xəritələşdirməyə çalışırsınız, məs. promouterlər və ya transkripsiya edilmiş bölgələr.

Linki sonra yerləşdirəcəyəm, lakin istinad Leuleu et al. 2010 tarixi: 10.1093/bfgp/elq022


Videoya baxın: Щебень для фундамента. Какой щебень выбрать. Виды щебня. (Avqust 2022).